5BMSA

Crystal structure of p21-activated kinase 4 in complex with an inhibitor compound 29
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
290
Chain Sequence
GSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-Guided Design of Group I Selective p21-Activated Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 4
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 290
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bmsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bmsA01
3UQCA 5CEMA 3POOA 1XBBA 2ZV9A 3N9XA 1IASA 2HWOA 4F0IA 1OITA 1MQBA 3EQBA 2QG7A 4I5PA 3UC3A 4YLKA 4AXAA 2OJ9A 2XP2A 5LARA 4EWHA 5FEQA 4EL9A 3UJGA 4DH8A 3C5UA 1QPCA 4Y72A 3ERKA 4AT4A 2OFUA 4H3QA 4WSQA 3RPRA 4NZWB 4XYFA 4AX8A 3ET7A 1PF8A 4BYIA 4BCJA 1J1CA 3HRCA 4EOOA 4CKJA 4KD1A 2ITOA 1H00A 3NLBA 3Q6WA 3KXXA 2B9JA 2GHLA 3G0FA 5E90A 5AUWA 2EB3A 3F3VA 1H27A 3VS4A 2XZSA 3ACKA 3DKFA 2QLQA 3FXWA 3UG1A 2WHBA 3U87A 3EKKA 3ORTA 1OM1A 4WNKA 5J9LA 4KKHA 5EYCA 2YCRA 3T9IA 3COIA 4CRLA 2XKCA 4PDOA 2BALA 1VZOA 5CU6A 4LM5A 5CTPA 5CU4A 2NP8A 3Q9WA 4F0GA 3FY0A 4FTOA 4DLIA 4RIWB 1KUTA 4AS0A 4OTQA 5EI6A 2XEYA 3CEKA 2IVSA 4E4XA 3PXKA 5LVLA 4C3FA 3EQDA 4EK5A 1NT2A 3P0MA 4PF4A 2C69A 4D0WA 2CGWA 3L8PA 5FLFA 3PXQA 5I9YA 3SRVA 3OY1A 4FKTA 2A4LA 2R3OA 4S34A 3MS9A 4C3PA 4W8DA 2RFSA 1IAHA 2XIRA 3VS5A 4HVGA 1R78A 3E3BX 3N4TA 2W99B 3FQEA 2XM8A 3LCTA 3FZOA 1AD5A 3Q52A 4B8MA 4F1TA 2QOOA 1H0WA 1E1XA 1S9IA 4EH9A 3R04A 4FZAB 4I6BA 4QNYA 4C7TA 4OTWA 3JYAA 3IGGA 3KVXA 4KBAA 4YHFA 4CLJA 4UXQA 2P2HA 2PVMA 2VTNA 5EYMA 2R3GA 4C4FA 5IEVA 5BX0A 4APPA 5KBQA 1OL5A 2A27A 4YLJA 4PRJA 1FBNA 4H39A 5IQIA 3GC7A 3UYTA 4RWKA 3E92A 2AC3A 4C2WA 3WZJA 4XOZA 1PHKA 2YM4A 4LI5A 3BHTA 4GU9A 2X6DA 3EL8A 4GL9A 4Q2AA 2OJJA 1Q99A 3FMMA 4PMPA 2OIBA 4PQNA 4QYHA 3LM5A 5C8MA 5M07A 5IA3A 2DS1A 4CZYB 4OBPA 2B4SB 1UU3A 3RNYA 2J0LA 1Y8GA 2PZRA 2Y8OA 1CDKA 3CE3A 2XK9A 5CVHA 3S3IA 4QMNA 3EQCA 4C0TA 4FVQA 4D9TA 2UVYA 3GCPA 4KABA 3B8QA 1OIRA 2CGVA 3FKOA 4RIYA 2W05A 4QMMA 3Q6UA 1WBNA 5HNBA 1DAWA 1ERKA 2UW7A 3VBQA 3I7BA 3P1AA 3FEGA 4D0XA 5I4NA 2WELA 4IB5A 2XEZA 4FSWA 2GCDA 2DWBA 5IKWA 4RC3A 1JSUA 4FIIA 2RFNA 4YTHA 1IRKA 1U54B 2DYLA 3OC1A 4RVTA 3EHAA 1GNGA 4P2KA 4QRCA 4FKVA 3NCZA 4DLJA 1KE8A 4HGTA 4XV3A 5IUIA 4ANLA 2Z8CA 2OICA 4FIJA 1RE8A 5HOAA 3KGAA 4UY9A 3GU7A 2IWIA 4M0ZA 5C01A 4OUCA 3RI1A 3QQJA 4TKSA 3ULZA 4QP2A 3MA6A 5CVFA 1M17A 2UW4A 4C62A 4MVFA 2ITUA 3EMGA 3KK8A 4CFFA 3NW6A 4X21A 4DT8A 1CKJA 2J9MA 4IZAA 5HX8A 2WTDA 2ZAZA 3KF4A 1IA9A 3FE3A 5DT0A 3U4WA 3QTRA 5KMMA 3D83A 4FSYA 4DE4A 2JAMA 4D2SA 2QLUA 3W32A 2WTCA 4ZZNA 2ITYA 2V5QA 4GV1A 3AMYA 3Q04A 5HVJA 4C33A 5JEBA 3P08A 4EHEA 1PXOA 5AP3A 2CKOA 4ZS0A 4FKPA 3KA0A 1PXLA 4GYGA 4FNWA 4BCGA 3A4PA 3EQPA 2WMAA 3ROYA 4WRGA 3ZXZA 4EHGA 3KMMA 2ITPA 1H1WA 3R21A 4O6LA 3OTUA 4QPMA 5A54A 2OH4A 2O3PA 5CAQA 5IDPA 4GYIA 5D1JA 2PE0A 3PJCA 4NUSA 4QMWA 5EDPA 4ZTRA 1W98A 3IW6A 5CSXA 4RFMA 3CXWA 3QUPA 4AN2A 2VO0A 3RWPA 3HV7A 3LW0A 5FWKK 2YDJA 4FA2A 4V0GA 3GXLA 2VTSA 1VJYA 2W5BA 4R8QA 3VS1A 2PVHA 3ALNA 3NVKI 1MQ4A 1YDTE 3KXMA 3AMAA 2WEIA 3IOPA 3F3TA 3Q9ZA 5I9VA 1RDQE 5H9BA 2C3LA 4RBLA 4XX9A 5J8IA 4CV9A 1B39A 4EZ3A 4D2PA 5J7BA 4U45A 1OUKA 2UW5A 3KU2A 2BZKB 5CF8A 3FZTA 2VO7A 2O0UA 5BVWA 3FI2A 2J0JA 3C7QA 3PA5A 3CLYA 2REIA 5ETAA 3K3IA 3ZU7A 4MEDA 5HNGA 1WBSA 4YJTA 5KNJA 4KSQA 2ITZA 4ZOGA 3TIZA 5HVKA 3LMHA 3RAHA 1SVGA 3EFWA 4QTBA 4IHPA 4WNMA 3KCFA 2ZM4A 1UKIA 4O7RA 4F9CA 3HMPA 1YRPA 1YWVA 3QALE 3NYOA 3I0OA 4O81A 4CFMA 5FTGA 4NM3A 3PPJA 4A4LA 2Z2WA 3V6SA 1P5EA 3F88A 3NW7A 5D9HA 2XMYA 5JZJA 4UYAA 3SG9A 3FYJX 2C30A 4TYIA 5HBEA 3Q3BA 4WKQA 3OUNB 2G2IA 4FV6A 4GT5A 4I20A 3V3VA 3H0ZA 4JDKA 4Z16A 5HTIA 3QX2A 3OEZA 5HG8A 4KS8A 1ND4A 5HIEA 1G8SA 2WKMA 1B6CB 3VBTA 3A4OX 3GC8A 2YITA 3FMJA 3FYKX 4AZFA 4IE9A 2YCSA 2E2BA 1YHWA 3D7TA 4LUEA 4GFOA 3C50A 5HBHA 3PP1A 4GK2A 2BDWA 1H0VA 2R4BA 4LUDA 4YC3A 4HYHA 3FMNA 3H10A 3ZLXA 5IA4A 3CP9A 5JGBA 3I1AA 3TNHA 4NJDA 2Y4PA 4YGAA 4A4OA 3E64A 4AOTA 5I3OA 4TXCA 5BVOA 3Q2JA 4KIPA 5DT3A 1QPJA 4GCJA 4C35A 2Y4IC 4ZTQA 3UODA 1ZYLA 2FH9A 3KULA 4X3FB 4EYJA 5AP2A 4AU8A 2VTIA 4LMUA 3VBVA 2HWPA 3P7BA 4FKIA 2BHHA 2HZ4A 5CXZA 4NFMA 1BKXA 5IU2A 3QZFA 3RJCA 4G16A 3IDCA 3O50A 2X4ZA 4IX5A 3ZS5A 2RFDA 4G17A 4FTRA 1DM2A 3COHA 5JZNA 3RAWA 3IW8A 3SQQA 1XWSA 2E9UA 1MRVA 1OKWA 4P7EA 1WFCA 3PSCA 4APCA 2ZJWA 3CY3A 4CG8A 2GU8A 3AC8A 2CNUA 3F7ZA 3V5LA 4HVDA 3VQUA 3EN5A 3ITZA 4H3PA 4EOIA 2C5NA 4FNXA 1QL6A 5CI6A 5JH6A 3U9NA 3VUHA 3R9OA 2QOKA 5EI2A 4RT7A 1H24A 3AT3A 2R3MA 3PSBA 4JX7A 2XNOA 4G5JA 4JIAA 2ZDTA 2Y6MA 4BZNA 4USDA 3FHIA 5IA2A 1BI7A 2XIZA 3MBLA 3LFCA 3R8LA 3W2PA 5E8UA 3E8EA 4C4HA 2PVFA 3DOGA 4BL1A 4Q5EA 3U9CA 3EN7A 4HPTE 5TOZA 5BVFA 1A48A 5EW9A 1IA8A 3HA6A 5M56A 3L9PA 5BQ0A 2JEDA 1JAMA 3LHJA 2VTMA 3VS3A 4QP3A 2RIOA 4MD8E 2EUFB 2BFXA 3ZFMA 4EZ7A 3I4BA 1A9UA 3A60A 3QUDA 4O2ZA 1PYEA 1T45A 2JDRA 3GCSA 5J95A 2Z60A 3AG9A 5GJGA 4ZSJA 4Y8DA 4W9XA 4Z9LA 4TZRA 4FEVA 2UZWE 4OTFA 3AT2A 4QYGA 3JVRA 3E93A 5IQBA 3BYMA 1F3MC 2J90A 2LAVA 4LRKA 4KSPA 5JGAA 4ZIMA 4CG9A 3DJ7A 3O7LB 2UVXA 1FVRA 1PXJA 2ITXA 4O0YA 2PVNA 5CAUA 3HMMA 1GIIA 3D15A 5HEZA 4DCAA 4QMPA 4YUQA 1L8TA 2OZOA 3D9VA 4K2RA 4CKRA 4AW0A 3A62A 3OY3A 3AOXA 4MXZA 2W1CA 4RJ7A 5HTCA 2VGPA 5KZ0A 4NSTA 4ZY4A 2NRYA 1OIUA 3PJ2A 1Q3DA 2C6MA 3VN9A 3R02A 3PUPA 4F7NA 4II5A 4E73A 4HVHA 3O71A 4MXOA 4FTMA 4P4CA 4DEIA 2W1DA 3OT3A 3DXNA 1Q8UA 5KE0A 3R30A 3MB7A 4IFCA 4RIXB 2R3LA 4ASZA 5DR6A 3DTWA 3HMOA 2CJMA 3L8VA 3QLGA 1Q97A 3ZSIA 2HW7A 4ITJA 1STCE 5DH3A 1PMNA 3TXOA 3RPYA 3WF9A 4J53A 5D7AA 4CTCA 1JQHA 4GFMA 4FL3A 3SGCA 3BQCA 4FG7A 5BVNA 3Q5ZA 4IANA 5HD4A 2P55A 2YEXA 1TKIA 2PVKA 4IVDA 1H1RA 3PA4A 1OPKA 3P9JA 5J9YA 3LFNA 3EOCA 5C4LA 3AC3A 1NY3A 3RCJA 5HO8A 4O7YA 4YJQA 3SKCA 5M4UA 5DGZA 2QOQA 5HNIX 4FEWA 4PL4A 3ORKA 3BLRA 4JAIA 3CC6A 4AT3A 4CLIA 4CV8A 3JY9A 3ZEWA 4G3GA 1HOWA 4FKWA 3ZC6A 4B99A 3TDVA 2Z7QA 5GJFA 4LL5A 4XG8A 4K6ZA 4N6YA 4IVAA 5H8EA 5HTBA 5D41A 3FZ1A 4QOXA 1WCCA 3F2RA 4W4WA 4LG4A 3R1SA 5C9CA 5HQ0A 3ZO4A 5HHWA 2WQBA 2J50A 2B53A 5LMKC 1APME 3OHTA 5KCVA 4FVRA 1KSWA 2ZYBA 3KRJA 3MYGA 5ETIA 3FLNC 1M2PA 3GC0A 4F7JA 4YZDA 2XNNA 4FI1A 2FVDA 4FGRA 3SAYA 3QWKA 3GCUA 5CU3A 2JDSA 2X8EA 3TACA 2EXEA 4JRVA 4MBLA 1JKLA 1JKSA 3O0GA 5AMNA 2QKWB 4O84A 1WVYA 4J98A 4EJNA 3AMBA 4ZMFA 4HJOA 5B2KA 4ZS4A 4I6QA 5GNKA 1OI9A 2PHKA 5CF6A 4FKLA 4Y85A 5HZNA 3R8VA 2C0OA 3QCSA 2HENA 5M09A 2RG5A 1G3NA 1TVOA 3ENHA 5EG3A 3S1HA 4EOJA 4JNWA 5AIKA 4BKZA 2VV9A 4NTTA 3PG3A 4YPSA 4C61A 4F99A 3TNWA 5BMSA 5L6OA 4QMYA 5FXRA 5CEKA 2BPMA 2WMXA 4IWPA 3CCNA 2RFEA 4FG9A 3TNPC 3ELJA 5I3RA 3TI1A 4UMPA 3D7ZA 2C6KA 4AGCA 2B7AA 4XEYA 2XNMA 3QQKA 4AAAA 1PKDA 5JQ8A 3WILA 1PXKA 3WYYA 4BZDA 3WZEA 4GS6A 2JIIA 4FV8A 4MKCA 4A9TA 2YABA 3EYGA 4CSVA 3UG2A 4DF3A 3D0EA 4I3ZA 1UVRA 4QMSA 4BDHA 4TYHB 5FUTA 2R3FA 2W1IA 3F9NA 2QURA 4FV9A 3HUBA 2VTQA 1AGWA 3C4FA 3ZOSA 1V1KA 1WBWA 3MFUA 2X39A 3DGKA 3ZRMA 4PMMA 5FDXA 4ASEA 4HW7A 2OIQA 5HIDA 2CGUA 4JQ8A 3TT0A 3V04A 2PYWA 2WTIA 5BVDA 5IQGA 3LFEA 3LLTA 2CSNA 2OG8A 2WU7A 3R7GA 3FMHA 4IB1A 4NIFA 4LYNA 3HV3A 1Z5MA 1UWJA 3OWKA 4D1XA 3V5TA 2F2CB 2JAVA 4C59A 4CCUA 3UO6A 2C6EA 3GP0A 4P5ZA 4TT7A 3VIDA 5CANA 5J79A 2XK3A 5AR7A 5IUGA 2CMWA 4YR8A 5AAEA 5EQPA 3PXZA 3QAME 2RKUA 2V62A 2F7EE 3TL8A 3V6RA 3GUBA 3N4UA 4O86A 1VEBA 3PIYA 2C47A 5DN3A 5EW8A 2QC6A 5GZ9A 2ITVA 3COKA 4ZTMA 5JRQA 3E63A 4M84A 2I7QA 2VX3A 1FQ1B 4NKAA 3D2IA 5DR9A 5AWMA 4DGMA 3UIXA 4WT6A 4ACGA 2BROA 4IAZA 4LQMA 4PPAA 3QC9A 5EHYA 3G5DA 2FSOX 3FSFA 3HMIA 2PK9A 1SVHA 4I41A 4L43A 3UOLA 2UZBA 4RIOA 5GIPE 2HOGA 5CSPA 4H05A 5FM3A 4ERKA 4TYGA 5AV1A 4Y95A 2OK1A 3BV2A 3MWUA 2PY3A 1IG1A 1V0OA 4FV4A 4FSNA 3W16A 2UZEA 4K33A 2HXQA 3RK9A 4JG7A 3KRLA 3OW4A 4DEHA 3BIZA 3BWFA 3QZIA 5L2IA 3HP5A 4O0TA 4U0IA 4AFEA 2P33A 3KXZA 4M3QA 4PV0A 5LMAA 4R77A 3OXIA 2X81A 3DU8A 2JFLA 3E7OA 3HV6A 2R3IA 3I81A 2G1TA 2CKPA 4RJ6A 3NNUA 4KKEA 4MNEA 3B8RA 4XV2A 4D2VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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