4ANOA

Crystal structure geobacillus thermodenitrificans essb cytoplasmic fragment
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
SEKKTYLETQLDAVMINDQPYTVIFQRAKLKMQDPLELEVLKEVDPCIVRDIDVSEDEVKVVIKPPSSFLTFAAIRKTTLLSRIRAAIHLVSKVKHHSARRLIFIVCPENLMFNRALEPFFLHVGVKESLPPDEWDDERLLREVKATVLALTEGEYRFDEYLKFHETLKCSPIAKELWQADHLDAVLAVLEKWVDEEEAKERAKVHIPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Architecture of Essb, an Integral Membrane Component of the Type Vii Secretion System.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ESSB
molecule tags Membrane protein
source organism Geobacillus thermodenitrificans ng80-2
total genus 68
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4anoA00
2R3NA 3IW8A 4R7IA 3HNGA 4MXYA 4WG3A 2GDOA 3NUSA 3DAEA 1H1SA 5LMBA 3UVRA 4HYSA 4I23A 4Q9SA 4V04A 4O0UA 4C4GA 5ANJA 4G6NA 2WMVA 4WT6A 2XBAA 4LOOA 4ZXTA 4BHNA 4HPTE 5AUVA 1HCKA 3D94A 3NUXA 2BROA 1LP4A 4JJRA 4CQEA 2X1NA 2WTCA 2YITA 4PRJA 4XG6A 3HMIA 1F5QA 4D1XA 4GUBA 2YERA 2YZAA 2XK4A 3U6JA 2JDVA 3C7QA 3VUTA 4FSYA 4JBPA 5IA1A 3ANRA 4K11A 3TNQB 2QOIA 4U9AA 4IB0A 4M7IA 1YXTA 2H96A 2P33A 1M2QA 5J87A 4BI0A 1KWPA 3Q9ZA 2XRUA 4FL2A 2AUHA 3MVHA 4WSYA 2R3HA 2JGZA 3HV3A 2ZDUA 4GT3A 4UXLA 5TKDA 3ZTXA 4FKIA 2UW6A 3QA0A 2WMQA 4EK8A 5AP3A 5CAVA 4C4EA 3RNYA 3P0MA 5E92A 4EH5A 3LQ8A 4JT3A 5A4QA 4JRNA 3CTJA 4I41A 4X2FA 2FA2A 5I9VA 3WZJA 4XS2A 2PZ5A 1XHAA 3VUMA 4C7TA 3FLNC 4I6BA 3K5UA 2UW4A 4Q5EA 4F65A 3D7TB 3H9RA 4EH9A 3F2NA 2EVAA 4M13A 3UG2A 5CT7A 3ZHPC 4QYEA 4CFVA 3NYNA 3R22A 2QO7A 2W1DA 5AAGA 4IVDA 4MVFA 4O91A 3NUYA 3ZS5A 4XCUA 2XNNA 4BCOA 3QTSA 4C3FA 4HYHA 2B55A 5CS6A 1TQMA 3R7UA 3H10A 3VW8A 3SD0A 2UZDA 5HX8A 3PG3A 2V0DA 5B0XA 4J8NA 5A6NA 2C68A 1MQBA 2JDSA 3PXZA 2XM9A 4AW0A 3ZYAA 1JWHA 4QYHA 4QTCA 4FKJA 4AZSA 2HZIA 3NYOA 1P4OA 4RIOA 3HV6A 4PQNA 3W2OA 3DJ6A 3HZTA 4YLLA 3PXFA 2IWIA 3OTVA 3F66A 2ZYBA 3PA5A 4UY9A 2R3PA 3LPBA 4GVJA 5F9EA 2YLFA 4JRVA 4C35A 2QQ7A 3A60A 4DN5A 2Z7RA 1GY3A 5KKRC 1ZY5A 2W1HA 3TI1A 3NAYA 2PL0A 3CY2A 5E7RA 1ZMWA 5FTQA 5EH0A 5AUTA 3QYZA 4P4CA 3QQGA 5AV4A 4FL3A 3V6RA 5JQ5A 1ERKA 3VN9A 2BAQA 2YM3A 3KKVA 3UPXA 1OZ1A 3PXRA 4A7CA 1Y6BA 3BLRA 3DTWA 5HLPA 4ZJJA 3WF6A 3V01A 3ORNA 4B8MA 4CFMA 2QR7A 3AMYA 2ZMCA 2H8HA 2BHEA 5FBOA 1H0VA 3COHA 3FBVA 4BZNA 5A46A 3UBDA 3I79A 4CKIA 3P7BA 5IUGA 2XA4A 3TEIA 2PVFA 4FICA 3V5PA 2WMTA 4E7WA 5DH3A 3I81A 4BIBA 4QMQA 2E9NA 5CT0A 2V62A 3IO7A 3OXIA 4RWLA 2PZYA 3WE4A 3ZEPA 3DBFA 2RSVA 4NUSA 3LFCA 4WNMA 5JEBA 1R1WA 4L42A 4P7EA 4C36A 4GG5A 4JQ7A 4NT4A 3NGAA 5ANGA 4USFA 5IISA 3CQUA 3VQUA 5H9BA 1YXSA 5LMKA 1ZZLA 1O6LA 2Z8CA 3A7JA 3POOA 3SKCA 4R5YA 2F9GA 4OBOA 3ZRMA 4XV3A 5IEXA 4M12A 3F3UA 4AT4A 4GRBA 1QMZA 4EOQA 3ELJA 4F9CA 2KTYA 4MK0A 4OTRA 1ZLTA 2UZTA 3MJ2A 4RIXB 4OTQA 4X2KA 5F4NA 3TCPA 3VQHA 4BGQA 4EWHA 3EKNA 1Q62A 3RAHA 3QTUA 3MFSA 4F7NA 3JPVA 3G9NA 2EXCX 4NKSA 4WOVA 2GPHA 4IVCA 5HD7A 2F2UA 3FYJX 4F1OA 4AWIA 3H0ZA 2P4IA 4EQUA 3VC4A 2EXMA 2G15A 3COKA 4KIKB 5FG8A 2BIYA 3Q60A 4IW0A 4XP2A 2VX3A 3MA3A 2R0IA 2W05A 2BZIB 2UZNA 1XH8A 2GNIA 5CU3A 2VAGA 5AR8A 1YXUA 5HGIA 5L2SA 2GS2A 3IOKA 3FLZA 1GJOA 3RVGA 1MP8A 3MIAA 3FI4A 3NIZA 3QTZA 4C3PA 3MH2A 4UWYA 2FB8A 4KIKA 5CF4A 4EBWA 4IAAA 5FEQA 2PZPA 1RDQE 3DNDA 1OB3A 1Q8UA 4MX9A 3EWHA 1H07A 4HGEA 3PTGA 1LPUA 3DKGA 3IDBA 3BCEA 4ZSLA 3OW3A 4PMMA 3D14A 2UVZA 2QHNA 3JYAA 2JC6A 3NNWA 2XK9A 3FL5A 3D5UA 4U81A 1FVVA 4C33A 3WF5A 4FF8A 3P79A 2UW9A 3U4UA 3CD3A 4L00A 2VD5A 2PWLA 2VTAA 3E88A 4OTIA 3EN9A 3K3JA 4WKQA 1YWVA 1I09A 4FIIA 3I0QA 3QTWA 1FOTA 4QYYA 5J95A 3RI1A 4EOKA 4RT7A 4C38A 5LVLA 4JBVA 5CI7A 3ZFYA 3RBWA 2C5XA 1B39A 5E8ZA 4BI1A 4IANA 4AX8A 5JRQA 4ENYA 3PXKA 5DGZA 3PP0A 4DEAA 3POZA 2CN5A 4ZSAA 5KBRA 4YHFA 3IGOA 5A4CA 4CMUA 5BX0A 5HCYA 4AZTA 3C4CA 4OTPA 3KMUA 2XYNA 2WHBA 3QUDA 1UNGA 4TW9A 3R7IA 4BI2A 5FXRA 4BCGA 3FSKA 4U5JA 3H9FA 2RIOA 2JIIA 4FSQA 5JGDA 4AUAA 3VBQA 1TKIA 2WMBA 5CSVA 1R0PA 3E3PA 4TYEA 2YIYA 3BYSA 5DR2A 1U5RA 2B54A 3MFRA 4BL1A 4FR4A 5HU9A 3A7IA 2VTLA 3OEFX 3QALE 4EOOA 3JY0A 1KSWA 4OTWA 2B9JA 4B7TA 4DH5A 3I4BA 1WMKA 4D0XA 2YFXA 4NIFB 3ZUTA 4B6LA 4BDEA 5BPYA 4G9CA 3RPRA 4O0VA 3P23A 5FWKK 3U9NA 3VJNA 3TXOA 2QOCA 4ALWA 4I1ZA 4CV8A 2RFEA 3A7GA 2Y7JA 3FQEA 4J53A 5GJGA 3R7VA 2QG5A 3R1QA 4G6LA 4RQVA 1OUKA 2FSTX 2RG6A 3CKWA 4M69B 2X7OA 3R28A 2W17A 4ITHA 2QR8A 3PXQA 2UUEA 3PY0A 2GCDA 4IVBA 5ANOA 4TN6A 4G16A 2GHGA 4MCVA 5HCZA 4G3CA 4MYGA 3IG7A 3H9OA 3R8MA 2G9XA 2F7XE 4PWNA 4D58A 4AXAA 2VTHA 3GNIB 2YA9A 1KE7A 3FE3A 4BRXA 1GZKA 3EL7A 2CCHA 4XBUA 1YVJA 3ORXA 4X2JA 2B9HA 3LLTA 1RW8A 4JR7A 4AGWA 1PMEA 4S31A 3FC1X 3MH1A 5DFPA 1URWA 4DH7A 2QURA 2YWPA 3Q4TA 4DGGA 5JFSA 2NO3A 3UNZA 1CKPA 2XNMA 4CRLA 5ETCA 3EFJA 1V0OA 3CQEA 2BMCA 2CN8A 5EDQA 4EK6A 3C1XA 2FSMX 2V55A 3D2IA 2R3JA 4RJ8A 4FKPA 5L6PA 4JDHA 4FTMA 2PVRA 4O22A 4X21A 3H0YA 3SRVB 3BHYA 2YM4A 4CXAA 4FG8A 3G0FA 4YNOA 4OAVB 4E20A 2CGUA 2AC5A 3DK3A 2YIWA 1AGWA 2YDJA 5FEEA 2FH9A 2Z7LA 2GS6A 4BCIA 2C5NA 3BV3A 5DVRA 1Q5KA 1PXJA 3FY0A 2WMAA 5LOHA 2FVDA 4BDCA 3R63A 2HY0A 5CQWA 5A4TA 3EJ1A 3RJCA 4PDOA 4C3RA 2WTIA 4J7BA 2A2AA 3OOGA 4C58A 2C6KA 5AP1A 4A9YA 4BIEA 4UMPA 1H08A 4HNIA 5JQ8A 3KN5A 2YEXA 3FZOA 4MXCA 3UC3A 3O7LD 3GENA 3QD2B 3PY1A 4YC6A 3TJDA 3ZC6A 5HE3A 5DMZA 3BZ3A 4QYGA 4WG5A 2VZ6A 3Q9YA 1VZOA 2HXQA 4KWPA 5AR7A 3VAPA 3CJGA 3ROCA 1XH5A 4FV7A 3JVSA 3PSBA 3DBCA 3DZOA 4ZAUA 4DITA 4ANQA 2QU5A 5ETFA 4NFNA 5J5SA 1H01A 4GH2A 5BNJA 4I22A 4A07A 4KB8A 2OG8A 5DE2A 3EOCA 4JS8A 4HCVA 3TV4A 4R8QA 4IDTA 3EQGA 3R71A 2GNLA 3DXNA 3OWKA 4R7HA 3AGMA 4BDHA 2Z7QA 4BCQA 3HMPA 4AP7A 3LIJA 4I0TA 4UX9A 4AACA 1OKVA 3QHRA 3KXHA 2IVTA 3F9NA 2O5KA 4RQKA 1DI8A 5C26A 2V7AA 2BPMA 2R3IA 2WTDA 4L52A 3REPA 3ZONA 1OPKA 4LMNA 3TZ9A 3GC7A 5IA4A 5HIDA 3CPCA 2YM6A 4G31A 3GU7A 4U41A 4BTMA 4XG4A 1MRVA 2A27A 4II5A 3UO4A 3PIYA 5D7AA 4L3PA 4XBRA 3F6XA 5A14A 5CWZA 2YAKA 4UWBA 4PF4A 3EN4A 4Q9ZA 1UKHA 2XP2A 3R6XA 4H36A 4O2PA 4B8LA 4D2RA 3OWLA 3C4WA 3U4WA 1KE8A 3PSDA 3F5GA 3DBQA 4G6OA 3HMMA 1SM2A 1OKZA 3MS9A 4J97A 2VTIA 2WOUA 4QOXA 5D12A 2QOHA 4RJ5A 3MN3A 3O50A 2RFSA 5E8YA 4U79A 4MEDA 5AAEA 3S4QA 3V5QA 3T3UA 2HZ4A 2YN8A 4HCTA 4ID7A 4XX9A 3ANQA 4A9SA 3UTOA 4BBFA 4AGDA 4NTSA 2NPQA 3Q5ZA 2KULA 4AW2A 4W8DA 2XF0A 3DNEA 3I7CA 4B99A 4KSQA 2ERZE 3EQIA 2HOGA 3OCGA 2ETKA 5IKWA 3W2QA 3W55A 3DA6A 4EK5A 1QPEA 4FG9A 4G34A 2I40A 5L4QA 4F9YA 2HYYA 3VW6A 5JH6A 4RVLA 3FC2A 5E90A 5FGKA 3GBZA 3RAIA 2XK7A 4XEYA 3HRFA 3QQHA 4TXCA 3TTJA 4IWQA 4FUXA 5EHOA 2VN9A 1O6YA 4MF0A 5HTIA 4PP7A 1B6CB 3TL8A 4BDIA 2XJ2A 4H3PA 3VS2A 1JPAA 2O8YA 5I5ZA 3KL8A 4FZDB 5DWRA 1QPDA 2X39A 3CBLA 4HVIA 4UMQA 3DY7A 4S33A 5JFXA 2VWXA 2CGWA 5HO6A 3SLSA 3BWJA 5FDPA 3UNKA 4BC6A 3HMNA 2UZVA 3OCSA 3ENMA 3R9DA 3MY1A 2JDOA 4XV1A 3PJ2A 3I1AA 4GU9A 3D9VA 4XYFA 3EFKA 4NM0A 1VJYA 1UKIA 2XNOA 3G51A 3GP0A 3NWWA 4FV4A 5JMSA 1PYEA 4ANBA 4KAOA 5L2WA 2HZ0A 4GK3A 4IEBA 4XRJA 4AN3A 4ZTSA 4IC8A 4FSWA 1GZNA 4UWCA 3FZRA 4FKQA 5JN2A 4RX9A 3KK9A 2Y0AA 4H1JA 4WUAA 5FRIA 4GEOA 1L3RE 4IZYA 4QQTA 4DH8A 2VWBA 5I9UA 3ZEWA 1SVHA 2IJMA 5BYYA 2W1EA 2JKOA 2RFDA 2SRCA 3KULA 3LFSA 4BHZA 3HA8A 2XEZA 4X3FA 2GNJA 1JLUE 4FTOA 4ZTNA 3WYYA 4RVKA 4XLVA 3AD4A 1WBTA 3FMJA 4JG7A 3VBVA 2JD5A 1O6KA 1M52A 2JKQA 4EBVA 1PKDA 4IX5A 4K8AA 3U87A 4O0TA 3KMWA 1H25A 3A4OX 3LXNA 5IUIA 2XJ1A 3F7ZA 2EB3A 4OGRA 3FL4A 5KBQA 4MXZA 3IW7A 3WZDA 5BVWA 5B2MA 3QHWA 3TKIA 4N6ZA 4AT5A 3UIUA 3KCKA 4MAOA 4PL5A 4FV8A 4S2ZA 4FK3A 3GGFA 4I20A 5L6WL 4ERWA 1DI9A 2PMIA 5L8LA 5FDXA 4BF2A 3DPKA 4GJ3A 3F88A 5AR3A 1Q24A 3GCVA 1UA2A 1ZAOA 3UOHA 4PPAA 5IDPA 1R0EA 3RZFA 2R2PA 4NM7A 1IG1A 4IE9A 3RPYA 1KE5A 4NWMA 2Y6OA 4D2PA 1GZ8A 3KB7A 3G5DA 3C4XA 3UZPA 3LFAA 3UPZA 4NJ3A 5IMEA 5FM3A 4L3JA 3QFVA 4HCUA 5BUIA 3LFQA 2VX0A 3EQHA 4OR5A 1ZOGA 3AC8A 5L8JA 4C59A 5G1XA 1Y8GA 1W98A 4O6LA 4JAIA 4YZDA 3Q4CA 2ZV9A 4FZ6A 4L44A 4LGHA 5D41A 2AYPA 1S9IA 5KZ0A 3MW1A 5AUYA 3ULIA 4ERKA 1KOBA 3L9NA 5HTBA 3WIGA 1XQZA 3LE6A 2OKRA 4AZVA 2ETMA 3OVVA 2WTVA 4L46A 3RP9A 5CXZA 4D1ZA 4TWOA 4J95A 2W0JA 3R8LA 3W8LA 1PXIA 3GU6A 5KZIA 2REIA 3KA0A 1Y91A 2BILB 5ANEA 3SHEA 3VS5A 3OHTA 4IADA 5I9ZA 2PZRA 4FKOA 4ANOA 4YP8A 4QPSA 3BX5A 4PP9A 3NDMA 3QLFA 5C8MA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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