4C8B | Genus

Total Genus 87

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	87
sequence length	309
structure length	279
Chain Sequence	SALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGTIIYMPPENYSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inflammatory Signaling by NOD-RIPK2 Is Inhibited by Clinically Relevant Type II Kinase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
total genus	87
structure length	279
sequence length	309
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2013-09-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4c8bA00

2YM4A 2YCFA 4NW6A 4DCEA 5CS6A 3RPVA 4D55A 4BDKA 3FKLA 4BGGA 5DR6A 5AV2A 4CFFA 4E7WA 2XIYA 2NRYA 3PJ8A 3MH3A 1VEBA 2VU3A 4C3PA 4QNAA 2BDWA 4QTDA 2VWWA 3QLFA 4LM5A 3ULIA 3OEFX 4BIDA 5KMLA 3D7TA 4FK6A 4UB7A 4UX9A 3RVGA 1OI9A 4JR7A 3ALOA 4AFJA 4ZY4A 2Z2WA 3MA6A 4DHFA 4IQ6A 4TYGA 3RJCA 3TG1A 3BYVA 3QTSA 2VD5A 3C0GA 4XV9A 1BKXA 4G3FA 3UQFA 2PZYA 5IA5A 3WZDA 1BYGA 5E8SA 4OTHA 2YIQA 1QMZA 4QYHA 3NDMA 3R1YA 1WVYA 1SZMA 4AGCA 4EZ3A 4JBOA 2WU6A 2VZ6A 4RC2A 1UU8A 4IVCA 3ZLYA 4IEBA 3U9CA 4YJPA 3D83A 4AZEA 4C2WA 4DBNA 2RKUA 1PW2A 4HVIA 2I0YA 3MFUA 3GENA 4KIPA 4MNEA 5H8BA 2XCKA 2PMIA 3Q4ZA 5M56A 2G2FA 2YWPA 5D7AA 5IA4A 1MRUA 3MVJA 4JAIA 4BICA 5HD4A 2B9JA 3A7JA 3AC5A 5K5NA 2YJSA 4OLIA 4CVAA 4FKIA 1K2PA 2JBPA 4HGSA 2ITWA 5EKOA 5JGBA 4FX3A 4RWLA 2C3IB 2PVYA 2ZOQA 4WNKA 3S95A 1ZZ2A 3UOJA 4JX3A 4DEDA 3PXFA 4QNYA 5CNOA 2VTLA 4GJ2A 4ZSAA 5J1WA 3LXNA 4DGOA 4FSYA 2CN8A 3PJ3A 2BVAA 4YSJA 4Z16A 4FG9A 2W5HA 4A9TA 2WQNA 1CKIA 3VNTA 2AC3A 2C3KA 3SXRA 4CXAA 2BIYA 4ZEGA 5AP3A 5AUWA 4BDEA 2RFEA 4ZSGA 2PMLX 2ITOA 2YDKA 3ZBFA 1U5QA 1CM8A 2VV9A 4UMUA 4JBVA 3GCVA 3A99A 3ORMA 3PRIA 3QZHA 4EH2A 3KB7A 1FVVA 3DLZA 4JT3A 4APPA 5IG1A 4AOIA 2HW7A 1PYXA 2QODA 5M4CA 3A7GA 4BI0A 3EYHA 5AUYA 1LPUA 3KRLA 2AC5A 3BCEA 2BDFA 3DK3A 3LFAA 3NPCA 2CPKE 5M53A 3QQGA 4I94A 4FEQA 4I6QA 4YLKA 4QYEA 5GJGA 4AU8A 3HMPA 2GTMA 3R1QA 2YABA 4RX5A 5C01A 4ARKA 3ENMA 5CALA 1FMKA 1PMVA 4O6LA 4MNFA 5M4FA 2GMXA 3CC6A 4ZJIA 2OIDA 1T46A 4YBJA 5I9VA 1PMUA 3EH9A 1H26A 2WO6A 4FSNA 4QD6A 4YLLA 4XS2A 5DMZA 2QONA 4L00A 4CSVA 4D9UA 4ZAUA 2ITVA 5HVYA 4DYMA 3JY0A 5K9IA 2ITXA 4FZAB 3IS5A 3P9JA 4YNOA 4U8ZA 5F1ZA 2UZBA 4IAYA 3WARA 4IFGA 1PHKA 2C30A 3DK7A 2W1DA 4DEBA 1OIQA 3ZRLA 1WBPA 2DS1A 2ERZE 1H27A 2UW9A 3WF6A 4ITIA 4IMYA 4E6DA 4OUCA 1CDKA 3IG7A 3ERKA 2BRGA 3D15A 5L2IA 1OIUA 2CDZA 3WBLA 3FHIA 3LCSA 4QPAA 3VUGA 2VO3A 4FSTA 2PMNX 4MQ2A 4EK4A 3IW8A 4OTWA 4N0SA 2C5XA 5M57A 4CT1A 3IKAA 4TYEA 5LMKA 3GQLA 4RIWA 3R7YA 3LFQA 4FKUA 2OJGA 2VNWA 4L45A 4L42A 2XMYA 4XHKB 4RWKA 3O7LB 2WIPA 3VS5A 5AV3A 1NVQA 3I4BA 4AN3A 4O0UA 4DG2E 4CEGA 3F69A 5ANJA 4IZAA 4O22A 3CGOA 4OT5A 5A4QA 4L7FA 4IADA 4R3PA 4X3FB 5I3OA 5CSVA 2R3PA 2WKMA 3A7HA 3R83A 2C6MA 3ZO4A 3HGKA 1UWJA 2ONLA 3K54A 4WSYA 5CWZA 3EN9A 4MWIA 5DE2A 4A4OA 4C58A 4IW0A 3GU7A 4JRVA 5LCKA 4OTIA 2R3GA 4RPVA 2HZ4A 4H1JA 4BB4A 1YDSE 4HYSA 4I21A 1GZOA 1MQBA 1V0BA 3LFCA 3K3JA 4A7CA 3W2SA 2YIRA 4I0TA 2GNFA 5D1JA 1OMWA 1DI8A 2XK7A 2VO6A 3HRFA 4UXLA 4YR8A 4EHZA 3MBLA 3FLYA 2E2BA 5D10A 2IVVA 3P7BA 2VTOA 3QUDA 4XBUA 4YHTA 4EORA 1PXPA 5DA3A 4J71A 5HO6A 3VUIA 4EOQA 4ZTMA 3S0OA 5FDXA 4IACA 1OL5A 1XH5A 3TACA 3D14A 5M4UA 1PXNA 2XBAA 3O8TA 5KCVA 2J2IB 5FBOA 1FMOE 4O1OA 3VHEA 5FM2A 3CIKA 4YC3A 4BYIA 3DJ7A 4WT6A 3KMUA 3QQFA 4ZTSA 4IAAA 4DFXE 4YZ9A 4AA5A 5ETFA 4IAZA 3GC9A 2BZJA 4CZUA 4F6SA 3GVUA 4HJOA 3VRZA 2UW3A 3O0GA 3PY1A 1OUYA 2W5AA 3SD0A 3LM5A 5ANKA 4L01A 2IW8A 3V5WA 4CKRA 4YJTA 1VJYA 1Q8WA 2XNPA 3O8PA 3TV7A 4BF2A 5K0KA 4OBPA 2JDVA 1PXIA 1YI4A 5KMIA 4X21A 4M68A 4M69B 2C6TA 3OT3A 3V5JA 3OBGA 4FZ6A 4Q9SA 3UO6A 4RWIA 3FY0A 2VGPA 4AZSA 3D2IA 3OY1A 4IM0A 3CR0A 4MVFA 4F4PA 3SOAA 5CU2A 2VX1A 4EOSA 3E62A 2B9HA 4ALVA 2W5BA 4W4YA 2F4JA 4RJ5A 3I1AA 3OTVA 3TV6A 3PPJA 5JGDA 3PVGA 2PZIA 2LAVA 4CLIA 2XK3A 2GFCA 2OZOA 2W06A 3NCZA 1GZNA 5IDPA 5LQFA 4NJ3A 3W2OA 4FSQA 2BAKA 1P5EA 3MPMA 4YPSA 1R1WA 3VBVA 1JSUA 2NPQA 3HZTA 4QMVA 1RDQE 4JG7A 4U45A 1SMHA 2Y6MA 2XH5A 3MDYA 2WQMA 2W1FA 3DZQA 4KIQA 4X2KA 3R8PA 4EUTA 3LOKA 4UBAA 4QMXA 5I9WA 3IW6A 2XBJA 2B4SB 3PRFA 4G34A 2A27A 4FKWA 5A4CA 5HZNA 2XNNA 2CGUA 2OFUA 4WBBB 5FQDC 3AMBA 5AP2A 4JR3A 4XJ0A 4JXFA 2VRXA 3KFAA 2RSVA 4TYHA 4D4YA 4MYGA 1E9HA 2JIUA 5D9HA 2C6DA 5C8MA 5IMEA 3AG9A 4MEDA 1IASA 4O21A 1FGIA 1YDRE 4IH8A 3HMNA 3ZUTA 3ZZWA 3QC4A 4AT3A 3BZ3A 3UE4A 2P2IA 4DAWA 4USEA 4KS7A 4AUAA 2GNJA 4EZ5A 1PJKA 2OJIA 4G5JA 3S3IA 4BCHA 4C3RA 3U8WA 3GU4A 4E6AA 5HG7A 5IA1A 2RG6A 5EI8A 3JVRA 4KABA 4R8QA 3UYSA 3W2RA 3UDBA 1F3MC 3LCDA 2ETMA 4FZDB 4KA3A 3QWKA 1BL7A 2P2HA 2R4BA 5IEVA 4PP9A 3M2WA 2JAMA 2EU9A 4IANA 5J87A 4EH6A 1YI6A 3O2MA 1ZMVA 4A9SA 2BKZA 4FYNA 4IX3A 5HE3A 3WE8A 3EN7A 3PA3A 4QMYA 4U43A 3RCJA 1AGWA 3R7IA 1M2QA 3KXMA 1U59A 2W1GA 1GIIA 4GYGA 4V0GA 3R2BA 1UV5A 2R2PA 4CZYB 3LCKA 5J8IA 3UYTA 3F2AA 3PXRA 5J79A 5B7VA 3CQEA 2PSQA 4IDTA 1JKKA 3QTIA 1YHWA 4IVBA 3TL8A 3VBWA 4D2SA 3LHJA 1YW2A 4BFMA 3E3PA 4BZOA 4C4IA 2CGVA 4QQ5A 1OIRA 4FL3A 4XX9A 5FRIA 5DH3A 4YPDA 5DVRA 3DT1A 3TUDA 1IR3A 1ZMUA 3RK9A 4YTFA 2H34A 5EW3A 4ANBA 5F94A 5D12A 3RWQA 3FHRA 4C4HA 4EUUA 3LXKA 1KE5A 4WA9A 5IUHA 3QXPA 5A6OA 4WRSA 3QD0A 3G9NA 4IAKA 2ITZA 4FUXA 3A4PA 4FKTA 3OXTA 3BU3A 4FIGA 4HCVA 1GZKA 4KINA 4U97A 4BTMA 4ZJVA 5CF8A 2ETKA 4FKVA 2R64A 2IVSA 2LGCA 3QQLA 4R5SA 4F65A 5HX6A 5HI2A 3HDMA 4BDJA 3WILA 4HW7A 2HZNA 3FQSA 4U79A 2J0IA 3Q5IA 4UMQA 4FT3A 4JAJA 1ZWSA 2UZTA 3IDPA 3TKIA 4QP9A 3W16A 5KMNA 1URWA 2JAVA 3O17A 1XWSA 5HX8A 4DG3E 3JPVA 3UGCA 1U4DA 5JQ5A 3T9TA 4YNEA 5DG5A 1KOBA 2X81A 2QO7A 4NKSA 4FTLA 1Y8YA 3AD4A 2PZ5A 4JX7A 1L3RE 4YTIA 3OCBA 2HY81 4ANLA 5DNRA 3R6XA 5CF6A 1YKRA 1M2RA 3W2QA 4F0IA 3FSKA 4FKGA 4LQMA 3QF9A 4PDPA 4ZLOA 2PWLA 1ZAOA 4BRXA 1GIJA 2JFMA 3VN9A 4YP8A 5EI2A 4HCUA 5LOHA 4KNBA 3FDNA 3JVSA 4UWCA 3ZTXA 4Q9ZA 2BIKB 4FV7A 1BLXA 4GU6A 1VYWA 4YJQA 2Z60A 2YIYA 3AD5A 3LXLA 4JG8A 5IH5A 1H0WA 2C6IA 3HX4A 3BX5A 2UW6A 2UZWE 3FZSA 3R04A 2O0UA 3NZ0A 3TNIA 1YQJA 5HCXA 3VO3A 1ZOEA 4AZFA 2F57A 4IE9A 4FTOA 4RQVA 1Q24A 3FI3A 5TKDA 3EMGA 3R7UA 3PIYA 4QTEA 4BI1A 2HENA 3DQXA 2W99B 5AP5A 2QVSE 3QCQA 1G3NA 2Z8CA 1GY3A 5DT3A 4GK2A 3G0EA 1Q97A 5IKWA 4UMPA 4FKRA 2VGOA 3R8MA 1XH7A 3ZS5A 3F2NA 4ASXA 2O2UA 3QHRA 4OR5A 4CYJA 4MBLA 3HMOA 1DAYA 5HLWA 4K77A 3SHEA 4FF8A 4C2VA 3I6UA 5HU9A 2I1MA 4C57A 3PY3A 1OVEA 4IWPA 3MFRA 5T68A 3GU8A 4ANNA 3O8UA 3PY0A 3D4QA 2X9FA 3I79A 1VR2A 4W9WA 1TQMA 3MB7A 3CKXA 4L8MA 3PA4A 5A4EA 3FKOA 4FGBA 4Y5HA 4X6QC 3HYHA 1NVSA 3EQRA 1NXKA 2BALA 5CXHA 3PIXA 4BDFA 3P79A 5ANDA 5AAFA 3VJNA 3QCSA 2Q0NA 3MY5A 5ETCA 5FEQA 3FLSA 1KSWA 5EM5A 4QMZA 4FA2A 2HZIA 4NK9A 4WD5A 3ET7A 3L1SA 1HCKA 4MXYA 4I6FA 3ZHPC 1LEWA 2HAKA 4RBLA 4NW5A 3A8WA 2QD9A 2UW5A 3MPTA 5BQ0A 4BZDA 2CCHA 2XKCA 3RAWA 4FV8A 2WNTA 3KK9A 5BMMA 5CI6A 1B39A 4GT3A 4EH8A 3QUPA 3OMVA 5L8JA 3F9NA 3E87A 1H07A 4YJNA 3S00A 4KSPA 5KHXA 3Q6UA 2VWXA 5AUVA 1UNGA 3TZ9A 5CAOA 3TUBA 2XP2A 4JOAA 4PTCA 2ZDUA 4I92A 4DGLC 2CGXA 1P4FA 4O1PA 4C02A 3FMNA 3HP5A 5CVHA 3RNYA 3R30A 4EKLA 2Y0AA 3H10A 3QRKA 5EM8A 4F7JA 4RA5A 2HWOA 4K1BA 4WHZA 2WTVA 5LVNA 2IZSA 3F3TA 2HY0A 4FTKA 3RTPA 3H3CA 1CTPE 4QRCA 4MD7E 4II5A 3NEWA 4AA0A 1M7NA 4N4SA 1XO2B 3KULB 5CSHA 3MIAA 4U9AA 2Z7SA 3AC3A 5CXZA 2QNJA 3QQHA 5CZHA 3BQRA 4RZWA 3COHA 1URCA 1H1WA 2IW6A 3Q4CA 2VWVA 2CMWA 4ACMA 1DAWA 1PXKA 2ACXA 2RFSA 3R28A 4E5AX 3C13A 1VYZA 4MXOA 4CCUA 4O38A 4ZTLA 1P4OA 3ORZA 3R8VA 3CD8A 3OD6X 4V04A 4QYYA 4RC3A 3RM6A 3ZSHA 4RIOA 2WU7A 2PVRA 1YDTE 1IG1A 4I0RA 3MV5A 3P08A 3MH2A 4IHPA 3SAYA 3ZO1A 2QLUA 1SNUA 4QMWA 2JFLA 4BC6A 4PTGA 3QZFA 4GW8A 2QOHA 4Y95A 3ORTA 3MYGA 3R0TA 2W1IA 3ODZX 4X3FC 3ROCA 3RZFA 3LJ0A 2QCSA 1WBSA 4L3PA 5I9YA 4J97A 5CU0A 1MP8A 4FIEA 4FV9A 3IW5A 1M2PA 2XNEA 4WO5A 4AW2A 4WNPA 3JUHA 4RFMA 4QQJA 5AUTA 4YMJA 3RINA 4LI5A 2X7GA 3QCYA 3BHHA 5FP5A 3ZLWA 5BVDA 2JDRA 5JMSA 1UU7A 2XYNA 2OZAA 4EBVA 1WVXA 1PXOA 1RE8A 2IN6A 3OWJA 3PUPA 5CZIA 2OO8X 3TT0A 4WG4A 3KMWA 3H30A 4M66A 5AV4A 1QPJA 2WAJA 4RJ7A 4DLJA 5EM6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4C8BA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations