3RBWA

Crystal structure of spire kind domain
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
195
structure length
154
Chain Sequence
DALSLEEILRLYNQPINEEQAWAVCYQCCGSLRAAARRRQPRHRVRSAAQIRVWRDGAVTLAPAADQCMETEVIESLGIIIYKALDYGLKENEERELSPPLEQLIDHMANTVEAIRSYRDVMKLCAAHLPTESDAPNHYQAVCRALFAETMELH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Spire KIND domain and insights into its interaction with Fmn-family formins
rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein spire homolog 1
total genus 49
structure length 154
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16474 KIND Kinase non-catalytic C-lobe domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rbwA00
2F57A 1Y91A 3R8PA 5IF1A 1QMZA 2UZVA 1IEPA 3UVQA 4B8LA 3JVRA 3RVGA 3DBCA 3OD6X 4PMTA 4QYGA 3PY3A 5LWMA 4I6BA 2X0GA 5H2UA 4YBJA 3ZEPA 4C0TA 3FY0A 3RMFA 2REIA 1H26A 3ZFXA 2R7BA 2WQNA 5HLPA 4RJ5A 3CLYA 3EB0A 1RJBA 2C5YA 2HOGA 2YISA 3CEKA 1WBVA 3D7ZA 2B9HA 1UVRA 2B4SB 3ERKA 2CGXA 2VU3A 3OW4A 3KRXA 1PJKA 2VWVA 3FYJX 3GC7A 3TNQB 3CY2A 4FT3A 5FRIA 4FSTA 3LFDA 3U87A 3EQDA 3EFKA 4TYEA 4M69B 3RAHA 3ZRKA 4C58A 2GMXA 2IN6A 2G2FA 3H30A 3Q3BA 4HYHA 4WNMA 4X21A 4FODA 4LI5A 4O2PA 3WZUA 4ZJIA 3N9XA 3NCGA 3OS3A 5EHOA 3RP9A 4DEIA 1YVJA 2FB8A 4BCIA 1W82A 4K8AA 4RVMA 4R7HA 4FSZA 4KWPA 4M13A 3FZRA 3QTUA 4GH2A 5D10A 3V6SA 3FLSA 3DJ7A 4H58A 3F3UA 4NU1A 4Y85A 2WU6A 2R3NA 3UOLA 4OAVB 3POZA 3QZGA 3UYSA 3NUNA 2YCRA 3EN5A 4N6YA 2XM9A 4CZTA 2X2MA 4NJ3A 4DEGA 3QQGA 5KCVA 3DJ6A 4EOPA 4Q2AA 3TIZA 5JH6A 3LFCA 4CFFA 2CGUA 4MXXA 3Q6WA 2VNYA 4IBMA 3P7AA 4YO6A 4MXZA 3RK9A 5AADA 5AAGA 1B6CB 2I1MA 4NM5A 3TACA 2X81A 4MKCA 4KINA 4EOJA 4KRCA 3VF8A 3TEIA 4KA3A 1Q99A 2VO6A 2ZV7A 2WIHA 2PVRA 3KK9A 3QYWA 4RRVA 5CNNA 2ZDTA 3LCSA 4AACA 4F6UA 3A61A 3WF8A 5D7AA 2XRWA 3LXNA 2W1HA 3VBYA 3BGZA 3P4KA 4JDKA 4F99A 4B6LA 2JD5A 4FKQA 4IZYA 4J97A 3MB7A 1IASA 3PJCA 3ZFMA 3G6HA 4E4XA 2XZSA 2XCHA 2JIVA 3PXYA 4RJ6A 2YCFA 4BB4A 3R7IA 3I79A 4K9YA 4D58A 4AOIA 1FVVA 4QMQA 4O6LA 4BDHA 3QQLA 3QRKA 3ZLYA 2BIYA 2B52A 3FMJA 3UZPA 2PZ5A 2X8IA 4ZTNA 3ZUUA 3ENHA 3RNIA 4YHTA 1PKDA 5FXQA 3O71A 4MNFA 1PXPA 3LIJA 1ZYSA 2HWOA 2PE2A 2R3GA 3II5A 3TJCA 3LE6A 4PMMA 4F4PA 1XR1A 4F7SA 2W99B 2JDRA 3ZYAA 2UW8A 4WG5A 3CGFA 3GBZA 3ZZEA 4HGTA 2P3GX 1J91A 3FZOA 2XIRA 5JGAA 3LQ8A 3R7GA 4AWIA 3DQXA 4X2FA 4O0RA 2NP8A 4YMJA 4HZRA 5IG1A 4EOQA 2GCDA 2C0OA 4P7EA 4BWKA 1PMUA 5AP5A 3BU6A 3D5UA 1OPLA 1UKHA 3A8XA 2YABA 5CSVA 3ZFYA 2NO3A 1XH5A 2GFSA 4FSRA 4FTQA 4FVPA 4M0YA 4U79A 4C2VA 4OTHA 1Q8TA 4F7JA 4QNAA 3FMNA 2WB8A 4FTRA 2UW9A 2BIKB 3UODA 1Y8GA 2P55A 2VTQA 3MFRA 4FT0A 4LGDA 4BVUA 1MQBA 2PZIA 4E26A 2C1AA 1YOMA 5L2WA 3E7OA 3WBLA 1VYZA 2VTLA 4GFOA 4RC3A 1P14A 2JEDA 4O0TA 2UW5A 4WG3A 5DLSA 4FF8A 1KWPA 5EW9A 4W4XA 3ZXTA 2ITTA 1PXJA 3ORNA 5AMNA 5E8ZA 4KD1A 1M7QA 3FLZA 4IX3A 3HV5A 2VO0A 5B0XA 4TWPA 4KBAA 4E6QA 2ONLC 4B8MA 3PWYA 3OXZA 3QQHA 2UZOA 3FE3A 4G34A 3LJ2A 4U40A 4BBFA 4QTCA 4YJTA 5IKWA 1DAWA 2OJFE 5E91A 1GZNA 5EYDA 2C6TA 4ZXTA 4OTIA 5FXSA 5M4IA 4GU6A 4NFNA 3MFSA 4U97A 1ZOGA 2XH5A 4YC8A 3MVMA 5F4NA 3C7QA 3NZ0A 4KBKA 4MF0A 4U0IA 2OICA 4AW0A 5K9IA 4B9DA 3B2TA 4UMQA 1ZAOA 3FSKA 3QRJA 2O2UA 4ZK5A 4EC8A 2HXQA 4DEHA 4DG0E 2PVHA 5FBNC 4E3CA 2P4IA 3MPAA 4H1MA 5CSWA 4GVAA 3P86A 5AV1A 2Y9QA 4Q9SA 4QP8A 3UG2A 4D55A 3ACKA 4RWKA 3SD0A 4I94A 2WMWA 3RCJA 4BCJA 1F0QA 3CR0A 3LOKA 3QCQA 5KKRC 3PSDA 2VWZA 5E8XA 4APPA 3QD4A 2GNLA 3PVWA 4D2RA 2W4KA 4JDIA 1UV5A 4RSSA 4QO9A 2ETRA 3BZ3A 3I0OA 2OWBA 4IAYA 4RGJA 4X2GA 3GC8A 4ZJVA 2ZMDA 2QC6A 3FLQA 3PA5A 2GFCA 4AZVA 5AEPA 4A9SA 3GP0A 3BU3A 2J0JA 2X8EA 3E62A 4LRJA 4TZRA 4XRJA 2XJ2A 4FSNA 5A46A 1OM1A 5IU2A 5AUYA 1H1SA 3FZTA 2J9MA 2UZUE 3AC5A 1OKWA 2ZJWA 3ORMA 1ZYCA 4FKSA 4C36A 4X0MA 4UN0C 3RAIA 3F6XA 3BEGA 4PTEA 4YZNA 4BDDA 3ZO4A 5HORA 2JKMA 2V7AA 1Q3WA 5C9CA 3OHTA 5BMSA 3U8WA 3G2FA 4Z7HA 2B9JA 2QCSA 4FKLA 5BUJA 4UMUA 3R7EA 2WXVA 4UEUA 3KCKA 3CIKA 3D94A 4GT4A 4PPAA 5HIBA 5CSPA 3W55A 4CCUA 5D9HA 3L9MA 4U44A 4R1YA 1YDRE 3VUTA 4JX7A 5CXHA 4AN9A 3EN9A 3VHKA 4GMYA 5EI8A 3AC8A 3HUBA 4JG8A 5ACBC 3MYGA 3UTOA 5J9LA 1CKPA 5CEQA 4G17A 3R8LA 4FSQA 4J53A 2OI4X 4FG8A 4ALWA 4EYJA 4EEVA 3EL7A 4F7LA 1QPJA 3KY2A 5DBXA 1H1WA 2ERKA 3NNXA 5AP0A 3HKOA 1E9HA 3AC4A 5CLPA 2XS0A 2QO2A 3C4EA 4CFVA 1A9UA 3BX5A 4Y73A 4G3EA 4YJPA 1ZYDA 2GS6A 2WPAA 4JT3A 2IZTA 3EQBA 4P5ZA 3F2NA 5K3YA 1OVEA 2ZOQA 2OO8X 2BFYA 4FL2A 4C3RA 4YURA 3CCNA 5ANDA 4GYGA 3HV7A 3NR9A 5EM6A 2XCKA 4IJPA 3N51A 3Q9WA 4BHNA 4EKLA 2CGWA 3DK3A 4R3PA 2IW8A 2J0LA 3DLSA 4USEA 1SZMA 4PPCA 1JSTA 3NUYA 4D0XA 1PKGA 4U45A 4EHGA 4QMNA 5CEOA 3E87A 4JDHA 1H1QA 3F82A 2VN9A 4EOOA 2YWPA 4QTBA 3T8OA 4IH8A 4L3PA 4ALVA 5J1WA 4CFNA 4WBOA 3DA6A 3KXMA 2X9FA 4P2KA 3DZOA 1WBSA 5LVMA 4GRBA 3HV3A 1DM2A 3MWUA 3O8UA 4PPBA 5AP3A 5CZIA 4EH8A 3GT8A 4O21A 3D7TA 1H25A 3KRJA 3U4WA 3GCUA 3OROA 4I5MA 4Y46A 5TOZA 4BYJA 4KRDA 4BDKA 5HI2A 4RIWA 2X7OA 1Q61A 4QPSA 3E8DA 1PXOA 3PRFA 1Q8ZA 3PTGA 3IGOA 4XBRA 4EK6A 3L9NA 2OIQA 3Q5IA 2AUHA 4ZZNA 3PE1A 3F7ZA 5EI2A 5AA8A 3HZTA 3PRIA 2B7AA 4RA5A 2J50A 2RF9A 2W1CA 3PXQA 4HVIA 3TT0A 5FTOA 2QOOA 3AGLA 4FKIA 3VF9A 1H08A 4M15A 5L6OA 4ZS0A 5C26A 1ZMUA 2BALA 2GHMA 3AMAA 1GZ8A 3NYOA 4E93A 1B39A 5H8BA 2NPQA 4EWQA 5HE0A 2IO6A 4L7SA 5TF9A 3PSCA 3Q53A 4ERWA 3BQRA 5JQ8A 4BI2A 3C9WA 2F2CB 3MI9A 4FYNA 3SAYA 1YWRA 1KE7A 3FJQE 3BQCA 2R3QA 3PPJA 4D2PA 1XQZA 5HG7A 4F9AA 5K0XA 2ESMA 4G9CA 2G15A 1JOWB 3D2IA 3TZMA 1K9AA 5KO1A 5M51A 1SVEA 4IAAA 1YHVA 2C3JA 4TTHB 3GU7A 3GC0A 3MJ1A 3UDBA 3D7TB 2JFLA 1J1CA 2HXLA 4O0SA 5AR7A 4AXAA 4BBEA 2O63A 4FMQA 1OL7A 2W9ZB 2W5AA 4GG5A 4UMPA 2E9PA 4YJQA 4QMXA 4WD5A 4K2RA 4KIOA 4EH5A 4O1OA 1REJA 1E1VA 1K3AA 3BYVA 3ZSHA 5KUPA 3BELA 3JXWA 4IADA 5JQ5A 2V22A 3SW7A 4AGDA 3V8TA 4QP2A 3PJ1A 2WMSA 2XMYA 2LGCA 4K6ZA 4O27B 4QTDA 4S2ZA 2Z7SA 4GV1A 2UW7A 2X1NA 3WOWA 4ERKA 3A99A 3F5UA 1Q4LA 5IISA 3OZ6A 5LMBA 4FT5A 1H0WA 3BHYA 2XIZA 2W4JA 3C1XA 5F94A 4I6QA 3IW8A 5EFQA 2QKWB 2XYNA 1H07A 2YFXA 5HCYA 5JFXA 4UYNA 4F9CA 4NH1A 2E9NA 3BHUA 4NW6A 3WF9A 4ZTQA 5GJDA 3TKIA 3GFEA 4DG3E 4EYMA 3SHEA 4I41A 2ITOA 2JLDA 3QZHA 4YNEA 4RJ8A 4E5AX 2J7TA 2RFSA 4XG8A 2O65A 1JPAA 5B2MA 4MAOA 3BGPA 5TO8A 3RINA 4ACHA 4FICA 5JRSA 2IVSA 3PG3A 3NRMA 3PWDA 4DG2E 2CGVA 3CBLA 4E7WA 2HYYA 3FXWA 3ODZX 5JK3A 4IQ6A 3GOPA 4QMZA 3RI1A 3RK5A 4BKYA 1TVOA 5CF4A 2QONA 4IX4A 3W18A 2VNWA 4L8MA 2JAVA 1CSNA 1Q3DA 4FL3A 4IJ9A 3QTIA 3D9VA 4ASXA 1UU9A 2WQBA 5EDPA 2NRYA 4C38A 1BLXA 1DS5A 5K0KA 2C3LA 2YIRA 3MDYA 3E8NA 4HZSA 3R7OA 5BYYA 4MXCA 1R39A 3A2CA 2XK8A 2WU7A 1UNGA 3DT1A 2QOHA 4XG3A 4FKGA 4A4OA 3FV8A 4IDVA 4FBXA 4HYIA 4ZAUA 2OXXA 4L52A 4EH9A 3TNIA 4LG4A 4BIDA 5HEZA 4EJNA 4MBJA 2ITUA 3EIDA 4Y95A 3VJOA 3UNZA 3WZJA 5IH6A 4MNEB 2UZLA 5AR8A 1YQJA 4FSUA 4BIEA 3AQVA 3DAJA 3OUKA 4CD0A 4U5JA 3UMWA 4HVHA 5JFVA 2QHMA 4AZWA 3QZIA 3NEWA 2GU8A 5EH0A 4DH3A 2PUUA 3U51A 4CQGA 4RX8A 4BTJA 2OSCA 4RC2A 5FGKA 1R0EA 3MFTA 3NIEA 3LXKA 2RGPA 4II5A 1YWNA 4XV3A 5LMAA 3FKNA 3W10A 5HTCA 2BRHA 2JDOA 3W2SA 3FC2A 5JSMA 3OCGA 4WSQA 4IM2A 2XIKA 3S95A 3W16A 2WQMA 4E5BA 3OWKA 3ZO2A 2W9FB 2PMNX 4C34A 4M84A 5GZ9A 4EH7A 3QUEA 4AU8A 4XJ0A 5E8WA 2WMVA 1JKSA 4G3CA 5HKMA 2QNJA 1Q8WA 3D5XA 3MSSA 3UP2A 5CEMA 4LMNA 5LCJA 1GIJA 5AJQA 1YHSA 3R8VA 4C33A 1NA7A 1PY5A 5BVFA 3FMEA 2BDFA 2KULA 4IC8A 5DHJA 2RL5A 3QAME 4MYGA 2YDIA 3D5WA 3FQHA 5FQDC 4PL4A 5E8TA 3BLRA 1BI8A 3UO5A 1L3RE 2C5VA 5EM7A 3OCSA 2V55A 4PP7A 1LEZA 3VS6A 3MGYA 4AW1A 2GHLA 2WMUA 1HOWA 2C0TA 2W4OA 3GQLA 4OT5A 4U7ZA 1EH4A 3E5AA 1U5QA 3SXFA 2ZVAA 5JFSA 5FEQA 2C3IB 4EI4A 1MRVA 3HV4A 3VS2A 3JPVA 4APCA 1JBPE 2YM3A 5IZFA 5JT2A 1H28A 4FV7A 2JBOA 2FSLX 3KU2A 2YJSA 4RQVA 2W96B 1FMOE 4NM3A 4RIXA 4ZOGA 2ZV9A 3R0TA 3C5UA 3MH3A 3IOKA 3V5TA 4UBAA 3F5GA 3JY0A 3DFAA 3QQFA 4USFA 5LQFA 1YI4A 4AAAA 3COIA 3WYYA 2Y7JA 3PG1A 4L01A 2J90A 5LWNA 5D11A 1G3NA 3KRRA 4QD6A 4BIBA 1UWJA 4YPSA 4BCOA 1PMEA 4H3QA 4R7IA 5J5SA 3FYKX 2FO0A 3PLSA 5DT0A 1YDTE 4EKKA 1O6LA 3NAXA 2BRNA 5AUZA 3ETAA 3Q9XA 5LCKA 1JSVA 3UE4A 3SRVA 3W8LA 4MXYA 2EWAA 2GTNA 3O7LD 3TZ7A 3EQHA 3FZPA 4BKZA 4G6OA 1FQ1B 4IWPA 5CVGA 3DB8A 4QQCA 2C6IA 4J71A 1ZZ2A 2SRCA 4U81A 4YZMA 5HLNA 1CMKE 3V8WA 2JKKA 3LFQA 5M44A 4GUEA 1ZY5A 2YZAA 4NIFA 5IA3A 1IA8A 1FVRA 5M4FA 4RIXB 3BE9A 3SOCA 4N6ZA 2EUFB 4HGLA 3W2RA 3BYMA 4W9XA 3HV6A 4IB1A 4USDA 4IIRA 3QC9A 2X2LA 1GIIA 4S32A 4KKHA 4ZLOA 2X2KA 2HW6A 4IZ5A 4DLJA 4J52A 4EOMA 2OXDA 4OTGA 4BTKA 4D4RA 2CJMA 4F1MA 4MTAA 5KNJA 1H27A 3VS5A 2BMCA 1GZKA 3R7YA 3NNVA 4PMSA 3COKA 4DC2A 4DAWA 5FG8A 2ITNA 3BHTA 4QTAA 4BZDA 1ZMWA 4FKJA 3UQCA 5AUVA 2UW0A 5DI1A 3SRVB 4DGGA 4IVCA 2QU6A 3HMMA 5J8IA 5JMSA 1URCA 3MIYA 4IVDA 3HLLA 2PVKA 4WNOA 2ZYBA 4FKTA 4PY1A 4QNYA 2HIWA 5I9WA 2CDZA 1BL6A 1LUFA 2R3FA 5I9UA 4O1PA 3QQJA 4DGMA 3D2KA 3R9NA 3A62A 2BAQA 3WIGA 3M2WA 1SNUA 3O7LB 1XBAA 4NIFB 2XIXA 3VBWA 4G3GA 4PDPA 3VAPA 2JITA 4Q5HA 2J2IB 2W5BA 3P79A 4DINA 5IA2A 4TYHA 1JKKA 3C4CA 2XNGA 4OBOA 5HHWA 3KQ7A 5E8VA 3RPYA 3EQIA 5KMLA 4C4HA 3ACJA 3U9CA 5T6KA 1XKKA 4N70A 1DI8A 1TQIA 2QKRA 4N4SA 4NUSA 5HIEA 5J79A 4IC7A 1P2AA 5AR4A 3WE8A 5CWZA 2BRMA 4XG2A 4M69A 2J0MB 4YU2A 5BPYA 4X7QA 3CS9A 5DMZA 3GFWA 1PW2A 3P78A 2XK3A 1OMWA 1W98A 3Q9YA 4AT4A 3D5VA 5ETIA 1P5EA 1V0PA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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