5HTIA

Crystal structure of c-met kinase domain in complex with lxm108
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
295
structure length
290
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of c-Met kinase domain in complex with LXM108
rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 91
structure length 290
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5htiA02
4L67A 3Q32A 4FKTA 2REIA 3IPHA 2IVVA 3R1NA 5J95A 5FM3A 1WMKA 3UQCA 3P79A 4TRLA 5HKMA 4UEUA 3NWWA 2OJFE 3V5PA 2R7IA 5GZ8A 1PMVA 4C4EA 2OIQA 2XIXA 1B38A 5HCZA 2W1IA 2BUJA 3QYZA 5KBRA 4P2KA 2AUHA 3FLSA 3DB8A 4G6OA 2GSFA 1IA8A 1JOWB 4AE6A 2GCDA 3O7LB 2WKMA 3IW4A 3VS0A 2WPAA 3ZU7A 4E73A 5JMSA 4C2VA 1Y8GA 4V04A 1H26A 4FTRA 3POZA 4OUCA 1CM8A 4X2GA 2B9JA 5KHXA 3LCOA 4CEGA 4NTTA 5HO8A 5JEBA 3WYYA 2B9FA 1XH8A 2OZAA 5E8WA 3HRCA 3AGLA 4NIFA 3UVQA 3WI6A 5ACKA 3ZXZA 3QQKA 5AUWA 4RX9A 1GZNA 1XQZA 4XG9A 4BCGA 5K5NA 1SVEA 2G2FA 3A7FA 4R5SA 2FVDA 4K18A 4X7QA 4LGDA 4YSMA 3ET7A 5H9BA 5H8GA 5I3OA 3T8OA 3DQWA 2O64A 5AX3A 3ZZEA 4L3JA 2CLQA 2PWLA 4O1PA 3U6IA 4RJ5A 5E8VA 4RJ6A 1Y6AA 2WXVA 3WIKA 5H3QA 4C36A 4D5KA 2OW3A 4W4XA 3RK7A 5LVNA 3MS9A 1XBCA 3UVRA 3ITZA 3V6SA 2FSOX 5HTIA 1OKWA 4F9WA 5A54A 5DGZA 1P4FA 2H8HA 2VTTA 4AOIA 5C03A 2B4SB 3R83A 4L3LA 1WBVA 3ZO4A 5IH6A 3S0OA 3I1AA 4FIGA 1PHKA 5TR6A 3RBWA 4XRJA 3QA0A 3ZRKA 2X8IA 3SD0A 2JDOA 2EUFB 3BU3A 2VGPA 3WF9A 2UZUE 3KL8A 5JZNA 3FZSA 3W2CA 4BCQA 5C8NA 5FG8A 3ZHPC 3BKBA 4ANQA 3IW6A 5HD4A 4QMUA 3NR9A 2XKCA 3LVPA 3RNYA 5BUIA 5JRSA 2YCQA 2V7OA 4U42A 5AUZA 4AAAA 3UPXA 4LUDA 4BGQA 4IAZA 4BDHA 5CEPA 5DR2A 2EB2A 1SNXA 4FTUA 4I22A 3PVUA 4F9BA 3RP9A 2UW6A 2WQEA 5ANIA 3BPRA 4YHTA 4UX9A 1KV1A 2Y8OA 3CD8A 4HNFA 4UB7A 5J87A 5DVRA 2QR7A 3RPVA 4BKYA 3R7VA 3IDCA 4C61A 2OH0E 3O8TA 1M7NA 3PG1A 4M12A 4HZSA 4WG5A 3TG1A 1F5QA 1MRVA 4ZLZA 3V8TA 4PTEA 4ZTHA 1SMHA 1YXUA 3MFRA 2VTJA 3Q52A 5IMXA 2VTSA 3VS6A 4RX5A 5L2TA 4DLJA 2WU7A 5FRIA 4FTKA 4QMZA 3LHJA 3BI6A 2OI4X 4YJNA 5BQ0A 3SXSA 2XNMA 2O2UA 3G9LX 3HV6A 3AC5A 2P33A 2PL0A 2WELA 2YM6A 3PVGA 3SXFA 3VUKA 4FK6A 3UO6A 1EH4A 3LFFA 4N4SA 2OIBA 3PZEA 3RAHA 3OMVA 3SDJA 3HGKA 4TWPA 4FBXA 2YDIA 5JH6A 2W1DA 3R9DA 4QP8A 3HMPA 2HW6A 2CPKE 4O22A 2WEVA 1OIUA 3DCVA 3QHWA 4UXQA 4IC8A 4DFZE 3BHHA 4RWJA 1QPJA 3VF9A 3VULA 3H9RA 3HRBA 4PL4A 4IFCA 3ROYA 4BTKA 3K2LA 1Q97A 4RVLA 4L46A 2W1ZA 1ZY4A 2PVNA 3IONA 4PPAA 3W33A 3TKUA 4XLVA 1R39A 2ETMA 2BPMA 4KS7A 4NSTA 4TWCA 3CPBA 2HK5A 2QOIA 3HVCA 3NAXA 4NM5A 3IOKA 1REKA 2V7AA 4E7WA 5FDPA 2V55A 3V5QA 4FZAB 2PZYA 2OXYA 3BRBA 3UP2A 4DGMA 5A6OA 4CFNA 2VTIA 2CKEA 3O23A 4KD1A 4LL0A 5CI6A 4HGSA 3MFTA 3W8QA 4BIBA 3Q6UA 5CU3A 4FTLA 4EH9A 1R0EA 3B8QA 4QP4A 2LAVA 5C26A 5KMIA 4QTCA 3GQLA 3I81A 4F7SA 2FSTX 1YOJA 4X2KA 5A4LA 3VUIA 3QCXA 5HG9A 4IVAA 4JDIA 5ETCA 3PPJA 4FMQA 4RIYB 4EZ3A 4PMTA 5FDXA 2R3FA 3DKOA 4I93A 2IWIA 4FKWA 3L9LA 3R9HA 3JY9A 4YJSA 2XEYA 2OJIA 5J9YA 2BVAA 2UW0A 3MY1A 3PSDA 2UV2A 4QTAA 3U9CA 2UW7A 3NEWA 4PL3A 1CKJA 5IISA 5JN2A 2FO0A 4FUXA 4O0YA 3WE8A 2VWYA 1MQBA 2ITTA 4AACA 4O0RA 2OGVA 4TNBA 1JAMA 2ITOA 4WKQA 2QOKA 5KMKA 3QUEA 2R3NA 3KXHA 4XOZA 3CBLA 1KOAA 5BVKA 4RBLA 4U0IA 1Y8YA 4GL9A 4E5AX 2WFYA 3VJOA 3LMGA 4IX5A 1O9UA 3TKIA 3QD4A 4E20A 5L6PA 4GCJA 4EOJA 4ZAUA 3B2WA 1OECA 4U43A 4V0GB 1ZRZA 1PJKA 3WOWA 3KCFA 2R0IA 2XIYA 1YKRA 5CVGA 4I5CA 3MH3A 1ZLTA 1P5EA 2ZYBA 1Q8ZA 1PY5A 2ITNA 2QONA 4O0XA 5AX9A 3RVGA 4YO4A 4YMJA 3SC1A 2UZVA 3WF8A 5C8MA 2VD5A 4JBVA 4ZZNA 1SM2A 3OBGA 3OZ6A 3DS6A 3GQIA 3FZ1A 1OL7A 3G6GA 3BELA 4YLLA 4WRSA 4FV8A 5HE3A 4M69B 4KIPA 2QOCA 3KB7A 3F2AA 4GJ3A 5AIRA 4U41A 2C6TA 2W1EA 4BDCA 5J5SA 2VTLA 4L43A 4NJDA 2UVYA 3RZBA 3ENHA 2C3LA 1WFCA 4PUZA 4U5JA 5CENA 2C0IA 3CEKA 3CQEA 4B7TA 3CTJA 5TKDA 2W05A 3WBLA 3QTZA 3RM7A 4Z9LA 2ETRA 3BGZA 3T9TA 3A62A 4JDKA 4ZJIA 2XBJA 1Y57A 4EK8A 3D14A 3GU5A 4OGRA 2OXXA 3QRJA 3SW4A 2A0CX 1YRPA 1IR3A 2BRBA 4X0MA 5HBJA 2C3IB 2RFEA 2HOGA 4DH5A 4YTHA 4FSQA 3GT8A 3KQ7A 4HCUA 4C34A 4Y72A 4YJRA 4EOLA 3EKNA 2XCKA 2J9MA 4ERKA 2YA9A 4XG6A 2X6DA 5T3QA 3AXWA 5CEQA 2O65A 5IH5A 5KMOA 5F9EA 2OH4A 4I0RA 3TI1A 2A4LA 3D94A 4ASDA 4L8MA 3VVHA 5DN3A 3NYOA 4BDBA 3QKKA 3COKA 2OJ9A 4RQKA 2IZSA 3PA4A 4UV0A 4WSYA 4ZLOA 3UYTA 4DFLA 5CAUA 4QO9A 2R3MA 2GS6A 5HQ0A 1OGUA 4BF2A 3DBQA 5AV0A 3UG2A 4FKJA 3HV4A 4RC4A 1NVQA 2HZ4A 4D28A 2P2IA 3D7TB 1OL6A 4LM5A 1FPUA 1SYKA 4FOCA 1Z5MA 2WNTA 1BX6A 3CCNA 3GCQA 3KF4A 4G9CA 4H58A 4MBLA 4N6YA 4UWBA 5CALA 3QXOA 1ZOEA 2YM8A 2FSMX 5HU9A 4HGEA 5HBHA 3H3CA 3VUDA 4HW7A 2FB8A 2P3GX 3HV7A 2GU8A 4GFOA 2OSCA 4D5HA 1H07A 2VTOA 4UZHA 1WBOA 3FI3A 2X6EA 1J3HA 3CE3A 4NEUA 4ZZOA 3I60A 4PTGA 5CNNA 2R3IA 2CDZA 3QU0A 4Q9ZA 3QD0A 3PY0A 4XG8A 3A7IA 2VO0A 4QPMA 1OPKA 1XH6A 4NKSA 3FL4A 3AMBA 4IW0A 2Y7JA 4KIKA 4UYAA 4QTEA 2BILB 3H0ZA 2XVDA 5JQ8A 3QZFA 5HI2A 3LZBA 3IOPA 4AZEA 4K8AA 4DYMA 3NW7A 3OUKA 3EQHA 5DEWA 2XYUA 1GIJA 3AT2A 3TXOA 4NZWB 4ZTNA 4EH4A 2XH5A 3A4PA 3TZ9A 4ZSAA 5CASA 3CLYA 4BYIA 1PMNA 4CZTA 4LOPA 2QC6A 4GT4A 5AV4A 3RZFA 4JR7A 3C0HA 3R8MA 3E92A 4I21A 3BV2A 4ZEGA 3P0MA 4HVIA 5IA4A 5T68A 2RSVA 2VX1A 4E6QA 4CT2A 4XYFA 4OTHA 4XV9A 3FXXA 5M55A 3BE2A 4L6QA 2DYLA 3HL7A 4CKIA 2C4GA 5GHVA 4ALVA 3F3TA 4FF8A 1JSTA 5JRQA 2ETKA 4JG6A 4MQ1A 3DTWA 3U9NA 2J90A 1L3RE 1SZMA 4D0XA 4DEEA 4UWCA 1ZYJA 3LFBA 1AD5A 2VWIA 1FMOE 1NXKA 2VX0A 3L8XA 4QMOA 5EHLA 5CYIA 3NX8A 5KMLA 3KVXA 5M4UA 3UIMA 4I4EA 4W4WA 4Y85A 1X8BA 3AQVA 5HX8A 4I5MA 4BCOA 3NUSA 1FOTA 3WF7A 4FTOA 5IA2A 4X3JA 3HYHA 1KE9A 4FV2A 1G5SA 3R01A 2XIZA 4FV3A 2OO8X 3U4WA 2VTMA 3EQBA 3FMKA 1M2RA 3LJ0A 4TN6A 3F3VA 2W0JA 3BV3A 5HVKA 3OXZA 3FQSA 4I92A 4YJTA 3P7CA 4C58A 1W83A 2BDFA 3BU6A 3BLHA 3F7WA 3O96A 4NK9A 2JDSA 3P9JA 4TZRA 4ANBA 4MNFA 2WMRA 1OVEA 2R5TA 2VWVA 2WD1A 2WTKC 3FL5A 4JIKA 5L4QA 4F08A 5EI6A 3PXRA 2W17A 3O2MA 3E7VA 2YM4A 5ETIA 3I4BA 3V5JA 3CY2A 2VWXA 5HCYA 3C4CA 3BX5A 4II5A 4RVKA 4AZFA 4CCBA 5AAGA 4IM0A 4C4HA 5H2UA 1JSUA 2BRMA 3NNVA 2IW9A 1WZYA 3I7BA 4KSQA 2QCSA 2VRXA 4LGGA 1H08A 2JAVA 3QYWA 3TUCA 4XG7A 3H10A 4FA2A 4USDA 1H00A 1WCCA 2R3GA 5CLPA 1YWNA 3ZS5A 4GMYA 4A9RA 4IJ9A 3L9PA 3O7LD 1RE8A 3NCGA 4YU2A 2P0CA 2UZDA 3DGKA 2PMIA 2XRWA 2G9XA 4FYOA 4A9SA 3TL8A 4ID7A 2JKKA 4QQTA 1XJDA 3QWKA 4FIFA 3UE4A 5C9CA 3AT4A 3GEQA 3L9NA 1FGKA 1YDSE 1YW2A 4YZNA 5IG1A 4LRKA 5E8XA 3GU7A 4FZDB 3SQQA 3OEFX 4D2RA 2JAMA 4FTCA 2WMWA 1PXKA 4MH7A 3SA0A 3EZRA 4FKUA 2C5VA 2OF2A 1P4OA 3LFEA 2WEIA 4AXAA 3DOGA 3TWJA 3ORLA 2PTKA 3LCDA 2GS7A 3FPMA 3G0FA 3GU8A 3WIGA 3QX4A 4APPA 3HNGA 2WTJA 4K1BA 3ZMMA 5E92A 5A46A 4U8ZA 1SVHA 4HJOA 4HYHA 4K33A 3HDMA 3KFAA 4FK3A 4H3PA 2QODA 3TTJA 5I9YA 5IMEA 5CT0A 2AYPA 4YC8A 4YGAA 3VNTA 4AQCA 3QRTA 3ODYX 4HYIA 1S9IA 4FI1A 3TNPC 3OF0A 1V0OA 4D4YA 4QQCA 3G9NA 5A14A 4DG2E 2OZOA 2YLFA 4GYIA 4RIOA 5J79A 4TT7A 3ZYAA 2Y4IC 3TV4A 3ENMA 2C6EA 4P5QA 3HLLA 4ZTLA 4I3ZA 4QPAA 3FMHA 3C4FA 3EMGA 4QP6A 4GW8A 1E1XA 5AR3A 2F7ZE 4G2FA 4MHAA 2XNGA 4JNWA 2XIKA 5AA9A 5AIKA 3NYNA 4M0YA 1IG1A 2AC3A 3G51A 4KBAA 4QP7A 4E4LA 1Y91A 4BIEA 1LP4A 1Q8WA 5CY3A 3VQHA 5KO1A 3PJ8A 3VW8A 3MV5A 4KABA 1MRUA 2W1CA 3EN9A 4IWOA 2W1GA 3WF5A 4AU8A 5DNRA 5CAOA 2ZM4A 3R04A 3Q53A 1H1RA 3VRZA 3NYVA 4YTIA 3VC4A 4M7IA 4MD8E 3W2SA 4BC6A 3FQHA 5HE1A 2PHKA 3PJCA 5HU3A 1JQHA 4W9WA 4F7NA 3LIJA 3EZVA 4UBAA 1LEZA 3ZTXA 3ZOSA 4NCTC 2VUWA 3E62A 5E7RA 4EI4A 3PA3A 4RGJA 5LMKC 4PNKA 2X7GA 3BYSA 5CQWA 2YHVA 4FT0A 3CTHA 4HZRA 2RFDA 3VBQA 4A4LA 3CJFA 4N70A 4UALA 2CSNA 5HIEA 4WA9A 5CF5A 4BYJA 2WQNA 5CI7A 4O0UA 5D12A 3D5WA 2Z2WA 1OIQA 3ORIA 2OG8A 4QYGA 2JEDA 5T6KA 5IEYA 4XBUA 5I3RA 3PIYA 5D7AA 3CIKA 5B2KA 3FLZA 2XMYA 3C4XA 3LM0A 4JRVA 2YM3A 5TOZA 4ACCA 4BGHA 4IB3A 3QUDA 4I41A 3KY2A 4FNZA 4GSBA 2GNJA 3C0GA 4C4FA 4RC3A 2QQ7A 2OK1A 5KMMA 3ORTA 2HXLA 3O0GA 4DC2A 4B0GA 3AD6A 3EIDA 3G2FA 3OC1A 3QX2A 2UW4A 4NT4A 3VUTA 4E4MA 5FM2A 1JPAA 1TVOA 1K9AA 2B7AA 4FZ7A 5FP6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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