2KULA

Solution structure of human vaccinia related kinase 1(vrk1)
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
MPRVKAAQAGRQSSAKRHLAEQFAVGEIITDMAKKEWKVGLPIGQGGFGCIYLADMNSSESVGSDAPCVVKVEPSDNGPLFTELKFYQRAAKPEQIQKWIRTRKLKYLGVPKYWGSGLHDKNGKSYRFMIMDRFGSDLQKIYEANAKRFSRKTVLQLSLRILDILEYIHEHEYVHGDIKASNLLLNYKNPDQVYLVDYGLAYRYCPEGVHKEYKEDPKRCHDGTIEFTSIDAHNGVAPSRRGDLEILGYCMIQWLTGHLPWEDNLKDPKYVRDSKIRYRENIASLMDKCFPEKNKPGEIAKYMETVKLLDYTEKPLYENLRDILLQGLKAIGSKDDGKLDLSVVENGGLKAKTITKKRKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Solution structure of human vaccinia related kinase 1(VRK1)
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase VRK1
total genus 93
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2kulA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2kulA01
2OK1A 1M52A 2VWVA 2WTIA 3BIZA 3MGYA 2NPQA 2R3FA 3A99A 4I4EA 4IZAA 3EZVA 4DTKA 5KMJA 5KHXA 2ZAZA 3QCSA 4G3EA 3WF7A 3ZU7A 2OICA 1AGWA 3I6WA 3R8VA 5ANGA 1J1BA 4DFLA 5AUTA 2DWBA 2J2IB 2WEIA 3TZ9A 2GFSA 2C6IA 3EFKA 3FJQE 5J8IA 1KE9A 2JGZA 3FXXA 5GJDA 2C6LA 4EL9A 2XUUA 1KOBA 5J9YA 4X2FA 5CY3A 3S0OA 5DR9A 3CY2A 5J5TA 3I60A 4RWLA 5A4TA 2V5QA 1DM2A 5JZNA 3TXOA 4XOZA 2YCFA 3OCBA 4Q9ZA 4S33A 3UZPA 2WIHA 3SXSA 2G2FA 5DH3A 4HYUA 2IPXA 5AR2A 2OXXA 2ZDUA 3MDYA 5TKDA 2H6DA 1I09A 4FIIA 4DITA 4ZMFA 3H9FA 4BGHA 1Q61A 5CEIA 4X21A 2ONLC 3H30A 4FV6A 3DGKA 3FLSA 3KA0A 3PJ8A 4QTDA 4S31A 1JPAA 4CFXA 4ERKA 5IU2A 5GIPE 3KMUA 5IUGA 3QYZA 2WB8A 4RBLA 4O0YA 3ZLYA 1Y8YA 2YIQA 3EQIA 1GNGA 2B7AA 3S00A 3C5IA 3FL5A 2E2BA 3GC9A 2CDZA 3A7GA 1XH7A 4GS6A 1FGKA 4J1RA 4I3ZA 4DCAA 4S34A 5LXMA 1B38A 3F5GA 4RIXB 3NUYA 3UODA 3P86A 4KINA 3FLWA 3KXHA 3R02A 3ID6C 4WBOA 5CF6A 4AE6A 3VBQA 3F5PA 2VTPA 5EDPA 3DY7A 4YSJA 5DOSA 3DT1A 4AFJA 5L3AA 2X2MA 4XX9A 4FYOA 4DH7A 4YTIA 3DXQA 4U3YA 3E3BX 1NVSA 3QQKA 5D7VA 1OKYA 4M68A 3MPAA 4AW5A 3DS6A 3TZ8A 3PWYA 2HYYA 4E93A 2YDJA 4F1MA 3GQIA 2R4BA 3OF0A 4K6ZA 3SDJA 4CFNA 2X1NA 3LXNA 4WSYA 4XV9A 5FM2A 4IH8A 3R2YA 3I4BA 4M13A 2HY0A 3NUAA 4U5JA 5EOBA 5EHLA 4KBAA 3U9CA 2R3OA 1O9UA 5CLPA 2ITYA 4FF8A 4O91A 5T68A 2WAJA 3BHUA 3D14A 3SW4A 4EOJA 4YHJA 4QP2A 5JMSA 3KF4A 4C4GA 4FEVA 3JY0A 3NEWA 4ZP5A 4N4SA 5JFSA 4U79A 2RSVA 4PY1A 5I5ZA 4FKPA 5ETIA 4IIRA 4KD1A 4I5HA 5K9IA 3Q60A 1OVEA 5C03A 3VWAA 1PYEA 2HWOA 2XKCA 4FV2A 3ZH8A 4NW6A 3RPSA 1G3NA 5KCVA 4O81A 3LXKA 4ZS0A 4MNEB 2BZHB 4PRJA 2QG5A 3SOCA 2ZMCA 2PHKA 3QWKA 5JRSA 1NW1A 5FM3A 3R0TA 1V0BA 5AR3A 4YJRA 4QTEA 2VTSA 2YM5A 2QOHA 4UY9A 2R2PA 4JRVA 5DIAA 4NEUA 4QO9A 2VTTA 4YR8A 5CAOA 5EOLA 2J0LA 4BDEA 4CKRA 4XP0A 2O0UA 3C50A 4FG7A 2OZAA 4OTGA 1IR3A 4AOTA 3OY3A 2JDSA 5HX6A 1H0WA 4PDOA 4LMNA 3P9JA 4O0WA 4M97A 4FV3A 1APME 3PTGA 3S4QA 4DGOA 2WOTA 3CS9A 4CRSA 2IG7A 2VX1A 4IAIA 2WO6A 3W2SA 3MB7A 2FUMA 4QPMA 4U81A 4DLJA 2BCJA 5A4LA 3A61A 5KO1A 4O7LA 2Z02A 5FEQA 2WTDA 4QMLA 1G8AA 5M4UA 5IMXA 2XF0A 4YC6A 5EDRA 1WBSA 3E7OA 3FZRA 3R63A 3AQVA 3TIZA 1XH9A 3NVMB 2PMOX 2CN8A 2FSMX 4QNYA 3Q96A 5JFVA 3QKLA 3R8MA 1LP4A 3DLSA 4FR4A 3A7HA 2BILB 4HGSA 4FUYA 1SZMA 2RFDA 1WFCA 5CZIA 4HGTA 4D28A 1JWHA 1Q8TA 4ARKA 5FTOA 4AA5A 4O7TA 3FMMA 2JKKA 3HV5A 3P5KA 3S2PA 4D4VA 2OFVA 3QXOA 4LM5A 5FG8A 3HMMA 4X0MA 3I0QA 4A9SA 3EOCA 1PJKA 4NM0A 4NJ3A 4P2KA 3QTSA 3ATTA 3CIKA 4CG9A 4RLLA 3TG1A 3ULIA 3FYJX 4PTEA 4YBKA 3F5UA 3VBVA 2FO0A 3QXPA 5AX9A 4K1BA 2ITPA 4FK3A 4BCOA 1JLUE 2RGPA 4KIKA 5J95A 2BRGA 5EYKA 5EYDA 2Y7JA 3U6HA 4R3PA 5M08A 4ITHA 4TT7A 2HELA 4Y8DA 5L8LA 4WHZA 4YZDA 3CP9A 2X6DA 3KCFA 4O2ZA 1MRYA 3FLZA 4HGEA 4IANA 4KS8A 3V6RA 1RJBA 4F9BA 1KE6A 3DBFA 3G2FA 1PHKA 4ANLA 3ZCLA 4CYJA 3ET7A 4RWJA 1E9HA 3F3VA 4RGJA 3GEQA 3G0FA 4RWIA 2PY3A 3LJ0A 5AUZA 5FTQA 5CXZA 4EWHA 3R2BA 2CKEA 4CTBA 5LVOA 5FDXA 2XRWA 3VBYA 4BI2A 3R01A 3FL4A 2OIDA 4R7IA 2YEXA 3LJ1A 4C02A 1IEPA 5HU9A 4L3PA 1VR2A 3E64A 3BBTB 3ZBXA 4ZY6A 1UU9A 4FNWA 4FZ6A 4F63A 2PYWA 1BX6A 2DYLA 3MPMA 3TCPA 4C8BA 3E7VA 1CTPE 3MW1A 3IG7A 4Q2AA 4BB4A 4OT6A 3BGPA 4NSTA 5GZ9A 5HE2A 4I5PA 2QOLA 3LQ8A 2HCKA 4Y83A 3VRYA 3ORKA 3RPVA 3ZC5A 2F57A 5CNOA 3VHEA 1H26A 1U5RA 4ANOA 4XG3A 4U7ZA 3R8UA 4IAKA 3AD4A 4FG9A 3ZSHA 4AF3A 4BKZA 1ZMUA 4CKIA 4KKEA 2ITUA 4CNHA 5CASA 3CXWA 3EKNA 4UMUA 4O7NA 3R7OA 3IPHA 4DGLC 2RF9A 4OBPA 3QCYA 4Z7HA 5M44A 4AAAA 4W4WA 4DG2E 3TI1A 3OXTA 2IZRA 3B8QA 3KXGA 5CVGA 4PP9A 4CEGA 2RL5A 4ZTHA 3UP7A 5BVDA 3BV2A 4D9TA 5I3RA 4L7FA 5EHOA 4ALWA 5AP1A 1IRKA 2GNHA 4U44A 3C4WA 2OI4X 3UMWA 2CGVA 3ZSIA 3AC1A 2X2KA 4OTIA 5FBNC 3ROYA 2E9NA 4FG8A 3F82A 4EH2A 5LVPA 2OJGA 2J0JA 4F1TA 2X7FA 4XUFA 2UZOA 3QGWA 4FKRA 3HGKA 3UG2A 5J5SA 5HLNA 2GSFA 4IAZA 4KKHA 5IQIA 1TQPA 3NS9A 5DR6A 5ANJA 4C4HA 1JSUA 5GHVA 2ZV2A 3MVLA 2XJ1A 2PE1A 2YACA 4X6QC 5D41A 3V5LA 3BI6A 5CAVA 2VUWA 3ZLXA 2OO8X 2BAKA 1P4FA 4O7ZA 5BPYA 4S32A 4FTKA 3OTVA 3MJ2A 3NDMA 4GEOA 4PWNA 3I5ZA 5CF5A 3V3VA 3ZDUA 2Y6MA 2XK3A 5CVHA 2EXEA 3PRFA 3W2QA 4D0WA 4DTAA 5AFVA 3QQFA 4YMJA 4MEDA 3BPRA 3ENHA 3H0ZA 3FWQA 3G5DA 3BHYA 3P79A 3Q32A 4C37A 4JS8A 4XP3A 2F2CB 2VD5A 3AT3A 4BCMA 1YDTE 2I1MA 3U6JA 5KZ0A 3VJOA 4AE9A 3Q5ZA 4LYNA 3VUTA 3RZBA 3JVRA 4ZIMA 5FDPA 2X6EA 4MD8E 1Y6BA 5IQFA 3G51A 3TNIA 3FAAA 4EOKA 3DXPA 2QI8A 2REIA 2BZIB 5LARA 3W2RA 4BRXA 2C5XA 3B8RA 4O0XA 4ACDA 4F9AA 4HVHA 2Z7LA 2C3JA 5J7BA 2UZNA 4NM3A 3ZEWA 3DAJA 2GHGA 3ANQA 5DGZA 5JFWA 1M2PA 5H8EA 1M7NA 1Q24A 4BZNA 2OJIA 4HCUA 4ZSLA 1YXTA 2B9FA 2CGXA 5M51A 2XK6A 3V01A 3U6IA 2GMXA 3QD2B 3G90X 4HGLA 5D1JA 5CNNA 5E8WA 1U54B 2OKRA 4IB3A 3ZMMA 3AD6A 3V6SA 4EOSA 4Y5HA 4JQ8A 4IVDA 4EH7A 5IUIA 5F9EA 2IO6A 3DQWA 5AAFA 2J5EA 5EFQA 5TR6A 3QKKA 4MH7A 5E90A 5EKNA 3RTPA 1KE8A 1Z57A 4I0RA 3PG1A 3FQSA 4YZ9A 3PDTA 3HMNA 5C4LA 2QKWB 1MUOA 3CTQA 3LMHA 5DEWA 1BLXA 1W84A 4I94A 2JIIA 2PZIA 4GT4A 4E6DA 5CENA 3U87A 3MH2A 4MNEA 3HUCA 3D2KA 3FZPA 4RFYA 1ZOEA 2HENA 3Q4ZA 4QMTA 5AP5A 3H9OA 1TQIA 3IGOA 4TYHA 3ALNA 2X4ZA 1MRUA 4ALUA 1PKDA 5DI1A 5C8MA 2VTMA 2B55A 3R9HA 1SYKA 4I6FA 4BCKA 2W1GA 4ACHA 4MX9A 5CAPA 5CVFA 4MXOA 3QCQA 4IE9A 4YC3A 3RHKA 1PXPA 1EH4A 3DKOA 1H1PA 2UW4A 2PZYA 2SRCA 2YCRA 3COKA 3Q4TA 4G17A 4J71A 4JIKA 5A54A 4EJ7A 1XBAA 2ZM1A 4E4XA 3MY0A 4I22A 5HTCA 1ZLTA 2AC3A 5LVNA 5L2WA 3C5UA 3VIDA 4E6QA 4XOYA 1QMZA 1S9JA 3GCUA 3O17A 2XNMA 4H3BA 5HKMA 4EK5A 3FZ1A 3NW6A 3ANRA 3KULB 3ZFYA 1PYXA 3NRMA 2XJ0A 3LM0A 3F9NA 5HCXA 4FEUA 2H9VA 3LW0A 3EFJA 3MY1A 1R0EA 3BQRA 3SQQA 4BICA 3FQHA 4DEHA 1RDQE 3TKIA 2O2UA 3BZ3A 2Y4IB 4QP8A 2UUEA 3GU4A 3DKCA 3KVWA 3QTRA 3BLQA 3V8WA 2WPAA 5DVRA 4IFGA 4BDHA 4F6WA 3QQGA 2QOBA 4WUAA 5IISA 5IF1A 5HI2A 3KXZA 4M84A 4JRNA 2Z7SA 3W1FA 3WYYA 3BU6A 5CX9A 2GNLA 3VS4A 1OKZA 2Y4IC 1ZXEA 2B9IA 2WQMA 4OTFA 1PXKA 1H1SA 1FBNA 2A4LA 4ZTNA 4R7HA 3Q5IA 3K2LA 3Q9ZA 1VYZA 3GOPA 4QMMA 4AZVA 3FQEA 2UZBA 1MRVA 2XA4A 2JITA 4QYHA 4UMRA 5JGBA 4NK9A 1NVQA 2W1FA 3GT8A 3I79A 4C3FA 3AD5A 4AZSA 3CC6A 1OZ1A 4AGUA 3T3VA 1JBPE 3DK7A 4GT5A 5E1EA 3H3CA 4O0TA 4QMZA 3PUPA 4O6LA 3QTIA 3N51A 4XV2A 5DMZA 5FXRA 1CMKE 1BL7A 3NX8A 1OL6A 2UW8A 1OBGA 3NZ0A 2FGIA 5L2IA 4DCEA 5GNKA 2YIYA 4G6OA 4E20A 4FKGA 4FOBA 2JAVA 2YJRA 4EKKA 1Z5MA 4RVMA 2PWLA 3C9WA 3ENMA 4PNKA 3FXZA 4BDGA 3ZUVA 4ZLOA 1STCE 4FI1A 1YWRA 1XJDA 2W0JA 4GYIA 5KHWA 4P7EA 3RMFA 4I41A 3W18A 2X9EA 4FTMA 4XLVA 3QKMA 4GT3A 1J3HA 2WEVA 2W5AA 3KRLA 1OGUA 3FI8A 2HZIA 2IW6A 3NIEA 5TF9A 3R7YA 4DEGA 5IA1A 2GS6A 2DQ7X 4I1ZA 5CAUA 3ORZA 5EM7A 5D7AA 5AP2A 4PTGA 5A4EA 3OS3A 4PDPA 1FINA 2XIYA 3JYAA 3QHRA 4FIHA 4F0FA 5KMKA 4CFMA 4FNYA 4RJ8A 4BZOA 5H3QA 5HZNA 4YTHA 4Q5EA 4O0RA 5E92A 5EW9A 1PY5A 5JH6A 3TZ7A 2C47A 5AP4A 2CKOA 4YO4A 1WVYA 3Q4UA 3I7CA 3LFQA 4FKIA 3EN4A 5IH6A 3RK9A 1PF8A 2Q0BA 5AR8A 5DPVA 4ZJVA 4AUAA 4W8DA 3MA3A 3CCNA 4ZXTA 2IZUA 4L8MA 2JBPA 5GJGA 2B4SB 4NIFB 2BALA 3Q4CA 1PMEA 2BDFA 3DDPA 3VUGA 3H9RA 2PUPA 3BEGA 2VZ6A 4WKQA 3WZKA 3L8XA 5HOAA 4D58A 1H1QA 2BTRA 3BKBA 4RFMA 3WE4A 4I21A 5KNJA 3DBCA 4CT2A 3HX4A 2JKMA 4PPAA 2BVAA 4YO6A 4IFCA 3REPA 3W33A 1FOTA 3QLFA 2VU3A 4JX7A 4B0GA 3VBXA 4ACCA 4X2JA 3BELA 2XIZA 4YZNA 3V5JA 1IG1A 1ZARA 3NUXA 2R3MA 5AV1A 3VW8A 3R83A 4C3PA 3NYOA 1MQBA 4DEBA 5KMIA 3UQGA 3A7JA 4B8LA 3NUSA 2WU7A 3AOXA 3DU8A 3FXWA 4A07A 5FTGA 3PXQA 3KRRA 4E6CA 3ZUUA 4ZY5A 5K4IA 2I40A 3O50A 4AWIA 4QMSA 2V22A 1YXXA 4ZTMA 3KFAA 5DEYA 4NUSA 1Q62A 1MP8A 1V1KA 4AGCA 3MS9A 3D2IA 3WOWA 3M2WA 2X7GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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