2A98A

Crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase c
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
EDGRILKRFCQCEQRSLEQLMKDPLRPFVPAYYGMVLQDGQTFNQMEDLLADFEGPSIMDCKMGSRTYLEEELVKARERPRPRKDMYEKMVAVDPGAPTPEEHAQGAVTKPRYMQWRETMSSTSTLGFRIEGIKKADGTCNTNFKKTQALEQVTKVLEDFVDGDHVILQKYVACLEELREALEISPFFKTHEVVGSSLLFVHDHTGLAKVWMIDFGKTVALPDHQTLSHRLPWAEGNREDGYLWGLDNMICLLQGLAQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
rcsb
molecule keywords Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
total genus 80
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2005-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2a98A00
4O4EA 1TZDA 4O4BB 4FRFA 1W2DA 4O4FA 2IF8A 2AQXA 4O4DA 2IEWA 4O4CA 1W2CA 2A98A 1W2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1M52A 4ANOA 1GIIA 3D94A 4LQMA 5DRBA 4XV1A 1AQ1A 3QD2B 2B53A 3BYMA 3CTQA 2RKUA 4FT9A 4L7FA 2PVFA 4LGGA 4O0YA 3F2AA 2PZPA 4FKPA 4FOCA 4ZTRA 3M2WA 5I9VA 3KCFA 3BQRA 3EL7A 3ZO3A 3COMA 5AV0A 1ZRZA 4C59A 5KMMA 3GEQA 5BMSA 2ZYBA 3ELJA 1YOMA 1YXTA 4BDCA 5CXZA 1ZARA 2GTNA 5CWZA 5J5TA 4CMUA 4IANA 3BYUA 3LM5A 4JR7A 5IMXA 4EYJA 3VHEA 2W4JA 2XKFA 3VW8A 1R3CA 3VUDA 4LOPA 5CAQA 4LMUA 3QRKA 4MNFA 4NW6A 3FKNA 4PWNA 4NIFA 4YJQA 4ZXTA 2YAKA 3ZDIA 1E1XA 4BWXA 4XBUA 4PTCA 4GYIA 3I81A 4G34A 5JQ8A 3OC1A 3BLRA 3EN7A 4J97A 3D7TA 4LUEA 4NZWB 3VW6A 4AS0A 2H34A 3ZEWA 2B4SB 1PXKA 4YZBA 4JI9A 3POOA 4S31A 4WNKA 4FICA 4EOIA 4U6RA 1W98A 3PRFA 3ZRMA 4UZDA 4CTCA 4H1MA 2ESMA 2XNPA 4RIYA 1YKRA 1PMNA 4MX9A 4RIWA 3NYXA 2YM7A 3PXQA 4CTBA 4FL2A 1WVYA 2OK1A 2OJ9A 3ALNA 3DAKA 4CRLA 2R64A 3PWYA 2V55A 4XP3A 3R8UA 1Y57A 3GXLA 4YURA 5BVEA 2W5BA 4KSPA 5I5ZA 2GNGA 3MVMA 3ANQA 2RGPA 3FYJX 4IWPA 5C8NA 3GCSA 4TYHA 3W33A 1JVPP 2OIDA 3I4BA 4EH7A 4BZDA 3FZPA 5CAPA 1Q8WA 3W16A 2YN8A 3OBJA 5EH0A 3TUCA 1M14A 3TIYA 5BYZA 3T8OA 3C4FA 2GHGA 1TZDA 2OGVA 4C57A 2R2PA 5HVKA 4PDPA 1CDKA 4QMNA 2QONA 3GQIA 3L1SA 3QHWA 5ICPA 2KULA 4MF1A 5AAFA 1W8CA 2RG5A 2XYNA 2C5XA 4XLIA 1OITA 5D7AA 5M4UA 1OM1A 1GOLA 2FUMA 4I0TA 2VTAA 2W5HA 4JG6A 4U80A 4BTKA 3DKGA 4FV0A 3I0QA 4RFMA 4Y95A 3MH2A 3QKKA 2PHKA 3DB8A 2Z7QA 2LAVA 5K3YA 2FSLX 2I6LA 1GZOA 4RGJA 4MXYA 5HCZA 2A1AB 2JFMA 4G2FA 4WSYA 4ZTLA 4ARKA 2BTRA 3PJ3A 4XG7A 3PZHA 4M69B 1FVRA 3O96A 2IVSA 5DR2A 2CGWA 3BYSA 5KZ0A 3QZFA 4FKLA 4O2PA 4RC2A 1FOTA 3OUKA 5F4NA 3C0HA 2X2LA 4I3ZA 4V05A 3VQUA 3Q6UA 3UQCA 4UX9A 2J0LA 2VZ6A 3NWWA 4QP1A 4DFYA 4HYSA 3IGGA 5EYMA 3S2PA 3QZGA 4GU9A 4HZSA 3Q52A 2Z2WA 3KVWA 3ZLXA 3QQLA 4Q5EA 3BKBA 1SNXA 3ORLA 3R1YA 2HWOA 5HG5A 2QKWB 3OY1A 3PP0A 4ANLA 1MQBA 4QTEA 2VTQA 4FZDB 4GIIA 2VUWA 2CGXA 2HELA 1PKDA 4A4XA 2YM3A 1YWVA 5EDQA 4TWNA 4BCJA 3H30A 5CX9A 5M4CA 4YJPA 2P33A 3F5UA 4JAJA 2FSOX 4TY1A 3GFWA 4RVTA 5DVRA 5H8BA 4F4PA 2C68A 1JOWB 4NUSA 1GNGA 3CQUA 4TWOA 1F5QA 5C03A 3E62A 2IZRA 2G2IA 5JFSA 1PW2A 5M53A 1UNGA 3D5XA 3R7OA 3VBQA 4KIPA 5LWMA 3NIZA 3OCSA 4JBVA 3V8WA 2IZTA 1HOWA 2C3JA 3CXWA 2A19B 3P5KA 4I6QA 4NU1A 2ITNA 3E8NA 4AG8A 4RZVA 3EL8A 3BU5A 2O8YA 4DEIA 5E8UA 3CQEA 4LV5A 4PPCA 3GB2A 2ZM1A 4HGSA 3B2WA 4JR3A 4S2ZA 5CEMA 5LMKC 4OTHA 3OHTA 1ZXEA 2VTOA 4DHFA 5D7VA 4R3CA 3G33A 2X81A 4TTHB 2VTRA 3DZQA 2E9UA 4U3ZA 3HYHA 3SC1A 1JKSA 3EN9A 3EZRA 2GNLA 3FYKX 3IW4A 3U8WA 2BILB 5HG9A 5ANGA 4DFZE 2WIPA 4X21A 1FGKA 5CSPA 2IW6A 5LWNA 2OXXA 3ORXA 2C3IB 2XEYA 3TZ9A 4JAIA 4APCA 2X39A 3DJ6A 4IJ9A 3QYWA 3FSFA 4PMTA 3QRJA 4K18A 4S33A 3PJCA 4WOVA 3VUMA 3G0FA 3H9FA 3K5UA 4GW8A 4HNFA 3E93A 3R8LA 1XWSA 1Y8GA 4UYAA 4GJ2A 2OJFE 4R1YA 4P5ZA 4KABA 3SV0A 5EM8A 2WTJA 4NFNA 1GAGA 4I0RA 3LJ0A 1H26A 2YDKA 4M14A 5HLPA 3OWKA 3CQWA 4MBLA 4YBKA 2AC5A 4AT5A 4F9WA 3G9LX 1R78A 4QYGA 2RF9A 3EB0A 2XK6A 3DU8A 4GFMA 4EBVA 4YTIA 3PIXA 4FV9A 2R3GA 2BTSA 4L67A 2RFSA 3ZLWA 3FUPA 3S0OA 3MIYA 4UZHA 3MGYA 3R6XA 5ETFA 3TWJA 4AA0A 5CF5A 3QF9A 3QTWA 1KWPA 3TV6A 5KKRB 3W2CA 4DLIA 5EYKA 1BI8A 3U4UA 3AGMA 5AUUA 3HKOA 3RPVA 3AD6A 4CD0A 1RW8A 1SYKA 3DKCA 4U8ZA 5AP1A 3DCVA 4MYGA 4C4EA 2IVVA 3OROA 3PPJA 1Z9XA 2VNYA 3QD0A 3EQFA 4TYIA 2C3LA 3LZBA 4KRCA 5AV3A 4FV4A 5TT7A 4QPAA 3EQIA 3DB6A 3G51A 1GZ8A 4G5JA 4DGLC 5AX9A 3SX9A 4FV2A 3QXOA 3RI1A 3KMUA 4FTAA 4YGAA 1H8FA 1NY3A 4USFA 2E9VA 4ZSLA 4E4NA 4I92A 3DLSA 3FLWA 1WBNA 3GC9A 5L2SA 3ORKA 2J0JA 2XNGA 3HMIA 4RJ3A 4XH6A 4R3PA 3QRTA 4FSQA 3UIUA 4QOXA 4ZLYA 3PPZA 4A4OA 5CU6A 5CZIA 4N6YA 5CEQA 1RQQA 2ITWA 2C3KA 2UZNA 2ZB0A 4P4CA 4M0YA 5EDRA 3QA8A 3RPRA 1YXUA 2WU6A 3KXHA 3PXKA 3CBLA 3GC7A 5DR9A 2A2AA 4J71A 2XYUA 4H36A 3LFSA 4X2GA 5AP5A 5IH6A 4ZY6A 4Y85A 4BDEA 3PSBA 2OO8X 4FTCA 3KU2A 2A98A 2PZYA 3MSSA 5T6KA 4JRNA 3MB7A 4KINA 4C02A 1SVHA 3ROYA 3KRRA 1ZZLA 1OPJA 3HMNA 1JPAA 3NUPA 1XH8A 5BVWA 1IRKA 1KOAA 1YXSA 2ITVA 1JKTA 3QQFA 5I9YA 2GDOA 4FL1A 3LCSA 4DEDA 1PMVA 3KA0A 3KRWA 4YHTA 3QA0A 5E8TA 3BHYA 5JQ5A 3EFLA 3A7GA 5AIRA 3EFKA 2VTMA 2R4BA 2XUUA 1Q4LA 4FVRA 3UPZA 1J1BA 4EH8A 3HX4A 5HTIA 3R7YA 4X2NA 5FP5A 3TXOA 3IQ7A 3P86A 3O23A 1BI7A 4BCMA 4FTMA 2W5AA 4GL9A 3E3BX 5HD4A 4K77A 3LFCA 2HZIA 5E1SA 5JH6A 2G2FA 1XH6A 5ACBC 1YI3A 4TW9A 3VC4A 3A8WA 3AC3A 4OTPA 5LVPA 4E3CA 3MDYA 4J8MA 4QMXA 2OJJA 2WEVA 1P2AA 2W1ZA 2X9FA 3F2NA 3F7WA 3AMAA 2JIVA 4KBAA 2H6DA 5C27A 4Z3VA 3TUDA 2DQ7X 4FTIA 3VUIA 4ERKA 4TYJA 3U6HA 3RWPA 2C6DA 3R8VA 4EHGA 3CP9A 4IZAA 5F1ZA 2ZB1A 2ZM4A 2BVAA 1U46A 3D0EA 3QYZA 3KQ7A 4RFZA 3TTIA 1WFCA 4MK0A 4X3JA 4D4VA 2OIBA 5LJJA 1UWJA 3V5WA 1IG1A 4O0TA 4QQCA 5IEXA 3W8LA 2UW4A 4X2KA 1G3NA 5FQDC 1Q3DA 3EFJA 3SKCA 4D58A 3RAHA 5IA2A 4A9TA 2HK5A 2HOGA 2ZV9A 2R3IA 4Z16A 5BVOA 3KK8A 4WNPA 1GZKA 4QP9A 4ZEGA 3R9OA 4DITA 3JS2A 4O6LA 3BV2A 4LV8A 2UVXA 4I22A 3LQ8A 4ZTMA 4C4GA 3MVLA 3QTXA 4G6OA 4PV0A 4OTQA 4UY9A 3JY9A 4MBJA 5EW9A 3D4QA 4I6HA 3W2SA 3IK3A 1REJA 4C3PA 4FG9A 4FTQA 2J90A 5HNBA 4XG9A 3PVBA 3GCVA 4F0FA 1PYXA 2F9GA 5FDXA 2WMBA 3HRFA 3EYGA 4FBXA 4GUBA 4J95A 5CZHA 3PE1A 5DWRA 3UC3A 3EIDA 2KTYA 2YDIA 3GENA 2XA4A 2F7EE 3HZTA 2UZBA 4EOKA 3E7VA 3R1SA 5L2IA 3V6RA 1M2PA 4OBQA 1JBPE 4BCGA 4BGQA 3DJ7A 4G3CA 5IA1A 3NUXA 2AC3A 5CI6A 3DNEA 1H24A 2XH5A 5TE0A 3RPYA 2YFXA 3M11A 3ACJA 4RWKA 3FSKA 2V5QA 3LVPA 2WO6A 3QALE 5D41A 3THBA 4RX9A 2JEDA 4R6VA 4XUFA 4YTCA 2WTCA 3V8SA 1REKA 1AGWA 5AP7A 4AACA 4FZAB 3E7OA 2XBAA 3RM6A 1KE5A 4O4DA 4R8QA 4C3FA 1W2FA 1UV5A 3VUHA 3DXNA 2ITXA 5HLWA 3W8QA 2OI4X 2UW0A 4KA3A 5D10A 2CLQA 2XRUA 4C7TA 4RC4A 2VGPA 3ZTXA 2UW9A 2WD1A 3F61A 4RA5A 2WTWA 1GIJA 4IAFA 5EFQA 1XKKA 3R2YA 4S30A 1M2RA 3IW8A 2W05A 2WAJA 4FZ7A 3I79A 3Q5ZA 4O4BB 3NZ0A 3HRCA 1TQMA 4E4MA 4U97A 4ZOGA 4PF4A 4X2FA 3SQQA 2ZV8A 3LPBA 3Q9WA 4IDTA 2VTLA 2JKMA 1NA7A 2XK8A 3HVCA 3UP7A 2J5FA 2UZLA 2W1IA 4RPVA 5AR5A 3RZBA 2HIWA 3O8TA 4CFFA 3KF7A 4F9CA 4CFMA 2FSMX 3DQWA 4EOPA 5CEIA 3RPOA 1OKYA 4FF8A 3R01A 4FV3A 4CQGA 2C6OA 2QOLA 3M1SA 4Q5HA 2EB2A 4ZSJA 3ACKA 3BU6A 3UOJA 3KMMA 2QOQA 2CGVA 4RFYA 5C26A 4OAVB 1SM2A 1QPCA 3BI6A 3D9VA 4MCVA 3VBTA 1Z5MA 4RIOA 3QLGA 4FUXA 4O1OA 3Q4CA 4ITHA 5HO7A 3NX8A 5DIAA 5CF4A 4RT7A 3MJ1A 4DH5A 5FBNC 3WF5A 3R7VA 2B52A 4AE6A 5AMNA 3BWFA 3QHRA 1H00A 3EJ1A 3TKUA 5IH5A 2WIHA 3MVHA 4UBAA 4IMYA 1FMKA 4AN3A 4HOKA 4PMPA 2BRMA 3OVVA 2W7XA 2WQNA 3GC8A 4E4XA 4R5SA 3OMVA 3HV7A 2IZUA 5J87A 4YLLA 2EXCX 4QMZA 3C7QA 3D7TB 3VNTA 3FMMA 3LFFA 4ZZNA 1OMWA 3R1NA 1BLXA 2Y6OA 3QZHA 3BQCA 2WMWA 4MHAA 4PPBA 4B99A 1APME 2YM5A 3C4CA 2BAKA 4GU6A 4BTMA 4RJ5A 4FKOA 3C1XA 4OTFA 3V5JA 3KF4A 4RIYB 3OEZA 2R5TA 5KMJA 4L3PA 4RIWB 4RQKA 3ERKA 2GTMA 3NDMA 5E7RA 5AUYA 4PMMA 4ZSEA 2PMIA 4E26A 3OT3A 3UDBA 2NPQA 4EHZA 5J9LA 4G3FA 4FKQA 2YAAA 4IDVA 3PXYA 2YCRA 4M66A 2YABA 3Q4TA 5GJFA 3ZO1A 1Q8UA 2X6EA 3TJCA 3O7LD 4JDIA 4D1ZA 1GZNA 1CM8A 3A7HA 3GQLA 3ZM4A 2H96A 3RHKA 3ZFMA 4BBMA 4KB8A 5IUIA 4YC3A 2VWUA 5JZNA 2CSNA 4Q9ZA 4PNKA 4BHZA 5ANJA 4BGHA 5KMOA 4HZRA 3RCDA 5LMBA 3S1HA 3AOXA 1J1CA 2WMSA 3F5GA 3ZCLA 3CGOA 2V22A 3E8DA 2CN5A 4EOMA 4KIKA 4KBKA 4M67A 3DBDA 4FX3A 3VUGA 4MXZA 3KY2A 3RCJA 2WZJA 3R28A 3SHEA 4BYJA 3FLSA 4KSQA 3Q04A 4HYHA 4NWMA 5BX0A 3F66A 5FEQA 2IVTA 2W4KA 1WZYA 5TOZA 4L42A 3VS5A 2OU7A 2ZOQA 1O6LA 2QQ7A 3QTZA 4I5MA 3UIXA 3UO4A 4DGMA 4FUYA 4UWYA 3AQVA 3KB7A 4N4SA 1UU3A 4DFXE 3QX2A 3ZMMA 4CCUA 4ZLZA 3SW4A 4QQ5A 5H8GA 4WBBB 4W9WA 3MBLA 2WMUA 4R3RA 4E5AX 2VX3A 4AN9A 3UNKA 5HCXA 2VO6A 2W1DA 2X0GA 2X7OA 4GVAA 4U42A 3G6GA 4W9XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4O4E A;  1TZD A;  4O4B B;  2X0P A;  4FRF A;  1W2D A;  4O4F A;  2X0Q A;  2IF8 A;  2AQX A;  4O4D A;  2IEW A;  4O4C A;  1W2C A;  2A98 A;  2X0O A;  1W2F A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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