4NEUA

X-ray structure of receptor interacting protein 1 (rip1)kinase domain with a 1-aminoisoquinoline inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
308
structure length
286
Chain Sequence
SLNVIKMKSSDFLESAELDSGGFGKVSLCFHRTQGLMIMKTVYKGPNCIEHNEALLEEAKMMNRLRHSRVVKLLGVIIEEGKYSLVMEYMEKGNLMHVLKAEMSTPLSVKGRIILEIIEGMCYLHGKGVIHKDLKPENILVDNDFHIKIADLGLASFKMWGTLYYMAPEHLNDVNAKPTEKSDVYSFAVVLWAIFANKEPYENAICEQQLIMCIKSGNRPDVDDITEYCPREIISLMKLCWEANPEARPTFPGIEEKFRPFYLSQLEESVEEDVKSLKKEYSNENA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of Small Molecule RIP1 Kinase Inhibitors for the Treatment of Pathologies Associated with Necroptosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1
total genus 89
structure length 286
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4neuA00
3R00A 4L3PA 2WFYA 4WO5A 2BRMA 2QO7A 4RGJA 1PMEA 2CGWA 5KMIA 4IX3A 3EMGA 3NCGA 3NYVA 4ITJA 4KIOA 3QTXA 4RFZA 3Q6WA 4LFIA 4BDGA 3DV3A 4FK3A 2IVSA 4BFMA 3SOCA 3PJ1A 1YHSA 4EH2A 3UOKA 2BTRA 2JIUA 3R7GA 4TYHB 3QHWA 4RX8A 1Q3WA 1ZMUA 4APPA 3PIXA 2PTKA 2YIQA 3IO7A 4AZFA 2B54A 2WZJA 3R04A 3LXNA 4XLIA 3Q9XA 4JBQA 3POOA 3ALOA 3QC9A 4RA4A 3FI3A 3PP1A 3PYYA 1NA7A 2C5YA 2OIQA 5BQ0A 3G6GA 5ETCA 2C5NA 4EK3A 4G3EA 2J9MA 5CQUA 3ZRLA 3OC1A 3EQPA 1A06A 3UYTA 4NKAA 1E9HA 3VJOA 4CMTA 2JKKA 3R71A 4U6RA 1Q41A 3KXNA 2R7IA 3TWJA 2G15A 4JG8A 4QP9A 3VS5A 3WYYA 1YXSA 5E8UA 3LXLA 4USEA 3WF9A 4BTKA 3FYJX 4MHAA 1Q8YA 3JVSA 3FLSA 4JT3A 4AUAA 4XG6A 3JS2A 4EWHA 2HXLA 4BN1A 5AP2A 4ZTLA 1NVSA 2Y6MA 3VF9A 2P2HA 3NS9A 4TWOA 3NGAA 4GMYA 5D1JA 3TZ8A 3QQHA 3R7EA 4ITIA 4PMTA 4EQMA 4PUZA 3AXWA 3C50A 3CEKA 2XB7A 2ERZE 5HNBA 4V0GB 3DNDA 5AX3A 3MPAA 5BX0A 2B1PA 4RFMA 1OB3A 4FOBA 4UWCA 4AT4A 5FG8A 3F61A 4BHNA 3E8NA 3P08A 3MVLA 4BZOA 4XG4A 4IFCA 1ZOGA 3FLWA 3F3UA 2PE2A 3DKGA 5IDPA 4FSWA 4OTRA 3FXWA 2R7BA 2C68A 1KV1A 4MWIA 1H00A 3CPBA 4MNFA 2WOUA 4WRGA 4PQNA 3BU5A 3PXRA 1DAYA 2QONA 4U41A 2C3JA 4R8QA 1XBAA 1WVXA 3QUPA 2XVDA 1YDRE 1OKVA 4FIHA 3NNXA 2ZV9A 4IAIA 3OBGA 5LVLA 2OSCA 2VU3A 3MFUA 5BVOA 5JKGA 5HESA 4F9AA 4PP9A 1PXLA 4BCQA 5E90A 5J1VA 2F2UA 3OG7A 4OTDA 1M7NA 2G2IA 3MFSA 5M4CA 4FSYA 5IA1A 2E9VA 2X0GA 4R7IA 3QCXA 3ZFMA 4ANSA 4C4JA 4F7LA 5HD7A 2I0HA 5CT7A 4M12A 2C0IA 5C8NA 4OT6A 5FXRA 3QU0A 4FX3A 3NDMA 3V51A 3PY1A 1URCA 4FKUA 5CLPA 3FHIA 5FBNC 2Z60A 3WILA 3TI1A 3NEWA 2UW8A 1G3NA 3OCGA 5BPYA 2BALA 4L42A 3VRZA 4G16A 2XKEA 2JFLA 4MNEA 1JVPP 2OKRA 1ZWSA 5H9BA 2OJGA 1YOJA 3Q4CA 4JVGA 2ZMDA 4MBLA 5DA3A 2EWAA 1JKSA 3BLHA 2KTYA 3DAJA 3GFEA 2VWXA 3CJGA 4U45A 2XM8A 3U9NA 4C59A 5M4UA 3QL8A 5EHYA 5E8ZA 2YITA 3SA0A 3AC5A 3SW4A 3FHRA 5LCJA 3BELA 1WBPA 4O6LA 2CHLA 1XH4A 2WMXA 3FJQE 3QZFA 4QQTA 2QOIA 3HV7A 3CKXA 4CQGA 4ZY5A 5HX8A 4TYHA 4J98A 4HVDA 4I41A 2HZ4A 4RSSA 4CYIA 2OH0E 4RC2A 4AGDA 3VBYA 2R9SA 5J9LA 3V6SA 2VX1A 5D12A 5IEYA 4R1YA 4GYIA 1BL6A 2SRCA 3TV7A 5HG5A 3UBDA 3E63A 1J91A 3H30A 4N4SA 3T3VA 4EOJA 4PMSA 1W7HA 2I0VA 4I23A 4II5A 3U9CA 1F3MC 4YTIA 3NX8A 2ZMCA 5CU3A 4DFNA 4D0WA 3NYXA 4JRVA 4QMNA 2HAKA 5AIKA 4C2VA 5CXZA 3FMEA 3BU3A 3A4PA 5BUIA 4OTGA 4ERWA 2RFNA 3ZUTA 2C5OA 3F5UA 5EK7A 1A9UA 4ZJIA 3PJ2A 4JR7A 4J99A 4E5BA 2WO6A 3E64A 1E1XA 4X0MA 5E8SA 5H2UA 1PMVA 4FMQA 2IVUA 4EOMA 3IS5A 3OXIA 2GS2A 3PP0A 4FSNA 4IWOA 5EW9A 4V0GA 5C26A 4CVAA 5CX9A 2WPAA 3HRFA 5J7HA 4FV9A 4B8MA 4DC2A 3TZMA 2DYLA 3I5ZA 4NH1A 5HLPA 4CFVA 4JRNA 4FTAA 4BDBA 4TYJA 4NUSA 4UZHA 3F9NA 3HMMA 5BVFA 2R3IA 3F82A 4EI4A 3IDPA 4QPSA 3ZO3A 4IBMA 2XIYA 3RPRA 3HMIA 3ZBXA 2Y0AA 5JN2A 3GC7A 2QOQA 3DBEA 2O65A 4J97A 2VWZA 5K3YA 3UTOA 4RC3A 3QRUA 4L53A 4EOQA 4JBOA 3F5XA 2CPKE 2NRYA 2WAJA 4J95A 4AT3A 1Y8YA 4IB3A 3R9NA 4AAAA 2YHVA 4MD9E 4O91A 3A7IA 3W2RA 5AA8A 5KMJA 2YAAA 4L3JA 1BKXA 5L6PA 3P4KA 3M42A 4BKYA 2ITVA 2V55A 3EYHA 2VO0A 3CQEA 4TWPA 3E7VA 3OTVA 4PWNA 3G0EA 3D0EA 4UBAA 4X2FA 5ANEA 4ZK5A 3TKHA 4D4RA 4BZDA 3SV0A 2FH9A 4BCJA 4FG8A 4C4EA 4E73A 1E1VA 4IWQA 4GJ2A 2XRUA 4GU6A 5DI1A 1H0WA 2UW7A 3H9OA 4LRJA 1WBVA 3V5LA 5HGIA 2R0IA 3DQXA 4WNKA 4RVMA 4QMQA 5I9UA 4LGDA 3P78A 2NPQA 4WHZA 3NLBA 3Q4ZA 4EK5A 4ZSAA 4B7TA 3UODA 5CSPA 4C4HA 1PYEA 2R3MA 3HMOA 4C2WA 3UG1A 5G6VA 3PRFA 3ZSGA 3EL8A 4DGGA 2VTHA 2BZIB 2NP8A 4U80A 3UNZA 3DOGA 3A7GA 5DHJA 5EI2A 4DITA 3CS9A 4BTFA 3MGYA 4IMYA 3NW6A 4EHVA 1OIQA 5HE1A 4CFNA 4AGWA 3NAXA 4JDHA 3RAKA 3SXFA 4MQ2A 2JITA 1XWSA 3Q9WA 5DOSA 2W1HA 5HNIX 3Q6UA 4IVCA 2UZUE 2RKUA 3TACA 4BCKA 1DAWA 5ANIA 2XK7A 4YTFA 3UYSA 3L9MA 3C4EA 3DTCA 5IA4A 2XKCA 4EH4A 4E4NA 1UV5A 4NJ3A 4NKSA 2F4JA 4RJ5A 3TL8A 2EU9A 3PPJA 4L7SA 4M69B 1PY5A 4TYGA 2XJ0A 5LMBA 1JQHA 3NWWA 4R7HA 4BCIA 2A19B 2YISA 3K3IA 4WKQA 3W2OA 5KKRC 3QRKA 3QYWA 4RZVA 5EG3A 3MFTA 4IB0A 3DZOA 2Y4IC 3DS6A 4TNBA 4AS0A 5AUVA 3NYNA 4WSYA 4ZEGA 2X6DA 3O7LB 4I0TA 4GT5A 3ORKA 4FZAB 2B9IA 2BAQA 5BNJA 4FYOA 3CXWA 1XH6A 5A4TA 3F3ZA 3P7BA 4QYFA 4GU9A 4D2TA 1KWPA 3BRBA 4NM5A 3DK6A 3ZH8A 1GOLA 4HNFA 1KE5A 4JS8A 4O0TA 4FYNA 4YJRA 4ONAA 5AADA 2REIA 2ITYA 2WELA 3RM6A 3A99A 2F7XE 3PXZA 4DAWA 1XBCA 4X6QC 3DBFA 3KULB 4FV5A 4FVRA 2VAGA 4S34A 3RPYA 1ZARA 4DEBA 3H10A 3OROA 1Y6AA 4AWIA 1DS5A 3OD6X 4FL2A 3BCEA 4EHZA 2F49A 5IG1A 2B9FA 2GDOA 4KABA 2C5XA 5H8BA 4ZTMA 3PA4A 2BROA 3R8VA 4BDFA 4OW8A 5FRIA 5HG7A 1CKIA 1GIJA 2Z7QA 4C34A 5FDPA 1BYGA 1YXVA 2VX0A 4WA9A 4BCMA 5EKNA 5CSXA 5M53A 1PF8A 2YZAA 3TIYA 4X2GA 4BDHA 4NM3A 4QMTA 2A2AA 2BDJA 5GZAA 4FTLA 1ZLTA 2OXXA 2WQBA 3PZEA 4WRSA 4RIXB 4DEAA 4GJ3A 4HCUA 4LRMA 1R1WA 2BFYA 5B7VA 2B9HA 4F9YA 3VN9A 4DH5A 4H1JA 4DTKA 1RJBA 5EM7A 3ZSHA 4NFMA 3CLYA 3E92A 3VS0A 2Y9QA 2YIXA 5M57A 4F6UA 4EOKA 5ETAA 2O5KA 3FPMA 4C7TA 3T9IA 2HOGA 3P23A 2QO9A 4OT5A 4U79A 3ORPA 4A4XA 4CCUA 4HZSA 4QMXA 3DK3A 3VW8A 3AC8A 5GJGA 1K2PA 2IO6A 3K54A 3FKLA 5LMAA 3QZIA 1YXXA 4I22A 1H1PA 5ETIA 5DR9A 5E8XA 4EBWA 3QD4A 4I5MA 4ASEA 2QU6A 3EKKA 4JDIA 2UZVA 4YPSA 1PXPA 1W98A 5HHWA 4EZ7A 3PLSA 3O96A 5J8IA 1GZNA 2XKFA 3KVWA 4BCPA 4XOYA 2J5EA 3BE9A 3U8WA 3GCVA 3O8UA 5I0BA 4FL3A 3GFWA 4IX6A 4MXAA 1ZXEA 4FKIA 1ZYLA 3BLRA 1T45A 2G01A 4BCGA 2V0DA 1JKKA 4DG2E 4QTCA 5HEZA 4UMTA 3NPCA 4YZ9A 1OZ1A 3ZYAA 3GP0A 3H0YA 2CCIA 4I5PA 3R1QA 3SXSA 4DFYA 4NTSA 1M2QA 3ANQA 2VTIA 5HD4A 4ZTRA 4WOVA 3AC2A 3ODYX 3LFSA 2WEVA 4KAOA 3UQGA 2VX3A 4F1OA 4PF4A 2FVDA 4QRCA 3ZXTA 4BKJA 3DKOA 2DQ7X 3QZGA 4CT1A 2WMVA 5JGDA 1QMZA 2BTSA 3EKNA 3FWQA 4RJ8A 4ZXTA 3RHXA 4UX9A 4YZBA 4X2JA 5I9VA 4LV5A 4M69A 4QMYA 1J3HA 2XIZA 3QQKA 3I0OA 4ZZNA 4ZY6A 4HGSA 2C0OA 4U5JA 3Q4TA 5GHVA 3F69A 3GU6A 4L68A 2XK9A 1QPCA 2A4LA 1ERKA 2C6EA 2PVFA 1YXUA 2PY3A 4IQ6A 4ENYA 4IM3A 5IPJA 2GHGA 2HY0A 3RPSA 2BRHA 4C4GA 4JQEA 5HVKA 2HWOA 2O2UA 1UWJA 1YHWA 3KXMA 5E8WA 4GH2A 5B0XA 4YJVA 2GTNA 3CQUA 1Q97A 2W1EA 2W5BA 4ZZMA 4CRSA 4BIBA 4E7WA 3GT8A 3MTFA 4IDVA 3QC4A 2XYUA 3KULA 3HA6A 4JAIA 2GNJA 3P5KA 4LOOA 4CRLA 4TYIA 2QKWB 4FTJA 4PDPA 3DY7A 3BBTB 5FEDA 2QOBA 2O3PA 4FR4A 1R78A 4UXLA 4AOTA 2YABA 3COHA 3VBWA 5F9EA 3BHTA 4Y8DA 1OPLA 5TR6A 4FICA 4BHZA 2XIKA 3RNIA 5DRDA 4DINA 3ORNA 2XNPA 2GMXA 4B8LA 3NUSA 2CLXA 3C51A 4H3PA 4KKGA 3EB0A 4KS7A 3ZEWA 4RIXA 2UW0A 3A62A 3IKAA 2W1FA 4TY1A 4N70A 3Q53A 4K1BA 3Q04A 3C4XA 3CD8A 3PVUA 3QUDA 5BYYA 1KOBA 4MF1A 4ANQA 3RWPA 3TZ9A 5A46A 1V0PA 3QAME 3VF8A 4D2PA 3CPCA 4RJ3A 5EKOA 5IUHA 4NCTC 2J7TA 2GNLA 3R2YA 4UWBA 1QPJA 5ANGA 2X1NA 2V7OA 3EZRA 4GIIA 1OUYA 4MVFA 4C4IA 2OIDA 2R3NA 4K9YA 3RZFA 5J7BA 1AQ1A 3FZPA 4RQKA 3WIKA 1UNLA 3F5PA 4YO6A 3O7LD 4BDCA 3T3UA 4A06A 2X7OA 5CEOA 5CASA 3Q5IA 3ZO1A 4IW0A 1KOAA 2FYSA 4F9BA 3LZBA 3EFLA 1VYWA 4H1MA 4O96A 5CAVA 3K5VA 3S1HA 2QOFA 4F08A 5CXHA 4YJTA 3H9FA 1B6CB 5CEIA 3LPBA 3UO4A 4KBCA 5JFWA 3OFMA 5JSMA 4JLCA 2GNIA 3BV3A 3G9NA 1YDTE 4Z9LA 5CAOA 4U0IA 5JT2A 2BZHB 3TUCA 4PPCA 2EVAA 2PMIA 3EQFA 4IE9A 3ZRKA 4EYMA 2VTOA 3KFAA 4MXXA 4QPMA 5LMKC 4FKWA 4MWHA 5JQ5A 4PMPA 5B2MA 4ASZA 2F57A 4FV7A 5B2KA 5JEBA 3OOGA 2C69A 1WBTA 2FSTX 4CZUA 5DN3A 2WTCA 1GIIA 5ACKA 4EUUA 1MRYA 4UV0A 3AG9A 3S3IA 4F1MA 3QTWA 1OL1A 3ZS5A 4USDA 3DLSA 3LCKA 5AJQA 4U42A 4JDKA 2GCDA 3ZO4A 1GZ8A 4EC8A 2QO2A 4CFXA 3BGZA 1PXKA 3DA6A 3JVRA 3F66A 2IW8A 2X8DA 3KU2A 2W0JA 4UMUA 4AGUA 1CMKE 5CT0A 3VWAA 3FL5A 5CF8A 3QKLA 3BGQA 4LYNA 4CTCA 3M11A 2BDFA 2UZOA 3EWHA 3VULA 4ALWA 3ORTA 5HE2A 2BFXA 4A9YA 2YJRA 1OL2A 1TQPA 5E8VA 4BB4A 2C6DA 2XJ1A 4QP7A 3UVRA 5AP7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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