4C8B | Genus

Total Genus 87

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	87
sequence length	309
structure length	279
Chain Sequence	SALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHIHTPLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGTIIYMPPENYSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLKKTKLQS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inflammatory Signaling by NOD-RIPK2 Is Inhibited by Clinically Relevant Type II Kinase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
total genus	87
structure length	279
sequence length	309
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2013-09-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4c8bA00

1NVQA 1Q5KA 3CP9A 5FTOA 1ZY4A 3CE3A 3VBWA 3TKIA 5ETCA 4XUFA 3K5UA 3LJ1A 2J7TA 3D94A 3II5A 3OXZA 5GJDA 3ORTA 3I5ZA 3RI1A 2I40A 4GU6A 1KE7A 3MFUA 3QCXA 4E5AX 1R3CA 3E87A 4C57A 4E6AA 2OU7A 1OECA 4UMUA 3HV6A 3TWJA 4QMSA 4AZFA 2KULA 4BVUA 2OH4A 4EK3A 5KX8A 2WIHA 4IDTA 2W1DA 4OR5A 2HENA 3HRBA 4J8NA 4FTOA 4TZRA 5HNBA 3OG7A 2XUUA 4H1JA 3UG1A 3SV0A 4F99A 2Z2WA 3ZCLA 5EYCA 5H8GA 3AG9A 2J51A 3PA4A 5EW3A 2Z60A 3VS2A 3MB7A 2WMWA 2JIVA 3KY2A 5D12A 5HLNA 3O7LB 2IVVA 3VQHA 4EH5A 4O0WA 4Y5QA 4FSQA 5L2WA 2ESMA 3VUKA 3QKKA 3A7JA 3OCTA 2C1AA 2P0CA 2XB7A 5FEQA 1ZLTA 5AEPA 3ULZA 5KZ0A 4G3CA 3Q4UA 4IB5A 4NCTA 3H30A 1VZOA 2WU6A 2HELA 3MVHA 1J1CA 3QTWA 1Q4LA 3H4JA 3RK9A 5D9HA 2VNYA 4RX9A 4AF3A 4PL3A 3MA6A 3KK9A 4WBBB 1WZYA 3F3UA 2HZIA 3R9OA 3V5LA 4ZY5A 1W83A 3OT8A 3QFVA 3QUEA 4IWQA 3PWDA 3SXFA 3FMNA 3SAYA 2RIOA 3QX2A 4FEQA 3PXYA 2YZAA 3RPVA 3ORKA 5AP7A 4BDDA 1JBPE 1Y57A 3KCKA 2FSMX 4KSQA 4Y73A 5J95A 4NKAA 4RJ3A 4C38A 1X8BA 3TG1A 4I5HA 4PUZA 5LVLA 5CASA 2IJMA 4U6RA 4HPTE 3FBVA 4CZUA 1G5SA 4AUAA 3C9WA 4CEGA 4EONA 3LCTA 2WPAA 1YWVA 2H96A 2AUHA 5DR9A 5I9ZA 4E3CA 3C13A 3Q6WA 4MX9A 2LAVA 4AA0A 3ZH8A 5HLWA 4W9XA 3KRRA 3MA3A 4GH2A 4V0GB 5ETAA 5EW8A 1GIIA 2OBJA 3ZM4A 5J1VA 3ZLSA 3O2MA 3NW5A 4BGQA 4LRKA 3CJGA 4B6LA 3EN9A 5BVFA 3AC5A 3UOLA 2BAQA 2JIUA 5E92A 4Z16A 2JKMA 1SVGA 2H8HA 3COKA 3EWHA 4QTDA 3EIDA 5JT2A 3BPRA 1P4FA 2YDJA 4AFEA 1PMNA 4HYIA 3P4KA 3Q96A 4TYIA 2C5OA 5DNRA 3OBJA 4BZOA 3HDMA 5DH3A 2YM3A 2GS6A 4TWOA 2OJ9A 2OWBA 4X7QA 4DH5A 4F6SA 3LCDA 4OTHA 4D2RA 4RC4A 4EQMA 4JDJA 3UNKA 2QOIA 4U79A 4RRVA 3VRYA 5J1WA 3VF8A 4DFNA 2IVSA 1BKXA 3KVXA 4FK6A 4OBQA 1PXLA 3KMWA 3UGCA 5AUZA 2X4ZA 3BU5A 4MQ1A 4YPDA 3D7TA 3A60A 2CCHA 1XH4A 4JBPA 3TZ9A 4C4EA 2GFSA 4FV9A 4OAVB 3QUDA 3G9LX 5BNJA 4KIPA 4U3YA 3VC4A 4KD1A 4C37A 3WF5A 3TNQB 5A4TA 3QYWA 4YC3A 2UW8A 4YNEA 2XIKA 5A14A 3LFSA 2JDRA 3R02A 4ITIA 1H27A 4IAIA 3RHXA 2E9VA 2VV9A 3I4BA 4U40A 1KE6A 3TKUA 5I5ZA 4G9RA 5M57A 4QO9A 3O50A 3NUNA 3R83A 5K3YA 4TYHB 4X2KA 3TL8A 2W4OA 2QODA 1VYWA 2C5YA 2C0OA 2YCRA 4R6VA 3FLQA 3H0ZA 3NS9A 4JG6A 5AADA 2A1AB 3PA3A 3LXLA 5J87A 4XG3A 2BZIB 3MTFA 4BCHA 5CAUA 2R3PA 4L00A 4RMZA 4ZY4A 3JS2A 3NW6A 2ZOQA 2ZVAA 3DDPA 3E64A 3NNUA 1H1PA 5E1SA 4TN6A 5F9EA 1V0BA 2P4IA 1OUYA 3RZBA 4Y5HA 5AV4A 2JKOA 5E8YA 5JRQA 4AWIA 5HEZA 1GJOA 3O8TA 4YMJA 2PE2A 3MDYA 1W84A 3VBYA 4JT3A 3O51A 4FZAB 4J99A 4FYNA 4EL9A 1R0PA 1ZWSA 3Q4ZA 4DH3A 3WE4A 3LQ8A 1FMOE 3RJCA 2HWOA 3R00A 2PTKA 4HCUA 5B7VA 5C26A 1YWRA 5LMBA 5IH5A 3BRBA 5BYZA 2X9EA 1FPUA 3RK7A 3IPHA 5J9YA 4XRLA 1PF8A 5CU6A 4A4OA 4B8LA 3IS5A 2XEZA 3EN7A 4LGHA 3UTOA 1REKA 5IDNA 4J97A 5JK3A 4CYIA 4FICA 2GQGA 3LE6A 3M1SA 4FODA 1JNKA 1GIHA 2B9IA 3MVLA 3Q9WA 4IX6A 4WUNA 4UV0A 3FQSA 2QKRA 2JAMA 4EC9A 2BPMA 4W9WA 3POOA 2OZOA 2C6LA 1GIJA 4WSYA 2VGOA 4FKLA 4BCIA 4H36A 4PDOA 1VYZA 4G17A 3BHYA 4I93A 4U41A 3W2RA 4EOQA 3PIZA 2IW8A 3OWPA 4CFFA 4EZ5A 3R7GA 4D58A 3SDJA 4C58A 3HX4A 3QZHA 4ANBA 1Q61A 4QPSA 5FDPA 3FQEA 1GZ8A 4H3QA 4Z7GA 2BDWA 3O8UA 3CD3A 3C1XA 3DV3A 5EOBA 3R7VA 4I5MA 4JJRA 2QCSA 3D0EA 3P0MA 4CT1A 2OFVA 1REJA 4ZS0A 4IB1A 3QRJA 3I7CA 3NAYA 4MD8E 3ZFMA 4C4FA 2O65A 3MN3A 3W32A 5JN2A 2BTSA 4R1VA 2G15A 3AC2A 4L68A 4YJTA 4E7WA 2FSOX 4E8AA 3HMMA 4BB4A 4FKOA 5JEBA 4J7BA 4CV9A 5L6PA 1TQPA 3GFWA 4QP3A 2AC3A 5ANGA 2VWWA 5DVRA 3FMEA 3QRUA 4W4WA 4F63A 2ETKA 2QR7A 3SX9A 1YXVA 3R73A 2CN8A 1GZKA 2EXMA 4BCFA 3LPBA 5HG7A 4IJ9A 4R3CA 1M7NA 2QOLA 1XBBA 3A7HA 4XG9A 2BZKB 3LXKA 4XG2A 4KNBA 4F0IA 2J0MB 2EXCX 3KXZA 4S31A 1JKLA 1Y91A 3P7AA 4PV0A 3HKOA 3ZRKA 4RX8A 3VW6A 1F5QA 3HDNA 3QGWA 1AQ1A 5EI8A 3F3TA 5C8MA 2WQNA 4AP7A 4CVAA 3DJ6A 4F9WA 2PE0A 3VJNA 2BILB 2PZYA 3HUBA 2WQMA 3MWUA 2Z7QA 2C69A 3D4QA 3PWYA 3GU8A 3GU6A 4GK3A 4AN3A 4Q9ZA 3AGLA 4JR7A 4OTRA 4YC6A 5AP3A 3TZMA 3CGOA 2P2HA 4A07A 3I6WA 5AUXA 1KV2A 4FV1A 4IX3A 1XWSA 3DK3A 3QD2B 5FXQA 2ZV7A 3SRVA 5IA3A 1UVRA 3SVVA 3F5GA 5JRSA 5KHWA 3DT1A 3UPXA 1ZMWA 4A9TA 4F1MA 3EQCA 1YI6A 3ET7A 4YZMA 3D5UA 1ZYJA 2XJ1A 3FPMA 3Q9ZA 3QALE 4I92A 4UMQA 2XBJA 4O6EA 3UMXA 4RJ8A 4C0TA 4DGNA 2OJIA 4FTIA 3FZOA 2ETRA 1UWHA 1F0QA 3EN5A 4U0IA 4Y83A 2PMIA 3PJCA 4KB8A 4O96A 4GT4A 5FQDC 5LCKA 5A4EA 5I4NA 3EN6A 4NTSA 4NWMA 4BKJA 4LM5A 3FSKA 3HP2A 3EFJA 3H3CA 3S4QA 1P5EA 4UYAA 4Z7HA 4R3PA 5BVOA 3QBNA 3NAXA 3D15A 4X3FC 3NIZA 1ZRZA 4D1XA 4FKVA 4V05A 3SD0A 4I20A 5H8EA 2F2CB 2X0GA 4E6DA 4CKIA 4M69A 3U9CA 1M2RA 5I9VA 2JDOA 5DPVA 5I9WA 2PWLA 3PE1A 4OT6A 2BIYA 5HG8A 4LQMA 3WF9A 5AV1A 4XX9A 4C35A 5EDRA 3OOGA 4EH3A 3LMGA 4RVTA 3PP0A 2HZNA 4IC7A 4QQ5A 5E90A 2KTYA 2PSQA 3LFAA 2OXDA 1IASA 2R3QA 3BU6A 4NM5A 5E8XA 1OM1A 2JFMA 5HESA 3F3VA 3QGYA 1OMWA 1OL1A 3BV2A 4YHFA 4BCMA 2E9PA 4U42A 3Q53A 2ZMCA 4QRCA 4CTCA 2PE1A 5A4CA 2WTIA 1I44A 3U8WA 2PZPA 2R3NA 3DXNA 4EOIA 1V0OA 1Q8YA 4TNDA 4F6UA 5B2LA 4KKHA 5HNIX 3VIDA 5KKRC 5CZHA 3CPCA 5EDQA 4EQCA 2JDSA 4FSNA 3LCSA 3KF7A 2C6OA 4I1ZA 4M84A 5AIRA 3W18A 4C2WA 3R9NA 2YDIA 5LVPA 2OH0E 5GJGA 4DH8A 3WI6A 4PQNA 2YM4A 3R7EA 5CF4A 3MJ1A 1YHSA 2XIXA 4FV8A 4U80A 4QYHA 3IDBA 3M42A 4BCGA 4FZFB 4Z3VA 2WFYA 5A6OA 1Z57A 3LCKA 3GC9A 3THBA 4IAAA 3BWJA 4XP0A 3G0FA 1CKJA 3TZ7A 5CU0A 5LCJA 2JKQA 3FMJA 3FZTA 4IAKA 4K33A 4BBMA 4F4PA 4YTHA 3R1YA 3V8TA 2R3JA 4F0FA 3PRIA 2QU5A 3ZRMA 4HYSA 4IVAA 2V55A 4F9YA 3KGAA 5HO6A 4IANA 3H9OA 3AGMA 2R7BA 5EM8A 4OGRA 3CXWA 3QX4A 3D2IA 3FKNA 4AXAA 3A8XA 3WZJA 4UWCA 4E4XA 3ETAA 5EDPA 2JIIA 4Q2AA 3PZEA 2H6DA 3FMDA 3D2KA 2UW9A 2ZYBA 3UIMA 2WNTA 3RVGA 3BU3A 3P5KA 5CT0A 2QOKA 4KIQA 5FG8A 5AWMA 4QMVA 4L9IA 1QCFA 3NDMA 3UQCA 2OFUA 3F7ZA 3VUHA 2XKFA 2PZIA 3ORPA 3ZS5A 3DFAA 2FA2A 3K2LA 2B7AA 3F5XA 3MH3A 2I0YA 1LPUA 2GS7A 3CQUA 3KB7A 3FDNA 2BHHA 2YCQA 1KE9A 3LFQA 2J5FA 5I9UA 5BMSA 4U9AA 1M52A 3ENHA 3F2AA 2P3GX 3F9NA 5CAVA 3MY5A 5FD2A 3FZSA 4MQ2A 4HGLA 1UV5A 4OW8A 3N9XA 4DTKA 2VTOA 4R7HA 2CMWA 2C6KA 2C6TA 3VQUA 3WF8A 3R7OA 4BDGA 4G31A 4BL1A 2WKMA 1ZZLA 2ITQA 3C0HA 3IO7A 3G9NA 3MH2A 3NSZA 4J98A 1MUOA 4N6YA 5HE3A 3FKOA 4F9AA 5K0XA 4GG5A 3UZPA 4USDA 4WRGA 3O8PA 4EOPA 2QD9A 5L6OA 4RIWB 5FM3A 2Z7LA 2WOUA 3E88A 4UMTA 3CCNA 2YCSA 4PNIA 4ANMA 4BCPA 3RZFA 4BCOA 4QNYA 5CAPA 4ZLOA 4ZTHA 2R9SA 3UBDA 3UIXA 3AXWA 4I3ZA 3TIYA 4KS8A 4NCTC 4IBMA 1H26A 1OGUA 2VWBA 4AT4A 1PKGA 2IW6A 3BHVA 2BZJA 1CTPE 1NXKA 5DGZA 4IH8A 4FKWA 4M14A 5EOLA 4AOJA 3DK7A 5AR8A 5IA2A 2NO3A 4RIXB 4KABA 3QLFA 4DFLA 4FIFA 4V0GA 2VGPA 3KXHA 3R71A 3K3IA 4J53A 4I23A 3DBCA 4AN9A 4EKKA 1XJDA 4WA9A 2VWUA 3PG3A 4IAFA 5CQWA 2XIRA 2OZAB 4JI9A 4A9UA 2XNBA 1DI9A 3L1SA 3DJ5A 4FTLA 3PG1A 4AQCA 2ITXA 1LUFA 1OI9A 2YIYA 4QTAA 4AZVA 3U6IA 3A4PA 3DBQA 4D4YA 1WBOA 3GU4A 4BDFA 5ANOA 3PTGA 2X2KA 2FGIA 4QMQA 3RHKA 5J5SA 2UW5A 4FG7A 4YO4A 2IZRA 3RAWA 4L42A 1ZMUA 1RQQA 2FVDA 4IW0A 4QMZA 4EKLA 2OF2A 3ZLWA 5CNNA 3KKVA 4J8MA 3FY0A 4TRLA 4FNYA 4ERWA 2WO6A 5HNGA 4RJ6A 4UBAA 1ZYDA 3G51A 3QA8A 3FJQE 4QP7A 3DKFA 5CAQA 3VBXA 2UVXA 3E3PA 4ZZMA 2XJ2A 4WKQA 3I5NA 3OFMA 5FEEA 4FIIA 3RWPA 4EWQA 2W4KA 1YDSE 2X81A 3KRJA 4BRXA 5CEKA 4AOTA 5FWKK 3FY2A 3ZUUA 2XIYA 5B2MA 2W0JA 1Q8ZA 3IW6A 2YFXA 2P55A 3KC3A 4IACA 4IWPA 3WILA 1Y6BA 3MIYA 4JQEA 2X7GA 3HEGA 4WG5A 5KHXA 4S30A 3NYOA 1YXXA 3P9JA 5HU3A 2V0DA 3U51A 4ALVA 2GNFA 4YC8A 3OTVA 4KS7A 5BUJA 3IQ7A 2O3PA 4J1RA 5AMNA 2OF4A 4OTGA 1FGIA 4GU9A 2GTMA 3PVGA 3VAPA 5AA9A 2F9GA 4QYYA 5EYKA 3VS7A 4I24A 5EI2A 3SOCA 4ACGA 2ITOA 4YZNA 2F7ZE 3UODA 3SKCA 2UVZA 3OXTA 3UPZA 5AX3A 5BQ0A 2UZEA 4IE9A 4KBAA 5TKDA 3FMHA 4CMOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4C8BA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations