3DKCA

Structure of met receptor tyrosine kinase in complex with atp
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
VHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEFDSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVKEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title SGX523 is an exquisitely selective, ATP-competitive inhibitor of the MET receptor tyrosine kinase with antitumor activity in vivo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Oncoprotein
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3dkcA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3dkcA01
4FZ7A 2WMSA 4RJ6A 2B54A 2I0YA 2I40A 4V01A 3OW4A 4L68A 5CF8A 4DFYA 4UX9A 4XOZA 5HEZA 2H9VA 5C27A 4M0ZA 2F9GA 2UW8A 2PWLA 3NLBA 3I60A 4U43A 1Q24A 3BLHA 3F88A 4U80A 3O71A 3KF7A 4YTFA 3DCVA 1PYXA 4KWPA 4KIPA 3IO7A 1H1RA 2E9OA 2UV2A 4ERWA 3ENMA 4O7RA 2LAVA 3E5AA 3FHRA 2WZJA 2XK8A 5IUHA 3ZS5A 5J8IA 2PUIA 4FBXA 3RNIA 2EU9A 4I21A 2O5KA 2X0GA 2XIRA 3DAEA 1Q4LA 1T45A 3R8VA 3KREA 3KXXA 3IKAA 3BKBA 3D83A 1K3AA 4M69B 5A54A 3CGOA 1BUHA 1LR4A 4Q9ZA 1YXUA 2WMBA 4I5HA 3UVRA 4AACA 5CI6A 4AW1A 4DFBA 3BBTB 4AN2A 1GIJA 4DGNA 4AA0A 5M57A 4HVIA 3SDJA 2OJIA 5JFXA 1WZYA 2VWUA 3DBCA 3QD0A 4USEA 3R71A 4ZSLA 4QMWA 3B8RA 4G5JA 1ND4A 2FSOX 4YC8A 4FZ6A 5IQBA 4YTIA 3QTRA 5CAVA 3B2WA 2CDZA 5L8KA 5HE0A 3BHTA 3UIMA 3LJ1A 3VW6A 4MK0A 3NS9A 5KCVA 4FV0A 3AQVA 3K3JA 2IW9A 4F9YA 4X3FC 4RZWA 3UC3A 4C38A 2XYUA 5IEVA 2ZMCA 3I0OA 5HBEA 3TV4A 3ETAA 4BWPA 4Q9SA 4EOIA 4EJ7A 4JXFA 4Z16A 2RL5A 3JPVA 4C4JA 5HO6A 4U8ZA 1Q97A 2YEXA 5CALA 2ITUA 5EDQA 3VVHA 3LCTA 3MH0A 3UMXA 3P7BA 1B6CB 4D4RA 4G6NA 4FMQA 4EH8A 3AD5A 3NAYA 3I4BA 3BE9A 4H3PA 2I0VA 3R28A 2OH4A 3I79A 3VUKA 1FVRA 3W8QA 3RWQA 2XVDA 2OBJA 4RA4A 2QU5A 4C62A 3GC8A 5EKNA 3TJCA 2OFVA 2PUNA 3NDMA 4IADA 3C50A 1UNGA 2VGPA 3ZONA 1ZZLA 4AW0A 3K3IA 5K4IA 2JKOA 4MXXA 2V62A 4ACGA 4ZMEA 5CSHA 2E9PA 3D14A 3F2AA 3Q9XA 4MNFA 5HESA 5E8XA 3UIXA 3PJ8A 3QZFA 4YPDA 4BI0A 4IC7A 5EYMA 4I6FA 3FMLA 1R0EA 4CSVA 1GJOA 5HE2A 4FKIA 1J1BA 2O0UA 4FC0A 5CZHA 4U3YA 1OIUA 1G5SA 1AQ1A 2FSTX 3BYSA 2VTJA 3DU8A 1FMKA 3RGFA 3RM6A 4YBKA 4QNAA 3VWAA 2C6LA 2WMTA 2XKFA 3EL8A 3NRMA 4NK9A 4YO4A 5I5ZA 2W96B 1UNLA 3HP2A 4L00A 2UZOA 4FKTA 3C4FA 3QRTA 2A1AB 4FL3A 3PG3A 4FKRA 2YCQA 1ZYJA 1ZAOA 3BQCA 4DTAA 2Y7JA 3DB6A 3T8OA 5BUEA 3UZRA 4NUSA 4YJRA 3LFFA 3MH2A 2BCJA 3HX4A 3G51A 4CT1A 5A9UA 5EDPA 2BRNA 2CNVA 1H01A 4NKAA 2WTKB 4KKGA 3RK5A 3UQCA 4IAYA 5CSPA 5M4CA 1ZWSA 3VBVA 2UZEA 3P9JA 4IX4A 4DFZE 1DI9A 3MIYA 4JQ7A 5M4IA 2C47A 1FVVA 2UZLA 3GOPA 3MIAA 4E4LA 5L2TA 4JRVA 4IAZA 3W2OA 4M68A 3WF7A 3PIZA 5DR6A 3VUIA 5ETAA 2A27A 4QQTA 1WVWA 2I0EA 3H0ZA 4N6ZA 4O0UA 5FLFA 5FTOA 1OI9A 1ZMWA 5AP1A 5CT7A 5EOBA 2QOKA 1G3NA 2R3IA 5TOZA 1GIIA 4FYNA 2WU7A 3MFTA 2JDOA 5B0XA 3ANQA 5F20A 3R9RA 2IZSA 3L8VA 4UV0A 4GH2A 4FT7A 4I5CA 4EWHA 5DT3A 1SYKA 3O51A 4IWPA 4O21A 4QTCA 5EM8A 3UBDA 4GW8A 3UDBA 2XF0A 4U42A 3ZSHA 1YHSA 4BWKA 5M51A 2GMXA 5AP0A 3QZIA 2GTMA 3KMUA 4YZ9A 3KK8A 2PZRA 4RT7A 2BAQA 3QYWA 3R1NA 1W7HA 4L6QA 2VZ6A 3EIDA 4V04A 4XV3A 5J7BA 3F6XA 1R39A 4I0RA 3RAIA 3OF0A 3RPOA 3BQRA 2ITYA 3SXRA 5AIKA 4KINA 3OUKA 2FVDA 3WZEA 3I6WA 5C01A 2I6LA 3CEKA 3NAXA 5BVOA 2QI8A 1J3HA 1Q61A 2YM7A 3TI1A 5JFSA 4FSMA 4RSSA 3FMMA 2PK9A 1IA8A 1J7IA 4HJOA 2ITNA 4E3CA 2ERZE 2W7XA 1JOWB 1XH9A 3FYJX 3QZGA 3PA3A 3ZZEA 5CF4A 5HNIX 4X3JA 2WXVA 3ZUTA 2IVTA 3SRVB 4IWDA 4I20A 4QMZA 3W18A 4EH6A 1ZMVA 4DH1A 4EH2A 4QMNA 5IUGA 3K2LA 3R01A 1PXIA 3Q4TA 4MHAA 5D41A 2WQBA 3CQUA 4F9WA 2BZIB 3RWPA 4N4SA 4RQVA 3UO4A 4YHJA 4IQ6A 2BHHA 5CSWA 2R7BA 3CTJA 2PVYA 3KC3A 4I4EA 2W05A 2IZTA 1R1WA 3FQHA 1WCCA 4P2KA 4UY9A 4EH4A 1H1PA 4FTMA 5I9VA 3GNIB 4XG9A 3FZTA 1BLXA 4FT9A 3AT3A 3RINA 4AT4A 2NPQA 3MWUA 3ZXTA 4LOPA 2EB2A 2GHMA 4RWKA 2XBJA 2CGVA 4QPMA 4UXLA 2B0QA 4PPBA 4AA5A 3HV6A 4EYMA 3PDTA 4L3LA 5J1WA 4PQNA 4JL9A 5JKGA 3P5KA 4E1ZA 5BUJA 3A7GA 4J52A 3WE8A 4DGOA 3PP1A 2PMIA 5AM7A 4CCUA 4R78A 3AXWA 1MRVA 3KXHA 4IC8A 4OW8A 5HD7A 3ROCA 3V8TA 5E1SA 5EQEA 5BVFA 3ODYX 2GQGA 2C0IA 5HVJA 3EMGA 2WMVA 3P4KA 4UEUA 1UKHA 3P79A 1WMKA 5JN2A 4PDOA 3LFDA 4F0GA 4ZSAA 4R3RA 5T68A 3MW1A 3TV7A 5LWMA 4X2KA 2JITA 4JIKA 4AT3A 3B8QA 3VS6A 5I0BA 4CG9A 5CANA 2O63A 2RG6A 2PUUA 3CY3A 5A6OA 3EN4A 1BMKA 2OO8X 3JUHA 2OJ9A 5E8VA 4DN5A 3V8SA 4E93A 4M97A 2J5FA 4EK3A 4CVAA 1JLUE 2UVYA 4QQ5A 4YJPA 4ZTRA 4CGAA 1UWJA 2ERKA 4K2RA 3OY3A 3TNWA 3Q52A 1UU8A 5ICPA 2VGOA 2W0JA 3HV5A 3KU2A 2VO7A 3K5UA 4Y8DA 3ZLYA 3U6IA 3RJCA 3LFAA 4JG7A 4IHPA 1O9UA 1GIHA 3F7ZA 2UUEA 4YJTA 3EKKA 4NZWB 1UU9A 4M69A 2ZV2A 4HCUA 3C5IA 4L9IA 4C0TA 3NW6A 1RDQE 2YM5A 3GU8A 3NYVA 3FMHA 1WAKA 1GZ8A 2IWIA 2J4ZA 1AD5A 2JDRA 3PXKA 3VUHA 4D9TA 4YURA 5AV4A 5JGAA 4FK3A 1JSUA 4GFOA 4HVGA 2GHLA 4EORA 4J96A 1H1WA 3Q2JA 3QKKA 5IG1A 3KRXA 3E92A 1WVYA 3Q04A 1H0WA 4OTGA 5L6OA 3LXLA 4MNEB 3D5UA 2QOQA 2VTLA 2WEIA 1VYWA 3FLZA 3SX9A 4E4NA 3UQFA 4C58A 3QCYA 4GYIA 2WO6A 3FI4A 5JFWA 4R7BA 4BRXA 4L52A 4UBAA 1OPJA 2XM9A 4KAOA 3RK7A 2VWBA 3LM5A 2PTKA 4QQCA 2WQOA 2PVKA 2W17A 3IONA 3LHJA 3QRUA 1H25A 2OZOA 4OTWA 5AEPA 2BRHA 3DNDA 3KCFA 5TR6A 3L9PA 5FTGA 3HMMA 4ZP5A 5H9BA 4I22A 5LWNA 5CASA 3D4QA 4QRCA 4IEBA 3H10A 4ALUA 5D7AA 4HZRA 2JKQA 4JT3A 4XYFA 3UZTA 2PUPA 3AOXA 3G2FA 3PE2A 4H39A 4WNKA 2ZVAA 4GT4A 3CQWA 3FI3A 4FKLA 1RE8A 4BKYA 3V5LA 3PVBA 3NIZA 5CEMA 3FHIA 5GZ8A 3UYTA 4WRGA 5IQCA 2PVJA 3HECA 4G9RA 5AAFA 4QOXA 4ANQA 4QP6A 2F7ZE 2J6MA 3TIYA 4NKSA 2WTCA 3PSDA 5DIAA 2PULA 4KKEA 2JAVA 3OP5A 5E8ZA 5EK7A 4PP7A 4KIKB 3HVCA 1Y6BA 4U3ZA 3R7GA 4F7LA 4LRMA 3N4VA 5EQPA 3DLSA 4BCGA 4BF2A 2HIWA 4PMMA 5KHXA 1PMNA 3G90X 5ETIA 1JNKA 3GGFA 3SLSA 3U4WA 3O7LB 4WG5A 3IGOA 4UB7A 1ZZ2A 1FINA 2P0CA 2XZSA 3GEQA 3JY0A 4APPA 4ASZA 4XP2A 3BWJA 3NUPA 2OJJA 2NO3A 4ALWA 2BTSA 4X0MA 1KUTA 1O6LA 3FQEA 1ZOHA 2EXEA 4XX9A 4EBVA 3ROYA 3FLNC 4CFXA 4PL4A 3TXOA 2P2HA 1URCA 3OWLA 1Q5KA 3LZBA 4BCNA 3VBQA 2UW0A 5M07A 1KE9A 2O2UA 3DOGA 3OEZA 2XK7A 4FV2A 4KBCA 4O38A 3UGCA 3NYNA 5DRBA 2EXCX 5EM7A 5L8LA 3ET7A 2B9JA 3DTWA 4K0YA 3C5UA 1OL6A 2XIYA 5D11A 2OG8A 4ITJA 5HCYA 4PP9A 5J5TA 5FXQA 3UNKA 3TACA 3ORIA 3RP9A 5LMKA 2BDFA 3LJ2A 4R1YA 4XJ0A 4E6AA 3LLTA 4EZ5A 5IQEA 3UE4A 4FG7A 2QNJA 4LV5A 3FAAA 5J87A 5DT0A 5KO1A 2BHEA 1JKLA 1QPJA 5AV1A 3GU4A 1OECA 4EK4A 4JBOA 4DGGA 1W84A 2X9FA 3ATTA 1VR2A 3ZU7A 2WQMA 5J95A 2PZ5A 2W9FB 4EJNA 2X8IA 2OJFE 3CPCA 3KF4A 1HCKA 2ZM3A 4O0SA 4ENXA 4S30A 5DR9A 3PY3A 3IS5A 4FICA 4I6BA 4MX9A 4O84A 4HYHA 2R5TA 4RLKA 3ORTA 4DGMA 4H05A 5IZFA 3RAKA 2BR1A 4BFMA 4AFJA 4BTFA 2XNGA 3JXWA 4JVGA 2F7XE 5F94A 3EB0A 2AC5A 3UIBA 5FEEA 3TDWA 4F1OA 4F09A 4XG7A 2RFDA 2CNUA 2XIZA 4JAJA 4FTNA 1YOMA 3A8XA 3QFVA 5E1EA 3DBFA 3MS9A 3RHXA 4JQ8A 4NJDA 4IZYA 4QYYA 3OCBA 1M17A 3H9OA 5EHOA 4E5WA 1LEWA 1U5RA 3TV6A 2YDIA 5HKMA 3SD0A 3NYXA 5CS6A 2X9EA 1OKVA 3PLSA 4A9SA 2NNWB 4P90A 3Q4ZA 4ASEA 4QP8A 3ZXZA 2WTIA 5AAGA 3OY1A 3SRVA 3H3CA 3LFCA 4QYEA 4U9AA 5H8EA 4Q5HA 2XIXA 4P5ZA 4TXCA 4Z3VA 2ITTA 2ITQA 3Q4UA 4QMMA 5M53A 3TWJA 3U87A 2WFYA 1DAYA 4O22A 3D7TB 1MRUA 3F9NA 3AGMA 1KE5A 3C4EA 4IX5A 4IW0A 4O91A 3LE6A 2HAKA 3MFRA 3P78A 5CYIA 2VTTA 5HHWA 5EG3A 4R3CA 4RWLA 2W1ZA 2Z8CA 3CPBA 3FKNA 1ZMUA 1APME 2YCSA 1RW8A 4KSQA 4LGDA 2XA4A 3KRWA 1KOAA 2C30A 3RTPA 2Z02A 4YNEA 4IIRA 5DR2A 1OIYA 3WZUA 4S34A 3IOPA 2XH5A 2YCFA 1PXPA 3OT8A 4GT5A 5GHVA 5AP4A 3ITZA 3PTGA 3MDYA 4G6OA 4O7ZA 2ITVA 2UZUE 3VIDA 4ANBA 3FYKX 3MTLA 2DQ7X 2VTIA 2XMYA 3FMDA 5C8MA 1OKWA 1I09A 1NY3A 4KS7A 3QA8A 2QKRA 3G6GA 3HUBA 3OXTA 3PFQA 3QRIA 4I92A 2XNOA 3OWPA 4DH5A 2B4SB 4I0SA 4DFUA 1OMWA 2X8DA 1J7UA 3O7LD 4RIXB 3RCDA 4AGDA 2YISA 1OPLA 4N0SA 3ACKA 4MQ1A 2VRXA 4F7SA 1WBTA 3NNVA 4QO9A 3DXPA 2ZV9A 2VN9A 3RPRA 1YHWA 5ACBC 2C5NA 4FEWA 4OUCA 3Q9WA 4FKQA 4O7TA 5HVKA 3EYGA 4BDFA 3UTOA 4AZWA 4HVSA 5KMNA 5JFVA 5CI7A 4CKRA 3SW7A 3DY7A 2IW6A 4FOBA 2VWZA 5LMKC 3EOCA 2IJMA 2UW3A 4JAIA 4ZTHA 4PNKA 2YM4A 4BZDA 5CU4A 4RC2A 2OFUA 2DYLA 4ZJIA 2ZDTA 5BVWA 4WOVA 4ZZNA 3M1SA 2V7OA 5DE2A 2C5OA 2QR8A 5I9UA 3DK6A 1B38A 2YM6A 4KIOA 4RIYB 2VO6A 4IB0A 1P4FA 4AE9A 4BHZA 3VJOA 2WOUA 5DBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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