4BWPA

Structure of drosophila melanogaster pan3 pseudokinase
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
409
structure length
386
Chain Sequence
PLEVENYHALYPLEPPAQPLHAKLTFPATTYRATHNTTGYKYCLRRIHGFRLQSTKCMTLVEMWKKLQHTNVVQLREVFTTKAFGDNSLVLVYDYHPGSQTLLAKYFTPAPRTSNGPLLPEATIWSIIMQLTAGLKAIHHAGLACKVLDPTKIIVTGKRVRFSSCCISDITQFDPNASNPLALVNMHQQDDLTALGRLVLALACRCLQSVQRDNVQSSIDMVTRNYSTDLRNFIVYLFTTNNRRSVTDLMPMIGARFYTQLDALQSKIDMQEDELAKEMENGRLYRILVKLNSINERPDFNLDCTWSETGDRYMLKLFRDYLFHSVTEDGRPWLDHAHIVQCLNKLDAGSIERVQLMSRDEQSVLIVSYAELKNCLENAFSELMSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
molecule tags Gene regulation
source organism Drosophila melanogaster
total genus 121
structure length 386
sequence length 409
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwpA01
4E73A 4Y73A 4IC8A 3QKMA 2PVHA 4GU6A 1H1WA 3VBWA 4F1TA 5F95A 1S9JA 4BDKA 2CN8A 1IEPA 4IX3A 2JKOA 3CTJA 5BYYA 4J1RA 3JS2A 4GCJA 1XJDA 5CU2A 1PMEA 5DVRA 4FV0A 4EORA 3CPBA 2R64A 1H1SA 3MBLA 4RLKA 3FV8A 1ZY4A 4D4VA 4X3FA 4TWPA 1OKZA 2ITUA 5F9EA 5JGBA 2RG5A 4JI9A 5I0BA 4HCVA 4FBXA 1J3HA 2BZKB 5F94A 4E6CA 2BFYA 3CJGA 4BKJA 4YURA 2C6TA 2W1DA 3L8XA 4FX3A 2UW9A 4B99A 1ZXEA 2XKFA 5J79A 5KO1A 3ZFYA 3QBNA 3LCDA 3R71A 4U41A 5M4FA 5EYMA 3MVMA 2YITA 4C37A 4B4LA 1W84A 1M14A 5CEOA 4CLJA 2B54A 3F66A 2G1TA 2ZV8A 5B2MA 5D9HA 3W16A 2GCDA 2WO6A 5CWZA 4C4HA 3HV4A 3KA0A 3HMOA 3JY9A 3D9VA 4ZJIA 3E64A 3MW1A 2IVTA 4WUAA 5HD7A 4A4OA 2XK4A 1O6YA 1L3RE 1MUOA 2WTJA 3BQRA 3IW5A 1U5RA 1E9HA 5M53A 5AR5A 4HVDA 3UGCA 3BGZA 3SQQA 4HVSA 4CRLA 4BHNA 5FGKA 1BL6A 4GSBA 5HORA 2UVXA 1Q41A 2PVLA 2P33A 3DU8A 3C4CA 4NTSA 3UMWA 4EJNA 2VO6A 1GZKA 3CY3A 3R1NA 3POZA 3FZSA 2J0MB 4FTAA 4LGGA 3LFCA 3JUHA 4ITHA 3VRYA 3FLQA 3PY0A 1DS5A 1BLXA 1YVJA 5KNJA 2RG6A 4RSSA 4EKLA 3DOGA 3RNYA 1OVEA 1PY5A 4ENYA 3R21A 2W1EA 1DAWA 4XMOA 4O0TA 4FTKA 4YR8A 2ITOA 1PXIA 2HZNA 4ZY6A 1MRUA 5A14A 4ZY4A 2VTSA 1O9UA 4FT0A 4KS7A 2QO2A 5A6NA 3DTWA 5BUIA 3ODYX 3TNQB 4C4IA 4YBJA 4AGDA 4BDIA 2JDVA 1EH4A 3PWDA 5CLPA 5CYIA 2OG8A 1AGWA 4PDPA 3W2QA 5K9IA 3Q6UA 4UBAA 3G33A 4X2FA 3D7TB 2X9EA 3GC7A 4ZJVA 2VWWA 1YKRA 4C59A 3I7BA 3ZBFA 2C68A 3KFAA 4RJ4A 4C33A 4BI2A 2FVDA 4LUEA 5EFQA 3SXSA 4JL9A 2IZUA 2PWLA 4QMVA 2VN9A 4IX4A 4NKSA 3VW8A 5DN3A 4RFYA 3W1FA 4DEBA 3UZTA 2BZJA 5CX9A 3R9DA 5CAVA 2V7OA 3EN4A 2J51A 4RIWB 1IRKA 3M1SA 4KA3A 5IA2A 2RIOA 5CU0A 2OO8X 2VNWA 1ZYDA 3V5WA 1M2RA 1KE5A 4PTCA 3ZSHA 3ZBXA 4IX5A 1URCA 2NRYA 2W9FB 5IDPA 4C4EA 5HO6A 2C3KA 3HA8A 5KX8A 2VGOA 2CGXA 2HCKA 4IWDA 3C4FA 3FMMA 3EMGA 3QUDA 5HBHA 4Q2AA 2KULA 2A0CX 3DA6A 2PZIA 5JFVA 2XK3A 4IVDA 1JKTA 4F0FA 3PJ1A 4NH1A 3RZFA 4TNDA 2YABA 1LP4A 5CAQA 1BMKA 2UZTA 1YDSE 4U81A 3ALNA 4AP7A 4U3ZA 3TV7A 4CRSA 5J1WA 3R2YA 4YGAA 1VYWA 3CD8A 2PUUA 3GC9A 4HYIA 2NPQA 3UOLA 3DK7A 4D4SA 4YPDA 3FHRA 2ZB0A 2W5AA 3UODA 3DBCA 3DS6A 5IPJA 2E2BA 2R3GA 4I3ZA 5EYDA 3RPOA 3NRMA 3U6IA 4EOJA 5A6OA 3EYGA 3Q9ZA 2ITXA 2GS2A 3H4JA 2E9UA 2GNLA 3QHWA 4FT7A 4MAOA 4MX9A 4X3FB 3H3CA 3OWPA 4G3DA 1F0QA 4XV9A 3RCDA 4HCUA 4BTJA 3UOHA 2VTQA 3UVRA 4HJOA 4RWLA 3OUKA 4YNEA 4O6LA 4W4VA 2C6KA 4BI1A 3MIAA 4KBKA 2ZOQA 4WUNA 4KRCA 5CSXA 4ZTLA 4C3RA 5HBJA 5L8JA 5TOZA 4ZSAA 4RQVA 4EZ5A 2Z60A 4ZSLA 1SM2A 3ZXTA 3W2RA 4NM0A 2RFSA 4QP6A 3LJ2A 3FBVA 4KKHA 2GDOA 4QMZA 3QWKA 3RPSA 3O8PA 4EC8A 3IK3A 5D7VA 2O64A 3EQPA 4FKUA 3TZ9A 3VUDA 4BCPA 3LCOA 4HYUA 3LPBA 4EHZA 4QQJA 4YHTA 5HTBA 1ZOGA 1TQPA 4IVCA 5ITAA 4NFMA 4A9RA 3C4XA 3ZONA 1H0VA 1KV1A 3OWKA 3P86A 3W10A 3LXNA 4FV6A 3PIZA 3RI1A 4L52A 1WCCA 4TYHA 4ITIA 2FGIA 1IASA 4E26A 4WO5A 3PVWA 3GU6A 3OY3A 4RZWA 4ACCA 4U42A 5ETCA 4C4GA 5AUUA 4C0TA 5BVFA 4E3CA 4IADA 3ZFMA 3P7BA 1X8BA 2W1FA 2WOUA 3L1SA 3QD3A 2F7XE 4K8AA 4BN1A 4MNEA 1CKPA 2ITQA 1I44A 3OCSA 4GIIA 2PE0A 4MEDA 3CY2A 4IAZA 4BDEA 2V55A 3UIXA 4A06A 2XK6A 3OXZA 5CANA 5GZAA 2X4FA 5EI6A 5K3YA 3PJ2A 4LRMA 5JGDA 4QD6A 5C1QB 3A61A 3E8CA 4YTCA 4MXCA 2VWVA 2F2CB 3FE3A 1J1BA 5LMKC 4AN2A 4QYHA 1U5QA 3KF4A 4RFMA 2QHMA 4D2TA 3NDMA 4FNXA 4USFA 2JITA 3VQHA 3DJ7A 4FSQA 2OFVA 4JDHA 5FEEA 3QU0A 4UZHA 2F7EE 4DFYA 4EQMA 3NWWA 4O6EA 3EWHA 3WF5A 2CHLA 5EI2A 3IQ7A 4QYYA 3Q04A 1QMZA 2VTOA 2YFXA 3GU5A 5I9UA 1R39A 4U43A 5CAUA 3ANQA 4ZSJA 1YOMA 3BHVA 2HENA 4P5QA 2RSVA 1XQZA 1KE8A 4MYGA 3MDYA 2R0UA 3C0HA 4FK3A 4NM5A 4R5SA 4AT3A 3I0QA 3U4WA 1XKKA 2OWBA 2Q0BA 2QOOA 3OEZA 3IKAA 2GNFA 3F5XA 4FTTA 3QRUA 4IMYA 4A9YA 4B7TA 4DG2E 3H0YA 3PFQA 5AMNA 2GS6A 1CKJA 3PSBA 3PTGA 2PZPA 2WAJA 3DQXA 4RX8A 3TI1A 4BCNA 3BE9A 1OKWA 3IGOA 2C5YA 2IVSA 4DGGA 4BBFA 3NUPA 4BDFA 4ZLOA 2B9JA 5TR6A 2IN6A 5IA0A 2JBPA 4C62A 1XBBA 1YWVA 5HGIA 3MI9A 4FTRA 4A9SA 2XIKA 3BBWA 3R0TA 1ZOEA 2Z7LA 3QALE 2IZRA 2BHHA 3BPRA 4BCHA 4ZTRA 1OPLA 2WEIA 4FSNA 5G6VA 5H8BA 3HEGA 2WMVA 1V1KA 3CP9A 3ZO2A 4RWIA 3OTUA 4BKYA 2YEXA 2WZJA 3FKNA 4FKOA 4M14A 1CDKA 4WSQA 5JN2A 1QPEA 5FTQA 2HELA 1MRYA 4NIFB 5LVLA 3TV6A 1Q4LA 2C6LA 4Y8DA 5HE0A 3DB6A 4ENXA 2J5EA 1FPUA 2C0OA 2PVMA 2X8DA 3QFVA 4FNWA 3MVJA 2XF0A 3OCTA 3WE8A 1ZMWA 3PA3A 1SZMA 4QMUA 4QTBA 3DKFA 3R22A 3S4QA 3D5XA 3DCVA 5JKGA 3TJCA 3AQVA 5HO7A 5HU9A 3DJ5A 2G2IA 1ZYCA 2P3GX 3QGYA 4H1JA 2PVJA 4RX9A 4C38A 3PPJA 2XYUA 4FNZA 4IAKA 3RK7A 5F1ZA 4BCFA 4J99A 2R3HA 2FSLX 4I6QA 5FP6A 3EIDA 4AOTA 4PMSA 4QOXA 4E6DA 3BU5A 5LQFA 1UU9A 3I4BA 2W99B 2CGUA 5I3OA 4CFFA 2WPAA 4TN6A 3ORLA 4F63A 4WNKA 5CT0A 1YHVA 4LYNA 4D1XA 4D55A 3OMVA 3R9HA 3C1XA 4RJ5A 4ZAUA 4DGMA 1FVTA 3CJFA 4QMWA 3DK6A 4RJ3A 4OTFA 3T3VA 3QZHA 4U44A 2FUMA 5CXZA 3GENA 4C2WA 4CKRA 5KHWA 5D1JA 3EL7A 2PMOX 4ASZA 2R7BA 4D0WA 5AP2A 4DEAA 4LOQA 4N4SA 2GNJA 4BDHA 5A4LA 2JIUA 2J0LA 4BZOA 4FNYA 3FI4A 2A27A 4AE6A 3QZGA 3UP7A 4F7JA 4EOQA 2WMSA 3QLGA 4AS0A 2YCRA 1XBCA 1YXXA 4IXPA 2JKQA 4HVGA 2AC5A 4GFMA 5DGZA 3MVLA 3ZLXA 4UWCA 3BV2A 3ZC5A 3PE1A 2WTIA 5L2IA 5FRIA 4I23A 3TG1A 4UMTA 3SX9A 3Q53A 3GCUA 3RPRA 3PSCA 3CE3A 3IOKA 3FLNC 3K3IA 3ORKA 5DT3A 5FBNC 2JIIA 3VS4A 5GJFA 5J87A 2V7AA 3DTCA 4XHKB 2OI4X 4O2ZA 5AUYA 2QOBA 2C5OA 4DEHA 3BU6A 3KL8A 4U9AA 3N9XA 3C5UA 3SDJA 3QD4A 1WZYA 2WB8A 4R8QA 4AXAA 3EN5A 3Q6WA 4QP4A 3HMNA 4ASDA 1SNUA 5K5NA 4BCMA 4JDKA 4XOZA 3WBLA 1SMHA 3MPAA 2B4SB 4D4YA 2OJGA 3G0FA 1TQIA 3REPA 4DH7A 5T3QA 2YN8A 3F3UA 3VBTA 5AV1A 2C47A 3D94A 5ANKA 5CVGA 4EK8A 2VWIA 4FZ6A 4NFNA 4XRLA 5E8XA 2YIXA 3ANRA 4M97A 3VS1A 4I21A 2OH4A 3QQGA 2UW6A 3VS5A 4L7SA 4JX3A 4IJPA 3EH9A 3LVPA 3RALA 3R8LA 3NLBA 4TPTA 3E63A 2XB7A 4IH8A 4FKSA 3DXNA 3ULIA 2X7FA 5FQDC 4FV5A 2Z2WA 1MQ4A 1BYGA 4LGHA 2F4JA 2J0JA 4EUTA 2CGVA 2QOQA 2R3JA 2OIBA 3EZRA 3SD0A 5C26A 4KRDA 3SC1A 3R8MA 4X0MA 2YDIA 4MQ2A 4I5MA 4DH5A 2W4KA 3VNTA 5AP0A 3II5A 3ZUTA 2I0VA 4O21A 4IE9A 3MY5A 2WU6A 1ZWSA 2PVFA 2YDJA 2PSQA 2CCIA 3KXXA 4HZRA 4M69A 4RIXB 4X2JA 3SHEA 3UYTA 3V5LA 2OIDA 2X81A 1P4OA 4PL4A 1XO2B 4FIHA 2C1AA 4FZ7A 5CU3A 4M3QA 4BTMA 4HGEA 4NM3A 1UU8A 2WKMA 4CLIA 3Q52A 1U46A 3BYOA 3LFAA 3GBZA 1JSUA 3MY0A 3CTQA 5EW9A 1V0OA 2A19B 2BTSA 3VHEA 4AZVA 5I9WA 4GV1A 3PVUA 4F70A 2XS0A 3VBQA 4BWPA 4B8MA 3U4UA 4MQ1A 4F6WA 1KV2A 3NPCA 4BWXA 4XS2A 1FOTA 4G6OA 4X2KA 2VTAA 3LAUA 4W8EA 1FINA 3HL7A 5KMIA 1S9IA 3Q60A 2R3MA 3ERKA 2ETMA 2YAAA 2YERA 3LJ1A 4FYNA 5DRDA 5AEPA 3W2OA 5C03A 3FC1X 1YXTA 4EHVA 2GTNA 1WBTA 4KAOA 2X2KA 4FKQA 3W2PA 1UU7A 4MXYA 5FXRA 1DAYA 5CXHA 4TWNA 4ZY5A 3AMBA 3I5ZA 3WYXA 3UC4A 3C50A 3FQEA 3N51A 4YTFA 2R3LA 5HX8A 3R63A 4QMOA 3VUMA 3E92A 5A4EA 4FF8A 3R04A 4J8MA 4C57A 4FGBA 4F0IA 4GT5A 3GNIB 2R3IA 2R2PA 2XKEA 3FZ1A 5M57A 5HI2A 5HNGA 3R7UA 1R78A 4J98A 5JFWA 3PJ3A 4FIEA 3K2LA 4GRBA 5EW3A 5M44A 5G1XA 1O6LA 4WD5A 1ZAOA 5H9BA 2FH9A 5HU3A 4D2RA 5EHOA 4TWOA 5JQ8A 4ANBA 5FLFA 2C5VA 5IDNA 3PY1A 4D5HA 1WAKA 5HLWA 5BUEA 2FSMX 3I6UA 4PPBA 5LMBA 2WHBA 4MNFA 4DFLA 2VX0A 4H3QA 4N6YA 2ERZE 3EFJA 3QRIA 4WNMA 2DWBA 3O23A 4CZYB 4R7HA 3SVVA 2CPKE 4WG4A 5HICA 3DAJA 2UUEA 1OUYA 4I6BA 3ACJA 4AU8A 3DKGA 4ZZMA 4Q5EA 2OJ9A 5CSWA 3R7IA 4G3CA 3LFFA 5FP5A 2YCFA 2J4ZA 2YM3A 4FTMA 4AGUA 3S1HA 2BZIB 3SXRA 3ZS5A 2RL5A 4YC6A 5IA4A 3BHTA 1ZMVA 2ZYBA 3ZSGA 1JQHA 4OTPA 2R3OA 4M12A 4EH7A 2OF2A 1DI8A 5HOAA 4RX5A 3FZTA 5D12A 3NYVA 1GJOA 4FSZA 5HIDA 4FL3A 3QZFA 4CYIA 5CS6A 3BX5A 4MWHA 4H3PA 3DK3A 2EXMA 2JC6A 3MFSA 4HNFA 5HE3A 3QX2A 3BYUA 2WQNA 3AC8A 1REKA 1ZOHA 4HOKA 3C4EA 3Q9YA 3EQCA 3KK8A 5AAFA 4XG2A 5GZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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