4PPA | Genus

Total Genus 69

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	69
sequence length	264
structure length	239
Chain Sequence	SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	69
structure length	239
sequence length	264
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-02-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ppaA00

1PMUA 4C4JA 5LXMA 3PSBA 4YZ9A 5A14A 1UNGA 5CSPA 3ZO1A 4S2ZA 2C6KA 1ZOEA 4OBQA 2YCRA 1OIYA 2R4BA 5D1JA 3KRWA 3VBXA 3NCGA 5JFSA 1BL6A 4BHNA 3OEFX 3Q4TA 3G90X 2GNJA 2XNGA 4GUEA 3PXFA 4QYGA 4FK3A 4ZEGA 1OL7A 2E9VA 1PMEA 2J0LA 2OFUA 2B53A 5AUWA 3AT2A 2VX1A 2RG6A 3MH0A 2YIQA 4LL5A 3Q52A 4NJ3A 3S1HA 4WIHA 3FI4A 3W2PA 3W8LA 3CC6A 3WF8A 4X3FB 2YDKA 4ERWA 1BI8A 3FKNA 3P7AA 1W84A 4H36A 3QQGA 2UZUE 5ETAA 2X81A 5HVYA 1XH5A 3ZLXA 3SVVA 4P2KA 5DEYA 3I79A 3LLTA 5J5TA 1WBSA 3A8WA 3BBTB 1ERKA 3CJFA 3QXPA 4L45A 5FP5A 4KIOA 3RCDA 3V8WA 1UVRA 4A9UA 4EOLA 1JKLA 3K3IA 1HCKA 4IW0A 4UMUA 3RK5A 4G34A 3C4EA 4A07A 4Z3VA 3IOKA 5EYMA 1AGWA 2QLUA 3PE1A 5D12A 1ZY4A 2C6DA 2YIWA 3TACA 4Z7GA 4LUEA 4IC7A 3ZUTA 4D0WA 3ZONA 2E9PA 4LMNA 4O27B 5JT2A 4S31A 4AZEA 4ZY4A 4C62A 3IW4A 4FVRA 1RW8A 2YM6A 2V7OA 3DJ7A 3CKWA 1URWA 4K2RA 2OZAB 3UZPA 2I0EA 3MVMA 4DITA 2F4JA 3BWJA 5AIKA 3O8PA 5KE0A 1YHVA 3R6XA 3VS5A 3V5WA 4Y85A 1ZZLA 3OT3A 3DBFA 3ZMMA 3R2BA 2I0VA 1GZOA 4AXAA 4BDEA 4NTTA 3KQ7A 3D94A 2ITZA 3FXWA 1XH8A 4IAZA 4JR7A 2F49A 2GNFA 3L9MA 4FZFB 1E1XA 4W8DA 4DYMA 4PMSA 3LAUA 4CT2A 4JAJA 5KMIA 5BNJA 1PXMA 2OXDA 2C3KA 2PVKA 2C3JA 3FY2A 2WOUA 4EWQA 3E7VA 1UU9A 3KB7A 2UZWE 2Z7QA 4XG7A 4FIEA 1WAKA 3KMMA 4BCHA 1PXNA 4GEOA 4QYEA 4NU1A 2C5YA 3EYHA 3FBVA 4EOOA 3FMHA 4DG3E 4XNEA 4X0MA 1YI6A 3PA4A 2W0JA 3AGMA 4ZTNA 1XBAA 3CCNA 3R1NA 4GJ3A 4HYUA 4IX5A 4QPAA 4RIYA 3RNYA 2W4JA 1WBTA 4D4VA 3QRKA 2WMSA 4D28A 2BR1A 3VW8A 5J9ZA 3H4JA 5G1XA 1YXVA 5M4FA 2ITQA 4N4SA 4ANLA 5L2WA 1EH4A 3LXNA 4W4WA 1DM2A 3QLFA 3R9OA 3WYXA 1WBOA 3F61A 4F9YA 2X39A 4U43A 2PMLX 3VUHA 2BRBA 3QCSA 5CEPA 1KE8A 3R28A 1I44A 5CEKA 3F7WA 3BU6A 3OHTA 3D5UA 3L8PA 2F57A 3DB6A 4HVIA 3S00A 4FF8A 2C47A 3IG7A 4FTJA 4DGOA 4WG3A 4ZJVA 4QRCA 4MD7E 2VTRA 4E4LA 2OIBA 1OMWA 4PX6A 1JBPE 4JQ7A 4YZDA 2FYSA 5A4TA 2A27A 3MB7A 4GJ2A 2ITXA 2XRWA 2IW9A 4A7CA 4DFZE 5LOHA 3JVRA 4E4XA 4QQCA 4O2PA 4TYIA 1JQHA 2XJ1A 2YCFA 4YZBA 4YSJA 4EH2A 3VUIA 5KHXA 4YPSA 4QMUA 1CKPA 4EH9A 3P7BA 3ZBFA 3CQUA 3KN5A 5H2UA 1BMKA 4F70A 2YACA 4YURA 4D2TA 5CALA 4I6FA 3BYVA 3A7GA 4IZAA 4IWPA 4C34A 4S34A 4O1OA 5EW3A 3AXWA 2YAKA 3PXKA 5AUYA 2QU5A 5AUXA 1J91A 2ITUA 4BCQA 2IVSA 3LFBA 2WMTA 4F09A 4ZAUA 2P4IA 4I6BA 4IX4A 3FL5A 4UBAA 4RVTA 1GJOA 4XCUA 4XV9A 2C3LA 2G1TA 4DLIA 3BHYA 1XH9A 3DXNA 5AUVA 5CZIA 3A7JA 4FKQA 3WF9A 4WRGA 4FZ7A 3D4QA 4E4MA 3C5UA 1XHAA 3OMVA 4OTWA 4IVBA 3V5PA 3RM6A 2QOIA 3K54A 3HUBA 4D2SA 4XHKB 5GJGA 2JIIA 3C0GA 3W32A 4C37A 4ZTMA 4ZZOA 1ZLTA 4I6HA 5CX9A 1RQQA 4D1XA 4F1MA 1GZKA 2ETRA 3QL8A 2GMXA 2HZ0A 2RIOA 3DTWA 2FSTX 3AQVA 3PSCA 5F95A 3P1AA 1GIJA 1Y57A 3BV3A 3MGYA 2HOGA 4FV2A 4Y46A 4BWPA 3MY1A 5I9ZA 2FUMA 4EK8A 4FG7A 1APME 1U59A 2JITA 5BVOA 4HYSA 4X2JA 2FSLX 4BCIA 5J95A 3HMPA 4FIIA 4TNBA 1RJBA 2C6LA 4V01A 1AD5A 5AV4A 2Y4IB 4IEBA 1OPLA 1ZOGA 4OUCA 5CEQA 4LMUA 1XH6A 4QMTA 2J0MB 1BUHA 4RJ3A 3QTUA 4U8ZA 3FE3A 3KK8A 4HOKA 4O0TA 4TYHB 1WVXA 3PXRA 2B9FA 4C61A 5JGBA 4FTLA 5HX6A 3EIDA 1PF8A 1JPAA 4RX5A 4YC8A 3QRJA 3R8MA 2W96B 3PJ1A 1BKXA 2CCHA 3R30A 4U45A 4G6LA 5IA4A 4M69A 3MA6A 3V6RA 3CGFA 1FGIA 4FTAA 2C3IB 4PMPA 1JSTA 4BGGA 3HV3A 3WE4A 3KKVA 4Y8DA 5IF1A 5EDPA 2R3HA 5I3RA 4AT3A 3I7BA 2R3GA 4RG0A 1U54A 3AMYA 1RDQE 3VJNA 5DT3A 1BL7A 3RAIA 4FSTA 4F4PA 3C4ZA 1B6CB 5H3QA 3UC4A 3VUDA 4AP7A 4QP3A 2X9FA 5DNRA 5DWRA 4YU2A 3F5UA 4BI0A 5BMSA 3KRJA 2ZVAA 2R2PA 4LUDA 3VNTA 1OI9A 2R3RA 3VO3A 3WI6A 1CM8A 1OKZA 4JRVA 4GU6A 1M17A 3RHKA 5JEBA 2C5VA 2VTTA 5DRBA 4BC6A 3UOKA 2WEVA 4C4FA 3FMJA 2BAJA 5M55A 3F2NA 2F7EE 3I0OA 3ORNA 4G9RA 5EDRA 1QCFA 3DBDA 4QQ5A 3TZ7A 4NUSA 2G2FA 2E2BA 3PY0A 5GJDA 3U87A 4YSMA 2O2UA 3UG2A 1OZ1A 3ORPA 2HELA 3HL7A 4EH3A 2VO6A 4JXFA 4WKQA 4UN0C 2UW3A 3ZXTA 1H1PA 3QZGA 5FEQA 2PZ5A 3AT3A 5E8UA 4DH7A 2X6EA 4YJRA 3WF6A 2PVRA 3C7QA 3AC1A 3CTJA 4JAIA 4MBIA 3U9NA 4DEHA 2B4SB 3Q9WA 4J98A 4L67A 1VYWA 2C69A 3PUPA 4PL3A 2EXCX 4B9DA 4EKKA 3ZSGA 2XEZA 2XF0A 5FM3A 4YJUA 5J1WA 1M52A 4OTPA 3Q4ZA 4AN3A 5CAUA 2B9HA 4Y83A 3SQQA 4MXCA 4E5BA 3TV4A 2EB2A 5EG3A 3DOGA 5BVFA 2AC3A 3BIZA 3FPQA 2Y8OA 4YJOA 5LVPA 4KD1A 5AUTA 4HGTA 4LI5A 3DK6A 3UVQA 3L8VA 2OBJA 3VJOA 4A4OA 5L3AA 5G6VA 3FJQE 4O38A 3QLGA 4UXLA 4I93A 2Y9QA 2X8DA 3EN9A 5AM7A 3R7GA 3DFAA 3QGYA 3R1SA 4TWOA 3MBLA 4E8AA 4TTHB 5HG5A 2OWBA 4EH8A 4HVDA 4HNFA 3W1FA 3TL8A 5HO8A 3SA0A 4JBVA 3I60A 4TYJA 5HD7A 4ENXA 2UZBA 4QMXA 3R9NA 2R3OA 5K9IA 3QHRA 1ATPE 3FZRA 3L9NA 4AGCA 1G3NA 4JL9A 4FV9A 4PPAA 5IUHA 1PKGA 4R3RA 5CAVA 3PVGA 4M7IA 5T3QA 4APCA 1WBWA 3C4WA 4C36A 4HGSA 3CP9A 4EQUA 4ZIMA 2J90A 3EL7A 5L2SA 5HG8A 3GFEA 1W0XC 3EQDA 4I92A 1YHSA 3R7VA 5AADA 5KKRC 3SD0A 4EK3A 5I9XA 4D5HA 2RFSA 1H07A 2PHKA 2CGWA 1W82A 3BE9A 3QYWA 4IB1A 4K9YA 5AP4A 5FTOA 5B2KA 3UIMA 2X4FA 3CJGA 3FUPA 2OSCA 2VTAA 5EYKA 4BB4A 2F2UA 2Z2WA 4XRLA 4CFVA 4PL4A 5EDQA 4O0WA 4O91A 4ANBA 5CU3A 2WPAA 3QCXA 4YTIA 3FLWA 4FIFA 5B7VA 4KINA 4QMVA 2ZV2A 3U9CA 1XO2B 5JZNA 3TZ9A 4G6NA 2HZNA 3VQHA 3GVUA 5CENA 3OW4A 2B9IA 2VTQA 4R1YA 3UMXA 3ZZWA 2UW0A 1OL5A 4IM0A 4M0YA 4OGRA 3E87A 1LPUA 2GQGA 3UGCA 2PMIA 5EKOA 4QNAA 5FXQA 1NVRA 3Q9YA 4IAYA 3TCPA 4C0TA 3D5XA 1Q5KA 5HO6A 4CZTA 2XVDA 2QHNA 3BYMA 4UWBA 4DH3A 4MXXA 4D2VA 4CKJA 1MRVA 5EHLA 1IRKA 2QONA 3OEZA 2JDSA 4OTHA 5EM5A 3RAKA 3WZUA 3E7OA 5FTQA 4QP6A 5IISA 3E63A 3KULB 1H08A 1I09A 4LV5A 5CVGA 4RIWB 4D58A 3E88A 5CSHA 5BYZA 3VS6A 2JC6A 3H10A 3QRUA 4FK6A 2LAVA 3TZMA 4AOIA 2IZTA 4RJ8A 3RZBA 4D9TA 3AMBA 3EQIA 3UIXA 5CSVA 1Y6AA 3QA0A 2CCIA 1UA2A 3QKKA 2GTMA 4KB8A 4D2WA 4KBKA 3MH3A 1PW2A 3BX5A 4M84A 2V62A 4OAVB 1J1CA 4ZSJA 5L8KA 5HE1A 2IZRA 2X7GA 4GT3A 5HO7A 5E8YA 4QP1A 4CMOA 3MV5A 1KOAA 4CMUA 4C4GA 5LVOA 3UO6A 4B8MA 5EI2A 3UOHA 3O0GA 3KMUA 1TKIA 2XCHA 5D7AA 1XKKA 2R3LA 2R9SA 3ODYX 3FI2A 3Q32A 4TYEA 3ALNA 4AZFA 2GNIA 4GRBA 2QKWB 3QTZA 4EOJA 4BDGA 2W1IA 4AFEA 1BLXA 1KV2A 4X2KA 1Y6BA 4TWCA 3G51A 4RA4A 4FTCA 5HTIA 4FI1A 5BX0A 1OGUA 3P4KA 4FR4A 2FSMX 3W8QA 4GIHA 1OIRA 4RJ4A 1A06A 5HHWA 2X2MA 3MTLA 4J71A 1UWJA 4K1BA 1WBNA 1TQMA 2W1ZA 2CGVA 4U3ZA 1KOBA 2QVSE 3GBZA 4EUTA 3DAKA 5AV0A 2ITPA 4IQ6A 4EI4A 4CCUA 3HV5A 4XG9A 3UIUA 1H1WA 2FB8A 4M13A 5KMLA 3RBWA 2EWAA 3DAEA 2BUJA 4JIKA 3LCDA 1Z5MA 5HG9A 2A0CX 3Q60A 3QGWA 5HNGA 3MJ2A 3PVWA 2JDVA 4WRSA 5CASA 3FYKX 4FKRA 3R2YA 3CIKA 4D0XA 4RBLA 5H8GA 4C4EA 4B8LA 4CT1A 1VJYA 4PNIA 3KMWA 5HEZA 4AQCA 3NS9A 4K11A 2JKQA 4KIKA 5DG5A 3GP0A 4QMWA 3T8OA 3TI1A 5K5XA 2XNPA 4J95A 4FIGA 5CTPA 1PYEA 2IWIA 4TY1A 5DI1A 2WMBA 4XP2A 4IMYA 5DR2A 3DK7A 5DLSA 4K33A 3DLSA 2VV9A 4FKJA 4G17A 2VWVA 3F3ZA 5CU2A 3VRYA 1T45A 2CSNA 2W1CA 3BBWA 4FKPA 3CS9A 4YJTA 2C6IA 2IVTA 1SVEA 5IH6A 3F3WA 3ITZA 4U44A 2XKDA 4TN6A 4QMZA 1ZMUA 1V0BA 1VEBA 3FQHA 4W8EA 3FZTA 2VGPA 4L7SA 4ANQA 2BFXA 5BVEA 3LCKA 3CY2A 3FMLA 4E5AX 3VULA 3VUTA 3IO7A 4NH1A 4X3FA 4CTCA 4BZOA 2BFYA 3TKIA 4IIRA 3C0HA 5CANA 3VBTA 3R8PA 4YP8A 3UO5A 3V8SA 2YDIA 4O6LA 1S9IA 4ID7A 1SNUA 1XQZA 2F9GA 1PY5A 4GK2A 2BZIB 2CN5A 3L1SA 2EXEA 4I23A 4R5YA 4QNYA 3DDPA 4ZSLA 4EHGA 5A6OA 4BF2A 3JS2A 4RJ7A 5K0XA 2ZM3A 2X7OA 4G3DA 3HA6A 3QQUA 2XK4A 3EQBA 2WTIA 1PYXA 4YNOA 5EYDA 2W06A 3I81A 3PRIA 2ITVA 3NLBA 1PMNA 1OUYA 4II5A 4RC3A 4QD6A 4IBMA 4R6VA 2PVMA 4DEEA 4PNKA 4ZS0A 2OJ9A 3QQFA 4N6ZA 4BCMA 4I4FA 1UWHA 3GOKA 1GY3A 2OIQA 3EOCA 4LRMA 4YJVA 4X3FC 4P90A 5IH4A 4AF3A 2JD5A 5KMJA 1GZ8A 4QP2A 2XEYA 2OZAA 4FT9A 4FT5A 4LL0A 3H9FA 3N51A 5CQUA 2QG5A 2P3GX 5AWMA 5HCZA 4MYGA 5M57A 3MYGA 2C6MA 3RI1A 3VBVA 1W8CA 2H6DA 4KAOA 5IZFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PPAA

Total Genus

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