4LGDA

Structural basis for autoactivation of human mst2 kinase and its regulation by rassf5
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
359
structure length
350
Chain Sequence
EDSLTKQPEEVFDVLEKLGEGSYGSVFKAIHKESGQVVAIKQVPVESDLQEIIKEISIMQQCDSPYVVKYYGSYFKNTDLWIVMEYCGAGSVSDIIRLRNKTLIEDEIATILKSTLKGLEYLHFMRKIHRNIKAGNILLNTEGHAKLADFGVAGQLTDTMAKRNTVIGTPFWMAPEVIQEIGYNCVADIWSLGITSIEMAEGKPPYADIHPMRAIFMIPTNPPPTFRKPELWSDDFTDFVKKCLVKNPEQRATATQLLQHPFIKNAKPVSILRDLITEAMEIKAKRHEEQQRELEEEEFDFLKNLSLEELQMRLKALDPMMEREIEELRQRYTAKRQPILDAMDAKKRRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Basis for Autoactivation of Human Mst2 Kinase and Its Regulation by RASSF5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 3
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 350
sequence length 359
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF11629 Mst1_SARAH C terminal SARAH domain of Mst1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4lgdA01
5AIKA 3MDYA 5EI6A 4YPDA 2ACXA 4D58A 2XKCA 4CD0A 2OJJA 4G16A 5BVOA 5J1WA 3SXSA 4C7TA 1KV2A 2B9FA 4JIAA 4A4XA 5KMMA 3DPKA 4R1YA 3KB7A 1YQJA 5E8XA 2NO3A 3V8WA 3H0ZA 4WT6A 5CAQA 1U54A 4FK3A 2A0CX 4RC4A 4APPA 5CEQA 1YI6A 5HE1A 4J53A 4NIFB 4YTCA 4FTUA 1PYEA 4FZ6A 4FKOA 2QHNA 4TWOA 5DMZA 4UMQA 4G1WA 3TV6A 3OHTA 4MHAA 4UX9A 3NUPA 2BIKB 2QOOA 4I21A 5CU6A 4HGSA 3DK6A 5EI2A 4IB0A 2W05A 1KV1A 3FMHA 1H1WA 3DK3A 5KZIA 4LMUA 2UZLA 2WU6A 3I1AA 4FODA 2QCSA 3LXKA 4RC2A 4RX7A 5AP0A 3BI6A 5C27A 3HV3A 5C8KA 5A6OA 4FZ7A 1KOBA 2JKOA 3CP9A 1U59A 5CQWA 4YJPA 3LM0A 5FDPA 3HL7A 4EQUA 3LFNA 4FVQA 2YM7A 4FL2A 2QO2A 4DITA 4ZTRA 4I4EA 2ZV2A 4E6QA 2J0MB 2I6LA 1PJKA 4MQ2A 4MXZA 5H8GA 4FYNA 1CDKA 3P4KA 3KK9A 3UO5A 3O7LB 2FSLX 2B55A 4PPAA 5BUJA 3ZMMA 1GZNA 3MJ2A 3EN6A 3SOCA 3DU8A 4RX5A 4IAYA 2V7OA 5AM6A 1A06A 3POZA 4TYJA 4BCFA 4WNPA 4DFXE 3VUKA 2HZIA 2NPQA 4GU6A 4PDOA 4GVJA 4QTAA 2QI8A 3VS5A 4DH3A 3EQFA 1P2AA 4FV1A 4DGMA 2OU7A 1J3HA 5FD2A 1Q24A 1OZ1A 3ITZA 4FSUA 3DT1A 2QR7A 5FXSA 4WO5A 4MYGA 4X3JA 5CSWA 3WZUA 3PUPA 5J1VA 3RTPA 2VNWA 3PA3A 5KCVA 3F9NA 3I81A 2O5KA 4IM0A 4ZZOA 5A4LA 1QMZA 2JBPA 1BMKA 4FTNA 3ZYAA 3SVVA 2R3NA 2QURA 2BDFA 4GYIA 1JKKA 3GT8A 4PUZA 5AV4A 2RL5A 3H9FA 4D1ZA 5A14A 5I9YA 4YZCA 3F3ZA 2C5YA 3UVPA 4QPAA 2XNMA 1WBVA 1Y6AA 3AC4A 4OBQA 3H10A 3SXRA 3QQGA 5K4IA 5EKNA 3EQHA 3SW7A 3GENA 3T9IA 2W1IA 4C4HA 2UW5A 2WO6A 4EH8A 5GJGA 2BAJA 4OTIA 3DQWA 2XK3A 4FKVA 3NSZA 4WKQA 3QUPA 3VRZA 3UIUA 4KINA 1ZYJA 3D5VA 3CCNA 4Y8DA 4AZVA 4V0GB 3NYNA 3GFEA 4XG6A 2YCFA 2CGWA 3FPQA 3HDNA 3R0TA 3ZHPC 1JAMA 2PMOX 2OWBA 3QRTA 3UP7A 5C8NA 1RE8A 1ZZLA 5E1EA 3R7EA 5JZJA 3KULA 4P2KA 3QF9A 4ZTHA 2VWUA 4ALWA 3O2MA 3UDBA 2WMTA 4AW0A 1UKHA 3NW5A 2GTMA 5M44A 3C4EA 4I5HA 3ZFXA 3PSBA 4C4GA 3W2QA 2QC6A 4BZDA 1IA8A 4X0MA 1UU3A 2QKWB 3LCOA 3BGZA 4PF4A 2ERKA 3NZ0A 1I09A 4QD6A 4I20A 2PTKA 3TN8A 3Q9YA 4C4EA 1AGWA 2Q0BA 4QMWA 3ZUUA 1OPJA 5L2WA 4X21A 4G6LA 2PMLX 3O8PA 3EFLA 3L9LA 3TI1A 5B0XA 3T9TA 3ZZEA 4IANA 3S3IA 3OUKA 3OUNB 4BN1A 3GU8A 5K0XA 2YM5A 3V3VA 3WF8A 4BB4A 4AA5A 2PVKA 4DYMA 3PXKA 3QZFA 2YZAA 3Q4ZA 3MB6A 2X4ZA 3DFAA 4MNEB 4MXAA 4FG8A 1BLXA 5LVMA 1YDTE 4FTCA 2XIZA 1J1BA 2C5NA 5TE0A 5CF5A 3UIXA 1GNGA 3NLBA 3Q4UA 2ZV8A 4M84A 3UOKA 4A7CA 4APCA 3IW8A 3NYVA 4ZLOA 5HBHA 2C3JA 3EQRA 1JWHA 4XH6A 4AZTA 5DVRA 4FT9A 2ITOA 4JJRA 3FBVA 2C6MA 3ORLA 4ALVA 1UU9A 5M4FA 1Q61A 4W4VA 4C38A 4B7TA 2ITQA 4FOCA 4M13A 4XV3A 1CKIA 2YM4A 1WFCA 2C69A 2PZ5A 2V22A 3KGAA 4NT4A 5JGAA 2ZYBA 4WNOA 2KULA 4ASZA 4UY9A 3BLQA 5H3QA 3HKOA 4LV5A 3EL8A 3EQIA 3JXWA 3O51A 3ZUVA 3OEZA 4FVPA 2X8DA 2YJRA 4FKRA 5AUXA 2XIKA 4CYJA 4GUEA 1PXOA 2QR8A 4HCUA 3O23A 4JX7A 4ZK5A 3ORNA 5AV2A 3ULZA 4YLJA 5D41A 2H8HA 2Q0NA 4L7SA 3FLYA 4D2VA 5E8UA 2ZB0A 3KCFA 1XQZA 3M2WA 3ERKA 5CT0A 5BVKA 2BDJA 2VTIA 4Y95A 4NFNA 5EDRA 5HESA 4TRLA 5B2MA 3Q6WA 4I0TA 5GZ9A 2FGIA 4RZWA 3OBJA 4IM2A 2OFVA 2R3RA 3O50A 3DZQA 3R9DA 3M1SA 1YHVA 3JYAA 2R9SA 2FH9A 1YXUA 5FEEA 2W5AA 5DEWA 5DRDA 3PLSA 4BIBA 2JDRA 5HG7A 1XR1A 3OXZA 1QPJA 2XZSA 5HO6A 3VIDA 5IMEA 3P7AA 5EYDA 3NNUA 3ZZWA 3GCPA 1DAYA 3FSKA 3FV8A 4O0RA 2R0UA 3OROA 2XNGA 5KMKA 4A4LA 3DB6A 3ZLWA 4AUAA 2QG5A 3HRCA 3NGAA 4L68A 5FM3A 5CALA 5IEYA 5IMXA 1R78A 3EJ1A 4L43A 4GMYA 3ZFMA 2XNOA 2C68A 4BRXA 2BFYA 2OK1A 1KE9A 4BCIA 2IVSA 5L2TA 1H26A 4KAOA 1WZYA 2QHMA 4GS6A 3PXQA 4NJ3A 4PTEA 4QYEA 3TG1A 2Y7JA 3DFCB 2ETKA 2IVTA 1PMEA 2PSQA 3VVHA 4KS7A 3E8NA 1OGUA 4AOJA 4D2SA 4EH2A 1ZARA 3DZOA 3PY1A 3E3PA 3VS3A 1OL6A 1OM1A 2WOTA 2X8IA 3O8TA 1PXLA 3QQJA 2JFMA 3E7VA 4QMXA 4RA4A 5I3OA 3HNGA 1STCE 4XJ0A 1W82A 3V5QA 2CMWA 5AP5A 4XLVA 5L2SA 4QYHA 4ZSLA 4F6SA 4LGGA 2ZAZA 4E1ZA 2C6OA 3W1FA 5DEYA 1PY5A 2ITPA 1S9IA 4UMRA 3MA6A 5EW9A 5DOSA 3BEAA 5HU9A 4YSMA 4Z55A 1F0QA 1BL6A 2BALA 3MIYA 4C2VA 3OEFX 4XP0A 5LJJA 1JVPP 1U5QA 3MSSA 2QOQA 4KKEA 3Q6UA 4U7ZA 4I92A 1ZOEA 1UV5A 4HYSA 4I6HA 3KF7A 1ZZ2A 4DEEA 5DH3A 2XF0A 4KABA 5HBJA 3K3IA 1PHKA 2GNLA 3HUBA 3WBLA 3DBFA 4ZY5A 3W10A 2UZWE 5AAGA 3PA5A 2J2IB 2ERZE 3FMJA 3QAME 3LMGA 1H28A 1Q5KA 2EB3A 2IZTA 4HGLA 4MXCA 3TNQB 4F7LA 3E7OA 2RF9A 3W16A 4L8MA 2G01A 3MH0A 2Z60A 2OG8A 4DH5A 2W96B 2HIWA 2HK5A 2YEXA 3IONA 3HECA 5I9ZA 4RIYA 4U8ZA 1UWJA 3CBLA 4FUYA 4X3FC 3JS2A 5CX9A 4PNKA 2OZOA 5DR2A 3KRXA 3EFJA 3ZSHA 2YM3A 3M11A 3V6RA 3FLQA 1WCCA 3LOKA 3QHRA 4DFZE 3CTJA 3MVLA 3P7BA 4C4IA 2WD1A 4ONAA 3FLNC 1M52A 3MFTA 3U4UA 3VUIA 2QO7A 5JMSA 2BCJA 3B2WA 5CVGA 3WILA 3UJGA 4BCJA 1UNHA 3CC6A 5CLPA 4I3ZA 1JNKA 2W1HA 3I79A 1DI8A 4RWLA 4WOVA 3UODA 4TYHB 3FLZA 4U97A 4H3PA 3EL7A 3ORKA 1OL2A 3MFSA 3G0EA 4ZJIA 3R8LA 3TNHA 4EHVA 1ZOGA 5E8TA 1ZXEA 4M14A 3R9HA 3QTQA 2WMVA 3OS3A 4W4WA 2WELA 1B39A 3FKLA 3ORIA 2ZMDA 5IA1A 3FPMA 4HYIA 2HAKA 4RQVA 5B7VA 4QO9A 5DFPA 4HCTA 4IFCA 4MBIA 2XJ1A 3UNJA 1QPEA 1FOTA 2F7ZE 2BAQA 2P3GX 4BHNA 4GFOA 2WQOA 3S4QA 4HVDA 1REKA 1ZMUA 4IWQA 3D2KA 2C6KA 3U87A 2BHEA 4AA4A 2F7XE 5I5ZA 2GNJA 2HYYA 2R2PA 4MXXA 3ZONA 2XK7A 2ZV7A 5DR6A 4BCOA 2C3KA 5K9IA 4C3PA 2Z7QA 4GUBA 3NUUA 4R7HA 3KVWA 4RRVA 3VBTA 3OXTA 4A9TA 4CKIA 2G9XA 4FIHA 4IE9A 3UNZA 4D4SA 4LOPA 3OD6X 4XS2A 1SMHA 3R1NA 1U46A 2WTJA 1JQHA 2WQEA 3OWPA 5LMAA 4ANMA 4XG7A 3D9VA 3GNIB 3MH1A 3GI3A 4AGUA 4FTAA 4DTKA 3PJCA 4KBAA 4W4XA 5J9YA 5LMKA 4CLIA 3OT3A 3SW4A 4CZTA 4XP3A 4HW7A 3DKCA 3EOCA 3EZRA 3W2CA 3HDMA 3NX8A 4PPBA 1MQBA 5LMKC 1XH4A 4MWIA 4DH8A 4YC3A 4ZOGA 2C4GA 4CSVA 3TIYA 1KE7A 4KIKA 1Q4LA 2W5HA 3FMMA 2WMAA 5IA3A 5ACBC 2B7AA 3ZU7A 1F3MC 4NM0A 3U51A 5KMIA 4JIKA 4ZTNA 4EHGA 4EH6A 1XWSA 4J98A 4CFMA 2E9UA 5F4NA 5E8SA 2J0JA 5I4NA 1EH4A 5ETIA 3FHRA 3DCVA 2XNPA 2W99B 4ANLA 4AW2A 3QTSA 2IWIA 5E8VA 3D7TA 4GRBA 3R28A 4ZAUA 3UVQA 2WTWA 3ZDIA 4L3JA 4BIEA 1GZ8A 2W0JA 1H01A 5JFWA 4D2RA 4EH4A 5K3YA 4O0VA 4FG9A 2HWOA 3PWYA 4MVFA 4Q5EA 4D5KA 2WTDA 4DINA 4CQGA 2BZIB 3R6XA 2JBOA 4TWCA 3DTCA 2WXVA 3MPTA 1ZMVA 3PIYA 2EU9A 3BWJA 4WG4A 3GC7A 3C9WA 3QBNA 4UZHA 5AX9A 3TNIA 3FZPA 2QLQA 4IJPA 1YOJA 3COKA 1Q41A 4GV1A 3L9PA 2BKZA 3IS5A 4EORA 2ZM4A 4UALA 2X6EA 4C0TA 5CI6A 4EUTA 2R3IA 5HE0A 2BRMA 2X2LA 3CD8A 2X8EA 3EN5A 2ITNA 3FZOA 5J9LA 4X2FA 3IDCA 4EOIA 4YHFA 3FKNA 5FWKK 3ULIA 4EL9A 4UBAA 4EUUA 2QOFA 2A27A 1BI8A 1WBPA 3F7WA 3IDPA 3VHEA 2GTNA 4X3FB 2XYUA 1VJYA 3MI9A 3RMFA 5A4TA 5DHJA 4J8MA 3Q60A 4X2JA 4ZLZA 5C03A 2H6DA 3MJ1A 4UXQA 3MVMA 4BKZA 4RIOA 4PDSA 4QMNA 1JKLA 1K2PA 1PMUA 2VWBA 3CPCA 3MIAA 4GT4A 4GT3A 5FQDC 3WF6A 4JRVA 3SX9A 3VNTA 2RSVA 2C30A 3A8WA 4MD8E 3T3UA 4YTIA 3DS6A 3UVRA 4DC2A 5DT4A 4OAUC 1O6KA 1PW2A 2BIYA 4I24A 4DEDA 4RJ5A 3HV5A 3ZH8A 4FV4A 4QT1A 5GZAA 3ODYX 2IW8A 3PXRA 4NIFA 2EXMA 3EH9A 4YUQA 2YAKA 3F5GA 4AG8A 4ASDA 4RX8A 2P55A 5AEPA 3NR9A 4CMOA 2PZIA 1LEZA 4EKLA 3U6IA 3OWKA 4CT2A 2H34A 4N0SA 5HI2A 3Q5ZA 4Y83A 3A61A 5EH0A 3V5LA 4G5JA 2FSMX 2WMSA 3EQBA 2YWPA 2X0GA 2XBAA 4OT6A 3HMPA 3WF9A 5HIEA 4D2PA 2OIQA 4LL0A 5IUIA 2YCQA 3UG2A 4O21A 3R63A 3WE4A 4IEBA 2VV9A 3ZLXA 3BHHA 1YW2A 5BNJA 1H1RA 4AS0A 4QMVA 4DG3E 1OI9A 4OTGA 2EB2A 2VRXA 3PE1A 4ERKA 4YTFA 1M2QA 4TN6A 3ZCLA 3UNKA 3E3BX 3P78A 4XMOA 5IUGA 5A46A 3KU2A 3TWJA 4WG5A 4EQMA 3IW5A 5BX0A 2WAJA 4RJ8A 3VAPA 4AFEA 4BTKA 4C4FA 4XCUA 5CY3A 4EK5A 3COMA 4YBKA 3PIXA 1L3RE 4FIIA 1RW8A 4M0YA 5I3RA 2CGUA 4FV6A 3W2OA 5M4CA 4UZDA 1XH6A 4FBXA 5AUZA 5BUEA 1ZYSA 4R5YA 5CWZA 3K3JA 3F3VA 1FMOE 3OW3A 2XMYA 2Y6MA 2REIA 3H30A 4JXFA 2JIUA 4QYYA 4YJVA 3QTIA 4HPUE 4WG3A 2XYNA 4YZNA 5K5NA 4R7IA 4XX9A 2QO9A 3I0QA 3MBLA 3PPKA 2R3FA 2EWAA 3II5A 3PPJA 5B2LA 3QCSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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