4BFMA

The crystal structure of mouse pk38
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
330
structure length
313
Chain Sequence
KDYDELLKYYELYETIGTGGFAKVKLACHVLTGEMVAIKIMDKNALGSDLPRVKTEIDALKSLRHQHICQLYHVLETKNKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQILSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDENHKLKLIDFGLCAKCGSLAYAAPELIQGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYEVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMRNLLNHPWVMQDYSCPVEWQSKTPLTHLDEDCVTELSVHHRSSRQTMEDLISSWQYDHLTATYLLLLAKKARLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structures of the Kinase Domain and Uba Domain of Mpk38 Suggest the Activation Mechanism for Kinase Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 95
structure length 313
sequence length 330
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bfmA00
2QOFA 5I9ZA 3PSCA 4G3CA 4NK9A 2VTRA 4XOYA 3FQEA 4U41A 3UPZA 3R73A 4RJ4A 2RFDA 3NS9A 3BEGA 3UIUA 4HYHA 2VAGA 2X2MA 3NLBA 4E4NA 1REKA 2WQMA 4E4XA 3TIZA 4KIKB 1OECA 1T46A 2REIA 4J53A 4IM2A 3OTVA 4L68A 4ZEGA 2A4LA 5HG8A 4ANBA 2P0CA 4FTMA 3DBDA 3QGWA 3JVRA 2H6DA 3BGZA 4YPSA 3VBWA 4AGWA 5DEYA 2X9EA 4FSQA 3E7VA 3MJ2A 3Q52A 1L3RE 1LEWA 2OW3A 5C01A 2J51A 2VNWA 3KRWA 3IONA 5L2SA 4O6EA 1YI3A 5HI2A 4A9TA 1OPLA 4AT5A 5CI6A 4FSRA 5AAEA 3D7ZA 1UWHA 5M4CA 3QGYA 3S1HA 2F7XE 2XVDA 4FX3A 4O2PA 5L6PA 2YABA 1Y57A 3R83A 4E6QA 3UOKA 4IVDA 1ZYCA 3Q6WA 2PMLX 2UZBA 3PVBA 3GGFA 1UA2A 4L46A 3D5WA 3ZFXA 4RC2A 4XCUA 3ROYA 3OWJA 3HMMA 4P5QA 3TXOA 5CAUA 3SD0A 3ZXZA 1UKHA 3FMHA 3GC9A 3HL7A 3UE4A 4AOIA 4EQCA 1YXVA 2VX0A 4XG2A 4ITIA 3PZHA 2X9FA 4IWOA 1NY3A 4BB4A 2QHNA 4YJRA 2G01A 3UIBA 4XV2A 4RVMA 5AP6A 5AP3A 4ZSLA 2IW8A 4F09A 4XRJA 4AUAA 2W4OA 2VO7A 2OICA 2CGUA 3SV0A 5AV0A 1DI8A 3W2PA 3WF8A 4CFWA 5J1WA 3CKWA 4EOSA 3LJ2A 4JDKA 4W4WA 3GU6A 3MSSA 4W8DA 3FMNA 3FI3A 1YQJA 4DEGA 3BYOA 3REPA 4AW1A 3KXMA 3KXZA 3PJ1A 4YLJA 2VWIA 3UYTA 2QOQA 4Z3VA 1GIHA 4AS0A 5KNJA 3RPOA 2Y7JA 4E6DA 4JQ7A 5LMKA 4WG5A 5DR2A 4UN0C 4WNPA 3GCSA 4OAUC 4U43A 1GNGA 1PXIA 2QR8A 2OF2A 4FC0A 3V5JA 5CF4A 1H25A 4OTPA 1OPJA 4Q9SA 3LFFA 1DAWA 3W8QA 4AA4A 4YTFA 4BN1A 5HBEA 4CT2A 3KN5A 3KVXA 4C0TA 4AGUA 5IEVA 4G3FA 2QD9A 3TUBA 1BL6A 1O6KA 1Y91A 5CEQA 2GU8A 3K3JA 3EN7A 3R7EA 4W9WA 3OUKA 4KWPA 5AV4A 2Y6OA 3RINA 4O0RA 4KIQA 4HYSA 2G2IA 4OTGA 5AP7A 4MBJA 3GUBA 2B54A 4IE9A 4KBCA 3C4FA 4I6QA 4H1MA 4PX6A 3MN3A 1WBSA 4GSBA 3F5GA 3KXNA 4QMWA 2XIYA 1SZMA 2X2LA 4WG3A 4EWHA 4QMNA 2BFXA 3NUNA 4Y85A 3HNGA 3L1SA 4RFZA 5AAFA 5TE0A 4IXPA 5TF9A 4A9YA 4EUUA 3VS1A 3LLTA 3OFMA 3P9JA 4EYJA 2HZ0A 2YJSA 3A7JA 2C68A 2J5FA 4F1MA 5J9YA 2FGIA 3PG1A 3HV3A 3V8SA 5EYMA 4PDSA 4EH5A 3QQGA 4U44A 3ORLA 2WFYA 4GG5A 2Z7SA 5HE2A 5JGBA 3SXFA 5B7VA 3BWFA 4ZSAA 1B6CB 1SYKA 3QWJA 3ZLYA 2J50A 3LCSA 4NU1A 4FKIA 5L2TA 1U54A 1Q8WA 5AM7A 5HBHA 3UNJA 3QZFA 5AWMA 3QZHA 2R3GA 5JKGA 4GL9A 4M3QA 3CTQA 4G17A 2XZSA 2J6MA 3BKBA 2QOCA 3O0GA 3PP0A 4ANQA 4RIXA 4J7BA 1M14A 2YHVA 4K6ZA 1WZYA 4WRGA 4NW6A 4AZFA 4EQUA 4XUFA 5C03A 4BF2A 1ZY4A 2W4KA 1KE6A 2IZTA 3PPJA 1ZZLA 4WO5A 5L6WL 4AZWA 1YI4A 2BDWA 3COKA 3P78A 3QTXA 2QOKA 3G0FA 4FTIA 4A9RA 3D0EA 3FI4A 5FG8A 4AU8A 1H1SA 1WVWA 2XEYA 2HELA 4FL3A 4AOTA 4E5BA 4ERKA 5HHWA 3QZGA 4CVAA 3OY3A 2C1BA 4PDOA 1ZXEA 5JK3A 1WBPA 2C6OA 1OIYA 2BR1A 2VX1A 3TV7A 4J95A 4F6SA 3COHA 3KRJA 4RWKA 3FDNA 2ONLA 2QOIA 4TNBA 3F3WA 2XNMA 4FT9A 4YSMA 4I94A 5FP6A 3A7IA 5BVWA 3PFQA 4KS8A 4QP7A 3QRJA 2UUEA 2QNJA 5DR6A 4UMQA 5FTQA 2R3PA 3HKOA 4CMTA 3LCKA 2O65A 3AMBA 2XK8A 4PMSA 4AT3A 4EBVA 4RIWB 2YM3A 1W83A 2XNOA 5K5XA 5BNJA 5L8KA 3GCPA 1MUOA 4GFGA 4EH9A 4QMYA 4FZ7A 3UDBA 4BBFA 4IAKA 4CEGA 5LOHA 3BLRA 5ANGA 5KE0A 3L9MA 3QKKA 1Q24A 3N9XA 4LOOA 3LM5A 5EHYA 4QMOA 3NX8A 3D4QA 3BQRA 4B9DA 3AC8A 5L2IA 1OL6A 2EB3A 3PXKA 1DM2A 3EFLA 2WZJA 4FOCA 4XG3A 2QU6A 5CF6A 5IUIA 3HRBA 3VHKA 5HU3A 5JT2A 1V0BA 2W17A 4F4PA 4EZ7A 3BQCA 4C02A 1JKSA 2JITA 5FDPA 2BTRA 3HMPA 5JFWA 3DAEA 4HJOA 4QOXA 4ERWA 2UZLA 3SXSA 2JDTA 3KULA 2HWOA 2CN5A 1URWA 5TO8A 4AXAA 4P90A 2WMXA 3KK9A 4M97A 5IPJA 4IDVA 4EC9A 3EZVA 1T45A 3DV3A 2ITWA 4KKEA 5HESA 5HGIA 5JEBA 2W5BA 1M17A 3HP2A 4LL0A 4FYOA 4QPSA 4YURA 4C2WA 3MFRA 4R7HA 4GYIA 2CN8A 4BDJA 3DB8A 3LXLA 2F7EE 5HOAA 3H9OA 3ZH8A 1I09A 5DA3A 3FUPA 3SC1A 5LVNA 1OKVA 3DBCA 4II5A 3F69A 3TNHA 2R2PA 2E2BA 3F7ZA 4B6LA 3KC3A 4K1BA 2YISA 3DDPA 4LOQA 5DNRA 4FT3A 1OPKA 4JNWA 4CKJA 2X7FA 4EI4A 2CCHA 4ENYA 2NRYA 4FNWA 5CLPA 1P4OA 4OUCA 4U5JA 4XS2A 3RM6A 5IUGA 4BGHA 1UNHA 3FBVA 3OW4A 4AOJA 4E6AA 2X8DA 4FEQA 3PPZA 4MCVA 5DOSA 5C8MA 2OJ9A 3SDJA 3W10A 5CZHA 3FZPA 2R3OA 3MFTA 2YDJA 3AQVA 4R7IA 3OC1A 4XP0A 3GCUA 3FQSA 3V8TA 4B4LA 5C1QB 3H30A 4RVKA 3TUCA 2ZMDA 4NT4A 3ZUUA 4ZLYA 1Z9XA 2WTIA 2R64A 1TQPA 3UMWA 4QP1A 4E4MA 4NTSA 2CKEA 5K0XA 2BHEA 4FTJA 4PTEA 5CAOA 4GU9A 4CLIA 3PXFA 3AGLA 3EFJA 3OT8A 4TYIA 5ANOA 3HV6A 4FMQA 3VBYA 2O8YA 2X4FA 3R1SA 4U3YA 1H26A 1OL5A 3MGYA 3FPQA 3C51A 1S9IA 5AP1A 1OL7A 3BU5A 1XBCA 3QUPA 4GIIA 4MQ2A 5HICA 3TJDA 1YRPA 3L8SA 2ITUA 4UWYA 4XYFA 2XCHA 3ZSHA 5LXMA 2X1NA 4XH6A 3V01A 2VWVA 2P33A 4K18A 4A9UA 2JAVA 4MXAA 3ORIA 3TV4A 4FG8A 2I40A 2C0TA 3UIMA 2GTNA 3AXWA 3I1AA 3BELA 3ORMA 4NWMA 4D28A 3FZTA 1NVRA 4CQEA 4IHPA 4G3EA 5DT3A 3EWHA 2HOGA 3GC7A 2XNBA 2YFXA 1JKKA 2Y9QA 2RFSA 2CCIA 4TZRA 2Z60A 3QC4A 2UW5A 3KMMA 4R1VA 2G2FA 2WMVA 5DI1A 3EB0A 2C3JA 1PXNA 2R3FA 3HZTA 4BI1A 2C4GA 4V05A 3R1YA 2ZB0A 3E92A 4GT3A 4AQCA 2SRCA 3QX4A 3ANRA 4ZTNA 3PIXA 3WZJA 5J5SA 3BX5A 4N0SA 1YDRE 4HVHA 3FHRA 4MXXA 4GMYA 2QONA 5BVNA 3F5PA 4FK6A 2XCKA 3MVJA 1OM1A 4IZYA 4JS8A 3ZHPC 3VUIA 4FKVA 4H36A 4M69A 2C69A 2HY0A 5LMAA 3CQWA 1Q62A 5L4QA 3FJQE 4UWCA 4U40A 3VUKA 4YJVA 2UW4A 3Q9YA 3C4CA 4L3JA 2V5QA 5CNNA 4DFXE 4U9AA 2HW7A 3NWWA 2R3KA 4DGGA 2RL5A 2VTPA 4H3PA 3VS7A 1IA8A 2J0KA 2GTMA 4YLLA 2OJFE 4YNOA 2NRUA 4FOBA 2WEIA 2BRNA 4USFA 5EW8A 4JAJA 3QQUA 1BLXA 4Y8DA 5M56A 3H9FA 4FV8A 2WTKB 2B4SB 3M11A 4FTAA 4FZ6A 4EOLA 3ZDUA 1WBVA 2W1IA 3ZLXA 3R6XA 4FG9A 3UMXA 4GEOA 5FTOA 3UOLA 5CF5A 2UZNA 4EK4A 4GG7A 4UB7A 1WCCA 4QTAA 4I21A 4BWXA 3O8PA 2JDSA 3TZ8A 3L8VA 4YMJA 2BRMA 2WKMA 3FI2A 4CZTA 4ZSEA 5I3OA 4GJ3A 3ZXTA 5CAVA 3HUCA 3F3VA 3UZPA 5ICPA 1E1VA 3R02A 2VTHA 5CNOA 4ZSGA 4BDEA 3CPBA 4N6ZA 1GIJA 3WI6A 3QU0A 3A7FA 3LFBA 2VTLA 2CMWA 2QO7A 2AC5A 3PXRA 1J1CA 4J8MA 1R0PA 4U7ZA 5LMKC 4E26A 2OFUA 4JR7A 2C6DA 3MPAA 4FSZA 2R7IA 1ZLTA 5HD7A 3EH9A 5EKNA 3AD5A 1U54B 4LV8A 3VRYA 4IIRA 4IM0A 2FO0A 3DS6A 3W33A 2WAJA 1ZWSA 3BWJA 4RQVA 3OVVA 4KS7A 4YGAA 1XH6A 5DT0A 5FWKK 3TI1A 3W55A 3WBLA 4H3BA 4XLVA 4D4SA 3OXTA 3TCPA 3C4EA 4KSPA 4JRNA 4PL4A 2WD1A 1QPDA 4KKGA 1Y8GA 3HVCA 2JD5A 1QPJA 3R8MA 4LMNA 5JZNA 3Q2MA 2WTKC 2WNTA 5HKMA 4D2VA 5H8EA 2W7XA 5CT7A 2XNPA 3ZBFA 5IH5A 3EQRA 4DH8A 3ZS5A 3EN4A 5CWZA 1VJYA 4X21A 2QO2A 3IG7A 3Q4CA 4E4LA 4GH2A 2Y8OA 2XBJA 1VR2A 4AACA 2WB8A 2HIWA 2XIXA 4I24A 4F65A 3QKLA 3DAJA 5A54A 5FQDC 2BAQA 3T8OA 4ANNA 5EYDA 4BCIA 1IRKA 4MF1A 2QOBA 3NUSA 2JKQA 3IOKA 4G34A 3ALNA 5BUIA 3UPXA 3PYYA 3BEAA 2NO3A 3UGCA 2IO6A 3NAXA 2HZNA 3ORKA 2IWIA 3TEIA 5DN3A 3QQKA 3ZLSA 3BHHA 4BDCA 1FMKA 1H27A 4IDTA 2BIYA 1HCLA 4ANSA 5AP2A 4P5ZA 4PTGA 2XK4A 4YZDA 1ZMUA 2B53A 2YN8A 4N70A 4QO9A 2PVJA 4XX9A 5HD4A 3F6XA 2OGVA 4XG4A 4GU6A 3CTHA 4IANA 3SXRA 2XYUA 1JWHA 2C5VA 3KMUA 3TKIA 5LQFA 5IA3A 5I9YA 3FMKA 3A60A 4NM0A 4B8MA 1F0QA 3KA0A 3CC6A 3KULB 5A6NA 1IR3A 2F9GA 5JZJA 3R8LA 4QT1A 5EOLA 2C5XA 4YP8A 5KMNA 4BCQA 4NSTA 4X2GA 5A3XA 3TZMA 4BZOA 4FTRA 3FZOA 2JDRA 4L43A 4TYEA 3B8RA 2VU3A 5ANIA 4FUYA 4JDJA 3TNPC 1PMUA 3ZRMA 2R3QA 2VV9A 3GOKA 3IPHA 4Q9ZA 1H28A 5BVFA 1V0OA 1K2PA 3RPRA 1XBBA 5EI6A 1ZYLA 3PVGA 3ZUVA 3LM0A 5KMLA 5DT4A 1SVEA 2WMWA 3CXWA 4S32A 3KKVA 3I5ZA 3R7VA 2WGJA 5ANJA 4EH4A 3QA0A 2UZOA 4HNIA 2VTJA 4N4SA 2JIIA 4PL5A 3I7CA 4YO6A 4DITA 4G3DA 5M55A 5KMOA 2XK9A 4X3JA 4M0ZA 4PV0A 4W4VA 3IW7A 3CQUA 3OCGA 3O50A 4PRJA 1QL6A 4QPAA 4DH5A 2RSVA 4YZCA 5ETFA 1H01A 3LVPA 3EZRA 3U6HA 4IFGA 3PVUA 4BBEA 2YIYA 1PMEA 3COMA 4WD5A 4FYNA 2CHLA 2OIDA 4UMTA 4WUNA 3IKAA 2X0GA 2W4JA 3Q32A 4OLIA 2OFVA 5ETIA 1P14A 4FTTA 5BVOA 4EYMA 5CASA 4UZDA 1IG1A 4WSQA 1PY5A 1XBAA 4BBMA 1JOWB 3K5UA 2GS2A 3QRTA 4O6LA 5CXHA 5K3YA 4QQTA 4U81A 1OKWA 4APCA 4C35A 3LFNA 4AE9A 3ZFYA 4BHNA 2PY3A 2ZM3A 3QRKA 4LI5A 4D4RA 3T3UA 1ZMWA 2WELA 1SNUA 3MVLA 3WF9A 3FZRA 3N51A 4Q2AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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