3VUT | Genus

Total Genus 38

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	38
sequence length	247
structure length	203
Chain Sequence	QKQLLMDLDVVMRSSDCPYIVQFCMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQM

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal and solution structures disclose a putative transient state of mitogen-activated protein kinase kinase 4 pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	38
structure length	203
sequence length	247
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date	2012-07-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	3vutA02

3R8PA 2F4JA 4AU8A 3DV3A 3SQQA 2V7AA 4J53A 4OTQA 4K1BA 1KE7A 2W4OA 3JS2A 1H4LA 2BRHA 4BCFA 4ZSAA 4LUEA 3Q53A 4TWNA 5H8EA 3TV4A 3VS3A 2X2KA 1YOMA 4TPTA 1MQ4A 3PIZA 1YHVA 1B39A 3ZH8A 4F9YA 3TUCA 4FIFA 3LZBA 2WU6A 4D1ZA 4IH8A 4UMTA 3LAUA 4R6VA 1DAWA 3OT8A 5E8YA 2BDFA 5AR5A 4RJ5A 4D28A 1WVXA 3VW8A 1RDQE 1WBSA 2OF2A 3Q96A 3QTSA 3PZHA 4H1MA 5EK7A 1OIUA 4XG8A 4MXOA 4FNXA 4IDVA 4H1JA 4NCTC 1WBOA 4C4EA 3MVHA 4DC2A 2UW7A 2OF4A 1YWRA 3NUUA 2HY81 4K77A 2QCSA 3AQVA 3LJ0A 3UO6A 4ENXA 4OTPA 5HICA 2GCDA 4V05A 1U46A 4R3RA 3C9WA 4Z3VA 5CSWA 5I9WA 3IOPA 3Q6UA 4MWIA 2WTIA 3PSCA 3R8VA 2FB8A 4RGJA 5LMAA 4II5A 3BRBA 4DEHA 5AP2A 1M14A 2GHGA 4EC8A 5EFQA 1ZMUA 3RALA 3SW7A 3FZOA 1XO2B 2Z2WA 4IADA 3VAPA 4C4HA 4Y72A 2YDKA 2UZOA 5IA0A 4O2PA 5G1XA 1M2RA 3FE3A 2O5KA 4EH8A 5JFSA 3RI1A 4ZSLA 2JFLA 5I3RA 4HPUE 1U5RA 3LCDA 5K5NA 2WOTA 4OT5A 2Y4IB 1GIHA 4EOLA 1AGWA 3ORKA 3HMOA 3O51A 5DPVA 3OFMA 1EH4A 1R1WA 4IBMA 3I7CA 3R8ZA 1IR3A 4UYAA 4IX6A 5GZ9A 5C9CA 4B8LA 1YVJA 2ZB1A 3Q6WA 2GHLA 4PNKA 5JN2A 2E9OA 2ITOA 4LRJA 3KK8A 4O91A 5ITAA 4L52A 4M15A 3HNGA 4RFMA 4PDSA 4FTNA 5FXRA 2OBJA 3HRCA 4FTIA 4QMTA 3WBLA 1H07A 3OZ6A 5TOZA 3QRIA 5AR3A 5FTOA 4IFCA 3UC4A 4B9DA 5JZNA 3UBDA 2R5TA 1GIIA 3GUBA 1OKZA 4K2RA 3V5QA 4JBOA 2QI8A 2RGPA 5TR6A 4X2JA 3COIA 2ZVAA 3MFSA 1HCKA 3HV6A 4YJNA 2UW5A 2WMXA 3OXTA 2FSLX 4O1OA 5HE2A 3PA3A 5FBNC 4HCTA 3FMJA 3F88A 4FODA 1VJYA 4XHKB 3V3VA 2WQNA 4A06A 2X6DA 4BIDA 5LVMA 4BICA 5H8BA 4FKUA 5BYZA 2OKRA 3HUCA 4BB4A 5CEOA 1JSUA 1OMWA 4U7ZA 4MF1A 3W33A 1QPCA 4X3FA 2C6MA 2NRUA 2R3KA 2X8IA 5ETFA 2C4GA 5HNIX 3PG1A 4OTDA 1M2PA 4EOMA 2PVYA 2WTKB 1Q99A 3MWUA 3PPKA 3SDJA 4YTIA 5LQFA 3WF6A 4EHZA 3EQRA 5HG8A 2HY0A 4GK4A 2WMWA 3LFSA 2VNYA 1KV1A 4FIJA 2AYPA 4JG6A 2OIQA 4D2TA 2UUEA 2GTMA 4GEOA 3I6WA 2YCFA 2PL0A 2W17A 4M69B 5ANDA 3SD0A 4F1OA 4C4FA 2PMNX 1UNGA 4FV9A 2UW9A 4L43A 2GNFA 2R3JA 4MXZA 2YIQA 2BZKB 4E93A 4BDFA 4EH6A 4FVRA 3TNHA 4C36A 3TJCA 1UKHA 3KL8A 4V0GB 4YBJA 4ZLZA 3GGFA 2PTKA 2PZPA 1OIRA 4YZCA 4XLVA 3NUNA 4ANNA 4ZLOA 3DBDA 4YZMA 1E1VA 4M8TA 3IW8A 1H27A 4TRLA 1O6YA 4HVHA 1LR4A 1Q4LA 4FTOA 5J1WA 3IW7A 4BCOA 4N0SA 5D1JA 2GNHA 3PUPA 4NIFA 4KBCA 4XV3A 5HEZA 3MB6A 2YWPA 4MQ1A 5BVFA 4I3ZA 1KE5A 2QD9A 3QAME 1PKDA 5F20A 3ZLXA 3NUPA 3NGAA 5HI2A 5T3QA 3OWPA 4FZAB 4IZAA 3TI1A 4IX4A 4JQ8A 3HX4A 4TL0A 1CSNA 3UQFA 2ETRA 4RJ7A 2C5OA 4UZHA 5HZNA 3ZOSA 2VWZA 4MXYA 2GPHA 3HMPA 5EOLA 3WZEA 2GNLA 4GS6A 1J91A 1YXVA 4AGUA 4D4RA 1XQZA 3QD2B 1PF8A 4U97A 2J5FA 5A4EA 5M56A 4G34A 3OG7A 3R8UA 4PP9A 1Q3DA 4C34A 5HTIA 3MIYA 1K9AA 5J87A 3TNPC 3HMMA 3F3UA 3LFQA 5FQDC 3C13A 2G2FA 4UMPA 3R2BA 5AA8A 5AA9A 5HTBA 2BROA 2W96B 1R39A 2GSFA 3AC4A 4FTCA 4GU6A 2V5QA 2IN6A 3A7FA 3GCQA 3EMGA 4HPTE 4DG3E 2ITTA 5KUPA 5EI8A 4NU1A 4U6RA 4YP8A 5FGKA 5I9UA 4F09A 5M44A 5L6OA 4EK8A 4GT4A 1H26A 2GS7A 1ZMWA 2GNIA 3KU2A 3RPSA 4YJOA 5TT7A 5CI6A 5A9UA 2PZYA 3LQ5A 2JDSA 3LCKA 2W5AA 3UOJA 4O27B 3WZKA 4MK0A 1XR1A 3JXWA 2VZ6A 5CX9A 1JOWB 4PPBA 1VEBA 4YGAA 3PRIA 1OPLA 4BZDA 1URWA 3LJ2A 5AX3A 4DITA 1Y6AA 4MXXA 3O8PA 4IDTA 2VTLA 4QYFA 1H24A 2CN8A 3R00A 3TG1A 3ZEWA 4XLIA 3C4WA 3DQXA 2R3FA 3QQUA 4F65A 4PWNA 3P08A 3MY5A 3ORLA 4HYSA 1Q8ZA 4I1ZA 4FSRA 4G17A 3TN8A 2F7EE 2F2CB 3K5UA 3KXXA 5CVFA 1SZMA 2W99B 4W9XA 3LM5A 4FTAA 4EL9A 3OCBA 4RJ3A 5E8VA 3SKCA 2QKWB 2VTRA 2X8EA 4HGEA 5CZIA 3KRRA 4IAZA 4AA4A 3LLTA 2G1TA 3QF9A 4RVMA 2VO0A 3EH9A 3EB0A 5AP4A 5AR4A 4O6LA 5EW9A 4AW1A 3L8XA 4BTFA 2HCKA 1W0XC 3OWLA 3QCSA 4QYYA 4YJVA 4GL9A 4DEGA 1YHWA 2C30A 3MPMA 3LCTA 4ZJVA 1ZZ2A 5LOHA 3VRYA 4P7EA 2YN8A 2XNMA 1Y8YA 1X8BA 5CF8A 2BVAA 4KIPA 5AUVA 2CGXA 2ONLC 2ZJWA 3C5UA 3ZRMA 4RT7A 4IAFA 3K5VA 2C1AA 1JKKA 3OUNB 3SOAA 3QQLA 4I4EA 3BLHA 4FZDB 4OAUC 5CF6A 5BVDA 3F5UA 3O50A 2X7OA 2EXMA 4MBIA 3MS9A 3UP2A 3V01A 3RINA 2QLUA 4CVAA 4H3QA 3NPCA 2WIPA 3ROCA 3AMYA 1ZYDA 2XIKA 4FYNA 4GCJA 4JQEA 2C68A 5HLPA 4CV8A 3FPQA 5EI2A 3EKKA 1UU9A 4M84A 3UO4A 2ITQA 5A54A 5J1VA 1OIQA 2VGOA 4QQ5A 5JMSA 3L9PA 3BQCA 2CGUA 2WELA 4JBPA 4NUSA 3VO3A 2PMLX 1Q97A 3D5VA 4ZZOA 3QTXA 5GZAA 2OJ9A 4RZWA 4RQVA 3UVRA 3QHWA 3NWWA 4IHPA 2VD5A 4IWPA 3LPBA 3FZRA 4LGDA 2PVNA 3OXZA 5ACBC 2FSOX 2GNJA 5CAOA 4KSQA 2XCHA 4FSZA 1K2PA 5DA3A 1PMNA 3UODA 3CJFA 2H8HA 4NTTA 4IC8A 3S1HA 3BQRA 4H36A 4QMVA 3U9NA 4CFFA 3E3BX 3G2FA 2RIOA 4YJRA 4GT3A 2OW3A 3WF5A 4TWCA 2GFCA 2OG8A 2QU6A 3AC5A 3DA6A 3VJNA 4RZVA 4BTKA 5CASA 2RG5A 4FMQA 1H00A 4RLKA 3H10A 4GFGA 4D0XA 4LL0A 4EYMA 3VUTA 4Z9LA 3BWJA 1J1CA 2YM5A 5E8WA 2QHNA 4DCEA 2YCQA 4RSSA 4U44A 2VO7A 4IQ6A 4RX9A 2W7XA 4DN5A 2A0CX 4LOPA 4EK6A 4D1SA 2NPQA 4G3CA 3AG9A 5CU4A 2W1IA 1R0EA 2ZAZA 4I20A 3DY7A 3PFQA 3OWJA 4M66A 1VZOA 4GJ3A 4PP7A 1ZWSA 1DI8A 2XK8A 5DR2A 2WO6A 3F61A 3DJ6A 3QUEA 2R3PA 3DBCA 3I60A 5JSMA 2WTJA 2ZM3A 4KBKA 4IB1A 3E7OA 2KULA 3ZFXA 4BDHA 4RJ6A 4C7TA 4CMOA 2PSQA 4Z16A 3VNTA 3NUSA 2H96A 4ANLA 3EYGA 3AOXA 3UG1A 1GZNA 4LL5A 5L2SA 5D10A 5EYMA 3BYUA 4D2SA 4ID7A 4GSBA 3RZFA 2WMSA 4RLLA 3TCPA 2YFXA 5GJFA 3ULIA 3KCFA 2HAKA 2GS6A 3TV6A 2HW7A 5FEDA 2J0KA 2X1NA 2XYUA 3BU5A 4C4JA 4ACCA 5KMMA 1H08A 3R63A 3VBYA 4FV5A 2WIHA 1CM8A 2G2HA 5AJQA 4LV8A 4JS8A 5CU3A 1QMZA 2X9FA 3PVWA 2JEDA 4ZEGA 2X7FA 3COMA 1OL2A 2J0IA 3FI3A 3Q4CA 4J99A 5DLSA 2Y7JA 4PTCA 4RA5A 3VS0A 3OCSA 4U0IA 3UGCA 4RA4A 4AE9A 4JG8A 2FH9A 4CFWA 1BI7A 1TKIA 5HVYA 2C0TA 3NYNA 1P4OA 5B0XA 4FEQA 3RPVA 4E8AA 4EZ7A 4IWDA 2YAAA 3UZPA 2UVYA 3GBZA 4F9WA 3HLLA 3KEXA 3GCSA 3UYTA 3FKOA 3AMBA 4CZTA 2BZIB 4E5WA 1H0WA 3R01A 3G51A 3SV0A 4BRXA 2HWOA 3R9OA 3A7JA 4EQCA 3HA8A 1YOJA 3ZONA 4JIKA 4M67A 3C50A 3OW4A 3CPBA 3P86A 2VWUA 4NK9A 4D9UA 3OTUA 3ZSIA 2WZJA 5BMMA 5JGDA 3RK5A 4KA3A 3PE2A 5AWMA 2VU3A 2QOIA 4QTCA 3W32A 1PXKA 4RWLA 4HGLA 2VUWA 2VWXA 2OJIA 5DR9A 4YBKA 5IA1A 3BBWA 2J0JA 3S2PA 3DT1A 5I4NA 4B6LA 2YDJA 5IEXA 4C37A 5F94A 1YDRE 4U5JA 4HOKA 1A9UA 4G3GA 4XP2A 3OUKA 3N9XA 3FC1X 4FTLA 5CSVA 2I1MA 4USDA 5J8IA 4ZK5A 4MWHA 3QUPA 4XV1A 1XKKA 5CSPA 3QD0A 2G2IA 1JKTA 2HZIA 4IAKA 2R3RA 2QOQA 4D5HA 3ZDIA 3DNDA 2C6DA 3CQUA 3PXZA 4N70A 3WIGA 3L9LA 4L45A 2R0UA 4JDKA 2JKOA 4WRSA 3HGKA 2XJ1A 4E7WA 5DOSA 3HMIA 3LFAA 2IW9A 4MTAA 3N51A 2YAKA 3W2CA 3C4CA 3PY0A 3NIEA 5BYYA 3B8QA 1OIYA 3QZGA 5IUHA 1KE9A 5HG9A 2VTMA 3BWFA 4A4LA 3DB8A 4WKQA 4IAAA 4QYEA 4L44A 2WOUA 1M52A 4FYOA 2W5BA 3EJ1A 3JYAA 1UU3A 4FNZA 4O22A 4AAAA 3A7GA 5D41A 4FV7A 5AIRA 5L8JA 5IEVA 3LJ1A 4M0ZA 5CEKA 3MFTA 1PXJA 3KF4A 5CXZA 4X6RA 5LMKA 4E6AA 3DXNA 2V62A 5IEYA 3ALNA 3P7CA 1P14A 3MY0A 2FO0A 4N6YA 4IXPA 4IVCA 3GP0A 2PY3A 4E6DA 5HX6A 4EOJA 3M42A 3R7IA 3OY3A 4G5JA 4MEDA 1PHKA 3CTQA 5CSXA 5AM6A 3QCQA 4DGOA 3TUBA 2X4FA 4L6QA 5FM2A 2O65A 4EH9A 4R7HA 1V0BA 1YOLA 2C3KA 1T45A 2W9ZB 2GU8A 2R4BA 3IW5A 3BU6A 4QT1A 3V6SA 5IISA 4EHVA 3ORNA 4A7CA 3S00A 2CGVA 4RX8A 2UV2A 4J97A 5A4QA 4OTFA 2A4LA 1BL7A 2YM3A 3EZVA 3QTIA 4HNFA 3UOLA 3P0MA 3NDMA 4ACMA 3KULB 3KXNA 4AUAA 4JX3A 1WBWA 4F0FA 1SYKA 2Y4PA 2CDZA 4P2KA 1XH6A 4S34A 3VBWA 4EWHA 3QA8A 2CGWA 3LVPA 5AUTA 3F9NA 3PIXA 3RKBA 1RW8A 2B53A 3SC1A 3CIKA 4BDJA 4D2PA 3QZIA 2W9FB 2OO8X 5HKMA 2HOGA 3ENMA 4YHJA 3ZS5A 3DTCA 2BMCA 4Q2AA 3NIZA 4WUNA 2OXDA 3EQPA 2XJ0A 4EUTA 5EYCA 4O0RA 1MRYA 1Q8WA 2I0YA 5CAUA 4FKVA 4BCNA 1IRKA 3VW6A 3SHEA 5TKDA 3ZZWA 2XZSA 5AV2A 3CQEA 3MFRA 2B54A 4QTAA 5K9IA 1H8FA 1XHAA 3F5XA 4CYJA 3K2LA 4NWMA 3FLSA 2XK6A 3ACKA 3PVGA 1Q3WA 4XP0A 1G5SA 3ODYX 1AD5A 3OWKA 3O7LD 4FI1A 5E8SA 4BGGA 4IZ5A 4TT7A 4ZSGA 2OGVA 3R9HA 3CCNA 2Z60A 3GOKA 3JPVA 5KCVA 4IEBA 3OW3A 1JSTA 3HECA 5CAPA 4CD0A 4FG9A 1WBPA 4QOXA 4W9WA 4BVUA 1REKA 3CTJA 2OICA 3VIDA 3ZDUA 1S9IA 1YWVA 3JVSA 1FGKA 4KBAA 4W8EA 2BAQA 3FXXA 4PUZA 4EH2A 5E8UA 5HCXA 3S95A 5M4IA 4EEVA 3II5A 2WMUA 4DAWA 3QD4A 5C8NA 2ONLA 3TZ7A 3RCDA 3ZC6A 4MBLA 2JITA 4AZTA 3NNUA 5TE0A 3IECA 4MYGA 5JH6A 4LG4A 2PZRA 3E62A 4IIRA 1LEZA 5HVKA 4FBXA 4QP8A 4A9TA 3U51A 3KCKA 4I6HA 2RFNA 4FZ7A 2A27A 4A9SA 5CANA 3U6IA 3RPRA 2X81A 4NIFB 4MKCA 4Y8DA 4ZZMA 2YJSA 2PVJA 2VWBA 1G3NA 4TKSA 2PZ5A 3AGMA 2G01A 2YIRA 3FWQA 1B6CB 2BRBA 5CXHA 2W1HA 2X2LA 5FBOA 3O8UA 3MGYA 3ZFMA 4BI0A 1OZ1A 1Q24A 3OY1A 5LVLA 4XBRA 4QP9A 2HIWA 3DAEA 3KRJA 5IH6A 5J9YA 3WI6A 4PMTA 5AEPA 4EOOA 2GFSA 3VN9A 4NM7A 5L2WA 2GDOA 2IVSA 2QOKA 3U9CA 5C26A 4EOPA 3EFKA 3RK9A 1ATPE 3I0OA 5HIEA 2J50A 4BYIA 1Y57A 2A1AB 2ESMA 2WTCA 3F6XA 4MCVA 2BILB 4DEBA 3DLSA 5JFVA 5LVNA 4XUFA 4FIGA 3R7UA 3Q9YA 4ASDA 1YXTA 2ZV9A 3TT0A 4BCKA 3AXWA 4P4CA 5DT0A 3R9NA 4C8BA 3BX5A 4ZJIA 3TKHA 2NP8A 1YI6A 2VX1A 5IH4A 3FV8A 5KNJA 2R3QA 3W8QA 2PVFA 4CT2A 4BKZA 2ITXA 2ZM1A 3FMDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3VUTA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations