2A98A

Crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase c
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
EDGRILKRFCQCEQRSLEQLMKDPLRPFVPAYYGMVLQDGQTFNQMEDLLADFEGPSIMDCKMGSRTYLEEELVKARERPRPRKDMYEKMVAVDPGAPTPEEHAQGAVTKPRYMQWRETMSSTSTLGFRIEGIKKADGTCNTNFKKTQALEQVTKVLEDFVDGDHVILQKYVACLEELREALEISPFFKTHEVVGSSLLFVHDHTGLAKVWMIDFGKTVALPDHQTLSHRLPWAEGNREDGYLWGLDNMICLLQGLAQS
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title The crystal structure of the catalytic domain of human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
rcsb
molecule keywords Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C
total genus 80
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2005-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2a98A00
4FRFA 2A98A 4O4CA 4O4FA 1W2CA 4O4EA 2IF8A 1W2FA 2IEWA 4O4DA 4O4BB 1TZDA 2AQXA 1W2DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H58A 4CRLA 4R7HA 3G51A 2B55A 3IW4A 3T3UA 3HMIA 3ERKA 2B7AA 3E87A 3G9LX 4BCFA 4I3ZA 3C4CA 4XG4A 4PF4A 4YTHA 3QRTA 2QOKA 5G1XA 5AP7A 3HMOA 4IAYA 4PP7A 4LGDA 2I0YA 5AR2A 4CV8A 5I9VA 3CD3A 4AS0A 4BYJA 2XKFA 5AP0A 1X8BA 3A7FA 2XYUA 1H1SA 4XG8A 5KMJA 2F7EE 3KXNA 4LRMA 4YC8A 2AC5A 2WMAA 4LUDA 4UWYA 3VS4A 3LCKA 3S0OA 3EN5A 2VD5A 1WBNA 2P2HA 4FOCA 2W0JA 3DAEA 3FPMA 3O50A 1I44A 4M14A 5LXMA 1H27A 3SHEA 4D28A 1OGUA 2WTDA 2XNBA 4BDJA 3FZSA 5LVNA 5J7HA 1YRPA 5E8SA 3QBNA 4F1MA 2OI4X 3NUXA 3KC3A 3QQFA 1YWRA 4H3BA 3D83A 4O21A 2HYYA 4E4NA 2J7TA 2RGPA 2VTLA 3ZRLA 4NM3A 2IZRA 2W1FA 5C26A 4PNIA 3NW5A 2ZM1A 3GQIA 4H1MA 2R3FA 4DHFA 3V01A 1PKDA 1DI8A 2W9ZB 2YISA 3R1NA 3ROYA 3QQUA 3VRZA 4C2VA 4O22A 5JQ5A 3BGQA 5CANA 4UYNA 3BELA 3U4WA 3FMJA 2YDIA 2ZV9A 2WFYA 3B2TA 3POOA 4ZTLA 3UO6A 5C8MA 5CEQA 1LEZA 3O2MA 4AGUA 3R9DA 5CF8A 2PWLA 1UWHA 1GIHA 3W2PA 4UV0A 1V1KA 2UW5A 4WT6A 3HP5A 5EI8A 5HVJA 2J0LA 2R3LA 5M55A 1WCCA 3KY2A 3PWYA 4EBWA 3W2CA 2ZAZA 3FMEA 2ETRA 4YTCA 4I0RA 4EK8A 2WO6A 3A4PA 4MTAA 1ZAOA 3U51A 4CT2A 4FA2A 3QWKA 3F5XA 3GU7A 3QC9A 3UZPA 3OD6X 3K5VA 3ODYX 3G6HA 3KEXA 3UQCA 1QPCA 3V5TA 5HORA 3O8TA 3UPXA 5K4JA 2O3PA 1GAGA 2YM6A 4IX6A 3BWJA 3M1SA 4L52A 4LG4A 3E7OA 3C4XA 3KMUA 5HVYA 3TG1A 4ZZNA 5CSWA 2JIIA 3C4FA 1BL6A 3C7QA 3EQRA 3KXGA 1ZOEA 4ZEGA 5H8EA 4WD5A 4F99A 5E8YA 3A8XA 4IVBA 4FSYA 2Y6MA 5HIEA 2JEDA 1SZMA 2IVSA 3MFSA 3OFMA 4O4FA 3QD4A 5HIBA 4FZ6A 3LHJA 4GVAA 2C3JA 2IN6A 4GW8A 2WIHA 4BTJA 4QMUA 1OECA 4ACGA 4PL5A 3CY2A 5D12A 3ZRKA 4RWKA 5JFXA 5F1ZA 3ZBXA 4DFLA 4FZ7A 1IR3A 2W05A 2PMNX 2R0IA 3VO3A 3ZC5A 3PIZA 3ZYAA 4ZLZA 2X6DA 3H30A 5CAUA 2WQEA 3ULIA 3TIZA 2BROA 1UV5A 3RNIA 2R3GA 5E90A 3RWPA 2C4GA 5EHOA 3U4UA 3ODZX 3MPMA 5FBNC 4X2KA 3C9WA 3PPJA 4GV1A 4NM0A 4ZTQA 2LAVA 2HAKA 2GHGA 3MSSA 4U6RA 5FM3A 4UMRA 5CU0A 4ASEA 4W4WA 3ORLA 1Z9XA 4JBPA 4NEUA 3V5WA 2NO3A 3SXRA 3DLZA 4ZSGA 3ZDUA 4BF2A 3F82A 5TT7A 1G5SA 5CQWA 2Z60A 3FZRA 4OGRA 3RPYA 2VTIA 3EMGA 5AP5A 1PXKA 1Q24A 4FKQA 4RJ8A 3PY0A 3HECA 4CFXA 4I41A 2WU7A 2B52A 1VEBA 4FZFB 5CASA 1M2PA 3RAIA 3AC5A 4FKGA 4DH8A 3UOJA 4Y85A 4IZYA 4C4IA 4UMQA 2VWWA 3BU5A 4EL9A 4X7QA 4BDDA 4ACMA 4AT3A 1TKIA 3ZEWA 1KV1A 2W99B 3SVVA 5EW8A 5AR4A 3R04A 4FSUA 2XKCA 1JSTA 5IF1A 1Q61A 2JD5A 2F49A 2PMOX 2XF0A 3BYSA 5E1EA 5FWKK 2BPMA 4AFEA 3MTLA 1XH4A 3ITZA 4DEBA 3IPHA 3EWHA 4NIFA 4QQCA 3BHHA 3E8DA 3R01A 4WO5A 3FZPA 5CQUA 4ZLYA 4FYOA 4X3FA 2XIXA 3HP2A 3L9MA 4PQNA 3EN4A 2GNGA 4BDHA 4N0SA 2IEWA 5EM7A 4D1XA 4NZWB 4ARKA 5FBOA 4X6QC 3UQGA 2ZYBA 4QYEA 4TWOA 4FF8A 4FEQA 4EQCA 2YCSA 3Q6UA 3F2NA 3HDMA 4WBBB 3NAYA 4XP2A 4AA0A 4RVKA 4IANA 4YJNA 2WD1A 5CS6A 4IC8A 1WBWA 4JBQA 2I0HA 5D41A 5JK3A 3NUPA 1NVQA 2W4JA 4KINA 4BDFA 5I4NA 4YJQA 4MNFA 2JKQA 2BHEA 3W55A 1YHWA 3PE1A 4O0VA 3EQPA 3QGYA 4CFMA 4EWQA 4XG3A 3ORXA 4GJ3A 5EM8A 5ANIA 4QMNA 4E20A 1KWPA 1H1QA 2ONLC 3D2KA 2YAKA 3GU8A 3QRIA 2HENA 3TV4A 1HOWA 3TV7A 1RQQA 3OT3A 1XBCA 2WTIA 3KCFA 5IDNA 3KVXA 2R3IA 4KB8A 3PG3A 3QTIA 4FV8A 5DT4A 4BDIA 4BIEA 4BCQA 4MD7E 4O4DA 4TPTA 3QKMA 5EM6A 3PYYA 1JLUE 3R7OA 1KE7A 3A99A 4M67A 2QKWB 2VWZA 4FG8A 2RIOA 2WQOA 2NRUA 5HKMA 3KN6A 3VW6A 4AZWA 4ITHA 4XMOA 2IZTA 4IAZA 4PMMA 4XV3A 4BWKA 3F3ZA 2VV9A 1YXXA 2RFNA 3HV3A 4GU6A 2J4ZA 4O4BB 4RIYA 5CU2A 3T3VA 1UNLA 4I22A 4BI0A 1LPUA 4O2ZA 4ZP5A 3ULZA 2F2UA 4RQVA 3V8TA 3DZOA 5LVMA 1KOAA 1A9UA 4FKRA 5IH4A 4UWCA 3NYOA 1OL5A 3QXOA 4FNWA 5CWZA 1IG1A 4E93A 1VYZA 1WBOA 4FTQA 4LMNA 2O0UA 4GEOA 4RZVA 4FTLA 3V8SA 2XK9A 3Q9YA 2OXYA 4EC9A 5BMSA 4BDEA 3KN5A 3QTQA 3MH1A 4P4CA 4RRVA 2PL0A 4E4MA 5K9IA 3TJCA 4JAIA 3Q32A 2DWBA 3UZTA 5TF9A 3SD0A 3RMFA 2H9VA 2XNEA 3HA8A 2WQBA 1JPAA 3NEWA 4QTBA 4ACDA 2F2CB 5AAEA 2QC6A 1TQIA 5HE3A 3DKFA 3W2OA 1PXIA 1E9HA 3PRIA 4GUEA 5H8GA 4FTMA 4GVJA 3HYHA 3ZMMA 4AZEA 4DH3A 2PTKA 2H96A 5BVEA 4ZZMA 3QKKA 1ATPE 4MNEB 5HZNA 2XIYA 4J52A 5JGDA 5KNJA 4F70A 4AZFA 1MRVA 2H8HA 3BYMA 2W9FB 3QZFA 4LOQA 2BRBA 2CLXA 4QP3A 5E92A 4ENXA 3W2RA 5B2LA 3H0ZA 4XV1A 3ZO1A 2UZBA 3BE2A 3LFQA 5AP6A 5HTBA 3KFAA 3F69A 4RFMA 3WE8A 3UNJA 2C30A 2ITVA 4BHZA 4PL4A 4O0WA 2ITPA 5GJGA 5CAQA 1UU7A 1SM2A 3OY1A 4FICA 2PZRA 5IA1A 3TZ9A 4FKIA 3GGFA 4BIDA 4WG5A 2B9HA 3R71A 2G1TA 2CN5A 2VWYA 4FIJA 4L53A 3M42A 4E5AX 3ZXTA 1F3MC 3PP1A 2X8IA 4TWNA 3FC2A 1PJKA 4I20A 4DGMA 2RFEA 4F7LA 2JIVA 1EH4A 1YHVA 5BPYA 4AXAA 4IC7A 3UPZA 1XH7A 2XEYA 3FMNA 3WIKA 3NX8A 3R7EA 3QCYA 1QPJA 3FZOA 4B8MA 5A9UA 4RJ6A 4J53A 2BRGA 4HPUE 3LMGA 2BTRA 3OVVA 3T9TA 3KRWA 5HO7A 5HU9A 3NUUA 5HX8A 4F4PA 4I5PA 2C6LA 3BRBA 4F0GA 4DEGA 4G9CA 4J8NA 2PE1A 3QXPA 4CQEA 3ANRA 2RG6A 5F20A 3VN9A 3ZH8A 5AM7A 2BRMA 3OHTA 4TYHB 3NZ0A 1Y8GA 3FQEA 3LJ2A 3CTJA 2PZ5A 3TZ8A 2ERKA 2VWIA 1PXNA 3PIYA 4L46A 3UYSA 3GT8A 3ETAA 4AOJA 4CKJA 3UP2A 4EOJA 4EHEA 4XOYA 3F3UA 3LM0A 3S00A 1LEWA 2XKDA 3LXNA 4MWHA 4XV9A 3OWPA 3BYOA 5ANEA 3QUDA 5EM5A 1KE9A 3HVCA 4CNHA 2FSOX 3UIMA 3DB8A 1XH8A 5HG9A 3BLHA 3LFSA 1JKTA 2IVUA 3OC1A 4DGGA 4G1WA 4L9IA 4RFYA 5AADA 1AGWA 2FYSA 4EOMA 2PK9A 4NWMA 3PTGA 3BX5A 2QURA 1J1BA 2O5KA 3R7YA 1YWVA 3ORIA 3R28A 3RM7A 4C2WA 3P0MA 1ZARA 3D7TB 5AA9A 1FGKA 2WEIA 2XIKA 3QC4A 3TXOA 4XS2A 2UZOA 3HKOA 4NU1A 5HCZA 5L2IA 5DRBA 2C6EA 4ZTSA 1WBVA 4L45A 1ZMUA 4WNKA 3BHVA 4DBNA 3QUPA 1Y8YA 4JQEA 2CHLA 3OW3A 4YBKA 2QCSA 2Y6OA 4L3JA 5FQDC 4NFMA 3ZO2A 2OW3A 4O6EA 4EORA 4HVIA 3UG2A 4U5JA 4JDKA 3ENHA 4ANNA 4AG8A 1UWJA 4F65A 4FT3A 5BVOA 1OPJA 4JNWA 3KULB 1W2DA 2UZEA 1CM8A 3TN8A 3IW5A 3VS1A 4HVSA 2VU3A 4H36A 5CI6A 4DFXE 3LAUA 4P5QA 2QODA 4Q5HA 3OS3A 4A9YA 3KL8A 4MHAA 2SRCA 4GRBA 3FI2A 3WIGA 3MVJA 5GJDA 3E8EA 4ANBA 3LFDA 1PXPA 4CD0A 4UEUA 1NVSA 3VS0A 2B4SB 3D5UA 2JFLA 3DBFA 5EOLA 2JFMA 4FIEA 3RTPA 1YI6A 4LFIA 3ZZEA 4AUAA 2RG5A 4C4FA 1YW2A 3MPAA 4C35A 4M12A 5I0BA 3PZEA 2QR7A 2ITUA 3O96A 5A4LA 4XBUA 1W82A 4HYHA 5F9EA 4EWHA 3QWJA 3A61A 2R3NA 3WARA 4BBMA 1MRUA 4R3CA 5EDRA 4GIIA 2G2IA 1W8CA 3FY2A 3FUPA 4X3JA 3FKLA 1AD5A 5E7RA 4GT5A 5C27A 1PXMA 3OW4A 4FC0A 4E8AA 4UZDA 3VHKA 5AM6A 3ACJA 2WZJA 3CS9A 3FYKX 2G01A 4EOKA 1NA7A 3DAJA 4F6SA 5HG8A 5J95A 4IDVA 3QYWA 4RT7A 1PXLA 4PMSA 5L2TA 1XBBA 3DB6A 3G0EA 3ORPA 5CU6A 1U5QA 3THBA 4WG3A 1S9JA 2BZJA 2EB2A 2IZSA 1M14A 4S32A 5AUYA 2OICA 2XK4A 4MCVA 5CY3A 4C59A 4AW5A 2J0MB 4IB0A 4QYFA 5A3XA 2AYPA 4B4LA 1WMKA 2FVDA 2ZDUA 4V0GA 4CZUA 2GNIA 2OXXA 5KMKA 2V62A 5AV1A 3E62A 2QR8A 1V0PA 2B9FA 4D9UA 5EW9A 2C5YA 2HWOA 3QD2B 4XV2A 5M57A 2X9FA 2PY3A 3TJDA 3EQDA 3WE4A 4AZVA 4CQGA 5J79A 4G5JA 3PUPA 1BL7A 3R02A 2C3IB 3MGYA 4AOIA 5A54A 2BIKB 3R2YA 2VRXA 2I0EA 2OFUA 4PNKA 2YACA 4X21A 3WILA 3HMMA 5GZ9A 1Y57A 2PVYA 3EKKA 5E8UA 1E1VA 5DGZA 2ERZE 4I1ZA 2OGVA 1HCKA 3PXQA 1AQ1A 4LUEA 4EHZA 2I6LA 1WAKA 5AUUA 5I9UA 4IADA 4EOOA 3CBLA 4U44A 1DAWA 1NY3A 3AT4A 1NXKA 4FT9A 3B2WA 2EUFB 3QRJA 4FOBA 4FV0A 4HGEA 3UIXA 4FUYA 4CZTA 3BHUA 3PA4A 3NGAA 4KKHA 1UVRA 3QX4A 5L2SA 2C6MA 4R5YA 2OU7A 2WOTA 3PXRA 4IM3A 4D58A 5D7AA 5HE0A 2W1DA 5HQ0A 2FGIA 4RJ5A 3ZUTA 3W2QA 2XZSA 1H00A 3DOGA 1K3AA 3I60A 3QRKA 3BU3A 4L01A 3SOCA 4V01A 3ZSGA 4C4EA 4O0XA 4E4XA 3FLNC 1RW8A 3P23A 2OJ9A 4YLKA 4YGAA 2GPHA 1PXJA 2C5NA 1V0BA 4EHGA 5DPVA 4J98A 1IEPA 4QMOA 1B6CB 4OBPA 4QP1A 4NK9A 5EKNA 4EK5A 2EXMA 2W17A 2GS6A 4YJTA 3G0FA 5FRIA 3PLSA 3HDNA 4FI1A 1H25A 3ZFMA 4ASDA 4FKSA 4GK4A 5ANDA 3FMDA 4D0WA 3QQJA 4RIWB 2OJIA 3S2PA 3RAKA 1U4DA 3IDCA 4YPSA 3VBQA 4EQUA 1H28A 4MXAA 2VN9A 3CCNA 5FD2A 5EKOA 5KX8A 3MI9A 4JI9A 3Q53A 3R8MA 2W1HA 4ZAUA 4Z7HA 1YXTA 4J99A 5BNJA 4NKAA 4MXXA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2X0Q A;  2X0P A;  4FRF A;  2A98 A;  4O4C A;  4O4F A;  1W2C A;  4O4E A;  2IF8 A;  1W2F A;  2IEW A;  2X0O A;  4O4D A;  4O4B B;  1TZD A;  2AQX A;  1W2D A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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