4NEU | Genus

Total Genus 89

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	89
sequence length	308
structure length	286
Chain Sequence	SLNVIKMKSSDFLESAELDSGGFGKVSLCFHRTQGLMIMKTVYKGPNCIEHNEALLEEAKMMNRLRHSRVVKLLGVIIEEGKYSLVMEYMEKGNLMHVLKAEMSTPLSVKGRIILEIIEGMCYLHGKGVIHKDLKPENILVDNDFHIKIADLGLASFKMWGTLYYMAPEHLNDVNAKPTEKSDVYSFAVVLWAIFANKEPYENAICEQQLIMCIKSGNRPDVDDITEYCPREIISLMKLCWEANPEARPTFPGIEEKFRPFYLSQLEESVEEDVKSLKKEYSNENA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Discovery of Small Molecule RIP1 Kinase Inhibitors for the Treatment of Pathologies Associated with Necroptosis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	89
structure length	286
sequence length	308
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2013-10-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4neuA00

2XKFA 4NW5A 5A4EA 1ZYSA 2E9VA 4IDTA 2YJRA 3L8XA 4OTIA 3IONA 2WTKC 4RWLA 4AE9A 1J1CA 4R5YA 5HIDA 5L2SA 4M67A 4XYFA 5CU2A 2W5AA 3ZFMA 5DEYA 4XRJA 4P4CA 4D4YA 1JOWB 3TIYA 1DS5A 4N0SA 2C0TA 2YDJA 4O0WA 3L8PA 2YM4A 3BE2A 4WNMA 1JNKA 3IDBA 4Y5QA 4WKQA 4B9DA 4U45A 2XJ0A 1UA2A 3Q6UA 4AN9A 4RG0A 1TKIA 4LV8A 5BUEA 1H26A 4FG9A 5A4TA 4L3JA 3OWJA 1PXNA 2JLDA 1F5QA 2XNPA 3QQUA 3NS9A 4X3FA 4QQTA 5IG1A 4I5CA 4EOSA 4Z55A 5AAEA 2RFSA 4GU6A 1GIJA 1RDQE 1KOBA 2OJGA 2XUUA 3BHYA 2CDZA 4HYUA 3ULZA 4FA2A 4EZ3A 4RMZA 1MP8A 1YXUA 2YCQA 5F20A 4BDCA 5CSPA 1QPDA 2WD1A 5TT7A 3I4BA 3NSZA 3HX4A 4AX8A 5KKRC 4IWOA 5CX9A 4BICA 3GU7A 4QT1A 2WEIA 2WTWA 1APME 3NNUA 5JGBA 2A0CX 3CGFA 1ZMVA 2JBOA 2XS0A 2Z7QA 3FXXA 2JAVA 3L9PA 5AEPA 2IO6A 3MY1A 3IECA 4O27B 2ZDUA 4O21A 4EH4A 3LFSA 5GZAA 3QL8A 2HOGA 5DBXA 3BLHA 3CS9A 4MAOA 4O0VA 3IW8A 2BAJA 5AP1A 1MRYA 3NNWA 4FTJA 4G2FA 4I22A 4FKTA 4KBAA 4DTKA 5DFPA 1FVRA 3QKKA 4RJ8A 4B0GA 2Y6MA 4GW8A 4EBVA 3Q4UA 4F0FA 3I0QA 1QL6A 2PVHA 4JAIA 2QU6A 3FI3A 4LOQA 2FGIA 1WBNA 3C5UA 3SDJA 3UP2A 4EYJA 5CAOA 2QD9A 3KXGA 3PFQA 4IX3A 3NAYA 3KXXA 4AU8A 1KWPA 3AC1A 2OJ9A 3OW3A 2R3RA 1OL6A 5AAFA 1CKIA 3U9CA 3ORNA 4V0GA 4CTCA 4KIKA 2C68A 4TRLA 3ZU7A 4AUAA 1OECA 1YDRE 3ZRLA 3DGKA 4ZTLA 3PZEA 3QXOA 2ZVAA 4I3ZA 4ZOGA 3U87A 4NK9A 2F7XE 2ITOA 3JY9A 4M0YA 3PP1A 3VWAA 4DH1A 2LAVA 4GS6A 4YO4A 2F49A 3B8RA 3FZSA 3AG9A 2VTAA 3PXFA 5E90A 4HPTE 3V04A 2CN5A 4CNHA 2E9NA 2R3FA 2JC6A 2XCKA 4O0TA 4JQEA 4MXCA 1OUYA 4FVPA 4TTHB 2YJSA 4PWNA 4UWBA 5IMXA 1Q62A 4BHNA 4CKRA 3C4CA 4PRJA 3ITZA 3RGFA 2C6OA 3ANQA 4NIFB 4JX7A 3BGPA 4DC2A 1OL1A 4KKGA 2JKKA 1K9AA 3IOKA 3AC4A 3Q4TA 2J5FA 1KE7A 2WMXA 4FKVA 4IANA 3GC9A 4FGBA 5H8BA 3DNDA 2VWWA 3CBLA 1WBVA 4D58A 4FV7A 1WBTA 2WHBA 2JGZA 3UVPA 1DAWA 4CZYB 2HZNA 4YHTA 3OBGA 4J98A 3WBLA 5HTBA 5CVFA 3GOPA 4M13A 4D1XA 1WVYA 4GYIA 5HG8A 1O6KA 4G6OA 3KXZA 3UZPA 4AAAA 5D7AA 4EEVA 1L3RE 3C13A 3LPBA 5HORA 5KMNA 4YJRA 3VS2A 5K5NA 2XEYA 1R3CA 2OICA 2X39A 3HP5A 4FSRA 4IZ7A 4L7FA 3RPYA 1PXLA 4QP8A 2ETMA 4F99A 4JDHA 3VW6A 2Y4PA 4IBMA 4Z7GA 2YCSA 4MHAA 5EDRA 4BZNA 1FINA 2O0UA 4OW8A 4QP7A 4NM0A 5FWKK 4M8TA 4HGTA 2JIUA 3M2WA 5AX9A 3KVXA 4X2JA 3LVPA 2OJFE 4CT2A 2VAGA 4EUUA 3IKAA 5BVEA 2O8YA 2VX1A 3EZRA 3QUEA 3FMLA 5ANKA 5C03A 5I3OA 4A9SA 3NUNA 5IH4A 3JUHA 3ORLA 4GIIA 4ITIA 3NUYA 3Q53A 5J7BA 5EHOA 2BRNA 3TNQB 3PSDA 2YABA 4OBQA 3R8ZA 5A9UA 3FLWA 1H01A 4IWPA 4BCFA 2B4SB 5CZHA 4UZHA 2C3JA 2W05A 3R7GA 4PV0A 4CMOA 3A62A 2P3GX 3DLSA 3EQCA 1BMKA 2CHLA 3VBXA 5FM3A 4ANNA 2VTRA 3OCBA 4AZFA 3QQFA 2UW0A 5CSWA 4F63A 4B7TA 2VTOA 3ENMA 4XBUA 3FC1X 2OZOA 2WTJA 4IE9A 2X7FA 3BWFA 3D5UA 3WE8A 3BLQA 3QKLA 3TNHA 4X6RA 4PL5A 2W99B 3HYHA 2ITVA 3QF9A 4U41A 4EH2A 2YHVA 3V8SA 1BI7A 3N51A 4OTHA 3H30A 4I20A 3QA8A 4GH2A 4XOZA 5KMIA 2HK5A 4WT6A 1YI6A 3AMYA 5CI6A 3COIA 2CGVA 3EHAA 4DGOA 4WO5A 4XH6A 5HU3A 1PKDA 5J8IA 4C61A 3ORZA 3OT3A 5HCZA 3W2SA 1ZOEA 3ZOSA 2QHMA 1J91A 4C34A 5AV4A 3SD0A 5IMEA 1XBAA 4FV3A 4B8MA 4ZIMA 2VWXA 3FQEA 4N70A 4H1MA 4NM3A 1K3AA 4MD9E 3ZEPA 4MXOA 3TV4A 3WARA 4FMQA 2R3QA 1ZYJA 4ANMA 3D4QA 4OBOA 2IZUA 4RJ6A 4YTCA 3C4WA 4LL0A 5FG8A 3IG7A 3T3UA 3RAHA 2B9IA 3PJ8A 2YLFA 1XH9A 4Q2AA 3IOPA 4LRMA 5IEYA 2CGXA 2ITNA 3BYMA 4BI1A 4CLIA 3C51A 3GGFA 4XNEA 5GJDA 4FSUA 5HCXA 3CQUA 2O65A 3CIKA 1XR1A 2C6DA 4MKCA 5FEDA 2C6TA 2ITTA 3CLYA 2XIYA 4BFMA 1DAYA 2GHGA 2RIOA 3FQHA 4XG2A 5ETFA 2IN6A 2R3HA 2X2KA 4TWNA 1W0XC 2HW6A 4MD8E 4QYEA 4AXAA 3RINA 2X8EA 4ZZNA 2XNGA 4OGRA 5A46A 1R0PA 2X8IA 2C5XA 3D7TB 3VBQA 3MGYA 3TIZA 5JGAA 1OPKA 4DAWA 4S32A 1JSVA 4YZMA 2W1HA 2BHHA 4Z9LA 4YJUA 5LWNA 2GU8A 4DN5A 3REPA 2GQGA 4YC3A 4H36A 2B9JA 4KS7A 4V04A 5AUWA 4PX6A 3PA3A 4BDGA 2IJMA 3BEGA 4XP3A 4I5HA 5J5SA 4WUNA 5M53A 3PY0A 4TW9A 3ACJA 5E8TA 1LUFA 4ASEA 4ZTMA 5BVFA 1LPUA 5AMNA 3OFMA 3ZBFA 3F88A 1Q8YA 3F5UA 2QODA 4QQJA 4U9AA 1G3NA 3D7ZA 2ACXA 2QC6A 3L9LA 3PVBA 4IB1A 4KBKA 5CQUA 2DWBA 3QRJA 3BGZA 5AP4A 2UZVA 1SVGA 4QMZA 5EK7A 4UMUA 3SV0A 3UDBA 4WHZA 4BZDA 5KMKA 4YPDA 4CTBA 1XH8A 3HRBA 3HMIA 3PRFA 4AACA 1NXKA 2WTCA 3PPKA 4ACGA 1YXXA 2W9FB 4NEUA 4BIEA 3UZTA 1Z5MA 1M2PA 3VW8A 5IH5A 4XEYA 4PTEA 4MXAA 4HW7A 2WMSA 3MW1A 5CF5A 4CQGA 3ZLYA 4XP2A 5JFXA 4DEHA 5DI1A 2F2CB 4UYNA 4OLIA 3RK7A 5HBHA 3MH1A 3W10A 3O0GA 4F08A 4BKYA 1XQZA 1PJKA 2PZPA 3AQVA 3HVCA 4L9IA 2P4IA 2JITA 4PNIA 3MFTA 4P5QA 3Q9YA 4MXZA 2ZM1A 3EN6A 3RK9A 3ROCA 3OZ6A 5C8NA 1OL2A 3OHTA 5K3YA 2BR1A 1PMEA 1O6YA 4GT3A 3RKBA 3FZOA 3QKMA 4FEQA 5CLPA 3O71A 4GU9A 2OI4X 3BYVA 3EFWA 1MQ4A 1IR3A 1XWSA 3MVJA 4ZS0A 3KA0A 4ZEGA 4PP7A 3UQFA 3PXZA 3TG1A 2ERZE 4LRKA 3OUKA 5C8MA 1OIUA 3QBNA 4YLKA 3ZMMA 5FQDC 4YZ9A 3MFUA 3RPRA 2YIRA 4ZSLA 3V8TA 5FXQA 2IW8A 2O5KA 4IB0A 3NUSA 3R0TA 4YTFA 3E5AA 4C3PA 3NAXA 4XBRA 4BI2A 3T8OA 1Y91A 2VUWA 3HRFA 4FTLA 2C0OA 4IAKA 5ANJA 5HIBA 4EH7A 2HELA 3D5XA 2XZSA 4CFUA 4O91A 4UMRA 4HNFA 3W16A 4BCHA 5L6WL 2QKRA 2G2FA 3UIBA 5CVGA 2YN8A 4ZK5A 4ZY4A 4NJ3A 4O38A 5LXMA 3OOMA 3R1YA 1Q5KA 2BFYA 2BZKB 4JIAA 4RA4A 5DRBA 2UVYA 3AXWA 3HV7A 2QHNA 4OUCA 1GZNA 5CQWA 3HA8A 5H3QA 4RFZA 4CV9A 2GFCA 2QKWB 3TWJA 2XF0A 2BTRA 3DJ5A 2PY3A 3QTQA 4DEGA 5KMOA 2PZYA 3HV4A 3NW7A 4A4LA 2QO9A 5C01A 2WXVA 2IVSA 3O51A 3O8UA 4ZSAA 5A54A 3V5QA 3OVVA 4CFMA 3O17A 3Q5IA 2CJMA 4RIOA 1OIRA 1PXIA 2PVNA 3RVGA 4LV5A 4EONA 1BKXA 4FV1A 2F7ZE 3TN8A 4FSQA 4HGEA 2UUEA 3BZ3A 4QYGA 3COKA 3L1SA 4U97A 3F7WA 3CJGA 1B39A 4BTKA 4EI4A 1LR4A 4V0GB 4E8AA 4NTSA 5L6PA 4KIKB 2NRYA 3MDYA 4QMWA 3RP9A 1FMKA 4IVDA 4FL1A 3DA6A 3CC6A 4IC7A 3UE4A 4GFGA 2YM7A 3KKVA 1OI9A 4TL0A 1JKTA 3F7ZA 3MIAA 5CENA 3Q96A 4RJ7A 4MD7E 3QTUA 3Q9XA 3GVUA 3MA3A 5CSHA 1P5EA 4JOAA 4TXCA 4YJTA 2ZV9A 1U5QA 4IMYA 4NU1A 2CSNA 4LI5A 2XM9A 4IB5A 1YOJA 4YP8A 3U51A 1U5RA 4CZTA 3R7UA 5CEPA 3UYSA 4BWPA 3MPAA 5AR4A 3OWKA 3FC2A 3W8QA 4MBIA 3R71A 3F69A 4DGLC 3MV5A 4IWDA 4C4FA 4RZWA 4U3YA 3PG1A 2QI8A 2B9FA 3GC7A 3K3IA 3IGOA 3OTVA 5DIAA 4ZZMA 3QRKA 5EG3A 2J9MA 1OL7A 2C3KA 4UV0A 3RK5A 4FT0A 1MQBA 5JSMA 3U4UA 1UWHA 4JX3A 5CEIA 3A4PA 3D15A 3KULA 1QCFA 3UOKA 3QLFA 3ACKA 4JLCA 4PMMA 2UZBA 1ZARA 4F9BA 3WF8A 3NCGA 1TQPA 2C6MA 4MQ2A 4BIDA 2W1ZA 3W1FA 2PZRA 2OJJA 1ZOHA 3LM0A 5CWZA 5TR6A 4CVAA 3NW6A 1ZY5A 4OT5A 3R00A 1XJDA 4IFGA 3UVRA 4KSQA 2CMWA 3JVRA 3T3VA 5E8SA 1SMHA 2EXMA 2WTKB 2X4FA 1XH5A 3NGAA 2GDOA 4JJRA 5IKWA 4H3QA 1I44A 5CS6A 4AGCA 5I9VA 4JAJA 2UW5A 3W2QA 3UG1A 5AP7A 4NUSA 4EOQA 4ZSJA 2WPAA 3QWKA 4ZJVA 3PE1A 2X6DA 3NZ0A 3ZLSA 4C3RA 4QMVA 3MN3A 4XJ0A 4RX5A 4AGDA 4DYMA 4CXAA 3WF5A 1WCCA 4CYIA 3B2WA 4TY1A 4EK3A 4M0ZA 5CANA 3PVUA 4IZAA 3QZGA 3TEIA 2OH0E 1LP4A 3VF9A 3EN4A 3M42A 4I93A 3QQGA 3TKHA 2RG6A 3E3PA 4NSTA 4QP4A 4QMXA 4X21A 4YZNA 1SZMA 5H2UA 3AD5A 2VTLA 3KF4A 5D10A 3P9JA 3WZDA 2VX3A 4FI1A 4FSZA 2XIKA 4ZZOA 2H9VA 1KE9A 3H10A 1UKHA 2JDVA 2BZJA 4ZXTA 4FTAA 5M4UA 3PJ1A 3EYGA 3E63A 1H8FA 1YWNA 5BVDA 1J1BA 3TXOA 5KKRB 4QPMA 5AA8A 1Y6BA 3ZYAA 3FYJX 1AQ1A 4QOXA 3R8MA 3F82A 4FT7A 4D2RA 2C30A 2RFEA 2F7EE 2ITXA 3A8WA 4O0RA 4QTDA 4PNKA 4XRLA 3HGKA 3VS3A 4AS0A 4ZLOA 3SX9A 3R8LA 1OPJA 3HMPA 5DA3A 5KMJA 3Q9WA 3HV6A 5CVHA 2YM6A 1U4DA 3UIXA 3NCZA 3OMVA 4BRXA 2E9PA 3R2YA 4YBKA 3U9NA 4J97A 4L3PA 4AW0A 5L2WA 3BYUA 4NJDA 2R64A 1Y8YA 3I7BA 3IW5A 4I6HA 2PVFA 4FZ6A 3DFAA 3QYWA 5M55A 2CGUA 3Q4CA 3LFEA 4ZTRA 5H8GA 4UXLA 4CKIA 3QD0A 3T9IA 3H9FA 3SRVA 3R9HA 4AW1A 5AUZA 3KCKA 3W32A 4G3CA 3RAWA 1H1SA 2C1AA 5L2IA 3ZCLA 3AC5A 3MH0A 4GVJA 5BVWA 2XIXA 2XB7A 5HO6A 3Q04A 3IS5A 3O8PA 3OF0A 1BLXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4NEUA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations