4BWKA

Structure of neurospora crassa pan3 pseudokinase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
412
structure length
392
Chain Sequence
PKDRRENLQKKLFHMQQLLPNSGLPNLDRWHSLFPLDTKATRNSTCFGYPSWMYKAQNNKNGRHFALRRIEGYRLTNEKAILNVTKEWKKIINANIVTVHEAFTTEFFGDSSLIFVYDFHPLSETLYDHHFPPNKIPENLLWSYVCQIANALLAIHNAKLAARCLELSKIIWENNRIRLAACSILDVLHHDSPNRKTIEELQQEDFVKFGRIILALATNTPTLNFNNIDAALATIVPRYSTQLRGVLEWLIKPSAPGETKTVETLLGGITTHLANFANFVMQESDEKEFHLMRELENGRIARLMFKLSVVNERETGERLLLKLFRDYVFHQVDADGKARLDTNHYLNCLSKLDASSEEQILLTSRDNATVFVVSYRSIRQMLDRAYGELGKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
molecule tags Gene regulation
source organism Neurospora crassa
total genus 108
structure length 392
sequence length 412
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwkA01
5DLSA 4QP4A 3RAHA 1SVHA 2W5AA 5C26A 2HXLA 4JG6A 2XKCA 1BMKA 1Q41A 4LMUA 4NZWB 2WTKC 4QMZA 3TEIA 3V01A 2A19B 3TCPA 1RE8A 4RVTA 3U9NA 3ZYAA 3AC3A 1IASA 1OM1A 4BCMA 4F6WA 3A61A 2F57A 3JPVA 4E3CA 2QR7A 3DK6A 4QMTA 2FA2A 4OLIA 3SC1A 2WMRA 3VUGA 3CIKA 4H3PA 3TTIA 3QX2A 2RG5A 5CSPA 4FNWA 4GFMA 4GVJA 5ANGA 3PLSA 3ZFXA 2WMSA 1FMKA 5D7VA 5CXHA 3IGGA 3VVHA 3AC5A 1REJA 2CN5A 3QTSA 2BKZA 4FIEA 3QTQA 4II5A 3OHTA 3CD8A 2PK9A 3F3ZA 2X7OA 3PXRA 3QTIA 1QL6A 2W5BA 1M2PA 2HW6A 3CC6A 3N51A 4IIRA 4BB4A 4BDDA 5D1JA 3PTGA 4XG8A 2F2UA 2RIOA 5EKOA 3A62A 3UPXA 1PXJA 3OWKA 3PRIA 2UZTA 1GZKA 4TW9A 3KMMA 3PIXA 3RVGA 5AP4A 2WAJA 4XOZA 3QRJA 2FSOX 2OZAA 3ZRMA 4I0SA 3I6UA 2O65A 4XP2A 4FEQA 5TOZA 5EI2A 4GU9A 5HCZA 2QCSA 3RHXA 4I41A 4RJ5A 5BMSA 3KK9A 3PWDA 3VS2A 3QALE 2X2KA 3GU6A 4R1VA 2PMLX 5ANDA 3V5LA 3MY0A 2RKUA 2EB3A 3SD0A 4U5JA 2F49A 1OPKA 3ORPA 1G5SA 1OIUA 4DC2A 3CQWA 3DKGA 2XNGA 5AM7A 4C33A 1PXIA 1U54B 3CEKA 2UZOA 1MRYA 3A60A 4QQCA 2RF9A 3VBXA 3AMAA 4MF1A 5DEWA 3ZZWA 4AE6A 1CDKA 2P4IA 3A7HA 5A9UA 2A0CX 4RWKA 1XWSA 3L9NA 4BN1A 4YBJA 4D2VA 4GUEA 5LXMA 3IW6A 4G5JA 3MSSA 4IACA 4FT5A 4IZ7A 4JI9A 1ZZ2A 2Y6MA 3PXFA 1KE9A 1P14A 2JIVA 3DU8A 3WARA 4AW2A 2YM3A 5LQFA 1YDSE 3SOAA 3U9CA 3P79A 3QRUA 4L3PA 1PYEA 4L67A 3QWJA 4P2KA 3TKUA 3VJNA 4G3EA 5ETIA 3F3TA 2QO2A 1MRUA 1KE6A 2ONLC 2GU8A 2YCFA 4ZSGA 2Q0NA 1PF8A 3R21A 1XBBA 3QHRA 4J96A 3TUBA 3VHKA 4BL1A 5DHJA 4D0WA 4EJNA 3VUMA 3LE6A 3O51A 4GCJA 4EH8A 4FA2A 1I09A 4RC3A 1PYXA 3TI1A 5CF4A 3POZA 2ITWA 5JN2A 1SM2A 5KHWA 5BUEA 4C8BA 4IVBA 2OF4A 3EQPA 3RAKA 5BPYA 2XBJA 3FKNA 5IZFA 4IBMA 4EOIA 2PL0A 2ZV9A 3RWQA 1H1SA 1GY3A 1R1WA 4BDKA 3RPYA 3VUDA 2IVUA 2IJMA 4RIYB 5AIKA 2IZRA 3RTPA 5HO7A 1BI8A 3QLFA 2QOQA 4ASEA 2JFMA 3V5QA 4PDPA 4ERWA 3OZ6A 3EFLA 3GNIB 5ANEA 5AP7A 4G17A 2C47A 3BCEA 2WU7A 3BYUA 3DLZA 2ERZE 3HRCA 2OG8A 3JY0A 4U0IA 3DQXA 4IWDA 5L2QA 4ZJVA 3F61A 4NIFB 3ZUTA 4IDVA 3OWPA 4R3RA 1V0BA 2PVYA 1DM2A 3LCOA 4BCOA 2HZNA 4YPDA 4XX9A 5D41A 3UTOA 5AP2A 2BTRA 3OCGA 1UNLA 4BICA 3ACJA 3GU4A 4JX7A 5C9CA 3BRBA 3MB6A 2C0TA 4UWCA 3UIMA 4E6CA 4DFZE 5KBQA 2JFLA 3BI6A 4GVAA 1U54A 4XP3A 3R71A 4TYGA 1YI4A 2FH9A 4N70A 4ENYA 4FSTA 2R3MA 2FGIA 2OF2A 4FVQA 2I0VA 3LOKA 4ITJA 2HY81 1CKJA 2W99B 3I81A 2J9MA 4D2RA 5DMZA 3QQHA 4LYNA 4YGAA 1XBAA 2VU3A 2Z7SA 4QMYA 4R7IA 1XO2B 2RGPA 4RX7A 4H36A 5ANJA 5EM5A 3W2OA 4ZP5A 1M14A 4O0WA 2C6IA 3UVQA 3ZO3A 2HELA 3I1AA 3A4OX 3OCTA 2W1CA 4FKJA 4UEUA 4W9WA 4BHNA 4YNOA 4C36A 4BGQA 4G3CA 4A06A 4AZSA 1JKLA 3RNIA 2QO7A 4XS2A 3DBCA 1PW2A 2W4OA 2W9FB 3HECA 5DRBA 3LM5A 2OXYA 3VW8A 4FODA 4KINA 4YPSA 2OGVA 2HY0A 3B2TA 4CMTA 3V6RA 4APPA 4AZTA 2NPQA 3R2YA 4X2JA 3R8LA 5DPVA 3T9TA 1Q3DA 1HCKA 3CS9A 1Q8WA 3GC8A 3K54A 4FVPA 4IEBA 1Q8TA 2CMWA 2OWBA 3DA6A 3FLWA 2WELA 5A3XA 3R8PA 3QU0A 4O22A 4RSSA 5JT2A 2UUEA 3S95A 3W8LA 1K9AA 4M67A 2G9XA 4YZNA 1BI7A 3TL8A 2XEZA 3NUSA 3QTZA 2YA9A 4JDJA 2XP2A 4RIXB 4RIYA 2VO3A 1V0PA 4NT4A 4L6QA 4AN2A 3KULB 4D2SA 5E91A 5KKRB 5BVEA 4FOCA 1M2RA 4ID7A 4CYJA 4C2VA 2YCQA 4CQEA 5AV4A 2YIYA 4EI4A 3H9OA 5FP5A 4G16A 3RM6A 4D4VA 1DI9A 1O9UA 3VJOA 4Y73A 5IDPA 5D10A 3QD2B 3M11A 5J9YA 1TKIA 3ET7A 5ETAA 2WIHA 3HMPA 4XV9A 4NIFA 2EWAA 5LCKA 2XM8A 2BIYA 3CQUA 3F82A 2BZIB 4IANA 4KIOA 4BDAA 4D2TA 3GGFA 3PP1A 4I3ZA 4HYUA 2UZVA 3R9NA 4F08A 3HMNA 5AAFA 4AXAA 1GZOA 5CF6A 2OIQA 2P2HA 3RI1A 5LVMA 5LVNA 4CVAA 4QT1A 4ASZA 4EKLA 3PPZA 5TO8A 3HUBA 4AWIA 4IH8A 1LUFA 4RC4A 4LV8A 2WQBA 3NSZA 5IMXA 5J1WA 4NFNA 4R3PA 3NX8A 2X2MA 4UMPA 2X9EA 4FSWA 4X6RA 4ACDA 3B2WA 4F9WA 4OAVB 1KE8A 2BFYA 2WMXA 4R3CA 5ICPA 4IVDA 2WTKB 5HIEA 4Z7HA 3LQ5A 4BBFA 4EH5A 4Z3VA 2PSQA 4EEVA 1ZXEA 3DBDA 4GG5A 3W2CA 5EW8A 3QA0A 2GPHA 5EDPA 3G6HA 4ZJIA 2XNMA 5CSVA 4UYNA 5LOHA 4U42A 3D7ZA 4JRVA 2PZYA 4DGMA 4ZY6A 3HX4A 4IXPA 2V55A 4O27B 3LAUA 2ETMA 2XNNA 4BBMA 3TV4A 2I0YA 2XIXA 5A46A 4IM0A 3CPBA 3AC2A 4KS8A 2G2IA 3OEZA 5CU6A 4CMOA 5EHYA 2WGJA 2VN9A 3TNHA 3REPA 5G1XA 5HTIA 4I6BA 2WTWA 3MJ2A 4NU1A 4O1PA 3GCQA 1O6KA 2BUJA 3QQLA 5J87A 4R5YA 5EYKA 1OB3A 1R3CA 2YIWA 2B1PA 3HUCA 3R9HA 3C4EA 4EUTA 4LRJA 4DEAA 3QC9A 4HYIA 4RRVA 4UY9A 4HVDA 3KRJA 5F1ZA 2GS6A 2OZOA 4FL1A 3V8SA 4YBKA 4OGRA 4FF8A 1J1BA 3VBVA 4RIXA 4UZDA 1RDQE 2HK5A 3HP2A 3PG3A 1YWNA 3TJCA 4BTFA 4LL0A 4RPVA 4WNOA 4X3JA 3WE4A 4PWNA 2B52A 3A7IA 4KB8A 1FINA 3AT2A 3DAKA 4J52A 4RG0A 4YP8A 4D9UA 3WF9A 2R3LA 4WHZA 1RQQA 4KBKA 3NYOA 4RA4A 3UE4A 4Q5HA 4QYEA 4QTCA 4QQTA 4AG8A 4TTHB 3C4ZA 2YM5A 3QZIA 3QUEA 3FC1X 4GT3A 2BZKB 4ALWA 4BZOA 4MQ1A 4AX8A 4RX8A 1UKIA 3ELJA 5F4NA 2ITZA 3VQUA 5KMIA 2XK9A 3CTJA 5HHWA 4C58A 4JLCA 4P7EA 4EQMA 3TJDA 2GNJA 4FKGA 2DWBA 2ZM1A 3PZEA 1K2PA 4NJ3A 3WZDA 2HYYA 4NM3A 1QPJA 4I5CA 3DB6A 3NUXA 3PFQA 4FYNA 4H1JA 3BU5A 4JR3A 4O0UA 4GFOA 2FSMX 4PL4A 4E1ZA 4X2NA 3VS4A 4MNFA 4XEYA 4ZSJA 4BBEA 2ETKA 4FKRA 4TPTA 2OIDA 4TXCA 4I0TA 1R0EA 4BCPA 1KV2A 5EK7A 4PV0A 2REIA 4PPBA 4KSPA 4DEBA 4G3DA 3HA6A 4TWOA 5A4EA 4RFMA 1FOTA 2OH4A 3VN9A 5DR9A 4A4LA 2HWPA 2EU9A 4EKKA 5KHXA 3GUBA 2ZB1A 4EOJA 1YOLA 3DPKA 4OTDA 1U46A 4WG4A 4OTIA 2WTVA 3F5XA 3BEGA 3GBZA 4WOVA 3H0YA 5IEXA 5I5ZA 4F6UA 4FX3A 4FTLA 4B4LA 3LJ0A 1JAMA 2GMXA 3EWHA 4BCQA 3ODYX 3QBNA 4CT1A 3BYMA 4YJSA 4H58A 3BHTA 4R7HA 2BAJA 3GQLA 5E92A 4ZSLA 3OUKA 4JQ7A 3ULIA 4HVHA 4Y8DA 4BZDA 2ZMCA 4YJTA 5JEBA 2YM6A 3COMA 4S33A 3DJ6A 2R3JA 2XYNA 4PPCA 3DAEA 5HNGA 4FT0A 4EK4A 3A7JA 4Y95A 4F0FA 3AMYA 4EYJA 3SXFA 2RSVA 5TR6A 3IOPA 1XKKA 2ITTA 4I5PA 2UW4A 4FV1A 5J9LA 1JOWB 2JDRA 5TKDA 3AD6A 3G5DA 2XUUA 4I20A 5AA8A 2XBAA 3AT3A 4TT7A 4OBQA 5DGZA 5JFXA 3KKVA 4CSVA 2EB2A 2WPAA 3FV8A 3PVWA 4D2WA 4HVIA 4FTMA 4JVGA 2JGZA 4BVUA 5IEVA 5LMBA 2ERKA 3TV7A 3O71A 3ORTA 1XQZA 4ZZMA 1H26A 2ACXA 2P0CA 4DCEA 3RAIA 3QCSA 3QZHA 3Q32A 4FSZA 5FBNC 2IN6A 4EZ5A 3ERKA 3SLSA 2R3OA 1Y8YA 3IW4A 3FYJX 5AADA 4JJRA 3OXTA 4L42A 5GNKA 1WBWA 4MXYA 2YDKA 4WBBB 2HAKA 2QHNA 3PXZA 3PJ8A 4K18A 5K3YA 4C02A 4HCTA 4BKYA 4X3FA 4JQ8A 2OO8X 3I0QA 4MCVA 4C4JA 3R7EA 4GYIA 4F7JA 4D58A 2LAVA 2WMTA 4NM7A 3DJ7A 3OP5A 3EQCA 4U8ZA 2XIZA 5K5XA 4P5QA 2PZRA 3DY7A 4FBXA 3OF0A 4OTQA 4WNPA 4KKEA 5KZIA 2GHGA 3RALA 4B8LA 4HJOA 4TYIA 1WBOA 1ATPE 3E5AA 5HE1A 4EUUA 1WBSA 4KIKB 3SX9A 1OL5A 3NAYA 4G2FA 2J2IB 2XEYA 2C6TA 1P4FA 4MD7E 3QGWA 2UZUE 5T6KA 1Q62A 5J95A 4EOLA 1PJKA 4D4RA 2ZV7A 4IVCA 3LW0A 3Q60A 4EOPA 3FLZA 1Y8GA 4BHZA 1JPAA 4J95A 4HYHA 5AUTA 4J99A 2QC6A 5HG7A 3QX4A 4EH3A 5IUGA 2B54A 1U59A 3VHEA 2ITXA 5GZAA 4D1SA 4XCUA 3EOCA 4JDHA 2VO0A 5KO1A 5C03A 3OW4A 4HNIA 4C38A 1XH7A 4QP7A 5CEIA 3W10A 3WBLA 3R22A 1ZMVA 4GS6A 1MUOA 4J1RA 1Z9XA 4BWPA 3VQHA 3GC0A 3LFDA 2X4ZA 3DNEA 4FKIA 2Q0BA 3SDJA 3ZU7A 4YC6A 4UN0C 4E26A 2YISA 5AP3A 5CANA 2W1FA 3MN3A 2CLXA 3CP9A 4KS7A 1BLXA 3PUPA 1SMHA 3GB2A 3R83A 2WB8A 4XYFA 3KB7A 4RBLA 4RFYA 2VTOA 2F7EE 4DEDA 3WOWA 3RPVA 3VAPA 3UPZA 2R64A 4BI0A 3PE1A 1M7NA 3LM0A 4H3BA 4CMUA 3FLSA 3MWUA 4JR7A 3TT0A 2QLQA 3VO3A 2I40A 5AR7A 1I44A 4FNXA 2QG5A 4W9XA 2QOFA 2B9JA 4XP0A 3HDNA 5AUUA 4QQJA 2ITUA 4F6SA 2JITA 4GMYA 5T3QA 3C0GA 3G9LX 3H3CA 2IVSA 4M66A 5AUZA 3VW6A 4NTTA 3V04A 4YJRA 1NVQA 4CFNA 4F64A 4AS0A 4BTKA 5CI7A 5HNBA 2Y4IC 1M17A 5EOBA 2JAVA 1ZYDA 5I9YA 3ORNA 5L6WL 3SAYA 4WSQA 3ETAA 4EQCA 3FC2A 4LGHA 3IW5A 5HG8A 3ZONA 4TYHB 5FXSA 5H9BA 3ZMMA 3UIUA 4APCA 2XJ0A 3MVLA 3CKWA 3Q2MA 5DOSA 4U45A 3MFRA 4FNZA 2WQNA 2P3GX 2P55A 2VD5A 2Y4PA 3NGAA 3R73A 4I21A 4O96A 4BDCA 4J98A 4KIKA 3RBWA 4YHJA 5EDRA 3UZTA 3EHAA 2YAKA 5C27A 4I5HA 2IVTA 3E62A 1UU8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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