1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
2A98A 2IEWA 2AQXA 1W2DA 1W2FA 2IF8A 4O4CA 1W2CA 4O4EA 4O4DA 4FRFA 4O4FA 1TZDA 4O4BB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TOZA 1Q5KA 1KV1A 1P5EA 3W10A 1GIIA 5ANGA 2B53A 2BZJA 4AA0A 5JZJA 3PIZA 4FKRA 3NPCA 3C7QA 3DFAA 4F9BA 5HE2A 2OFUA 4XEYA 4LMUA 1KOAA 5CZIA 3SXFA 4UWCA 3PY0A 3GC9A 1ZOGA 3TNIA 5AV2A 3O8PA 3BHHA 2QO2A 4XOYA 3V8TA 3V8WA 2JDOA 3Q52A 5CVGA 4EZ7A 4BCQA 1OL2A 5EKNA 2BKZA 3QQLA 5AX9A 1YWRA 1YXXA 2V62A 3QTZA 4UB7A 3BELA 4DGMA 4UZDA 3QQHA 3FHIA 2WQEA 2W1FA 4BGQA 1PXJA 3FLYA 1WAKA 3KXMA 2IVTA 5EK7A 2RIOA 3T9TA 4PMTA 1ZY5A 2V22A 2YM8A 3E62A 4U79A 4CRSA 4D9TA 4QNYA 5D41A 4FTLA 2R3FA 3E92A 3ZEWA 4BHZA 3I81A 5CANA 4XLVA 4RGJA 5CF4A 2IWIA 3KRJA 4EH7A 1YXSA 3DAJA 3L1SA 3D83A 3VNTA 4AF3A 3TIYA 3C51A 2WFYA 3R7IA 3FZPA 3KXNA 4NM0A 4WG3A 4BZOA 1PXKA 4D28A 5KMIA 3TNHA 3U8WA 1SYKA 4ZTNA 3UOKA 2W1ZA 3GOPA 4G34A 5IPJA 5F94A 2CGVA 2UW5A 1MQ4A 3R8PA 2XIXA 3FZRA 4USDA 3I79A 1APME 4AN3A 3LLTA 4I5HA 3RI1A 3BYUA 1M2RA 1O9UA 3IECA 3SC1A 4QD6A 4FNXA 4EL9A 4FF8A 3HV3A 3NYOA 2ZV2A 3KMMA 5EYCA 3GB2A 4CCBA 2XS0A 2YIYA 4YZCA 4E4NA 4EH6A 5B2MA 2UZTA 4ZZNA 3N9XA 2R3JA 2XIYA 5FXSA 3EQRA 3P23A 4WBOA 2AQXA 1OGUA 4G3EA 3UG2A 4O27B 1UWHA 3S3IA 4DH5A 3P4KA 4QO9A 1UVRA 4F9CA 5A4TA 4IAZA 4YJUA 4ASDA 4G6LA 1BX6A 3PE1A 4KKEA 4LV8A 3DJ7A 3M11A 2YAKA 2WIPA 2W5AA 4PP9A 1QCFA 4IB1A 3S4QA 2VNYA 4CQEA 2XVDA 4WG5A 5GNKA 3MB6A 3HRBA 2QOLA 4FIFA 4NW6A 3FI2A 3HRCA 4DFXE 2GNLA 4QMQA 3HGKA 2YJSA 4XLIA 4ENYA 3FKLA 3H3CA 5LMBA 3EWHA 2BRGA 5FDPA 1B6CB 5HX6A 4FKLA 4YC8A 4UV0A 4A4LA 1PKGA 4NFNA 5L2WA 4PUZA 2C6IA 2UW4A 2J90A 3CKWA 3EN5A 3FY2A 2W4JA 3VUGA 4IANA 4ZXTA 2WMUA 5KX8A 3EN9A 4U41A 3WARA 1FINA 2PVLA 4JAJA 3DJ6A 5I9VA 2R0UA 3PLSA 2R3QA 1P14A 4DLIA 3BLRA 4RVMA 4TWNA 5IF1A 4FKTA 2P3GX 1GZOA 2Q0BA 3E64A 4U81A 1Q4LA 2HWOA 1ZRZA 5JEBA 5EI6A 3EQFA 3G2FA 4YO6A 4R3RA 4W4VA 3EB0A 3FXZA 1DS5A 3OCTA 1YHVA 3MH2A 1YHSA 2W1DA 4XG9A 4KAOA 3W2QA 3CC6A 5AR2A 3UOJA 4CFFA 5D10A 4LUDA 4J1RA 1Q8UA 4L45A 2B1PA 3LFSA 3IOKA 3TN8A 3R8MA 3GUBA 2YISA 5LCKA 2C6DA 5LMKC 1J91A 3QF9A 4X0MA 4AFJA 2J4ZA 5HLPA 4ZZMA 3HV4A 3D94A 3CQEA 4IC7A 3TG1A 4C38A 3C0IA 4Y73A 5E8VA 3E8NA 4U3ZA 1Y8GA 4D2WA 3L9LA 3H30A 5EM6A 3FSFA 2WQBA 4QMOA 3DK7A 1AGWA 2QR8A 5LVOA 3LPBA 4ERKA 2YIWA 4C59A 1NVRA 4ZJVA 2CN8A 2OI4X 1A9UA 3JXWA 4XG6A 4TL0A 3H9RA 4CTCA 3NW7A 2VNWA 1VR2A 3NYNA 3COHA 2YDJA 1SM2A 4LOQA 4RX7A 1W2CA 4PMMA 2VWXA 5DLSA 4XS2A 4A07A 3O8UA 4TYJA 2E9PA 3KRWA 2XP2A 1P2AA 3Q5ZA 4PL5A 3HYHA 5CEKA 3ACKA 3VBTA 3W2CA 5BVKA 3IQ7A 3QQJA 4X21A 3GENA 4EWQA 4HCTA 3R9NA 4C57A 2GTNA 5AAFA 3DBFA 2QLQA 4YBKA 4O1OA 3ULZA 4MNFA 2Z2WA 4PNKA 2VWIA 2J0LA 4RX5A 2FSTX 4TN6A 5L8KA 2YLEA 4BI1A 4XMOA 3ANRA 5EDQA 4RLKA 4YZMA 2XEZA 3S0OA 3GNIB 4QMYA 2UUEA 2ITUA 3LMGA 4XG2A 2R3PA 3GFEA 2W4KA 5KHWA 4E6DA 1F0QA 2QO9A 4L6QA 4F70A 2JDVA 1E1XA 3KMWA 4H58A 3OXZA 3ORLA 3RAWA 1VJYA 2QI8A 5I5ZA 2RFDA 4E73A 3U51A 5T6KA 3VS1A 3HX4A 4OAVB 4YJRA 4I20A 5CLPA 4WIHA 5LCJA 4ASZA 4AZSA 3Q9WA 4RVKA 3UQCA 4JNWA 4XJ0A 4N6ZA 4BKJA 3GFWA 5TE0A 4ANLA 2R3IA 4OR5A 1OL5A 4UBAA 4JG8A 5CI7A 3WOWA 2BDJA 3P79A 1CKJA 1IA8A 3Q96A 3ZM4A 5GJDA 5KMMA 4IM2A 1YWVA 3R7OA 5J8IA 5KKRB 5BUEA 3IDBA 4AGDA 1FGIA 4FSMA 1YXUA 4JBOA 3VN9A 4ZY5A 3REPA 4HNFA 1ZYDA 1Y91A 4Y83A 4H1JA 5EHYA 5AR5A 5HHWA 3Q32A 5DFPA 4FL1A 3DBQA 3ZU7A 4PPAA 2EUFB 4FG7A 5HEZA 4WNPA 2B9HA 2OWBA 1A06A 3KB7A 5C8NA 3OD6X 3NUXA 5JK3A 3E7OA 4QMUA 4CD0A 5LARA 2YERA 2F4JA 5CT0A 5A6NA 3MIYA 5DT0A 3ZUVA 1VZOA 3I7BA 2BIKB 3R00A 3CY2A 3O17A 5J7HA 4ASXA 4QP1A 1GY3A 3QQKA 4F65A 5KMJA 3MSSA 5EG3A 2GTMA 2WEVA 4LI5A 3HZTA 4YC3A 1JKSA 3GC7A 1CTPE 1R78A 4V04A 3UVQA 4A7CA 3CIKA 2GPHA 4ALVA 1GNGA 4YGAA 1PY5A 5T68A 5CT7A 3KF7A 1LEZA 1V0PA 3OTVA 1LUFA 5G1XA 3LAUA 4JDJA 5JGAA 1BMKA 2PK9A 2J50A 2WU6A 3A7GA 4L3JA 2X2KA 5AP5A 3HDMA 5E91A 5JFSA 3B8QA 4RIOA 3W2OA 4QNAA 4PMPA 2ZVAA 4YHFA 3UBDA 5CF8A 2YM7A 1J1CA 4AT5A 4HPTE 3F9NA 3CY3A 2VX0A 3E93A 1FMKA 1MP8A 5K4IA 3HMPA 4HGEA 2RFSA 3F5UA 3SXRA 4K6ZA 4E93A 4I93A 3FBVA 2VZ6A 3ZUTA 2X0QA 2QOQA 4WD5A 5L2QA 3F5XA 3PJCA 5J5TA 1Q97A 3ETAA 2B9JA 5A3XA 3RM6A 4G1WA 2OF2A 4RC2A 2WTDA 3QTSA 2YCFA 3QLFA 4MXCA 5IUHA 1H01A 3NRMA 5CAOA 4O0WA 3T9IA 3ORTA 5HTBA 2YACA 4U8ZA 4FT5A 3RPRA 2BMCA 3KKVA 4ANMA 2OJIA 3LJ2A 5AV1A 4PPBA 3FAAA 3QTWA 1CDKA 3FY0A 2XKCA 3G5DA 1FPUA 4JIAA 3OG7A 2CPKE 4X2KA 3OT8A 2VO0A 4BZDA 3WYXA 4FZAB 3HUCA 2UZLA 4Y72A 3PVGA 4O96A 4RC3A 4P90A 5ETIA 3RTPA 1UKHA 5AJQA 5EDRA 5FBNC 3PJ8A 1LEWA 1OB3A 3RINA 4ZIMA 3PYYA 3IW5A 4PL3A 2PVRA 2R7BA 4KRCA 5HIBA 4X3FB 1IASA 3MA6A 2REIA 2VWBA 3O8TA 4JRVA 4CT1A 5BYYA 2OXYA 1YI4A 4N70A 4IX5A 1JAMA 4QQTA 5A4CA 4QMMA 4AP7A 5HD4A 5AP7A 4I94A 5TO8A 4CQGA 3NLBA 4OTFA 4XRLA 3CD8A 5EYMA 2BFYA 5D12A 4UXQA 3DDQA 3FHRA 4EH3A 4L9IA 4E1ZA 5K0XA 1G3NA 4MBJA 4YPSA 4EONA 2YWPA 3MVLA 2YAAA 3QC9A 3F5PA 4RLLA 4DEHA 2E9UA 5DEYA 3F3ZA 3GU4A 4H1MA 4W4WA 4RQVA 3GT8A 2PVKA 5JQ5A 3VJOA 1H1RA 2J9MA 2QOOA 3R28A 4U44A 2BHHA 3NUYA 4NT4A 2QLUA 5DIAA 4F08A 2XJ1A 2JBPA 3HP2A 1WVWA 1ZYJA 2CCIA 3DTCA 3PSBA 5CVFA 5H3QA 4CLJA 5M4FA 4QP4A 1UU7A 4FSQA 1NVSA 4EHEA 4ACDA 1Q8ZA 1NY3A 4IVCA 4ZK5A 4EK8A 3OHTA 1U4DA 2G01A 2HIWA 3ZRMA 5JSMA 1YXVA 4ZTHA 4QRCA 4JX7A 2WTJA 2YIRA 5L8JA 4ACHA 4DGGA 5BQ0A 1MRVA 2JLDA 3QUPA 4CXAA 2YA9A 4Y85A 1TKIA 2XB7A 3BHVA 4GYGA 5CAUA 2G9XA 4GJ3A 3CPBA 4K2RA 2ETRA 5DVRA 4AW5A 4GVAA 4F9WA 3PZHA 3HUBA 4ZLYA 3HL7A 1ZYCA 2W96B 4M84A 1DM2A 5EOLA 4U45A 1Y6AA 4EKKA 3EJ1A 4C61A 4FTCA 5FEDA 3QTQA 3FI4A 2FSMX 2H9VA 2X9EA 4M0YA 3FMDA 4YC6A 4C02A 4HVIA 2QC6A 3UODA 4DFLA 4QYEA 2YDIA 2P2HA 4DEIA 2XIZA 3G0FA 3NCGA 3OFMA 4G6OA 4I3ZA 4YJVA 4PTGA 5M4UA 5ANKA 4V05A 1JWHA 2GMXA 4YHTA 4D4RA 3U6HA 4FOCA 3L9PA 4IIRA 3ZDIA 1ZY4A 2C30A 3NUPA 4P4CA 3W55A 5LWNA 1I44A 4N4SA 4EUTA 5LJJA 4HYHA 3AT3A 3CD3A 4EZ3A 3QD3A 3CR0A 2ITXA 3DNEA 3FKNA 3IKAA 4FV1A 2VTAA 4IX3A 2FYSA 4Q9SA 4AGWA 1XH9A 3F2NA 4G3GA 4R1YA 3NDMA 4KD1A 4U3YA 1U54A 3ORKA 3UC3A 3VS7A 4EOQA 4I21A 2XNNA 3DA6A 2R4BA 3QQGA 3I0OA 4FRFA 4NFMA 4D4YA 3F82A 2ITVA 2JDSA 3FKOA 3O7LB 4NKAA 5AA9A 3RK9A 4MHAA 1Q8YA 3JPVA 5TKDA 3TKHA 3I0QA 2I0HA 5EHLA 5GJFA 5H8GA 1E9HA 1Z5MA 3DZOA 4HJOA 5CU2A 5AP6A 1GJOA 3CS9A 4CZTA 4G31A 4D2TA 2X39A 5ANDA 3FLNC 4S33A 2GU8A 4CV9A 3VBVA 4ZTQA 2FSLX 5BVDA 1OECA 2I1MA 1JSTA 2KULA 3CGOA 3EFKA 3IK3A 3PVBA 3RM7A 4P7EA 4BGGA 4NWMA 4D5KA 3NSZA 4QQCA 5HESA 3VS6A 4CYJA 3OCBA 4RBLA 5HLWA 2WD1A 3BI6A 3SHEA 4RIYA 2VWZA 4ALUA 4B8MA 2C5XA 3IDPA 2BDFA 3AGLA 3QTRA 4FV6A 4O2PA 2ZM4A 5CZHA 4ANBA 3MJ1A 4LFIA 3Q4ZA 4BDIA 2O5KA 3DFCB 4DG0E 2GHGA 3FLSA 2JIUA 4FZFB 4MEDA 3R73A 2X0OA 1Q61A 3A61A 3O7LD 4FKQA 3LM0A 5GZ9A 4X3FC 4GH2A 3W8QA 4BIBA 3JVRA 2Y9QA 3P7CA 3WIGA 3HLLA 4FNWA 3N51A 2HW7A 2QNJA 4LOPA 5KZIA 5TR6A 1SZMA 2Y4IC 4K77A 3HMOA 3DT1A 4C33A 1UU9A 1UKIA 4JXFA 2EXMA 4Y46A 4J8NA 3WF5A 2VTRA 2SRCA 3FZOA 2ACXA 4DHFA 4TZRA 4PDPA 1BI7A 5HTCA 3ZLWA 1M52A 2RG5A 4J7BA 3R7VA 3V5JA 5DG5A 4EK3A 1VEBA 4FZ6A 3RALA 3PRIA 4QTCA 2GHMA 3W2RA 4NUSA 5KO1A 3OTUA 4IVBA 3RZBA 4OBPA 3ZH8A 4QOXA 5CY3A 3Q5IA 4L53A 4QMLA 1TQIA 3PJ3A 1WBPA 3D5VA 4JDKA 3BPRA 3S00A 5D7VA 2WGJA 4Q5EA 2BPMA 5IH4A 5I9YA 3DZQA 4I6FA 5AP1A 4C4EA 4M69A 5DR2A 4IJ9A 1I09A 3C4EA 1PYEA 4IB5A 2F57A 1QMZA 2WAJA 3QKMA 3PPKA 3Q53A 1PMEA 1ZMVA 3AT2A 4YNOA 2QR7A 5DPVA 3OW3A 2HOGA 4AZWA 4ANSA 4RIYB 5J87A 3EQCA 5HICA 5M51A 4PTEA 1H1PA 2O63A 3OROA 3QHRA 4FZDB 4MCVA 5J9ZA 1Q3WA 3FYJX 4OT6A 5C9CA 3ZZWA 3BKBA 2QOBA 3QX2A 4GFOA 4E26A 5EW9A 3S95A 2DUVA 3P08A 4CZYB 3KRLA 3FWQA 1H08A 4IWPA 3PIXA 3OXIA 4ACGA 3VUTA 1PXNA 4IDVA 4IDTA 4BDEA 5K0KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4QP6 A;  4YHJ A;  1Q99 A;  4G3D A;  5AR8 A;  3DXN A;  2WTI A;  3PP0 A;  4EBV A;  2YCR A;  2E9N A;  3Q6W A;  1PMU A;  4NIF A;  4UYN A;  5DEW A;  3GCS A;  3QUE A;  4QP9 A;  5A46 A;  4ANN A;  4X2G A;  4U6R A;  2X6E A;  4C34 A;  4QTB A;  2PVN A;  3L9N A;  4YZD A;  4RRV A;  5HX8 A;  4ZJJ A;  3KUL B;  2ONL A;  5ANO A;  1VYW A;  4JR7 A;  5AUZ A;  4NKS A;  3OOG A;  5GHV A;  5C26 A;  4K1B A;  4HZR A;  4HPU E;  1OUK A;  4AUA A;  2W4O A;  3WZK A;  3C9W A;  4GT4 A;  2VRX A;  3LQ5 A;  2Y8O A;  5HBJ A;  4M12 A;  2R9S A;  5IME A;  2VWW A;  3TIZ A;  3DAE A;  3LFD A;  1MRY A;  4FI1 A;  2XJ2 A;  3THB A;  4RIW A;  3A2C A;  2WEL A;  4A9Y A;  4K33 A;  3BU5 A;  2WQN A;  3LOK A;  4KNB A;  2BTS A;  4GYI A;  4NU1 A;  1MQB A;  5CQW A;  1B38 A;  2WMS A;  1BI8 A;  5LVL A;  5A9U A;  3O51 A;  2C6K A;  3IO7 A;  3UPX A;  4YO4 A;  5HNI X; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2A98 A;  2IEW A;  2X0P A;  2AQX A;  1W2D A;  2X0Q A;  1W2F A;  2IF8 A;  4O4C A;  1W2C A;  2X0O A;  4O4E A;  4FRF A;  4O4D A;  4O4F A;  1TZD A;  4O4B B;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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