4BWKA

Structure of neurospora crassa pan3 pseudokinase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
412
structure length
392
Chain Sequence
PKDRRENLQKKLFHMQQLLPNSGLPNLDRWHSLFPLDTKATRNSTCFGYPSWMYKAQNNKNGRHFALRRIEGYRLTNEKAILNVTKEWKKIINANIVTVHEAFTTEFFGDSSLIFVYDFHPLSETLYDHHFPPNKIPENLLWSYVCQIANALLAIHNAKLAARCLELSKIIWENNRIRLAACSILDVLHHDSPNRKTIEELQQEDFVKFGRIILALATNTPTLNFNNIDAALATIVPRYSTQLRGVLEWLIKPSAPGETKTVETLLGGITTHLANFANFVMQESDEKEFHLMRELENGRIARLMFKLSVVNERETGERLLLKLFRDYVFHQVDADGKARLDTNHYLNCLSKLDASSEEQILLTSRDNATVFVVSYRSIRQMLDRAYGELGKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Gene regulation
source organism Neurospora crassa
publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
total genus 108
structure length 392
sequence length 412
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwkA01
2G2IA 3PVWA 3DOGA 2X4ZA 4FVRA 2WMUA 5AR4A 1UNGA 4S33A 3QRTA 5BQ0A 2JAVA 3V3VA 3AMYA 5BVWA 3P7CA 3DKFA 3E8CA 4F7SA 3ZH8A 3IW4A 4G31A 4NWMA 4IH8A 4RSSA 4XCUA 3LZBA 5HBEA 4ZY4A 2Y0AA 3O0GA 4ENYA 4BDKA 3NIZA 5C8NA 3OT3A 4AOIA 4BBFA 4FTTA 4Q2AA 3BKBA 3R2BA 5D41A 2CGXA 3BRBA 4LV5A 3RTPA 4KIQA 4WKQA 3E8NA 4XG4A 3VUGA 4RG0A 4QP4A 4EKLA 5HU9A 3HRFA 4JRVA 4IX6A 2HELA 2YACA 4XP0A 2WMTA 4QTBA 4DCEA 1L3RE 2F2CB 3CS9A 4LOQA 5M4IA 2YM5A 5M4UA 5JRQA 3Q4UA 4BHZA 2B9FA 5CEMA 3SKCA 2ITVA 3A7HA 5G6VA 1J3HA 4JIAA 4ANBA 4GL9A 3COIA 3WZDA 4KBAA 3ALOA 4GYIA 3UO4A 3MS9A 2X8EA 3NLBA 4WUNA 5E7RA 3U8WA 4MD7E 3SAYA 2GHLA 3VJNA 3TI1A 4AOTA 3ZLXA 2W9FB 3Q4CA 1PMVA 1Q41A 3I0OA 3V8TA 4EEVA 3C13A 3REPA 4ASXA 5JGDA 3V6SA 3QLGA 5EOBA 3GCSA 5CQUA 3FPQA 4WNPA 2O0UA 3TV4A 4EOJA 4EJNA 4HVHA 2OG8A 4YJNA 5KBRA 4IZ7A 3BI6A 1LR4A 1CMKE 4AF3A 4UXQA 4NM5A 4IEBA 1LEZA 3OTUA 4OGRA 4PL4A 4PTCA 3QD0A 3VC4A 4AGCA 1ZAOA 3C4FA 4JBQA 5AAGA 2I0HA 3DBEA 3G9LX 3MV5A 5EK7A 3MVHA 4R5YA 5AP0A 4QYGA 4BCIA 4WG3A 2CCHA 2VN9A 3CTJA 3II5A 3ACKA 4K77A 2YA9A 4C59A 3NUSA 5HLNA 3R7YA 4QMQA 2OZOA 2BFXA 4EOLA 1O9UA 2QU6A 3VF8A 3MN3A 5F4NA 4IVDA 4NEUA 3CKWA 4B7TA 3IO7A 1OZ1A 4EK8A 4IBMA 3OOGA 3DB6A 3QC4A 4G6LA 5CANA 3MTFA 4R7HA 1JBPE 2JBOA 2QOOA 5HBJA 2C6IA 2RIOA 2X9EA 1ZRZA 2V55A 5KMOA 5HG8A 3MSSA 5DPVA 3GENA 3DGKA 2QG5A 2YAAA 3ZO4A 5JZNA 2PMOX 3KCKA 3C7QA 4FIIA 4R1YA 4CKIA 5GZ8A 5HU3A 3E8DA 3V01A 3O17A 2VTTA 5KMLA 3NIEA 2ITUA 2XM9A 4G5PA 4PUZA 4E5AX 2ZMCA 3QL8A 2QOIA 5L6PA 4HVIA 1ZYCA 2Q0BA 3HUBA 2W1CA 5CAPA 2OF4A 1FVRA 2PMIA 3DBFA 4BC6A 2OJ9A 2HCKA 2JKOA 3MA3A 4PQNA 3FBVA 4U6RA 4K6ZA 3F3UA 3I0QA 3ZEWA 4H58A 5B0XA 4Q9ZA 1PW2A 2YM7A 2IVSA 5HX8A 1OIRA 3GFWA 3ZSHA 2XEZA 4MK0A 3F2NA 2J90A 3LPBA 4D4VA 3MVLA 3OTVA 4AGDA 4C2VA 4II5A 3A99A 3OC1A 3VS1A 3QF9A 3HV7A 3C5UA 3QCYA 4PDOA 4HYHA 3UMXA 3OW4A 1Q4LA 3HNGA 2DYLA 5EM7A 2ITNA 3F3WA 4X2FA 2JKQA 3NCZA 3PZEA 4L42A 1GZKA 4FSUA 4FKOA 1OKWA 4YZMA 4KBCA 4EOKA 4CZTA 4YJPA 5FDXA 3A7JA 2WU7A 4OLIA 3MJ1A 2ONLA 2CKEA 3SD0A 2R2PA 1PMUA 3QTWA 4YJUA 3TEIA 3W2OA 4ERWA 4D4RA 4RVMA 2W06A 4FKWA 1WBTA 2HY81 2R0IA 3KY2A 4W8DA 5CLPA 4ARKA 1W7HA 5HNGA 4BI2A 4DH3A 4DEDA 3K54A 3EQFA 4I6FA 4OBPA 2QI8A 3OS3A 4MYGA 4RC4A 4UZHA 4YLJA 5E1SA 4RFMA 2OWBA 4U8ZA 5EH0A 2A1AB 4YP8A 3RPSA 4C4IA 2GNHA 4KSPA 3OEFX 3SRVA 3EN7A 3IDPA 3BHHA 2XIZA 4F6SA 2WTCA 4ANSA 5ETCA 5L2IA 4PWNA 2ZM3A 5LVOA 4GJ2A 1YI4A 3BE2A 3P08A 2BKZA 4AP7A 2FUMA 3FAAA 4DGOA 4O0XA 2C3JA 4QMUA 3ETAA 3O8TA 3MPMA 1H1WA 3WZKA 3QQLA 2PVMA 2J4ZA 3VS4A 3RM7A 4M14A 5HE2A 3SOCA 2F57A 5E8WA 4PV0A 3UNZA 2YIQA 2YJSA 3I5NA 5CSPA 1Z9XA 3DLZA 3SQQA 3QZGA 4XNEA 3POZA 1NA7A 2BCJA 1XQZA 3O7LB 3PRIA 3ZSGA 3C51A 1Q8TA 2YISA 5HVJA 3QZFA 2P33A 3G9NA 1WBSA 5HCYA 3GQIA 4F9AA 4FL1A 4J96A 2FH9A 5AWMA 1UU8A 3LCOA 3VUIA 2CJMA 4MF1A 3BZ3A 3QZHA 5E8VA 2OKRA 2LAVA 4E8AA 3MA6A 2WQNA 1UWJA 3QQGA 3QTRA 4DN5A 5KKRB 3PVUA 1UU3A 2J51A 1TQMA 1W82A 4X6RA 3UODA 4FZDB 3LFDA 2YITA 2X81A 4E5WA 3BLHA 3KCFA 1CM8A 2VTSA 1Z57A 4NCTA 4PRJA 2VO3A 2X0GA 3WF6A 2WQMA 1URCA 4IE9A 4X2GA 3PPKA 3RNYA 4L8MA 3NR9A 4A4LA 4QNYA 5IA1A 4ENXA 4GK3A 1B38A 4RC2A 2X2KA 3AD4A 1MUOA 1YWNA 3PSDA 4JDKA 3UQGA 3RMFA 2C3LA 3TCPA 4C4GA 1OL6A 1WAKA 1JOWB 2R3QA 1TQIA 1AD5A 3F3ZA 3QWJA 4Z16A 4M13A 4IC8A 5DR6A 3ZM4A 2BHEA 3EFWA 1IASA 4F0FA 4S31A 4FT7A 1PHKA 2VWVA 5EKNA 2VWXA 3SX9A 3F5GA 1XHAA 3NEWA 4BCMA 2BDFA 1REJA 3L8VA 1M14A 5F9EA 2YM6A 3UMWA 3ZLSA 1Q8YA 5JFXA 3EFLA 4C57A 2ZDTA 4FVPA 4MBIA 2BDJA 4XLVA 3CKXA 3P0MA 5EW9A 4N70A 4WG4A 2XB7A 4I41A 2J6MA 5FGKA 4KIKB 4M7IA 3FY0A 5F1ZA 2QHMA 3O2MA 5IH6A 1XH7A 4FOCA 5C1QB 3A4PA 4QMLA 5JSMA 3OCSA 3ORXA 3OUNB 5IZFA 2OH0E 3CLYA 5CU2A 1J1BA 4X3JA 3ZOSA 4IANA 1NVRA 4BWXA 4BDAA 4ACDA 5ANDA 5K5XA 4CV8A 4I6HA 2RFSA 4MHAA 5FQDC 3OXZA 4MWHA 4ZTNA 3OWLA 5CT0A 3W2QA 4ZS0A 4BF2A 5HGIA 5FEQA 4UV0A 4I22A 3VNTA 1TKIA 2PVRA 4AU8A 3R21A 4BI0A 4JIKA 5DMZA 2JBPA 3Q3BA 3CCNA 4IQ6A 4KRCA 3VS7A 5CS6A 1Y91A 3L9LA 3Q53A 4H1JA 3W18A 3VBTA 3L1SA 3P7AA 5CALA 5CI6A 4DEEA 1E1XA 4IZAA 3NCGA 4PTGA 2JIUA 4BTFA 4HOKA 3FMMA 1H1SA 5KUPA 2BZKB 3PE2A 4AW1A 3KC3A 1PXKA 3CIKA 3H9FA 3N51A 4LQMA 5DT0A 2UW8A 2JDSA 5J79A 5I3OA 4A9UA 3BIZA 1R0PA 4MNFA 3D83A 3WBLA 1GZ8A 2YCSA 3NUPA 1H27A 3M42A 3GC9A 4O0VA 5EHLA 4DG3E 4BN1A 1OIQA 3WZUA 5IA2A 4BDIA 3EJ1A 3VS6A 3KXGA 4YPDA 3R73A 5DWRA 1YDTE 4E6CA 5A4TA 5EW8A 3DCVA 3GC0A 2ITTA 4GW8A 4RIYA 4A4OA 3L9NA 4KIKA 1JKSA 3FE3A 3KGAA 3QYZA 2ITWA 4WT6A 1ZYDA 2R7IA 4WSYA 2YN8A 4R5SA 4IFCA 3SW7A 3EQHA 1VZOA 2G15A 1ZZ2A 2YHVA 2GPHA 4BTJA 4NTSA 4AW5A 4I24A 5AAEA 4D2VA 3BPRA 5T68A 1XBCA 4V05A 3PXYA 3QHWA 2ZB0A 3MYGA 3IKAA 1ZARA 3HYHA 5AP5A 4EC9A 1OECA 2WKMA 2XKCA 1E9HA 3H9RA 3FMEA 3QXOA 4ZOGA 5HCZA 4F4PA 4PP7A 4UMUA 2IJMA 3FYKX 5JGBA 1GNGA 5CYIA 4RFYA 1Q5KA 4CRLA 5CTPA 3R1NA 5L2WA 4APPA 2UZLA 3OXIA 4FUYA 3RPRA 3DKCA 4DEIA 4L3JA 1JAMA 5EFQA 3W55A 5ANEA 2EB3A 3OWKA 1UA2A 2BILB 2JFLA 3TNIA 4ANMA 4HYIA 3VVHA 4ZLYA 4RWIA 3IQ7A 4F7NA 5LOHA 4GG7A 4L6QA 4DAWA 1ZYJA 5DEWA 4EC8A 3FHIA 4OTPA 2HZ0A 1Q97A 5HESA 2W1GA 3DNDA 4X2NA 2B9JA 3IW6A 5HTIA 1RW8A 5EI6A 2XMYA 5JFSA 3FSFA 3JVRA 1QPJA 3GC8A 2UVXA 4FTKA 4JVGA 3UIUA 4X2JA 2XNEA 3F2AA 1F0QA 4I92A 2G1TA 4LMNA 4WSQA 4F65A 5BUEA 1YOJA 2HK5A 3CQEA 5CEIA 3DNEA 3TT0A 4S34A 2JGZA 3V51A 4FTLA 3AT2A 3IGGA 1FGIA 2B55A 4HCTA 4L3LA 4QP8A 4RWKA 1P4FA 3HA8A 4FV7A 3OMVA 4HVGA 4FA2A 5I9WA 4PX6A 3HV3A 2VNYA 1Y6AA 3G0FA 4TRLA 4BCHA 2PVJA 4KBKA 3UOLA 3FV8A 5EOLA 4JBOA 5LCKA 5JT2A 2GU8A 3PA4A 5HOAA 1WVYA 4UBAA 3NPCA 1PKGA 2UW4A 3ANRA 2EUFB 3F7WA 3FZ1A 4J8MA 1S9JA 5J1VA 5DHJA 2VWIA 4ZSGA 4KA3A 5L8JA 3RPYA 5EHOA 3BYMA 4RIXA 3NS9A 3PZHA 5EI8A 3NDMA 3VAPA 2WPAA 4LM5A 4LRKA 2OO8X 2XBAA 4CD0A 5HTBA 4M84A 1JQHA 4FIHA 5CVGA 1IA8A 2R3OA 4FZFB 2R3GA 2VUWA 4MD8E 3TV6A 5CX9A 1VJYA 3QD2B 2ZV9A 1QMZA 4N6YA 4E4NA 4YLLA 4JS8A 2BPMA 4D5KA 2WQBA 1JSUA 4WRSA 5ETFA 5CEPA 4YZ9A 3O8UA 4NFMA 3MBLA 4FKVA 5CQWA 4XLIA 3UYSA 3UDBA 4BHNA 2GSFA 4AN2A 4U81A 1APME 2VTIA 5LMKC 3I4BA 2QHNA 4QTEA 2BFYA 2UZOA 2YIXA 4Q9SA 3RP9A 4RT7A 5IMEA 5A14A 4ZTLA 3H0YA 5CF5A 2E9UA 2Z7QA 3FHRA 4OAVB 4JJRA 3BYVA 2BIYA 4E93A 1YW2A 3UVQA 4F0IA 3QUEA 3OROA 5H8BA 2C5OA 4IJPA 1MRVA 4RIOA 2YABA 2QD9A 2VV9A 2XP2A 3V04A 4RJ4A 4QMYA 2XBJA 3LCSA 2VTHA 2Y6MA 3CBLA 2C6EA 4FVQA 3COKA 4EL9A 4EK3A 5FEDA 3EL7A 3FMHA 4FTRA 4CMUA 2E9PA 2WELA 5BVNA 4M0ZA 2OXDA 3TUCA 2F2UA 5AR2A 3VS2A 5LWNA 3PPZA 2E2BA 4G9RA 2FSLX 4FMQA 3SLSA 4HGSA 3RJCA 4C33A 3L9PA 4I5CA 2GS7A 4RQKA 2YIRA 3OG7A 3UG1A 3PWYA 4JOAA 1M17A 3F61A 3K5UA 3KMWA 4ZJIA 4DH5A 2HAKA 4FNYA 5L2TA 5M44A 3WIGA 1FINA 4UX9A 4MH7A 2ZV8A 4FTMA 1YWVA 3SOAA 4TYIA 4I0RA 4P5QA 3ZHPC 2C6DA 4AQCA 4FT0A 5FM2A 1X8BA 5ANGA 4JG6A 1LEWA 5HIBA 2I0EA 3A7FA 3FKNA 3QFVA 3TKUA 5IEYA 3DJ5A 1UKIA 5BUJA 3M2WA 2Y9QA 4RQVA 4HPTE 1AQ1A 2O3PA 5EDPA 4F6WA 3F7ZA 4DYMA 1W98A 3GP0A 4NIFB 4FKSA 4D2SA 4V01A 2PE1A 4ERKA 5JQ8A 4A7CA 2Y7JA 4FNWA 4FIFA 3KMUA 3NNVA 4GFGA 3THBA 4FSYA 2P3GX 4NW6A 4Z3VA 3QQHA 2CN8A 5AMNA 3F66A 4FKLA 4QMMA 4BIEA 4GT5A 5ICPA 3NNUA 2F7XE 2PVYA 4QMNA 4Y5HA 4CT2A 5HNBA 4DBNA 4BDJA 3AGLA 2W1EA 4GCJA 3Q5ZA 3UVRA 2XNOA 1FOTA 4O1PA 3S00A 4USDA 4E6DA 4XV9A 3WF9A 3WE8A 4FKQA 4E20A 3RBWA 4UZDA 1CKJA 3MY1A 3KRJA 3PA3A 3MPTA 3POOA 4QTCA 4BDDA 4QQTA 4XX9A 5E90A 4JDIA 5DE2A 2ZOQA 3QZIA 1PXMA 4BCOA 4BKYA 2QCSA 4MKCA 5DG5A 3D5WA 5EI2A 3IW7A 5AA9A 5A9UA 4UYAA 3TIZA 5CASA 5LMAA 4B9DA 2ONLC 3SXSA 1RQQA 3JS2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2G2I A;  3PVW A;  3DOG A;  2X4Z A;  4FVR A;  2WMU A;  5AR4 A;  1UNG A;  4S33 A;  3QRT A;  5BQ0 A;  2JAV A;  3V3V A;  3AMY A;  5BVW A;  3P7C A;  3DKF A;  3E8C A;  4F7S A;  3ZH8 A;  3IW4 A;  4G31 A;  4NWM A;  4IH8 A;  4RSS A;  4XCU A;  3LZB A;  5HBE A;  4ZY4 A;  2Y0A A;  3O0G A;  4ENY A;  4BDK A;  3NIZ A;  5C8N A;  3OT3 A;  4AOI A;  4BBF A;  4FTT A;  4Q2A A;  3BKB A;  3R2B A;  5D41 A;  2CGX A;  3BRB A;  4LV5 A;  3RTP A;  4KIQ A;  4WKQ A;  3E8N A;  4XG4 A;  3VUG A;  4RG0 A;  4QP4 A;  4EKL A;  5HU9 A;  3HRF A;  4JRV A;  4IX6 A;  2HEL A;  2YAC A;  4XP0 A;  2WMT A;  4QTB A;  4DCE A;  1L3R E;  2F2C B;  3CS9 A;  4LOQ A;  5M4I A;  2YM5 A;  5M4U A;  5JRQ A;  3Q4U A;  4BHZ A;  2B9F A;  5CEM A;  3SKC A;  2ITV A;  3A7H A;  5G6V A;  1J3H A;  4JIA A;  4ANB A;  4GL9 A;  3COI A;  3WZD A;  4KBA A;  3ALO A;  4GYI A;  3UO4 A;  3MS9 A;  2X8E A;  3NLB A;  4WUN A;  5E7R A;  3U8W A;  4MD7 E;  3SAY A;  2GHL A;  3VJN A;  3TI1 A;  4AOT A;  3ZLX A;  2W9F B;  3Q4C A;  1PMV A;  1Q41 A;  3I0O A;  3V8T A;  4EEV A;  3C13 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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