4LGDA

Structural basis for autoactivation of human mst2 kinase and its regulation by rassf5
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
359
structure length
350
Chain Sequence
EDSLTKQPEEVFDVLEKLGEGSYGSVFKAIHKESGQVVAIKQVPVESDLQEIIKEISIMQQCDSPYVVKYYGSYFKNTDLWIVMEYCGAGSVSDIIRLRNKTLIEDEIATILKSTLKGLEYLHFMRKIHRNIKAGNILLNTEGHAKLADFGVAGQLTDTMAKRNTVIGTPFWMAPEVIQEIGYNCVADIWSLGITSIEMAEGKPPYADIHPMRAIFMIPTNPPPTFRKPELWSDDFTDFVKKCLVKNPEQRATATQLLQHPFIKNAKPVSILRDLITEAMEIKAKRHEEQQRELEEEEFDFLKNLSLEELQMRLKALDPMMEREIEELRQRYTAKRQPILDAMDAKKRRQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Basis for Autoactivation of Human Mst2 Kinase and Its Regulation by RASSF5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 3
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 350
sequence length 359
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF11629 Mst1_SARAH C terminal SARAH domain of Mst1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4lgdA01
2PY3A 3TKIA 3F66A 3NNWA 5CAVA 3DLZA 1FINA 2NP8A 4WG3A 1CM8A 4YMJA 3QCQA 2W7XA 4JIKA 4YUQA 5HG9A 3FKOA 3P7AA 3Q96A 4HZRA 5LMKA 3WZEA 4KRDA 2G01A 3QQJA 5DLSA 2BZIB 4Z16A 5M4UA 1W0XC 4BFMA 3ZO4A 3EHAA 2R3LA 4GMYA 5HIDA 3WZUA 5F94A 4DN5A 4O0RA 4RVMA 3E8CA 2UZUE 2UW6A 5JGBA 3POZA 3KF4A 1IEPA 5IA2A 1YXXA 2W9ZB 4M68A 4GK4A 4G3FA 3P79A 3PJCA 4F9WA 5A46A 2J0MB 5AA8A 3JVRA 3ORLA 4GSBA 4C3RA 4HVHA 3D9VA 3GQIA 3SLSA 3VS6A 4HVDA 4AW0A 5E1SA 1A06A 4TPTA 1Q24A 5BUEA 3O8PA 4ZP5A 1OL2A 2YIQA 2EB2A 3Q32A 2AUHA 2C5NA 1OKVA 1WAKA 4OTPA 1XKKA 4RA4A 3R7OA 1M2QA 1IASA 3FSFA 4J53A 4YHTA 1M7QA 4RX5A 4E1ZA 3NR9A 4OW8A 5IG1A 5I3RA 4QQ5A 5C03A 4BDBA 2P55A 4YTFA 4A9TA 1TVOA 3IG7A 1JSTA 3D5XA 4OR5A 1IR3A 4YZNA 4RVLA 3A61A 3KXXA 2C6IA 3OWPA 3R30A 2PMOX 3RPRA 4ZTLA 5ITAA 3U6IA 1CDKA 5KMNA 4M7IA 2X8DA 3H0YA 3EZVA 2C30A 2F49A 2AYPA 2C5VA 4W8EA 3EOCA 4BBEA 3TI1A 5ANOA 2GQGA 5C9CA 3GOKA 5HBEA 3EFWA 1AD5A 3CE3A 3VS3A 2VX0A 4DFXE 3HECA 4KBKA 4EEVA 4M67A 5KZ0A 2YN8A 5F4NA 3PWDA 3LCDA 3MV5A 4EBVA 4F6SA 3O71A 3RK5A 3UC4A 5J1VA 5L6WL 3FE3A 3VUHA 2OXYA 3ZLYA 4JQEA 5I9UA 3VRYA 5AAEA 1U5QA 1BMKA 1OITA 3GOPA 3DQWA 4AAAA 3LXLA 1JLUE 1LEWA 1URWA 5CEQA 4PV0A 3W33A 3PFQA 3DXNA 4QTCA 3S2PA 2BIYA 4CSVA 5B2MA 4IDVA 4WA9A 1HCLA 3QTSA 4KKEA 3UNJA 5L6PA 2UZOA 3PY3A 5CASA 3FMJA 4YJPA 3BHTA 3DKGA 5C01A 2XB7A 4N4SA 2OFVA 3L9LA 3R2YA 4OUCA 4YTHA 4QYYA 2JDOA 5ANDA 3MW1A 5GJDA 3WF7A 4HVIA 4XEYA 2O8YA 3GU8A 3HV5A 4F0IA 1XHAA 1ZYSA 4V05A 3R7IA 1H08A 3E8DA 4NU1A 3U9CA 2R3GA 2VGPA 4QPSA 2BTSA 5CEMA 5L6OA 3NYXA 3F5XA 3LFSA 4LM5A 4C02A 4EUTA 4L67A 5HG8A 1Y57A 5IA0A 5FEDA 3H4JA 5IKWA 3MB7A 1Q3WA 2RKUA 4IMYA 3LQ5A 4TWOA 1ZZLA 2VX3A 5AV1A 1GY3A 2R5TA 5D1JA 4BCJA 4E93A 2RFNA 1OECA 3DZQA 4K0YA 3D15A 4OTHA 4WNOA 2A27A 4GK3A 4MBLA 1CKPA 4F7NA 4FV8A 4F7JA 2IVVA 2J0IA 5BVFA 3LPBA 4ITHA 3R9OA 3MFUA 2VX1A 3HA6A 4NCTA 5IUIA 3IOPA 2PVMA 4AS0A 4TL0A 3PVBA 2J51A 2YM3A 2V55A 5CZHA 5CQWA 5EH0A 3HRBA 4AUAA 3TUDA 4O0WA 3CLYA 4Q9ZA 3QTZA 3R7EA 3COHA 4O0TA 5HCXA 2UVXA 3QLFA 2WTWA 3OXIA 3WZJA 5JFVA 3EQCA 5GJFA 1ZOHA 4BDIA 5E8SA 1LP4A 1IA8A 4PDSA 1G3NA 5LQFA 3RP9A 5LARA 2C6KA 1ERKA 4I5CA 4QP7A 1NVSA 2QU5A 3DTWA 3KN5A 5D9HA 4FTTA 4HVGA 2C0OA 2WEIA 4C4GA 5CEPA 3BGPA 4D4SA 3F6XA 2G1TA 4FC0A 4A07A 1CSNA 2WQMA 2YFXA 4AA0A 3AGLA 1K9AA 2J2IB 4DHFA 2BKZA 3DKOA 3NCGA 3BV3A 2B9FA 4XV3A 3W18A 2VTIA 1JQHA 2X0GA 2OIDA 3FC1X 3MVLA 5G1XA 4AN9A 4EH7A 3QWJA 5BPYA 4O6LA 1NY3A 5HE3A 4FA2A 1R3CA 2PL0A 3M11A 2ZJWA 2W5HA 3R28A 4FSRA 4RLLA 4I6HA 3D0EA 3OXZA 4S2ZA 5BUJA 3DT1A 4ENYA 4D2TA 4GVJA 1YXSA 4W4YA 3PXYA 3LHJA 2XF0A 3OCBA 5J95A 2X2KA 1U4DA 1REJA 3QTXA 2NPQA 4KKGA 3MTFA 2YWPA 2WB8A 4HCTA 3MY5A 5AADA 3AG9A 3FLNC 5EKNA 1WCCA 2C68A 3MDYA 4K11A 5DT0A 4FTIA 4RVKA 3FI2A 2KTYA 2WTIA 4M3QA 4BTMA 4M0YA 1WBOA 2YDIA 4RBLA 1UNLA 4YSMA 4XBUA 2HCKA 4LMUA 3E8NA 3UVPA 3AGMA 3LFAA 3GQLA 3S3IA 2ITYA 3FXZA 1CTPE 4L44A 1P4FA 3QGWA 3JY9A 4I5PA 4X2JA 4EH8A 2JC6A 2YCRA 3ZC5A 1QPEA 4LGGA 4WD5A 5A9UA 4I94A 4LOPA 4EOJA 2ERKA 4ARKA 4JBQA 4HW7A 4KWPA 3QD3A 3QD0A 4IWPA 4O22A 4R7IA 4XG9A 3ZO1A 4FIFA 4IZ7A 4KIQA 3C0GA 3UYSA 5L2TA 2W1FA 4IB3A 3VWAA 3VS5A 3EN6A 4YR8A 3V8SA 1GIIA 1W7HA 2C3LA 2O64A 3NEWA 4RPVA 2F4JA 4XYFA 3ZLXA 4ANNA 4CLJA 5HLNA 2FSTX 3CQWA 3F5PA 3PJ2A 3QXOA 1S9JA 3R8LA 4BWXA 5CSPA 3MIYA 3KVWA 5TKDA 3HKOA 2PVHA 3TNWA 1YI6A 3LJ1A 5AEPA 3UP2A 5A6OA 1H25A 4UWYA 4H3QA 4JXFA 3FV8A 1UWHA 4FKGA 2OKRA 2ZVAA 2C6TA 3LFNA 1F3MC 3EWHA 4D2SA 4UBAA 3EQGA 1BUHA 2UZTA 3TZ9A 1DAYA 2HOGA 1XR1A 1FPUA 3FLZA 5DRDA 3TL8A 4EZ7A 2ESMA 3VW8A 4BCNA 3PXQA 1OL7A 3AD5A 2X4FA 2HY81 3GGFA 3O51A 2LAVA 2HWOA 3WOWA 2PMNX 4D0WA 5GZAA 5DVRA 1U54B 2E9VA 4MNEB 4F0FA 4QMNA 2OWBA 3MI9A 1Q8ZA 2QO2A 1PMEA 4YLKA 5IA5A 4R7HA 5EHOA 4FG9A 1AQ1A 4GYGA 3IGOA 4MEDA 4JBOA 4YPDA 4DG0E 5JKGA 3E87A 1F5QA 1ZXEA 4JVGA 5KHXA 5C8MA 2EXCX 4FV6A 1V1KA 3TNIA 3S0OA 3FKLA 1OIQA 3WZKA 3ZDUA 3GUBA 5F95A 2ITVA 2XCHA 4G16A 4NM3A 5HO8A 5D7VA 3O7LD 4B4LA 3S95A 5HESA 3AXWA 3CD3A 5AUUA 4FX3A 4G6OA 4U44A 3OXTA 3ORTA 1MQ4A 4O27B 5EI2A 3HMNA 4TYEA 5HGIA 4HYSA 4PPCA 1WZYA 4WUAA 2OH4A 3GENA 4TNDA 5E92A 5FDPA 2ETMA 2W5AA 3RPVA 3ZH8A 3TWJA 1OIUA 4K6ZA 4TYIA 3PUPA 2YCQA 2QHMA 4F99A 1GJOA 2QOFA 4OT6A 5DT4A 4BL1A 2BDWA 2YAKA 4BF2A 4EC8A 4QQJA 4YC8A 5HEZA 3A62A 2UZNA 2JKQA 5HE1A 3WF9A 4YGAA 5ETIA 2PUUA 3DNEA 1PYEA 2J0JA 3EN5A 3F7ZA 2UZVA 1BYGA 2Y4IB 2YACA 4QMPA 4GIHA 3GC7A 4C59A 3R9HA 4IAZA 3RNIA 2HZ4A 5CU0A 4CLIA 3FZSA 4AFJA 2OJGA 5L2SA 2VO7A 3M1SA 1SYKA 1ZOGA 4IM0A 1P14A 2XIKA 3PPJA 4MD9E 4GG7A 5AR4A 2I40A 2BR1A 2CDZA 3DK7A 1Y8GA 3QTWA 4FKWA 4EH5A 3DDQA 2VWWA 3F3UA 3QRIA 4WIHA 3FMHA 1OKZA 4I3ZA 3PE2A 2Z60A 2GNLA 4YJOA 3W2RA 5J8IA 3D5WA 2I0VA 5IPJA 2X4ZA 3KXHA 4WSQA 2YABA 4G9CA 2JKMA 3U8WA 3CTQA 4TRLA 3C4CA 5CVHA 1IRKA 5FXSA 4Z9LA 4IVBA 1PXPA 3L8PA 3HDNA 5F1ZA 4MQ2A 2JDSA 5AUXA 1R1WA 2RG6A 4KSPA 5CNOA 5HIBA 4CFNA 3AT3A 2QG5A 1M7NA 2BRGA 4GT4A 3PY1A 1YXUA 3HNGA 4MHAA 3V5QA 1PXNA 2QNJA 1B38A 3W2PA 4JBVA 4X3FC 3O17A 4G6LA 4P7EA 3AC1A 1U46A 3COIA 3ZDIA 4FZ7A 4TYGA 1XBCA 2JKOA 2VTQA 2W1DA 2XKCA 3CPCA 3K54A 2WMUA 3KULB 4FG7A 4FKIA 4LUDA 4NM0A 1UVRA 2O63A 5AA9A 3L8XA 3ELJA 1U54A 4MNEA 4XG6A 2CSNA 4BDJA 5FTQA 4CNHA 2XRUA 4JQ8A 3C5UA 3H9RA 4OTDA 4A06A 4FTCA 4EONA 2I0EA 5A54A 1KSWA 2CMWA 2OJJA 4U9AA 5J5TA 2J9MA 4BTKA 2CN5A 2FB8A 2X39A 3PP0A 1ZY5A 5J87A 4IX6A 4JRNA 1JSUA 4HCVA 2JBPA 2VN9A 2R3FA 1LUFA 2BFXA 3U6JA 4AOIA 4FEQA 3ZYAA 2ACXA 2HWPA 3ALOA 2GDOA 4L7FA 3TNQB 3BQRA 1PXMA 2JEDA 4H36A 2BHEA 3R00A 1JBPE 5EDQA 3ODZX 2FGIA 4FSZA 4HYIA 4QYGA 4UXLA 4EYMA 3CCNA 4R1YA 3PPKA 5A3XA 4BTFA 4RC4A 3CIKA 1OMWA 2WO6A 4RX8A 2X6DA 5CSVA 3WZDA 3PTGA 2EXEA 2OIQA 3BYOA 5IH5A 1G5SA 4PL3A 3FBVA 4EQMA 3KA0A 2B9IA 2V0DA 5LWMA 4IADA 2F2CB 3WIKA 3I6WA 2W96B 4IWDA 4FK3A 3PXFA 1NXKA 4ZSLA 3F3TA 4DLJA 3AC8A 2WQBA 3FLSA 5IU2A 3MFSA 1BX6A 4JX3A 5HG7A 1CMKE 3G9NA 1H00A 5JZJA 3MN3A 2C5OA 4FT9A 4GYIA 2XS0A 4F08A 3KN6A 4P4CA 4RZVA 1XBAA 3DBFA 4QMUA 1UNGA 2CGUA 4EHEA 3KXGA 1OVEA 2Z7RA 3V5PA 5JEBA 5M55A 1Q41A 4F70A 1H07A 4KIOA 4NZWB 3FZOA 1TQIA 2G15A 4I6BA 2YZAA 4EHZA 4AGWA 5LMKC 4CZYB 1J91A 2QO7A 3I0OA 5DI1A 3BGZA 3QA0A 4EORA 3EKKA 4U97A 4C58A 4ASDA 4E5AX 2Z8CA 4BCOA 2NRUA 1XO2B 5CEOA 4ANBA 3BBTB 2VU3A 3OW3A 3SXRA 1KV1A 4DFYA 2JDRA 2OSCA 3PJ8A 3ZEWA 4QP6A 4JAJA 2G2HA 4MD7E 5CVFA 1CKJA 2EXMA 5AJQA 3VHEA 3WBLA 4ZTNA 3UIBA 4BIEA 2W4OA 4EUUA 1BLXA 5IMEA 5AP0A 4USEA 3IGGA 4IIRA 4UALA 3FLYA 2UW0A 2X8IA 3QGYA 2CGXA 1KWPA 4IE9A 5ANGA 3ITZA 4BI0A 3AMBA 1V0OA 5DR9A 3UO4A 4I24A 5AIRA 4XG8A 3UMXA 4G3GA 4QMXA 2XBJA 3B8QA 3FQEA 3UBDA 3ORMA 1DS5A 3I6UA 3FZRA 4BDGA 3OEFX 4FR4A 2E9UA 3AC5A 3B8RA 4DCEA 1SVEA 2UVYA 2A2AA 2GPHA 3A99A 3KFAA 3MWUA 3VO3A 3VHKA 3WARA 3PZHA 5HD7A 5IEVA 3DKCA 4I4FA 2EWAA 4IVCA 2R3RA 2R0IA 2R7BA 4M15A 3KULA 4W4XA 5TE0A 4E3CA 1H24A 2F2UA 1RE8A 4FL2A 4AW5A 4U7ZA 4W8DA 1K2PA 3OUNB 3SW4A 4B7TA 1UU3A 4CV9A 2BVAA 4EK3A 4F6WA 3ULZA 3UO6A 2R3OA 5L2WA 3MH2A 5AR5A 1T46A 3ZO3A 4R3PA 1VYZA 5I9ZA 4GG5A 5CXZA 3MPMA 3PSBA 3GC0A 3F9NA 3T9IA 3ZBXA 2CCIA 4KSQA 4A4LA 4QP1A 3U51A 3ZFMA 3RMFA 3P7CA 3IW7A 4ANSA 3QQHA 1KE5A 1ZYLA 4ZSJA 3L1SA 4JR7A 4CEGA 4D1ZA 4BHNA 4DGNA 4G31A 4LRKA 4QMQA 3F5UA 5IUGA 2FYSA 3FKNA 4YZDA 5E8YA 4JS8A 2E9OA 3DAJA 3VUKA 4DH7A 1JWHA 1UU8A 2VZ6A 1Q99A 4H1JA 4CYIA 5FLFA 4QMSA 3TTJA 3VQUA 3BE9A 5HE2A 4NFMA 4NKSA 3REPA 3AMAA 4XOZA 4FV0A 5HNGA 4NIFB 4IX5A 2XK9A 4EQCA 3Q4CA 5I4NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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