4C8B | Genus

Total Genus 87

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	87
sequence length	309
structure length	279
Chain Sequence	SALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGTIIYMPPENYSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inflammatory Signaling by NOD-RIPK2 Is Inhibited by Clinically Relevant Type II Kinase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
total genus	87
structure length	279
sequence length	309
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2013-09-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4c8bA00

3CLYA 4XP3A 4CXAA 5IU2A 3NNVA 2WIPA 4QYHA 4C02A 3UPXA 1PXNA 2JITA 4M67A 4KIKA 2LGCA 4EZ7A 3PSBA 5HX8A 1KWPA 2ESMA 4IMYA 3K3JA 2OJIA 5EI2A 3UVRA 4AACA 1W98A 2BTSA 2OFVA 5CS6A 5A4LA 3NNXA 2AUHA 5CANA 2G2FA 3COKA 3QKLA 4WG4A 3DXNA 3PSCA 1J1BA 3GGFA 4NKSA 1U4DA 3PJ1A 1W83A 1XR1A 1DI9A 2CLQA 3BV3A 3OEZA 4FSRA 4C37A 3FMNA 2C1AA 4L8MA 1BI8A 1OKVA 1PXMA 3SV0A 4JXFA 3QQJA 4ALWA 5G1XA 4C4IA 1FGKA 3U4UA 5JKGA 4MCVA 5J9ZA 3NR9A 3PIXA 4XG8A 3UC3A 4EUUA 3RWPA 2X6DA 4BRXA 3FXXA 5E90A 2WTKB 3LJ0A 4R3PA 4FSUA 4V0GA 3RK5A 5CEQA 4TYIA 3TI1A 3MH3A 4IAIA 5HEZA 2E2BA 3LZBA 1PY5A 1ZY5A 2X81A 4YU2A 4DFYA 3QD0A 4QPMA 3MWUA 4HGEA 5DR2A 2WU6A 4FSYA 2QKRA 2RG6A 5AV0A 1W7HA 3D5WA 3GU7A 4RZVA 4OTGA 4C2WA 1JAMA 3RBWA 3UOHA 3C0GA 3ANQA 4FIEA 4GK3A 5CVGA 2JKOA 4DG0E 1OZ1A 2X7OA 4N0SA 5CEKA 3AGMA 4JDJA 2F2UA 3ZCLA 4MXOA 2BR1A 1M14A 2VUWA 2C5OA 4FG8A 3ZSIA 4LGHA 5AP6A 4HYHA 4WO5A 2BALA 3I7BA 1YRPA 2XCKA 5M4UA 2DS1A 3JVRA 5IPJA 1YXVA 4LL0A 2IO6A 2YLEA 3NCGA 1NVSA 3HP5A 2EB2A 3ZTXA 4BZDA 3ZUVA 4B9DA 4GFGA 4BC6A 3SW4A 5KZIA 1WAKA 3S2PA 4B4LA 1UV5A 2BDFA 4FTCA 4G9CA 5HCYA 3HV7A 3Q9YA 4BICA 4YPSA 3FZTA 5JQ8A 3V5QA 3E7VA 5H8BA 3B8RA 3RI1A 4LOQA 5DE2A 1ZMVA 2X8IA 2WFYA 3LVPA 3VC4A 4BI0A 4DBNA 4O38A 5HLNA 4OTIA 4N6ZA 4P90A 4MAOA 3QCYA 5GZ8A 3SOAA 4AOTA 5HGIA 5A46A 5CZIA 1REKA 3UOKA 4XEYA 2O65A 1KE9A 4ACCA 4YO4A 2WO6A 3MV5A 1QPCA 2R7BA 4DHFA 3DB6A 5DG5A 2F57A 3I7CA 5AX9A 3TNWA 4RSSA 5AP7A 3V5JA 3ZYAA 4EH4A 4EHGA 4CKJA 3V3VA 2YZAA 4U42A 3RAHA 3KULB 4M84A 4BWPA 3D5VA 4FVRA 5BYYA 3FHIA 3OOGA 3W32A 5TF9A 3Q4CA 4WNPA 5K3YA 4R8QA 3MI9A 2OZOA 2QO9A 5J95A 3VUGA 4BGGA 4UX9A 3WIKA 4TYHB 3E8CA 3HDMA 3TTIA 1WBNA 3LAUA 5TKDA 1STCE 2HZNA 3MSSA 3F3TA 4WNKA 5IISA 5EHOA 2ZDUA 4RWIA 3QTWA 2X2MA 3KC3A 1H0WA 3OG7A 1VJYA 3GC0A 3QFVA 5CENA 4X21A 3ZRMA 4C7TA 4JX3A 4MXCA 5A6OA 3QQKA 1GAGA 5DR9A 1MRYA 4JOAA 3TN8A 3JYAA 1PYXA 4QMWA 3CTHA 2VTRA 3RWQA 1KOBA 3ZSGA 1MRVA 3BYSA 2O3PA 2VO6A 3CKWA 3B2WA 4LOPA 3LJ1A 1GIJA 2F2CB 4HOKA 1BLXA 4QNAA 3RM6A 3DFCB 4DITA 1KV1A 4IB0A 2I0VA 3UIUA 5HG8A 1GZOA 5HIBA 2Q0NA 4I22A 5BVOA 2OG8A 4QQCA 2PHKA 3K54A 2RF9A 5I3OA 4M0ZA 2H8HA 1UWJA 1ZYCA 4FBXA 2WZJA 2XK7A 4GH2A 3DPKA 2HAKA 5JFWA 1L3RE 5FD2A 2WIHA 2C6MA 2F7EE 5E8UA 4ZSEA 1IASA 4EOMA 5LWNA 3V5WA 1TVOA 2PZIA 3P0MA 4RX7A 4XH6A 4D4RA 4E5BA 5KX8A 4KD1A 5E8TA 3R8VA 3D94A 2YM3A 3ZM4A 3VRZA 5CI6A 2GPHA 3QUEA 4TNDA 3WIGA 3FY0A 5L2QA 4AZWA 2ONLA 3BHYA 4K0YA 5BVWA 3A7IA 3NX8A 1QPEA 4A9RA 4CTBA 3UYSA 3EWHA 4B7TA 4EHEA 4N6YA 3D15A 3KY2A 3RPSA 4BDGA 2YA9A 4BDCA 4TY1A 2FUMA 2RSVA 4CMTA 2R2PA 3FZOA 2ETRA 2BIYA 3S0OA 1OITA 1Z5MA 4EK3A 2J90A 4EKKA 3CY3A 4FV1A 4BCHA 4ITJA 3PPJA 2XNMA 5H3QA 3L9PA 1LUFA 2HWOA 2UW0A 4QP7A 2JLDA 3SX9A 4LGGA 3ZFXA 4IWDA 4KKGA 4PL5A 4USDA 3TEIA 4GRBA 5IA1A 3CP9A 1ZMUA 2C6TA 4A7CA 4R3RA 2W0JA 3BWJA 1WVYA 5HO8A 2XK6A 4UN0C 5AAFA 5AR7A 5CY3A 4M0YA 4MNFA 4IBMA 4W8DA 4GIHA 1CM8A 4UEUA 4X3FB 3CBLA 5CYIA 5D41A 3ENMA 4F6SA 1YHSA 4LMUA 4BDJA 4DGNA 3P79A 3GCUA 4D55A 3LCKA 2YAAA 4J71A 1OECA 3Q4ZA 4YJRA 3UGCA 2VTQA 4FV4A 5L2IA 4S32A 3ULZA 4MQ1A 2EXMA 2CCIA 3SHEA 4AOJA 4XBUA 3NUUA 2QD9A 1NXKA 4RJ6A 5GZ9A 3R7OA 5K4JA 3HZTA 1M52A 4DFZE 3HRBA 1JPAA 2ZVAA 4IWPA 4RA4A 4C62A 3CPCA 3Q9XA 4NIFB 3HLLA 5ETAA 3UOJA 4YJTA 1Q3DA 4JVGA 5CALA 3KVWA 4BDDA 2UZOA 2PY3A 3PVUA 2G2IA 4FSQA 3RALA 2J5EA 3R73A 4D4VA 4BDIA 1V0BA 3UIBA 3UIMA 2UVZA 3LMGA 3RAWA 4IM2A 5HHWA 3VUTA 3FMKA 4XUFA 2CGVA 3DFAA 3PFQA 1ZYSA 4KBCA 4D2WA 4W4WA 2BRNA 2JKQA 2WTWA 5ETCA 1R3CA 1Q24A 3GU5A 4Y73A 1SM2A 5AR2A 1Q4LA 3FXWA 4ALUA 4LRKA 3BKBA 1OL1A 4FVQA 3LFAA 2GFCA 5A3XA 2BZJA 4C3FA 4EK8A 3RHXA 2BROA 1F0QA 5AMNA 4OTWA 4CLJA 4OR5A 2QI8A 5JQ5A 3PXZA 2X4ZA 1YWNA 2QQ7A 3II5A 1H07A 5E91A 4S30A 4I23A 5DHJA 5EYCA 3I5ZA 3NCZA 3ORZA 4EH9A 1MQBA 5JEBA 4X2FA 2BVAA 3GEQA 3C5UA 3R83A 3OHTA 3O2MA 3GFEA 1PW2A 3NYOA 2ZV9A 2UZNA 3Q6WA 3V8SA 3V8WA 5JMSA 3OXIA 3OXZA 4HVGA 3QQGA 3AT3A 5KKRC 3WZKA 5HD7A 1CKIA 5J9YA 3KXGA 4M66A 1H1QA 4MH7A 4IACA 4FG9A 3OY1A 4FZFB 4GUEA 1OB3A 3CPBA 3OZ6A 4EOIA 1PMVA 3DY7A 3E62A 3CGFA 3DDQA 3E92A 4J8NA 5EM7A 3MH0A 3VAPA 3NYXA 4WNMA 5CEOA 3UPZA 3MFTA 4DGOA 4NWMA 5H2UA 4R1VA 1JSTA 2X6EA 1XH6A 3QRKA 1PF8A 3WF8A 4MQ2A 1H1SA 5HNIX 4BGHA 1ZOHA 4GYIA 1NA7A 3ITZA 4IAZA 2PWLA 2W9FB 3PG3A 3DV3A 3ZZEA 5A6NA 1Y6BA 5L8JA 3W33A 3QLGA 5FEQA 1YVJA 3E63A 2FYSA 4UWYA 3E87A 3V6RA 3HGKA 3EH9A 3U6JA 2OIBA 2P2IA 3DCVA 5JRQA 4G34A 4F63A 2YITA 4IE9A 4LMNA 3UYTA 4EOJA 1M2RA 4O6LA 3EQHA 2J51A 4YZ9A 2R3RA 4XLIA 4YC3A 3RPRA 3PY1A 2IW8A 2UZTA 3Q53A 4ENXA 1TQMA 3QX4A 4I21A 3VBXA 4CD0A 2XKCA 4UMQA 2A4LA 2BHHA 4LM5A 5L6OA 3OMVA 5DT0A 2VZ6A 2BUJA 4YZDA 3L8SA 3F5PA 4F65A 1Q97A 4AA5A 4DCEA 4F7JA 3LFSA 3QC9A 5DH3A 2VWZA 3ZO4A 4YC6A 3AT4A 3Q5IA 2XJ0A 5L8KA 4JQ7A 2C5XA 2Y9QA 4P4CA 4QMXA 3THBA 3AOXA 2XS0A 3HMMA 3NUYA 3UNKA 2PZPA 3P78A 1CTPE 4ACMA 3EFKA 4ANBA 4CMUA 3WE4A 1Z9XA 5JFVA 2W4JA 5J1VA 3AC5A 4DEHA 5L2SA 2NRYA 4JG7A 5L2WA 2YCQA 1H24A 2RFSA 4MVFA 1SZMA 3NYNA 4EEVA 3C4EA 3HMPA 2YACA 1J3HA 2XH5A 5KMOA 1OKZA 3MIAA 4TKSA 1PMUA 2WMWA 4BCQA 4JAIA 2Y6OA 4K11A 3E88A 3UBDA 4RIOA 3AMYA 4RVLA 3P08A 3DK3A 3G6HA 5FLFA 5HLPA 1WBOA 5BVKA 4I1ZA 3F2AA 4G5PA 4AN2A 4ERKA 3NW7A 4PL4A 5J1WA 4ZZOA 1YHVA 3E3PA 2GTNA 2XK8A 4FKOA 1YOLA 5AUWA 3WZUA 5CLPA 4TN6A 4BFMA 3G2FA 1MRUA 4BHNA 3WE8A 4EYMA 5HLWA 4B99A 5L4QA 5J8IA 4IX4A 2VNWA 3ZBFA 2GSFA 3BELA 4AGUA 1JOWB 3T8OA 1PXKA 4PTEA 4Q9SA 4XRLA 4AS0A 4BDBA 2AC5A 4M8TA 4Z3VA 2X8EA 2QURA 3GCQA 3FHRA 2WEIA 2P55A 3N51A 4TTHB 5EHLA 4AT3A 3DGKA 3D4QA 2GS7A 2GS6A 4FL3A 4G3EA 2W1EA 2I0EA 3LXKA 4FV5A 4UV0A 4Y8DA 3U51A 3EQRA 3SC1A 4B8LA 4EQUA 5CSPA 3R0TA 4I20A 4QMNA 5ITAA 2GU8A 2UZWE 2E9OA 4WG3A 2XRUA 2BZHB 5T3QA 4HYSA 1SVHA 4RIXA 4G3DA 3FQHA 3IW4A 4CFWA 2IW6A 4O1OA 3IOPA 3PTGA 2ERKA 2XCHA 1SMHA 2BHEA 5EW3A 3TJDA 5M4CA 4HZRA 3U87A 3DOGA 3UQFA 2WQOA 3ZLYA 1JKKA 1NVQA 1W82A 4FX3A 4YBKA 1TKIA 1YI6A 4C0TA 1ZWSA 4BDFA 4QMQA 1VEBA 5DIAA 4EI4A 3AMBA 2QG5A 4M3QA 4CQEA 3Q04A 5DRDA 3ZLSA 3NUPA 1PXLA 4WSQA 3AD5A 2YDIA 4I4FA 4RJ7A 5GJDA 3MB7A 3WZEA 3QRTA 4F4PA 2HYYA 1SNUA 4F1MA 3HV5A 5A4EA 3MA3A 4D0WA 4OT5A 3PVBA 3QGWA 4FGBA 4EZ5A 2VO0A 3JS2A 4ENYA 2JDTA 2ZV7A 2Z7RA 3NNUA 4FKPA 2GNGA 2XVDA 5IUIA 4C2VA 5I9UA 3OW4A 4E93A 5A4QA 3VS4A 1PKDA 3BHVA 3LOKA 3NUSA 3OCSA 4O91A 3UNJA 1I09A 4M69A 3GQIA 5A54A 3KN5A 1FVRA 4HCVA 1ZYDA 2C6LA 3DLSA 5HE2A 4C35A 2QHNA 3L9NA 4MNEB 2H34A 3R30A 4AX8A 4UMUA 4KBKA 2GQGA 3VWAA 4Z55A 5JGDA 5AM6A 5HO6A 5KO1A 4FUYA 4JBQA 3EQIA 3I79A 4FV2A 3VBVA 3HA6A 2ITTA 3R7UA 2JD5A 5HD4A 4O6EA 1S9IA 1UKHA 4FKWA 4DAWA 4EZ3A 4YUQA 3DNEA 1OPJA 5KBRA 4OAVB 3DK6A 3TTJA 4I5PA 2CKEA 3GOKA 4S34A 4QQTA 2OH4A 4LGDA 4QP9A 2B7AA 3QCXA 5FTQA 1WVWA 2X0GA 1IG1A 3WILA 5HIEA 4G1WA 4R1YA 4JLCA 5AR8A 3E8NA 5CF6A 1FINA 1Q41A 2C4GA 3U8WA 2UW3A 3E3BX 4KAOA 2HIWA 3R8LA 4ZLYA 2IZUA 3PY0A 4A07A 4IB5A 2YM4A 1HOWA 2I0YA 4OGRA 2B1PA 2XBJA 4FTRA 3AC8A 5EDQA 2W9ZB 2YCRA 2W99B 1DAWA 3QUDA 3VUMA 4II5A 3KF7A 3HA8A 1FMOE 2WQNA 3DTCA 5FGKA 5HTBA 5JH6A 4FTIA 4MBIA 2JEDA 2YCSA 3QL8A 4F1OA 2W1HA 1Y8YA 4HZSA 4NK9A 3DBFA 3ZFYA 4ZP5A 3R9HA 5F94A 3O51A 3QTSA 2BRGA 1Q8WA 3NZ0A 5AV2A 2E9PA 3GUBA 3QD2B 4MXZA 4TNBA 1QL6A 3A62A 3PIZA 3ODYX 1R1WA 5CSWA 4F9YA 2P2HA 4P5ZA 4ALVA 4L3LA 5KUPA 2R64A 4AWIA 2QC6A 5J5SA 4J53A 4PDSA 3T9TA 4N70A 4MTAA 4FICA 2R3IA 3ZDIA 2YJRA 1F3MC 5IA2A 1U59A 2BDWA 4I5CA 2XNNA 4NSTA 4RJ4A 5HE3A 5HI2A 3EJ1A 1YQJA 4RIYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4C8BA

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations