5CEMA

Pseudokinase and c-terminal extension of human tribbles homolog 1
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
277
structure length
252
Chain Sequence
PSRIADYLLLPLAEREHVSRALCIHTGRELRCKVFPIKHYQDKIRPYIQLPSNITGIVEVILGETKAYVFFEKDFGDMHSYVRSRKRLREEEAARLFKQIVSAVAHCHQSAIVLGDLKLRKFVFSTEERTQLRLESLEDALSDKHGCPAYVSPEILNTTGTYSGKAADVWSLGVMLYTLLVGRYPFHDSDPSALFSKIRRGQFCIPEHISPKARCLIRSLLRREPSERLTAPEILLHPWFESVLIVPEYQED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Molecular Mechanism of CCAAT-Enhancer Binding Protein Recruitment by the TRIB1 Pseudokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tribbles homolog 1
total genus 78
structure length 252
sequence length 277
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5cemA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5cemA01
2JC6A 4FL1A 3F7WA 3OROA 4U7ZA 3SW4A 3C1XA 3EQFA 2W5BA 4ITIA 4FKLA 5CEPA 5HX6A 2NNWB 2YZLA 3HKOA 4GFGA 5JFVA 4IHPA 4YURA 1R0PA 1Q4LA 3GOPA 3E3BX 4PDYA 4B8MA 3DZOA 3LW0A 3H9RA 4MTAA 4JR3A 2BIKB 4L7FA 2YERA 4X2NA 3RPYA 3PJ8A 2ZJWA 1PW2A 3Q5ZA 3SOCA 3U4WA 1REJA 3UNJA 4DGOA 1Q8WA 2BROA 4QMWA 4G6NA 3L9LA 2QD9A 2GNFA 2FH9A 3BELA 4BIDA 2BILB 3FLWA 4PL5A 2BTSA 5A9UA 4CFUA 3G6HA 2XIYA 4GIHA 4IVAA 4D2RA 4C61A 3BHUA 3FXWA 3ET7A 4CTBA 4TWCA 2OJJA 3KXXA 3TEIA 4BDDA 1AQ1A 1Q3WA 1WMKA 2VNWA 2ETMA 3EQCA 3EZRA 1GIHA 4L45A 1YHVA 4YC6A 3QD0A 4QMQA 1J7UA 5CXZA 4M68A 4J71A 1W0XC 5A54A 1JBPE 3BHTA 5M08A 3OTVA 1XBAA 5GIPE 1Z57A 2BIYA 2UZDA 4D4RA 3R22A 3DTCA 2YABA 4BKYA 4RMZA 1KUTA 3DPKA 3GOKA 4PNIA 3RAKA 2ZYBA 3RI1A 3VUHA 4DINA 4G6OA 4FG8A 4NIFA 3PSBA 4O38A 2BALA 4RPVA 2QHNA 4W4VA 3FL4A 5AP6A 5L8LA 4KIPA 5K0KA 3OVVA 3OBJA 3P79A 4OTQA 3R8LA 5LVMA 1H8FA 3ODZX 4XLVA 4GJ3A 5HOAA 3UBDA 4EL9A 3SKCA 2HXQA 5JEBA 3GU6A 2W7XA 1M2RA 4FIFA 4K2RA 4CLJA 1YKRA 2B9FA 4L3PA 5ANOA 3QCXA 3R6XA 2UUEA 4JAJA 1Y8GA 3I7BA 4I5HA 4FSZA 2WOUA 4I41A 4AOJA 4D1ZA 2VD5A 1BL6A 1FGIA 2JDVA 2OW3A 3HUCA 4BHNA 2NRYA 3FLNC 4OLIA 2F49A 2FA2A 4Z3VA 5HGIA 5DT3A 4ACCA 1YVJA 3I0OA 3LAUA 2UVXA 4DFXE 2CKPA 4FIIA 4E4XA 3ZZWA 5HORA 3D4QA 4C3FA 1M14A 3MYGA 4KB8A 3OCBA 2CDZA 4FVQA 3TZMA 2ETKA 4MX9A 2X7OA 4IWOA 5F20A 1ZY5A 2E9UA 3A4OX 3V5WA 4EUUA 4P4CA 2O2UA 1WVWA 4EK5A 2X6EA 3CD3A 3Q04A 1Q8UA 5AX9A 3QTIA 4HZSA 2YAAA 4C4IA 3II5A 4QP7A 1PJKA 3MB7A 4IAFA 4E6CA 5IEXA 1UU9A 3F6XA 3MFRA 3OXTA 4KABA 4XRLA 1Y6AA 4IBMA 3R0TA 1YI3A 4U6RA 2RF9A 3S4QA 4B7TA 2WTKC 4XHKB 4DH1A 2X4FA 2QG7A 2PVFA 4JQ8A 3OWLA 5CALA 4XJ0A 4D4SA 5IISA 5E8ZA 3OCGA 4LGGA 5L2WA 2F4JA 3IPHA 3UIBA 4UX9A 5HE3A 2OWBA 4ZS4A 3NCGA 4FE2A 3QZHA 3SAYA 4L00A 2UW4A 2YN8A 4DEEA 3NUNA 2UVYA 4JBVA 3ORXA 2PYWA 1UNLA 2X1NA 2JKKA 4FT7A 4WG3A 4Y83A 5HLWA 1BLXA 3ROCA 3UG2A 2WZJA 4M8TA 3ERKA 4FTKA 4FV4A 3ZSIA 4F9WA 2XK4A 3R1QA 5E92A 3R00A 2E9NA 3OXIA 4RFMA 4H39A 4TPTA 4MQ2A 4BCOA 2B7AA 4XLIA 5JRSA 3TI1A 2G01A 2VWYA 5DT0A 4EK4A 4BCNA 2VWZA 2PE1A 5TE0A 4O22A 1TKIA 2YWVA 5L6PA 4AW5A 2BCJA 2PZIA 4MD9E 4YO6A 4O82A 5GJGA 1Y57A 4GK2A 4BZOA 2E2BA 1ZY4A 4BIBA 5TF9A 3VS0A 3C51A 3NUSA 3B2TA 1GAGA 2YZAA 4PUZA 2O65A 4AUAA 5IH6A 3UOHA 3LCDA 2VTRA 2HY81 3DKGA 3TJCA 3DBFA 3IONA 3KULB 4FBXA 3LFDA 4R7IA 4BGHA 4A07A 4DGGA 4EWQA 3JR1A 4W8DA 1G3NA 3K3JA 1G8AA 4BI0A 2CMWA 4BGQA 4I1ZA 2ZAZA 2C0IA 3EL8A 2ITVA 4N6YA 3CGOA 5IA3A 2A19B 2B54A 4J8MA 4AW2A 5JFXA 4E4NA 1MRVA 2AC3A 2ITTA 2OIBA 5CY3A 1OBDA 2ERZE 3FQHA 3D83A 5D1JA 4PL3A 2YIYA 4RJ5A 4DEHA 5AUXA 2JKOA 3ZUTA 5HVKA 5CVGA 4DEGA 2XIRA 2F7XE 3PP1A 2YDJA 4O0TA 4U42A 5DA3A 4LM5A 3UC4A 2XM8A 3QQFA 1GOLA 1OL2A 2CPKE 4JBQA 5ICPA 3VBTA 1L8TA 1OIUA 4ZSLA 4S32A 4IZYA 4FA2A 2X9EA 4V0GB 4KA3A 5AAGA 3SG9A 2R64A 5KKRB 2YCSA 3FMEA 3OWKA 3HV4A 2GMXA 5IKWA 1OKVA 5T3QA 1OITA 2DWBA 5CU6A 5IA5A 2V22A 3HMNA 4FI1A 4YZDA 2X8DA 5HG7A 3ZRMA 3ZLYA 2OG8A 1E1VA 2XUUA 4EC9A 4RQKA 1ZLTA 2DS1A 2I0HA 3QWKA 2R0UA 4BL1A 3JYAA 5I9VA 4I0RA 2BHEA 3O7LB 4MNEB 4YZBA 5CANA 4GH2A 1J7LA 3JPVA 5BVWA 2VTIA 4QMVA 3I7CA 4U45A 3ZEWA 2BRMA 3ZSHA 4EHVA 3NZ0A 4K9YA 4TYHA 4XG2A 3DBCA 4ALWA 3AGLA 3EIDA 3M11A 3FZOA 3O51A 4M67A 3HRBA 4W9WA 3ETAA 3HLLA 5IA1A 5HG9A 4O7YA 1YI4A 5H8EA 3EWHA 1XWSA 2YJSA 1QPEA 4MH7A 3IKAA 4PDSA 3NWWA 4ZAUA 3ZLXA 4BCPA 1S9JA 4NJ3A 2FSOX 4NWMA 3VBWA 4BI1A 4DE4A 2OK1A 3FLSA 2W9FB 4BCFA 1UWJA 1BUHA 3BYOA 4L9IA 4A4OA 2J0MB 5KUPA 3P86A 4LQMA 3W1FA 3WZUA 2F2UA 4E5BA 2OFVA 3BE2A 3FI2A 3PJ3A 4MBJA 3F2RA 4RJ6A 5EH0A 3VRZA 2JDRA 1B38A 2C6TA 2EB2A 2ZV9A 3KN6A 3R28A 2XCHA 3EFWA 3ZBXA 2OLCA 4I93A 4CNHA 3PLAE 3QAME 2YISA 4YPSA 4KIQA 5K4IA 5CVFA 3Q9XA 4UWBA 4QTEA 2OGVA 2XJ1A 1Q99A 4PMMA 1V1KA 3ZLSA 3V3VA 4GW8A 1VYWA 3G5DA 4FZ6A 4F9CA 4CMTA 4FTQA 3TWJA 4EYMA 3OEZA 2WMUA 3RPRA 4PQNA 3PTGA 2I1MA 3ACJA 2ZVAA 3LFAA 5E8YA 2UV2A 3DNEA 3HECA 2YM6A 3FSKA 3FE3A 3OXZA 5CI7A 4BB4A 3H4JA 4O6EA 2R5TA 2YACA 4CZUA 4F9BA 3HMIA 1OKYA 4MF0A 3P23A 5CSWA 2XK9A 3V8TA 2B55A 4RVKA 2H9VA 4RIXB 3OOGA 2HWOA 3UPXA 4PPBA 2UZUE 5M44A 4X2FA 5M56A 2IJMA 3HDMA 4BDBA 2OZAA 3LMHA 1BI8A 3KEXA 4FIJA 4FEQA 2PVJA 3A4PA 5ANIA 1J3HA 3IG7A 1U5RA 1H0WA 2VRXA 4CD0A 4YNEA 3OFMA 4QTDA 2V7AA 3MIAA 4RLKA 5IG1A 4XG9A 3DU8A 4MVFA 5AAFA 3QQHA 5IQIA 2JITA 1GY3A 4FYOA 5AA9A 3UVQA 1OL7A 3IDCA 1VZOA 1SZMA 2WIPA 2H34A 4FT0A 2IW8A 3LJ1A 3PDTA 3KMUA 5B2KA 2JAMA 3VWAA 4U97A 4FV9A 5AUYA 5L4QA 3AC2A 3KXHA 4D1SA 3TKUA 1WBTA 1YXSA 2KTYA 5IQAA 3Q2JA 4X3FC 5L2SA 4ZTNA 1DAWA 2Z7RA 4Y5QA 3DV3A 4MBIA 5B0XA 4EHGA 2PHKA 5BYYA 3L9PA 2R3GA 5GINE 1K2PA 4RSSA 3W32A 4AXAA 4DFBA 5EW3A 5IQHA 4UWYA 2JD5A 4J1RA 5CU0A 2VU3A 3DFAA 2VTQA 3NYOA 2C68A 3VBQA 5LWMA 3LM5A 4C7TA 3T9IA 3NAXA 4BTJA 3BLRA 4FSTA 1NY3A 4U81A 4BYIA 4PMTA 5E8WA 3A62A 3VULA 5CAPA 4FTIA 5J1VA 5FP6A 4YR8A 3ZZEA 4TTHB 5IZFA 3KXZA 4UV0A 3NNVA 5EM8A 4BVUA 5KHXA 3AXWA 3A60A 3QC9A 3WI6A 1IA8A 3RPVA 4UALA 5CZIA 4AGCA 1E1XA 4FEWA 5ETIA 1JQHA 2PZYA 3CY3A 3MB6A 4HGEA 4DHFA 1U54B 3GCPA 4GEOA 5JRQA 3R02A 3KY2A 1CKPA 2J4ZA 2YJRA 4O96A 2EU9A 4Q2AA 3TIZA 1QMZA 5B7VA 3W16A 2Q0NA 2WMWA 5EW8A 4TWOA 3L9MA 2Z02A 4MXYA 3OG7A 4AZFA 1M7NA 3OY1A 1NW1A 4NEUA 3DLZA 3TIYA 4DFZE 3FL5A 4GFMA 1R1WA 4RBLA 4X2KA 2YIWA 3PA5A 4X3FA 4CFFA 1QCFA 4K77A 3JVSA 3NR9A 1ZARA 5C8NA 3MPTA 4O83A 5I9XA 3VRYA 2IVSA 4TYEA 4NM7A 1WBSA 2VV9A 4CMOA 4DYMA 3MY5A 2EWAA 2QKRA 3ZLWA 2Y4IC 5CXHA 5FTGA 5J8IA 2XBJA 4RIOA 4ONAA 3BGZA 5CS6A 2C5YA 3MH3A 4HYIA 2E9VA 3E8NA 4IX5A 3AG9A 4ANBA 3DKOA 1W84A 5JGDA 4J99A 5HCXA 3QCYA 4QO9A 5DWRA 2GNJA 3RKBA 1G5SA 3WE4A 2OIQA 4ZSEA 1KE5A 4RG0A 1OPJA 3PJ2A 1SVEA 1YHSA 4C2WA 3IQ7A 2NPQA 4FMQA 2OH4A 2A2AA 2ZM3A 4MD7E 3QCQA 2J0LA 3W55A 5CEOA 4O7RA 4QPMA 4ZLOA 2WEVA 2X2KA 2VTMA 4FVRA 3A7IA 3KU2A 4IZ5A 4RVMA 5CF5A 1U5QA 3QD3A 4R7HA 3DQXA 2Y6OA 4D4YA 1PXOA 4C02A 2QHMA 5AWMA 2XCKA 3MY1A 3NPCA 2BMCA 4YC3A 5EYMA 2H8HA 4ZY6A 3ULZA 1Q8ZA 1K3AA 5EYDA 2OF4A 2RFNA 4AT3A 3RZFA 4YHFA 4WG4A 5CF4A 2W1DA 2IW6A 2XKCA 4CZYB 2J0KA 3FYJX 2WTDA 5JQ8A 2XEYA 3EQGA 4R3CA 1XJDA 3RZBA 3BI6A 2I0YA 2PVLA 2WB8A 3M42A 4M15A 4OUCA 4LOQA 4DEAA 3P7BA 2UW3A 5FGKA 3LQ8A 3UQGA 5DEYA 5LCKA 3GQLA 4B8LA 5JZJA 5FEEA 5BUEA 5EK7A 5BUJA 2WMSA 3BRBA 3VS3A 5EI8A 5BNJA 3O2MA 4Z55A 3DXPA 3OUKA 3LFCA 3R1YA 4UMTA 3FZSA 4AX8A 2BDFA 5EFQA 5KMOA 4ALVA 4DTBA 2IZSA 5CNNA 4AOIA 3QZGA 3BEAA 2H96A 5CQWA 5DH3A 3OEFX 1E9HA 2QG5A 4FG7A 3W8QA 4YSJA 4IVBA 3TUDA 3UMWA 3QQJA 2W1HA 2JFMA 4L6QA 4J53A 3E64A 4KIKB 4O0XA 4EEVA 4QTCA 3QXOA 4FSQA 3WYYA 1DAYA 4EWHA 5F95A 3LJ0A 1FQ1B 2F7ZE 4N70A 5E8UA 5BMMA 5LXMA 3TNHA 4EH7A 4DN5A 4O7NA 5J9LA 3PVBA 2YM8A 4ZJJA 4QQCA 1FVTA 5HBEA 3R2YA 2J50A 5M4FA 3WZDA 2R3JA 5DR6A 5CSVA 3D14A 1H25A 4EQCA 2VTHA 3O0GA 3QLGA 3FMNA 2V62A 3OD6X 3C4WA 4LV8A 4AT5A 3FI4A 4XV3A 4DT8A 5FDPA 5LMBA 4RA4A 3I5ZA 4AN9A 4XP2A 1WBWA 5EQYA 2BRBA 3VW6A 4DGMA 5FEDA 5IEVA 3PY0A 3TG1A 3UIUA 3KREA 2PMNX 4C3RA 2XNPA 4H3BA 2BAJA 4I6QA 4L53A 4QT1A 2QOIA 4I21A 2F9GA 4IEBA 4WUNA 3R73A 3F5XA 4YO4A 5DYJA 4PRJA 3VS4A 3F88A 4I5PA 2HAKA 5HIBA 4N0SA 1KE6A 4C2VA 1GJOA 2RL5A 3VS6A 5E7RA 3OHTA 4CT1A 4D4VA 5HBJA 3VUGA 1HCLA 3FPMA 2CN8A 4FSRA 3R7IA 4YBJA 3UO5A 5GZ8A 1OIQA 5CYIA 3OBGA 3N4TA 2X7FA 4YZNA 3TUBA 4G31A 4LOOA 1PXLA 2J9MA 2XKFA 3ORIA 3H0ZA 2C0TA 5KMJA 3NCZA 3E8CA 3QA0A 3ZMMA 4D0WA 4GG7A 3TCPA 5LVLA 4BIEA 4BTKA 1RW8A 2C3JA 4BDIA 5CU4A 3CTQA 2RKUA 4ANOA 3R1NA 3VUTA 4GUEA 3LXPA 4PV0A 3QRTA 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