4BWXA

Structure of neurospora crassa pan3 pseudokinase mutant
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
413
structure length
395
Chain Sequence
IPKDRRENLQKKLFHMQQLLPNSGLPNLDRWHSLFPLDTKATRNSTCFGYPSWMYKAQNNKNGRHFALRRIEGYRLTNEKAILNVTKEWKKIINANIVTVHEAFTTEFFGDSSLIFVYDFHPLSETLYDHHFPPNKIPENLLWSYVCQIANALLAIHNAKLAARCLELSKIIWENNRIRLAACSILDVLHHDSPNRKTIEELQQEDFVKFGRIILALATNTPTLNFNNIDAALATIVPRYSTQLRGVLEWLIKPSAPGETKTVETLMPMIGARFANFANFVMQESDEKEFHLMRELENGRIARLMFKLSVVNERWSETGERLLLKLFRDYVFHQVDADGKARLDTNHYLNCLSKLDASSEEQILLTSRDNATVFVVSYRSIRQMLDRAYGELGKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
molecule tags Gene regulation
source organism Neurospora crassa
total genus 124
structure length 395
sequence length 413
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwxA01
1KE7A 1T45A 3DY7A 3LFFA 3NUPA 4EHEA 2XNGA 4FIGA 4FYNA 2QCSA 3RP9A 5TKDA 3BLHA 4EONA 3NCGA 4FVPA 5GJGA 2IWIA 4CFWA 2J50A 4FIEA 4IADA 1JPAA 4P90A 4KKEA 3PRFA 4XLVA 2ERKA 2BZJA 2QLUA 1Q97A 4IAAA 2QD9A 5LVLA 4BTFA 4EOLA 3O23A 3PPKA 4GT5A 4MD8E 3LVPA 5K4IA 5M44A 3QUDA 5ITAA 1M17A 1UKIA 3GFWA 4D1SA 3ZU7A 3QZHA 4BCHA 3I7BA 3IW8A 3GCUA 2OFVA 5TOZA 3OCSA 3VUKA 3OY3A 4D4RA 4RG0A 5AR3A 3D94A 3EYHA 1Q61A 4QP8A 3V6RA 2BPMA 3TV6A 2CSNA 2FH9A 3Q3BA 3V51A 5E8SA 4C61A 2GS2A 3E3BX 5J8IA 3FY0A 3R63A 4QO9A 3CBLA 1XWSA 1LEWA 4N0SA 4C57A 3OHTA 2YZAA 4NIFA 5DH3A 4C4IA 3C13A 4UMQA 2RSVA 4HVDA 5KX8A 5IEXA 2J90A 3VBWA 4EK5A 5BVDA 2OZAA 4I93A 5DWRA 3Q6WA 3RAIA 2XNNA 5L2SA 1UWJA 4X21A 3OXTA 4IFCA 3GC0A 1ZYCA 4YZNA 4CSVA 4V04A 4UY9A 5FM2A 2X81A 3VAPA 3ZHPC 3QL8A 4EJNA 2JDOA 3MH3A 3FZPA 4WHZA 5EYDA 2XCHA 3PUPA 4ANQA 1RE8A 1KSWA 3D2IA 3LMGA 4OTGA 2WXVA 2WFYA 5HNIX 2V22A 3Q60A 1Q8TA 4FODA 4GU6A 4G3EA 5AM7A 4I23A 3RZFA 2V62A 3TEIA 3DB6A 2Y9QA 5L6OA 2B1PA 2WQNA 3LXNA 5CWZA 4CTBA 2YAKA 3SLSA 3CCNA 3EQRA 2G2HA 1NVSA 3OD6X 2BFXA 4LV5A 3C0GA 4CCBA 2VZ6A 3GUBA 5AV2A 2XEZA 2WMUA 2R7BA 3E5AA 3BQRA 4LRKA 3VUTA 3RALA 3PIXA 3Q2MA 1ZOEA 4JNWA 1TVOA 3O71A 5EYKA 3ZO2A 4WSYA 2X7OA 3N51A 3VIDA 4Y95A 1PYEA 5AMNA 4EYJA 2X2KA 3P5KA 3ALNA 2OW3A 3EFWA 2J4ZA 3AG9A 3F69A 2C3JA 3I6WA 4CLIA 4C37A 3S2PA 1WBTA 2ONLA 5ANJA 4NK9A 3BKBA 2ZAZA 2Q0BA 3UOKA 4ACHA 5B2KA 4TZRA 3C51A 5K0XA 2XS0A 4UZDA 2ITYA 3PE2A 5HCYA 1R78A 3DK7A 1YDSE 3EL8A 5HO7A 1Y8YA 2I0VA 4BCOA 2OIQA 3R9DA 4QP9A 4MQ2A 3CXWA 4BBEA 3EJ1A 3I6UA 3HL7A 4O38A 2IJMA 4CQEA 4E6QA 3ZXTA 2BALA 3FI4A 2X2LA 5CEPA 4QP1A 4TKSA 4HGTA 4EUTA 4FSQA 5AUXA 3PFQA 2QU5A 4YC6A 2WB8A 2WMWA 3SD0A 1K2PA 2XA4A 4JQ8A 3E8EA 3TJDA 3QC9A 4EOIA 5LMKA 4GUBA 4RRVA 2W1CA 3FI2A 4WRGA 1PW2A 2CDZA 4JIKA 4P5QA 4OTDA 4FNZA 5HGIA 4XG2A 4BHNA 1ZZLA 4BTKA 2CN5A 3KA0A 5AA9A 2W0JA 4FIFA 1OZ1A 1PXPA 4PTCA 2XJ2A 4L43A 4R3RA 5DVRA 5CU2A 3MB6A 5I5ZA 2WMTA 4EH9A 4GVJA 3E8NA 2ITOA 3Q4CA 4BDCA 3DB8A 4DCEA 4BGGA 2EUFB 2CCHA 4MF1A 5AP2A 4IZ7A 4JAJA 5CZHA 5LVOA 2ITPA 3LFCA 3CKXA 2XM9A 3IW4A 3PPZA 1GJOA 5A4EA 3EMGA 4L45A 2F57A 2YHVA 4A9YA 3R7EA 3TKHA 3R8MA 4EHVA 1M2PA 3ZFMA 5I9ZA 4OR5A 5CEIA 4RJ7A 4X3JA 4IM3A 3HUCA 4E20A 3AQVA 3A99A 3IW7A 4X2JA 3FHIA 4ANMA 4C7TA 4FKOA 4I5CA 5J95A 2YN8A 1GIIA 5DOSA 4AACA 4EWQA 1PYXA 3DJ7A 4I92A 2QOLA 3EN5A 4U44A 3F6XA 4AZWA 1ZYJA 4HPTE 3EWHA 3A61A 3W8LA 1ZYLA 4CMUA 2WU7A 4PWNA 3P1AA 1OL1A 5C26A 3FQSA 3NNXA 2VV9A 4FBXA 4PMSA 4Q2AA 3ZO4A 5A4LA 1Z5MA 4RJ6A 4EK4A 1YDTE 3N9XA 4FSWA 3IOKA 5HG5A 4OTWA 1A06A 4IAIA 3MA6A 4G16A 2REIA 2V5QA 4O6LA 3WF7A 3MVLA 2G2IA 2WD1A 3GGFA 3MWUA 4FTJA 4EYMA 5FEQA 3UP2A 3LFBA 1ZYSA 4FUXA 3Q5IA 5A6OA 4FSNA 1T46A 3SHEA 3KXZA 1M14A 1PXIA 4C4GA 4FX3A 2R3MA 1ERKA 3CJFA 3F5GA 1WBWA 2CN8A 4QTBA 2UV2A 5E7RA 5M4FA 2WAJA 1JBPE 2VU3A 4O0TA 4QQJA 4OW8A 1YOJA 2WQEA 1SMHA 5CI7A 5EI2A 3V01A 3OFMA 4F0IA 4JLCA 3AD4A 3ENMA 4QYGA 5DFPA 5EHOA 3W18A 1Y6BA 2ESMA 3MH1A 4NJDA 4WOVA 5M56A 3REPA 2WMRA 2HENA 3D5VA 4II5A 3OROA 3S95A 2YERA 2PVLA 5AM6A 4O21A 4B99A 4QMWA 4IC7A 4E6AA 3FDNA 3G51A 2R3LA 1JSUA 4RQVA 4TWOA 1X8BA 3BGZA 4IVAA 3Q32A 3PVWA 2EWAA 4E8AA 4TT7A 3VJNA 2ETKA 4XS2A 4K2RA 2PE1A 3DJ5A 4DGNA 3TZ7A 4I4FA 4ZP5A 2VX0A 3AD6A 3OWKA 4F7JA 5HQ0A 4YJNA 1OIYA 3KXNA 2DS1A 1REJA 1Q8YA 3MW1A 3O8TA 2GNLA 4JRNA 3QKLA 1RJBA 2X1NA 4DH8A 2XMYA 4KS8A 2VX3A 3WILA 2WQOA 5CVGA 2ITQA 4W4YA 4UN0C 3DLSA 3VWAA 4PMPA 3NNUA 1ZY4A 3CY3A 2F7XE 4GG5A 2R9SA 2YCFA 4LFIA 4XG4A 4OTHA 4PP9A 3GC8A 4V05A 5EM8A 5F20A 2EXCX 3RKBA 4EQCA 4F08A 5L2TA 5GHVA 2BTSA 4MCVA 3DT1A 2HWOA 1XR1A 2XNEA 5FTQA 3CD8A 3TNWA 4QPSA 4AT5A 4G17A 2C6LA 2YCRA 2OF2A 2I40A 3OWLA 4JRVA 4QRCA 4BDDA 2GPHA 3PYYA 4IB0A 2UW8A 4IWDA 4R1YA 3QWJA 1P14A 1PXOA 5DRBA 5JFVA 4BVUA 4D1ZA 4QMPA 1KE6A 4R3CA 3MFRA 5FGKA 1FVTA 3G9NA 1RQQA 2C6IA 1VYWA 2HZNA 3AMYA 3QQKA 4PF4A 5DGZA 3VULA 3QRTA 3EQCA 3AGMA 2X9EA 3LXPA 5E91A 1UVRA 2FO0A 3FQHA 5T68A 3VW8A 1OITA 3ZUVA 3PP0A 1OB3A 3RK9A 2CMWA 1FOTA 4QTAA 3A2CA 2O2UA 3FI3A 2WMAA 3MPTA 2VTSA 4L67A 4EOQA 5CNNA 1FGKA 2KULA 3HA8A 3OW3A 4FG8A 4NFNA 3KK9A 4RX9A 3P08A 2O3PA 4DH5A 3WBLA 3NS9A 4S30A 3JXWA 3UQCA 4BDFA 2R4BA 3FL4A 2CGXA 2Y4PA 2JFMA 4XRLA 4YZDA 2CLQA 3OCBA 2KTYA 4JDIA 2J6MA 2WTIA 3PWYA 3QQUA 3SXSA 3FKNA 2J0KA 4KINA 5CT0A 4QMYA 1H1RA 1M7QA 3WARA 3BYVA 3DXNA 3QWKA 4RWLA 4RJ4A 5EYCA 4RC4A 1PXJA 4ZLOA 5DMZA 2C6DA 3IKAA 5C1QB 4MKCA 4AT3A 4F99A 1GZNA 5DPVA 4DEHA 3SXFA 4S2ZA 4O0VA 5HO8A 4YNOA 3SQQA 2J0MB 3QHWA 2OWBA 4KD1A 4CV9A 1LPUA 2BRBA 3FJQE 1P5EA 3RGFA 5JZNA 4ALVA 4BFMA 3HDNA 2E9VA 3QQFA 5HEZA 3FZSA 2UZNA 4FV2A 4MNEB 5J79A 2PK9A 1WCCA 2F49A 3JY0A 4P4CA 4IX4A 2XIXA 2G9XA 3G9LX 4YBKA 1HOWA 1YKRA 4JT3A 3VS6A 4AW5A 1Z9XA 2BDJA 5T3QA 1FPUA 2AC5A 1SNUA 3FBVA 5FM3A 4QPAA 4BTJA 4ZS0A 5DIAA 1XH4A 2AUHA 3C0IA 3OOGA 1U4DA 4APCA 5FXSA 1GNGA 4RLLA 4AZVA 1MRVA 3QUEA 4Z7GA 1PMUA 5HESA 3PA5A 4KBAA 5K9IA 3K3IA 2ETRA 2VTNA 3SVVA 4FNXA 1OL6A 3A7GA 4AZFA 2W05A 5AP7A 4TNDA 3UNJA 4YP8A 4F7LA 2W96B 3H30A 2ZYBA 4OGRA 4OLIA 5C03A 3EQGA 3QQGA 4E73A 3ZFYA 4ZSLA 1I09A 4IVDA 3CLYA 4QTEA 1J1CA 2WO6A 3QTXA 4XOYA 3HRCA 3R7UA 2QR7A 5EDPA 4DEBA 3NW7A 4KSPA 4O0UA 1MRYA 1GY3A 4PTEA 2YLFA 4NH1A 4QQCA 1AD5A 4CTCA 3HA6A 4DGGA 2YIYA 2JDTA 2HXLA 4I6FA 3RMFA 5HCXA 4W8EA 2XK6A 5J9YA 4AN3A 5HE1A 2UZWE 5LWMA 5J1WA 1H25A 1NY3A 1Q8WA 2ZB0A 3A4PA 2HELA 1GZKA 3FMLA 1ZRZA 2YACA 3QCSA 3VS7A 1LUFA 5IDPA 3Q5ZA 3PLSA 5F95A 1ZXEA 3VS2A 4L68A 1Q99A 3I60A 1QMZA 3Q9XA 2UZVA 3TZ9A 4CKIA 4XG8A 2VTRA 4FTIA 5C27A 3KRXA 2EB2A 5LVPA 2X7GA 3UTOA 3Q96A 5ETCA 5L8LA 4RIYB 4D58A 2WTVA 3NPCA 3OBGA 3Q04A 4G2FA 3DQWA 3EQBA 4PDPA 4CFNA 4D4YA 3DQXA 4H3BA 2NO3A 3WOWA 3NDMA 4RA4A 2FB8A 2WMSA 2PZYA 2RKUA 4IB3A 2GHMA 3FSKA 3ZXZA 4Z9LA 2RFDA 5BMSA 2GS7A 3UG2A 4Y72A 3M2WA 4K18A 1O6KA 4UB7A 1ZYDA 3O0GA 4C0TA 4LQMA 3OCTA 4F9AA 4Y8DA 3BU5A 4PL5A 3UVRA 4DEIA 4D5KA 3CQUA 4F70A 4CXAA 2QONA 5J5SA 4WSQA 4FTCA 3E87A 2B9HA 3ODYX 3GT8A 2OBJA 4FV4A 4XYFA 4YTHA 4EK8A 2CGVA 5C8NA 4M97A 5CSPA 5GJDA 5DT4A 5FBNC 3UO6A 4X7QA 3WYXA 2PMIA 4PQNA 2YDKA 3RPRA 5L8JA 3BPRA 2YIWA 3EHAA 4P2KA 2XZSA 3BEGA 3FLNC 4BI1A 5IPJA 4TYHB 3NRMA 2YIRA 2WMXA 5KKRC 4JBQA 1B38A 3VW6A 2XBAA 2ACXA 2JIIA 4K1BA 4ANOA 4U5JA 2BVAA 5IKWA 2BIKB 2JKMA 4G9CA 4LYNA 2JIUA 3DBCA 3GBZA 4BCJA 1YXXA 4UWCA 2FA2A 4EHZA 1DM2A 5ETIA 4CZTA 1YI3A 3DTWA 4CD0A 5TO8A 2PZIA 3SC1A 4BCFA 1JNKA 4M14A 5TE0A 3UE4A 3DAEA 4Q9SA 5BUIA 5JFWA 3UZTA 3PA3A 3DA6A 3MY1A 2XYUA 2P33A 3IOPA 4QMTA 1W0XC 3EZVA 5HU3A 5I9VA 3V5TA 3GEQA 3W2RA 4AGCA 2ZV8A 4ACMA 3TKIA 1K9AA 2H9VA 5JK3A 3PRIA 3LFEA 5BPYA 2FGIA 2E9PA 5AR4A 4GV1A 5JSMA 2RGPA 3LLTA 4OT5A 4HOKA 3FY2A 1BLXA 3MPAA 2ZMCA 4A9RA 4X2KA 2BFYA 3BE2A 1H8FA 4FNWA 4A4OA 4ARKA 1ZWSA 2A2AA 4QMQA 2QOKA 5IA4A 5AX3A 3D14A 3HV3A 4NEUA 3MFTA 2WEVA 3FLQA 4FL3A 4NT4A 5M57A 5C9CA 4F1TA 4K8AA 4U97A 1OKZA 3TNHA 5L2IA 5AR2A 4EH7A 4FZ6A 2C0TA 3BU3A 2YAAA 2O63A 2ITZA 3Q52A 4ZTLA 4A07A 3K5VA 3MJ2A 2W5BA 3PG1A 4U40A 2O65A 4CV8A 2W06A 4FIHA 1U54B 2OIDA 4ASXA 3ODZX 4HGEA 5KO1A 4GFMA 1W84A 3ORTA 3F3VA 4RIYA 5KZIA 5D1JA 3KXXA 4BIEA 4C35A 5F4NA 2QOQA 1NA7A 4C38A 4MH7A 4QMZA 1H07A 4F0GA 3P4KA 4AW1A 2YM6A 2P55A 4U3ZA 4AN9A 4FV0A 3RM7A 4HCUA 2HY0A 5I9YA 4U80A 1DAWA 5EH0A 4O2PA 4FYOA 5DT3A 4TYGA 5TF9A 1PF8A 4YPDA 5HCZA 3KRLA 1QL6A 2OO8X 4AUAA 4HNIA 4HVIA 3DKFA 5L6WL 5BQ0A 3GC9A 4QP3A 4TWNA 4LUDA 4YTCA 1FMKA 2R3PA 3PIZA 3PXFA 2X8IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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