2A98A

Crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase c
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
EDGRILKRFCQCEQRSLEQLMKDPLRPFVPAYYGMVLQDGQTFNQMEDLLADFEGPSIMDCKMGSRTYLEEELVKARERPRPRKDMYEKMVAVDPGAPTPEEHAQGAVTKPRYMQWRETMSSTSTLGFRIEGIKKADGTCNTNFKKTQALEQVTKVLEDFVDGDHVILQKYVACLEELREALEISPFFKTHEVVGSSLLFVHDHTGLAKVWMIDFGKTVALPDHQTLSHRLPWAEGNREDGYLWGLDNMICLLQGLAQS
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
publication title The crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 80
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2005-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2a98A00
4O4CA 2A98A 2IEWA 4O4BB 1W2CA 1TZDA 2IF8A 1W2DA 4FRFA 4O4EA 4O4DA 4O4FA 2AQXA 1W2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FSNA 4JDKA 4M67A 4TYEA 3RHKA 3SDJA 1QPJA 2UUEA 3KN5A 1YXTA 4M0ZA 2OXXA 2YA9A 4LMUA 5TR6A 1ZY5A 4FZAB 5EI2A 3IG7A 3O96A 4HNFA 4DGNA 5KMIA 5E1EA 3QCXA 2X0QA 3IW7A 4FKUA 4F08A 5JRSA 2GNLA 4PPBA 4CRLA 4DYMA 2IW6A 3LAUA 4WHZA 4YJNA 2GFCA 2WGJA 3PWDA 4CKJA 5J9YA 2C0TA 1Y8YA 3LPBA 4QYEA 4MNEB 5FM2A 3CXWA 3KXZA 3R6XA 3W1FA 5DEWA 4IHPA 2C6EA 1JAMA 3COHA 3HGKA 1K3AA 4QTDA 4ZZNA 1W2FA 2J51A 5ANOA 5D10A 3LQ8A 3Q5ZA 3FY0A 2VWYA 4QP8A 3PVBA 5KMLA 3FXXA 1YDRE 2OF4A 1KOAA 5LMAA 3V5WA 4A4LA 5AUXA 1U5QA 2I0YA 3D15A 5TOZA 4CTCA 4D0WA 5IA0A 2VTPA 5F4NA 4M3QA 2R3JA 4CZYB 3ODZX 2LAVA 3VF8A 4CQGA 5HVKA 5I9VA 1OL7A 4PWNA 5HU3A 2C68A 2VTTA 3PSDA 2VN9A 4YHTA 5I0BA 5JK3A 2OKRA 3G6HA 3GCUA 3KK8A 5E8UA 2C4GA 1JKKA 2CGVA 3K5UA 3R9NA 3O8UA 1VR2A 1CKPA 4F9YA 5A4LA 1XBAA 3TUDA 2XNPA 5AV3A 4MBIA 2R3QA 2UW0A 2J0MB 3FXZA 5EI6A 1ZMWA 3HRCA 1PMVA 4CFMA 3TJCA 5CU4A 2C69A 2R3FA 3H9FA 3PZHA 2QLUA 2GDOA 2V22A 5AIRA 4WIHA 2W1EA 3UO4A 2ZM1A 3LZBA 4FTKA 5FG8A 4AUAA 5DFPA 2XIRA 4H58A 3MPTA 5AIKA 3FLQA 4U9AA 3GCQA 3FKLA 4IAKA 4JIKA 4FV4A 3RK7A 4ANSA 3C13A 3HV6A 3R1SA 3TKIA 4ASXA 2VTIA 3BWJA 3AD5A 3IONA 2PUUA 3NLBA 4UBAA 3R7OA 3QTIA 3HA8A 5IEXA 3MB7A 3ROCA 5BVEA 2OBJA 3JYAA 2UW3A 4IAFA 4X0MA 1ZY4A 2OSCA 4PMPA 3MVHA 5M4IA 3PVUA 4FSZA 2PWLA 4O1PA 4FTMA 2QNJA 5G1XA 4HCUA 3AT2A 4FA2A 1UKIA 2YEXA 3PPKA 2CN8A 2JEDA 2VTHA 3IECA 4MXZA 5GZAA 3FI3A 1ERKA 3NS9A 1Q3DA 4G5JA 2PVNA 4IB1A 3VBWA 2PVJA 5IA5A 2W0JA 2WQBA 2JFLA 2EVAA 3FQEA 3QTSA 4FNZA 4IB3A 2GNFA 3D0EA 3KXMA 2PY3A 3LCTA 4FTLA 3QKLA 4ACCA 4EHEA 1JKSA 3RK5A 3LFDA 4FV2A 3MY5A 4HZRA 2O3PA 4FTUA 4MTAA 4F9CA 1E9HA 4O4EA 3DKFA 3DY7A 1R0PA 4XG3A 3LHJA 1KE6A 1GJOA 4FT3A 4N4SA 2H96A 3EQCA 4XHKB 4EH6A 3QZIA 4W4VA 3OXZA 2XJ1A 4FIHA 2FVDA 4GK4A 3KXHA 3F3UA 3QTXA 4BDIA 1YW2A 3Q9YA 5A4QA 4WG5A 4F4PA 3DKGA 2B9JA 2HY81 4IM2A 3W2RA 1BLXA 3U87A 1B38A 2JKKA 4ZP5A 4B8MA 1Q8UA 4TZRA 4FT5A 5CANA 3UP7A 3B8RA 3KVWA 3H4JA 4O38A 1OITA 1MQ4A 4C4HA 3ITZA 3TZ8A 4ONAA 4W4YA 4FV8A 3EQGA 5AP4A 5TKDA 5HIBA 3QUEA 4TYGA 3U4WA 3UOKA 3UVPA 3LFCA 4FSQA 2J9MA 1ZWSA 3QLGA 4GJ3A 2YERA 5HVJA 4I0RA 2YLEA 1KE5A 3GU4A 3VS5A 2YHVA 4UX9A 3C0HA 3FKOA 4DCEA 1OKVA 3BU6A 2P55A 3GC7A 4H1JA 4L68A 3QRUA 4AZFA 4FTRA 4OLIA 4UXLA 4I41A 4AA0A 4KIKA 4AW2A 5J5TA 4J99A 3ROYA 4D5HA 4K11A 4BDEA 3MY1A 4BIDA 3HMMA 3GVUA 5FP5A 1UVRA 4ZJIA 4LV5A 1V1KA 4DFNA 2YCQA 2GSFA 4GFMA 4Y83A 2BZHB 4EOJA 3LM5A 4I3ZA 5HNBA 3AC1A 3MPAA 4DEBA 4FNWA 2UW4A 2VTNA 4YLKA 4EZ3A 2PZRA 3ZONA 3ULIA 4YZDA 5HLNA 5BUEA 4BDAA 3D7TB 4IBMA 2R3KA 3QX2A 3R63A 4PX6A 2ITQA 3EQBA 3Q4UA 1S9JA 2FYSA 2IN6A 4HYIA 3CLYA 2W17A 5L8LA 2XB7A 3L9NA 3IDPA 4U45A 5E90A 1F0QA 2WNTA 1W84A 2WTKB 2XJ2A 2B9HA 2PMNX 4EZ7A 3F66A 3FAAA 4K18A 4GT5A 3ZMMA 4BDKA 2J5EA 4A07A 3NIZA 3GC8A 3BIZA 4XBRA 3CKWA 4EOPA 3BELA 4FC0A 2DWBA 3F7WA 4E20A 3V04A 5IH5A 3R8MA 3UC3A 3NW7A 1ZAOA 5CEMA 4I1ZA 3DJ6A 4EWHA 5CT7A 4F70A 3E8NA 4AQCA 5EW3A 3IOKA 2WTJA 4L67A 4D4RA 4KB8A 3QD2B 3PYYA 2A27A 2R2PA 3FMJA 4ZK5A 3V6SA 2C6OA 3EQDA 3VS2A 3HMPA 4AN3A 2VTQA 3IW6A 4AFEA 4LGHA 4I93A 2CDZA 2IZTA 5ETCA 3AC2A 5BVKA 5JN2A 2E9OA 3HEGA 3M11A 3OCBA 1HOWA 2OF2A 2QOBA 3KEXA 3QGYA 4QMYA 3Q32A 2G1TA 3PA3A 5GJDA 4TYHB 4FTJA 3UODA 3BWFA 4DEAA 3IW5A 3OD6X 4FKLA 4PUZA 4F7JA 5ICPA 1M2PA 4A9YA 5LVMA 2C3LA 3CQUA 3EZRA 1MQBA 5AAFA 4Q9ZA 3I6UA 4FEQA 1UU7A 4JR3A 4TWOA 2Y4IB 3ORMA 4BB4A 1ZARA 2B1PA 3IOPA 5HTBA 3EB0A 5DR9A 3UQGA 2C1AA 4QMPA 3IW8A 3AD6A 1PJKA 4IWPA 4WNKA 4NEUA 2PTKA 4UMTA 5K5NA 4QQ5A 1YOLA 1JSTA 4TPTA 3ANRA 3CP9A 4AS0A 4D1XA 3PZEA 4FSWA 4C35A 2F9GA 4C8BA 3MYGA 3MI9A 5KNJA 3OROA 3H9OA 4R3CA 2W9FB 3OHTA 2H6DA 2V7AA 4IXPA 3WYXA 3WZDA 4BKZA 4ENXA 2C6DA 2JKQA 4L7FA 3BEGA 5FDXA 2R7BA 3MTFA 3POOA 5EW8A 4D5KA 2OJIA 2JIIA 3VHEA 4BGHA 4L46A 3MVMA 3VWAA 3GENA 2IVTA 5HOAA 2Y9QA 3MJ2A 4OTGA 5AR2A 1SVHA 5KHXA 3ZFMA 4C33A 4DHFA 4X3FC 3RPSA 4KAOA 1SZMA 4QP3A 4RIXB 2CMWA 4QQJA 3OWKA 3VQUA 2XRUA 5AP5A 4C4JA 2RFDA 3LXPA 4V04A 3V5JA 5J87A 4G3DA 4DFZE 3BE2A 3L9LA 4QP7A 4MD9E 4I22A 3OWPA 3PG1A 2PE0A 4RJ6A 1P5EA 5DIAA 4DINA 2VO6A 4FSMA 3KN6A 5K9IA 4DH5A 3ORKA 4FTIA 4YTHA 3BZ3A 5DE2A 4DLJA 5HORA 5IH6A 2OIQA 5CALA 3GXLA 3D5WA 4UWBA 2WTDA 4AF3A 4D4SA 4O22A 4AW0A 5LMKA 1UNLA 2A19B 3SHEA 1PMNA 4ANLA 4IVAA 4APCA 4P7EA 5HTCA 3HMOA 3R2YA 3MBLA 2OJGA 4BC6A 5J1WA 4RIYA 2ITZA 2J5FA 5B0XA 2WTCA 1OM1A 3U9CA 3H30A 5B2KA 2XIYA 3ZXZA 4D2VA 3FZ1A 2PVHA 4MHAA 5ANJA 4XRJA 4JQ7A 5EDRA 3VUHA 2R3NA 4C4EA 4YZNA 4Z3VA 2AQXA 2QQ7A 4IJ9A 3PXYA 3TL8A 3RI1A 2HZIA 4B7TA 2UW6A 4I6FA 2W4OA 4XNEA 3PWYA 2OJFE 1RJBA 3ZDIA 2ESMA 4FOCA 4ZTNA 3EL7A 5LVOA 3KMUA 4RIWA 4N0SA 2J0JA 4BTKA 2PVMA 4AT4A 4YJTA 3ZFXA 1K2PA 4MQ2A 3EN6A 3R7UA 1RQQA 4FV5A 3Q5IA 4WA9A 3T9IA 3R73A 4BZDA 5C8NA 3KULB 1PF8A 4QTAA 4V05A 3ZUUA 4AX8A 4UMUA 3WOWA 5KMKA 3FLZA 4IACA 2WMWA 4B8LA 5IKWA 2B54A 4PP9A 1W2DA 1KV1A 3HRBA 5AAEA 4KKHA 3QC9A 3PXQA 3HX4A 4BHNA 1ZYLA 3NCZA 3OCTA 3T8OA 3OCSA 4QP6A 2RSVA 4O21A 4RSSA 3MDYA 2WMRA 5H8EA 5KBRA 5CQWA 5IZFA 1OECA 3HKOA 2ZV2A 4MD7E 2DUVA 5F95A 4YUQA 2WQEA 4UN0C 1XBBA 4GYIA 4USDA 3CQWA 4XLIA 4RA5A 4L9IA 3QRKA 4M15A 4QMMA 3TNQB 5IEVA 4OAVB 3R1YA 1PMEA 5J7BA 1YXXA 4ERWA 2BUJA 2QHMA 4OBPA 5H8BA 4Y46A 4ENYA 4GH2A 4EL9A 4HGLA 3SVVA 4PNIA 3BBWA 3BX5A 5BVDA 3SX9A 4MCVA 4BCFA 3TKUA 4ZXTA 1DI8A 4IX4A 4YJSA 5TT7A 2W9ZB 4ANNA 3EQPA 4C62A 4RX8A 5M53A 4R7HA 1J1BA 3PIYA 1Z57A 2ETRA 3F2AA 5J9ZA 1Q41A 1AD5A 2WMAA 2ITUA 3FMNA 3G0FA 4RLKA 3FC1X 4E4NA 3AQVA 3LIJA 4ITJA 3ZTXA 1H0WA 5IA2A 3OOGA 3NNVA 3C0IA 2R0IA 1PXJA 4XG9A 2W7XA 3IQ7A 4H36A 4RGJA 3P4KA 4UYNA 1OL6A 3RZFA 3CGOA 4YPSA 1BI7A 1CDKA 5JRQA 2CN5A 3CIKA 2UW8A 4NWMA 5HBJA 5CXZA 5LQFA 5DRBA 4MX9A 4J96A 4WBOA 5A3XA 2PK9A 3ERKA 4OT6A 2BFXA 5GNKA 4YMJA 3SA0A 4BFMA 3QKKA 4AW1A 2ZYBA 5T6KA 3OBJA 4M69B 3REPA 2FSOX 3L8VA 2WIHA 1Y6BA 2QKWB 5I9XA 4EYJA 2ZAZA 2JLDA 4AZVA 3GCSA 4BCMA 2WMUA 3LCSA 4MWHA 4DEIA 4EYMA 2FH9A 4FYOA 4BZOA 2W1GA 3CTJA 3EZVA 4HYHA 1M2RA 2ZM4A 1LP4A 2XK9A 4MXOA 2X0OA 3NYVA 5E91A 3T3UA 3A7HA 3O23A 2GTNA 1URWA 2YM5A 4IDTA 5IPJA 2XNMA 3ENHA 1PYXA 5AAGA 1OIYA 4CTBA 2V0DA 4DFYA 4F1MA 1F5QA 4H39A 4MXAA 3Q9WA 2XUUA 5FD2A 3QQLA 4D9TA 4DFLA 5BPYA 3OY1A 4QRCA 4ZTMA 2PMIA 4EBVA 3ZO1A 4RWJA 1DAWA 3ZRMA 3SKCA 4BBMA 4Z7HA 1VZOA 4E1ZA 3P78A 4YP8A 3UC4A 3ZUVA 1GZKA 2W1CA 3S00A 4IX5A 5L3AA 4JDHA 4KKEA 2YJRA 5J1VA 2WMSA 3NYNA 3TKHA 3QGWA 2G2FA 2P2IA 5JMSA 5AEPA 2BHEA 2WHBA 1YWNA 2R3OA 5EHYA 2FO0A 1YKRA 3RPYA 3H0ZA 2F7XE 4MD8E 3C51A 3QWJA 5H9BA 4YO6A 4EJNA 2FB8A 4M14A 2R5TA 3PPJA 3QZHA 4BVUA 2X81A 2IJMA 2VZ6A 3G9NA 1YWVA 1UNGA 3T9TA 2VTSA 5IMXA 5LMBA 4HCTA 2BIKB 4YHJA 1YQJA 2FSLX 2YIXA 4IEBA 2O5KA 2PL0A 3BV3A 4CLIA 4EK6A 5AADA 2YM7A 2QOLA 2ZMDA 3H9RA 5EFQA 3SRVA 5KKRB 3R7EA 3OTVA 3ALNA 4K1BA 1NA7A 1OKYA 4U80A 3DV3A 1PKDA 4F9BA 1YOJA 4XCUA 1QPEA 2ONLA 4UMPA 3PA5A 4HYUA 3WF8A 2P3GX 2QO7A 5I4NA 2VO3A 1ZYDA 1WBVA 4QQTA 4F65A 3F3TA 1BX6A 2A4LA 1A9UA 3F7ZA 2BDJA 2OFUA 3D4QA 3GT8A 3Q2MA 4FUXA 4UWYA 3NUNA 4HVGA 3NNXA 4KBCA 3RINA 1H07A 4QTCA 4IM3A 3WI6A 4PF4A 4W4WA 4FKIA 2C3JA 2CCIA 4G16A 4L7SA 3RZBA 5HNGA 3ZS5A 5CQUA 2NP8A 1WVXA 4XG8A 3JUHA 4QMVA 1WBTA 4BI1A 3OUNB 4JBOA 4JBPA 3UP2A 3F3WA 1H01A 4NIFA 3KU2A 5ANIA 3RAHA 3ELJA 4TNBA 3ZFYA 4ARKA 5CSXA 4QT1A 4RWKA 1XH5A 2Z60A 5D1JA 3TXOA 4WRSA 4YZ9A 3PXKA 4USFA 3AC5A 2VNWA 5CY3A 1H8FA 3W10A 5FP6A 4DEEA 2HOGA 1MRUA 4K0YA 4WSQA 3TACA 1YRPA 3KMMA 4IC7A 4PV0A 5DT4A 2JDVA 2W1HA 3Q3BA 3MFUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4O4C A;  2A98 A;  2IEW A;  4O4B B;  1W2C A;  2X0Q A;  1TZD A;  2IF8 A;  1W2D A;  2X0P A;  4FRF A;  2X0O A;  4O4E A;  4O4D A;  4O4F A;  2AQX A;  1W2F A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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