1W2DA

Human inositol (1,4,5)-trisphosphate 3-kinase complexed with mn2+/adp/ins(1,3,4,5)p4
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
SFKAAGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILASLAER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a Human Inositol 1,4,5-Trisphosphate 3-Kinase; Substrate Binding Reveals Why It is not a Phosphoinositide 3-Kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords INOSITOL-TRISPHOSPHATE 3-KINASE A
total genus 94
structure length 265
sequence length 265
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1w2dA00
4O4DA 4O4EA 4O4CA 1TZDA 2IEWA 4O4FA 2AQXA 1W2DA 2A98A 2IF8A 1W2CA 1W2FA 4FRFA 4O4BB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H1JA 5HICA 3UOLA 1OGUA 2DWBA 4WKQA 2WO6A 3AC3A 3KRWA 3ZHPC 2HY81 4G3CA 4L43A 4J98A 4ZLYA 2FUMA 4OW8A 3KK9A 4D1XA 3POZA 3KC3A 1ZLTA 4ZOGA 4IZ7A 3TEIA 3QQUA 3EFLA 1JKTA 3R01A 3U87A 3FXWA 4V05A 5L6WL 4K33A 5H8GA 3CP9A 2C1AA 3LOKA 4XG7A 3FZPA 3QU0A 4YHJA 2IVTA 4XRJA 2XZSA 3IOPA 5AX3A 4BDIA 2XNBA 4K2RA 4WSQA 1WBOA 4FV9A 3H0ZA 2Z7RA 4IVBA 2BALA 3FKOA 2J0MB 3QKKA 4U97A 3ALNA 3F9NA 1MP8A 2Q0BA 4FV4A 5CT7A 4NEUA 1S9IA 4EOKA 5LWNA 1YXVA 4W4YA 3V6SA 5LVOA 5A3XA 1WBNA 2REIA 5HTBA 3R73A 2H9VA 3GENA 4S30A 2OJ9A 3EQBA 3MH2A 4I6QA 4ASZA 2HY0A 2Y4IB 2C47A 2E9UA 2YCRA 2R3QA 3BV2A 3IG7A 4PUZA 5HLNA 1LP4A 5I9ZA 4AW1A 2C6DA 4OAUC 1BLXA 1R78A 1UWHA 3NR9A 4BDFA 3IOKA 4GFOA 3GU5A 3LM0A 4WD5A 1P5EA 3MB6A 3GCQA 3TNPC 3D5UA 2OU7A 3RHKA 2XP2A 3I7BA 4B4LA 1BUHA 5I4NA 3MPAA 2R64A 3FSKA 3WF5A 2XKFA 3KXGA 2V55A 2GTNA 2PVKA 3UODA 3LXKA 1YRPA 3PWDA 4NCTC 4UMQA 5M56A 3F7ZA 2P3GX 4CFFA 4IB3A 2WKMA 4EWHA 3R8PA 4QMYA 5FM3A 1AD5A 4C59A 1L3RE 4ZTHA 3CQEA 4IZYA 1PXNA 3VUKA 2VWVA 4KKGA 2RL5A 5JMSA 4GK3A 3TKIA 1JLUE 4U3ZA 5E8SA 3AG9A 3HMNA 4L3JA 5DEWA 4NM0A 2FSTX 3OCTA 4JQEA 4AXAA 1Y8YA 2F7XE 3DDQA 3FLWA 4U41A 4IVCA 4G6OA 4BI0A 4FKPA 5CF5A 1J1BA 1ZYJA 1U4DA 2WMWA 4GEOA 3QTWA 3BU6A 5DT4A 3BBTB 3D5WA 3QX4A 4DHFA 5I3RA 4QP6A 3ZSHA 2C0OA 3ORKA 2ZB1A 4FVQA 2VGOA 3LJ2A 3ANQA 3ALOA 4RG0A 1RDQE 5IUIA 3WIGA 2VWXA 4RC2A 4L3PA 4LMNA 3NUPA 1SMHA 4LYNA 2UW6A 5LWMA 1DS5A 2VTRA 4AQCA 1UV5A 5TF9A 4I4FA 2ZDUA 4AOTA 1Q97A 4YLKA 4QTAA 4C3PA 2WTKB 4MVFA 2OH4A 3K5VA 4EKKA 4EQCA 5E1SA 5ANOA 5BX0A 5M4UA 4H3PA 2X7OA 1YI6A 2VWIA 5ETAA 4IB5A 4AT4A 5EKNA 5JQ8A 1SNUA 3FMJA 2QOIA 4QP7A 1QPJA 1Q3DA 4L53A 2W1IA 4F6SA 4HVHA 5I5ZA 3TV7A 3PJ8A 3RPYA 3CLYA 1UNLA 4QP1A 4QT1A 3TZ7A 4AZEA 4BWPA 4D2TA 3MW1A 4K9YA 1JSVA 3FY0A 2P4IA 2HZNA 2EVAA 4F1MA 2R3PA 2G2HA 3F3VA 4I1ZA 4Y85A 4YLJA 3KMUA 3SC1A 2YITA 3JPVA 4LV8A 4UMRA 3V3VA 4IVAA 3KY2A 1NA7A 2YCFA 1BKXA 4NK9A 4BGGA 3EH9A 4RA4A 4ZSGA 1AGWA 3VULA 4BFMA 1E1VA 1UNGA 4KKEA 4D2WA 3TWJA 3CPCA 4MD7E 3QD3A 3BPRA 1H00A 2QOLA 3KRXA 4GSBA 5DT0A 5IU2A 2OJFE 2IW6A 4IB0A 3O51A 4FX3A 3JYAA 5HTIA 5CI7A 2GCDA 3UO5A 1YI4A 2PVHA 1SVEA 3V01A 3HGKA 1Q61A 3OS3A 1YXTA 4LUDA 5KMLA 3UPZA 2CPKE 2A1AB 3ETAA 3QTZA 1BMKA 5IA5A 5IDPA 4KSPA 5CX9A 4HCUA 3TIZA 3Q9ZA 4OLIA 4FK6A 5FP6A 4L01A 3CY2A 3GUBA 2Y4IC 3UZPA 2WIPA 2WGJA 3MFRA 2ZV8A 3LMGA 4IACA 5HG9A 4W4XA 4HPUE 4WG5A 2C5OA 4JBVA 4I6HA 2B9FA 3AC1A 3DY7A 3EMGA 3QL8A 2XIYA 3G9LX 4FNZA 4JLCA 2XEZA 4KIKB 4OTQA 4TTHB 5HQ0A 2YEXA 4X3FA 3OTVA 3BHVA 3ZO3A 4KWPA 2VTAA 2OZAA 5J79A 3T9TA 4EQUA 1ZMWA 3EB0A 4ZJJA 3D5XA 2NO3A 4LL0A 2PTKA 3W2QA 4E8AA 3DFAA 4RIWA 2X4FA 2XNMA 3GFEA 4LUEA 3MH0A 4TRLA 3NX8A 5AX9A 5H3QA 3DOGA 3PPJA 5JT2A 4HW7A 4LQMA 5L2QA 4JBPA 4PDPA 4Y5HA 5CSPA 3BHYA 3LCKA 2Q0NA 3GC8A 3JVRA 4HVGA 4ZTNA 5IG1A 1B38A 3AMYA 4H1MA 2YM7A 4PPAA 3QCSA 4K11A 5CZHA 4BDJA 4IWOA 3KVWA 2GNIA 2BMCA 2R3FA 2YERA 3KQ7A 3EN6A 3UYSA 4AGDA 4C4JA 4KB8A 4DITA 1GY3A 3VS5A 5C9CA 4QYHA 4CFXA 3EKKA 5JGDA 4YJPA 2VTJA 2F9GA 3G6HA 2GHLA 5EW9A 4ZK5A 4B6LA 4BCOA 4F99A 1YW2A 3OROA 4OTHA 2ZV2A 5HCZA 2UW3A 1CKJA 4ZSLA 2XM9A 3LFEA 4ZLOA 3O7LD 4I22A 3QAME 4CZUA 2ESMA 2NRYA 1YWRA 4H3QA 1H01A 3RZBA 5JFXA 3C0HA 4GVJA 2HWOA 5EK7A 3PP1A 4WT6A 4F9BA 4YZBA 1NVSA 4CMOA 3NIEA 4EQMA 4E4NA 5LMAA 3KB7A 4FTKA 3BYMA 4ANLA 4UX9A 2A19B 2FVDA 3RHXA 5CQWA 4DC2A 1JPAA 4C2WA 5E1EA 5AM6A 4D28A 2C3JA 3FZTA 3LLTA 2YCSA 4BI1A 2W4JA 4FT9A 3WBLA 1FGKA 4V0GB 5KBQA 3PVUA 4NZWB 2C4GA 2IJMA 2VX0A 3HV3A 5CSHA 5DHJA 3LQ5A 2YJSA 4FYNA 1F3MC 1M2QA 4JBQA 3OWLA 5CWZA 3U6IA 4UZHA 4CFWA 5C03A 3EZVA 3W2PA 4QP3A 1GIJA 3TKHA 4UWCA 2J51A 1RJBA 4PMMA 1V0OA 3HMPA 3GB2A 4FOCA 4FSZA 4F9YA 1FMOE 3CR0A 5AP7A 1R1WA 3H30A 1WCCA 3UQGA 3BELA 1FPUA 2W17A 5HVKA 3QGWA 4X3JA 4FICA 3ITZA 4ERKA 4EOPA 3GBZA 4G5JA 4JAJA 3UVPA 2BHEA 4PMTA 4M15A 2HW6A 4W9XA 3A7JA 4R7IA 5CENA 4XBRA 4CLJA 4RGJA 3BLRA 3RZFA 2HOGA 2ETKA 4W8DA 4UWBA 4PP9A 2HXQA 2JDVA 3VS1A 4EOJA 1H1WA 5J5SA 3NNVA 3ZFMA 2PMIA 3MGYA 4BCGA 1KE8A 2JFLA 5TE0A 1NXKA 3ZFXA 4WBOA 4B9DA 2WMBA 4O0SA 3S4QA 3C7QA 4ACHA 2C6LA 3NS9A 4EHZA 3MA6A 3MY1A 3TXOA 3WZKA 3EL8A 5GJDA 4OGRA 2BUJA 2P0CA 3TCPA 1YQJA 2I0VA 5AP3A 3UC4A 4BF2A 2R3LA 2CLXA 5FEEA 3ZBFA 2OJJA 3C9WA 4M0ZA 3ULZA 1JKSA 4Y46A 3HP5A 4YTIA 2GU8A 4KKHA 4FGBA 4IH8A 4D58A 3NCGA 3FV8A 4YJRA 4X7QA 1DM2A 5G6VA 3CKXA 1CM8A 3NAYA 4CFNA 4IJ9A 4JT3A 4EBWA 3ORMA 4ZY5A 3Q6WA 3MPTA 4KS7A 4CYJA 5HNBA 2VGPA 4ZTQA 5BVOA 1FOTA 1ZXEA 1M7QA 4O4EA 4BCPA 4FTMA 5M4IA 1UU8A 3DU8A 3SVVA 2HAKA 3ORZA 2ITOA 4J97A 5CF4A 1Y6BA 3UZTA 1UA2A 4X6RA 1ZY4A 4ENXA 1H24A 2VO6A 4O4FA 1ZYDA 5LXMA 2ITQA 4RVKA 4JDKA 4OTIA 4Z7HA 4EOSA 4RIXA 2C69A 1KWPA 5AWMA 3HDMA 4D4YA 4FTAA 4HNFA 4ALUA 2YAKA 4ZSJA 3L8PA 3LE6A 2CGXA 2WTDA 2XJ1A 3FY2A 3IONA 4IAYA 1WFCA 1ZOHA 5IA0A 4E4XA 3DLSA 4HCVA 1YVJA 1JKLA 3EQRA 3CBLA 4TZRA 3HVCA 3RKBA 4D2SA 5IA2A 5HEZA 4ZSAA 2JGZA 3E63A 3T8OA 3OOMA 4L42A 3ZLSA 4ZTSA 2ZV9A 4GVAA 3PXYA 2IZSA 4FZ6A 4EH5A 3ZBXA 3RGFA 1CMKE 2YCQA 4QQ5A 5M55A 5KHXA 2X2MA 3FQSA 3EQCA 4DAWA 3C50A 4D2PA 5ETIA 4YHTA 4AN3A 3L9LA 5L3AA 3CIKA 1OECA 5CS6A 4GT3A 4PY1A 3ZXTA 4O0WA 4HYSA 5DR9A 2Z8CA 3NWWA 5F4NA 5LVNA 1OKYA 4XJ0A 3VS7A 1G3NA 1IEPA 4NIFA 2R3GA 3PTGA 4M67A 4C4GA 3HDNA 4I6BA 4FIEA 5KCVA 3BGPA 4BDCA 4R5SA 2G15A 3E64A 2ERKA 3BGZA 3FZSA 4L8MA 4ZS0A 2R3JA 3FPMA 3BX5A 4EYMA 5DWRA 4IZAA 1OL2A 1WVWA 3OCSA 3TUDA 3I6WA 3I81A 3QXPA 4HZRA 4XG6A 3R7EA 3VBXA 4CCBA 3A7GA 4XP3A 3WARA 4AN2A 2FGIA 2XMYA 4C2VA 3GT8A 4D2VA 2V5QA 3HMMA 2ERZE 4MWIA 4GIIA 4C4EA 5A46A 4FTJA 3FMKA 4GFMA 2XNPA 2VTIA 2JAMA 1YOMA 1WBVA 3W2SA 2O0UA 4RIOA 4EUUA 3PP0A 3PPZA 2BAKA 4EJNA 3OY3A 3R2BA 3RCDA 4GV1A 3CS9A 3PYYA 5L8LA 3OEZA 1SNXA 4JR3A 3RAKA 4H3BA 4PWNA 4DYMA 4L7FA 4TYIA 3OW4A 4IBMA 4AGWA 3PXRA 2KTYA 3P08A 5A9UA 2P33A 5CAVA 4GJ3A 2WMQA 4FT0A 2WQBA 3MVHA 4KBCA 4QMPA 2X0OA 1P14A 4JG7A 3WF8A 4QNAA 3P79A 5EYKA 4FTNA 3OP5A 1GZNA 3TZ9A 3L8SA 4BCIA 3ANRA 4FZFB 4Q9SA 3ZMMA 4CZYB 4E4LA 1MRUA 4G9CA 5BMMA 2OGVA 4PF4A 4U81A 4PL5A 3RAWA 4FKJA 2G9XA 2RFDA 3MVJA 2WXVA 4ZLZA 4BGQA 3QD0A 4DEIA 5HCXA 5HOAA 3KEXA 3W8LA 5E8VA 3DT1A 3WYYA 4JX3A 1V0BA 4LRMA 5D11A 3C4XA 3QQFA 3QTRA 4X2KA 4FA2A 1WZYA 3N51A 4E6CA 2IWIA 3A8WA 5C8MA 4AP7A 1H08A 4LRKA 3BYVA 4NJDA 3KF4A 4PX6A 4QO9A 4E73A 5M4CA 3UNKA 3D7TA 4U40A 3OT8A 3MA3A 5A4LA 1KSWA 1P4FA 4IC8A 3FL5A 5IEXA 1JSTA 3D14A 5A6OA 4C58A 5AA8A 4W8EA 4DG0E 5J7HA 4YU2A 2IEWA 3PG3A 2W1DA 3TTJA 3QQJA 3FLQA 5DVRA 4TKSA 4HVDA 4KAOA 2OW3A 5L8JA 3CXWA 4KA3A 3BE9A 3ORTA 2ITNA 3II5A 4I0SA 3SRVB 4G17A 3V5LA 3CQUA 3OG7A 1HOWA 2J6MA 4UXLA 5E8XA 4LM5A 4FTUA 4ITHA 5AAGA 3QZGA 4L67A 4O22A 1PYXA 2PHKA 2B1PA 3HLLA 5D1JA 3A60A 1JNKA 1R3CA 2GS7A 4TN6A 2OG8A 2PMOX 3ROCA 4N4SA 3IGGA 4C33A 3U51A 3P0MA 4YZ9A 3HRFA 4DINA 2WMTA 4FKGA 3ZEWA 2E2BA 2PZIA 3VUIA 2PZ5A 3EJ1A 1I09A 1O6LA 3LJ0A 5HHWA 3OF0A 5ACBC 1KE7A 2OFVA 4XG8A 3UO4A 4EOMA 3OBGA 5JH6A 3AXWA 3OCGA 5CAOA 5I9XA 4IANA 4RT7A 4TWCA 4FIGA 4CD0A 5I3OA 3RM6A 2WMXA 3L8XA 3HNGA 2JKKA 2QONA 3VJOA 2YABA 3UTOA 3OXTA 3QKLA 4P2KA 1ZYCA 3LAUA 4L6QA 2BDWA 2B9IA 3RM7A 3PSDA 4J8MA 4DH8A 4EHGA 1UWJA 5LCJA 2WU7A 3ZU7A 2ZOQA 3RJCA 4Y83A 2UZTA 4B8MA 3QKMA 2BVAA 2HW7A 4YJUA 1OL1A 3TNQB 4BZNA 4DH5A 4OTWA 4BRXA 2JLDA 3EN9A 4QMZA 5CXHA 3G90X 2V7OA 2YM8A 2PVLA 2NRUA 3ZSGA 2A4LA 1BI8A 2XNOA 4OTPA 4UYAA 5CQUA 3NPCA 3R9HA 3C13A 4DCEA 1Q99A 2UV2A 3KRRA 3L8VA 4ERWA 4TYGA 3FQEA 4LGDA 3OUNB 1XH9A 2B9JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4ACC A;  4L9I A;  4GG5 A;  2G2I A;  3PA3 A;  3QQH A;  1J91 A;  3EN7 A;  3LFC A;  5ANI A;  4AE9 A;  4F08 A;  3CQW A;  5AV0 A;  3E87 A;  4BDD A;  3VO3 A;  3R7Y A;  2YDI A;  1IR3 A;  3QX2 A;  4USD A;  3HYH A;  3NUU A;  4JL9 A;  3RK9 A;  4RFZ A;  3F88 A;  3FC1 X;  2RKU A;  4FTL A;  2X2L A;  4FG7 A;  4YJV A;  4NM3 A;  4ZZN A;  3UG1 A;  4C4I A;  4ZY4 A;  4WBB B;  4YC3 A;  3BQR A;  5CEQ A;  5HNI X;  3F5X A;  3RVG A;  3VF9 A;  4IFG A;  3CD8 A;  4QMS A;  2QO7 A;  2UZN A;  4DH3 A;  2XJ0 A;  4LOP A;  4MXO A;  5JFV A;  3F2A A;  3P23 A;  3OZ6 A;  3R8M A;  3VUM A;  5F9E A;  2PZR A;  1W84 A;  4YJO A;  1PMN A;  4S33 A;  2Y6O A;  5HE1 A;  2BZH B;  1H07 A;  3ORN A;  4G5P A;  3F3T A;  3VBQ A;  1O9U A;  3AC2 A;  4O6L A;  2UVX A;  4BGH A;  5J5T A;  3UVR A;  3PIX A;  4KNB A;  5EHL A;  3R8L A;  3LPB A;  4A7C A;  3BWJ A;  4G6L A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0P A;  2X0O A;  4O4E A;  4O4D A;  2X0Q A;  4O4C A;  1TZD A;  2IEW A;  4O4F A;  2AQX A;  1W2D A;  2A98 A;  2IF8 A;  1W2C A;  1W2F A;  4FRF A;  4O4B B;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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