2A98A

Crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase c
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
EDGRILKRFCQCEQRSLEQLMKDPLRPFVPAYYGMVLQDGQTFNQMEDLLADFEGPSIMDCKMGSRTYLEEELVKARERPRPRKDMYEKMVAVDPGAPTPEEHAQGAVTKPRYMQWRETMSSTSTLGFRIEGIKKADGTCNTNFKKTQALEQVTKVLEDFVDGDHVILQKYVACLEELREALEISPFFKTHEVVGSSLLFVHDHTGLAKVWMIDFGKTVALPDHQTLSHRLPWAEGNREDGYLWGLDNMICLLQGLAQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
rcsb
molecule keywords Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2005-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2a98A00
1W2DA 4O4EA 1W2CA 4O4BB 1TZDA 1W2FA 2IEWA 2IF8A 4O4CA 4FRFA 4O4FA 4O4DA 2A98A 2AQXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YTCA 4IH8A 5AAEA 2ZM3A 3NYXA 2R3LA 5A4EA 2WIHA 4BGGA 3VS7A 2J9MA 3BE2A 3O0GA 5HLWA 4YZMA 2B52A 5D12A 4BCNA 2CKEA 5M56A 4JXFA 4M0YA 4EI4A 4MD8E 1BYGA 4FRFA 4AQCA 4UXLA 3BGQA 2Y4IC 2BFYA 4L7FA 3EN4A 2XKEA 4RIXB 1SNUA 2B9IA 2PHKA 2XUUA 3NIEA 2UZDA 3OY1A 4S32A 4BBFA 1XH4A 2G2IA 4LUEA 5L8JA 4EQMA 5LCKA 3SXSA 2B7AA 4X7QA 4FKJA 4JDIA 4C8BA 3K54A 2J7TA 5E8VA 5E1SA 3F61A 3Q9WA 4IFGA 4D55A 5CEOA 4G6OA 5CENA 2FYSA 2X4FA 4RLKA 3SAYA 3LCDA 4WSQA 1YI3A 1H26A 2C5XA 4USDA 3ENMA 3FWQA 2WU7A 5EYMA 2VWIA 1FVTA 1CTPE 2QOQA 3QZIA 5D7AA 5FM2A 2X8IA 1IRKA 1IA8A 4MWHA 4XS2A 2BDWA 3A2CA 4JLCA 2FUMA 2ZV9A 2KTYA 3CBLA 2WMAA 4HZRA 2W9FB 1Q3DA 4PPCA 3DV3A 4IWDA 3R1YA 2XK9A 2YISA 3OCTA 4L46A 3L9LA 4I6FA 2A1AB 3TV4A 5D41A 4CFFA 1YXVA 5HBJA 4EL9A 4S33A 5IH4A 2FB8A 3GVUA 1KOAA 4FF8A 4RX7A 5CALA 2V5QA 2RFDA 2X0PA 4QMUA 4U45A 4EUUA 1E1VA 4LGGA 1QPJA 4EZ7A 2WMVA 3VUIA 2UW0A 4ALVA 3GOPA 4OBPA 4OUCA 4QQCA 4YC6A 3UZTA 3HV5A 4FIFA 4YBKA 4BVUA 3H30A 4F0IA 3GI3A 3ZM4A 4BC6A 3VBWA 4BZDA 4DFYA 4EC8A 4EH6A 3ZXTA 3O8TA 4NTTA 1SNXA 5ETAA 1FGKA 2UZLA 1UWJA 5EYKA 4IDTA 5L2QA 4C61A 1GZKA 3LIJA 2H96A 2XS0A 3S2PA 4A9TA 5LOHA 4HZSA 3ZUUA 3EH9A 3QKKA 4AX8A 3U9NA 2O2UA 4IB1A 4TKSA 4CFUA 3BBTB 1XBAA 5IUIA 1OL1A 3DBFA 5B2LA 5I0BA 1OGUA 5FEDA 3ZU7A 3KRLA 2OXYA 3NNVA 3EQIA 2WOUA 3QALE 5FG8A 5C26A 5I9XA 2XYNA 3R7OA 1ZOGA 4UN0C 4K1BA 2IF8A 1TVOA 1PJKA 3S4QA 2EWAA 4BIEA 3C50A 3OF0A 2C6LA 5EHYA 3EZRA 3S0OA 2BTRA 2VX1A 3GCVA 4E7WA 3H9OA 2PZYA 3MB7A 4CFWA 4GRBA 3V5WA 4D0WA 4F0FA 5M53A 1H25A 5DMZA 5ICPA 3ROCA 2WMUA 4KBAA 3E8NA 3QHRA 3ENHA 5CF8A 5A14A 4NM3A 4CFMA 2AC3A 3SRVA 2XNNA 5HTCA 2VTPA 3DLZA 4E8AA 2F4JA 3QYZA 3LW0A 5IUGA 3W16A 4UWCA 3VWAA 2R7IA 4FV4A 2IVSA 4WNOA 3UQGA 2QONA 1W2DA 4JBVA 2UZNA 2IZUA 3EQGA 4FIGA 4XCUA 4RX5A 4FTLA 4A9RA 5A6OA 2HK5A 1Q24A 2NRYA 3OXIA 4QP1A 4CYJA 1OITA 2B55A 2Z7RA 3QHWA 4O0XA 4IVCA 3M11A 1LPUA 5M4FA 3FXZA 4J8MA 1K2PA 2PE0A 3LXKA 2VTOA 3ODZX 3JVRA 4QTEA 4ZSGA 4YJOA 5CQWA 3C4FA 2XNGA 2VO3A 3MH1A 2ESMA 2B53A 2VWYA 3QF9A 3RAKA 2GHGA 1ZYSA 3RI1A 4IADA 4WG4A 4BKYA 3ZCLA 3F88A 4BB4A 4C35A 3C7QA 3ET7A 1PXNA 2CJMA 2OG8A 4L53A 4IJPA 3E64A 3PXZA 4IQ6A 1YXTA 1JQHA 2RSVA 4XV2A 3UP7A 1PMVA 3RZFA 5HD4A 3UP2A 3KU2A 1MRVA 2YJSA 2H34A 2WFYA 3F6XA 2DUVA 2VD5A 2ZMCA 5CWZA 3E8DA 4QP9A 4ZSEA 3DQWA 3ZSIA 3TV7A 4YJTA 3TIZA 2HIWA 3EFLA 4W9XA 4ANSA 5DE2A 1WZYA 1Q99A 2DWBA 2PY3A 4MKCA 4U0IA 3U6IA 4IBMA 4JR7A 3TKIA 3E3PA 2C5NA 3NYOA 5HD7A 4F9YA 4BGHA 4NCTA 4UMQA 1XH6A 4YGAA 5J9ZA 3UC3A 3VS3A 4YNOA 5E8XA 3AT4A 4V01A 4YNEA 3FQSA 4Z16A 2O3PA 3SW4A 3DB8A 3M1SA 4Q5HA 3ZRMA 3SVVA 3NR9A 3P86A 4AFJA 3HECA 5AV0A 4MQ1A 5F4NA 3NUUA 5DOSA 4K9YA 5JKGA 5CY3A 2B9HA 4OBQA 5J1VA 4O38A 2UZVA 4OTWA 2QLQA 2XP2A 3DKOA 4N70A 4ANLA 3GOKA 4CFVA 5CANA 4PL5A 4ZLOA 4C4EA 3TV6A 3LLTA 2R0UA 2E2BA 2DYLA 4KB8A 5HO7A 3WI6A 3ALNA 4NM7A 2HYYA 2XKDA 3W2CA 4FTJA 5I4NA 2G15A 3VBTA 4QTAA 1KE8A 4W4WA 4I0RA 1Q41A 1BMKA 3LXLA 3R02A 1OVEA 2PZIA 3D2KA 2YCFA 3GT8A 2OFUA 4OT6A 4ACMA 3EFWA 2OXDA 2REIA 4JAJA 3R0TA 4PDPA 4FTRA 4BWXA 3HA8A 2GPHA 4JRVA 4LOOA 4ZTMA 4F70A 5C8MA 4X6RA 4ZEGA 4LI5A 1YOLA 3F5UA 4R6VA 2QNJA 3MFSA 2VTIA 2J0JA 4HNIA 3ZYAA 5JGDA 4KIKB 2JKKA 3CCNA 3G33A 5IPJA 1JVPP 4FKSA 3FLYA 5BUJA 1JSTA 4O27B 4HYHA 2J0LA 3MIAA 3T3UA 5FDPA 3O71A 4GT3A 4G6NA 3AC2A 1LR4A 4C7TA 4NIFA 5KBRA 4KRDA 1XJDA 4KBCA 4FIIA 4L68A 5ETFA 5EH0A 3UE4A 3EN7A 4C59A 4RSSA 4PMPA 4J98A 2PVRA 4BI0A 3GGFA 4A4XA 4EKLA 2C6DA 3PE1A 3VW6A 2WQEA 1JNKA 3QUPA 4O96A 4QYYA 2QD9A 3AC3A 3DJ5A 1H0WA 3DU8A 4FSUA 4GW8A 1J91A 1OL7A 1URWA 2C5OA 4YJPA 5AP4A 4U40A 3LFNA 5KMMA 4YZBA 4RQKA 1OL5A 4ITJA 3QD2B 4WNPA 2Z2WA 3TNHA 3VQHA 4AOIA 5GHVA 1YDTE 3QLGA 3FQEA 4O0TA 4ZS0A 3HUCA 1SVHA 5KMIA 4AT3A 5AM7A 3I7BA 4F1MA 3N9XA 2O5KA 3POZA 3ZLYA 3P9JA 4PNKA 5HE1A 4FKGA 3HKOA 4R3RA 4AT4A 5TO8A 5F9EA 4QMNA 2X2KA 2JDTA 4BYIA 1QMZA 2UZUE 1YXXA 3DZQA 3N51A 3FY0A 3COIA 4RT7A 5C9CA 4DEEA 3F66A 5L2SA 4IAIA 3M42A 4RVTA 4FKIA 5BVEA 4JNWA 1K9AA 1P4FA 5CT0A 3ZXZA 3T8OA 4JJRA 4GFOA 4DYMA 3ZLXA 3AXWA 1KSWA 1LP4A 3EKNA 4O0WA 4NU1A 2VTAA 2R3NA 5C8KA 1WBWA 2BRMA 4E1ZA 2OZOA 2PZRA 3LJ1A 4FI1A 3CQEA 4B8MA 4TZRA 4YZ9A 1CKPA 3QCQA 4GS6A 4GU6A 3IK3A 5ETCA 2BHEA 5CXZA 5LMBA 2WMSA 3E63A 2BHHA 4LV5A 1BL7A 3U8WA 2OO8X 1M2RA 1YWNA 3Q53A 3NEWA 3LM0A 3QGYA 5JN2A 4FT7A 3DKCA 2YCSA 2RFEA 2X9EA 3UZPA 3CGFA 3Q3BA 3NCZA 4F7NA 2XNMA 4FV3A 5JMSA 2DS1A 4EH4A 4WT6A 2WQOA 3QQHA 4D58A 3QTUA 4CV9A 3OROA 1WVXA 2GFCA 4O0VA 5LVLA 1UKIA 4APPA 4BDBA 5I9ZA 4LRMA 4G3EA 5IG1A 4X0MA 1LEZA 2EXMA 3GU4A 4WRSA 3BQRA 3Q4ZA 3VS4A 3HEGA 3VUHA 5DWRA 4X21A 4I5MA 4L42A 4ACGA 2BKZA 3PSBA 4LL5A 4NKAA 3UYSA 3R1NA 3RJCA 2AUHA 5AJQA 4KKGA 2R64A 4JG8A 2ITZA 2CCIA 3QL8A 4AF3A 2XK3A 2ZDUA 5DA3A 3TCPA 4FT0A 4ALUA 4QD6A 5IKWA 4E6CA 3BLRA 4ZY6A 4DG2E 3BI6A 4FTQA 3I1AA 3BHTA 2QOCA 3RTPA 5E8TA 5LMKA 5AP5A 1ZZ2A 3HRBA 2ITWA 2HZ4A 2OFVA 3E5AA 2OU7A 1O9UA 1WBPA 2HXLA 4DEGA 1SVEA 3IPHA 3HDNA 4A9YA 2ZDTA 5CS6A 2XM8A 4I41A 4JDKA 5AP3A 3H0ZA 2ONLA 2VGPA 4BCKA 2X8DA 2XYUA 5DR9A 4P2KA 4KD1A 3FZSA 3E88A 2UZWE 4C4HA 5CI7A 5K4JA 4G9CA 2Y0AA 4FSTA 5IH5A 2JKOA 3SXRA 3TIYA 3VBXA 5FTQA 4AU8A 5HLNA 5L6OA 2EVAA 4RIYB 3R21A 4J96A 5JRSA 4U3ZA 1XBBA 4C4IA 4CD0A 3OHTA 5KUPA 5AA8A 2H6DA 2PSQA 3EQPA 3R28A 1ZWSA 4V05A 4WG3A 5EK7A 3V3VA 4GIIA 1PY5A 3O50A 4TYJA 2JDRA 4YLLA 4XRJA 4E4NA 4FSQA 4I4EA 3GCPA 4FSWA 4JRNA 2H9VA 3DBQA 1XR1A 3MSSA 5CEMA 1NVRA 3PZEA 3ETAA 4I92A 4ANQA 2XKCA 4C4GA 3KKVA 3F82A 3R7GA 3IW7A 2OJJA 4I0SA 4IM3A 2O0UA 4FNXA 5DG5A 4DHFA 1DAWA 3D15A 5E91A 3KF7A 5LARA 5JGBA 3KF4A 3W2RA 4XG6A 4F08A 3SA0A 3F9NA 4FG7A 4IX4A 2Z8CA 5AR5A 2J0IA 3GFWA 4FV1A 1UV5A 1X8BA 2OIQA 4JX7A 3FBVA 4TYIA 1PXMA 1H8FA 3R7IA 4IE9A 3FL4A 3ZLWA 4ZTLA 1FMKA 5HNGA 1PKDA 2BDFA 4QOXA 4ERWA 2OJGA 4GJ3A 4OTRA 4BDFA 4UB7A 3EKKA 4M69A 2ITYA 5K9IA 4QT1A 2XMYA 1U59A 2C68A 2HWOA 4XRLA 2X2LA 4FYNA 4I23A 3TWJA 3V01A 4H36A 3O7LB 3UIUA 3DA6A 5A46A 3W8QA 5JFSA 3OT3A 1U4DA 2F7XE 4D5HA 4EOOA 5DT3A 5HG8A 4M7IA 4EH2A 3D83A 4K11A 4DG0E 3P7BA 1UU9A 1QPEA 4IWQA 2X6DA 4C57A 2GNLA 3BHYA 2V7OA 1H01A 2W1FA 3BU5A 4B9DA 2C6OA 1Q8WA 1Q5KA 3QRIA 4YC8A 2W96B 1VJYA 3D9VA 1FOTA 5HIEA 3OC1A 2UUEA 1TQPA 2BTSA 5FD2A 4W4XA 5GNKA 3Q32A 4FV7A 3V51A 4I4FA 4QMWA 2XRWA 4MK0A 3OVVA 4ZLYA 2QHNA 3QZFA 4V0GA 2VWBA 4QP6A 4MD9E 4AA5A 4I5HA 1GZOA 3KL8A 2ACXA 1NY3A 1ZZLA 2ETKA 3DOGA 4HCTA 5E1EA 1F0QA 3V5QA 1Q3WA 4EOLA 3KRJA 3HV7A 3W2OA 3P78A 4QMTA 3VF8A 3ZRKA 3UNJA 4D4SA 4EWHA 3CXWA 4FV9A 4M13A 2BRNA 3R8PA 3HVCA 4BCMA 1FQ1B 1ZY4A 2C3LA 4OTGA 3CGOA 5AMNA 4IFCA 5EM6A 3V5JA 4U5JA 2W1EA 4EYMA 2BR1A 3PG3A 4X2GA 4E6DA 4D2SA 4AACA 4F1OA 4PPBA 4RJ7A 3UG2A 4WSYA 4IMYA 3W1FA 4EEVA 4HGSA 4YHJA 4IAZA 4O2PA 2C6IA 4H1JA 4M3QA 1JWHA 3F3ZA 2CCHA 3R30A 1BI8A 3QD3A 2OZAB 3MFTA 3ROYA 2RIOA 4EBVA 4D9TA 3MTLA 5LVNA 5TE0A 5E8YA 3KGAA 4O6LA 4BTFA 3VN9A 4AN2A 3EYGA 2PMNX 4KS8A 1PXJA 2R4BA 3RP9A 4D2RA 3F5XA 3RAHA 4BCGA 5IMXA 3KXMA 3QQGA 4GYIA 1YWVA 4BDDA 4IVDA 2ZOQA 3TNQB 1E9HA 2KULA 4UWBA 4D2WA 4LMNA 3MVHA 1AQ1A 3R73A 5JFVA 4OT5A 5E90A 5E8ZA 1ZOEA 4JBPA 3B8RA 5CF4A 2WZJA 1QCFA 3CC6A 1SYKA 2EXEA 3SLSA 4DTKA 2XH5A 4FV0A 1IASA 2XIXA 4OGRA 4BDHA 4CYIA 5HVKA 3UPZA 4RIOA 3BELA 3NCGA 3UTOA 4XP2A 2B9JA 3CD3A 4NFMA 4RZWA 5GJGA 3QWJA 4QYFA 2GTMA 4GG5A 1TKIA 4XLVA 4M97A 4RWKA 3ZZEA 4DEDA 3PE2A 2P3GX 3DFAA 3ZBXA 5M44A 4UYNA 2XEZA 3G2FA 3NW5A 4G3FA 4CFXA 2VTTA 5DFPA 4DH3A 1LUFA 4P90A 3PY1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W2D A;  4O4E A;  1W2C A;  4O4B B;  1TZD A;  1W2F A;  2IEW A;  2IF8 A;  4O4C A;  4FRF A;  4O4F A;  4O4D A;  2A98 A;  2AQX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5HBE A;  2QU5 A;  4QTD A;  4ZTQ A;  4D2P A;  3LCS A;  3HRF A;  4RJ6 A;  4TWP A;  5T68 A;  4E6Q A;  3C4E A;  1Q8Y A;  3OBG A;  3DAK A;  5L2W A;  2UZE A;  4I94 A;  3T3V A;  5J7B A;  2W7X A;  2VTH A;  5DH3 A;  2BZK B;  2EXC X;  1YHS A;  3CPC A;  1DAY A;  1YKR A;  5G6V A;  1MQ4 A;  1ZXE A;  2I0Y A;  4FL3 A;  3PPZ A;  2Q0B A;  3HP2 A;  5CXH A;  3R9O A;  2IZR A;  4C37 A;  4ZTN A;  2R3G A;  1FIN A;  2GNI A;  2GS6 A;  3NYN A;  3QQL A;  5H2U A;  4C3F A;  1KE6 A;  3SC1 A;  4L00 A;  1Q8Z A;  3THB A;  2CN8 A;  4EKK A;  4AA0 A;  2F57 A;  4M84 A;  2F2C B;  3ZFY A;  4C02 A;  4D4Y A;  4FK3 A;  5EYC A;  2VWZ A;  4MNF A;  4XNE A;  4QMX A;  3R7Y A;  2ETR A;  2RG6 A;  4IXP A;  5HOR A;  3IO7 A;  1H1R A;  3C4W A;  5D10 A;  4F6S A;  4Z9L A;  4AZW A;  1U54 A;  4FNZ A;  3D14 A;  1JAM A;  1YHW A;  4XV1 A;  4OAU C;  3D0E A;  2Y4I B; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1W2D A;  4O4E A;  1W2C A;  2X0P A;  2X0Q A;  4O4B B;  1TZD A;  1W2F A;  2IEW A;  2IF8 A;  4O4C A;  4FRF A;  4O4F A;  2X0O A;  4O4D A;  2A98 A;  2AQX A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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