4D2P | Genus

Total Genus 95

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	95
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	95
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4d2pA00

2AC3A 4FKRA 3R8MA 4PNKA 3UZPA 2V55A 4J99A 4DGGA 3VBVA 2JAMA 3RM6A 3DJ5A 4YZDA 3EYGA 5CNNA 5EFQA 3PJ2A 4XBRA 3BWFA 3QUPA 3SKCA 3TKIA 4WBBB 3U4UA 4CMUA 5L2SA 3F61A 1CM8A 1A06A 5I3OA 5IPJA 3BE2A 4AN3A 2XRWA 1BLXA 3CKXA 2NPQA 3UIXA 4I4FA 5KZIA 1PW2A 2ONLC 5E8UA 3ZO4A 3COKA 1YDSE 4EZ3A 4M97A 3KRWA 2OIQA 1FVRA 4FTQA 2WTCA 3TV6A 5FTQA 3T8OA 1OUYA 3R30A 2BZJA 3RPSA 2HIWA 3G9LX 2CPKE 2J0MB 4M14A 1WBSA 3ZFXA 1IR3A 4BTKA 2X0GA 3ZONA 4LV8A 4ZS0A 5CZHA 3QD2B 5LMAA 4U0IA 4FIFA 4MXZA 4M8TA 4QP3A 4RQKA 2W1EA 4C7TA 5KMLA 3FBVA 3HECA 1YHSA 1OKYA 4DH5A 1H1RA 3MPMA 4FKQA 3TNHA 4MBJA 2PVHA 4IWOA 1PXIA 2YCSA 4ZSEA 5HORA 2WIHA 4G3EA 4UZHA 4JX3A 2RKUA 3GUBA 5FXQA 4DFXE 2VX1A 4DTKA 3NNXA 3CPCA 1ZMVA 3FE3A 2ZB1A 3KXNA 5FGKA 4F9AA 1E1VA 1JOWB 5CVGA 3FAAA 3GFEA 4HJOA 5FD2A 2WTJA 1YQJA 3DDQA 4X7QA 4ITIA 2VV9A 2R3FA 4OBOA 4YJSA 3TL8A 3R1SA 3VNTA 3UNKA 4YC6A 2R4BA 5DG5A 3WOWA 5FXRA 4N4SA 3UVQA 4DGLC 3FZRA 2UW4A 5E1EA 3ULZA 5B2MA 4L3LA 3BPRA 4K18A 5I3RA 2WFYA 4I0SA 1UVRA 2I0HA 2YDIA 3QX4A 4ERKA 3H0YA 4IX6A 5CU3A 4YHFA 4D4RA 2UUEA 3LXKA 3F7ZA 4C3RA 3R2YA 3I79A 3EHAA 4X6RA 3W2PA 3QTQA 4F70A 4GG7A 5J7HA 1ZYDA 3WILA 3PG1A 5GJFA 4ZSAA 4F64A 4DH3A 3G0EA 3Q4UA 3PJ3A 4FZ6A 3U6IA 5E91A 4EH6A 4HVDA 4F99A 3BYSA 3HRCA 4FKWA 5T6KA 5C8MA 3TJDA 3R8VA 3TUCA 3S00A 2Z7QA 3TV4A 4CNHA 2X2MA 2UW3A 5D1JA 4AE6A 2UVYA 2OJ9A 1ZAOA 3MYGA 3QWJA 4G6LA 4MD9E 5JFSA 3RZFA 5JSMA 3OVVA 5M57A 5HOAA 5DEWA 4D0WA 4U3YA 3QF9A 2QU6A 5AEPA 2CCIA 3UIBA 4X3FA 2RG6A 2BDFA 3EQRA 3OD6X 4EUTA 4FZDB 3QGWA 5DIAA 1JSUA 4JQ8A 5DR2A 3F3ZA 4R3PA 3ROCA 1QL6A 5AR4A 3PY1A 5L2QA 2XJ2A 4C58A 3VBTA 2OFUA 2OZOA 3TZ7A 5AM7A 4WNMA 1RW8A 3SRVA 1H0WA 1OKWA 4ZLZA 3BLRA 2BTSA 3PXQA 2X8IA 3WZUA 4CFUA 3IOKA 1UNLA 1QPDA 1YWNA 2CN8A 2RIOA 3I5ZA 4PMPA 5A6OA 3QQUA 4BCQA 4J52A 3ZLYA 4PPBA 3VUIA 2EWAA 4OTQA 5BMMA 1ZARA 4A07A 2O2UA 4YUQA 4ZTMA 3RHKA 3DAEA 4BDHA 3QAME 3UE4A 3MH1A 4GT4A 4CEGA 4XLIA 3PRFA 2XJ1A 4JG7A 3EN9A 2W96B 2W5HA 2XYUA 3PWYA 5TF9A 3F82A 4CV8A 1MUOA 2FH9A 2PSQA 4WG3A 4RJ3A 5CT7A 4X3FC 4RIYA 3RNIA 3ZXTA 5AUYA 3R63A 2V5QA 3FLNC 1P4FA 3OCTA 5G6VA 5B0XA 3PVWA 4I21A 3KK9A 5IUIA 4D2WA 4IVDA 1WVWA 4FIHA 3UP2A 3WBLA 1J91A 2H6DA 4MXCA 4LMNA 2BRBA 3WIKA 1H27A 5M4FA 3OC1A 3NNUA 4MXYA 4TPTA 3NYVA 2YCFA 3CY2A 4KA3A 2OSCA 4FIJA 2XUUA 1PYXA 2W4JA 3E92A 4CKJA 4KBCA 4FTCA 5I5ZA 3VS0A 3VUTA 2Y4IC 4S30A 2PE0A 2WKMA 4OUCA 4Y85A 2XP2A 4JNWA 4PY1A 4D5KA 3W8LA 4RJ8A 4BIDA 1WMKA 2ZDTA 2ITWA 5BQ0A 3M1SA 5JZJA 5EDPA 5E7RA 4D4SA 3FXXA 1KE8A 5A9UA 2B9IA 3QLGA 4PDSA 5FXSA 2V7AA 2WPAA 4AFJA 2WAJA 2ZMCA 3VHKA 5JRQA 3KN6A 3ORLA 1ZYJA 4C4JA 5DGZA 2VTQA 3A8WA 4AGWA 5IDNA 4HYIA 4E6QA 3CTQA 3FC2A 4FKUA 3RK9A 1CKIA 1OIQA 4YZBA 3BYMA 4PV0A 4K6ZA 3KMWA 3DCVA 4NH1A 4UXQA 4YGAA 4BBMA 4EONA 2GSFA 2HAKA 2C6EA 1H00A 3ROYA 2W99B 3DV3A 3TACA 3W33A 2W0JA 3FY0A 3KC3A 4PMTA 3L8PA 1A9UA 2FSLX 4Z7HA 3TNQB 4UYAA 3V6SA 4BDCA 4F9CA 1Q3WA 5LOHA 3GU8A 3NDMA 3LXPA 4Q9ZA 3LIJA 4C59A 1APME 4NW5A 3BHVA 4UV0A 1T46A 3GU6A 3QXOA 4EH2A 3CTHA 4EYJA 3NUNA 3Q4CA 1YOJA 3EJ1A 3O96A 3FV8A 3OCBA 4JDHA 4FKTA 3MSSA 2O65A 3BYUA 4YR8A 5BMSA 5LWNA 4O96A 3JYAA 3CQUA 5EM7A 5A4QA 3NX8A 2OK1A 3RPVA 2F7ZE 5C01A 2ESMA 5CALA 2BFYA 1Z5MA 3MTLA 3H9RA 4RC4A 4E6AA 4F6SA 3DZQA 5HNBA 3PLSA 3IW4A 3FUPA 4E73A 3FKOA 3G90X 3CP9A 2BILB 4QP1A 1DS5A 1P14A 3ANRA 4KIOA 4MWHA 4QP4A 3V8TA 3U6JA 3A7JA 2FA2A 2X4FA 4I24A 2XIXA 2ZV9A 3HUCA 3C0HA 1MQ4A 5EH0A 3KVXA 5ETAA 3OWJA 4L52A 4AE9A 4E6DA 3CPBA 4DH1A 5BUIA 2VWXA 3LMGA 2X6DA 4WKQA 3GEQA 5L6PA 3KKVA 5KBQA 2F49A 1YRPA 3D14A 2YEXA 4O0TA 2HZ4A 3PP0A 3DT1A 4NCTC 3ZSGA 5AJQA 4UWYA 5AAGA 4IBMA 5EKNA 4KKGA 1BL6A 4S2ZA 5HBEA 4F6WA 3GU5A 4DYMA 3KULB 3KQ7A 1F3MC 4JT3A 4U6RA 4PX6A 4C57A 2GQGA 3PVBA 3LPBA 4JR7A 2NP8A 4XV2A 3MV5A 4EK6A 5JGDA 2QHMA 5HVKA 3UZTA 4WT6A 2R3PA 3LXLA 3I7BA 1Y8YA 3A7GA 5AUWA 2ITQA 5CAUA 2NRUA 2WMXA 4HGTA 3A7FA 3FQEA 4BGQA 4Z3VA 1ZY4A 3NS9A 2ITNA 2QURA 4BIBA 1Q97A 3PSDA 2X8DA 3NW5A 2J0JA 1PXNA 3WYXA 3CR0A 5HG8A 1WVYA 5AA8A 3S0OA 4H3QA 1LEWA 2I0EA 2QC6A 3ZBFA 2XBJA 2XBAA 5KNJA 3FZSA 1W0XC 2DS1A 3VRYA 1PY5A 3PXZA 4BF2A 2B53A 2OJGA 4HCVA 5EHYA 5LVNA 2QOKA 2YM8A 4TYEA 1H07A 2W1IA 4TW9A 3RK5A 3RWQA 2PVFA 3IOPA 4ITJA 3MVJA 3KRRA 5K0XA 5FDXA 4YTHA 2A2AA 4J53A 5HNGA 3DKFA 5C03A 2R3OA 4BKYA 5CI6A 5L2WA 4ZJVA 3ZCLA 4XYFA 1GAGA 4UZDA 5AR2A 5HEZA 3NUXA 3F88A 3BYOA 3W32A 3LJ1A 3MH3A 3MY1A 3FLZA 4KIKB 3PXYA 2PVNA 5I0BA 1WVXA 5GJDA 4QPAA 3UG1A 5DEYA 3RPYA 2XNMA 2Q0NA 3EN5A 5FEDA 4AOIA 3P1AA 3FHIA 3NLBA 2Z2WA 2QKRA 4U3ZA 4EI4A 1PMNA 5FDPA 3GFWA 3V5TA 3Q5IA 4YBKA 3K3JA 4GVJA 4RC2A 3NYOA 3BQCA 3AD4A 4FV0A 3QL8A 4NM5A 5FP5A 4DLJA 1U5RA 2Y7JA 4QOXA 3W2RA 3OEZA 3P86A 4FV3A 3CBLA 2IVTA 4RG0A 5CQUA 2FSOX 3MIAA 3QZGA 1GZOA 4YC3A 1RE8A 5HIBA 4ZZMA 5J9LA 2R3QA 4AN9A 3KXXA 2XEZA 2H96A 4FSZA 5M55A 5H2UA 2BMCA 2YABA 4YPSA 2OXYA 2G2IA 3FMNA 3QA0A 4O1OA 4O0VA 4FT3A 3R22A 4MD8E 1CDKA 4EQMA 5KO1A 4M3QA 2YA9A 5ACBC 1K3AA 4LOOA 5AA9A 2WZJA 3F3UA 5M44A 1KOBA 2HWPA 4FV7A 3ORXA 3MGYA 3CTJA 2ZV8A 3VF8A 5HIEA 3QKKA 2QONA 4IW0A 4ENYA 5A4CA 5BVOA 5BVFA 4ALWA 4RJ4A 3ZSHA 4GMYA 3JUHA 2XNGA 3RKBA 3Q96A 4IM2A 5LJJA 3KXHA 2ACXA 4NU1A 4X21A 4AW5A 3A4OX 5L6OA 2CGXA 5JQ8A 4F65A 4FSYA 1AGWA 5FLFA 4YO4A 1JWHA 3MPAA 4K77A 4JDJA 1SVEA 3MIYA 3D5UA 5A4LA 5EOBA 3R9NA 3PFQA 4A7CA 3PTGA 4MF1A 1XH5A 3LE6A 4HVGA 5F9EA 3H9FA 3RP9A 3DQXA 3QQGA 3DTWA 4UY9A 3QLFA 3G33A 4ZSJA 3UG2A 5CEPA 1R0PA 3BV2A 4FF8A 4ANMA 4OTHA 3NW6A 4FK3A 3P79A 4FNZA 4QYEA 4HVHA 3U8WA 4USDA 4G3CA 3KMUA 3AG9A 2A27A 2YAKA 5AP1A 3ZFMA 4EORA 4Z16A 4F7SA 4FTLA 4FTOA 2Y4PA 4CQGA 2J2IB 5AX9A 4AW0A 4DG0E 3JVRA 4Y5HA 1W8CA 3CCNA 2Z8CA 3DB8A 2IW8A 5C27A 2YIQA 2W1ZA 3POZA 2BR1A 3JVSA 2PY3A 4U97A 3P7AA 5EHLA 4ANBA 4OR5A 4FKLA 2VTNA 4QMPA 4I3ZA 4JI9A 4AA0A 4FMQA 4J8MA 3PE2A 4XUFA 4CFXA 4E20A 3POOA 4FKPA 2EB2A 2VO0A 4I1ZA 4ASZA 3F5XA 4EYMA 3RAWA 5KMIA 3PPKA 4IEBA 5CAQA 2V0DA 4YSJA 2V7OA 2GFCA 2VWIA 4XG7A 3NPCA 4CZUA 2GNLA 3P78A 1H08A 1X8BA 2BFXA 4ACGA 4HGEA 4WHZA 4GYGA 4FTKA 1W98A 3HDMA 2WEVA 4UMRA 3EB0A 4AZEA 3M2WA 2JD5A 3OWPA 1TVOA 3HZTA 4GSBA 2UZUE 5CXHA 4O0YA 3UODA 4R3RA 3LHJA 2A1AB 3PRIA 2ZM4A 4PWNA 2ITXA 3EL7A 5A6NA 3ZLWA 4WO5A 3VBXA 5J87A 3QTZA 2GS7A 3MJ2A 2QD9A 3JY9A 2Y9QA 2UZTA 4DH7A 1G5SA 3SC1A 4GT3A 3UVRA 1ZYSA 4WIHA 4O91A 4GT5A 2G2HA 4FG8A 1XKKA 4J96A 1Q4LA 2YJSA 5AUZA 2JKMA 1R39A 3EQDA 5ANKA 4ZZNA 3LFSA 5E8XA 2IVSA 2WQOA 4HGSA 5HLPA 4MNFA 4XX9A 3OT8A 5F95A 2A4LA 5D11A 4LGDA 3VJNA 4D9TA 2VWUA 4CCUA 2YM6A 4EH4A 4F63A 4TNDA 3AC3A 4IVAA 3G5DA 4YLKA 3O7LD 4J8NA 4I0TA 4DCEA 4FNWA 2HELA 4IAYA 5TT7A 4ZTNA 3VBWA 3MVHA 3CGFA 1XO2B 3I60A 4FK6A 1U5QA 5J95A 5HX8A 2J4ZA 4RX8A 3GC7A 4DLIA 2Z7RA 4BBEA 3ZRLA 1JVPP 4CRLA 2QLQA 4KINA 5E8SA 2BRNA 3MW1A 3E7VA 1YOLA 4P5ZA 4BWKA 1Q61A 3WE8A 4QPMA 3BIZA 1JSTA 3KA0A 2IN6A 3TIZA 4X3FB 4ASEA 1NA7A 2OZAA 3A7HA 4DN5A 2XK8A 1O6KA 2F57A 2XF0A 3F7WA 3MB6A 4BCOA 1LR4A 1FVTA 4XP3A 3ZEPA 3TG1A 2JBPA 4RBLA 2UZEA 2BIYA 4BCMA 4XG6A 4BL1A 3NUSA 4GUBA 5AM6A 5IKWA 4BDEA 2GU8A 3NWWA 4IX5A 3SRVB 4FTJA 3U87A 3PZHA 4RQVA 4U80A 5IMXA 3IO7A 4RIXA 4OW8A 4G3FA 4QYFA 4L43A 3DBEA 4E93A 2UZDA 3DKGA 2KULA 3HKOA 4UMPA 4KB8A 4BI0A 2UW6A 4MQ1A 4JOAA 4L45A 2Y4IB 4MHAA 2W06A 2XM8A 4LUEA 3R7UA 4DEIA 5BNJA 1IEPA 1K9AA 4QMOA 4LGGA 4MQ2A 4FV1A 3SW4A 3UQGA 3S95A 4ANLA 1V1KA 3RK7A 4BI2A 2XH5A 2JFLA 2WTWA 3OHTA 4BGGA 3QC4A 4GCJA 3C7QA 3PJ1A 4UN0C 2RFSA 2O3PA 4HVSA 5J1WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4D2PA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations