4FF8 | Genus

Total Genus 53

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	53
sequence length	218
structure length	169
Chain Sequence	KEFDHPHVAKLVILPFMKHGDLHAFLLASRIPLQTLVRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVAVKWLALESLADNLYTVHSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Mus musculus
publication title	Highly selective 2,4-diaminopyrimidine-5-carboxamide inhibitors of Sky kinase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3
total genus	53
structure length	169
sequence length	218
ec nomenclature	ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2012-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ff8A00

4GFGA 2VWWA 4XLIA 4S34A 3IGGA 4CTCA 3DKFA 3HLLA 3LZBA 2W1EA 4J1RA 4RQVA 4UZDA 3PY0A 5IKWA 1YW2A 1IG1A 2B1PA 3GCPA 2FGIA 4I3ZA 4L68A 4WO5A 4DFLA 3II5A 3FMEA 5IUIA 5EHYA 2VTQA 3PVUA 4BDIA 4KRCA 3R02A 4QQ5A 3DDQA 4EH8A 1W0XC 4ZY6A 3P78A 2B55A 4QTEA 4UMUA 4F4PA 4HGTA 4AN9A 2XB7A 4TW9A 3AC2A 2UZDA 3F7WA 4MXAA 5DN3A 4G3EA 1Q41A 4GT4A 4JIAA 5ETFA 3RPSA 3UP7A 4AZWA 4BWKA 5BUIA 4YJSA 4HYIA 2HOGA 1TQIA 4O27B 4J7BA 5DGZA 4HW7A 3NSZA 5BYZA 2WAJA 2ITXA 4L44A 5BVNA 5H3QA 5CZHA 3SOCA 2ZV9A 4JG7A 5CI6A 4CNHA 5HG5A 1NA7A 2VWBA 4C2VA 3D5WA 4R8QA 4AGCA 1J3HA 2V7AA 4QPSA 1XH4A 3RAWA 5IDNA 4GRBA 4USEA 1PXKA 3MBLA 4JRVA 4K77A 4Z3VA 2X4FA 4F09A 2FO0A 4P5ZA 2JBOA 3TZ7A 1PXIA 4ANBA 4UN0C 1Q3DA 1W98A 3QUDA 4FNWA 3VS4A 3WE8A 2BZKB 4IVAA 2QQ7A 4QYYA 4Q9ZA 4WD5A 2ITTA 4KS7A 5DT3A 5F1ZA 4R3CA 3R7VA 1TQPA 1IASA 1LEZA 4H1MA 4YHJA 3H0YA 2VX1A 2XNPA 3V51A 3OBGA 5JMSA 5K0XA 3V5QA 2HY81 4FL1A 4UEUA 3TNPC 3DB8A 1A06A 4I23A 3AXWA 3RAIA 2P33A 2XK4A 3N9XA 4DH8A 1BYGA 1Q99A 5IDPA 3K3IA 2XIZA 4QRCA 1ZY5A 3GQIA 4I4FA 5LMAA 4APPA 2IZRA 2BRGA 2V62A 5FXSA 3W18A 2OGVA 3GB2A 3LFBA 1YWVA 1S9IA 5JGBA 3LJ2A 3MGYA 4RWKA 4AW0A 4U45A 4AU8A 4ZSJA 5CT0A 4N6YA 5FP5A 1HCLA 3QGYA 4LV5A 2J5FA 3D94A 1WBWA 1OIQA 4G17A 4YLLA 4NIFB 4BYIA 5BVDA 4JX3A 3OWPA 4IWQA 4C02A 3HMMA 2XM8A 4CCUA 4KINA 5ANJA 3POOA 1SVHA 3R8UA 2GSFA 5CZIA 4BTFA 2UZWE 1I09A 2UZLA 4EK6A 1PKGA 4DGNA 2BALA 1YRPA 1GIIA 2X2LA 4C4EA 2PVMA 3SW4A 5HNBA 1YOJA 2CHLA 3ZXZA 2J90A 4IFGA 2XBAA 2QO9A 2RIOA 3ULIA 3CEKA 3ELJA 3HDNA 4MAOA 4JDJA 1UNLA 3R8LA 3PPKA 4L46A 4TWOA 3S4QA 5D1JA 3HNGA 2C6DA 4IM2A 4L53A 1WAKA 3NLBA 4R3RA 3FKOA 3KQ7A 2R3OA 4U81A 3VW6A 4IAIA 3KVWA 5FLFA 2CLXA 4AZSA 3VJNA 3F3UA 4K11A 1Y8YA 3RZFA 3F69A 5I9XA 4TTHB 5BVFA 2QOFA 3C4ZA 5D11A 4IHPA 4IWPA 2WHBA 2QURA 4HVSA 2Q0NA 3QALE 4HPUE 4QO9A 3E7OA 2VTNA 4JI9A 3CE3A 2YIQA 1XBBA 2E9UA 4JQ7A 2I1MA 4LUEA 4QP4A 5AP4A 3RTPA 4X3FC 3EN4A 2YFXA 3ZHPC 2PVFA 4DLIA 4YZBA 1FVTA 4TZRA 4WHZA 5HBEA 2FSMX 4TWPA 4USDA 4YZCA 2XYNA 4F0IA 2IZUA 1T45A 5A4LA 4MXOA 5I3RA 2Z2WA 3MPMA 4WA9A 3KN5A 5AUYA 4MTAA 3DAEA 3LOKA 3MTFA 3F5XA 2XK6A 3E3BX 4O0XA 2PE2A 4P2KA 3MH1A 2W5BA 4JAIA 2ERZE 1YHWA 3OG7A 1OVEA 2ETMA 3VRZA 4AF3A 4KAOA 5HTBA 4GW8A 3DK3A 3MYGA 3LFSA 2OXXA 3OWJA 3C7QA 3QKKA 2YIRA 2OJ9A 5HIDA 3VJOA 3IKAA 5AR4A 5IMXA 2B4SB 3PPJA 4HGSA 1HCKA 4D1SA 2XKCA 4L00A 3KULB 4X2KA 4DGLC 4YC6A 3BGPA 3P23A 1O9UA 4F6SA 2WMRA 4AAAA 4E1ZA 4G9CA 4KSPA 4L8MA 4QQCA 4QTBA 2WTJA 1ZY4A 3UO4A 5IEYA 3T3VA 5AX9A 2WMWA 3HV3A 2PZRA 1YI6A 3PVBA 4NIFA 4F64A 4WRSA 2FVDA 2OKRA 2AUHA 2QOIA 3BE9A 3FYJX 5LCKA 2IW9A 3FXZA 3ZBFA 3VWAA 2W05A 4BDHA 4J98A 2BFXA 4LM5A 4YPSA 3COMA 3FZOA 3MB7A 2R3HA 1CSNA 3FZPA 4EOPA 1SVEA 3C4XA 4YSMA 5DE2A 4F08A 1URWA 4EH6A 1WMKA 3FXWA 1JVPP 3RP9A 3P79A 4D2SA 3D2KA 3EL7A 1YXVA 5AWMA 5HESA 4E3CA 4S2ZA 3AD4A 4YJQA 1CKPA 4S31A 4RC4A 4MQ1A 4LI5A 1R1WA 3PJ8A 4QP6A 4RX5A 3QRJA 3MW1A 1OPJA 4XRLA 5HI2A 3RK9A 3U6IA 4DBNA 5HKMA 3QBNA 1DM2A 3U51A 4ZY4A 3JVSA 2YIYA 4DEEA 4YJRA 4JX7A 3O8PA 4IZ5A 4F7SA 2YHVA 3FY2A 2DWBA 2IO6A 3U4UA 3JUHA 2I0YA 2WMBA 4N6ZA 3RHKA 1H08A 4IDVA 3BWFA 3TZ9A 2Q0BA 4I0RA 3GU4A 4OBPA 4U40A 2WQMA 3NNXA 4H3QA 3AT4A 2CJMA 2WKMA 3OOGA 4CFVA 4A9SA 2ONLC 3DCVA 5KZ0A 3V8TA 4ACMA 4GS6A 3KEXA 4KNBA 2UZEA 2VNWA 3QFVA 5AIKA 4D5HA 2QKRA 3KRRA 3EQCA 4LRMA 2QOOA 4BICA 2Z7RA 2UVYA 4HPTE 4CFUA 4CZYB 3E8EA 4GCJA 4ZJIA 3JYAA 3RKBA 2R64A 4XX9A 2OJFE 3A4PA 5HCZA 4LRJA 3GGFA 4RIXB 3FLWA 3VBWA 4D0WA 1XR1A 3F2AA 3UVQA 2XEYA 3D7ZA 4NEUA 5HLWA 4EI4A 1UWHA 4E8AA 4RWIA 4YJVA 4HZSA 2W4OA 5ANGA 5L2QA 4FZ7A 5AP7A 2QONA 2X6EA 5F95A 3PRIA 4EONA 1ZLTA 4L7SA 4BI1A 2QNJA 3OXZA 4FR4A 5AP0A 3QHWA 4K1BA 5HVJA 1KE7A 3PLSA 4F0FA 3OD6X 3KULA 1RE8A 1XH9A 2E9OA 3HMPA 4K2RA 4EL9A 2R7BA 5E7RA 2W1FA 3BCEA 2WQNA 5CT7A 5ACBC 4FVPA 4D9UA 3UG2A 3V5TA 1KSWA 4WRGA 3MB6A 2BAKA 4FT5A 4JRNA 3AD6A 2XKFA 3L9LA 3QCYA 3QD2B 4EK3A 2ETRA 3EMGA 5IA3A 2IN6A 3L1SA 2VTAA 3LFQA 4FV7A 4E93A 4FKSA 5AR2A 4IACA 2YDIA 3ZLXA 3ZLSA 5J8IA 3BU3A 3VAPA 4QMMA 1H07A 3FMMA 2GS6A 2NRYA 4W4VA 3FBVA 3GU6A 3ZXTA 1PKDA 3NWWA 5F20A 5EDPA 2P0CA 1MUOA 2C5YA 2WFYA 4D4SA 2VTHA 5C03A 3JPVA 4ZTNA 5AA9A 4CVAA 4RWJA 3CPBA 4XHKB 3QU0A 3POZA 4KWPA 4IC7A 3K3JA 4UWYA 2BIKB 4GL9A 4QQTA 5I9VA 2YJRA 2VO6A 3HMOA 2WEVA 4IZ7A 3D5XA 4K0YA 3NZ0A 5AP2A 4CCBA 4IAYA 1KOBA 4I20A 4FODA 4IVBA 3KXGA 1XHAA 3DJ7A 4ZZMA 3MVMA 3FLYA 4DFNA 4C3RA 4L43A 4W9XA 5CQUA 3KU2A 2HZIA 3P86A 4L3LA 3CCNA 4IZAA 2LAVA 4KD1A 3H9RA 3PIXA 2ITVA 4AT3A 3P0MA 5KZIA 4IX6A 4KB8A 2XK9A 2WQEA 4IAKA 3W2QA 5HORA 3LCOA 4XV2A 3CY3A 1UWJA 3U87A 2G2FA 4GT3A 3ZDUA 4M97A 5HG7A 1H1PA 4RIXA 4FEQA 3SDJA 3B8RA 3EN6A 2W1DA 3RPVA 1H1WA 4OTWA 3ZH8A 2R3MA 2YM7A 3FMKA 5JZNA 3ZFMA 3RK5A 2JDRA 3JS2A 2VN9A 5DNRA 5AV2A 2C3JA 5EI2A 3GCQA 2JIVA 3DK6A 5AADA 2WMSA 3O2MA 3EZRA 5L2TA 3UPZA 5JK3A 4FIFA 2OZAB 5CU2A 1OZ1A 1OM1A 5F94A 4ZTRA 1B6CB 1XKKA 1SNUA 2EB2A 3GC0A 3H9FA 3ZTXA 4DEHA 3DAJA 3D15A 4FKPA 5K4IA 3G0FA 2QOQA 3MTLA 4WG4A 5AP1A 5HG8A 4AG8A 4YPDA 2WU6A 4E5BA 3T8OA 4EHEA 3U9CA 2B53A 2OJJA 3W10A 3WZUA 3COIA 5IISA 2JGZA 1PJKA 3W2PA 4FIHA 4IAAA 2IWIA 4QPAA 3OROA 3AMBA 1OKZA 2HZ0A 3W2OA 2OI4X 2QLUA 4U43A 2R3LA 2PVHA 4FL2A 2BPMA 1OIYA 4C37A 4FC0A 5LOHA 4D55A 2E9VA 4HCVA 2X39A 3MY0A 4O0TA 5AV3A 1FGKA 4FKGA 1OKWA 3QRTA 2PMOX 1WCCA 1J1CA 1ZYLA 3C1XA 5LVLA 3VBXA 4BDJA 4FMQA 4Y83A 4ZAUA 4H58A 2H34A 4A06A 5BUJA 4GT5A 2HZNA 2XMYA 4WIHA 2F57A 2R3RA 4ASZA 2C5OA 5FGKA 4EBVA 4LL0A 2PY3A 2R3GA 4FA2A 3EQIA 4MD9E 3DY7A 5ACKA 3G0EA 4P5QA 4RLLA 3ACJA 2ZM3A 2ZDUA 3MH2A 5LJJA 3NNUA 1XO2B 3GC7A 3RNIA 1HOWA 2GFSA 3MN3A 2Y7JA 3F6XA 4GFOA 3VHKA 2ZAZA 4U3YA 3F5PA 4TYIA 4I93A 4RX8A 4FT3A 3KF7A 2RGPA 3PWDA 5ETAA 4XBRA 3BLHA 4OW8A 4FV9A 4IW0A 2YLEA 2PVLA 5CEIA 3FI2A 2HW6A 2XNMA 4IAZA 1XQZA 4MWHA 5JGDA 3EJ1A 3R8VA 4P7EA 3RCDA 3SC1A 1XBCA 4JDIA 5DFPA 1R3CA 3DBDA 3UIMA 3D7TB 1H27A 2PMIA 3DA6A 1ZMVA 4TYGA 1YQJA 2BUJA 3GP0A 3P5KA 4FV3A 1R78A 5EFQA 5E8YA 4J52A 4HGEA 4QYEA 4G2FA 1WVWA 4YUQA 2CGVA 4FKOA 4HNIA 5IU2A 4KSQA 1KE9A 3DS6A 3L8SA 4CTBA 2ZM4A 3HV6A 3DKGA 3ZO1A 5BVEA 4AW1A 5DVRA 2OZAA 3QXPA 3I79A 2OFVA 4O6LA 4J8MA 4FOBA 4LV8A 4ZTMA 1OL1A 5GZ9A 3Q9ZA 1ZZLA 3ZFXA 2WZJA 3OEFX 3QC9A 4DEAA 2C6LA 5BPYA 2X7GA 4LL5A 4FNYA 5KKRB 1B38A 4EHGA 5EYMA 4K18A 3UZPA 4DC2A 3IECA 4JLCA 3FMLA 3HZTA 4FTQA 2YM4A 4TXCA 1WVXA 5FWKK 4EZ3A 3CC6A 4ZP5A 3TI1A 5AM7A 3UGCA 5JH6A 4YBKA 3FL4A 1W82A 4O96A 4IDTA 1NVSA 2H8HA 4ACHA 1WBTA 5FEEA 3CLYA 3NYXA 5L6OA 1UU8A 3QCQA 3S3IA 2C5NA 5E8WA 3ORZA 3BHVA 3CS9A 2O8YA 3NW5A 4OTRA 2REIA 1NVRA 3OMVA 3QTIA 4RFYA 3C0GA 3R9HA 3UQGA 2XBJA 2CPKE 2XM9A 3R01A 3CKXA 4KIKB 5AUWA 2B54A 2VWYA 3NAXA 3FAAA 3V3VA 1GZKA 3W32A 3R30A 3TKHA 2GHLA 3DQXA 5ANIA 4HYUA 5KE0A 3IW5A 3TACA 3IDCA 4EEVA 3FHRA 4KIOA 4IM3A 4NT4A 3O23A 3PA5A 4JBVA 5K0KA 4EK8A 2O3PA 3LXNA 4UWBA 2R3FA 5EW9A 4RWLA 2WTVA 2YN8A 1YDSE 4U41A 4TNDA 4BTMA 4EH9A 2WEIA 4HYHA 4EUTA 5CEKA 2BR1A 3FKNA 4JOAA 4PTEA 3FXXA 3D0EA 5IH5A 5LCJA 5JFVA 3FSFA 4XMOA 5KNJA 5HTIA 5K3YA 4E73A 3EQGA 1STCE 3IPHA 1U5QA 3F7ZA 2XF0A 3I5ZA 3FE3A 3R1YA 1O6LA 4RX7A 4XH6A 3MA3A 1P14A 4H3BA 3UMWA 3FY0A 5HX8A 2UW5A 4F9CA 2WOUA 3RCJA 2ZV7A 3GXLA 4K33A 5ANEA 4B99A 5EKNA 5AMNA 3D7TA 3FV8A 1UKIA 3R9NA 3GOKA 5HQ0A 1ZWSA 3EL8A 3G33A 5L6WL 5H8EA 4YC3A 5E8ZA 2A27A 4BZOA 1ZYDA 1TVOA 2J6MA 3EYGA 3FZSA 3PSBA 5FQDC 3I1AA 4YJPA 4XCUA 4DGOA 3MFTA 5HIEA 3FLQA 2PE0A 1TKIA 3FZ1A 4RFZA 4ACGA 5CAOA 3BX5A 3WYYA 1Z9XA 4JVGA 4NKSA 5CAVA 5H8BA 1G5SA 2C0IA 1H24A 2R3KA 2UVXA 4CKJA 4U7ZA 3UJGA 2GPHA 3EKNA 4XV9A 3VRYA 4C4IA 3U6JA 3KXMA 3KK9A 1OUYA 4M0ZA 4CD0A 2B9IA 1NY3A 2HZ4A 4J71A 3NNWA 1YI3A 3A7JA 4EHVA 4N4SA 3L8XA 2E2BA 3OEZA 2BKZA 2VD5A 1S9JA 2W4JA 4TT7A 1XWSA 2GCDA 4YLKA 3RGFA 3QD4A 4FVQA 4XLVA 1U5RA 5L8KA 4UY9A 4AZEA 3GC9A 2IVVA 3DNDA 4M67A 2JKOA 3UIBA 2XUUA 4NW5A 3ZLWA 1OITA 2W96B 4K6ZA 3B2TA 3OTUA 3QTWA 5H2UA 3Q32A 1YDTE 3PJ3A 3ODYX 4BC6A 2BVAA 4XG3A 4APCA 4UBAA 1IA8A 3RWQA 4DITA 4I6BA 3Q60A 4QT1A 4QMTA 4QTCA 3IONA 4L52A 5HVKA 5JFSA 2C4GA 4OGRA 3HA8A 2RFDA 3BLRA 3KGAA 4R1VA 3NUNA 3R1NA 3D14A 2C6IA 1GZNA 2WMQA 3H3CA 3QA0A 3R7UA 4RZWA 4EWHA 4L01A 4CFWA 2X8IA 3PFQA 2C1BA 3ERKA 2WD1A 1CMKE 1RW8A 2R9SA 2G15A 4ONAA 2ITZA 2X0GA 4QMQA 4Z9LA 4A4XA 2PL0A 5J1VA 4AFJA 4BBFA 3MPAA 1JKSA 2ITYA 4ID7A 4L42A 4ZSGA 3QZGA 2QHMA 4EOLA 4I1ZA 2PMNX 3FLZA 4PY1A 2C1AA 4YNEA 2XIYA 2C47A 2Y4IC 2Z7LA 3AGMA 3KCFA 3R8PA 3DTWA 3SOAA 2JLDA 4FKLA 3MFRA 2P55A 3QKLA 2OWBA 2P2IA 3GU5A 3O17A 4LUDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4FF8A

Total Genus

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Chain Sequence

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