3V5LA

Crystal structure of interleukin-2 inducible t-cell kinase itk catalytic domain with thienopyrazolylindole inhibitor 542
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
262
structure length
240
Chain Sequence
GSVIDPSELTFVQEIGSGGLVHLGYWLNKDKVAIKTIMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title X-ray crystallographic structure-based design of selective thienopyrazole inhibitors for interleukin-2-inducible tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
total genus 75
structure length 240
sequence length 262
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3v5lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3v5lA01
4J71A 3A7FA 5AV1A 3F7WA 4I93A 3JUHA 4WUNA 4EQUA 4JX3A 2HK5A 2YJSA 5M51A 2C3LA 2G2FA 3OOGA 5KE0A 5K3YA 3I5NA 1Q24A 4TPTA 3R8MA 2QR8A 3RPVA 3E8CA 3Q2MA 4DBXA 2QOCA 5B2KA 3FSKA 3ORIA 3ZO1A 2VWYA 4H3BA 2B0QA 4TTHB 2CPKE 3U87A 4HVGA 2HOGA 2Y8OA 2PTKA 4AWIA 2ITXA 5HX8A 2UVXA 3UOLA 4FKGA 4JG7A 3LCDA 5CZIA 4ANBA 5BYLA 1OI9A 5E8XA 5B7VA 1TKIA 2VTJA 2IN6A 3KMWA 4ZZMA 4QRCA 4ANSA 4JR3A 3BQRA 2ITYA 3D4QA 3R2BA 2P55A 1XQZA 4X6RA 4GT5A 2DWBA 4JBOA 4IWPA 2ACXA 5FEQA 4HVHA 3ROCA 2OU7A 4O0YA 3ORLA 4EK4A 4NJDA 1FPUA 3ELJA 4OLIA 5F1ZA 4OTDA 3ZHPC 3U6IA 2C47A 4YHFA 2UZUE 3HEGA 3LXKA 4OBQA 2VUWA 4JAJA 4XOYA 5CT7A 3ANRA 4OGRA 2VWXA 2QONA 4HVSA 4DF3A 3R7EA 2PUUA 3K5UA 1KV2A 4W4YA 1H8FA 2XKCA 2UW7A 2I6LA 4AU8A 4BDDA 1NVRA 3GC0A 3HUCA 3T9IA 3VF8A 5ACBC 2C6LA 3ZH8A 4CD0A 2C4GA 2QOKA 3R63A 4FKOA 4X3FC 5C03A 4KBAA 3ZLSA 2XMYA 4UX9A 4J1RA 2GNHA 2XZSA 2WMVA 3PZHA 5LMKA 4FBXA 2BDFA 5BNJA 3FKNA 3F82A 5AUXA 4M8TA 2W05A 4QP4A 3Q9XA 4K0YA 3HAVA 3UIUA 3UJGA 3ATTA 2BDWA 2Z7LA 3TZ7A 4EOSA 4A9UA 4FTQA 5J9ZA 3N51A 4CFFA 1GJOA 2WTKC 3E7VA 3NNXA 5BYZA 3TJDA 5A6OA 2Q83A 5A4LA 4F1OA 4BGHA 3SX9A 4UMTA 3LLTA 4FTNA 1P4FA 5IA5A 4D1SA 4I6BA 2CKPA 5M44A 2WQMA 3BQCA 4F4PA 2FB8A 5CVHA 1YWNA 1PYEA 3PE2A 3I5ZA 3ORKA 3SD0A 1XH6A 3FEGA 3FXWA 4N57A 1X8BA 3BWFA 5L3AA 5DT3A 5D7AA 1UVRA 2X8DA 2VNYA 1XKKA 3DDQA 4QP3A 3B8RA 4EHVA 3UIXA 4DT8A 4AE6A 4YTFA 4UN0C 1Q8ZA 5T6KA 4BCHA 4N0SA 4EC8A 3LJ1A 5GJGA 5L2SA 5D7VA 4UBAA 2W7XA 5AP1A 4ASDA 2JC6A 4QYEA 3V5QA 4MKCA 1UU3A 2IZTA 3VUTA 3F69A 4XJ0A 3F3WA 4J53A 4LUDA 4ZY4A 5K9IA 3Q6WA 1GIJA 4ZXTA 2CGXA 5HO8A 3W2PA 4EONA 5DR9A 3W2SA 4ACMA 2UW6A 3LFAA 2A27A 3BU5A 2OZAA 3I81A 3RNYA 3I4BA 4DGNA 4RC4A 1M2PA 3SOCA 3UG2A 4BC6A 3BYMA 2OIDA 3OWLA 5C27A 2YZLA 4JLCA 4K6ZA 5M4UA 3DGKA 3UC4A 4PY1A 5CXHA 1KE7A 4DEDA 4XG6A 3PDTA 3QKMA 2C0TA 4YJSA 4D58A 4TYJA 4CSVA 4D9TA 4OBPA 2BCJA 3IW8A 4JNWA 1OIRA 4LI5A 4QOXA 1H1PA 5EYDA 3G9NA 4W4VA 4QMUA 2FA2A 4GS6A 3UQFA 3ID6C 2J4ZA 4XLVA 2XUUA 4U41A 3KF7A 3NVKI 4NSTA 3VO3A 2OLCA 3N4TA 3R00A 4YZMA 3OG7A 4L6QA 4DH3A 3FZPA 3CE3A 2ITUA 3CGOA 3R2YA 4ZOGA 2XK9A 3WYYA 2W4OA 5IH6A 3UP7A 4GFGA 4BL1A 4Y73A 5A4CA 4IANA 4GFOA 3TZ8A 2Z2WA 3OZ6A 3PLAE 4Z55A 4EH6A 2VWBA 4APCA 2FSTX 2JKOA 2W9ZB 4KIKB 2HCKA 4F63A 4JL9A 5C26A 3DKGA 3HMIA 5AA8A 2HY81 3FC1X 5CSXA 2YABA 1UA2A 3DLZA 3FV8A 3D14A 1W0XC 2YM5A 3QZIA 3EL7A 4DEEA 3EQDA 2JD5A 5IMXA 3AD4A 4MK0A 4XBUA 3PA4A 4F9AA 4LRMA 2Z7QA 3GU7A 5EHYA 5IA1A 3UZRA 2F4JA 2A0CX 3ALNA 3RINA 4MYGA 3V01A 5AUVA 3QXOA 4IX4A 3R8ZA 3TV7A 4E6QA 3ALOA 4E4NA 1UWHA 5IH4A 3TUDA 5BVKA 3ZFXA 3F3VA 3LM0A 3DK7A 4GV1A 4X2GA 4RG0A 5E8VA 2GU8A 2XIRA 3FHIA 3MFUA 3QTRA 3BYOA 4DEGA 4IAAA 5HCZA 4XP3A 4O38A 4D0XA 2JFLA 1WCCA 3QD0A 3VS3A 4BDEA 4RX8A 2PVLA 3VS0A 3F61A 2UZWE 4H05A 1PMUA 3G0EA 3SLSA 3HRFA 1Z5MA 3VBQA 1ZRZA 4O7SA 5AM7A 2J9MA 3PPJA 3UOHA 1YHVA 4R8QA 5LVPA 2JDSA 4C61A 5IU2A 4ZS0A 4I3ZA 2I0HA 3QD4A 4JBPA 4LL5A 4ZTHA 4AE9A 3GU6A 3QTUA 2WTVA 3BWJA 2NRYA 2UV2A 2RG6A 5HI2A 3VW8A 4M12A 1P2AA 5I9WA 1HOWA 5EDQA 2SRCA 2X1NA 3LHJA 1PMEA 4HYSA 4KS8A 3ZCLA 4DINA 1JKSA 1OBDA 4FTLA 4QMVA 1BI8A 2BZJA 2ZDUA 3ATSA 1YOMA 1K9AA 5KMKA 3CJFA 3UP2A 3CD8A 1JKKA 4W8DA 3EN9A 4I23A 3D0EA 2GSFA 2W9FB 4PPAA 1YRPA 2GNJA 3R22A 5AWMA 4BZNA 5HLNA 3HNGA 2UW3A 3K2LA 2IZSA 4I6HA 4S32A 2BZHB 1OIYA 5HD4A 3COIA 5HEZA 4I24A 5LVMA 4GG7A 3RM6A 3FZOA 3ZS5A 4JX7A 4ZSLA 4F1TA 1K3AA 2WHBA 4MQ1A 3QTXA 4C2WA 3TNWA 1IASA 4V0GA 1YXUA 1WMKA 3F5UA 1PHKA 2X7OA 2B7AA 3TACA 4IAFA 4BCMA 3PZEA 1PXPA 4MD9E 5DYJA 2XK7A 2QOHA 3ZSIA 5EG3A 1WBOA 2NP8A 5K4JA 5CF8A 3MDYA 5AV2A 3VQHA 3GP0A 1RJBA 2JKQA 2WXVA 2Z7SA 1QL6A 3IOPA 4O6EA 2YZAA 3TNQB 4BCIA 2BRGA 4H3QA 4C33A 3UIBA 1IA9A 2W4KA 4YGAA 4AN2A 3JY9A 4JBQA 4MXAA 4LOPA 2F57A 4IVAA 4O0SA 4XV9A 3RP9A 3FE3A 1ZYSA 2C6DA 3W8QA 3VS2A 1H07A 4G3GA 5EQPA 4FEQA 5E8UA 5EYKA 5FDXA 2GNGA 3FMMA 3A60A 4ITHA 1ZZLA 4U40A 5HGIA 3ZZEA 4S34A 2XCKA 4TWNA 4ZSJA 3WF5A 3BV2A 2IO6A 4PRJA 4AA0A 5K4IA 1JPAA 2P2HA 5CEMA 5HORA 3S1HA 4E6AA 5F95A 3UVQA 2PZRA 3GUBA 4FTIA 4LRKA 5A9UA 3AC3A 3G6GA 3E7OA 4XG3A 4QNAA 4YO4A 3QD2B 3V8TA 4E4LA 3QLFA 2PVNA 3ZDUA 4LQMA 4AW0A 2XNPA 4HJOA 1WBNA 2R3OA 3PJ8A 3C4ZA 2HENA 2QR7A 5BVWA 5A3XA 2BILB 3V5WA 2OH4A 2OXDA 2PK9A 2B9JA 3MVHA 3UQGA 1JNKA 3ZXTA 4G31A 5CS6A 1XWSA 2F7ZE 3QCXA 3SRVA 4D28A 2OFVA 3ZDIA 3PYYA 3BCEA 2ZMCA 1REKA 2QC6A 3LOKA 3NNVA 4OTFA 1CM8A 1CTPE 1Q3DA 1WBSA 4XG7A 5EW3A 2BKZA 2XNMA 4FKIA 5HVYA 2VTOA 2E9VA 5CY3A 3V3VA 4F7LA 4M68A 2IPXA 3UMXA 2YCRA 3NYVA 4BWXA 5K0XA 2ZV9A 3U54A 1DS5A 2P3GX 2AYPA 1JVPP 3N9XA 2O65A 4F0FA 3S0OA 3LLAA 4J7BA 2FH9A 3ZSGA 2PVFA 4ERKA 4L42A 3PWYA 4HVIA 2C6IA 4NKSA 4U8ZA 3BYVA 3QALE 3CC6A 5EM8A 2WU7A 3SW7A 4FV1A 4CGAA 3VUMA 1OKWA 3EWHA 4PPCA 4IM3A 4C36A 1A06A 2WB8A 4CFWA 3BLHA 2RGPA 5GJDA 5G6VA 2PZPA 4FX3A 2PUIA 4XP2A 2WMTA 2HW7A 2Y4IC 3RHKA 2RFNA 3LFEA 3MGYA 4H36A 3FLQA 2QQ7A 1ERKA 5DPVA 3VJOA 4FKPA 3A4PA 3R0TA 4WBBB 3D9VA 2R3HA 3MH1A 4YJRA 2HYYA 3OTVA 3KK8A 5JT2A 3UC3A 2CLQA 3LCSA 2C3KA 4C3FA 2C3IB 4YJOA 2PE1A 5CU6A 5AX9A 2VD5A 3NX8A 4FSQA 3AT2A 3QX4A 1LPUA 3ETAA 4NT4A 4ZS4A 4JOAA 2R3LA 3W32A 3TEIA 3KRXA 4MXYA 3FPQA 4XV3A 3RPOA 1YI4A 3VNTA 4CMOA 5DEYA 3W10A 4TYHA 4PMSA 4C7TA 3QHRA 3TZMA 4G5JA 4CG9A 2R7BA 3COHA 4PDSA 4B8MA 5BPYA 3MVLA 2XA4A 1OUYA 3C7QA 3HV5A 3IW7A 4RFZA 3HKOA 4BCJA 2R64A 4CFXA 3S00A 3Q04A 3PWDA 3OD6X 4TWOA 5HTBA 5L8LA 2WEVA 3KXNA 1YHSA 3BHHA 3Q52A 1UU8A 2V5QA 1CMKE 2J0LA 2OWBA 3EQIA 4IAKA 3FI4A 1YKRA 4XV1A 1Q4LA 3R30A 3CTQA 4RLLA 1GAGA 3R1SA 1YQJA 2CN5A 2O5KA 3AMAA 4YMJA 1ZYCA 4E73A 4FG8A 4OT6A 5IMEA 5E7RA 4AZEA 3AGMA 4WT6A 3Q96A 2A19B 5GNKA 4WRSA 4CFUA 5CU3A 3P23A 2YEXA 3MJ1A 3OT8A 3DZQA 4IZAA 1MUOA 5DG5A 3VS1A 2J0MB 3DKFA 3RPRA 4LM5A 4AZVA 4DAWA 5IG1A 3CKXA 5IEVA 5L6WL 4EH8A 2XBAA 2ETKA 4II5A 3DQWA 3F5GA 5IISA 3FL4A 3KKVA 5L2TA 5J1WA 3G5DA 2YDIA 4AFJA 2XEZA 4DEHA 2J6MA 3SXRA 2KTYA 5JKGA 3WZKA 4DTKA 3G90X 3HP2A 4ANOA 4EZ3A 4I22A 3CBLA 5FQDC 3WARA 1YXTA 3QTSA 4FNZA 2PWLA 3KULA 4J99A 3RCDA 3KF4A 1JKTA 1Y91A 1KE5A 1G3NA 3VJNA 4BBEA 3DK6A 5AADA 2Q0NA 4XCUA 4NTSA 4C4GA 3P4KA 2BR1A 2OBJA 3TKHA 4CMUA 4RJ4A 3FYJX 2WQEA 5M4FA 2Y9QA 2WKMA 4IAZA 3IW5A 3UMWA 3Q4TA 4RGJA 4FSTA 1PXMA 3KQ7A 4WBOA 4N6YA 3A62A 5LVLA 4FOCA 5CEPA 3NSZA 2FGIA 2OF4A 1Q8WA 3LCKA 4FV7A 4R3CA 1CKJA 1MRYA 3TM0A 3BV3A 2AC5A 2WEIA 3DTWA 2JEDA 1U5QA 5AMNA 3OHTA 4K9YA 3R7YA 2YIYA 4CTBA 1XR1A 4RIYA 3THBA 3MTLA 2IWIA 4ANQA 2I0YA 5A4TA 3QQJA 4HOKA 5A4QA 3I7CA 4LV5A 3P86A 2J5FA 3C9WA 4UXLA 5D9HA 3JS2A 3GENA 3O17A 3UBDA 3MY1A 3ZM4A 3E3PA 2WTIA 3MTFA 5EK7A 1KE9A 4R7IA 4GVAA 4BDIA 5IDNA 2Z7RA 2O0UA 4FIIA 3R8LA 5AP3A 1KOAA 5E92A 4FZ6A 4F6SA 4AZSA 4EJ7A 1OKVA 1NVQA 1XH7A 3ROYA 4U97A 3FMJA 4G6LA 3A8XA 4BTJA 1O6KA 4O27B 3F88A 3JXWA 5L2QA 2ZOQA 3V6SA 3QKLA 5CT0A 2GNLA 3IGOA 3LCOA 4WUAA 4EUUA 2JDVA 3ZMMA 4Y95A 3HVCA 2Z02A 3SRVB 3O71A 3NUYA 4EKLA 1H00A 3A2CA 3MY5A 3QAME 4KRCA 4OTQA 3Q4ZA 4ZTQA 2WD1A 4IQ6A 5EHOA 4GK2A 4CRSA 3P5KA 2BALA 3QUEA 4C3PA 4QMPA 4E20A 5GJFA 3HL7A 5LMAA 2ZDTA 4I5CA 4IB0A 4KD1A 4MNEB 5DBXA 5HU3A 2PYWA 4TKSA 5DFPA 3V5TA 5LWMA 3CCNA 4RWJA 4NEUA 3C0HA 1WVYA 3ORZA 3FYKX 4C2VA 3C50A 1H24A 4EHGA 3FMDA 1OM1A 5CASA 3AMYA 1JSUA 3AC5A 5AUWA 3GBZA 3K3JA 1W8CA 3GVUA 4FV4A 4EQMA 4CEGA 5J79A 2J50A 2XJ0A 2B53A 4JDIA 2AC3A 3AC4A 3AG9A 3HV3A 3UGCA 4D4RA 4FEUA 2QKWB 3WZUA 3AGLA 5EYCA 1MQ4A 3RAIA 5DR2A 4UY9A 3FMLA 2JITA 2YIQA 3NUSA 4RC3A 4EQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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