3NYNA

Crystal structure of g protein-coupled receptor kinase 6 in complex with sangivamycin
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
556
structure length
553
Chain Sequence
ELENIVANTVLLKAREGGGGNRKGKSKKWRQMLQFPHISQCEELRLSLERDYHSLCERQPIGRLLFREFCATRPELSRCVAFLDGVAEYEVTPDDKRKACGRQLTQNFLSHTGPDLIPEVPRQLVTNCTQRLEQGPCKDLFQELTRLTHEYLSVAPFADYLDSIYFNRFLQWKWLERQPVTKNTFRQYRVLGKGGFGEVCACQVRATGKMYACKKLEKKRIKKRKGEAMALNEKQILEKVNSRFVVSLAYAYETKDALCLVLTLMNGGDLKFHIYHMGQAGFPEARAVFYAAEICCGLEDLHRERIVYRDLKPENILLDDHGHIRISDLGLAVHVPEGQTIKGRVGTVGYMAPEVVKNERYTFSPDWWALGCLLYEMIAGQSPFQKKIKREEVERLVKEVPEEYSERFSPQARSLCSQLLCKDPAERLGCRGGSAREVKEHPLFKKLNFKRLGAGMLEPPFKPDPQAIYCKDVLDIEQFSTVKGVELEPTDQDFYQKFATGSVPIPWQNEMVETECFQELNVFGLDGSVPPDLDWKGQPPAPPKKGLLQRLFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Molecular basis for activation of G protein-coupled receptor kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords G protein-coupled receptor kinase 6
total genus 169
structure length 553
sequence length 556
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.16: [G-protein-coupled receptor] kinase.
pdb deposition date 2010-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00615 RGS Regulator of G protein signaling domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.167.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Regulator of G-protein Signalling 4; domain 2 Regulator of G-protein Signalling 4, domain 2 3nynA03
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3nynA04
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3nynA01
1UWJA 2PVLA 3R7VA 4BCQA 5J9ZA 2VTAA 2OO8X 3LIJA 3E8CA 3PXZA 4IHPA 3UPXA 5G1XA 4KABA 1OKVA 4JDKA 3RJCA 5IISA 3P23A 4XJ0A 3EFJA 2W5BA 4CCUA 3N4VA 4FKPA 3UYTA 2ITNA 3TNHA 4AUAA 3MDYA 4DGMA 4MK0A 2UZLA 3MPAA 2PVKA 3QLGA 3NR9A 3QQLA 2B7AA 4FSQA 4N4SA 4V05A 4C0TA 3ORLA 1Q8WA 4RJ7A 4QYHA 3BZ3A 4C3FA 1NT2A 3Q32A 2QOFA 4EZ7A 3F3WA 3F69A 5EDRA 2H96A 2ZOQA 3R7UA 5FQDC 4IJPA 5A6OA 3PZHA 4M8TA 4R77A 2KTYA 3UGCA 1WCCA 4U42A 4BIEA 4GS6A 3UO4A 5GHVA 1APME 4YJQA 3VUHA 4GL9A 1H0WA 3ZXZA 5JFXA 4NW6A 2EWAA 3QRTA 5KCVA 2IZTA 3S00A 2IN6A 4KKGA 3R00A 1YXSA 2YIYA 3GU6A 3COMA 3HV6A 3MIAA 3MY5A 5DGZA 4AAAA 2FVDA 2YISA 2XKEA 3KN6A 3LJ0A 4KRDA 4RC4A 3PE2A 5AA9A 3V5TA 4PL5A 2EU9A 5D12A 3ZUUA 1QPCA 4EKDB 1IASA 3BV2A 2OIDA 4PMPA 5ANGA 3NUAA 4CEGA 3NUNA 5FLFA 4Z7HA 4MYGA 2OXXA 2P2HA 3UP7A 4RX5A 3Q5ZA 2J0MB 3LJ2A 3G90X 3P1AA 5EFQA 5D41A 1FQKB 1OL5A 2V55A 4FUYA 4I92A 3ZH8A 2WMXA 2XBJA 4B8LA 2QOIA 2QQ7A 3PE1A 3RHKA 3BYMA 2A19B 4ORKA 3CKXA 4AACA 1PW2A 2QI8A 2R3MA 4QO9A 3G0FA 5HESA 4B99A 3AG9A 4O1OA 5L2WA 3LCOA 4OLIA 5GNKA 3H0ZA 2VZ6A 2WIHA 3R7OA 3TDWA 3ALNA 1TVOA 4ZP5A 4CZTA 4P5ZA 2ITWA 2JDTA 3I5NA 2VX3A 4IZ5A 3E3BX 3ZS5A 3LCDA 2GS7A 5EQYA 4C02A 3T9TA 4ITIA 2ESMA 4N0SA 2OGVA 3VS6A 2OZAA 3D4QA 4IB0A 4KBCA 2FGIA 3OT3A 3PXQA 3HKOA 3EQRA 1R3CA 1DS5A 4MBLA 4JDIA 4RIYA 1SMHA 4AFEA 4WA9A 5TO8A 4AZTA 4KIQA 3DU8A 5IQBA 4XRLA 4CNHA 4FTIA 2GNIA 1IEPA 3V8TA 3ZM4A 4IZYA 4BDEA 3QCQA 1OUYA 2FSOX 2Y7JA 4B6LA 2SRCA 5GJFA 3W55A 1SNXA 2B9IA 3QZHA 5J5TA 4ZK5A 3FJQE 3BEGA 3O7LD 4G3CA 1Q3WA 4QPAA 4TXCA 4YJOA 4EQMA 5M08A 2VTMA 5DR2A 3R9NA 3AC1A 2FSTX 4ZTSA 2PVMA 4BRXA 3GENA 4PDPA 4EC9A 4YZMA 1OZ1A 2ITXA 3CJFA 4EEVA 3FYKX 3LXLA 4BGQA 1RW8A 5M4UA 4DTAA 2WMTA 2CGWA 5L2QA 2OW3A 1KE9A 3IW6A 3HP2A 1JKLA 4O2ZA 3O17A 3AXWA 3TXOA 3RAKA 3FQEA 5CZIA 4ACHA 4Z55A 3KK9A 3MH1A 1OBGA 5HOAA 4D9TA 4QMWA 3LAUA 3MIYA 3U54A 1ZOHA 5HIBA 4ZSJA 3ZLXA 2BDJA 5HX6A 3FC2A 2XJ0A 3G9NA 2CGXA 3BGPA 2UW3A 4JT3A 4EOLA 5CT7A 3GOKA 1GZNA 1XHAA 4OTFA 2GNHA 3U6IA 3HV5A 3LQ3A 3DT1A 3F5XA 3RWPA 3WZKA 3R8LA 4JAJA 4NT4A 2ZVAA 4QMVA 4KBKA 4DLIA 1PXIA 2BRBA 4L52A 4TNDA 4Q5HA 4EH9A 3VIDA 2JAVA 5A14A 2J5FA 3UOHA 3EKNA 4AG8A 3QTRA 4GVAA 4JNWA 4FKIA 2RFNA 3HA8A 5AADA 2XKCA 3A7IA 3PXRA 5DR6A 2ONLC 3U51A 2X4ZA 3LFSA 5CQWA 3DTCA 2B9FA 4CG9A 4FODA 2QODA 5J7HA 3NW6A 4DG3E 1H28A 2YJSA 3EQPA 5CXZA 2GQSA 3PVGA 4E6QA 4O0RA 2Q0NA 4WUAA 2UZEA 2O65A 3CGOA 4DF3A 1TQIA 2VWYA 4L3LA 4R8QA 4UWYA 3NNUA 3KVXA 1JOWB 3DS6A 1P2AA 3QBNA 3GC0A 4IAAA 4D4SA 5IMXA 4WG5A 4BBFA 2B9HA 5AP5A 2JKQA 4P2KA 1S9JA 3KFAA 5LMAA 2VGPA 4IX3A 5CWZA 3RK7A 4F99A 5CAPA 2F4JA 4FT3A 4IDVA 4IVCA 2HW7A 4JVGA 4AFJA 1YW2A 3GQIA 3NUUA 1WZYA 4XV3A 3BYOA 3SXRA 3FZPA 3Q60A 5C26A 3TG1A 2F57A 3P79A 5FD2A 3IECA 3QTWA 3ORPA 4ZZMA 3HGKA 3MB7A 4YLKA 2JFLA 4KD1A 5CF5A 5IUHA 2PYWA 2XIKA 4L46A 4AT3A 2OG8A 3A7FA 4PX6A 4WNPA 3VBTA 3TN8A 3IKAA 2VTPA 2VWZA 5IEYA 4ZSGA 1M7NA 1U54B 3ORKA 4OTPA 5IPJA 5K0XA 4BCNA 4HVDA 4RA5A 4ANQA 1Z57A 4FKQA 4AZFA 5FTQA 2ZM3A 5A4QA 3UJGA 4AA5A 3RPRA 4BI0A 4F63A 3KY2A 3NPCA 5DMZA 2NNWB 3BPRA 1M7QA 4ID7A 4XCUA 5IG1A 5A6NA 1BI8A 3QZGA 3RNYA 4TRLA 4EOKA 2R3RA 2YWPA 3EL7A 1XH6A 4G9CA 3G6HA 2GCDA 3C9WA 5CQUA 4JBOA 1QL6A 2QNJA 2VUWA 1H1RA 1X8BA 3Q4UA 5B2KA 5C01A 4RQVA 5EH0A 4DEBA 4TWCA 2WU7A 3AMBA 4KIPA 3TI1A 3VUTA 2QR8A 4BDDA 4IFGA 2YABA 5AFVA 3R7YA 5AP2A 4ZTQA 2ITPA 2OH0E 4YZ9A 4UXLA 3QYWA 4RIXA 3H9RA 3PY0A 4FTNA 4BDBA 2IVTA 4WHZA 4CFVA 1M2PA 2JKMA 4XH6A 3O7LB 1WAKA 3OOMA 3U9NA 3MI9A 3MJ1A 4FSWA 5AA8A 4LGGA 4RT7A 4FVPA 5D7AA 4RX7A 3PXFA 5CU3A 3E87A 3GC9A 1YWVA 3LM5A 3PIYA 1ZYDA 4JR7A 4C38A 4U7ZA 4AZEA 4ZLOA 3C1XA 4ASZA 4F1MA 4FZDB 2XK6A 5I3RA 2CCIA 5J1WA 2IZSA 1SVEA 1EMUA 3OTUA 4WKQA 3BWJA 3DAEA 4EOIA 2VU3A 5AX9A 3F3UA 3FKLA 3NVKI 4CSVA 3SG9A 4MXZA 4EH3A 3LQ8A 4Q9SA 3HL7A 3VUKA 1DK8A 3GCSA 3O50A 3S95A 3WIGA 2ZB0A 1OIQA 2ZV2A 1PXNA 3AD5A 4FT9A 4IAIA 4U44A 3RK5A 3OZ6A 3V5WA 3AC3A 2UW6A 1UVRA 3DBFA 5I5ZA 3TNQB 1J3HA 2PHKA 4YHTA 2WB8A 2XIXA 1XBBA 2XMYA 3DGKA 3VRYA 4AOIA 3SC1A 3ZSIA 3ODYX 2W5AA 5AR3A 5CANA 3PPJA 5EHLA 3D5VA 2YACA 3EN5A 3IW4A 5BUEA 1W0XC 4I22A 2XK3A 4EOPA 1KSWA 1PJKA 4TYHA 3G6GA 4C4FA 4JG7A 3PJCA 4HVSA 3KCKA 4FNXA 5DEYA 3FI8A 5LVLA 4JLCA 4AWIA 1J7UA 5M07A 3MPTA 4EJ7A 4ZJIA 3VBQA 4PNKA 3OBGA 1KE6A 3DBDA 4L67A 4XG9A 4G6OA 2Z8CA 4XS2A 4MWHA 3RALA 4QMUA 4ANOA 1PHKA 3MVMA 4CYJA 3P7BA 2VTHA 4MXXA 3CQEA 3KKVA 1UNLA 2CKEA 4UV0A 4HJOA 4C37A 4E6CA 4G5PA 4RBLA 5KKRB 3BBWA 3FXXA 5JQ8A 3U87A 4Y95A 3DZQA 4F9AA 4YBJA 4ACMA 4ALUA 2X2LA 2C4GA 4IH8A 2YAKA 3FAAA 3DJ5A 3GB2A 4BF2A 4O7NA 2W1ZA 2RKUA 4KINA 4R1YA 2WMWA 3CY3A 2W1HA 1XJDA 4UMTA 4B0GA 5IH6A 4O38A 3FMJA 3SDJA 3AD6A 3EFWA 4QMOA 4F64A 2UZBA 4MTAA 4PPBA 3W16A 4IWPA 3K54A 2Y9QA 4U97A 4Y46A 4MF1A 5D1JA 4EQCA 4YU2A 4ZTMA 3GCQA 4MXCA 3NVMB 2BMCA 4ZTLA 3OXIA 4UMQA 4U43A 3R8MA 5FBNC 1LR4A 2ITVA 3FLSA 5AP3A 2B53A 2Y4IB 5AM7A 4M84A 1M2QA 4CMOA 1YHWA 5HLNA 5M4IA 3IPHA 5DO9B 3IW7A 5AV2A 3PRIA 2OJ9A 1M2RA 2OF2A 3CTHA 5IMEA 4A07A 1JPAA 3KXMA 2ZDUA 1EH4A 4EHZA 4QMTA 4G16A 4RIOA 5LVOA 4FGRA 5D10A 5H3QA 1P4FA 5HTCA 4U5JA 4BDGA 3HRBA 4ZZOA 3U4WA 3QZIA 5KUPA 4LGHA 4QNYA 5KMKA 5E9EA 5H8EA 1E1VA 4WOVA 1KE8A 2OZAB 2RF9A 4IX5A 4QP6A 1OGUA 4O7VA 4IX4A 3WZDA 3OVVA 2C5NA 3FI2A 2OJJA 4YC8A 3JY9A 5GIOE 4MQ2A 3NYVA 4RIYB 5ICPA 5HU3A 3HDNA 2YCFA 3F3ZA 3FPQA 2GQGA 4EONA 5IQIA 2UVZA 2QO2A 4JOAA 4NM0A 4OR5A 2I0YA 5FRIA 3UMWA 1ZMVA 4RJ4A 4ACGA 3P08A 3KGAA 4BDAA 5CSXA 4CCBA 3A99A 3SD0A 5KHXA 4ZMEA 4AN9A 3FMKA 4DT9A 4AZSA 2QVSE 3ZLWA 1XH4A 4QPMA 4V0GA 4JL9A 2Y8OA 3QX4A 2UVYA 5E8TA 4AA0A 5KHWA 3SKCA 5TR6A 4J95A 4AOTA 3UZTA 3AGLA 1I44A 3TZMA 2V0DA 2HAKA 1CKPA 3HV3A 2FA2A 4I23A 5A4EA 5FUTA 4TKSA 4ZOGA 5F94A 4X3FA 2W9FB 4NIFA 4F4PA 1TQPA 4Q9ZA 4O7ZA 2ODEB 2IW9A 4QP3A 4I6FA 5ANJA 2WMUA 3R04A 2W4JA 2VWUA 3CY2A 4HVHA 4XP2A 3CQWA 1WBSA 2QD9A 2Z7QA 4YC3A 4EK4A 1V1KA 2A4LA 4DEAA 4DINA 3ODZX 4C58A 1J1BA 3QGYA 3ACJA 4KIOA 2B55A 2PULA 3MA6A 3GCUA 1PF8A 3C50A 3OWLA 4FUXA 4J53A 5CZHA 1ZMWA 3A7JA 4WNMA 5AUZA 5JZNA 4CKRA 2W1CA 4O22A 4BDFA 1UWHA 4RGJA 1UU8A 1SVGA 4W4VA 3KEXA 1XBAA 3ACKA 4APPA 4E1ZA 4FZ6A 3R9DA 4NYEA 2JC6A 3DPKA 3PP1A 5DNRA 4AGDA 5E8WA 3ZM9A 5AV4A 1ZXEA 2J6MA 3HV4A 3I81A 4FKWA 4PV0A 4XHKB 2R0IA 2VGOA 4IB3A 3F7WA 3FHRA 3QC9A 3KRRA 3H0YA 4FIEA 4I6BA 4XUFA 2YHVA 3K2LA 2XM8A 1Y6AA 3R22A 3R71A 4HGEA 3HMIA 1SZMA 4FT0A 2VX0A 5LOHA 3PJ8A 2J0JA 4FVRA 4ZLYA 4ZMFA 5KMMA 3WILA 3FMHA 5EI8A 3AT4A 3C7QA 1JSVA 2EBZA 5L8KA 3QQJA 2PK9A 4YTIA 3TACA 2X8DA 1M14A 2BHEA 3DY7A 2GQRA 4EOMA 4GSBA 3QKMA 3E62A 2JIIA 4TT7A 3ZEWA 4DGLC 5L6PA 3VS0A 4JX7A 1YOJA 1FGIA 3CBLA 4I41A 1PXOA 2Z7RA 5HBEA 4EJNA 2UZUE 1WBVA 1PXMA 4BBEA 4BZNA 1PMVA 3ZFMA 3H10A 3PFQA 4LMNA 4XOYA 3MH2A 1YOLA 3D83A 5BYLA 4D1ZA 5CI7A 3DOGA 2B0QA 4K2RA 5KKRC 2C0OA 1A06A 1XWSA 5EM5A 1Q61A 3A2CA 3G9LX 4YBKA 4CRSA 4B8MA 1ZRZA 4FTKA 4G1WA 4CV8A 1H1SA 4QQTA 2C6LA 4RX8A 4MKCA 4AOJA 3R8ZA 3E8NA 3ID6C 3OWJA 5BVEA 2X2MA 3C13A 3UNJA 4FSTA 2Z7LA 1WVYA 3SAYA 4QOXA 4X2FA 3C4XA 5C8KA 4ZSAA 2XK7A 5DR9A 2EVAA 3RPYA 3NLBA 2O3PA 3HMPA 4J52A 1YI4A 3DB6A 3NW7A 4FV0A 5LWMA 4I4EA 2X7GA 4OTGA 4RJ6A 3ZHPC 4ZSLA 2G2IA 2QLQA 2J0KA 1ND4A 3DNEA 4X6RA 2FH9A 1CKIA 2QLUA 4KBAA 5J5SA 2X39A 4IWQA 3EKKA 5LCKA 1A48A 2XJ1A 4YHFA 3ZUVA 1FQIA 1WBNA 1YXUA 1XH5A 2LAVA 4BCPA 2HWOA 3MJ2A 1ZARA 4D5KA 4PPCA 4KS7A 4XG7A 4BDCA 4B9DA 3FEGA 2YDJA 4M13A 3QKKA 3ZXTA 4JQ8A 3TWJA 1WBWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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