3L8PA

Crystal structure of cytoplasmic kinase domain of tie2 complexed with inhibitor cep11207
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
308
structure length
292
Chain Sequence
TIYPVLDWNDIKFQDVIGEGNFGQVLKARIKKDGLRMDAAIKRMFAGELEVLCKLGHHPNIINLLGACEHRGYLYLAIEYAPHGNLLDFLRKSRVLETDPAFAIANSTASTLSSQQLLHFAADVARGMDYLSQKQFIHRDLAARNILVGENYVAKIADFGLSRGQEVYVKKPVRWMAIESLNYSVYTTNSDVWSYGVLLWEIVSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRLEKPLNCDDEVYDLMRQCWREKPYERPSFAQILVSLNRMLEERKTYVNTTLYEKFTYAGIDCSAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of cytoplasmic kinase domain of Tie2 complexed with inhibitor CEP11207
rcsb
molecule keywords Angiopoietin-1 receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 292
sequence length 308
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3l8pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3l8pA01
3E8NA 3FV8A 3FYKX 3QU0A 4FKJA 3ID6C 1B6CB 1H1SA 3KA0A 3KB7A 4Z7HA 3VUKA 4RZWA 5CVFA 3R7UA 2YHVA 3P0MA 5M09A 2Z60A 2HZ4A 4XG9A 2A4LA 4DAWA 4UMPA 4YURA 2YWVA 3OTUA 2XNGA 2Z8CA 3HV4A 4IAKA 5T68A 4XG3A 2V62A 3OT3A 3E7OA 2OSCA 1F0QA 3KRXA 4IADA 3V5WA 2F2UA 3NW6A 3VS0A 4FZFB 3WILA 2VWBA 1OPJA 3DY7A 4P5QA 2G2IA 4BTFA 2ZB1A 3AC5A 3FPMA 2UZVA 2GQSA 3LFAA 4RX8A 5K5NA 5JSMA 5LWNA 1Q8WA 5BQ0A 3L9PA 4M69A 3GCPA 3IO7A 4ASDA 3A2CA 3OP5A 4FOCA 4MXYA 4G34A 1XKKA 2CN5A 2P2IA 2X9FA 4L00A 4HVIA 3VW6A 4CVAA 4ERWA 2W5HA 2PY3A 3EQPA 4M0YA 4PV0A 4AFEA 3PPJA 3CQUA 3KXZA 2ITPA 4AACA 4EK8A 2CLXA 2FA2A 3ZSHA 4CTCA 4O7LA 2C6KA 4O0SA 4UV0A 3F66A 3PIYA 1H00A 2PMOX 3WBLA 4R1VA 2JDSA 3FMHA 4JAJA 3WZJA 1SZMA 2WO6A 4G9RA 2WTJA 4RWKA 3EQGA 4TRLA 1YWVA 4IM2A 4UYAA 3R8UA 4AE9A 2OLCA 3FC1X 3EL8A 3VS2A 2WB8A 3FSKA 3DAKA 4GFGA 2ITXA 4AOJA 4HZRA 5CF8A 1OL1A 2HZIA 4Y5HA 3BEAA 4B6LA 4IDTA 4LG4A 3OBGA 5CI6A 1ZY5A 1XBCA 1LUFA 4AZWA 3DFCB 2QC6A 4LUDA 3ZRKA 3QALE 4D2RA 5HTIA 4XLVA 4RRVA 5J1VA 3R01A 3RMFA 4IVDA 4S34A 5HVYA 4BGQA 4JVGA 4FG8A 4QYYA 4YHFA 4QMUA 4R5YA 1ZMVA 3MDYA 5DT4A 3R9DA 1IR3A 3R73A 4FVRA 3KVXA 3Q5IA 4WHZA 3UVPA 5IQIA 4YNOA 2UUEA 3BU3A 2PMIA 3BE2A 3UYSA 3U4WA 2OBJA 4ITJA 5HZNA 3MY0A 2R3GA 4EOOA 5HVKA 2XB7A 4N70A 3LW0A 4O7NA 2CGUA 5L2TA 1GIIA 4MXCA 4BTJA 3M1SA 2B55A 3R7GA 4QTAA 2KULA 4TYEA 4XS2A 2G9XA 4E4NA 3KXMA 1L3RE 3MVMA 3PIXA 3FLQA 4BCJA 4W4WA 3MH2A 3MY5A 2JKOA 1GNGA 4GK3A 4A9UA 4W9XA 3C0HA 2WHBA 4FIHA 2AUHA 5D41A 2NP8A 4D1XA 4JIKA 1UNHA 2VTSA 3P1AA 5J7HA 4D4YA 4IAYA 4EOLA 1G5SA 4OTQA 2OU7A 4I0RA 3UE4A 4CMTA 4CLJA 4L68A 4FUXA 3ZONA 1H4LA 1IAHA 4ACHA 4JX7A 1URWA 4OTIA 3VUMA 2J5FA 1ZARA 2BMCA 2VWUA 2I0VA 3O8UA 4R7HA 2BIYA 4KD1A 5EQYA 4WBOA 4RA5A 4FTUA 4LFIA 3PP1A 5FBNC 5B2KA 5CEQA 2WXVA 4DGOA 4NCTA 3WF8A 1UVRA 3AMBA 4DH5A 5HIDA 2O64A 3IW6A 2UV2A 3O23A 2C3KA 3NRMA 3MN3A 4JDHA 2W7XA 3DJ5A 4PDSA 4B8LA 1PKDA 5LXMA 2QOOA 5HLNA 5BVKA 5E8ZA 3Q4CA 4I6FA 4BN1A 3MH1A 4ZTLA 4ZIMA 3SVVA 2OJIA 4DFNA 2YZAA 4DG2E 4QMNA 4U40A 3A62A 4G31A 4YC6A 2PL0A 4QP4A 4EJ7A 2XK6A 3VBQA 4WD5A 3ZC6A 2W1CA 3EQIA 5D12A 4R77A 5ETCA 5ANKA 5AV1A 4Q5HA 5L8JA 4DCEA 4I6BA 3AC2A 2WQOA 5KZ0A 4F9AA 5FM2A 2JAVA 5C9CA 4CT2A 3I1AA 4U79A 3NNUA 4BKZA 3Q2MA 4BBFA 2R3MA 4C3RA 5FM3A 2B0QA 4PDOA 4RVKA 4LRJA 3QTIA 3TV7A 3A61A 4U9AA 4KKGA 1OL7A 5FEQA 4IX4A 1KV2A 5E8SA 4IX6A 4NSTA 3SAYA 2C68A 2ITZA 5CZHA 3BGZA 1Q99A 1WZYA 3PJ8A 3SW4A 2OFUA 4N4SA 4TWPA 4TWOA 3GU7A 4BCGA 4ALUA 3EFJA 2PVHA 4TWCA 4RWLA 1Y91A 4LGHA 4BYIA 2WEVA 3QYWA 4EOIA 3MWUA 5E8UA 3ENMA 4CKIA 3MA3A 4FSZA 4AGUA 4CMOA 3I79A 2R0IA 1UWJA 2FSTX 2BRGA 3QCSA 3FXZA 4QPAA 4EK5A 4HW7A 5L2IA 2FO0A 3VO3A 2J9MA 3DFAA 1E1XA 3KEXA 4IFGA 3ZLXA 3F5PA 4F70A 4IXPA 4F9BA 2CKEA 4WO5A 3FMKA 3FZPA 3TZ9A 3UBDA 3NVMB 3HV6A 3SOCA 4F9WA 4AZFA 3BYVA 4F7LA 4FNXA 5EI2A 1ZRZA 4BWXA 4ZAUA 2WZJA 4BBMA 1WBWA 4HNIA 5IA0A 4Y73A 2XJ0A 2ZV7A 4Z3VA 5ETFA 5E9EA 3KXNA 2OW3A 4YO6A 4L6QA 4WG5A 2P55A 3MFSA 2YDKA 5L6WL 4PMTA 3LKMA 5FLFA 2BTRA 3GC0A 2ITVA 3W8QA 4FZ6A 4FIFA 4WNKA 3V5JA 2C6IA 4G3GA 4QTCA 1A06A 2XK8A 3BWJA 1XH9A 2OWBA 3D94A 2PVRA 3V6SA 4MHAA 1YWRA 3U51A 3R9OA 2XKDA 3QTUA 4MWIA 1I44A 5A4CA 2XNOA 4FG7A 4YJOA 3W8LA 5HX8A 2RG6A 2YCQA 2RKUA 3HZTA 4W8DA 4Y85A 2F57A 1L8TA 3BV3A 4CQGA 3VS6A 5CSVA 4QNYA 3S4QA 4NK9A 4M69B 4H3QA 3U87A 2HENA 3MIAA 3C7QA 4JBPA 1WVXA 4IB0A 4R3RA 4ZLYA 2WGJA 3PSCA 4QPSA 4RJ8A 4Q9SA 4E6QA 4L3LA 4EH7A 1MQBA 5CX9A 4QMMA 4D28A 4YO4A 3W2SA 2XNBA 4ACMA 5I3RA 3IKAA 5IDPA 5LMKA 5L8KA 2Y6OA 4KSQA 4YJVA 4YP8A 2C5NA 5LMKC 1ZMUA 2ZYBA 5AR7A 4ANOA 5E4HA 4R3PA 5KHXA 2P3GX 2V7OA 2W1EA 4M7IA 4AN9A 4NKSA 3IGGA 3WE4A 4ANQA 3II5A 4CZTA 5EM7A 2J7TA 4DEEA 3VWAA 2OF4A 3ZSIA 3KRLA 4UMRA 3D5WA 4GU9A 4O7VA 3FLYA 4BB4A 2HZ0A 3O0GA 3UO5A 4CTBA 2QHNA 4M8TA 4G3EA 4F0FA 3CKWA 2O2UA 3FC2A 3BBWA 5CSWA 4ALWA 4GCJA 4BHNA 3DB6A 2YCFA 1ZMWA 3TT0A 4DGLC 2C5OA 4FZDB 3RZBA 2IPXA 2VX0A 4C35A 1PXMA 2WQEA 4TYHA 4YHTA 5EKOA 3KCKA 3VQHA 5ANGA 3RNIA 4UMUA 2YFXA 4NTSA 1PXPA 2GNJA 4I24A 1YDRE 2NRYA 2H8HA 4FKOA 3KREA 3TUBA 2WTDA 3LMHA 5DT0A 3EQDA 2R3LA 1JAMA 4M66A 5CTPA 2PTKA 3D14A 4C02A 4XG8A 5AA9A 3E93A 3BPRA 3GC9A 4ZY4A 4KIQA 1SVHA 4IJPA 3VS5A 4E73A 5HOAA 3CS9A 3AGLA 1Z57A 4NYEA 4C57A 4XJ0A 2GNIA 4G6LA 1FVTA 3F7ZA 2XA4A 4L43A 5A4EA 3FL4A 4BDEA 4TPTA 3KVWA 3ODZX 3FMLA 4EH2A 4RFZA 5C8NA 5EHLA 2Y7JA 2WOUA 3ZLWA 1YDTE 3QAME 5KKRC 4FV5A 2Q83A 2VWYA 2VWZA 1TKIA 5DG5A 3ZO2A 3CEKA 4CZYB 2OKRA 1Q8YA 4AA0A 3VBWA 3ZDIA 4QT1A 3V5QA 4APPA 3MPAA 1WBPA 5AUTA 2JC6A 1XHAA 3L8XA 4UB7A 5FDPA 3R21A 2PVJA 5IMXA 5C4KA 4HGTA 1JNKA 1Y6AA 3K2LA 3QD3A 4BI1A 4C2WA 5CAOA 5HI2A 5HU9A 5AADA 2JITA 2X2LA 3P7CA 5DFPA 5CEKA 4BCNA 4UWYA 1PJKA 3K5VA 4IVCA 4ZSJA 4BF2A 4OBOA 3FY2A 5BUIA 3QA0A 1Z9XA 4B9DA 5ACBC 3VHKA 3DAJA 4Y72A 4AW1A 5LCKA 4QMQA 4EC8A 5IPJA 3LM5A 5CWZA 3UO6A 3HP5A 3WF7A 2B54A 4PUZA 3U4UA 4FV4A 4BWKA 4E6AA 5JK3A 4IMYA 2CNVA 2X4ZA 3VF8A 4K1BA 2UZEA 2VTHA 5F1ZA 4AT3A 2YIQA 4PL4A 4J97A 4YJTA 3E62A 3VVHA 4EUTA 4MD7E 2HYYA 3Q9ZA 1O6LA 2J6MA 4O96A 3CE3A 2HXLA 3THBA 2R3FA 3AT3A 4CMUA 4YJSA 2Z7SA 3DCVA 1YXVA 3F69A 4AN2A 1MRYA 3NNXA 4IX5A 4GEOA 4TZRA 4CFXA 5BYLA 2PZPA 2VWXA 3JVSA 4OTWA 4YTHA 5DWRA 3V6RA 4AA4A 1Y8YA 1OPKA 5G1XA 5ITAA 2ZJWA 4GRBA 2R7IA 4X2FA 2G01A 4R1YA 4EEVA 2YEXA 4W9WA 4A4LA 1UU8A 2XBJA 4EQMA 4QP6A 3PJ2A 2QG5A 4IVBA 1Q8ZA 2GS6A 2XRWA 5B7VA 4PQNA 4FV3A 3FUPA 3PRIA 4FEXA 4F1MA 3NUXA 2IO6A 3CTJA 3I5ZA 4FZ7A 5JZJA 3PVBA 3ZFXA 2B52A 3BU5A 2UW8A 3COMA 3FQSA 3NVKI 5JGDA 2W4OA 2SRCA 3BGQA 3KFAA 5CS6A 3Q2JA 3FZOA 3OCTA 4CV9A 3TWJA 3QRUA 4G3FA 4JQ7A 3ROYA 3HAVA 5FBOA 5CU0A 4IM0A 2C6EA 1GZ8A 2UZBA 1YXUA 4IEBA 1OGUA 3A60A 3MB6A 1PXOA 1SYKA 3LQ8A 3O8PA 3NLBA 2DQ7X 4DHFA 1U54B 4TNDA 5IEYA 2GNFA 1CKJA 2XIZA 3D83A 4OTHA 3WOWA 4XG4A 1FQ1B 1ATPE 3PXRA 4JNWA 1APME 2CGXA 3CPCA 2P0CA 4U44A 1GZOA 4Z9LA 4HVGA 3DS6A 3NUNA 3F82A 3RWPA 1FINA 3UOLA 4WG3A 1IA9A 1ZYSA 4XRJA 3Q9WA 2FSOX 1YI3A 3ORZA 3L9NA 3PE2A 4OUCA 4E6DA 3QD0A 4FE2A 2WMRA 2Y0AA 5BMMA 3RHXA 1Q3DA 2W06A 4O2PA 5BMSA 4IE9A 5HHWA 3JR1A 3CP9A 5B0XA 4JBOA 4F1TA 3TNPC 4QMOA 1U46A 3KL8A 4C62A 2YLEA 4HYSA 4RPVA 5CAUA 3GVUA 3V5TA 4F1OA 4DFLA 3PDTA 3QCQA 4GUBA 3KXXA 4EHZA 2WMVA 4XHKB 3UYTA 1VYZA 4C4EA 4BCFA 4FT3A 4FV1A 4IANA 4L53A 4Z16A 4AOTA 5AA8A 5K9IA 3Q4ZA 2DWBA 3EKKA 4IM3A 4XRLA 3DJ7A 3OT8A 1KOBA 4YGAA 3PYYA 4CRLA 4D58A 5IUGA 4WUAA 3MESA 4IX3A 5ICPA 5IUHA 5JFVA 3G0EA 4S32A 3AC1A 3BWFA 2BZJA 4DEHA 3BHUA 4WNOA 5DGZA 3R8MA 3OWKA 3OHTA 2HXQA 5FGKA 2UW0A 4MBIA 3CPBA 2X9EA 3DA6A 3PXKA 4C7TA 5CALA 5CANA 5DEWA 3IW4A 1W0XC 2BR1A 4GW8A 2A27A 2BUJA 2YIWA 2C0OA 5J8IA 5TF9A 3JVRA 1T45A 5HEZA 5BUJA 4QQTA 1YHVA 1YOLA 1OL2A 2BALA 4J1RA 4ACDA 2PMLX 4GJ3A 3BYUA 5EW8A 5DR9A 3I0QA 4HOKA 3R7EA 4PMPA 2XIKA 3AD5A 2ETMA 3SQQA 2VN9A 2X6EA 3RAHA 3QFVA 3TZMA 3DK3A 1XH6A 2FUMA 4DTKA 3QKKA 5IH6A 1SVGA 4HCVA 4A07A 4FI1A 5FXQA 4EH6A 2GFSA 3ZBXA 3SD0A 4KIOA 3UQCA 3EN6A 3VBXA 2ACXA 5GJFA 4G3CA 3RM7A 2CLQA 3NCZA 2CNQA 5DBXA 4C37A 4EORA 3UG2A 4CZUA 4ZZMA 3SLSA 5IQBA 5M51A 5GHVA 3QZFA 2E9NA 2PVMA 4FT0A 4AW5A 4EZ3A 2CKQA 3ELJA 4UYNA 1OIYA 2A0CX 3W10A 4E5BA 2BDFA 4YU2A 2UVYA 3CY2A 4D4VA 3FMEA 3FMMA 1F3MC 4IZAA 2EB2A 3UNJA 2JIVA 1KOAA 3FWQA 3QRJA 4JDIA 4TKSA 4DG3E 5H2UA 3ZOSA 1IRKA 3TXOA 2QOFA 4EHVA 3H30A 4XX9A 4YJRA 3D7ZA 3I81A 3RK5A 2OZAA 5L3AA 2XK9A 4KUJA 4GKHA 3NGAA 4FV9A 3RAIA 3C0GA 1MUOA 2H6DA 2H9VA 2P33A 3KY2A 4IZ7A 4RFYA 5IQGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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