4BWPA

Structure of drosophila melanogaster pan3 pseudokinase
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
409
structure length
386
Chain Sequence
PLEVENYHALYPLEPPAQPLHAKLTFPATTYRATHNTTGYKYCLRRIHGFRLQSTKCMTLVEMWKKLQHTNVVQLREVFTTKAFGDNSLVLVYDYHPGSQTLLAKYFTPAPRTSNGPLLPEATIWSIIMQLTAGLKAIHHAGLACKVLDPTKIIVTGKRVRFSSCCISDITQFDPNASNPLALVNMHQQDDLTALGRLVLALACRCLQSVQRDNVQSSIDMVTRNYSTDLRNFIVYLFTTNNRRSVTDLMPMIGARFYTQLDALQSKIDMQEDELAKEMENGRLYRILVKLNSINERPDFNLDCTWSETGDRYMLKLFRDYLFHSVTEDGRPWLDHAHIVQCLNKLDAGSIERVQLMSRDEQSVLIVSYAELKNCLENAFSELMSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Gene regulation
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
total genus 121
structure length 386
sequence length 409
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwpA01
3IPHA 3O0GA 3C0GA 3WF7A 4UWBA 3LMGA 4JG6A 4FOCA 5M51A 4GIIA 1OPKA 4PDPA 4PWNA 4TYHA 3GNIB 4FBXA 3NAXA 3GVUA 2RFEA 4BKZA 3BHYA 3F6XA 4QMYA 2YFXA 3Q52A 4JIAA 5JFWA 3EQCA 4DLIA 3SA0A 2F4JA 4CRSA 5HTIA 4FKSA 4FKPA 2WXVA 4QMQA 4EBVA 3UDBA 3DAJA 3CPBA 2IJMA 4EK3A 4C4JA 3FV8A 4WNPA 1GZKA 3SOCA 2WMVA 3VUMA 2BAJA 2OG8A 2JFMA 4DH7A 2YABA 3E63A 4U97A 5CT7A 3NDMA 4M97A 1R3CA 1LEWA 3BGPA 1YI4A 3DJ5A 2W06A 3MVMA 3TV4A 1JNKA 2GHLA 2J6MA 4EONA 3MPMA 3ZUUA 3F82A 4WNKA 2X39A 2X8EA 4YNOA 2JBOA 2PTKA 4L45A 5DN3A 4F0GA 5IA1A 1WBSA 3OXIA 3DBDA 4AA0A 3GU8A 2YAKA 1CMKE 2NPQA 4PTCA 1X8BA 3V5JA 3P9JA 4Q5HA 3Q4ZA 3F61A 3HMNA 4YZNA 3UVRA 4NUSA 1HCLA 4PMMA 3D14A 3MY1A 4IWDA 5AV2A 3ZBXA 3A7JA 3FHRA 4D1SA 2A19B 4U80A 4JLCA 4GK3A 5B2KA 4JAIA 1KE6A 5ANIA 1Q62A 4IM3A 2CGVA 2PL0A 3W33A 4XP3A 5AJQA 4USFA 4NT4A 3VS4A 3EH9A 2BVAA 1Q3DA 3ORLA 3OG7A 5GJFA 4FIJA 3BGQA 1V0OA 4L6QA 3O17A 1OPJA 4FNYA 5AP1A 5HORA 3G9NA 2W1IA 4MXOA 4FZDB 4TZRA 4YLLA 2E9PA 4APCA 4IAFA 4GRBA 3HV3A 4YHJA 1P14A 1REKA 4PPAA 2BRBA 4UY9A 4O0RA 4W9WA 3OHTA 3TNPC 2GNFA 3N9XA 4JG7A 3ZLYA 3MWUA 5JRQA 3AMAA 4N4SA 4XG4A 2YDJA 3VQUA 4FMQA 4K0YA 2VTTA 2XM9A 2OWBA 3WZDA 3PG3A 3LFQA 3VS3A 1Z5MA 2IO6A 3AC3A 5EI2A 2X8DA 5JEBA 4HZSA 2QHNA 4G3DA 1OECA 3BYSA 5F95A 3WOWA 2YM4A 4G3EA 2C6IA 4N70A 1DI8A 3V8WA 5LWMA 1MRVA 3UNZA 3R9NA 3V5TA 4FSMA 4FSTA 4P2KA 4FNWA 5HTBA 4ZTLA 4PL5A 1YHVA 4C3RA 3EQIA 1M2PA 3R73A 1HOWA 4DCEA 3SXSA 3UP7A 4BYJA 1QCFA 1ZY5A 4BCJA 4MXZA 3LFEA 4H36A 2QLUA 3KK9A 5AAFA 3LCSA 3R7UA 1W7HA 3QUPA 3VO3A 4EKLA 5IA0A 3RAHA 4R5YA 4FC0A 3G51A 4U44A 4XS2A 3EKNA 4D5HA 4O2ZA 3BKBA 3E8NA 1SNUA 5J5TA 4CKRA 4DN5A 2X9EA 3C4WA 2J9MA 4O27B 3DAKA 3CD8A 3QRKA 5L8JA 4I22A 2XB7A 3NYOA 2V7AA 4CQGA 3UBDA 3ORMA 3R7VA 3TV6A 2BHHA 3UC3A 2JDVA 3AG9A 1WVYA 1WBWA 3IOKA 3Q9YA 3TN8A 4EORA 2FSLX 2OF2A 4RSSA 4B6LA 2BKZA 3ZEWA 3UIBA 3C13A 4UYNA 4V0GB 3MPTA 4AZSA 4JBVA 4NEUA 2GCDA 4FV3A 5CXHA 3VS2A 5JQ8A 4W4YA 5FRIA 4GCJA 3R00A 4BYIA 2XK4A 2R3NA 4WUAA 4XRJA 5JZJA 4I20A 3NIZA 3IDBA 4N6YA 2XKEA 3G2FA 3G6HA 5LCJA 1XBAA 5ITAA 2OSCA 3CY2A 2Z7SA 4IC7A 5BVFA 4C0TA 2XIYA 3K5UA 4D2RA 4FUYA 1ZXEA 3FZOA 2PZYA 3O8PA 3QZHA 4FIIA 4FV7A 4PRJA 3FUPA 1WBPA 2CGWA 5CS6A 5BVDA 5EDRA 3AC2A 1P4FA 2I40A 2UW3A 3QKLA 3Q4UA 5CY3A 3V5PA 5FDPA 4UV0A 4ZY4A 3K54A 5KMNA 3DK3A 2CCIA 2O3PA 3MA3A 2QI8A 1KE9A 4FV8A 5CALA 5IH4A 2Z7QA 5AMNA 4D58A 1NVSA 3AGMA 2WTJA 3P7AA 4I0TA 2J0MB 4NTSA 2FO0A 4QQJA 5LMAA 3ODZX 3TCPA 2PMOX 5FP5A 2OZAA 3TL8A 5JGAA 4F70A 4A7CA 4CXAA 3MVLA 4TYJA 4G2FA 4DHFA 4EH2A 4WRGA 3JXWA 4M14A 2JGZA 4X0MA 4GVJA 1VYWA 4RX9A 1WBOA 3CS9A 5AUXA 1YW2A 5IDPA 5L4QA 2F49A 4QQTA 1BL6A 5J1WA 4RZVA 1GOLA 3KF4A 3G0EA 3AD4A 2XCHA 4O6LA 1FVVA 3U4WA 4RBLA 4F9CA 4LGHA 4G5PA 4LL5A 5IPJA 3DQXA 2UZDA 3R02A 2O2UA 2PK9A 2V22A 4C7TA 4TWCA 3ZS5A 4BI2A 1H24A 4GT4A 4AN2A 4U45A 2OJ9A 3QCXA 4H1JA 3TTJA 4YGAA 5HG8A 5I3RA 4ALWA 2WMWA 5HE3A 4TN6A 2F7EE 3NS9A 3KRWA 3ODYX 4X2JA 4AW1A 4EI4A 4ZY5A 4YZ9A 5IISA 4OBOA 2ITXA 4L3LA 1JSVA 5HEZA 5C8MA 2J5FA 3AMBA 2B52A 1STCE 2WD1A 1PXNA 1WFCA 3KXGA 4HYIA 3FZTA 4DFLA 1H0VA 2F7XE 5C03A 4B8LA 2C68A 4R7HA 3KB7A 4CLIA 3GUBA 1H4LA 2Y4PA 3PXQA 5TT7A 4YBJA 5I9VA 3U8WA 2YIXA 1UKHA 4ANNA 2QLQA 4LOQA 2ZOQA 4YZBA 5H8GA 4FKLA 2REIA 4BC6A 4EOPA 2ONLA 2XNEA 4RFMA 1Z9XA 4ZSAA 2NRYA 4K9YA 3C0IA 5AR2A 5LOHA 3I6WA 2FSTX 5DRDA 2XCKA 3MPAA 3VUDA 5LVLA 1R78A 1I09A 4XX9A 3RAWA 3AC1A 4AW0A 2PHKA 3C5UA 3LIJA 4NK9A 4BTJA 4IAAA 3ZLWA 5HQ0A 3RP9A 3B8RA 4BDBA 5JN2A 4YURA 5LQFA 2PE2A 3F5XA 2UZVA 4LV8A 4UMTA 5KHXA 4KBAA 1FVRA 3GCSA 3PG1A 4K33A 5CENA 2WEIA 3HV5A 4TWOA 4RIOA 2JIVA 4HCUA 2ZV8A 2I0VA 4WKQA 3AD5A 3NW7A 1JKKA 3BLQA 4BBFA 1SNXA 2B7AA 5DT3A 4KBKA 4AZVA 3P5KA 4FKUA 3S0OA 3FI2A 1ZLTA 2F9GA 3QWJA 4K1BA 3UVQA 2WMTA 3PXFA 4XV9A 2VGOA 4J53A 5B7VA 2DUVA 2R3GA 5B2LA 4YZMA 3GBZA 4HW7A 5J79A 3CC6A 5DA3A 4LUEA 4DINA 1YRPA 3SXRA 4MKCA 2YIRA 4IZYA 3C4CA 4BDIA 4LMNA 4YR8A 4RIXA 3BHVA 2XP2A 2WQBA 2X0GA 5AR3A 2C6LA 4MHAA 1PXIA 5J8IA 4MNEA 3I4BA 4A4LA 4BGHA 5I9WA 2PY3A 4MD7E 4QYYA 2VO6A 3EZVA 3FL5A 3SDJA 2I0EA 3LXLA 4J8NA 2E9NA 3F9NA 3KRXA 3KEXA 4P4CA 4RA5A 4KB8A 4FTNA 3BYOA 5BQ0A 5LVPA 3HKOA 5FBOA 5KMKA 4TY1A 3KF7A 2NO3A 4KSPA 4CD0A 3O2MA 5HLNA 2BALA 5CVGA 5H8BA 2OW3A 3UNJA 4XG6A 1XBCA 3OTUA 3ZXTA 3QXPA 4EOKA 3PJ3A 2UW7A 2WFYA 4EK8A 2R9SA 3WZJA 4IZAA 3TACA 5CVFA 3O7LD 3Q4CA 4J98A 3I5ZA 4HYUA 3HV4A 1OL1A 3BPRA 4WO5A 3TZ9A 4BCOA 4FR4A 5AX3A 3FQSA 4AUAA 1JKTA 3KVWA 1O6YA 2WIPA 4BTMA 2R3HA 4TYEA 2W17A 2ZMCA 3BIZA 4FSNA 4FICA 3TV7A 2XYNA 1ZWSA 4YJVA 2XEZA 4W9XA 3RK9A 3R21A 3G0FA 4BZNA 2OJIA 3S3IA 2ZJWA 4B4LA 2W1HA 4KIKA 1P4OA 1YVJA 3H4JA 3LCKA 1H27A 4BRXA 3R30A 2F2CB 3UQGA 4W8DA 3GCVA 4L3PA 3EHAA 3WZUA 4R7IA 5H9BA 4BDJA 3SXFA 2XKCA 2Y7JA 2IWIA 2XNMA 4BF2A 5BUIA 2VWYA 3KXXA 4RC3A 2PE0A 4D2PA 4O0XA 4RJ6A 3U6IA 3RCJA 5JKGA 4U41A 1GAGA 2QKWB 2QOFA 4DEAA 5CI7A 3R7YA 5KMIA 4XG9A 4J99A 4AW2A 1H0WA 1SVEA 4UX9A 4Y46A 1ERKA 4XYFA 2J0LA 2F7ZE 1IEPA 4FL1A 4S33A 4BCQA 2HZNA 2WZJA 4FX3A 4PV0A 3TG1A 1ZMWA 1J91A 3DPKA 5CU4A 3UIUA 4JDHA 1WBTA 5I9ZA 2JDOA 1OKWA 3MIAA 3DOGA 3T9IA 5CAOA 2J4ZA 3D9VA 5D9HA 5HO8A 3W16A 5IUGA 3COHA 3OW4A 5LCKA 3TNIA 4FIHA 4P7EA 1CTPE 1GIIA 1ZARA 3NX8A 4KKGA 1H1QA 3IDPA 1PXLA 5ANKA 2BRMA 5M53A 2GNJA 2QCSA 3QTWA 3R0TA 3ZSHA 4IACA 4BKJA 1E1VA 1M14A 3W2QA 4ANOA 5CEMA 3RINA 3SV0A 4EH6A 4JR7A 2QOCA 3LE6A 3FMHA 4MK0A 2O5KA 4R3CA 5HTCA 4AZTA 4JT3A 2QHMA 2ITUA 3PY3A 2Y4IC 1YDRE 1U5QA 3R71A 3VUHA 3OEFX 3NUSA 3OWJA 2X2KA 3BYVA 3FDNA 4J52A 3EQBA 3A7HA 2H96A 3PVWA 4JDIA 4MTAA 2BRNA 3F66A 3Q32A 4NTTA 3I5NA 3ZSIA 4K77A 2ERZE 2XNOA 5DR6A 5EH0A 3UPXA 5FDXA 3WF5A 2OICA 1YWVA 4R1YA 5CNOA 4EWHA 3CQWA 3GFWA 2BTSA 4RJ5A 3TUBA 4CZYB 2YITA 4AZWA 1H01A 4KBCA 4OUCA 5F1ZA 2R3QA 5ETCA 4U42A 2GHGA 3HNGA 4TL0A 1UU7A 2Z7LA 3QZGA 3POZA 4IX6A 4M8TA 2QD9A 3DBFA 4FV9A 1JPAA 4Y85A 3PUPA 4QP8A 2WQOA 2UVYA 1URCA 5FM3A 5HLWA 5HBEA 5AUUA 3A7GA 4X3FC 1PF8A 1H25A 3IGOA 1PMVA 4A9TA 3DDQA 3KVXA 5CEKA 1O6LA 3FJQE 1H08A 4ALUA 2VAGA 3CGOA 4IJ9A 5D1JA 2B9IA 4GG7A 2ZV9A 3ROCA 3LFBA 3QUEA 3A7IA 4WRSA 3ET7A 3QHWA 4IDTA 3TIYA 3E3PA 1SVHA 2B4SB 4E1ZA 5H2UA 5CANA 2WMXA 1WVXA 4JX3A 4RZWA 4XG7A 3OUNB 5L2IA 4ZOGA 4W8EA 1M52A 1PJKA 2WAJA 3EFKA 4RX8A 2GHMA 1H8FA 3O96A 2VNWA 4D2WA 2Y6OA 1BX6A 1V0BA 1XH5A 3M2WA 4F6UA 2QOHA 3D7ZA 3MFTA 2FH9A 3FZPA 3GU5A 5AADA 4ZTSA 4L8MA 1OL6A 4UZHA 4AN9A 4EK6A 5EKOA 5AP3A 4JDKA 5CEIA 5E91A 1AGWA 3F3ZA 4BTKA 4FYOA 1GZ8A 5IUIA 2B9FA 2Y9QA 3UTOA 4F7JA 2BFYA 3BQRA 1WCCA 1B6CB 5T3QA 3HP2A 5E1SA 4QP6A 1XQZA 1YHWA 3PTGA 4OLIA 4YJPA 4QYFA 3OP5A 1UU9A 2PZIA 3AC8A 3L8VA 5ANJA 3L9MA 4DEBA 4U79A 3WIKA 3R8LA 4JQ7A 4YNEA 2OI4X 4I5CA 2C5XA 2GS7A 4YLKA 4YTHA 5DOSA 3LM5A 2AYPA 4KS8A 3O7LB 1OB3A 4IAZA 3B8QA 4XUFA 5CWZA 2JKMA 2Y6MA 2X4FA 5IH6A 3KXZA 3VW6A 3LAUA 1PMUA 5TE0A 3G5DA 3DA6A 2C6KA 3K3JA 3SW4A 4NM3A 5L2QA 2BTRA 3NNXA 4RLLA 3V3VA 2XJ1A 2BZKB 4AOTA 5LMKC 2R3FA 3UG1A 3QQFA 4D4RA 1OIQA 4KIQA 4ZZNA 4ITHA 3RZBA 4G6LA 4GUEA 3MS9A 3MH0A 3NUUA 3R1NA 4CCUA 1V0PA 4J97A 5AV1A 4CVAA 5IZFA 2VTQA 1JSTA 4M15A 4WD5A 5ETAA 3FLQA 2X7GA 5FM2A 4DGLC 3CR0A 4UMQA 4QD6A 1IG1A 4M0ZA 4M68A 4RWLA 4E5WA 1Y8GA 2RG6A 3DQWA 3NYNA 4NM7A 1PHKA 2RL5A 4OTDA 4CFVA 2HWPA 1OPLA 4GVAA 4GFMA 3DLZA 3P79A 3WF8A 3DZQA 4CFXA 3NPCA 3LQ8A 5ACBC 3NNUA 4E73A 5DEYA 4BVUA 4PP7A 1IASA 3VJOA 5JFSA 2ITPA 3DLSA 5J1VA 4L7SA 1P5EA 2I0YA 2E9VA 3VBYA 3JS2A 3DAEA 5DI1A 2YA9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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