1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
1W2DA 2IEWA 4FRFA 2AQXA 2A98A 4O4EA 4O4CA 4O4DA 1W2FA 1W2CA 2IF8A 4O4BB 1TZDA 4O4FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BRGA 3WYYA 5ANJA 1LPUA 2C6LA 3EQRA 4BI1A 3GFEA 4F65A 2Y6OA 3DDQA 3FMDA 2DS1A 4IFCA 4LOPA 3W32A 4QMQA 4AU8A 3CQWA 4GW8A 4L52A 4R5YA 4CRLA 4J52A 3W2CA 4FKWA 2UW4A 4L3PA 4LV5A 5ANKA 1GNGA 3NPCA 4IDTA 4ACHA 5J9YA 3KF4A 1XBBA 1YDTE 2JC6A 2R3OA 4FSYA 2GFCA 5KMKA 3EH9A 3L9NA 2YCQA 5CEQA 5CQWA 2WMAA 2VO7A 4FSWA 3MY5A 1JKLA 4RA5A 4N6ZA 3PSDA 3WZEA 4F09A 3ZBFA 1OUKA 4QP4A 3GU7A 4AE9A 2F57A 2Y4PA 3ALNA 3QCSA 4ITJA 4TTHB 3L9PA 2OG8A 3DAJA 4L68A 5CAUA 4L6QA 5IKWA 3MA6A 2ZV2A 4QYFA 1YOLA 4PNKA 3R22A 3RTPA 2WZJA 3FMMA 3UODA 3LHJA 3C0IA 2UVYA 3A2CA 4QMTA 4YHTA 3ZXZA 3JUHA 3MI9A 5AV2A 4F63A 4FTOA 4FV2A 4WRGA 4BCGA 4OAVB 4OLIA 3TXOA 4E4XA 4USEA 5CALA 4G1WA 3ORZA 3QUEA 5ANGA 4UV0A 4FV6A 5EDPA 3TTJA 2WMVA 1SVEA 4MH7A 4E7WA 5BVNA 4C3FA 4ASDA 1YXSA 3WBLA 1CMKE 1J1BA 3IGGA 2X2KA 2R0IA 2FUMA 3RWPA 4ZSLA 4A9SA 4E3CA 3PJ1A 3F7ZA 3LFSA 3TV7A 1B38A 3UO5A 2WPAA 3BU6A 2XEYA 3JY0A 2UZVA 2XF0A 1STCE 3N51A 4O38A 3VS0A 4BYIA 4HPUE 2UZWE 1XH5A 2YISA 3KCFA 3KQ7A 3C4FA 5FQDC 4AA0A 3UNKA 3ZCLA 4CZYB 2C6EA 1ZYJA 4R1VA 4FKGA 3VUHA 5I3RA 4LM5A 2OF2A 3LE6A 5KMOA 2XNMA 1DAYA 4QPAA 4AT3A 3ENHA 3VS1A 5KZIA 2F49A 4WUNA 4D0WA 5CF5A 2PSQA 1XKKA 3LFEA 4JBPA 4E5AX 3I5NA 2P55A 2KTYA 3R8UA 4F70A 3M11A 4MCVA 1IRKA 4Q2AA 5DWRA 4RG0A 2GHMA 3QA8A 3LVPA 4ENYA 2VTQA 3IO7A 1Q5KA 4I0SA 4NIFB 5CEIA 4AP7A 3V5QA 2ITYA 3LOKA 3P7CA 2FSTX 4UXQA 5AX3A 2C47A 2ESMA 2E9UA 2G01A 3ANQA 4CFWA 4Z7HA 1XH9A 3HECA 1UNHA 3MH0A 3FPMA 2J7TA 3QRUA 3KMWA 4TZRA 3VBXA 4JL9A 5A46A 1P4FA 1Q97A 2XBJA 2WOUA 4ZY6A 3DBFA 4GFOA 4RVKA 3R8ZA 3R21A 2RG6A 4MWIA 3UC4A 3KRJA 5DFPA 4FOBA 5A4CA 4X2FA 3GXLA 3ZEWA 2AC3A 4D28A 2PTKA 4TWOA 5CVHA 4MF0A 2QNJA 5AUXA 4APPA 3E7VA 3OCSA 2JKOA 4QMLA 3LXLA 2GNIA 3OTVA 3EYGA 4U0IA 4ASEA 5L2TA 3ZM4A 4KS7A 3QCQA 2FB8A 4E4NA 2UZOA 2XS0A 3C0GA 2WTIA 1REJA 4XBUA 4QP9A 4Y73A 1H27A 2WEVA 4KKGA 3QTSA 5HE1A 4PPBA 3FZ1A 3RJCA 3KULA 4WOVA 5EI8A 2VV9A 4AUAA 4F9BA 4P7EA 3MPAA 2VD5A 3UZTA 4H39A 4L01A 3D7TB 4KBAA 2WQOA 3GNIB 4EYMA 2V5QA 1PXJA 2Y0AA 2VTHA 3WZJA 4J98A 3BX5A 4V04A 2XJ1A 3K5UA 4DGGA 2BDJA 2Y8OA 5CSVA 4KB8A 2AYPA 4QP8A 4I3ZA 2WTVA 3ORXA 4EI4A 2CJMA 3UO4A 2W1IA 4NW5A 4YC6A 4QPMA 3FYJX 2QOFA 2WTKB 3IG7A 4HNFA 4PWNA 5FBOA 5FRIA 5DOSA 1BMKA 3WIKA 4BTKA 4NH1A 1YXUA 3KXXA 2UW3A 3TJCA 5BYYA 5ETAA 2W1EA 3L8PA 4KRCA 4BGGA 2RGPA 1K3AA 3AQVA 4RX9A 2PWLA 3KVWA 3QKKA 5HO7A 3CS9A 3ORLA 4X2NA 2R64A 2WEIA 3S1HA 4GYIA 2QHMA 4NM7A 4X6RA 4AX8A 4ERKA 5B7VA 3ZFMA 1GOLA 2PZYA 3EZVA 3RWQA 4EOMA 3GENA 3D2KA 4LRMA 3P78A 3RM7A 4TRLA 4NEUA 4IADA 4ZTRA 2W0JA 3DAKA 2GQGA 2PY3A 3WI6A 3QHRA 3ZUVA 4EC9A 3QTRA 1PY5A 2XNEA 4KIKA 5CEMA 2X4ZA 4BKJA 3Q2MA 3DKFA 4C7TA 4CV8A 3RNIA 1Q61A 2ERKA 2HW7A 3QQKA 3NUYA 3ALOA 4XG2A 5KNJA 4FVRA 3JVSA 4TPTA 3OW4A 2IVVA 4L7FA 2CN5A 2PVJA 4QRCA 4GS6A 2VU3A 3WE8A 4JQ8A 4YJOA 2PL0A 3R7EA 3NW6A 3TI1A 5KHWA 5C8NA 3FMNA 4IB1A 1YDRE 3DGKA 1KOAA 1M7QA 4J8MA 4DH5A 3OWJA 3OROA 1VYZA 5F4NA 1JKKA 3W18A 1WBOA 3M42A 2JKKA 2JIUA 3VS7A 1P2AA 4ID7A 1TQPA 4ZJJA 1DS5A 4XG3A 4FTMA 3W16A 1WFCA 1OPLA 2BFXA 3DV3A 4FIHA 2YEXA 3W2PA 1YHWA 2G2HA 3O23A 2E9VA 5DT0A 4XV1A 5HICA 3RPRA 4EQMA 3LCTA 3CIKA 4O4FA 3FLZA 4FX3A 4WRSA 1OL2A 3G9NA 1PYEA 3U8WA 4ZOGA 5IEYA 4IZ5A 3HV4A 4QMPA 3QWJA 2BPMA 4M8TA 4RX7A 5JRSA 5ANEA 5LMAA 1PMUA 5CI6A 1G5SA 3BHHA 2W1ZA 3PXFA 5CSWA 2CPKE 5HCZA 5C9CA 3H0YA 3VIDA 2REIA 3ZLWA 4E4LA 3RPVA 4CXAA 4Z16A 2Q0NA 4EZ7A 2LGCA 4EK3A 3GQLA 3PY0A 3R01A 5EM6A 3Q32A 3QX2A 4O4BB 4KKEA 3G51A 1YW2A 2NP8A 3G33A 4KIPA 4FGBA 4O0YA 4ZSJA 4E20A 4ZLOA 4AS0A 2W1GA 2RSVA 3UGCA 3LQ5A 5HG7A 2OI4X 2YLEA 4I21A 4H3PA 4U9AA 4KS8A 2O2UA 4OBQA 3QQUA 3UMWA 3BGZA 3P7BA 3R04A 5JH6A 4PL5A 3AD5A 5HEZA 5L8LA 2VTPA 4MNEB 3GB2A 4V0GB 4LI5A 4EH6A 2OFVA 4ZSAA 2XIRA 1H1WA 2RFDA 4QYYA 4YBJA 5AUYA 5HLWA 2HW6A 3IOPA 4J1RA 2BZKB 3KRXA 4B4LA 1CKPA 5JRQA 5HNBA 3T3VA 5AA9A 2H9VA 2QLQA 4DAWA 3WOWA 5JKGA 1PXOA 2QO2A 3I79A 3R9NA 3ZYAA 5E8SA 4DGLC 2OWBA 2JIIA 3C51A 4FTTA 4QYGA 4D2PA 4XP3A 4YTIA 3F9NA 4I94A 4DG3E 3DA6A 3FQEA 5E8VA 2W1CA 4TY1A 4IAZA 1Q8WA 3PXYA 2W4JA 4JBQA 4YTFA 3LXKA 1U54A 4FNZA 1YI6A 1WBTA 3PPJA 2W96B 5DHJA 4BN1A 2I1MA 2YIRA 3UVPA 2OJIA 4GIIA 2CN8A 2YA9A 4HOKA 4BIDA 5IEVA 3DBQA 2I0YA 3PG1A 2VWWA 4IB3A 3MH1A 3F82A 3E8CA 4XG6A 3NGAA 5CU4A 5EM8A 1H0WA 1SZMA 4CMUA 3G0EA 4DYMA 3G2FA 3NLBA 5A4QA 3OCBA 4C4HA 5CXHA 2ITXA 4BCOA 4AF3A 3TZ8A 4QPSA 5IDNA 2W4KA 3F5PA 2A19B 2I0VA 3CBLA 4WUAA 4ZTSA 3A7GA 3OEFX 2F7ZE 5EYCA 4AQCA 3QTQA 3FQSA 5K0XA 3AD6A 4RIXB 1OKYA 5L4QA 2IO6A 2LAVA 1GY3A 2RFEA 5GJGA 5C8MA 4M14A 3F69A 4ZIMA 3F2AA 3U4WA 1ZAOA 3EQHA 3AGLA 3D5UA 3EN4A 4IJ9A 4AN3A 5FDXA 4ARKA 4BCPA 2J51A 4FTUA 2YM3A 4GJ3A 3CPCA 4RJ6A 2PMOX 3NIZA 5LARA 3I60A 5LWMA 5HIDA 4CKIA 3FMKA 3QRJA 4RBLA 3RM6A 3S00A 4AGDA 5AP6A 4BKZA 4O0UA 5GZ8A 3AGMA 5ETCA 4E6AA 2JITA 1O9UA 2XH5A 3NNUA 5E8WA 3SXSA 4IAFA 2UW0A 4CMOA 1VYWA 2CLXA 4D1ZA 4OW8A 5L2SA 2YN8A 3O8TA 2XIZA 5KHXA 4OTHA 4CFXA 4F7SA 4EOLA 5BNJA 1Q4LA 1YRPA 2CHLA 3OXTA 3MSSA 2ONLC 3F3WA 5H8GA 2X9EA 4DCEA 3UG2A 5FXRA 5IH6A 5AV1A 5JSMA 5T3QA 5M4UA 4UZDA 4FZ6A 1BL6A 4JQEA 1GZNA 3I1AA 3D7ZA 2Y4IB 4FG7A 3SXFA 2YCFA 5IA0A 4W4WA 3DNEA 1A9UA 2WTDA 3TG1A 5L6PA 2H8HA 4Q9SA 3II5A 3IDPA 2B54A 2R4BA 3HA8A 2XK4A 5EHOA 3Q4TA 2XZSA 4A9UA 4HZSA 4AXAA 4CEGA 3OFMA 4J7BA 2VTLA 3R2BA 4GCJA 5CTPA 2PVKA 4FIEA 2VTAA 5AUVA 4RFMA 4G6OA 4RRVA 4N4SA 4WO5A 2HWOA 4AFJA 3AC2A 1U5RA 5IUGA 2OJJA 1HOWA 3UTOA 2ITQA 2R9SA 2F7EE 3G0FA 4PTCA 4QMMA 2B1PA 4D2WA 5F9EA 1H1QA 1ZWSA 1BX6A 4MBJA 2W9FB 1GZ8A 3DBDA 5C26A 2VGPA 3QX4A 4K8AA 5D41A 4C0TA 3F6XA 2PVHA 3HEGA 3QWKA 1OL7A 4G5JA 3T8OA 3VUGA 3E7OA 3PY1A 4YPSA 4XUFA 2P3GX 4GMYA 4GSBA 5DEWA 4J95A 4GVAA 3DTWA 3BRBA 3ZLYA 3PVUA 2WMXA 4ZZOA 2OJ9A 4G3EA 3KXMA 1PXLA 4A4OA 5KZ0A 3CP9A 4AZFA 5C8KA 3RKBA 4CMTA 3CTQA 4JDKA 2BTSA 3P1AA 4RVTA 3ZZEA 3FBVA 3FAAA 3UYTA 3ORNA 2SRCA 4HVIA 4FKPA 3QZIA 4HGLA 3GC8A 4IFGA 1JNKA 4I6QA 4QO9A 2BRMA 2FGIA 2VWUA 2HK5A 3PJ3A 5HLNA 3WZKA 2X0PA 1H4LA 4A07A 5I0BA 1MQBA 4U8ZA 1H1SA 5KMNA 2XP2A 2X2MA 3D94A 4FKIA 5CSPA 3KU2A 4P90A 4R5SA 4UMQA 2CGVA 3GU8A 4FTAA 4AACA 1EH4A 1FOTA 3MB6A 4YSMA 5M4CA 2XNOA 2YJSA 4DC2A 3SQQA 2EU9A 3BKBA 3NW5A 2QD9A 2UVZA 4G9RA 4I4EA 3R7OA 5J7BA 3QYZA 3UMXA 3ACKA 4AN2A 3EQGA 3BV3A 3HLLA 4CTCA 4BRXA 2GNFA 4FBXA 4BL1A 2PE2A 4HJOA 3GP0A 4RT7A 3EKNA 4YZCA 3DK7A 4MKCA 5I9XA 5DR6A 5EDRA 3TKUA 4G3DA 1Y57A 5M44A 3W10A 2UW5A 3BPRA 3AC1A 2BHHA 1YDSE 3UIUA 3OWPA 3DBEA 3D9VA 3FI3A 3MW1A 5CAQA 2PVRA 5I9WA 3WARA 3E8NA 1RQQA 5D7AA 3CC6A 5DIAA 2GHLA 5C27A 1Q8YA 1PYXA 3NUPA 4IZ7A 4L8MA 4U43A 2OXXA 4CZTA 4EONA 4QP2A 2QG5A 5JFSA 3LFAA 4QNAA 4A06A 5A14A 3R1SA 3NYOA 3VJNA 1ERKA 3POZA 4HCTA 4ACCA 4IM3A 2FSMX 4NWMA 3MH3A 4F1OA 4NFMA 4EHZA 4EHEA 3MY0A 4GG7A 3A99A 3BCEA 4A4LA 4KRDA 4AW5A 2NRUA 4FSTA 5IUIA 3QGWA 3FUPA 4KSQA 1ZMWA 3A7JA 3BHTA 3ZDUA 3OUNB 2X7OA 3F61A 1JVPP 2JDOA 3PRIA 4FA2A 2WXVA 3KB7A 4C59A 3RPYA 3R7IA 2WELA 2YZAA 3R2YA 1XJDA 4MYGA 4C3RA 5JGAA 4C57A 3KF7A 4LGGA 4GU6A 2C6MA 4DHFA 2WU6A 4RIWB 3A8WA 2G2IA 4X3FC 5D1JA 3WF8A 3DZOA 2C6KA 3Q52A 4IC7A 3QZFA 4DITA 5JN2A 1JWHA 2J0KA 4LG4A 2IZSA 4H1MA 3GOPA 3KY2A 3SDJA 3V8WA 1MRVA 2PVFA 3IPHA 3DKOA 3CTHA 2YCRA 3JS2A 3QRIA 2C6OA 4RIYB 4C2WA 2W5HA 2W99B 4IX6A 4G16A 1CTPE 4U97A 2JBPA 4FIGA 2Z7LA 2C5XA 3D7TA 4RZVA 4CV9A 2WKMA 1XQZA 2QCSA 4YJUA 3E87A 5M56A 5KMIA 1U4DA 4ZTNA 3ZU7A 5ITAA 4JX7A 3SW4A 2X4FA 5FEEA 4YO4A 4PTEA 5AR4A 3ANRA 4LRKA 4PQNA 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 1W2D A;  2IEW A;  4FRF A;  2AQX A;  2A98 A;  4O4E A;  4O4C A;  4O4D A;  1W2F A;  1W2C A;  2IF8 A;  4O4B B;  1TZD A;  4O4F A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HZT A;  4DEG A;  4AW0 A;  4G17 A;  3RK5 A;  4MAO A;  3ULZ A;  2J0L A;  3Q6W A;  4FIJ A;  4JG6 A;  1ZYS A;  2G1T A;  1OKZ A;  2XCH A;  3QD3 A;  4JI9 A;  4M0Z A;  4M0Y A;  5CSX A;  3SRV B;  3MFS A;  4CKJ A;  5CU6 A;  4B7T A;  4I0R A;  1T45 A;  1R1W A;  2R3K A;  3BU5 A;  3R0T A;  3R9H A;  5CLP A;  3E93 A;  3EFJ A;  2IWI A;  5AP3 A;  4ANO A;  3NCG A;  3NNX A;  3C0H A;  5DMZ A;  3VUK A;  4TWP A;  3B8R A;  3HRF A;  1Z9X A;  3IW4 A;  2ETM A;  4FOD A;  4J99 A;  3VBQ A;  1MRY A;  3PIX A;  4QYH A;  3V8T A;  4EZ5 A;  2BIY A;  4QMW A;  5L8J A;  5K5X A;  1J91 A;  4XV2 A;  2BAK A;  3FLY A;  3H3C A;  3RK7 A;  4LV8 A;  4HVS A;  3SVV A;  1OPJ A;  3KKV A;  5HCY A;  3MFT A;  3OWL A;  3ZOS A;  1L3R E;  4YGA A;  2CLQ A;  3LCS A;  2ZV9 A;  4CYJ A;  5M4F A;  2X1N A;  4S30 A;  4C3P A;  4AZE A;  5K4J A;  3FKO A;  3R71 A;  3RZF A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1W2D A;  2IEW A;  4FRF A;  2X0O A;  2AQX A;  2X0P A;  2A98 A;  2X0Q A;  4O4E A;  4O4C A;  4O4D A;  1W2F A;  1W2C A;  2IF8 A;  4O4B B;  1TZD A;  4O4F A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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