3R7GA

Crystal structure of spire kind domain in complex with the tail of fmn2
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
195
structure length
154
Chain Sequence
RDALSLEEILRLYNQPINEEQAWAVCYQCCGSLRAAARRRQPRHRVRSAAQIRVWRDGAVTLAPAADQCMETEVIESLGIIIYKALDYGLKENEERELSPPLEQLIDHMANTVEAIRSYRDVMKLCAAHLPTESDAPNHYQAVCRALFAETMEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Spire KIND domain and insights into its interaction with Fmn-family formins
rcsb
molecule keywords Protein spire homolog 1
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 154
sequence length 195
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16474 KIND Kinase non-catalytic C-lobe domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r7gA00
4MBIA 4AA0A 2W5AA 4V05A 4EONA 4QP9A 1YI3A 5IH4A 5KMJA 4AW1A 3RK7A 4GSBA 1M2QA 3NYXA 4OTQA 1CDKA 5DR6A 3V5PA 2OXXA 4HCVA 3POOA 4L01A 5HVJA 4AACA 3FQEA 3BLQA 4QTDA 3T9TA 3UZTA 4M15A 4O1PA 4TXCA 4I92A 3EL7A 1PXJA 2JDTA 4I0RA 4F0GA 3PE1A 4L43A 2XK9A 3MV5A 3NSZA 2UV2A 5JRQA 2YDKA 3F5PA 2REIA 1H07A 3B2TA 3R1QA 4NM0A 1TVOA 4GU9A 5DH3A 3WZUA 3R7IA 2RSVA 4JBOA 3Q4ZA 4ANBA 4EOKA 1H26A 4LL0A 4R8QA 1GY3A 3A7JA 5FEEA 4M12A 3FL5A 3C4FA 4O0TA 4C34A 4GMYA 3KL8A 4Z7GA 4YC8A 4KABA 4YTIA 3KK8A 2WGJA 4NH1A 3RPOA 4G3EA 3DQWA 3QTQA 3THBA 5T68A 4CLIA 3PJ3A 4AGUA 1WBPA 3OZ6A 4TKSA 5CSVA 2YLFA 1JVPP 4BCFA 1RQQA 3BHTA 3OOMA 1OL2A 3MY0A 3NDMA 3VUTA 4FL2A 4U5JA 4Z9LA 1FVTA 5HIEA 1UA2A 3OCBA 4FR4A 1J1BA 3DOGA 4H3PA 4DFNA 4ZSLA 4BKZA 3LCDA 4QTBA 4U80A 3PA3A 2X0GA 4CKRA 3E92A 2R3MA 3P78A 4DEGA 4EYMA 4YJNA 3ZOSA 2O8YA 3QTUA 3QCYA 4IM3A 3H9OA 3VS2A 1W83A 5BVOA 2CGWA 3Q5ZA 3EB0A 3FLWA 2CJMA 2OKRA 3QFVA 4I4EA 2IZSA 3VRZA 4O0UA 2OZAA 4PV0A 3KEXA 5GHVA 5JN2A 5HU3A 1Y8GA 5HE1A 4IM0A 5DT4A 3SKCA 3IKAA 4HW7A 3BQCA 3DU8A 1IASA 4BCGA 4S2ZA 4XX9A 4C57A 5CLPA 4GK3A 3H0ZA 3KB7A 5A4QA 2BTRA 2WAJA 3O51A 2YIQA 4HPTE 2GNGA 2B52A 3GENA 4FSQA 3MH3A 3OY3A 4J98A 3CGOA 4P4CA 4FT7A 4FSTA 4H39A 4XV1A 5HI2A 5HE2A 4C58A 2C6OA 2XNPA 2XKFA 3O96A 1KE6A 2PVFA 1PW2A 4O27B 3QQUA 2YIXA 4ZSGA 3W2CA 4CKIA 3A99A 4UMQA 4BDHA 3AC8A 4UWCA 3S0OA 3VVHA 4X3FA 4ZSEA 4BDDA 3DAKA 2H96A 3V5LA 4WIHA 3K5VA 4QTEA 5HG9A 3TZ7A 4Y72A 4DFLA 3IDBA 4UZHA 4Q5EA 1KOAA 4DGMA 1FMOE 2X8IA 2V22A 1ZZLA 3F61A 4WBBB 4ZTRA 4IX4A 2IN6A 4BDGA 4KS8A 4X7QA 1J91A 2W7XA 5E8XA 4D2VA 4L9IA 1SYKA 2PMIA 4JBVA 3LIJA 4F70A 4FVPA 2UW9A 5AEPA 2UVXA 3C5UA 1NA7A 3NYVA 3R7VA 3RKBA 5A46A 4LGDA 1OUKA 4L3PA 4M84A 4AP7A 4PRJA 4TTHB 1PMNA 2V7OA 5CEQA 4QYEA 3DCVA 2OH4A 2ZV7A 4UALA 5DFPA 4LOOA 3E62A 4EEVA 5L8KA 1Q8ZA 4D1XA 3G5DA 3HGKA 4FKVA 3ZFYA 3CQWA 3CCNA 4QQJA 2JD5A 1Y6AA 4WBOA 3ZO2A 1OPLA 2OZOA 5J9YA 2Y4PA 1MRYA 5HIDA 3UMXA 3EN7A 3OW3A 4M69B 4CEGA 3JYAA 2UW5A 3UOHA 1YDRE 2ITYA 3M2WA 3F3WA 2W1GA 3V51A 1JKSA 3K2LA 4BDAA 3BCEA 3TT0A 3FKLA 4WUNA 2Q0BA 3FHIA 4AUAA 3E63A 3PY1A 4I24A 4UX9A 3ANQA 4G6OA 5B2LA 2AC3A 2XCKA 1M52A 4JVGA 5LXMA 2QLUA 5EI2A 3VBVA 2VX1A 1Q3WA 4OAUC 1Q5KA 2ITZA 4L7SA 1SNXA 5IMEA 3BEGA 4CTBA 2JBPA 3C9WA 2VTHA 5CSXA 1GZ8A 3Q9YA 1UU8A 4FKPA 4FKGA 1V0PA 4C38A 2EWAA 3ODZX 4AG8A 1PHKA 4L67A 4ERKA 2BZJA 3DBDA 4U42A 1CKIA 3DJ7A 3K54A 1QL6A 1REKA 2FB8A 5IA3A 4BCQA 1JKTA 4MQ2A 4E6AA 3ALOA 5JGAA 5ICPA 5CNOA 3U6HA 4ZK5A 5AUXA 4ZP5A 4CFWA 4I6FA 4BFMA 4X3FC 1TQMA 3ULIA 4EK5A 2JKMA 4W4XA 2XVDA 3ENMA 3ZZWA 3PUPA 4K11A 4PF4A 4YO6A 3ZONA 4F9AA 2R3LA 3VS5A 2EB3A 1J1CA 4JR7A 4OTWA 3SDJA 4E93A 2YIYA 3ZLWA 4GG7A 3Q9XA 2CGUA 3OP5A 4C3PA 3KC3A 3R1SA 4PPAA 1URCA 3R1NA 5DT3A 3RPYA 3DJ6A 2W9FB 5CAQA 2QOCA 2XNBA 1BYGA 5JGDA 2R5TA 3A61A 3BLHA 3D5VA 3F2NA 4D9UA 3TUBA 2FGIA 4GIHA 4BDCA 1OUYA 4IWOA 2JBOA 3CTHA 5HG5A 2CGVA 2J5FA 4HNIA 3VULA 2WMVA 4GCJA 1OMWA 4CCUA 4FA2A 1DAWA 2PVRA 2X6EA 3ZUVA 4ZZMA 1KV2A 3MB6A 2CCIA 3SV0A 1YRPA 2WTVA 5F1ZA 3AD6A 4IXPA 4RIOA 3BIZA 2XK3A 4UWYA 4E6CA 3GQLA 3MBLA 4XP2A 4XG4A 1JSUA 2X1NA 4YNOA 3FMNA 4QO9A 2FSOX 1WVXA 4CFVA 3CY3A 3A7HA 1T45A 4G9RA 2BUJA 1SMHA 3GFEA 3E87A 3P9JA 4A07A 4ANOA 3LCTA 4BI0A 1BL7A 2OI4X 5J1WA 4QTCA 5E8SA 5LARA 2OK1A 3G51A 5EDQA 3D83A 4FTQA 3WBLA 4K0YA 5AR2A 2WTIA 3C4EA 4J8NA 4C02A 3VWAA 5IEXA 1UKHA 3VBXA 4F6WA 3R71A 4YTHA 5LWNA 5HLNA 4HJOA 3L9NA 5AR3A 5CI7A 4OTDA 2FA2A 2C3KA 4G1WA 5F20A 1PKGA 2EXEA 2QONA 3V5TA 3OWKA 4CCBA 4AE6A 2GTMA 1O6YA 4HVGA 2BDWA 4LI5A 4S34A 5CU3A 5TR6A 2C6KA 3HP2A 5DRDA 4D0XA 4FG8A 4IB5A 4S32A 5T6KA 1ZARA 2A0CX 3VUMA 2VUWA 3AC4A 3HA6A 1S9JA 3MSSA 4I20A 4JBPA 4QMNA 4YURA 2PVYA 3QGWA 3ROYA 5FM2A 5L3AA 5HIBA 3PXZA 4USDA 2WELA 4DHFA 4CZUA 4HCTA 5DWRA 5AX3A 3VS7A 4GH2A 2QOFA 4X3JA 2CGXA 3AC5A 1JNKA 3PLSA 2FVDA 5IF1A 3NUYA 3WZJA 3HMNA 3W10A 4C8BA 3GGFA 1UKIA 1FINA 3EFKA 3QQJA 3EN6A 2CN5A 2Z2WA 4ENYA 2E9UA 5EM5A 3R1YA 4ALUA 4TPTA 3R7YA 2JDVA 3PRIA 2F2CB 2G1TA 2VTOA 4IE9A 5EYCA 5EI6A 5FQDC 3OEZA 3Q52A 1V0OA 3LQ5A 4JG6A 5J79A 4GS6A 1NVRA 3OXZA 4O6EA 2IW6A 5EOBA 3O50A 3CIKA 4TWPA 3AT3A 2YLEA 3MH0A 4LFIA 4E4XA 3VC4A 1VJYA 1XHAA 2VD5A 3W1FA 2B7AA 3ZRMA 4UEUA 4M66A 2HW7A 4V0GA 2JKKA 3ZCLA 3HEGA 3COMA 4FZDB 3MVMA 5KBQA 5JMSA 3A8WA 5HOAA 2UW6A 1Q41A 5M56A 3PSCA 1H01A 3ORIA 4C4EA 3Q4UA 2VGOA 4PMSA 4FKWA 5JRSA 3CEKA 3IW8A 4EHZA 3OF0A 3HMMA 2OIBA 3QQLA 3K3IA 1O6LA 3H30A 4E8AA 5DE2A 1XH8A 3IW5A 3ZUTA 3AC2A 4E1ZA 3QTZA 3PSDA 2HK5A 4FV5A 5DBXA 3F9NA 4BZDA 5J7HA 1OL5A 3GOKA 4AF3A 2E9PA 3EH9A 4ANLA 4B9DA 4WKQA 1VEBA 1YHWA 2GNFA 4FNZA 4QQ5A 4L3LA 4FKJA 3ZC6A 5DN3A 2NO3A 3S95A 4KNBA 4QMQA 2WMWA 2JGZA 2IZUA 1MRUA 3MPTA 2BAKA 4NIFA 3IG7A 5M53A 3GP0A 2RFEA 2CSNA 2V5QA 3PVUA 2CLXA 4FC0A 4YPSA 3FPQA 3TNPC 4AGCA 3HX4A 5K4JA 3CKWA 2GHLA 3PXFA 3C50A 3G9NA 3VW6A 2UZTA 2AUHA 2YCRA 3QQGA 4RC3A 3BYMA 4KAOA 3QUPA 3LXLA 3TXOA 1CKPA 4NW5A 4YHFA 3G90X 3SA0A 5AX9A 1W82A 2XP2A 4O91A 3QGYA 2WB8A 5E8VA 1UU3A 3W55A 4AZFA 4FF8A 4BWXA 1H00A 1PY5A 3A4OX 2W99B 2Z7RA 3HV4A 4WSYA 4CMTA 4F0IA 4J99A 4ZTQA 3U6IA 5LOHA 1VYZA 3TV4A 2V7AA 2C68A 3IONA 3BWJA 1JOWB 5KMIA 5J1VA 3KKVA 4J8MA 4E4MA 3DFAA 4FL1A 4ACDA 2OFVA 2E2BA 4IAFA 5FDXA 3F7WA 4EHGA 5J9ZA 3UQFA 1YQJA 2FSMX 2WMTA 2WTDA 1RE8A 4BZOA 5CXZA 2PVHA 4DEBA 5HVKA 5M55A 4JRNA 4M0YA 2O63A 3GEQA 5DVRA 2X39A 2NRYA 4EZ5A 3W33A 3D94A 3RAIA 1KSWA 3LCKA 4HZRA 4Z16A 3ELJA 2RKUA 3JVSA 5EM8A 3ZUUA 1UU9A 1XO2B 4DAWA 5IISA 3CD8A 4RFMA 1W0XC 2ZJWA 3VJNA 3WF9A 4AT5A 3LM0A 2Y0AA 2NP8A 2VWZA 4XH6A 4DGOA 3PJCA 3T3VA 3EFLA 3R6XA 4AFEA 2G15A 3Q04A 1J3HA 3AT2A 4GFOA 1Q8WA 5IUHA 4G6NA 5CI6A 4F6UA 4NFMA 3UZPA 2OJFE 4OTGA 5CNNA 2BAQA 3ZC5A 4ZXTA 2FH9A 3F69A 1M7NA 4X3FB 1OKZA 1T46A 3MTFA 3HRCA 4RVTA 5D41A 3TNWA 2C6MA 4ASZA 4BL1A 1K3AA 3MVLA 4PP7A 5H8GA 2XNNA 5D11A 3KMMA 4R5SA 4FKTA 4FG9A 3TNQB 3MPMA 2NPQA 2VTQA 4YJOA 5J5SA 4IVCA 4DEHA 2WIPA 2ZDUA 3GCQA 5HESA 5BVWA 5CF4A 3IGOA 3ZTXA 4KA3A 5I9WA 5ETIA 4O0RA 3MFTA 5DR9A 4X0MA 5L2IA 1LEWA 4RZVA 3B8QA 3KRXA 2C4GA 4K1BA 4APCA 4FTNA 4AT4A 4B4LA 4EC8A 2RFSA 4CNHA 4ERWA 3UC3A 3ORMA 4CVAA 3A2CA 4NCTA 5A14A 4K18A 4NJ3A 3PJ8A 3UVRA 3TEIA 5HX6A 5IH5A 5J5TA 4OTFA 4LMUA 4FKRA 2YJSA 2B9FA 5KUPA 3SRVB 4OBPA 2RGPA 1YXSA 2PE1A 3MI9A 1PXOA 4GT5A 4LYNA 4WG3A 5HCXA 3ZMMA 3TKUA 2BROA 4A7CA 3VS3A 3MWUA 3ZXTA 4FMQA 3IDPA 4N6ZA 1XBCA 2BHEA 2QU6A 2R3IA 2ZM1A 3L8XA 3DT1A 3QKMA 5J95A 3CS9A 5M44A 5HCZA 4U3YA 2VGPA 1ZOHA 4F09A 2EVAA 5DIAA 3CKXA 3ZSHA 4JOAA 3KXMA 4WNPA 4YNEA 3PXYA 4XHKB 3ET7A 3KMWA 5HBEA 3PJ2A 3R8UA 3F66A 4W9WA 1OIRA 1E9HA 2R9SA 3PXKA 3S3IA 3CD3A 2YCQA 5CZIA 3NNWA 1IR3A 4HGEA 5ACKA 2XIYA 3WARA 4C3FA 3GXLA 4PP9A 2XK4A 3CY2A 3FLQA 4IADA 3P79A 4FNXA 1RJBA 4HYSA 4QP6A 4UZDA 3DXNA 4IB3A 2BZIB 5C8NA 3P7CA 4H36A 2VWBA 3N9XA 4BGGA 3NNXA 2JDOA 3RPVA 2ZV2A 1XH7A 4RA5A 4DC2A 4IVAA 2J2IB 3KF7A 2UW3A 3D9VA 3O8PA 2W06A 3P23A 4KSQA 4Y5HA 4R3RA 4KIPA 3FSFA 2R2PA 4G9CA 1GNGA 2VO7A 4TWNA 5JT2A 3REPA 3QWJA 2YM3A 4IZ5A 2W4KA 3FMKA 3KXZA 4C4HA 4KB8A 1HOWA 2X4ZA 1QPEA 5F9EA 4DH3A 4E7WA 4IVDA 1STCE 5KCVA 4F9WA 3WF6A 4FTKA 5LQFA 4K2RA 4R1VA 4TNBA 4E4LA 3C4CA 4D2WA 4MNEA 2KTYA 5I9XA 2W17A 4OTHA 1U5RA 4M8TA 1R0EA 2ETKA 4FL3A 3GOPA 5KZ0A 4WG4A 5CEOA 2G01A 2ERZE 1SVEA 3F3TA 4JAJA 4CSVA 4QD6A 4CZTA 2GPHA 3ORTA 4YZNA 4DH7A 4F63A 4OLIA 3VBYA 4C59A 5LVNA 4NCTC 2OU7A 4I5PA 1YKRA 2GNJA 1Y91A 1A06A 3CBLA 3R0TA 5D7AA 3RPSA 3FC2A 3BV2A 2BRNA 2W1FA 4EOQA 2JEDA 4LGHA 4C4FA 4RWIA 5CWZA 2QOQA 1Q3DA 1YDSE 4XV2A 3U9CA 5AUVA 3ANRA 3KGAA 5K4IA 1H1PA 3BZ3A 2R3HA 3HKOA 1AD5A 4IM2A 5EYMA 3W2PA 3MJ1A 5H9BA 1MP8A 5AP1A 2CDZA 4KS7A 4J96A 4MNFA 4QTAA 2EB2A 3FZTA 5A6NA 4RX8A 3V5WA 3ZDIA 1ZWSA 2C0OA 3UPZA 3W32A 3FZOA 2BTSA 2XIXA 2Z60A 3HMOA 3MW1A 4BTFA 5TE0A 2EU9A 4AW2A 4RLKA 4BI2A 2O0UA 1UV5A 4I6QA 4L45A 3BHHA 3AD4A 2QLQA 3IOPA 4X6RA 2BIYA 5KX8A 5HNGA 2XNEA 4XBUA 5CVGA 5BUIA 2BPMA 3R21A 2XEYA 3E3PA 2XNMA 4R5YA 3R22A 4J53A 4BCMA 4D28A 4I0TA 4IWPA 4BN1A 2W0JA 2UW8A 3SLSA 3D2KA 4ARKA 2R64A 2I0VA 2X81A 4F64A 3K3JA 3QF9A 3GT8A 4GUBA 4YMJA 4NKAA 3QUDA 4G16A 2EUFB 4L8MA 3OHTA 4IZAA 3W2SA 5HO6A 3JY9A 1KOBA 2GQGA 2UZDA 3TKIA 3LLTA 3PVBA 4A4OA 3VJOA 4C0TA 3UC4A 4UMPA 4FTAA 2P0CA 4KRDA 3QQFA 5BYYA 4F7LA 2CCHA 2WMXA 4J95A 3E8CA 4YZ9A 3BV3A 5G1XA 5AA9A 4EWQA 4FODA 4C4JA 3IW6A 5AV3A 3H10A 1ZYLA 3FV8A 4QMPA 4UMUA 4F9CA 3C51A 5GZ8A 4EOOA 4D0WA 2BZHB 2VN9A 5ITAA 4CZYB 4XLVA 2BDFA 2RIOA 3A60A 4JDHA 4NWMA 4BBFA 3AXWA 2B9HA 2QR7A 3FZSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4TYJ A;  2VO0 A;  3UBD A;  3BBT B;  2Y9Q A;  3MY1 A;  4EK4 A;  3GU7 A;  4JAI A;  1VZO A;  2XMY A;  1F5Q A;  5LVM A;  3DS6 A;  4JIA A;  4U43 A;  4MD7 E;  5H8B A;  2IVS A;  4WRS A;  3LCO A;  5I3R A;  2XCH A;  4AT3 A;  4AN9 A;  1YDT E;  2PZP A;  4O0S A;  4FG7 A;  3LFE A;  3ZYA A;  5IZF A;  1FVV A;  3Q96 A;  4OGR A;  3P5K A;  4OW8 A;  5A4L A;  5L6P A;  3OEF X;  4GEO A;  4ID7 A;  4XG7 A;  4ANS A;  4PPC A;  4P7E A;  5F95 A;  4QYF A;  2H6D A;  3D0E A;  4FSR A;  3DLZ A;  1GIJ A;  2C47 A;  4O0W A;  3FXW A;  3I79 A;  4FIG A;  4M7I A;  4NK9 A;  2P33 A;  1RW8 A;  3I6U A;  5AV2 A;  3BYU A;  2WQN A;  3KXN A;  3GUB A;  4D1S A;  4MH7 A;  1ZY4 A;  3NUS A;  4G3C A;  4GT4 A;  3MGY A;  3DFC B;  2YCS A;  4H58 A;  3NYO A;  2JLD A;  3R8P A;  4G2F A;  3VHE A;  2BMC A;  3AC1 A;  1AGW A;  3U6J A;  3I5Z A;  1XBB A;  4AU8 A;  1E1X A;  4MED A;  3TIY A;  5AM6 A;  1YOJ A;  4IX6 A;  4HYH A;  3FDN A;  3VF8 A;  4U9A A;  5FP6 A;  4FZ6 A;  4DYM A;  4Q9Z A;  5FBN C;  1ZRZ A;  4ZY5 A;  4NU1 A;  2X0Q A;  4MD9 E;  2R7I A;  4FYO A;  5CX9 A;  3DGK A;  4AW0 A;  1YHS A;  4RX5 A;  1X8B A;  2OID A;  4E20 A;  1PXI A;  5FLF A;  3ZFX A;  4BWK A;  1TZD A;  4I41 A;  4ZJV A;  5IMX A;  1NVS A;  2XK7 A;  3GC8 A;  2YAK A;  4JX7 A;  4N0S A;  1GAG A;  2A4L A;  2IWI A;  4X6Q C;  4RBL A;  3ZEW A;  4ACH A;  4BYI A;  1NVQ A;  5ANG A;  4D9T A;  4IIR A;  4UXL A;  3V04 A;  3QAM E;  5I4N A;  2ITU A;  3MFS A;  4I5M A;  3R01 A;  1PJK A;  4AOT A;  4DH1 A;  2C6D A;  4M13 A;  3R73 A;  2P2H A;  4EOS A;  4RRV A;  2GS7 A;  2QI8 A;  3PA4 A;  3R28 A;  4AN2 A;  3O17 A;  5I0B A;  2ACX A;  3LFC A;  5I9U A;  2QOB A;  4BCI A;  4OTP A;  4EK8 A;  4UN0 C;  2ERK A;  1XR1 A;  4F1M A;  3FMJ A;  3BGP A;  3L8V A;  2ITP A;  4MKC A;  2QHM A;  3GU8 A;  3R7G A;  4RWL A;  3I7C A;  4EZ7 A;  3ROC A;  3F88 A;  4Q2A A;  4MWH A;  2QOO A;  4RLL A;  2FYS A;  4DH8 A;  5AAG A;  4C3R A;  5K0X A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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