2EXE | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	282
structure length	262
Chain Sequence	ARLEINVLKKIKEKFLCVLMSDAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of the phosphorylated CLK3 rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Dual specificity protein kinase CLK3
total genus	79
structure length	262
sequence length	282
ec nomenclature	ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date	2005-11-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	2exeA00

4EH3A 4D5KA 3FI4A 2HK5A 5CENA 3I4BA 2J0MB 4O22A 2WTDA 3FJQE 4WOVA 1DI9A 2ZV7A 5E8TA 4A9TA 3AC3A 4IB3A 4GJ2A 3H3CA 4IWQA 4WUNA 2B52A 2PTKA 4F65A 2B9FA 2UV2A 3KU2A 3QCXA 1MUOA 5L8LA 3G5DA 4W4VA 2QO9A 1YXSA 2VTLA 5EM7A 4FT7A 5HICA 2XF0A 5L8KA 3F2NA 1Q3DA 3CQUA 1H26A 3WF8A 1WBTA 2QO2A 2ETRA 2VU3A 2OXDA 2BHHA 4IANA 3UP7A 3R2YA 4D28A 5KKRC 2WTKC 3TZ7A 3QUDA 1LUFA 1YXXA 3FL5A 3GCQA 3MVJA 3PUPA 4FKLA 4L6QA 5KMJA 4AT3A 1Q5KA 3C0IA 2JIVA 3QCYA 1IG1A 4FV6A 2IVSA 3EMGA 4KKGA 5CU6A 3THBA 3QQHA 3V5JA 2ZM3A 3LCOA 4QPAA 3AXWA 3W1FA 5CANA 2C5XA 2O64A 3F9NA 2WGJA 4FOCA 5DGZA 3DFAA 5FGKA 3A8XA 4CT1A 4EK3A 3TZMA 3RPRA 2QU5A 3RWPA 4F6SA 1R39A 4JBPA 4JQ7A 4AQCA 3OP5A 5J9LA 5F94A 1BI7A 3EN5A 1UU3A 3H10A 3FQEA 3KY2A 3UNZA 4U45A 4OTGA 4AZFA 4HYHA 4QQCA 3OXZA 4BDCA 4EONA 5HTCA 3UOJA 4PPCA 5IEVA 3E8EA 3OCBA 4KIPA 2XK7A 5IMXA 1M52A 5CAQA 5LMAA 5JFXA 2DWBA 5JMSA 4EOIA 3SA0A 4RBLA 5AJQA 2ONLC 1WMKA 3UO6A 5KX8A 5EOLA 5EG3A 4RRVA 5JFWA 3UQGA 3LE6A 4K1BA 4DITA 3CQEA 3LIJA 4BN1A 4QQ5A 2WOTA 3BBWA 4IX6A 5JRSA 4X2FA 4E6QA 4FV0A 2OICA 5HG7A 5E8YA 5CF6A 1KE6A 3AMYA 1JKLA 2BFXA 5KNJA 2YAKA 3WF9A 2PVKA 2VGPA 4PQNA 2J50A 2C30A 1URWA 4Y85A 5CT0A 3BLHA 4FSYA 1PJKA 1YOJA 2QG5A 3F5PA 4I6HA 4RZWA 1FOTA 5AV1A 1VYZA 2W17A 4Y8DA 2REIA 4I41A 4IAYA 5KMNA 2CGVA 5HVJA 1XBBA 3CY3A 1ZYDA 5JRQA 3COIA 4MKCA 4G3FA 5CT7A 5EI8A 1PXLA 4F7LA 1GOLA 3HMIA 3VAPA 4BCGA 2QOKA 1UWHA 2BROA 3KB7A 4LOQA 3GENA 3U8WA 4WG3A 3WF7A 4OUCA 2B7AA 5BVKA 5IH5A 4ENYA 3SAYA 2X9FA 3Q4CA 4XCUA 5M4IA 5JZNA 4FK6A 1OB3A 3NRMA 5CWZA 5AP0A 1TKIA 4RIWA 3TUBA 3CKWA 3V01A 5J9YA 4GVAA 4I4FA 4WBBB 5K0XA 3GBZA 4DG2E 2ZV9A 3ALNA 5L2QA 4CSVA 3C4EA 4D4YA 5DH3A 1DAWA 2PE0A 4QMZA 4AGWA 2WU6A 3CD8A 3PA5A 4FBXA 2W4KA 3TNQB 1H1SA 4Z16A 4W4WA 3RZBA 1Y8YA 2XNMA 3W16A 3W2CA 2JDOA 5K5XA 4AN9A 5LARA 4YLJA 1L3RE 3HUBA 1MRUA 4QNYA 4TXCA 3PVGA 3ZXTA 2Z7QA 3TN8A 4I23A 5LMKA 4EBVA 3ORTA 4OT6A 4IQ6A 1IASA 2VTMA 1R0EA 3VS1A 3BLQA 3C7QA 2JKMA 2HZIA 4XOYA 4E5WA 3F3WA 3QD0A 3QGWA 4GK4A 2J51A 3O7LD 5BVDA 3I60A 3PE1A 4MBJA 3WOWA 4QO9A 3FZ1A 4K2RA 2XNNA 3WIKA 3VUDA 4R3PA 1Y57A 2XK4A 1KWPA 5IA2A 2QI8A 3NYOA 4HGTA 1URCA 3KXXA 5I0BA 4X3JA 3NSZA 3M2WA 4EL9A 4JBQA 5DNRA 4QYYA 4Y5HA 4N70A 5J79A 4OBOA 2R3NA 4JX7A 2XJ1A 5GZ9A 4AT5A 1WAKA 2VWIA 2PVHA 3LFNA 5EI6A 3RCDA 3SRVA 3ORXA 5M44A 3QQFA 5D1JA 3A7FA 3G9LX 5AM7A 2W5AA 4EK4A 1W0XC 2YDKA 4CRLA 5E7RA 3D15A 4U97A 5EW9A 4F09A 4UN0C 3DNDA 2C6OA 5A6OA 4KRCA 3GUBA 3LFCA 3FYJX 4G16A 3C13A 4GT3A 1XBAA 4NZWB 4YJVA 3ORNA 4ZS0A 3PSCA 4V04A 3CJFA 4PP9A 4EWQA 2C6TA 4IC7A 3LXLA 3U6JA 3EQGA 4CKRA 2UVZA 4Y95A 2QKRA 2WOUA 2V7AA 1Q97A 3HECA 4D1ZA 3FHRA 3DAJA 3MVLA 5KO1A 5TT7A 3UODA 5AX9A 2FB8A 3KN5A 5HESA 3PVUA 4AE9A 4TY1A 3ZCLA 4YR8A 3LCSA 4W8DA 3OW3A 1KE8A 1OI9A 3L8VA 4KWPA 4ACGA 3FAAA 3NUYA 3HV4A 2FH9A 4HZSA 4DEHA 4QTDA 2C47A 5HORA 4J7BA 4L7FA 3D5XA 1J91A 3R8ZA 4L01A 5I9VA 3GP0A 4LV5A 3D0EA 4FICA 2JAVA 4WHZA 2J4ZA 3FI3A 3DBDA 4FOBA 1NVQA 4EYJA 4FIEA 4S33A 2XCHA 4MXXA 4BYIA 4U0IA 2QOHA 4HVHA 2PMLX 4BCHA 4CFUA 5C03A 4JS8A 4C4JA 1Z5MA 4NM0A 4RWIA 4BZOA 3C4XA 3SXFA 5M56A 4RVKA 3LM5A 3KEXA 2C3JA 3QTQA 4FKRA 4YZCA 2QKWB 4LMNA 5CVGA 3OROA 3ZLWA 1QMZA 5FM2A 3ULZA 5ANEA 4UMUA 5I9XA 2UZUE 5CI7A 5I3RA 4NWMA 3CJGA 4DLIA 5HO7A 2X7OA 3MDYA 1SVEA 5ETAA 4J96A 3VBQA 3VW8A 4GIIA 4L00A 4QTAA 3SX9A 4BDFA 2GFCA 2HZ0A 3BHVA 1Q61A 4EI4A 2W06A 3MFRA 3HRFA 2YIYA 3KK9A 3HUCA 3R7EA 2OBJA 4MBIA 4MD7E 4UWYA 2R7IA 3WF5A 5C8KA 2X2MA 1DM2A 4C62A 2C6KA 3OBJA 1SNXA 4JDKA 5CU2A 4H3BA 5HG8A 4DH3A 4D58A 2XCKA 2IZUA 2PZYA 3GT8A 5E1EA 4GVJA 4RA5A 3DKGA 3ORPA 4S2ZA 4I4EA 3VIDA 3P7AA 3QKMA 4U9AA 4H58A 1DS5A 3NS9A 4MXCA 4O2PA 5EDQA 1P2AA 4BKJA 3NAYA 3PJCA 1SZMA 2ZB0A 1U5RA 3DOGA 1ZXEA 3ERKA 3KRRA 4ANQA 3MPTA 2VO0A 2EWAA 2E9PA 4J8MA 4ARKA 5DI1A 3FKOA 4EYMA 4KSQA 2UW8A 1E9HA 4FTIA 3C1XA 3QQGA 2NO3A 4GIHA 1H07A 2EVAA 4C0TA 2HELA 4C37A 4EOQA 4RJ8A 3AGLA 3COMA 5CAPA 3A60A 1WZYA 2X6DA 3GU7A 1XH5A 3ZFYA 4OW8A 3P4KA 2VTTA 4L3JA 4K11A 2F57A 3WILA 4C4EA 4I5MA 1H08A 4WA9A 3EFWA 3CTHA 2Y4IC 1UVRA 2JKOA 2UZTA 4WKQA 2W1CA 2GFSA 3ZHPC 5KHXA 5IEXA 2XKCA 3SVVA 3GEQA 4OTWA 4YPDA 5GZAA 5I5ZA 4XMOA 4BBEA 2YJSA 1K2PA 1HOWA 2O8YA 3QAME 4EC9A 4NFMA 4QRCA 1PY5A 1H1RA 3B2WA 4WNPA 4YC3A 3RPVA 3H9FA 4BDBA 3ZRMA 4BF2A 5CXZA 2RSVA 5AM6A 2WAJA 3RHXA 2GS7A 1WVXA 2A2AA 3FMKA 3HP5A 4AXAA 2GNJA 2VWZA 3O8UA 3HP2A 4GMYA 2Y6MA 4IWPA 3IW5A 1UU7A 4LOPA 4PL3A 5AUZA 4AFEA 3QD2B 2WO6A 5AAEA 3W55A 3EKNA 3P7BA 4FEQA 3ZFMA 3RM7A 2C5VA 4YGAA 2WHBA 3TKIA 1IR3A 5LQFA 4C58A 4EH4A 2GSFA 1ZZLA 4JOAA 2UZNA 4WUAA 5K9IA 1B6CB 1ZMVA 2VAGA 3Q6WA 4G1WA 4NUSA 4BCQA 4CT2A 3K3IA 5FEDA 3R9HA 1GNGA 1XKKA 5AAFA 3RAWA 3TKHA 3DTWA 5A4EA 4EQCA 4N0SA 4B8LA 2F9GA 2WZJA 5CZIA 3ZMMA 3NR9A 4YZBA 4YBKA 1BKXA 3WZKA 4CKIA 1W82A 2ERZE 2XK3A 3QTIA 4WG5A 4XV2A 2OW3A 4RWLA 5JGDA 4J99A 5I9UA 4AU8A 3ODZX 4BTJA 4XLVA 1Q41A 4FYNA 3FYKX 4O6LA 4P4CA 3VS6A 3O17A 1UKIA 3H9OA 3P78A 2FYSA 3VRYA 5C8NA 2OXXA 3U4UA 2VWYA 1E1XA 4FV4A 3N51A 3SKCA 3UVQA 4QMNA 5AP4A 4AFJA 3OUKA 2YLFA 3NNUA 3BE2A 5CU3A 4D2WA 1OUKA 4YSMA 2RFNA 1PMVA 3BPRA 3OTVA 2AYPA 3EN9A 4O6EA 4DINA 3RTPA 4WBOA 4FV8A 2OJ9A 5HO8A 3NPCA 3WYXA 2B54A 3O50A 5HD4A 2BZJA 3W32A 2HYYA 3WIGA 4F7JA 3Q96A 2X1NA 4DH8A 1MQ4A 5JQ5A 1JKTA 4A4XA 3PY3A 5EYDA 4X2GA 5K3YA 2XYNA 4Q5EA 1VJYA 1BUHA 3E3BX 4IJPA 1MRYA 5BPYA 2E9UA 2ZMCA 4YTIA 4U44A 2JKQA 3KF7A 5HZNA 5DR6A 4R5SA 2GQGA 1ZMUA 4TWOA 3F3VA 4I24A 2IVVA 3PPKA 4OTHA 4PV0A 4A06A 4ACMA 3QRTA 3LJ2A 5IUHA 3R1NA 3QU0A 4GH2A 3SLSA 4C33A 4W4YA 3RKBA 4H1JA 1TQPA 5K4JA 4ANOA 4D1SA 3GFEA 1SMHA 2DQ7X 4FTQA 5KCVA 2HIWA 3LM0A 1M2QA 4HCUA 4B9DA 3KMWA 4I92A 4P2KA 2B55A 2ACXA 4F1TA 1YI6A 2XIRA 3C5UA 4DHFA 3R9OA 2UZEA 1Q3WA 3BX5A 3P23A 2WTWA 3O23A 4U43A 2VRXA 4M13A 3TNIA 1E1VA 3MH1A 3TACA 4O1PA 3CC6A 2A0CX 3EZRA 3KFAA 2O2UA 2X8EA 4FKTA 4JRVA 3EQPA 3UNJA 3VVHA 2VTJA 2XZSA 4U41A 5JH6A 3G90X 5EFQA 2IW9A 2QOFA 1JNKA 2YERA 2YN8A 5KMIA 2IZTA 4KIKA 1YDTE 2JFLA 4AN3A 2QOBA 4XOZA 5EHYA 5CEQA 5HE1A 4CVAA 4HJOA 1OUYA 4JQ8A 4V01A 5AR4A 4YJPA 4F70A 4C3PA 2QOQA 2Q0BA 4RX9A 5IH4A 4GFGA 2WU7A 4R3RA 5JSMA 4X0MA 4GFOA 4UXLA 4IVCA 4BCIA 3CPCA 4LL0A 4M14A 3DB6A 3IKAA 4UV0A 4XEYA 5LVOA 3GXLA 3GU6A 3RAHA 3MFUA 3T9TA 4DFXE 3V5TA 5L6OA 2PUUA 2J5EA 2UZBA 3E8DA 3NUXA 4OBPA 3VS4A 2GHMA 5IKWA 4MD9E 4JG6A 5A6NA 4CCUA 2WXVA 1WVYA 4QYFA 1KV2A 4F9WA 3R6XA 5ETIA 4O21A 3PVBA 4EJNA 3VHKA 4ANSA 4YPSA 2ITWA 2P33A 3FV8A 5FG8A 1JLUE 2WEVA 1UKHA 2HAKA 4FV2A 4P90A 2VO3A 4BI0A 3R30A 5D7VA 1XH8A 4I20A 4M97A 4RQKA 4WSYA 3S00A 2YLEA 4JDHA 4BWXA 3FMEA 4F0IA 4FL1A 4QP3A 2ZDUA 1CKJA 4GG7A 3SXSA 3P9JA 3ZO1A 4CZUA 3R0TA 1GIJA 4FF8A 4KRDA 4DTKA 2YCSA 3R73A 5H2UA 4ZSEA 4RC3A 3EQDA 4CMOA 3VC4A 2G15A 3EWHA 5IU2A 5C01A 2CGWA 3I5ZA 3JY0A 3CPBA 4N6YA 4XP3A 4A9YA 3HLLA 4ZSGA 2C5YA 4XJ0A 2P55A 5HCXA 4U81A 4TWCA 1CKPA 4BDKA 4L45A 2BAJA 3PYYA 2P2HA 4ZTLA 5L6WL 4PL5A 4YJUA 3WBLA 3AT4A 3C4WA 4ASZA 4X3FB 4AA0A 3D9VA 1JSUA 4HW7A 3KXMA 1SYKA 5DPVA 3V8TA 5L2TA 4Q9SA 2GTMA 2F7XE 2UVXA 3R7UA 3R9DA 5IA1A 2BZKB 2IZRA 3OCTA 3PJ8A 3FXXA 4EZ7A 5LJJA 2W05A 3QQJA 1SM2A 3G51A 3VN9A 4D2SA 2QU6A 4GYGA 5LVNA 1M2PA 4E26A 5AUYA 4G6OA 4UYAA 1Y91A 2R0IA 3UZPA 3RK9A 1PMNA 1YDRE 3OWKA 3FBVA 4BCJA 4TYGA 1GAGA 2OZAA 3A7JA 3H30A 4DGOA 3MFSA 2WQNA 5H8BA 5HGIA 2XNEA 3R8UA 2Z60A 4ZSLA 1ATPE 3JS2A 4HCTA 3OY1A 4CYIA 5JKGA 4FSTA 4AACA 4KS8A 2PE1A 3EJ1A 4RJ7A 3RHKA 4UZDA 5M53A 4EHEA 3I0QA 5EOBA 5DBXA 4RIXA 4DFYA 3F5XA 1Q62A 3BKBA 2OXYA 3UG1A 2J0LA 5FDXA 3MI9A 3GFWA 3MW1A 4M0ZA 2BKZA 2BRBA 4QTCA 3VS3A 1YRPA 2CSNA 2WMWA 5CU0A 3TKUA 3ROYA 5JZJA 5KUPA 4GK2A 1OL7A 3K3JA 5BVWA 4YC6A 3IGGA 3TCPA 4NTSA 3O71A 4D0XA 1PYEA 3R8MA 5BUIA 4TRLA 2YIRA 5E8XA 3B2TA 4DLJA 3LCKA 2QOCA 4FG9A 4HPTE 1YI4A 4IM3A 4RVTA 4BZDA 4TPTA 3JVRA 3QRKA 1JQHA 3EFLA 3QTWA 4CFWA 5HNIX 4D2PA 1JPAA 4WO5A 4F08A 4FI1A 2XIYA 4FZDB 5A4QA 4NJ3A 4IAAA 3VS7A 3GNIB 4MNEB 4C3RA 2YCFA 4PMSA 3BYVA 2CLQA 5J95A 3NCGA 4QD6A 4DFNA 5EKNA 3FMLA 4IACA 4YZMA 5FTQA 5G6VA 3TZ9A 3JUHA 3A62A 3BHTA 2WD1A 4HVSA 4P5QA 2B1PA 5AAGA 4CD0A 4YJTA 2XUUA 1PMUA 4O96A 5ETCA 4R7HA 2J0IA 2QR7A 2VWVA 2WIHA 3D94A 3QHWA 2XRUA 4QP7A 4TN6A 3QXOA 3V8SA 4QP2A 4CTCA 1OL5A 4D0WA 4BTFA 4I0TA 2CGUA 3ENHA 4FV1A 3PE2A 3E3PA 4EOSA 4M3QA 4L46A 3BHYA 3F6XA 3GU5A 4H3PA 4G3DA 5AADA 5ANDA 5M4FA 3QQUA 1STCE 5J7HA 2XYUA 3TIZA 2WTIA 2VTSA 4NCTA 3TV4A 2JAMA 2XEZA 2YFXA 4I22A 3TJDA 3C51A 3VW6A 3LPBA 2XJ2A 4Q2AA 4BDHA 3HDMA 4KIOA 5GHVA 3FPQA 4RPVA 4IWDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2EXEA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations