4QYEA

Chk1 kinase domain in complex with diarylpyrazine compound 1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
278
structure length
271
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of the 1,7-diazacarbazole class of inhibitors of checkpoint kinase 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 80
structure length 271
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4qyeA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4qyeA01
1U54B 3IDCA 4WKQA 4FG9A 1SVEA 3CR0A 2XNMA 4AN3A 4F9CA 2PVRA 3CKXA 2WB8A 4ZTSA 2R64A 3TKIA 4FKQA 3GOPA 4FL3A 4YBKA 3FPQA 2QURA 3EJ1A 4U7ZA 4QMNA 1I09A 2NPQA 3PYYA 1SVHA 2VZ6A 5IU2A 5KMNA 2GS6A 4FI1A 4FX3A 3ATSA 3L8PA 3TL8A 5AV1A 1Z5MA 2EXMA 3ZLSA 2I7QA 4FICA 2Z60A 4ARKA 3NW7A 2WFYA 2C47A 3FYJX 3LLAA 3QALE 4QOXA 4J96A 5CEIA 3C4ZA 2GFCA 3PG3A 4O27B 3W32A 1X8BA 4DFUA 2BAKA 2YHVA 4BI1A 3D9VA 5DG5A 1WBSA 3RK5A 4C33A 4CSVA 4FTKA 4DEEA 4EOKA 4KB8A 3KXNA 4X2FA 2QU5A 4DT8A 3OWJA 2WMVA 3AC1A 3SXRA 3QA0A 4XOYA 4H05A 4F64A 3E88A 5J8IA 1Q3DA 3DDPA 4NZWB 5JQ8A 4ENYA 2EWAA 3QX2A 1JKLA 1TKIA 3IGOA 4IH8A 1ATPE 1M2PA 2WTKB 4GG7A 4HW7A 2Z7SA 3DOGA 5AX9A 2XMYA 3OT3A 1UU3A 4QP9A 4YTCA 1BKXA 2VX0A 5AR3A 3R7VA 4TXCA 3M1SA 2BRHA 5DEWA 4C4EA 4R7BA 4CYIA 2PZPA 4YJSA 5GHVA 5IF1A 4BCQA 4UBAA 4W9XA 3AQVA 3SOCA 4CKRA 5M06A 2GSFA 5EQPA 1XBAA 1SZMA 2YERA 2GNGA 4FKIA 3KGAA 4IB5A 4MTAA 4O0WA 4RJ5A 4YZ9A 3RJCA 4WOVA 4CQEA 3MJ2A 5JMSA 4KIKA 4EYMA 4NJDA 4A07A 1VJYA 3EFWA 3LCSA 2UUEA 2VX1A 4EOPA 1XWSA 5KMIA 3ALOA 1W7HA 3CY3A 3VRYA 3GB2A 4CZYB 3R1YA 4EOMA 5C1QB 5E7RA 3U8WA 5J1VA 3PXFA 3D0EA 4QPSA 4I4FA 3CSVA 3RI1A 3QTSA 4GH2A 2F7ZE 3AGLA 3RM6A 3VULA 4U40A 3QWKA 5CU0A 5L8KA 5IG1A 4H1JA 4I6FA 5HBJA 1M17A 3PSCA 4YTFA 3NLBA 3F61A 2CLXA 1FMKA 3KQ7A 2HZ4A 4MNFA 2HOGA 4BFMA 4BICA 5FTGA 2B9IA 3KU2A 3CKWA 3F2AA 4TYJA 3MWUA 2IZTA 2RFNA 4MD9E 4L01A 4X3JA 3FSKA 2VTMA 3I4BA 3M11A 4LI5A 5A6OA 3FXZA 2A4LA 2PZ5A 3OFMA 4FKPA 4YBJA 3ZLXA 4UYNA 5J7HA 3G15A 3B8QA 3OXIA 4FR4A 4KRDA 3CQWA 3JUHA 4TYIA 4ITIA 4D9TA 4ZJVA 5JZJA 3A8XA 5AUZA 2UW4A 2GNHA 3R9OA 3W8QA 5J79A 5LVPA 3NUXA 4IZ5A 4PDSA 3H9RA 3IOKA 5AEPA 4O2PA 3QUDA 2PTKA 1URWA 4LG4A 4GUEA 2JD5A 4OR5A 4BGQA 5I3OA 2XJ0A 2HXQA 4BDGA 3OWLA 2BHEA 2GS2A 2OH0E 2IW9A 3RNYA 3PPKA 2XM8A 5CF8A 3LCOA 4OT5A 4PQNA 3U55A 4EQUA 4BCGA 2GDOA 3UQCA 3DA6A 2A19B 5KMJA 4FKRA 1B6CB 3RZBA 3BHVA 3QXPA 3ZZWA 2WPAA 3GC0A 4W8DA 3RTPA 2UZDA 2CCIA 4HZSA 4PL3A 4RGJA 4E5BA 3A7JA 4UMUA 3ZO3A 2HZ0A 5TF9A 3C4CA 4R6VA 4O7ZA 4BCMA 1H27A 2JDTA 4I93A 5IH6A 3EL7A 2XEYA 2OSCA 3AD5A 4D2WA 1GZ8A 2E9OA 1FGKA 2G01A 1XH4A 3UDBA 2OICA 3A61A 1HCLA 3F3TA 3VC4A 3FI8A 5D11A 3ZEWA 1OIRA 2C30A 2YIXA 4RBLA 5CSVA 3KMUA 2ITWA 4RRVA 2IO6A 3ODYX 3CTHA 3BYMA 3NUYA 5HBEA 4I5HA 2PE2A 3VUMA 4UV0A 3OWKA 3EFJA 3NW6A 2R3HA 3HV6A 3Q04A 4NTTA 3IOPA 4U0IA 3MA6A 4U3YA 1Q8YA 2R3OA 5D10A 3ENMA 3E7VA 5LVNA 2J0KA 4V05A 5C8MA 5G1XA 3VJNA 5HLWA 2CNVA 3UOHA 5AX3A 3W16A 4CD0A 1JKKA 4BY9E 4J8MA 3UZTA 1YXSA 4RVMA 4D4VA 4ONAA 5C03A 2BFXA 5CEKA 3D7TA 4UWYA 1JVPP 4FODA 3ZO1A 3MVMA 3LOKA 4CG8A 2PVNA 3BBTB 2OZAB 4ID7A 2W9ZB 3K2LA 5D7VA 4CVAA 5DBXA 4O1PA 1HOWA 2FYSA 4FBXA 4F0GA 4FTQA 2PZIA 5HTIA 3D5XA 2G2FA 5AP0A 5GJFA 3QQKA 1Y91A 3DU8A 4RWJA 4D1ZA 3E7OA 3VBQA 4E6CA 3FLYA 4FV7A 4FNYA 5EHLA 3IK3A 2ETMA 2ZDUA 1SMHA 3Q52A 3GOKA 4G2FA 4MWIA 3MH1A 5K4JA 3DBFA 4FV2A 3EH9A 2PVLA 4E6DA 2Y0AA 1GZOA 3ZZEA 2YITA 5IKWA 5B2LA 4O82A 4IDVA 3U4WA 5FM2A 3UNKA 3SXSA 4O83A 2OF4A 2VO3A 3MPAA 4MF0A 4MHAA 2HY81 3V6RA 4C3PA 3DGKA 4MBLA 4D2PA 4FZAB 1XHAA 3EOCA 2ZM1A 1WVYA 4P5ZA 4QTEA 2FB8A 1PYXA 2JKOA 3LFSA 4NFMA 4FNXA 3ORTA 5AUXA 3ZXZA 5EOLA 2C5XA 4HCTA 2XZSA 5J9LA 1F3MC 3ENHA 3FXXA 3P0MA 4JQEA 4BTFA 2PU8A 4LMNA 1RDQE 3UO4A 3O23A 4XNEA 4YZMA 4NEUA 4F0IA 1FOTA 4YC3A 3HRCA 3OZ6A 3ZUVA 3TEIA 3MFTA 4FSZA 3RCJA 1Q62A 1MP8A 3VUHA 4KKGA 3WIKA 4F9YA 3NVKI 4KKHA 2O8YA 5IUHA 5F94A 4NWMA 3Q4TA 4EK6A 4B9DA 1OL2A 4GL9A 5HD7A 5G6VA 4S33A 3FMMA 3GU7A 5HE1A 5E1SA 4Z7GA 4ANBA 1P14A 3JXWA 4CMTA 2F2UA 2WELA 4L00A 2XA4A 3LXNA 3RWQA 3ZUUA 4QMPA 4K0YA 3NYVA 3R6XA 5C8NA 5KBRA 4BKJA 3HGKA 3FLWA 5CALA 2V7OA 5LVLA 4FEUA 3PIZA 3Q4UA 4BYIA 3BEGA 5DR2A 4JBOA 5AAFA 5FLFA 5ANEA 4B7TA 2VO6A 2WTJA 4QP7A 3ZCLA 4YP8A 4JRVA 3FJQE 4B6LA 4CZUA 5JZNA 3AD4A 3Q96A 3TNQB 4BRXA 4DHFA 3R9NA 3H30A 4JL9A 3F5PA 3WZKA 4AQCA 2H96A 5AR8A 4AZWA 2OLCA 4F1OA 3LLTA 5HE0A 3UVPA 1ZOEA 3UPXA 2W17A 3TIZA 3QYZA 2IN6A 3FY2A 3U54A 3MY1A 3WE4A 3QTUA 4GYIA 3ZFXA 3UNZA 4PMPA 3Q4CA 2BDFA 4EOLA 2W9FB 3H0YA 4Z55A 3CTQA 3OS3A 3NUSA 2QNJA 5H8EA 2ITYA 4IAKA 4FK3A 3TZMA 4ACGA 5HTCA 1WCCA 4F9BA 2BTSA 4H3QA 4RX9A 3MBLA 4CFFA 1ZRZA 4EH8A 1GIIA 4NJ3A 5L6WL 3D2KA 5K0KA 4FV0A 5DT0A 3EN7A 3MTFA 3EQHA 3QCYA 4O81A 4ZSJA 3H9FA 3TG1A 3QC9A 4GVJA 4GIHA 1YI3A 3PA4A 4FYNA 4NSTA 4XG7A 4D5HA 4KD1A 3DCVA 1UU9A 2I40A 3UYSA 5CAVA 1QPCA 3A4PA 3PSBA 3PP1A 3AC4A 4L67A 4G31A 5AP3A 3UODA 4IBMA 4ACCA 3F69A 5GJDA 3R21A 3HKOA 4RG0A 4EH5A 2QR7A 2GU8A 1XJDA 2YEXA 3PIYA 3SKCA 2W96B 4E4LA 2Z02A 3MH2A 4P5QA 4ZOGA 3QD3A 2BVAA 2O64A 4EH9A 3QTWA 4C38A 2I0HA 2PE0A 1K9AA 1OKYA 3DKCA 1YWVA 3DKFA 5EI2A 5CF4A 3PY3A 5KBQA 4L52A 3WARA 2WMTA 1CKIA 3GUBA 1RJBA 2XKDA 4MD8E 2PSQA 4DG0E 4C36A 5KKRB 3S1HA 3TUBA 2Q83A 5K9IA 4C58A 1PXLA 3O7LB 2XCHA 3A60A 1ZXEA 2JBPA 1WVWA 4H1MA 3ZC6A 3AMYA 5IEVA 2YCRA 4B8MA 5DT3A 1H0VA 1ZZLA 3OTVA 4MNEB 2VTLA 3HL7A 4W4WA 3IW7A 1STCE 4Y85A 3ZSIA 2X8IA 3W2PA 3QTZA 3D5VA 3VJOA 1PHKA 3N9XA 3AC3A 5AIKA 3TV4A 3QZHA 5M44A 4BKZA 3I81A 2YCQA 2ZV8A 4G3DA 4QMWA 5HGIA 2PE1A 5CSWA 4RC2A 3F3VA 4FV1A 5DFPA 4RA5A 4PDYA 2OWBA 3DS6A 4RVTA 4GT4A 2VO7A 4QMZA 2XIKA 1LPUA 4NK9A 3V01A 1PMUA 5JRQA 1YHWA 2H34A 3PFQA 3HP5A 1KE7A 4OTFA 2BROA 1ZZ2A 4MX9A 4BGHA 4C35A 2DS1A 4K18A 3GP0A 4KS7A 4R3RA 5EKOA 4UMPA 1KV1A 3KF4A 4E8AA 2QKRA 3MTLA 4CFVA 3D94A 5HCXA 2WEVA 3NUNA 2BALA 3AC8A 4M68A 4WRSA 4AA5A 5CEMA 3TJDA 1H1WA 2OGVA 1PMVA 2I6LA 3KY2A 3VBTA 1V0PA 4PPAA 3DJ6A 3RAKA 3QGWA 1WMKA 5DWRA 3G6GA 4QMOA 2C0TA 2DQ7X 3OG7A 3LIJA 2JIVA 3MVHA 4M13A 4X2JA 4YC6A 3SDJA 5J9YA 2FVDA 3OEFX 5CU3A 4FKLA 2RFEA 4GYGA 1WAKA 3VW6A 4LL5A 2G15A 4BZDA 1YXUA 4EOJA 4EWHA 4AP7A 2PUPA 3P79A 4L46A 5CSPA 4NM5A 2WMRA 2XK7A 3FI3A 3H3CA 3LJ2A 3MFUA 4PV0A 2HELA 4RIYA 5E8YA 4F9AA 5K5XA 2GPHA 1CKPA 2XK8A 5CEQA 5L2WA 5HVKA 2WTKC 4FT9A 5C27A 3AMBA 4RIWB 3PXRA 4CRLA 3DXQA 1E1VA 3A62A 3NPCA 3TACA 3OCGA 4ZMEA 4JT3A 3EQFA 4RX7A 5ANJA 5IQAA 3BGZA 4I92A 3L1SA 2R3PA 5D9HA 4TNDA 3EKNA 5AV4A 5HCYA 3R9RA 1B39A 2W1GA 5C01A 2UVZA 2EUFB 5ANIA 5JN2A 5M4IA 2ITUA 5E8XA 5LVOA 2OFVA 2QHMA 2W5AA 4GJ3A 5BMSA 3PXQA 5ANGA 1JQHA 4FZDB 3R7EA 2WQBA 3TWJA 3QRJA 4IAFA 1PXOA 3FKOA 4UMRA 2W06A 2Y6OA 3HV7A 4OLIA 4F7JA 1W84A 5CNOA 4FG7A 4P2KA 3A7IA 4I5PA 1W83A 2YLFA 3UO6A 4EHEA 4S31A 3BYUA 2J4ZA 3MB6A 4U42A 3TZ9A 3VS0A 4AAAA 4RA4A 4I0RA 4II5A 4GKHA 4YUQA 4TNBA 5CLPA 4TWPA 5M4CA 1M7QA 2GS7A 3KRLA 2Z7QA 4A9UA 3ZM4A 4TPTA 4K11A 3AOXA 3PJ2A 4H3PA 2P3GX 3OF0A 4YSJA 2VTAA 4NCTC 1BMKA 4BDHA 4FZ6A 4WSQA 4DCEA 1PXJA 4V0GB 5JRSA 5M53A 3A7HA 4Y83A 3GENA 4L8MA 3ALNA 2WTCA 4KWPA 3DNEA 1R1WA 3EQIA 3F9NA 3V5JA 2HENA 5FBOA 2X2LA 2AC3A 3C0GA 3FZTA 4Y95A 4YZBA 3G2FA 4H36A 1OIUA 3CCNA 5D1JA 5E91A 3QLFA 3EQPA 1S9JA 3BHYA 1F0QA 2QI8A 3G0FA 3GGFA 3VW8A 1PMNA 5D12A 4ERKA 4DAWA 3KXXA 3QTXA 2P2HA 3LE6A 4BWXA 4FTTA 4ZS4A 2BRGA 2PZRA 1WVXA 2XK9A 3LFNA 4MBIA 1J3HA 2QLQA 2WTDA 4MQ2A 4RJ4A 2UZOA 3ZLYA 4UN0C 3SC1A 5JFSA 4DTAA 4FMQA 2ZDTA 3DBCA 5BYYA 3KK8A 4G3GA 3W2RA 3FKNA 4BHZA 5J5SA 4Y72A 2RF9A 4AOIA 5DEYA 4EUUA 2WU6A 3G9LX 5TR6A 4JOAA 4UMTA 1YI4A 4CMUA 3VHKA 3JVSA 4PUZA 4CXAA 1U59A 2NO3A 3QF9A 3GQLA 4RFYA 3S0OA 4O7NA 5GIPE 5HHWA 2XYNA 1BUHA 2V55A 4MXZA 2XNGA 3SHEA 1Y6BA 5FP6A 2UZUE 2NRUA 3Q5IA 1O9UA 2P4IA 3FMNA 2GTMA 2A27A 4O2ZA 3PWDA 2XNPA 4GUBA 4Y46A 4R3CA 3AC5A 2X39A 2VTQA 3CJFA 1PXPA 4L7SA 3DQWA 4IVBA 3F5GA 4CQGA 3A8WA 2RG5A 4M8TA 2PVFA 3R01A 1RQQA 4EORA 3FMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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