4D2V | Genus

Total Genus 98

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	98
sequence length	334
structure length	313
Chain Sequence	HMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	98
structure length	313
sequence length	334
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4d2vA00

4FKRA 2OXXA 4FIGA 4L3LA 2B9HA 3VF9A 4C4IA 3F69A 4HGTA 3L8PA 4L6QA 5EYMA 2ONLA 5E8TA 3UZPA 5HBJA 1IEPA 4B0GA 4HGSA 3A8WA 4WNMA 4IWQA 3FKLA 4KA3A 4AGDA 4TNBA 3SD0A 2XEZA 2WEVA 3PPZA 4DH3A 4ZSJA 2OJ9A 4L01A 4U6RA 3FI2A 3MVMA 3FAAA 3ORNA 4L67A 4EKKA 4IB3A 4X3FC 4O0WA 2C47A 4JL9A 1HCKA 5J7HA 3LPBA 2OIDA 5CWZA 2ZYBA 4I93A 3S3IA 5K0XA 3HLLA 4WD5A 4OT5A 4OT6A 2H96A 3F5PA 4QYHA 4UZHA 2XK7A 3UC3A 4ZTMA 3V8WA 4JX3A 4D9UA 2WQEA 3TUDA 2C3KA 3ODYX 2UZNA 4L3PA 1FVVA 4W4XA 5CF8A 2FGIA 4ANOA 3D94A 4EBWA 2X4ZA 3CTHA 4XG7A 5HI2A 4FYOA 2I0HA 2OFVA 4L8MA 2PWLA 2XYUA 3VRZA 2RIOA 5CVHA 4CKJA 3COIA 3EQCA 1XHAA 4L42A 5TT7A 2ITTA 3WILA 2WMSA 2X9EA 3E7VA 1GZKA 3PG1A 5GZAA 4FF8A 3PSCA 2UW6A 5B0XA 2HYYA 2EB3A 3ERKA 3OTVA 3UOJA 3GB2A 3QQKA 4H3QA 2QO7A 3R8MA 3VUKA 1YXUA 4GG7A 5FBNC 3VAPA 4G34A 3VJOA 3AXWA 3MGYA 3NW5A 3ZFYA 1U46A 2W96B 2C3JA 4XV9A 1GZOA 3FZRA 4I21A 3S4QA 3SKCA 5I9YA 4E6CA 4JIAA 4YNOA 5CEIA 4GIIA 3ZUTA 4GT4A 4RFMA 2PK9A 4DFZE 1JSUA 4A9TA 4QQJA 2G15A 3R7IA 1MRVA 5ANDA 3FJQE 1X8BA 2WQNA 1JKSA 2VTHA 3UVQA 3BHVA 3ZUVA 4GT5A 1CKPA 1OL6A 5JH6A 2ZM4A 5FP6A 4H1MA 3WIKA 4O6LA 1M2RA 3FMLA 4TYGA 3NNWA 4BCOA 3NNUA 4FOBA 2JKQA 4NWMA 3O51A 2VGPA 4D9TA 2XKCA 1J3HA 3DAJA 2VGOA 4LL5A 4O96A 4F7SA 2WMBA 4GG5A 4RG0A 5CS6A 2XYNA 3UBDA 5B2LA 1WVYA 3RAIA 2P33A 5A54A 2YEXA 4IC8A 4ERKA 3SLSA 5ETAA 5CF4A 3OCTA 3F7ZA 5LXMA 3PYYA 2PVLA 3R73A 3G2FA 1E1XA 1S9JA 3FY0A 3GFEA 2IZTA 4AA5A 4ZY6A 2RF9A 5IA1A 4FBXA 1OECA 2DQ7X 4AZEA 5AP3A 4DH1A 1J91A 2UZUE 1PYXA 4AA4A 5DA3A 1BL6A 4FL2A 4N6YA 4ZSGA 1PXKA 2E9OA 3JYAA 5C8MA 4HYIA 3OXTA 3CBLA 3TJCA 2OZAB 5GJFA 5HU3A 3MTLA 3QTWA 3SRVB 3E8CA 1A06A 2W1IA 4OUCA 5HTIA 3JS2A 5C03A 4R3CA 4ZTNA 1J1CA 4JAIA 5AP2A 1PMEA 2I0VA 3LFEA 3QC4A 3QD3A 3R8ZA 2YM3A 4FMQA 3BYMA 5HG5A 3FLNC 4V04A 3UQFA 2Y4IC 2Y6MA 3H0YA 4FKWA 3WZEA 1PXIA 4FA2A 2B55A 2WMTA 2OI4X 3IQ7A 5L8LA 3VUMA 3A8XA 4I92A 4EOIA 1Q3WA 4FTKA 4M7IA 4YBJA 4RC2A 1OKYA 4FT5A 5F95A 5KMJA 1ZYLA 4BDHA 2PTKA 2G1TA 5BVNA 3A7FA 1FVRA 4FKGA 4Z55A 2AYPA 2YM6A 4WG5A 4U0IA 4DEGA 4G3FA 3WOWA 4YTFA 3IOPA 4TT7A 3IKAA 3ZEWA 4EH3A 4QPSA 5A14A 5E8SA 5H8EA 2OH4A 3QX4A 4NEUA 4UEUA 3K5VA 3SW4A 4NKSA 4HVGA 3BEGA 2UZWE 4R5SA 2YAAA 3HMNA 1MQBA 4YTIA 2C0OA 2QHNA 2C6KA 3LQ8A 3MIAA 3NCGA 1TQMA 3QA0A 4FT9A 4ZSLA 5M51A 2XRWA 2C1AA 2GNHA 1Q5KA 4KINA 4LGGA 5I3OA 3UDBA 2PZYA 3FYJX 5AUUA 1OIRA 1CDKA 4QMXA 5J87A 1RJBA 3NS9A 4J52A 4RVLA 3IDBA 1BL7A 2GMXA 2IZRA 3KRLA 3FLZA 3KXNA 2YJSA 5KMKA 2ITYA 5EKOA 3R9NA 2OU7A 3W8LA 3TV6A 4QMPA 4YJOA 2QCSA 2WMXA 4CFUA 4JS8A 2GU8A 4MNFA 4IWPA 2JDVA 5HX6A 4CKRA 2EXEA 3RGFA 4XH6A 5LMBA 1YQJA 1Q4LA 2XK8A 4FTMA 4N6ZA 2H34A 4D4SA 3DQWA 1BYGA 3D2IA 2W05A 5LCJA 2IWIA 2Q0NA 4OTRA 5D10A 1OKZA 1DM2A 4JOAA 2X1NA 5BMMA 3GCVA 4RQVA 4X2KA 5I3RA 3EQHA 4Z3VA 5J95A 3FZTA 1B39A 2HK5A 5AM7A 3LXLA 4HYHA 2R0IA 5ACBC 3AC4A 5CY3A 5GZ8A 4ZOGA 4FODA 5JGBA 1OITA 3FLYA 4IC7A 4G9RA 3LJ1A 4IX4A 4LG4A 3D7TB 3QTXA 5CNNA 3AT2A 2EVAA 4I0TA 4JX7A 4MF0A 4MQ1A 4YBKA 3SXRA 3FC1X 3OHTA 4C7TA 4UMRA 4WT6A 3VS7A 4QQTA 5EDRA 2ETKA 4EZ3A 5IH4A 5H9BA 4PP7A 4FV6A 5CX9A 2OJFE 4MBIA 3MS9A 1I44A 4UMUA 3UQGA 4ITHA 3MW1A 2BUJA 5CTPA 5HEZA 2JDRA 2OIQA 4QNAA 3R02A 5AX9A 4XOZA 5ANKA 4FR4A 1W84A 2C6MA 2VWZA 4Y8DA 3V5LA 3KXMA 4O0TA 4U5JA 5C8KA 3QX2A 3MB6A 4RPVA 3U9NA 3REPA 4E5BA 1I09A 5HD4A 3QRIA 4EK8A 5DLSA 5AAEA 2FH9A 4U8ZA 4JG8A 5AV4A 3HGKA 2H6DA 3MH3A 4GV1A 4NTSA 4QP4A 4AT3A 4F1TA 4E6DA 4TRLA 3EL8A 3BGQA 3GI3A 2YM8A 3L1SA 3H9OA 4MXCA 1RE8A 2KTYA 3RHKA 2GQGA 4RIYB 2UVXA 5EOBA 2XK6A 3IW6A 5J8IA 3OEZA 4FEQA 2V0DA 4DGOA 1JVPP 4J96A 1H27A 2H8HA 2R3GA 4CRSA 2XH5A 3UNZA 3K5UA 4RWKA 1F3MC 3MA6A 2X6EA 2O5KA 3V5PA 3Q6WA 4DAWA 3UIXA 3TL8A 3NEWA 5CZIA 5EM5A 4AZSA 2HW7A 5CT0A 2BMCA 1KWPA 4H39A 4CV9A 2ZJWA 4X6QC 2GFSA 3KXHA 4OLIA 5JMSA 2QOQA 4JBQA 3PRIA 5CYIA 4FIFA 2V22A 4XX9A 2PVYA 3R00A 3HP2A 5DRBA 3U87A 3NSZA 4BCJA 2VTTA 3NNXA 4USEA 4W4WA 3R7UA 5AA9A 4R7HA 5JEBA 2WMWA 4DLIA 4QYYA 4XBRA 3NAXA 2IW8A 3BKBA 3DK6A 4L43A 4RJ3A 1FPUA 3CGOA 3MH2A 3E92A 4QTCA 5JN2A 2NRUA 3HKOA 4BCMA 4BZDA 4UWBA 4MYGA 4PL5A 3QKKA 5JSMA 2YITA 2QLUA 4OBOA 4EOQA 5HLPA 3OWLA 2IVUA 4D0XA 5JFXA 3HYHA 3MPTA 2EXMA 4E73A 3R8PA 1XH7A 4RZVA 5GZ9A 1ZRZA 3BGZA 3K3JA 4ENXA 2PE2A 2X9FA 2BIKB 4ITJA 4I24A 3PY1A 3RPVA 3T3VA 4ARKA 2QKWB 4YZCA 2LGCA 2FYSA 1DAWA 3MFTA 4EOSA 4O1PA 4PMPA 2JDSA 4IJPA 4GYIA 4XUFA 3R8UA 4ZZMA 3QC9A 3IONA 1E9HA 3P4KA 4K2RA 2I0YA 5AV0A 3C9WA 2YERA 4PMMA 3QRUA 4FC0A 4LGDA 4BDGA 2PMNX 4S33A 4KBAA 3FMDA 4NM5A 4KKEA 3A60A 3E5AA 1WZYA 2YHVA 3LM0A 2QLQA 2BCJA 3CC6A 4IB1A 3DDPA 4YMJA 3QCSA 4YJTA 4FKPA 2R3MA 3TNWA 2GNLA 3OWPA 3U4UA 2XCKA 4RSSA 5AUVA 2B1PA 3Q9WA 4RWLA 5FXSA 4DHFA 5ETCA 3F61A 2VX0A 3LW0A 4EK5A 3OY1A 2VN9A 3RPSA 2VWBA 5FEQA 5LARA 3UP2A 3ZC6A 5EOLA 1PHKA 3P9JA 5HICA 4ALWA 4AW2A 4RLKA 5LMKC 3HMMA 3MVJA 2YM4A 2W4JA 5M55A 3ZC5A 3IOKA 5JZJA 4Q5EA 3SDJA 2FSMX 5HQ0A 3AD5A 4F6SA 1QPCA 4TNDA 1TVOA 3EN6A 5D11A 3FSFA 5CU4A 1R3CA 4G2FA 3PP0A 3NUYA 4C4JA 5JFSA 1U5QA 4QMZA 4RLLA 3GCPA 3UPXA 2IW6A 4AP7A 3Q53A 4L00A 5GNKA 3A4PA 2W4OA 2C5OA 1S9IA 2E9UA 5ETFA 3R9DA 4EONA 2W4KA 4F0GA 2YCRA 4FKOA 2H9VA 3ZRKA 4BIBA 1PKDA 3II5A 2HZ4A 1NY3A 4FTAA 5HG9A 5KKRC 5LVMA 4YO4A 5F4NA 4QP6A 3QD2B 4JQ8A 4Z16A 2VV9A 3CQWA 1ZXEA 4GL9A 2ITPA 4BF2A 3WYXA 4EWQA 4MBLA 2OJIA 4KB8A 3LFFA 3V3VA 1T45A 3OW4A 4RWIA 2Z2WA 3CKXA 4ASDA 4EL9A 3UO5A 1VR2A 2HXQA 4DFYA 3Q52A 1YKRA 4F9YA 5FP5A 1GJOA 3OCBA 1R78A 5DT0A 4QMQA 4RIWA 3UNKA 3K54A 4E4MA 4XLVA 2PE1A 4XP0A 1Q8WA 2XIXA 3AMBA 4RJ5A 5AA8A 1BX6A 3SOAA 1W83A 2X7GA 3A61A 4NJ3A 3GC0A 2IO6A 5HVJA 4YZBA 3QGYA 2AUHA 5FD2A 1U54B 4K77A 2CHLA 3UPZA 4MD8E 2UZBA 1ZMWA 1M2QA 3MIYA 3M1SA 4FTJA 2Y7JA 3FBVA 1YVJA 1ZYDA 5DR2A 4I1ZA 5DEWA 1Y91A 3DNDA 2X39A 3QTQA 5E8WA 3VS6A 3PWDA 2PMOX 4I5MA 4M13A 2BRNA 2OZAA 3TUCA 4DGMA 4FVQA 3BGPA 2J0IA 3SRVA 4BC6A 3PP1A 4I94A 2X8IA 1H01A 4L52A 5AP4A 5G6VA 2BRBA 5H8BA 2JKKA 4DEIA 4FKUA 3PXFA 2PZIA 4PTEA 4QTAA 5DG5A 4BDKA 4MAOA 4D5HA 2W7XA 4MKCA 2Z7RA 2RFSA 3QHWA 4FTNA 4OTWA 2R64A 3E8EA 4K18A 4O22A 3EB0A 3ULIA 3NIEA 3VUGA 4BGGA 1PXOA 3RK7A 3KQ7A 1ZYSA 3KU2A 5HVYA 3AT4A 3PRFA 4L3JA 3MI9A 3BYVA 2QD9A 1VEBA 4YJPA 3OMVA 4AN3A 2IVTA 4RJ8A 5FLFA 2C4GA 2J90A 3C4EA 5B2MA 3TNHA 4TPTA 1YOLA 4JXFA 5DMZA 3COMA 3R9OA 4GVJA 3P78A 2WPAA 3ROCA 3CY3A 5HE1A 4C0TA 3UODA 2C6OA 3LJ2A 3NUPA 1OGUA 3LFSA 4WKQA 4AZVA 4O1OA 2IZSA 1H1SA 4QD6A 5CAOA 5AX3A 2G2FA 4MBJA 1H0VA 1YDRE 1VYWA 5BYZA 4E4LA 5DT4A 3HA6A 3QUDA 4P5QA 4WSQA 4IM3A 4D2WA 5CAVA 4C37A 2I6LA 3C7QA 4FK6A 4EH8A 3C0IA 3ODZX 2X0GA 3NIZA 3GNIB 1ZAOA 2BRHA 2YIQA 4Y83A 1OI9A 1XH6A 3Q5ZA 4IVBA 3BIZA 3KCFA 5FM2A 3DJ6A 4HPTE 2OFUA 2RG5A 2GS6A 4X0MA 3IECA 5BUJA 4I4EA 4I3ZA 4RA4A 5AM6A 3BHYA 4FUXA 2ZB0A 4N0SA 5LVOA 2HIWA 2XM8A 3UMXA 3GU5A 4U9AA 4KIKB 5BVFA 3K2LA 3FDNA 4Q2AA 1SM2A 4OTHA 5KUPA 5LJJA 3DB6A 4G3DA 4NIFB 4CT2A 3UZTA 2ERKA 1NXKA 3KMMA 3V04A 3F9NA 3KEXA 3VC4A 4Q9ZA 2JDTA 3RINA 3G6GA 4JG6A 4ASEA 2OGVA 3NCZA 1IASA 3A7JA 4XV1A 3PY0A 5KO1A 2F2UA 4YC3A 4G1WA 2QURA 2YCSA 4LOQA 4K0YA 3B2WA 5T3QA 5IDPA 2IVVA 3ENMA 4I41A 1MQ4A 4JR3A 5E7RA 1LR4A 5J5SA 4EHZA 1V0OA 2GS7A 3P86A 3ORZA 3LCSA 2VO0A 5AUTA 2HXLA 3OY3A 4KKHA 5F1ZA 5IMXA 2WMVA 2DYLA 3D5WA 2NPQA 2W0JA 5A4EA 3NZ0A 5M4FA 4AA0A 3M2WA 3SQQA 2QI8A 4GEOA 4B4LA 3I4BA 3RP9A 3VJNA 3FSKA 3KRJA 5CF5A 4BCNA 2BRGA 2RGPA 4NU1A 2VRXA 2BDWA 5AP6A 3BLQA 3PVUA 4F9BA 4YUQA 3DKGA 3D7TA 4ITIA 3U9CA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4D2VA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations