2EXE | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	282
structure length	262
Chain Sequence	ARLEINVLKKIKEKFLCVLMSDAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of the phosphorylated CLK3 rcsb
molecule keywords	Dual specificity protein kinase CLK3
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	79
structure length	262
sequence length	282
ec nomenclature	ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date	2005-11-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	2exeA00

1WBWA 5JGBA 1J1CA 4OTPA 5LVOA 4FICA 1V0BA 3TI1A 1R3CA 4FG8A 3QWJA 4ZSAA 4FTTA 4FR4A 4K1BA 4C37A 4LV5A 3KQ7A 3BGPA 1XH7A 3F6XA 3MPTA 2P2HA 4IC8A 4PMMA 4RMZA 4AGDA 2W1GA 3ALOA 2VO0A 4BGGA 3C51A 3CCNA 2XF0A 5J7HA 2B52A 2F2UA 2VUWA 3JVSA 1MUOA 4O1PA 4G31A 4D4YA 4WUAA 4AFJA 3PZHA 2XYNA 3E8EA 1URCA 3P7BA 4S2ZA 4ZSEA 4UX9A 2JFMA 1B6CB 4RIXB 3RPSA 3CPBA 4IM2A 4LRKA 5KNJA 3ZDIA 5M4IA 4RX7A 3FI3A 4WA9A 4XBRA 2OWBA 3OWPA 5F95A 2X7FA 5EDPA 5AAGA 3ITZA 4U8ZA 3ZUVA 4EH9A 3GT8A 3MI9A 4MXCA 3GC7A 3QQGA 1NA7A 4ACHA 5CXHA 1JSUA 2IZTA 3KXZA 4GT5A 3HA6A 1Q8YA 4FSRA 5HIEA 5HE0A 1P14A 3TNHA 2PE1A 2FA2A 3PPZA 3COHA 3ZCLA 2R7IA 4Y73A 4WT6A 3HRFA 2WTJA 5IDPA 1PMUA 3DCVA 2YLFA 1OIUA 4U97A 4OTQA 3GU7A 4NUSA 4AZTA 3R73A 3KULB 5AWMA 4DBNA 2PVLA 4U3ZA 3U87A 1J91A 1H24A 2ITXA 3H4JA 3GU5A 2VTTA 4BKZA 3I0QA 3N51A 2VGPA 3F82A 2XUUA 4XMOA 2WMAA 4NJDA 5TR6A 4CYIA 4XHKB 4BDFA 3QALE 1MRVA 1GAGA 5AV4A 1E1XA 1R39A 1REKA 4E4MA 3RAWA 4F1MA 3FE3A 4QMYA 4BDHA 2VO7A 3DKFA 3HKOA 1XH4A 2E9OA 5JMSA 1PHKA 2W1IA 1KSWA 3QA8A 3FLSA 2R3LA 4KA3A 4KIKA 3DBQA 3S95A 1OI9A 3TNPC 5BYYA 4K0YA 2VTQA 3VULA 3QKKA 4AE9A 2OG8A 2YITA 3NDMA 4BCIA 4DGLC 4R3PA 2Y9QA 3OBJA 2RIOA 2Y7JA 3VBWA 3R8UA 5L2WA 4HCTA 4QTBA 5DBXA 2RFEA 4PMTA 4DH8A 4CRLA 2O63A 2YERA 2UW6A 4H1MA 5FG8A 4BWKA 5AV3A 3RZBA 2IZSA 4XG8A 2JEDA 1JSTA 4F9WA 3W2CA 4BCFA 2WU7A 2BCJA 2X8DA 2VWIA 2C30A 4A9UA 3DQXA 3EL8A 3FZRA 3ZBXA 5I9WA 4C02A 4BCHA 2QVSE 2CLQA 3DJ5A 1RDQE 4JI9A 2ZM4A 4FT3A 4KWPA 3E8CA 4R5SA 2J0LA 3D9VA 3Q6UA 2XNEA 4KSPA 2OW3A 2YACA 3DTWA 3GEQA 2BDJA 3QLFA 3FC2A 5H8BA 4RWKA 3AC5A 2QKRA 3AD5A 5A9UA 4WUNA 1PXMA 3TZ9A 1YWNA 2W4KA 3UOKA 4BCPA 3TNWA 2JLDA 3MS9A 3U6HA 4QP1A 5K0XA 4AZFA 3CPCA 1I44A 4OTRA 1ZZLA 3CGFA 1NVSA 3BU5A 4BCKA 4EOIA 3VBXA 5E1EA 4O21A 3VQUA 3D7ZA 3MY0A 3UYSA 4F99A 1JKTA 2R3MA 4FG7A 4N4SA 2QURA 3WF8A 4MNEB 3MVJA 4D0XA 4CKIA 4CFVA 4CKJA 4O0RA 4F6WA 5L8JA 4BL1A 3PSBA 4TPTA 2OZOA 3BI6A 3KFAA 4L44A 4P90A 5J9LA 3E7VA 3LFBA 4G5PA 4YPSA 3D5UA 1WBNA 3E7OA 4OTIA 4RGJA 3CQUA 3L9LA 3TIYA 2B4SB 2OU7A 4G6OA 5AA9A 3NS9A 4AFEA 3C1XA 4FGBA 2C69A 1F5QA 2HELA 4ARKA 5HTIA 4ZTHA 3UOLA 2YM7A 1IEPA 3FMNA 3CQWA 5IKWA 2G01A 3U4UA 4CT2A 4ACCA 4J96A 3UPZA 1XKKA 3T9TA 2I40A 1SMHA 1JQHA 3VF9A 3D2IA 4L45A 5IA5A 2UUEA 4V0GB 2XVDA 4JQEA 3VIDA 3PE2A 4FV8A 3W10A 3RPOA 2Q0NA 5FQDC 2XBJA 3LQ5A 5I0BA 2JKOA 2CJMA 2XK3A 4M0YA 4FIHA 5KO1A 2HZIA 5AP2A 4BDBA 4Y8DA 4DGNA 5CSWA 4ANBA 4F0FA 5CEOA 2Z7QA 2XP2A 1XO2B 2I1MA 5CU2A 1KV2A 4GJ2A 5CU3A 3NLBA 2WHBA 1OL2A 2WOUA 5JFWA 3QCSA 5I9ZA 3MBLA 4IZ5A 4RJ3A 4FTNA 3MFSA 4X6QC 2C6OA 4XG7A 4BI0A 4IAAA 3OUNB 3QX4A 3P5KA 2UZWE 4BWXA 5CAQA 1OB3A 4QMOA 1YW2A 4FZDB 5A4EA 3IPHA 1PXIA 1RW8A 3Q60A 3RNYA 1FGKA 2J6MA 4M13A 3ORMA 5FWKK 4EOJA 3R28A 4IWOA 3UVRA 4FV9A 3MA6A 3FKOA 3KU2A 3UIUA 3VS0A 2GHGA 2PZRA 3GVUA 3E8NA 1DS5A 4RIXA 5CALA 5AV2A 4UWBA 5KE0A 3IGOA 3QTUA 3TNQB 2UZUE 5FTQA 4JAIA 4LL0A 5HVYA 3LIJA 3SLSA 3TNIA 3UP2A 4FKQA 3R8PA 2J9MA 3EQBA 5CI6A 4OT6A 4U5JA 4CKRA 1GIIA 2BZKB 5IPJA 4MF0A 1CTPE 3ZFYA 2ITQA 2OZAA 3A4PA 1M2PA 3EYHA 3LAUA 3MB6A 4I20A 3R6XA 2Z60A 4KNBA 1ZMUA 2ERKA 1IASA 3SVVA 4FV6A 5E90A 4E5AX 5EDQA 4M66A 4CV9A 4IEBA 3TZ7A 4IQ6A 4TYJA 1U5RA 3DXNA 5CEQA 3HUBA 1XBAA 4ACGA 4DAWA 2FGIA 3QQKA 4NT4A 2VN9A 3ERKA 3G6HA 4YNOA 1W7HA 2PE0A 4A4LA 4EOSA 3KULA 2R3RA 3VBTA 4IB1A 4F6SA 2BAQA 2BILB 3VWAA 4ZLZA 1PXKA 5A46A 2W0JA 4G3EA 4NCTC 4YJTA 4F9AA 3MDYA 4G6LA 4ACMA 4I24A 2BR1A 2PY3A 4DG0E 3HDMA 4ZZMA 5C01A 3R8VA 3AOXA 3FPMA 2CN5A 3GFEA 2BIYA 4LRMA 5BUEA 4AAAA 4ENXA 5M4FA 4E6DA 4RC4A 2OXYA 4C7TA 5HTBA 4IH8A 4YJQA 2H34A 1Z57A 3MFUA 4B9DA 1CKPA 5DEWA 3FXZA 3QZHA 4IB5A 3HECA 3CKXA 1LEZA 2QU6A 5JKGA 5K9IA 2YISA 4YPDA 4RVMA 3OCTA 2B1PA 3FLZA 3VF8A 1YOJA 5IF1A 3COMA 5B2KA 3FMJA 2X81A 3HRBA 5CZHA 3IKAA 1YWRA 3OCBA 4AW5A 2C5VA 4TY1A 2XIKA 4YZMA 3UQGA 2X9FA 4BTJA 3IW4A 2JDOA 4NKSA 3BYMA 3EN4A 3D0EA 4PX6A 4XV1A 4A07A 5E1SA 4RJ5A 4QQTA 1YHWA 4I0SA 4CLJA 4FUXA 3IOKA 4R1YA 4RWJA 3GCSA 4AN2A 5CAPA 5CF6A 4AT5A 3OTUA 4H36A 2G2HA 3R1QA 5IMXA 3QD0A 5DH3A 5ICPA 4C4FA 2EB2A 4RA4A 2QO2A 3UVQA 4RT7A 5CTPA 4DFLA 2C3LA 2R7BA 3FXWA 3R1NA 3BHHA 3OHTA 4XV2A 2WMVA 4NM7A 1O6YA 3SA0A 1SZMA 5HEZA 4PWNA 4QT1A 5BX0A 1PXOA 3MN3A 4ASEA 3A7IA 3FY2A 4CYJA 3NEWA 4Q2AA 4EWQA 4O6EA 3DZQA 1GZOA 2XNPA 3MSSA 4A4XA 5EDRA 5B2MA 5KMOA 5LVPA 2OJIA 5CS6A 1NXKA 4E8AA 4L3JA 3OEZA 4G16A 3CE3A 3V04A 1U59A 3GU6A 2C5NA 2J0MB 3UIXA 1UV5A 4V05A 4EH3A 4F63A 3AC1A 2JIUA 3RAIA 4W9WA 5AP4A 1U54B 3JY9A 2VWBA 4WNOA 4BDDA 5EYKA 3BLHA 5IH4A 2HYYA 4BHNA 3AC8A 4PQNA 4LMUA 2WTVA 3JS2A 5H8GA 3VNTA 4XCUA 3UO6A 3ZRLA 4G6NA 2ZV8A 4G3FA 1ZARA 4UEUA 4AGUA 2VTPA 3LM0A 4LMNA 1YVJA 2X2KA 4FTQA 3BEGA 5GZ8A 1P5EA 4YZCA 5FM3A 2V22A 3ZZEA 3ACJA 4BVUA 3GFWA 2VWXA 2OJJA 4GT4A 4H3PA 3S0OA 4JX3A 4KAOA 2UZVA 4E26A 1LPUA 5AR2A 2JGZA 2YM4A 1ZYDA 2XCHA 2Z7RA 4NH1A 2FO0A 3AT4A 1PMVA 1X8BA 5HQ0A 5AMNA 3EQIA 1PJKA 4HGLA 4PDPA 4C34A 3KRWA 4AP7A 4B6LA 4J7BA 5T3QA 2SRCA 4CMUA 2VWYA 4LUDA 2QOOA 2C6DA 4YC6A 3OMVA 4Z55A 5HD7A 3RNIA 3UPXA 3V6SA 4FV3A 4C36A 5HCZA 4EH4A 4BIDA 4O0XA 2XJ1A 4YZBA 3GCUA 4U9AA 4EZ5A 4IB3A 1FMOE 2PMNX 3H30A 2W1DA 4YO6A 2E9PA 2QOKA 3D5WA 3NAYA 5IA4A 5JK3A 2WPAA 3QCYA 5AIRA 4NEUA 5H2UA 5TF9A 3RAKA 1H28A 4H58A 3CD8A 2ITVA 4MK0A 4F70A 3ZBFA 3G0EA 1W83A 2J4ZA 2XS0A 4I93A 3HMMA 3EQRA 3G2FA 3PXZA 3QTIA 4EZ3A 4TRLA 4FKSA 3EZVA 3EQPA 3ZLXA 3QC4A 4HYIA 4W8DA 3S2PA 5JFVA 3UQFA 3MYGA 4I1ZA 4IIRA 4DYMA 5I9XA 3HA8A 3R22A 4PPCA 5AJQA 4ZZOA 2UW9A 3Q4TA 4F4PA 5A3XA 4OLIA 3HLLA 3RPYA 2ITPA 4CSVA 4FSWA 5BUIA 5L8LA 4P5ZA 4CV8A 3Q4CA 5FEEA 3EKKA 3NUXA 2ZM1A 4JVGA 3A7JA 2OIQA 2JKMA 2R3HA 4RJ6A 4GU9A 3OROA 4BYJA 2ETMA 5HG9A 2R3PA 3QL8A 3GGFA 5CQUA 3R21A 5HE1A 2WMTA 2WMUA 1YDTE 3EQGA 5EH0A 2GFCA 4ANMA 3O51A 4H3QA 4JLCA 2H96A 2VTAA 3QTZA 2A0CX 5DVRA 5TO8A 3SQQA 2VTHA 1FQ1B 1OECA 4CMOA 4XBUA 4ZY4A 1H01A 5AAEA 3CTHA 2WMSA 5EYMA 2V0DA 5D1JA 1U46A 1GJOA 4XG2A 4AUAA 3QTSA 2VX3A 5CLPA 5FD2A 4YJSA 3R7IA 3WE8A 1WCCA 1H4LA 3FZSA 3W55A 1YI4A 3ORLA 3VHEA 4ZTMA 4QMMA 1JLUE 4OUCA 3ODYX 4YHTA 4Q9SA 3E3BX 2F57A 3AXWA 4GJ3A 5EW9A 5BQ0A 4L68A 5AUTA 4GCJA 4BKYA 2IW6A 3VUGA 4YO4A 2UW5A 4AGWA 1JSVA 2QCSA 4UMRA 3OWJA 4JR3A 1KE6A 4HYSA 5ANEA 2W9ZB 4WSYA 5HBJA 4ONAA 4ITIA 4B4LA 3HV3A 4BBFA 3CY3A 4NCTA 4LV8A 4MXXA 2J5EA 4C4HA 4Z16A 2I0HA 4N70A 4RC3A 3C50A 4WO5A 5HIDA 4KIQA 3FLNC 5HLWA 5M44A 3QRUA 5DG5A 1XBCA 2PHKA 2ZDTA 3PA3A 2GHMA 4C35A 3EJ1A 2CPKE 4YLJA 5AAFA 4HYHA 2PZYA 4A9YA 5KCVA 5LWNA 5FBNC 4IFCA 4ITJA 4IB0A 4H3BA 5CSXA 4J99A 4I22A 3FPQA 1PY5A 4F7SA 3FSFA 3H9FA 5K4IA 3RK9A 3RINA 2JIVA 3WZDA 2VWVA 4CCUA 4JQ8A 3L9NA 1KE7A 4ZSGA 5IISA 4F0IA 4IM3A 3MTFA 3QRJA 4ZEGA 2I0VA 2J0IA 5IUHA 2OJGA 2P4IA 2Y6OA 4YTFA 2O3PA 4UMQA 4DGGA 3O8TA 5IZFA 4ASXA 4F7LA 4XP3A 3F5XA 4QMXA 1H1SA 5CAVA 3Q53A 2GPHA 3BU6A 5EI6A 3MY1A 2JAMA 4IX4A 2BRBA 3R7EA 4UYNA 5I4NA 5G6VA 3UOHA 2YIYA 5JH6A 1U54A 1OUYA 4NIFB 5BPYA 1Y8YA 4NW6A 3LZBA 1KWPA 2W9FB 5D9HA 5FXRA 3EN9A 4MX9A 4UMUA 2OF4A 2OGVA 4W4VA 5TT7A 1Y6BA 3G0FA 1APME 1XJDA 4EZ7A 2XYUA 2PVFA 5IMEA 5CY3A 4KKGA 4Y46A 3C0IA 3TT0A 4TWNA 3SRVB 4DEBA 2B55A 3E93A 4J98A 1OKZA 2BZHB 1H26A 3WI6A 1LUFA 2GU8A 2AYPA 2GCDA 2DUVA 2PWLA 2ZV7A 3EHAA 4GS6A 4IJPA 5E92A 5GJDA 5HGIA 4OAUC 3KXNA 4H1JA 4FT9A 4DH5A 3BGQA 4RPVA 5ITAA 5LVMA 3FLWA 3OBGA 4FTAA 2Z7SA 4GW8A 4DEIA 3FKLA 3NUYA 2QOQA 4G3GA 3A8XA 3PA4A 4V01A 3VVHA 5JFXA 5AUUA 4JQ7A 3LXLA 4OTWA 4BZOA 5JZJA 5KMMA 4Y5HA 4YC3A 5FTOA 2X1NA 2ITYA 3LFAA 5CF8A 2XK9A 3CLYA 1YQJA 3K5VA 4JBPA 3W18A 4N6ZA 4JG8A 3NR9A 3ZZWA 4FG9A 4UMPA 4FV2A 4MHAA 2ZOQA 4XNEA 1HOWA 3GUBA 4L6QA 1KE9A 2QHNA 3DK3A 3RWQA 4C61A 5J1VA 2X39A 3UJGA 3ZUTA 4S32A 1WVYA 4D9UA 3AT3A 4PY1A 5CT7A 3QUEA 5HCYA 3R9DA 4MNFA 4NFNA 2Y6MA 3FC1X 4ANNA 2C0IA 4BDKA 4I4EA 4TXCA 3DAEA 4XUFA 4HVIA 4QP9A 4GYGA 3Q04A 3QQJA 4LG4A 3GC9A 3H0YA 3F61A 1W0XC 4EWHA 2YM6A 3ZO1A 2P0CA 3VUHA 3KMMA 4IHPA 5AUWA 4NJ3A 1W98A 3QKLA 3R2YA 3GBZA 4OAVB 4RWLA 2QC6A 4O6LA 3R7GA 4C8BA 4I5MA 3FLYA 4APPA 4MWIA 2CHLA 3ZHPC 1SYKA 1H00A 4ZSLA 4DH7A 3SV0A 4WKQA 1UNGA 3HV7A 3FWQA 2HXLA 4N0SA 4C3RA 1Q3DA 3PUPA 4TTHB 3ROYA 2FUMA 3WE4A 3FI2A 4WNKA 4J97A 4IW0A 2CDZA 3BIZA 2YDIA 4Y72A 2GNHA 2G2FA 4PPAA 2PZ5A 2X7OA 4I4FA 2RKUA 2PTKA 3NNWA 3FDNA 2B7AA 1UU8A 5JGDA 2CKEA 4W4XA 4FVQA 5BMMA 3PXQA 4FKOA 3T3VA 4G9RA 4J1RA 3NNVA 1HCKA 2NO3A 3OS3A 2W4OA 3LOKA 4KRCA 3HMOA 4EHGA 1GIHA 2F9GA 4D1ZA 1ZLTA 5E8WA 4D9TA 2XK7A 3MB7A 1BMKA 2IVSA 2WKMA 3EQFA 3ORNA 4RX8A 3FMHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3QXP A;  4M15 A;  4F9Y A;  3TTI A;  3OG7 A;  3V5P A;  2VO3 A;  2VWZ A;  5L6P A;  5AX9 A;  4QYE A;  2YN8 A;  2YIR A;  3IW5 A;  3BQC A;  4YTC A;  3CKW A;  3H0Z A;  2YIX A;  3LFD A;  4L9I A;  4BI2 A;  3Q9X A;  2HXQ A;  2I6L A;  3E88 A;  3Q6W A;  4FTC A;  3UGC A;  1U5Q A;  4WHZ A;  4RQK A;  3UE4 A;  1QL6 A;  2WIH A;  1ZWS A;  1IA8 A;  1JKL A;  3RM7 A;  2R2P A;  4BZD A;  4DIT A;  3C4Z A;  2P55 A;  4DLI A;  4QMW A;  4BDG A;  1YDR E;  3PIY A;  4FK6 A;  5EI2 A;  4HCU A;  4RX9 A;  4CFF A;  3WAR A;  1JOW B;  5K3Y A;  4RSS A;  3RMF A;  3QRT A;  4D5K A;  4B0G A;  3DBE A;  4J95 A;  3OW3 A;  1I09 A;  3D5X A;  3PLS A;  3VRZ A;  1TQM A;  2CCI A;  5DR6 A;  4GFM A;  1KOA A;  3FAA A;  4ANL A;  4QPA A;  4JIA A;  4QTC A;  4QYH A;  5DFP A;  3MWU A;  3V8T A;  4BIB A;  1WAK A;  2NP8 A;  2GFS A;  4JG6 A;  4MBI A;  3LCS A;  2BAJ A;  2HIW A;  4XJ0 A;  3BEA A;  4CNH A;  1FVV A;  2GQG A;  3G6G A;  4MCV A;  4YBJ A;  3I6W A;  4F7N A;  5L2I A;  3DAK A;  4QOX A;  2QKW B;  4KKE A;  3UMW A;  4UN0 C;  2GS7 A;  2GMX A;  5BVN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2EXEA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations