2EXE | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	282
structure length	262
Chain Sequence	ARLEINVLKKIKEKFLCVLMSDAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of the phosphorylated CLK3 rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Dual specificity protein kinase CLK3
total genus	79
structure length	262
sequence length	282
ec nomenclature	ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date	2005-11-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	2exeA00

5K3YA 2OICA 3ZSGA 3RHKA 4GJ2A 4MX9A 4TN6A 3NNWA 4ZZOA 1JBPE 3R01A 3IDCA 3EZRA 3DZOA 5LVLA 3I0OA 5E7RA 4C3FA 3HUCA 3OW3A 4CCUA 2ZDTA 3RHXA 3L9LA 4DC2A 4E8AA 3P4KA 5HX8A 2VAGA 4RIXA 3UE4A 3SLSA 2B9JA 2YM7A 4A07A 1FGIA 1Q41A 3ZBFA 4CZUA 2OFVA 1GJOA 2VTIA 5CX9A 4CZYB 3OCGA 3E63A 4Y46A 3V5JA 3SXFA 4L3PA 1PYXA 4CTBA 2GFCA 1BKXA 4I1ZA 1H01A 3R9HA 3ORMA 4YLLA 3RP9A 3ORPA 4QQCA 4ASEA 1YI6A 2R3KA 1XWSA 2YJRA 2F2UA 4F7JA 4E5BA 5J1WA 4ITJA 4XP2A 3R8MA 2HZNA 2SRCA 1Z9XA 5K0KA 4DEAA 3QF9A 3H0ZA 4I4FA 5FDXA 3EQRA 3SD0A 4FVQA 3U6JA 2E9OA 4ACCA 2WEIA 3HECA 3NDMA 4E4NA 4FZFB 2O5KA 4UXLA 1REJA 1ERKA 1CKIA 3V5LA 2JLDA 5BVEA 4PL5A 4KIKA 3Q9ZA 5IEVA 4GVAA 5EOLA 2YCSA 4DEDA 3TNQB 3T3UA 1F5QA 2BAKA 4JAIA 4HGSA 1I09A 4IHPA 3U9NA 2BTSA 2XVDA 2GS7A 3F5PA 3HLLA 3EL8A 4IDTA 4D2RA 3FLZA 2GNHA 3H9FA 3MB6A 4U79A 3I6WA 4W4YA 1ZYLA 4FKRA 4RA5A 3DKCA 3QCQA 4D4YA 4M3QA 1YWRA 3SX9A 4DG0E 2B54A 2QD9A 3QRTA 3Q9YA 4ZTHA 4RIXB 2QHMA 3PYYA 4O6EA 2VX0A 4BTFA 4ZAUA 5HCZA 4Y8DA 1U5QA 4BYIA 3NIZA 3G6HA 4DFYA 3TI1A 3SW4A 2XA4A 4QTCA 4OT5A 5LMAA 1OIYA 2OGVA 3B8QA 3C4XA 3FAAA 4II5A 3MV5A 2GNJA 1M52A 1UVRA 2B4SB 3OBJA 1Q3DA 2WHBA 5KNJA 5ETCA 3TNWA 2R64A 4L52A 1PMEA 5LVMA 4E4MA 2X8IA 3MY5A 4XG6A 3B2WA 4CMUA 5ACKA 2WTKC 4E6AA 2YIYA 2ZV9A 2IWIA 3BX5A 4FL1A 3C9WA 4C3PA 3E3BX 5HCYA 3D94A 4P7EA 5C8MA 4UMRA 1GNGA 1BL6A 1AGWA 3A7IA 4RRVA 4FYOA 4AZTA 3N51A 5BMSA 5C01A 4DBNA 3LW0A 2IVTA 2IZUA 1G5SA 4ZSJA 4X2NA 4BN1A 2GS6A 2VO7A 2PVMA 3ROCA 5DFPA 5L2SA 4GEOA 4LYNA 5JQ8A 4TW9A 3ZONA 2X6DA 1ZXEA 3OHTA 2R3JA 3D5XA 3ZM4A 2Z7LA 3HZTA 3NAYA 4NEUA 4IAKA 1JAMA 4L44A 2XK9A 3DAKA 4QP9A 4WHZA 4LUEA 3CTJA 4Y85A 2FA2A 2GTMA 4FV0A 5FTQA 4CRLA 4F65A 3NUPA 4KA3A 4E4LA 3TV6A 4KAOA 2V22A 2RFNA 2UUEA 3F3UA 4KRDA 4M7IA 3VN9A 5JMSA 2VX3A 4RMZA 4CLJA 2VTLA 3ELJA 5HD4A 3W2PA 5EHLA 1XQZA 5AV0A 2VNWA 3AMBA 4WD5A 3JVSA 4BDAA 1TVOA 1Q8UA 2BROA 3F2NA 4L68A 3QQFA 2ZDUA 5AV2A 2C3LA 1S9IA 4AFJA 3FLQA 3KULA 5I3OA 4C34A 1O6KA 3KKVA 1VYZA 3VO3A 5LMKA 2OG8A 3OOMA 1ZOHA 2PE1A 5CEMA 4J95A 2R5TA 5ETIA 4DFNA 2GTNA 4CV9A 4IB5A 4EH5A 4AE9A 5DBXA 5JFXA 4QPSA 5JSMA 4F6SA 2FUMA 2V7OA 2C0TA 3SOAA 4C62A 3OUNB 2BRHA 2B52A 4F63A 2HWPA 1OKZA 1OPKA 4FTKA 3JS2A 5KO1A 4ACMA 1Q8YA 5CASA 1H00A 3AC3A 4KIPA 5DRBA 4FIFA 2GFSA 1UNHA 4E26A 3UNKA 1OKWA 2W06A 3FV8A 2ETMA 4E5AX 2C0IA 4FSRA 4FI1A 5CZHA 2W5BA 2Z2WA 3F5XA 4G9RA 4GYIA 5CLPA 4X2GA 2ITWA 4USFA 4RWJA 3MY0A 3GB2A 4WNPA 2NO3A 4ANSA 4BCJA 2R3RA 2BDWA 3KK8A 2EXMA 4FOBA 4FTUA 3RK7A 4AW0A 1P4FA 2C3KA 2XJ1A 2NRUA 4OTHA 2LGCA 4MTAA 3WIGA 4I0RA 4EK8A 5ANJA 3ZFYA 4D1ZA 1YXTA 2FSOX 3DZQA 2X2LA 4ZIMA 4MAOA 4MQ1A 2VV9A 3D83A 5DH3A 3FXXA 2WO6A 4FIJA 3AMYA 3FYJX 3UIXA 5BYYA 2C6DA 2QOLA 1SVEA 1E9HA 4EK4A 5AA8A 2E9PA 3LXLA 3OXZA 3R7GA 3VIDA 3LLTA 4NM3A 3Q4CA 4OAUC 4ERWA 3BI6A 3UIUA 3ZYAA 1OUKA 3P7AA 4RLKA 1PMVA 4DEGA 3OD6X 4IVDA 2VTJA 1KV1A 1MRUA 1H8FA 3ACJA 3Q6UA 3PWDA 4ANMA 5EYDA 1VJYA 2YIXA 3IQ7A 3ORZA 4ENXA 1JKKA 4A9TA 3AC4A 3CLYA 4L3JA 2Y4PA 4EORA 4F7LA 2JBPA 4I0TA 4MXOA 5EKOA 4ANNA 2RFDA 4BDKA 2HK5A 4L7FA 4YSJA 5HG8A 3GOKA 3HRCA 3MPMA 4U42A 4UEUA 4F0GA 3LM0A 3E88A 3OWPA 3UYSA 4WO5A 3QD3A 2C1AA 4FVRA 2R3FA 4BCQA 3SAYA 3S2PA 3RNYA 2WMAA 3WIKA 4CRSA 5DVRA 3DLSA 2OSCA 1W83A 3Q4ZA 4PL4A 4GFOA 1W98A 2PVJA 3PPZA 5I0BA 4MH7A 4ANOA 4K2RA 4KKGA 3NYXA 3UZPA 2F7ZE 4Z55A 3FHIA 3CGFA 3C4EA 3TZ9A 5JN2A 4YTIA 4I93A 2W17A 3DAJA 2ITOA 3Q96A 4IAZA 3TN8A 4C57A 3HDNA 4ZY4A 5LOHA 5HOAA 2WQMA 3AMAA 3CY3A 5EM7A 3LFAA 3RPSA 2WIPA 3T8OA 5KMJA 5TR6A 3L8VA 4TYEA 3V5QA 2CPKE 2F49A 4FSTA 4FK3A 3OFMA 1XH9A 5K0XA 1ZY5A 1CKJA 5J5TA 3DBCA 1DI9A 2QOKA 4EZ7A 2VTSA 4FT0A 4FTOA 3D2KA 3CEKA 2YM4A 3E62A 3QCSA 4JG7A 4I6HA 4UMUA 5K9IA 1BUHA 1XBCA 4YR8A 3G2FA 1JSUA 2JEDA 3KXHA 5AX3A 1QPJA 3MI9A 3FKNA 5IDPA 4I41A 4FR4A 3ORNA 1ZYDA 5FEDA 4C61A 4R8QA 4P5ZA 4D5KA 2GHGA 2XKDA 5L6OA 3SV0A 4IH8A 4A7CA 2HYYA 2WMRA 2J5FA 4EC8A 1REKA 3PA5A 5D7VA 2X2MA 2RIOA 4UMQA 4EZ3A 5JQ5A 5IMEA 3CR0A 4GH2A 2QOBA 1H28A 1GZ8A 5IMXA 4BCHA 4X2KA 4I23A 1GIJA 4TRLA 4D1SA 4EOOA 1BI7A 3G90X 4EKKA 4C2WA 2Z7QA 3GT8A 2OH4A 4TWCA 4A06A 5I4NA 5CAPA 2WAJA 4FKGA 2BCJA 1SMHA 4KRCA 2YDIA 3QZGA 3BRBA 4IFCA 3BLHA 4JQEA 3RM7A 5KMKA 5AUWA 3JY9A 2ITYA 3GFWA 2VU3A 4IB3A 4FV9A 1BL7A 1FVTA 1UA2A 2QI8A 3P5KA 3UTOA 5EW9A 4CVAA 3PG3A 4BCFA 3UG1A 4AOTA 2BALA 2QODA 2OIQA 1VR2A 3ALOA 4B0GA 3I6UA 1H1WA 4Z7HA 5DI1A 4R1YA 3V8SA 5K5XA 3BGQA 3C0GA 3HMOA 2WU6A 4FKLA 4OW8A 1ZYCA 4NM5A 4Q5HA 1LEWA 2X0GA 5DGZA 3RK5A 2UW3A 4O0VA 4CFNA 1ZMVA 4PMTA 4EH2A 2FSLX 4H58A 4J8MA 4FKOA 3PIZA 3EFJA 2LAVA 1W7HA 4QTDA 3UVQA 4E6QA 3OY3A 4FK6A 4F0FA 3OG7A 3AC2A 4BBFA 2CGUA 2JFMA 3C7QA 2QOFA 4XOYA 3Q9XA 4HZRA 5TE0A 4KKHA 4NTTA 1JKSA 2UW8A 1W82A 4N6YA 5JRSA 3R8UA 3OVVA 2JKOA 4XOZA 3R8PA 5CAVA 3FI4A 3PXZA 4M66A 1OZ1A 4IIRA 2PZ5A 2PMNX 5I9WA 5JFVA 5IUHA 5A4LA 3LFEA 3RCJA 5CF8A 5IPJA 2X4FA 4JAJA 3ZLXA 5D7AA 2QCSA 4FNWA 4EL9A 4IB0A 4J97A 1OVEA 3DTCA 2ZB1A 5ANEA 4QP4A 3VHEA 4AA4A 5BVFA 2EB3A 2WMSA 3C5UA 4CSVA 3IDBA 2QO7A 4LMNA 3WF6A 1ZOEA 3EQBA 4R3PA 4C02A 2PVYA 4TNBA 4GU6A 1Q8ZA 3WZEA 1OIQA 5E1SA 4C0TA 4D55A 3QQJA 2OO8X 2XNBA 4BCPA 2XJ2A 5TOZA 4ASXA 2H96A 2XK3A 2YDJA 3M11A 1WFCA 4FTQA 4NJDA 3ZEPA 2CKEA 5CXZA 2G01A 1M2RA 5FWKK 1ATPE 4AX8A 3LJ2A 3D5UA 3PRFA 2XF0A 3QX4A 4KBCA 3R9DA 3O71A 4ZTLA 3TV7A 4AA5A 4V0GA 2ZJWA 3F5UA 4YURA 4O0RA 3A8WA 1F0QA 3CPCA 5B2LA 3FKOA 5L2IA 3M2WA 5M56A 5JK3A 2UVYA 4ZS0A 4U41A 3EYGA 4DG2E 1GY3A 2C6KA 5C1QB 3DDPA 4BGHA 3HMPA 1UU9A 2YHVA 3SDJA 3D0EA 3A61A 3GBZA 2XNOA 3ZC5A 4E6CA 3QQUA 3BU6A 2YCQA 2Z60A 4XUFA 3KGAA 4DEBA 1IR3A 3ZO1A 4FKVA 4M69A 1KWPA 2WMXA 4XP0A 3SQQA 2A1AB 4NZWB 2W1FA 3MVLA 4BZDA 5CAQA 3R2BA 5HCXA 4EYMA 3FZTA 4IAYA 4XV9A 3TNIA 3HL7A 5E90A 4LGDA 4ZSAA 3OWLA 2VRXA 4EOJA 3COIA 1VEBA 4D2VA 3KQ7A 4F99A 3WZUA 1NVSA 5E8ZA 4EOPA 2H34A 2HZIA 5A9UA 4PL3A 3FY2A 2VTNA 4CMOA 4Z16A 4ZLZA 1Y8GA 3E5AA 2ZV8A 4ZTNA 4IWQA 2C68A 2PVFA 3BU3A 5A4EA 1PW2A 5KUPA 3DPKA 2JDRA 3A7GA 1IEPA 4FX3A 4UWYA 4YJUA 5HG5A 3F3TA 4OBQA 4F4PA 5IZFA 5E92A 2XUUA 4YZ9A 4R3RA 4OTGA 3QQGA 3LCDA 3Q32A 5E1EA 4F1OA 4WUNA 3JYAA 4YTHA 5DLSA 4CQGA 2HOGA 4FYNA 4YJOA 4G16A 4C2VA 3R1NA 5J95A 2BPMA 3I7BA 4EOKA 4TL0A 3SKCA 4RC4A 3AG9A 2X7FA 4AW2A 1HCKA 1OIRA 2Y6OA 3DKGA 4C35A 4F1MA 5CU6A 4YGAA 4DFXE 2YACA 3UGCA 4ACHA 5KBQA 1R3CA 2ZM4A 3HMIA 5J1VA 1G3NA 4FSQA 3RPVA 2OH0E 5CT7A 5DRDA 1OIUA 3KL8A 1KE9A 1BX6A 5CEKA 3VW8A 1YXXA 3O8UA 2B55A 2JDOA 2YM5A 1WVXA 3HV4A 1L3RE 3QCYA 5CF4A 2ITZA 1FMOE 2XMYA 2BUJA 2X8DA 3VUTA 3EB0A 3HRFA 2Y6MA 1ZMUA 4FMQA 2GSFA 4QMWA 3R1SA 5BVDA 5M4IA 2BDFA 3AOXA 4UWCA 4GJ3A 1XH5A 2YFXA 3LQ5A 5J5SA 3DK6A 3TUCA 3ENHA 5DWRA 4F9YA 4D0XA 2XCKA 4KINA 1H27A 4M13A 4ASDA 3P1AA 3QWJA 5L6PA 4RIYA 5EKNA 2WELA 5CVGA 5EYMA 4EBWA 4LL0A 3TUDA 2P4IA 4FEQA 5M4CA 3L8PA 3PPJA 4QYGA 2OJJA 3L9NA 4TYIA 3QALE 4LRJA 3F2AA 3CP9A 1WBSA 4LOPA 3KEXA 3BHHA 4AUAA 5KCVA 3UDBA 3V3VA 3IGGA 4FTLA 4JRNA 4OUCA 3NNVA 3QTSA 4FICA 4BHZA 4C58A 4JOAA 3OROA 4ID7A 2VZ6A 4FA2A 4O21A 5IA4A 3PTGA 1RDQE 5AP3A 2FYSA 4GV1A 2GCDA 4BDGA 2O3PA 5J8IA 1YQJA 3R7YA 1WVWA 4V05A 1XJDA 4L45A 4FSWA 2I40A 5ICPA 2V55A 1Q4LA 2XK4A 3IDPA 2B1PA 4M15A 3K5UA 4IEBA 4ALUA 3NEWA 4ZSLA 3LHJA 4MXCA 3SC1A 3OTUA 5CWZA 4ZZMA 4KD1A 3VRZA 4BHNA 3LFSA 2R3GA 5GJDA 1LR4A 3MA3A 2RSVA 3G9LX 4R3CA 4UV0A 4EYJA 4D9TA 3ROYA 1AQ1A 2XIXA 3Q04A 4OTQA 2Q0NA 2P0CA 3DBDA 1KSWA 4MF1A 2WQOA 4QMYA 1ZWSA 5CVHA 3H9RA 3VUDA 5IISA 4O91A 4AN9A 5A4CA 5ANOA 4FTMA 5HTCA 4UB7A 4FSUA 2X81A 3SXRA 1M14A 3BPRA 5BVOA 4I0SA 5DIAA 3NW6A 3QWKA 1PMNA 4QTAA 4WNKA 3VS0A 1JWHA 3II5A 4BIBA 5E8TA 5JGBA 1YI3A 4EHZA 4FL3A 2QVSE 4H1JA 3GCUA 4D2SA 5AIRA 1YHVA 3G51A 4RVTA 4C4FA 3ZZEA 1ZOGA 4F64A 3R8ZA 4WNOA 2X6EA 2WOUA 4FV2A 2PL0A 3FL5A 4FSZA 2ZAZA 3QKMA 4PWNA 4RJ8A 5DT4A 4WUAA 4U80A 4PP7A 3SRVA 4G3CA 4IQ6A 2BAJA 5C9CA 2XYUA 5CU0A 5AX9A 3ZLSA 5IF1A 3V01A 5BMMA 2XJ0A 3TTIA 2QOHA 1YRPA 5CU3A 4CYJA 3ZO3A 2EXCX 5CAOA 4MNFA 4BL1A 2J7TA 3AD5A 5D41A 5IH6A 2Y9QA 4IX6A 2Q0BA 2O65A 5B2MA 3R73A 4W4XA 3PSDA 5AIKA 4EHGA 3OMVA 4EHEA 2IJMA 2VN9A 3UBDA 2HW7A 3FMHA 3NW5A 1UU7A 1HCLA 4UMPA 5BUJA 3LE6A 4FZ6A 5AJQA 4JDIA 3D9VA 3VS6A 2XBJA 4QMZA 3MJ2A 4FT3A 3ZHPC 4CTCA 2WU7A 5FXSA 2AC3A 4YZBA 3GC8A 4OBPA 3R2YA 3NCGA 4FKJA 4C38A 3S3IA 1BMKA 4ANBA 2C6MA 3D5WA 3KC3A 4IE9A 4XG9A 5JH6A 2F9GA 4GK2A 2JAMA 4YZCA 1RQQA 1XO2B 2BZKB 3HMMA 3PZHA 5DPVA 5HZNA 4CV8A 4MXXA 5A54A 4F9CA 3RCDA 1V0BA 3E8NA 3FC1X 4IZAA 4MVFA 4X7QA 2OK1A 5L3AA 2RFEA 3GENA 3HP2A 4QRCA 2BRMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2EXEA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations