5EM8A

Egfr kinase domain with pyridone compound 13: 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{n}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{h}-pyridine-3-carboxamide
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
323
structure length
303
Chain Sequence
GEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKEATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPDMDDVVDADEYLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Pyridones as Highly Selective, Noncovalent Inhibitors of T790M Double Mutants of EGFR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 303
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5em8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5em8A01
2VV9A 5JEBA 5LOHA 1U4DA 4F1MA 3K3JA 4RJ8A 4YPSA 3NVKI 2P2HA 4LI5A 1ZMVA 5EOBA 3SV0A 1WBTA 3DAJA 4YJNA 5K9IA 2ITXA 4F4PA 3H30A 4ZSLA 3RAHA 2J9MA 4F1OA 4C58A 3PXZA 2CSNA 4HNFA 1MUOA 3OXTA 4MWIA 4YJPA 5IA5A 4BCFA 3FZRA 2J90A 4PV0A 4IB0A 4DGNA 4FEUA 1Y91A 5FG8A 2UW8A 5F1ZA 5HO8A 3VVHA 1KSWA 5JRQA 1Y8YA 4G5PA 3SAYA 2V7OA 3NUNA 2WPAA 3Q96A 3AMAA 4XP3A 4PMPA 3P9JA 4YBKA 5A6NA 5DH3A 1YOJA 3ODYX 3AC1A 4YZDA 4FV0A 1SMHA 4D5KA 2HK5A 2OG8A 2JKKA 4QP4A 3DOGA 3TN8A 3FMEA 5FBNC 5AV3A 4W9XA 2OICA 1B38A 3ZZEA 4U40A 4ZAUA 1URWA 3QQJA 1Q3WA 1XHAA 4QTAA 2OF4A 5C8MA 2QOHA 3PDTA 3PA4A 4KNBA 5FTOA 4EQMA 3VNTA 5FP6A 3MFRA 4ACGA 2UW4A 1JQHA 4F9BA 4RC2A 1YXSA 4I5HA 4I4FA 5AWMA 3LZBA 4OAUC 1KE7A 2WO6A 3NUXA 2ETMA 3RJCA 2BKZA 2XNNA 4OTGA 3PVWA 3FYJX 4RIYB 4MXXA 2YAAA 4DEAA 3HDMA 2PVKA 2B0QA 3FI3A 4RSSA 5HLWA 4C4FA 4TXCA 3UVQA 4ZJVA 1R3CA 5DT3A 4O91A 4RJ5A 3MB6A 2R3QA 4IZ7A 4O0WA 3UIMA 3VBXA 3IONA 4O7VA 1MQ4A 4FIEA 4F1TA 4E4NA 4FX3A 4X2FA 4IM2A 4PRJA 4AACA 4NUSA 3VF9A 4AW0A 4E6AA 1XH4A 3BBTB 3TUBA 2PPQA 4M84A 1OMWA 2WMWA 1H00A 4U3YA 2B55A 5J1VA 4F9YA 4A9UA 2JIIA 2OWBA 3UMXA 3PY1A 3RINA 2GNIA 4MNEB 2C47A 2GCDA 2X0GA 2E9NA 3KMUA 4YLJA 4ZZOA 4HYIA 3NDMA 1OPJA 2HZ0A 3IO7A 3E8EA 3KQ7A 3QF9A 1P2AA 4CQGA 2GNFA 5JFVA 3PZEA 4ZTLA 5E91A 3QZHA 5ETFA 5AP3A 5T68A 4XRJA 3HLLA 2IW9A 5CF8A 4ZMFA 1GZ8A 3PY3A 3UG1A 3NCZA 1KWPA 4FEQA 4WG4A 4CGAA 2C68A 4C3RA 2XF0A 2PZRA 3COHA 4FKSA 3E8NA 4HVSA 3KREA 4FF8A 2ACXA 3P23A 2V0DA 3OF0A 2F7XE 4C4JA 1JKSA 4CFWA 1H1RA 2UZLA 3HUBA 4CKJA 4G6NA 5H8BA 2DWBA 4DINA 4NEUA 4EYJA 4ACHA 2F7EE 2EUFB 2EB2A 3NGAA 4RWIA 4YJRA 2ZM4A 2YJRA 5AP1A 3RPVA 4D58A 1I09A 5AR4A 4Z55A 5J79A 3E64A 5AIRA 3ZONA 3KULB 2W4KA 2YCSA 3MVHA 5HE2A 1VZOA 4M67A 3A4PA 3DJ5A 3O71A 2GFCA 4O7WA 3ORXA 4EK8A 3ZO1A 4DG2E 4G34A 4ZTMA 2IZRA 3HL7A 3ZMMA 5JFXA 4LMNA 1B39A 3LFDA 4L00A 4CNHA 4I0RA 4CLJA 2X8IA 5I3RA 3HP5A 2XJ1A 3PTGA 4GUBA 4TWCA 2P0CA 4ZLYA 3ZM9A 3BHTA 4FZAB 2RG6A 3G6GA 1YHVA 3QQHA 4RRVA 4J96A 5AUZA 3ZUVA 4CVAA 4NL0A 2XJ2A 4RFMA 5IA1A 4KIKA 4YURA 3EQRA 4RWJA 4E20A 5KNJA 3WF5A 4EQCA 3GUBA 4AU8A 3ORZA 4H1JA 4QTEA 3V01A 4USDA 2R3JA 4F65A 5GJFA 1JAMA 2WTIA 3WOWA 1TVOA 3BLQA 4IM3A 5D41A 4ANOA 5CVFA 3D15A 4EOIA 3P7CA 3KRLA 4ASZA 1M7NA 3BEAA 5CYIA 4EH5A 1UA2A 2C1AA 2UZEA 4ID7A 3ZRMA 4BR3A 3U4WA 3BYUA 4YSJA 3G0FA 4WBOA 3S1HA 2UW0A 3A60A 4BZDA 3W18A 1J7UA 4G5JA 4DE4A 3DA6A 3WF9A 3UE4A 4F7NA 5DYJA 1OL2A 3K5VA 4O86A 3DLSA 2W1ZA 3QX4A 4BCPA 1ZXEA 1YXUA 1JSVA 3VUGA 5CEIA 4FSRA 3VBVA 3IK3A 1FPUA 4BDGA 1ZZ2A 4NW6A 5KX8A 3CTHA 5LMKC 4EHZA 4EUTA 4WRGA 2CMWA 3KU2A 2G2IA 5B0XA 1H01A 2XS0A 3OXIA 3COIA 4FTOA 4XBRA 4N6ZA 4IH8A 4ENYA 5HE1A 4FZ6A 4UWYA 2WMQA 2YM3A 4M0YA 2UW9A 2C6IA 2YM4A 3CTJA 3QUPA 4ZZMA 4AZSA 4TY1A 3NEWA 2EXCX 5EDQA 4MTAA 5DEWA 3TNHA 3FSKA 4BIDA 2JDRA 1CMKE 1W8CA 4FKPA 4YPDA 5CS6A 4GEOA 3O8TA 4MX9A 1SVEA 3Q6UA 2XIZA 3ZXTA 3SRVB 2JITA 3R71A 2VWYA 2G9XA 3FQSA 4C2WA 5IQAA 2V62A 3I79A 3QTZA 4J52A 4J8MA 3HMNA 3SD0A 4YZBA 3BYVA 4U81A 4UALA 4FT7A 5FXSA 3VUIA 3UTOA 2OXYA 2ZV2A 4UYAA 3ZBFA 2Y9QA 1Y8GA 2PVRA 2JAVA 2VTQA 3GBZA 2HOGA 3HUCA 3QALE 4D2TA 4BDDA 4XJ0A 4KRDA 3QBNA 3QTRA 4M68A 2QOOA 5B2MA 3IW5A 2CN8A 4II5A 3TNWA 3F7ZA 3ZO3A 4DBNA 3DK3A 5HD4A 1OL5A 1BYGA 1JPAA 4FT5A 5CSPA 3L9LA 4PF4A 4PDSA 4CG9A 4IW0A 5CU4A 4O7LA 3O8UA 2I1MA 1YOMA 3QGYA 3VRZA 2X39A 2CLXA 3F3WA 4JRVA 2YM6A 1BKXA 4HOKA 5D7VA 1J1CA 2FB8A 2H34A 3A7IA 4BCHA 2BDWA 2C0OA 4OT6A 4EBVA 3VUTA 4CT2A 4FA2A 3UO5A 5F20A 2IW8A 3NAYA 4A7CA 4B9DA 4U6RA 3ZBXA 3CKXA 4IANA 3ZFXA 3A8XA 5J9YA 2G15A 2BZHB 4TT7A 4YTCA 3EN6A 3OW4A 3V8TA 3FZPA 4K1BA 3ENMA 4AN9A 2QQ7A 3O96A 1PYXA 4U41A 3ZYAA 1JKLA 5AMNA 1WVWA 1XR1A 4K0YA 3CBLA 4M14A 5K4JA 2Y4IB 5J7HA 5IQGA 3CD3A 4PTEA 5CU6A 2Q0BA 4Y83A 2JLDA 2GHGA 2X8DA 4QRCA 4BCGA 5A6OA 2XKCA 4K8AA 4CLIA 2VGPA 3KL8A 3DLZA 4F70A 2UW6A 5BYYA 4BGHA 4K77A 1OIRA 4V0GA 4DEEA 4HCTA 3PXKA 4BDJA 4FTUA 3V51A 4XS2A 4O82A 4R1VA 3Q04A 2C6KA 4RZWA 3W10A 4P5ZA 3NNVA 1G8AA 2LGCA 3S0OA 1PKGA 3OUNB 4EH4A 3V5JA 4QMMA 2QU5A 1XH8A 2W0JA 4S30A 2X4FA 1ND4A 4FSTA 5GJGA 4ITIA 4XLIA 5TKDA 2ZB0A 2AC3A 1FGKA 3H9RA 2CGVA 3AQVA 3EL8A 3NYXA 3WYXA 3UIBA 3WZEA 1K9AA 4AE9A 2PE0A 4FVPA 4AGWA 4YO4A 3RPRA 2V22A 3E3BX 3K54A 4O0TA 3DKGA 3FI8A 2NO3A 3QD4A 3MVJA 3P4KA 4U3ZA 2XZSA 2QOCA 4U5JA 1PHKA 5HNBA 3O7LD 1Q97A 3W1FA 2DYLA 2RFDA 2PE2A 2VTPA 2CN5A 4GMYA 3R7YA 4OBQA 4CV9A 4XG8A 5DNRA 4PP7A 2JDSA 4XRLA 1Q8UA 4FV4A 5C8KA 1XBBA 4QMNA 2R2PA 1FVVA 2PMOX 2YITA 3FMMA 4FIHA 4LYNA 5AR2A 1F0QA 3CSVA 1Y6AA 4ASDA 3LAUA 3EN5A 4D55A 3FWQA 4R3RA 3RZBA 2OLCA 1IG1A 4D2RA 3NR9A 3QD2B 2QOFA 4IXPA 2BPMA 4QQJA 5I9UA 2RKUA 4L3JA 4TTHB 3TEIA 4DT9A 1QCFA 4O0SA 2W1FA 2I0VA 3A2CA 5FQDC 3CPBA 5AV4A 4RWLA 3NUYA 4DEDA 5AM7A 4EONA 2ERZE 3F9NA 4BDBA 4FNZA 2B53A 2C3LA 4N6YA 2YCFA 1O6KA 2Y6OA 3LXLA 1ZYDA 1YKRA 3BWJA 3OVVA 3N9XA 5DEYA 4QMLA 3ZTXA 2WFYA 5TOZA 2R3LA 3RNYA 3NPCA 3FKLA 3RCJA 3UYSA 3PE2A 3NW7A 3Q9ZA 4LV5A 4E26A 4R5YA 3OTUA 1RDQE 3ZLSA 2QR8A 4ZY5A 2RGPA 1WBWA 4IE9A 3QTIA 4KS7A 4RFZA 4FKLA 4TPTA 4Y73A 2QKWB 2BCJA 1BL6A 3D83A 2HW7A 3OBGA 4CFMA 5L8KA 3PLAE 5IA4A 4EQUA 5K4IA 4MVFA 4EL9A 4N0SA 4QP3A 3BV3A 3R7GA 4PNKA 2H6DA 3NNXA 4G3DA 2Q0NA 4O0RA 3ANRA 2J2IB 4A07A 2V7AA 4X6QC 3F2RA 4I24A 1BMKA 4D0XA 4LRKA 2G2HA 2NRUA 4IAKA 2QO9A 1F3MC 2IWIA 5AP5A 2QNJA 5DRDA 4GSBA 3DU8A 4FIFA 4NCTA 5CTPA 4AA0A 4GV1A 4RIXA 5AR5A 4CKRA 4FOBA 4LGGA 3S00A 3JPVA 4FMQA 4NKAA 3PXQA 3PJCA 2R4BA 3NNUA 5HG9A 5CU0A 3EFWA 4GUEA 1QPJA 2F7ZE 2VWWA 4M8TA 1QMZA 3VUHA 1FVTA 3R9RA 5JH6A 1FMKA 2E9UA 1ZAOA 1RW8A 1A06A 3ATSA 4HPTE 4H3PA 3R7EA 5JMSA 4YC8A 5D9HA 5TE0A 3LMIA 2XNPA 3C0IA 4Q2AA 3DK6A 5L8LA 4ZP5A 2W17A 1VEBA 2UZTA 3BU5A 4J71A 4I6BA 4R6VA 2O65A 2QR7A 2YM5A 2VRXA 3MY5A 4P2KA 4RLLA 2PMNX 4TYJA 2WMUA 4HNIA 5A3XA 4QQCA 3DXQA 4I5PA 3GC7A 3OT8A 3LJ1A 3NZ0A 5DE2A 4FKWA 4OTDA 3V8SA 1YWVA 3EH9A 2WTWA 4G16A 2O3PA 4O2PA 3C4ZA 2Z7QA 1WBVA 3ULIA 2OIBA 4EK6A 4FV2A 3SA0A 3VQUA 5A9UA 3FLNC 3TNPC 5DR6A 2WU7A 3BE2A 3NUAA 2JIVA 2WZJA 3K3IA 2YACA 1XJDA 4Q5HA 4DA5A 5C9CA 5BMSA 1ZY4A 3SOCA 3DV3A 2PZ5A 4HVHA 4CXAA 5E7RA 5B7VA 5FEDA 4ENXA 5BX0A 1W83A 3CP9A 3F6XA 3FY2A 3OROA 4TYGA 3QTQA 3KGAA 3QAME 3QRUA 3BZ3A 2IZTA 3ETAA 2JBPA 2LAVA 5IEVA 2WQBA 2VTSA 2CPKE 2PWLA 3IQ7A 1K2PA 4GFMA 4KKGA 4BF2A 3LM5A 5IQIA 2BZKB 2FSTX 5FEQA 2W1GA 2HAKA 4L42A 3ROYA 4MBLA 2YEXA 1FBNA 2VX3A 5HICA 4QP2A 4S31A 2PUIA 4NCTC 2ITZA 5EYCA 5H8GA 5B2KA 4AP7A 3T9IA 3W32A 2JEDA 3G90X 4QP9A 1Q3DA 2R3KA 3H9OA 3R8ZA 2CGUA 4UV0A 2BROA 5FTGA 2J4ZA 4XX9A 4I3ZA 2RF9A 4QTCA 3C4EA 4FSMA 4D28A 4FZFB 2JGZA 4JQ7A 1U54B 3LMHA 4CTCA 2HZ4A 4YTHA 3ELJA 3DDQA 3G5DA 3VBTA 5DG5A 4FTIA 5I9ZA 5AR3A 1RE8A 5HO6A 1MRUA 3QCXA 4RGJA 2EVAA 3NRMA 3LXNA 4WRSA 2ONLA 4ZSAA 5DR9A 3GP0A 2OGVA 1L8TA 1SVHA 1Q8ZA 4FNXA 4FIJA 4QNAA 4F64A 2J5FA 4U42A 3PSDA 2J0IA 3ANQA 3NW6A 4GIIA 4ITHA 3W16A 3Q6WA 1OL6A 1Q99A 3DXNA 3OS3A 3QLGA 3H3CA 3LOKA 4IWOA 3A4OX 4PX6A 3N51A 3HV4A 3LCOA 3QKKA 5FBOA 3ACKA 3UDBA 4ZJJA 4L53A 4OTFA 3ZEWA 5KMLA 5CQUA 5AX9A 4D1ZA 4Q9ZA 4JOAA 4O83A 4YBJA 4BBMA 2XJ0A 5FWKK 4JRNA 2AC5A 4K33A 5DPVA 4W9WA 2X1NA 4O0XA 1H07A 2R7BA 2UVXA 3GQLA 4CYIA 4IADA 3EQBA 4EOJA 3KB7A 5A14A 1IEPA 5KHXA 2XEYA 2F4JA 3GXLA 5E8WA 3WF8A 1QPCA 3P7BA 3QQGA 3Q9XA 2DUVA 1I44A 2QLUA 3G2FA 5T6KA 4BRXA 3EN7A 1H1PA 5DLSA 5JSMA 4GYIA 5M53A 3EFKA 3FI4A 4ALWA 4IVDA 4FNWA 1EH4A 3KF7A 3R8LA 3CY2A 3VW6A 4MKCA 3D5VA 3HV3A 2O8YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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