4NEUA

X-ray structure of receptor interacting protein 1 (rip1)kinase domain with a 1-aminoisoquinoline inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
308
structure length
286
Chain Sequence
SLNVIKMKSSDFLESAELDSGGFGKVSLCFHRTQGLMIMKTVYKGPNCIEHNEALLEEAKMMNRLRHSRVVKLLGVIIEEGKYSLVMEYMEKGNLMHVLKAEMSTPLSVKGRIILEIIEGMCYLHGKGVIHKDLKPENILVDNDFHIKIADLGLASFKMWGTLYYMAPEHLNDVNAKPTEKSDVYSFAVVLWAIFANKEPYENAICEQQLIMCIKSGNRPDVDDITEYCPREIISLMKLCWEANPEARPTFPGIEEKFRPFYLSQLEESVEEDVKSLKKEYSNENA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of Small Molecule RIP1 Kinase Inhibitors for the Treatment of Pathologies Associated with Necroptosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1
total genus 89
structure length 286
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4neuA00
2BTSA 2R9SA 4FSQA 5ANDA 4JG8A 3L8XA 2GU8A 2Y8OA 4EYJA 1OKWA 2OBJA 4U42A 5C03A 2WHBA 5J8IA 4Y73A 2VUWA 4A06A 2IZUA 2E9VA 3AC2A 4JS8A 4ENYA 3GXLA 3BWFA 4TYGA 5DFPA 3LQ5A 1OI9A 4PMMA 4CNHA 3N9XA 1K2PA 3UP2A 3FBVA 3FKNA 4K0YA 2W05A 4IADA 4N4SA 2JAVA 3FKLA 4FIFA 2WMBA 4JR7A 4PP9A 3FXWA 2YHVA 2WMXA 5CEPA 1ZY4A 2A1AB 4GU9A 2PK9A 2GS7A 3CJFA 4O0VA 4YPSA 3ZONA 2H34A 3FQEA 4FYOA 2XCKA 4XCUA 5LOHA 1GY3A 2GFSA 4L53A 3BX5A 2IO6A 4ZOGA 3QALE 5HIDA 2C3IB 1GZOA 2EU9A 2YDJA 5BVKA 4UZHA 4KIKA 3BBTB 3KCFA 2R3FA 3PXZA 4Y46A 3JVSA 4I20A 4M0YA 3MTLA 3RALA 4USEA 1QPDA 5B0XA 1FINA 5HORA 3OUNB 4I6BA 3IG7A 4CFUA 4CTBA 5AP2A 4WBBB 4BCHA 4NU1A 5CASA 1ZZ2A 1QPEA 4ZXTA 3CTQA 4RQKA 3E3PA 5DT4A 4HNFA 3KQ7A 4RX9A 5AR5A 3LMGA 5CVHA 4NK9A 3DNDA 1GNGA 3FLSA 3OBJA 2C5OA 4KIQA 4I0SA 4XG8A 4WSYA 5BYZA 2JIUA 3SOCA 4C4IA 3VS4A 4FA2A 3HZTA 3F5GA 4AZSA 2IW9A 3OTUA 2O0UA 3RWPA 4FKJA 2QCSA 3KL8A 4FT3A 4XP2A 2QD9A 2YCSA 2W4KA 3QWJA 3WYYA 5HTBA 2QR8A 3HV7A 2GQGA 4IZAA 4U7ZA 1OL7A 4EQUA 4UN0C 3R7VA 3Q6WA 3CKWA 3F66A 4K2RA 4NEUA 3DZOA 4Z55A 4JG6A 3RHKA 4HVGA 1WBPA 2C5YA 5AEPA 3F5PA 1IG1A 4TY1A 2HENA 5IA4A 3R8VA 5E8WA 4F0FA 2OZOA 5KBRA 2RFSA 3QTWA 4K11A 5AR8A 5DEWA 4AT4A 4N70A 2W1HA 3PRFA 1VR2A 4G6LA 3NZ0A 3R22A 4L7FA 4F0IA 1UKHA 1U54A 2ZM3A 1PKDA 3GEQA 4LL5A 3UO6A 4EOKA 1FVRA 2VWIA 4U43A 5ACBC 1YDTE 4F1OA 3TZ9A 2Z7LA 1R78A 3UNZA 2J0LA 4RLKA 2Y9QA 3F2AA 3D7TA 4IE9A 3LE6A 2W7XA 4O0UA 4M13A 1Z9XA 2PVMA 2FGIA 3IDCA 4AA5A 2QU5A 4EK4A 3EFWA 5HCZA 2BROA 2QURA 1LR4A 3KK9A 1SVEA 3PE2A 4I3ZA 2YM4A 4GW8A 4BDFA 2HWOA 2OKRA 4H3QA 4QP4A 5LARA 3FC2A 4DGNA 2JKOA 3ZCLA 2ITOA 4OTRA 4BI1A 5JEBA 2NRYA 2VWVA 2Z7SA 3ZLWA 5HI2A 4UWCA 3I5ZA 4F9WA 1TQIA 4NZWB 4QMQA 4DAWA 4F0GA 5ETAA 1XH8A 2JIIA 2ACXA 2ZB1A 4JX7A 4QYGA 2ZMDA 3HA8A 4FV8A 4ACGA 4YJQA 5DT0A 2BRMA 2DWBA 4GG7A 5EW8A 3EQHA 3C51A 3OWJA 4PPAA 4FK6A 2EB2A 3TNPC 3Q96A 5EH0A 3VUDA 5KO1A 4EHZA 2QU6A 3V8WA 3JXWA 2YERA 4BI0A 5K5XA 5HIBA 4FTTA 5GNKA 4ZTHA 4MXCA 2RGPA 3FMMA 2XCHA 1H1WA 4AU8A 1BX6A 4OBPA 4EHEA 2C3JA 4FICA 3VJOA 4FV0A 4G17A 1OL6A 4DBNA 5CI7A 4TYHB 2NPQA 4IB3A 4S30A 3DB8A 1P4OA 2J0MB 3I81A 1J1CA 4FTRA 2ETRA 3R73A 4FSRA 4D4YA 5EFQA 4EEVA 4KNBA 3S0OA 3OCTA 2OICA 1JPAA 4OW8A 4RWLA 4D55A 5BPYA 2OZAB 2YIRA 3WF5A 3VUTA 2YISA 5M44A 3WE4A 2F2CB 4UYAA 4E20A 3PZEA 4EJNA 4FSZA 5M4FA 4V04A 3A7HA 2FUMA 4W4WA 5AP7A 1Y8GA 4BZDA 3NYNA 4QTAA 3VO3A 4RX8A 3DBDA 4ZJIA 3JUHA 4GIHA 1M17A 4E6QA 2YCFA 2YCRA 1W82A 2X9FA 3LM0A 2W5AA 3QX4A 4BKYA 3DLZA 4OBOA 1UU3A 5DPVA 2SRCA 3COIA 3HV4A 4RVMA 4E7WA 4FUXA 2W4OA 1H26A 4Z9LA 5D12A 3WI6A 3LQ8A 4LYNA 2BHHA 2YIXA 4LGDA 5DH3A 4GFOA 2YIQA 5LMBA 2XK3A 2ERKA 4AZTA 2I0HA 1LPUA 3ORLA 4CQEA 3O8UA 3SXSA 5IDNA 4JIAA 3E93A 5IEYA 2FO0A 5HX6A 3A61A 4HPTE 3E5AA 1UVRA 2PZ5A 4MEDA 5H8BA 3R8LA 4C2VA 3HRFA 3VS3A 3I6WA 4O1OA 3QRIA 2Z2WA 3F9NA 1PXOA 3FKOA 2V7OA 4RA4A 2J7TA 3G6HA 4G5PA 3C4XA 4EHVA 5AP5A 2C69A 3UP7A 5JT2A 3GCVA 5LVNA 4CFXA 5CU6A 3OROA 4I94A 4Y95A 3P5KA 4LFIA 3T9IA 1YI4A 3AGMA 3RK9A 4PTCA 3Q9ZA 2P33A 3UE4A 4B99A 3LLTA 4CV8A 4GYGA 3R71A 5IA5A 5ICPA 3PPKA 4FKQA 3ZLXA 1YKRA 4M15A 2JGZA 5A4LA 3OCSA 2W5HA 3V5TA 4V01A 2GSFA 2PE1A 4KA3A 5D41A 4WNPA 4BYJA 3Q5IA 4E4XA 4FKRA 5HTIA 5FDXA 3BWJA 3ULIA 4BCQA 3V3VA 2VAGA 2WNTA 4M8TA 4FNZA 4Y8DA 5ETFA 2Y4IB 1K9AA 5FEDA 3RCJA 4DN5A 4F9YA 5JFWA 5HESA 3S2PA 4Z7HA 1SVGA 2OW3A 2PVRA 3COHA 2R3KA 5AV2A 3KXNA 2XB7A 3RAIA 5J5TA 1W8CA 1CMKE 2BIYA 3TUDA 3BEGA 2XBJA 2FB8A 5HEZA 3LPBA 5HE3A 1WVYA 2B9HA 4IJ9A 2QO9A 1V0PA 4FL1A 4FT9A 1JKTA 1TKIA 3PFQA 4BWKA 3AQVA 2C0IA 4V05A 3I0OA 1U4DA 1Z57A 2WQEA 3QLFA 3FI2A 4FTLA 4U79A 3VW6A 5GJFA 5F9EA 4KBAA 5E91A 3QXPA 3GC7A 4IVDA 4R5YA 1JNKA 4AW2A 3C4WA 4HVIA 4Q5EA 4GRBA 3KXHA 3VS0A 4RC2A 2NP8A 3V8TA 2C0OA 5TKDA 4EQMA 4M69B 1Y91A 3ZH8A 4F6WA 5FG8A 3CXWA 4XLIA 2C5VA 3EQRA 2XIZA 4L45A 4PNKA 4WG3A 2ZV9A 2BZHB 5KHXA 4UX9A 4YUQA 2F7ZE 4ANOA 4IW0A 4EONA 2P0CA 4Q9SA 3FI4A 3GCQA 4EL9A 2WB8A 3R9DA 1Q8ZA 4O0SA 4Q2AA 5E8SA 3U9NA 5A4CA 3CR0A 1BL6A 2CN8A 2WTJA 1REJA 3GU5A 1R1WA 4C57A 1M2QA 4GU6A 5J79A 3LVPA 4UB7A 1AGWA 5JH6A 1O6YA 1FGIA 3ZUTA 2QVSE 2XJ0A 4FV4A 2OJFE 3MY5A 3QBNA 3R8MA 3UIUA 5IH4A 2WMRA 2YABA 1Q5KA 1STCE 5L6WL 3EN7A 2BUJA 2RIOA 4FL2A 3QTIA 3G51A 4X3FB 1OKVA 2ITXA 3OCGA 2G2HA 3U6IA 4PMTA 4IZ7A 2EXCX 3LJ0A 3O7LD 4X2JA 5EHYA 3POOA 3ZEWA 1T45A 2XYNA 1Q8UA 1YXXA 2VD5A 3ERKA 3KMWA 4FKOA 4QTDA 3ZMMA 4CCBA 5BVOA 4FV5A 5JSMA 3V6SA 5FXRA 4FOCA 1ZLTA 3OEZA 5KKRB 4R3RA 4B4LA 4OR5A 1ZARA 1L3RE 2VTMA 2W06A 1KE6A 4ZSEA 1TQPA 2C4GA 3PWYA 4ZAUA 3GC9A 5EG3A 5I9UA 4RRVA 5E1EA 1O6KA 2HIWA 4KB8A 4ZSLA 3EYGA 4CEGA 3PVBA 4O0TA 3R8ZA 4I6HA 2OF2A 3QZHA 3KVWA 3W32A 5EYMA 5HNGA 5HVYA 2RFNA 3WE8A 2PVLA 3FUPA 4V0GA 3D14A 5HGIA 1YDRE 2GTMA 3BBWA 4RG0A 3P7AA 2W1DA 5CAVA 3KRRA 4R1YA 3W8QA 3TXOA 4D4SA 4K18A 4RVLA 4X2FA 3O2MA 3SRVB 5CT7A 5HO6A 5KX8A 2ITQA 5ETIA 2BCJA 4YJUA 4U81A 3VULA 1KE8A 4BDAA 4EUTA 4I5PA 5G6VA 2CGUA 3ORMA 3F88A 2WZJA 3HLLA 3KVXA 4AZVA 1JVPP 4QD6A 4RJ4A 4RJ5A 1ATPE 3P7CA 3DKCA 3QUPA 4YJRA 4DH7A 1FVVA 4YJPA 4J53A 3A99A 1XJDA 2WXVA 3ANQA 3DZQA 2BRHA 1U5RA 3V8SA 5K5NA 3U4UA 3FMHA 3COKA 2WQNA 4MD7E 4DHFA 3OBGA 2XNEA 3BZ3A 1VYZA 4CD0A 1OKYA 3QUDA 2XKEA 3NYOA 5J95A 1VZOA 4QPMA 2CLXA 3R1SA 3Q9WA 4RGJA 2HW6A 4YJNA 5I9XA 3C13A 3VBYA 2XIKA 3BKBA 3PG1A 3KMUA 4KIKB 2QOFA 5D1JA 4EC9A 4RX7A 2Z7QA 3TIZA 4AGDA 3NUSA 3QD2B 3VUHA 4ACDA 2RG6A 3TWJA 3H3CA 2E9NA 3QRUA 3RINA 4C3FA 4AGCA 2C6TA 3FQSA 3EQGA 5DBXA 3DAEA 4J71A 3WILA 4C7TA 3ZSIA 3S3IA 5LQFA 2A4LA 4JVGA 2F7EE 5KCVA 3BHUA 4B0GA 3MFUA 5B2MA 2VX1A 1ZXEA 5HO7A 4C2WA 5AADA 3RP9A 1ZYSA 2EXEA 4XP3A 3VVHA 3EZVA 2XNPA 1ZRZA 4XV2A 4JDKA 4AOJA 3GCSA 3Q9YA 3WF7A 4YU2A 3A7GA 1PMNA 4YO6A 4C62A 3CTHA 4C36A 5FM3A 4EK8A 2R3LA 3AC8A 5CALA 4FT7A 4AFJA 3PXQA 3BU5A 4XG2A 2CGVA 3NCZA 4AW0A 1KE7A 5J9ZA 3PXFA 2XIYA 1YOJA 5IKWA 4ASXA 2YEXA 3BGZA 2DS1A 4DGOA 3I1AA 3LJ2A 3OWPA 2YACA 3GT8A 2DUVA 2WKMA 4RWKA 2QO2A 3OZ6A 4ZSJA 2C1BA 2BDFA 3QRJA 3DBQA 3QUEA 4IFGA 5ANEA 2OJJA 5DR2A 3I4BA 4NM5A 3TL8A 4J1RA 2HCKA 2ZMCA 3F7WA 4M12A 5HQ0A 1Q8WA 3F3VA 2QHNA 4QTEA 2BIKB 4AOIA 3SD0A 1JAMA 1B38A 3QTSA 4ZTQA 4KBKA 3ZZWA 2C1AA 3BU3A 3HMMA 5TR6A 1J3HA 4D4VA 4CLJA 2CLQA 4O2ZA 4PNIA 4PTGA 3GOPA 4O6EA 2YJRA 4IHPA 1UU7A 5ANJA 3VIDA 1PHKA 4KS8A 2J6MA 2RKUA 3HL7A 2OH4A 3RKBA 5EOLA 4FKIA 5AP6A 5LVOA 3LCKA 4IVCA 4C38A 2BRNA 3TNQB 3P08A 4UXQA 3EMGA 2QO7A 5FP6A 4L46A 3QLGA 1YOMA 3FMJA 2B54A 5CAQA 3IGOA 5L6PA 4L6QA 3UZTA 5A4EA 4Y83A 4AF3A 5ANIA 4JRNA 4IDTA 2VTJA 4L00A 3VBQA 4U44A 4BCJA 5GZ8A 3QL8A 4FTCA 3G9LX 4J8MA 5LCKA 5TE0A 5E8UA 4E5WA 4FZ6A 4ALWA 3EN4A 5A4QA 2VTSA 4YMJA 2X8EA 2P2IA 3D7ZA 4QMYA 4PRJA 3RMFA 3CY2A 2YDIA 1OKZA 3GGFA 5T6KA 3BIZA 4D2VA 1M52A 1GOLA 4HJOA 3RBWA 2B53A 1OZ1A 1GZNA 2CHLA 4ZLOA 2HZ0A 4R8QA 3MIYA 2ZDTA 3PVGA 4JBOA 3WOWA 3D4QA 3DGKA 3EHAA 3QRTA 1A9UA 4J98A 3QZFA 1XH6A 4BIEA 1IA8A 3MY0A 4CZTA 2OSCA 2YM5A 3JY0A 4RIOA 5JKGA 3PVWA 2R3RA 5CYIA 4BGHA 1KOAA 2QC6A 2W1IA 1ZMWA 2OGVA 2ZM4A 1KOBA 4O1PA 2E9PA 5KBQA 3FZRA 4TWPA 3SLSA 1GZ8A 4QP8A 2YAAA 4WIHA 4ASDA 5IPJA 2UUEA 3W16A 3W2OA 4GUEA 1BKXA 3MVJA 4BCGA 4JBPA 3TTJA 5JGBA 4KBCA 3FLQA 2ZAZA 1R39A 3AMAA 3NGAA 3LXLA 2GTNA 1ERKA 2UZNA 3B2WA 3IDBA 1M14A 4AZEA 3Q6UA 4PUZA 4B9DA 1DS5A 4O0RA 3OY3A 2VU3A 4FTKA 4NFNA 4XEYA 5AP1A 4AW1A 3MPAA 3SXFA 2X9EA 3OTVA 2JITA 4LUDA 5FTOA 2X1NA 3KK8A 2R3NA 4RVKA 2XH5A 3UO4A 1H0WA 3VJNA 3Q4TA 3UNKA 3P4KA 4G6NA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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