2IF8A

Crystal structure of inositol phosphate multikinase ipk2 in complex with adp and mn2+ from s. cerevisiae
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
332
structure length
255
Chain Sequence
GLLIFKPAFPQELEFYKAIQGDAPLCSWMPTYLGVLNESKQYLVLENLLYGFSKPNILDIKLGKTLYDSKASLEKRERMKRVSETTTSGSLGFRICGMKIQKNPSVLNQLSLEYYEEEADSDYIFINKLYGRSRTDQNVSDAIELYFNNPHLSDARKHQLKKTFLKRLQLFYNTMLEEEVRMISSSLLFIYEGDPERWELLNDVDKLMRDDFIDSLSSMSLIDFAHSEITPGKGYDENVIEGVETLLDIFMKFLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of inositol phosphate multikinase 2 and implications for substrate specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inositol polyphosphate multikinase
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 87
structure length 255
sequence length 332
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.151: Inositol-polyphosphate multikinase.
pdb deposition date 2006-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2if8A00
4O4DA 2IF8A 1TZDA 2A98A 4O4EA 2AQXA 4FRFA 1W2FA 4O4CA 4O4FA 1W2CA 1W2DA 2IEWA 4O4BB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M11A 3R1QA 4ZTQA 5M57A 4WT6A 3W2SA 1VYWA 1OL1A 2F7XE 2W9ZB 3EHAA 2RF9A 4FKUA 4EH6A 3MJ1A 4RPVA 4HVHA 5L6OA 1A06A 3WIGA 3P79A 1ZAOA 3V6RA 5A6OA 1UKIA 4IAYA 3PZHA 3TV7A 1PMEA 2BDJA 4IAKA 3PVGA 4EL9A 3KN5A 4EZ7A 2GHMA 2CJMA 2BZIB 2JAMA 4JJRA 3UVQA 3QTRA 4ZOGA 3DDQA 4L00A 4IE9A 2VO3A 5DE2A 3P9JA 2WKMA 2ONLA 2OK1A 2HOGA 2C3KA 3BELA 4FZ7A 4ZAUA 3LCTA 1WVWA 2YLFA 4FV0A 4AW2A 2AQXA 3GC9A 4MQ1A 3RCDA 4M97A 5CQWA 3GC0A 4GT4A 2YEXA 4EC8A 2OW3A 4ALWA 3UOHA 4DH7A 4GIHA 4EZ5A 1Q8YA 3ENHA 2ITWA 4NT4A 5F95A 3WF7A 3SA0A 2O8YA 2X7GA 3T9IA 4CSVA 1NA7A 3KULB 3V8WA 3FXZA 3OWLA 1WBSA 2JC6A 5F94A 4L67A 3ZZWA 1OKZA 4JDJA 2ACXA 1REJA 2WTJA 3OTUA 1OL6A 4KIKB 1JSVA 3LZBA 1YDRE 4MHAA 4FNZA 3S2PA 1QPCA 2IW6A 1KE7A 2QR7A 3C4ZA 4NJDA 3VQUA 4LYNA 2E9NA 4E6CA 5HKMA 3PA4A 3HNGA 5FEEA 1BLXA 5J8IA 1NXKA 2BTRA 2J0LA 5EM6A 4YBJA 4MK0A 4MWHA 2WMAA 4Y72A 4RZWA 2J2IB 1BX6A 2XIKA 4IEBA 2J0JA 4USDA 1Y8GA 2JITA 1QPEA 3BU3A 2C0OA 3FMKA 2OFUA 5HTBA 3PUPA 4XUFA 4I94A 3ZC5A 5AUXA 1LEWA 3QGWA 1J3HA 3ET7A 4JAJA 3ZTXA 5I3RA 4RJ6A 3L8SA 4F64A 5IEXA 2Y0AA 3GOPA 4QYHA 3R9NA 5HIEA 4WA9A 2RG5A 4A9TA 1BL7A 3PVUA 3QZFA 2VWUA 3QQJA 4JBPA 4Q9ZA 5F1ZA 1HCLA 5EYKA 3H10A 4B4LA 4PY1A 5LVOA 1K2PA 3ZXZA 3GBZA 3PLSA 1HCKA 4BIBA 4NIFA 3NNXA 5HBJA 1PJKA 2WIHA 1IA8A 2YJRA 4OT5A 4C3FA 5AA9A 3D5XA 1OL5A 3HUCA 4IANA 4CRLA 4MXYA 5A9UA 1S9IA 2WU6A 4I4EA 4F0GA 3QFVA 5DNRA 4MNEB 2OXDA 2J7TA 3PXYA 4E6QA 4IJ9A 3F3WA 3MFRA 3S0OA 4JVGA 2H96A 5BYZA 4U81A 2QHMA 4LMUA 3UYTA 4FTMA 3KK9A 5DRDA 4UWBA 1FVTA 1STCE 5HVYA 2YIQA 3WZJA 4FSWA 4L43A 4CKIA 2C5XA 3QF9A 3HZTA 4YJRA 1PKGA 3GNIB 2GSFA 3LCSA 5BMMA 3AMAA 5BUEA 5EI8A 3GCPA 4FTTA 3UPZA 2PZ5A 2BAKA 2XCKA 4DH3A 3PZEA 5AEPA 4RVMA 2AC5A 4LI5A 4ZTRA 3BYVA 4ZZNA 4CVAA 4QTBA 2PMOX 5EDPA 3GU6A 2VTJA 3PTGA 2IVUA 4ZJJA 2C4GA 1M52A 5BVDA 4HPUE 3BQCA 4B8LA 5C1QB 5JGDA 4EJNA 4H36A 3LHJA 2QI8A 2PVFA 3HV5A 4E73A 2VAGA 2ZMCA 1KWPA 3ZUUA 4EH4A 3NLBA 4W8EA 4U8ZA 2OFVA 1JQHA 4BCOA 3COHA 4C2VA 4WUNA 2XZSA 1P4OA 2F7EE 3KXZA 3EFKA 1JPAA 5L8JA 4YP8A 3OC1A 4I1ZA 5J95A 4L52A 4O0WA 5DR9A 4UX9A 2R2PA 3QHRA 4QP8A 4RJ7A 3RAHA 4XCUA 4ACHA 3OROA 3O8TA 4YTFA 1ZLTA 4APCA 2WMQA 4EH9A 4F0IA 4XEYA 2WMRA 4B8MA 2CGVA 3LQ5A 5HCZA 2PVKA 5CNNA 4KA3A 2OU7A 2Z7LA 4FKOA 4K2RA 3ZBFA 2UVZA 4K6ZA 3LCOA 3BV2A 4LGGA 3BE9A 4F09A 2FO0A 4EC9A 2UZBA 3VBQA 1EH4A 2OF4A 3HA8A 1Q97A 1OVEA 2XNPA 3ELJA 2VGOA 2GFCA 4MXCA 3QHWA 4MXXA 4JQEA 4P5QA 3QALE 5LCKA 3VAPA 4Y83A 4E4NA 3GCVA 5GHVA 3BYUA 1UVRA 3OY3A 4UZHA 4MXZA 3MYGA 3LXPA 4M14A 4WUAA 2C6OA 2V55A 1U4DA 3F61A 3F9NA 3H30A 3A8WA 5AM7A 3MTLA 3I5ZA 4LRKA 4TYGA 2CPKE 5EK7A 3KMWA 1QPDA 3QCXA 4E20A 1V0OA 4OGRA 3LFDA 3Q04A 3VHEA 1GOLA 2F2CB 1TQIA 2X0GA 3AC3A 4OTPA 3OXIA 3QYWA 3UNJA 1YHVA 4HW7A 5CEQA 3QQUA 4LFIA 4E6AA 4QPAA 4M8TA 5AUZA 3KCFA 5CQUA 3FMLA 1U5QA 3FHIA 2WEIA 4KIOA 3G0FA 3HMNA 3C0GA 2P2HA 3A4OX 4RWIA 1H1PA 4G31A 2WNTA 1F0QA 5KZ0A 4ERWA 2DWBA 5J1VA 2YABA 3LW0A 4BBMA 2BIKB 2OIBA 4E5AX 4C37A 2IN6A 4IW0A 4Q9SA 3DBEA 3SKCA 4X2FA 3UNZA 5HQ0A 3RAWA 2B54A 3LLTA 2XK8A 3M2WA 2B9JA 3RPVA 5DLSA 3Q2MA 5CAPA 2VWYA 3FL4A 4XJ0A 3DNDA 4X3FB 5E8WA 1H0VA 4FTAA 3MY5A 2VWVA 3KQ7A 2XJ0A 3UQGA 3MH3A 5HIDA 1QMZA 4EQCA 3B2TA 3RK7A 4D1SA 4NU1A 4EWHA 5B2MA 3GCUA 4JBVA 3ZO4A 2WTCA 4N0SA 1W82A 4ZSJA 5CF5A 1ZRZA 2J51A 4O0XA 1YI3A 4HVSA 1WCCA 4TYEA 4UALA 2ZM1A 3QRTA 2OG8A 3BU6A 4BDHA 3RAKA 5JGBA 2WTDA 3ORKA 1SYKA 3VW8A 3S1HA 2J0MB 1Y91A 3LM0A 4RIXA 4EKKA 4FA2A 3BHYA 5GZAA 3WZUA 2GNGA 3AMYA 3R7EA 2PVLA 3CBLA 3EQGA 4FC0A 2WTKB 3E8CA 4O0YA 4U7ZA 3VVHA 1PF8A 4ANOA 4ZEGA 3R2BA 5FBOA 4YURA 4X3FC 3ZLWA 4H1JA 5AJQA 1PXIA 4AW5A 5AAGA 3UQFA 3EKNA 4H3PA 3KF7A 1Q62A 2W4OA 2YWPA 5CSXA 4MKCA 5EI6A 4KKGA 3ZEPA 3ZHPC 1E9HA 4O0UA 5A4CA 5ANJA 3UP2A 5CI6A 3VF8A 3O71A 2ITTA 4BCNA 2GS6A 2PMNX 3C9WA 4QP3A 4TT7A 3AC5A 3MVMA 1ZYDA 2QOIA 2VX3A 3FLWA 4IAAA 4TNDA 3FSFA 2DQ7X 3EJ1A 3FHRA 4NCTC 3GCSA 3LCDA 3UJGA 3VS7A 5CZIA 3R02A 4C7TA 3CLYA 4DAWA 1H27A 5D11A 2Z7RA 3E8NA 3I7CA 2P55A 3UPXA 4EOKA 3JY9A 3MDYA 3MFTA 2X7OA 4AT5A 2WTKC 3EOCA 2GCDA 1ZYSA 5IMXA 4RZVA 2B1PA 3ORMA 3TJCA 4QP9A 4YHJA 4OBQA 1PXJA 3EQPA 1W84A 4DEGA 3HL7A 3ZS5A 5K9IA 4N6ZA 4XV2A 1ZZLA 4P5ZA 3V5WA 2VX1A 1H28A 4I41A 3ZRKA 3E88A 1UNGA 3DJ5A 3BLQA 3G6GA 2O0UA 5E8VA 4AOTA 3C5UA 4FG9A 4TWNA 5L6PA 1VR2A 4JIAA 4QQTA 2VUWA 3II5A 3OFMA 4D1ZA 4XV1A 1PXPA 2QOKA 3U8WA 3ERKA 2O3PA 2XNGA 5HICA 4RIOA 3S3IA 4ALUA 5JFXA 2UZNA 4QP4A 5D1JA 3WYYA 2H34A 2J0KA 4ALVA 3PXFA 4FSQA 4S30A 3SAYA 1DAWA 3QCQA 4M0ZA 4QTAA 1OM1A 3EIDA 3B8QA 4BDBA 2GHGA 3QA0A 1FPUA 1KE8A 2V22A 5DGZA 3ZFXA 5IA4A 5ANDA 2IO6A 3UOJA 4NW6A 5JSMA 1WVXA 4K11A 4JBOA 1JNKA 2VGPA 4Y5QA 1IASA 2J4ZA 4AU8A 2A0CX 2HXLA 2QQ7A 4F99A 5AX9A 2HY81 4WKQA 3AC8A 4FTJA 4FTUA 3PY0A 2UW9A 4M13A 2F7ZE 3AC1A 3H9OA 3DZOA 4XV3A 5HBHA 3I79A 4PPCA 5EDQA 4C62A 3FYJX 3NAYA 4F6WA 3NYNA 2EXEA 3S95A 1XH7A 1P2AA 2BFYA 2C1AA 3F88A 3QQGA 4HYSA 3ZDUA 3G0EA 2W1ZA 1NVSA 4I6HA 4KRCA 2R3PA 4FK6A 2W17A 4DGNA 3PA3A 3EL7A 2BILB 3FZTA 5HHWA 4FT9A 5E91A 1GIJA 1KSWA 3OEZA 3R8ZA 4ASZA 3K5UA 1R3CA 4HCVA 4IWDA 4RLKA 2WIPA 3ZDIA 1RW8A 3QYZA 4YTHA 4EK3A 1Q8ZA 3WE8A 4YO4A 4CT1A 2YN8A 3QKKA 2YCQA 4G6OA 2VNYA 4IB3A 4IACA 4D4VA 4AT3A 4TYHB 3R83A 3DK3A 1ERKA 4EOQA 1VJYA 4DGGA 2DYLA 3R8PA 1VZOA 4KBCA 4FNYA 4YC3A 3KRLA 2WMSA 1YXTA 3BLHA 5AUYA 4IX5A 4WO5A 3HMOA 3DAJA 1SVEA 3F2AA 4S2ZA 5AAFA 2RFSA 1ZMVA 2QO7A 3O23A 4IXPA 3QQLA 2W1HA 4J8NA 3ZMMA 4AG8A 3QX2A 3Q9YA 1YHSA 3FQEA 2FVDA 2BRHA 3NIZA 4UB7A 2OXXA 2XJ2A 4JG6A 4MBIA 2FUMA 4AGWA 3ZYAA 4U41A 2R9SA 3MN3A 2R3KA 2JBPA 1BYGA 4YJSA 2FGIA 4FKPA 1APME 4BZNA 3EQBA 3QGYA 2V0DA 5L8KA 3RPSA 4IADA 4UWYA 4UMPA 4UXQA 3L9LA 4HYUA 3UP7A 4DINA 3VJOA 2VWBA 4R3RA 5AADA 1XH4A 1PW2A 3VUHA 4EH7A 3I4BA 3UIBA 1Q8UA 3I5NA 4BFMA 4EUUA 5HORA 4O4BB 3KK8A 5D41A 5AV3A 3R28A 1DM2A 4O1OA 3RM6A 2XH5A 2XBAA 3L1SA 4X6RA 3DNEA 1ZMUA 1BUHA 5EM8A 4DFYA 1CKIA 4FL1A 5A14A 2SRCA 3DS6A 4NTTA 4V0GB 4D2VA 4DGMA 3C51A 5EYDA 3DB6A 4YZ9A 5ANEA 3RHKA 2X7FA 3EQFA 2PVRA 3ZH8A 1OGUA 4MTAA 3QLFA 4U79A 2IVVA 2ITQA 2OWBA 1T46A 4AOIA 5BYYA 4D9UA 5EDRA 3QZIA 1ZWSA 4FTCA 4EQMA 3AT2A 2A98A 3G2FA 3RWQA 2BRMA 3UZPA 2VTOA 2G2HA 2PMIA 3G33A 3GQLA 3QQFA 4G3DA 4Y73A 4PF4A 3W2RA 5KNJA 5EOBA 3CCNA 5H2UA 1XBAA 1M2QA 5I3OA 1JKTA 2GS2A 2BTSA 2P3GX 5AR2A 4OUCA 4H39A 1CKPA 3TKHA 3UG1A 3D7TA 2E9PA 3LM5A 4E6DA 3U51A 4RBLA 4AE6A 3HMIA 3DT1A 3B8RA 4KAOA 2X0QA 2HAKA 3FC2A 4K18A 3POZA 3I7BA 3KXHA 4PMMA 3AD5A 3SOAA 4BYJA 2H9VA 4V04A 3GGFA 3IONA 3R7IA 3QC4A 4RFZA 3VQHA 3NNVA 4DG3E 4QD6A 5D12A 5JZNA 4GCJA 4ZLZA 3VUTA 4J98A 3CTJA 4H58A 5GJFA 3KRWA 5CU6A 4D1XA 2R7BA 4YJOA 4DEAA 4QP7A 4F7NA 3LJ0A 1CM8A 5M53A 4YNOA 5HX6A 2ERKA 3GU8A 3P7CA 5A6NA 4RGJA 3WZKA 4OAUC 4BWXA 4BHZA 2WAJA 3V5PA 1ZARA 2A2AA 3DJ6A 3BZ3A 3CIKA 4C3RA 1SNUA 2J6MA 3NYXA 3CC6A 4L6QA 2Y4PA 4J52A 3DBQA 2QOQA 4LV5A 3O2MA 4XG4A 2XK3A 3PP1A 3DY7A 4YC8A 4ZIMA 1ZY5A 3V8TA 1PMVA 5AA8A 2XM8A 4CFXA 4ZY4A 3LVPA 2I0VA 5L2WA 3MB6A 3ZO2A 5KMMA 5JFSA 3FI3A 5HI2A 3ORLA 3VS1A 2OO8X 2QC6A 5CEIA 3TI1A 2VTNA 3Q96A 5FD2A 3NUPA 1Q8WA 1XH8A 3DOGA 1PMNA 3OP5A 3IW8A 4BDDA 3FZ1A 3AG9A 4GFOA 3R00A 5DVRA 4C4FA 4U3ZA 3HX4A 3MSSA 4RQKA 4CZTA 3BEAA 3KN6A 4GIIA 4FX3A 3QZHA 5KO1A 3OCBA 5BQ0A 3TUBA 3CQUA 4XV9A 2UZDA 4DCEA 4JBQA 3QBNA 2YAKA 3QRIA 2CSNA 4O2PA 3SW7A 2VTHA 4ITIA 4HYIA 5IDPA 3P5KA 3DDPA 3QAME 1XJDA 5FP5A 3TL8A 5HU9A 2AUHA 4CQGA 4O2ZA 3V5TA 4E1ZA 1YXVA 4BC6A 4FSTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4O4D A;  2IF8 A;  1TZD A;  2X0P A;  2A98 A;  2X0Q A;  4O4E A;  2AQX A;  4FRF A;  1W2F A;  4O4C A;  4O4F A;  1W2C A;  2X0O A;  1W2D A;  2IEW A;  4O4B B;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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