4PPBA

Itk kinase domain with compound 28 (n-{1-[(1s)-3-(dimethylamino)-1-phenylpropyl]-1h-pyrazol-4-yl}-6-(1h-pyrazol-4-yl)-1h-indazole-3-carboxamide)
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
264
structure length
239
Chain Sequence
SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 239
sequence length 264
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ppbA00
4O2ZA 5BQ0A 4TYHA 4K1BA 2WMSA 2YCQA 3V5PA 3P0MA 2CGWA 5AJQA 4LMNA 2PZPA 2VUWA 4F70A 1J1CA 4W4WA 2BROA 3RM6A 2IVVA 3LVPA 2W7XA 3GU6A 5CAPA 1FVVA 1SYKA 4O1PA 3VWAA 1MQ4A 3O8TA 3LLTA 2UW5A 4QTCA 3TKHA 5EFQA 1OIQA 3I60A 2OJJA 2PK9A 5KMNA 2C1BA 3SHEA 4MD9E 5F95A 4Y83A 3EN7A 3NYXA 4FTIA 4QD6A 3VS3A 4FICA 3R83A 3R8MA 3GU7A 4X3FB 1WBTA 2JBPA 3AXWA 4BBFA 3FJQE 4OW8A 5F9EA 3WZUA 4M8TA 4RFYA 2EB3A 4FV6A 3WZJA 1XBAA 3LCTA 3O8UA 5BUJA 1YHWA 2HENA 4WRSA 5IDNA 5JFWA 2WNTA 3TI1A 3LE6A 3WILA 3FYJX 3MDYA 2J0JA 3QLFA 4KRCA 4ZJIA 5TKDA 5J7BA 4XG9A 5J5SA 3BQRA 3C13A 1JSUA 3OBJA 4IC8A 4R3PA 5CEIA 3VUDA 4HCVA 1W98A 1M14A 5L2WA 2VO0A 1QMZA 4YU2A 3ZRLA 3IS5A 2J0LA 4RFZA 3R7OA 2VV9A 4M3QA 2RKUA 4RZWA 3IQ7A 5K5XA 3RK9A 3ZUTA 4BWPA 4BDHA 3WF9A 5A4CA 4YR8A 3HRFA 4ZK5A 2O64A 4ZTLA 4F0IA 4EWHA 1YKRA 1OITA 3TWJA 2DUVA 4EZ7A 1LPUA 2XP2A 2VTLA 4A9TA 1P4FA 4D0XA 2ITWA 1F5QA 4ZEGA 3TIYA 4EHEA 2XNPA 2JIIA 4W8EA 4PV0A 5FM3A 4X2KA 5AV2A 5KX8A 2PUUA 4D2SA 1Q8YA 1Z5MA 2PMNX 3KK9A 4V01A 3IO7A 1ZRZA 5LCKA 4LYNA 4I0RA 1H24A 3G6HA 3R28A 4DG3E 3QALE 5FTQA 4CT2A 4ENYA 4C4HA 2W1FA 4YHTA 1M7NA 3P7CA 3N9XA 4MXAA 3QYWA 3NWWA 1E1VA 3COMA 4ZTNA 3SXSA 2ITVA 3GC8A 5EHLA 4EQCA 1KSWA 4YZDA 3VRYA 4FYOA 4L3LA 4JG7A 2RIOA 3O7LB 4G5PA 4S33A 4BCKA 1P5EA 4KIKA 4MXZA 4B9DA 4CMOA 5HICA 4BDAA 2VO3A 2Y6MA 4MF0A 3NYVA 4FTAA 4TRLA 1YWVA 4FTKA 3HLLA 3NUNA 3OMVA 2RFEA 1JLUE 3FMEA 3D7TB 4FTQA 4W9XA 4R3CA 2HAKA 5JGBA 3QCQA 1H25A 2IVUA 2C5OA 2NRYA 3R2YA 4G3FA 2XNGA 3EH9A 3OVVA 4J96A 4XV3A 1ZYJA 4EK4A 3NNXA 2REIA 5EM5A 1WBOA 4YNEA 3ODZX 1PMVA 4MXXA 1Q41A 2PMLX 3MA6A 1RDQE 2IW6A 4AX8A 4F99A 4YTFA 4QYYA 2YM6A 2AUHA 4G5JA 2EXEA 2UZEA 2J90A 2UVXA 1DI9A 3FLZA 3NIEA 3W10A 5EDQA 3QZHA 2VTRA 3UODA 2XKEA 3MSSA 4EH9A 2W17A 5AEPA 1UKIA 1BX6A 2XNEA 3ZDUA 3CY2A 4I3ZA 3WOWA 3GC9A 2ETKA 3LAUA 4BCHA 2R64A 3GUBA 3RALA 4FL2A 1VYZA 4X3FC 3HZTA 3G51A 4YO6A 5AUYA 4LRJA 4YLKA 4QQ5A 4E6DA 4BKYA 5KKRB 3QTQA 4OTWA 2W1EA 3BPRA 2VZ6A 4FV1A 4O0UA 4PL5A 1YDRE 4O38A 5LMKC 4OLIA 3DFCB 4FR4A 4GL9A 3BWFA 3RZBA 4PPCA 4IZ5A 1GY3A 3LFAA 3DK7A 5FTOA 5LQFA 5IDPA 3PVWA 4QMZA 4NW5A 2CLQA 3R02A 5HBJA 1B39A 2OU7A 2IVSA 3LXPA 3VW8A 3MVHA 1ZWSA 4O96A 2Z8CA 4FV7A 4S31A 5CT0A 5HCXA 2VO7A 1BL6A 3DKCA 2UW3A 4AW0A 3EB0A 5J8IA 3D5UA 4EH4A 4E6AA 5HORA 3BKBA 4ZIMA 3V5JA 2H6DA 2OG8A 2UZTA 4O22A 5HX6A 2ZM4A 5FEEA 4EBWA 2WTKB 1XH6A 3Q6UA 3D83A 1HOWA 4QMYA 1K3AA 2VTTA 2R3GA 4X2GA 3LFFA 3C7QA 5D41A 3UVRA 3UQGA 2BZJA 3TV4A 4GK2A 2GNFA 5M4IA 4I6FA 3QUPA 4FVQA 3FE3A 4HW7A 1OGUA 2QVSE 4D2PA 1DAWA 2V55A 4EQMA 5I3RA 3LCKA 3ZFYA 4QMUA 2ERKA 2VTNA 1TQMA 2WU7A 3JY9A 4YZMA 4R7HA 4BGQA 4PRJA 2X2KA 2XK3A 4OT6A 3HDNA 5ETCA 3M1SA 4C0TA 3QXOA 4F9CA 4V0GA 5IEXA 2I1MA 1SMHA 2WQEA 5L6OA 2H8HA 3BI6A 3TL8A 2PZRA 3OUKA 1Q3DA 4NJDA 3EQGA 3QQKA 4X0MA 3DBQA 4APCA 5IH6A 2ZV9A 4G3CA 5J79A 5CEKA 1O6KA 4EHVA 4GFGA 2P0CA 3QD4A 4L9IA 4YO4A 3ANQA 3P79A 1H0WA 4AGDA 1A06A 4AOJA 3QF9A 2B54A 4XLIA 4C2WA 5JGDA 5JZJA 3IGGA 2QU6A 3DQWA 4GH2A 4R1YA 2PZ5A 3VN9A 5KMOA 4NCTC 2IO6A 3KF4A 3P78A 1Q4LA 2X8IA 3BBTB 1Z9XA 5M4UA 4EOLA 4MBIA 1XBCA 1H4LA 2VWIA 2XJ2A 4RG0A 5M55A 4AT3A 1OKVA 5CI6A 4L7SA 3TV6A 2J0MB 3BELA 4BICA 4TWPA 4TWOA 4BDDA 1DS5A 2ZYBA 1BMKA 2ZJWA 2PVMA 4MXCA 5HO6A 4DITA 4Z9LA 5DA3A 3PJCA 4G31A 3IKAA 3V5TA 3QCYA 4GSBA 1YI6A 3MY0A 2VGOA 3CQUA 3NS9A 4I23A 3NEWA 1CKIA 1WCCA 2BZKB 3QKMA 2X4FA 5HE2A 3LM0A 2ITUA 3LJ2A 3RTPA 3PA4A 3BEGA 3QA0A 4IE9A 4WRGA 1T45A 5IA5A 4C4EA 3HYHA 2XYNA 1OUYA 4NWMA 2XKCA 4XMOA 3WE8A 4BDIA 3NGAA 4DH3A 3TJDA 2C6IA 4PNIA 4BWXA 4FSUA 4CXAA 2XS0A 4CFVA 5B2MA 2QCSA 5AMNA 1RQQA 2P4IA 4Y5QA 3C4EA 3TG1A 3KMWA 5AAEA 3C4WA 4FC0A 3OCSA 3R9NA 2A2AA 2DWBA 3BYVA 4QPAA 5FXQA 1Q24A 3OZ6A 4OBOA 4PQNA 3C9WA 2YLFA 3CJFA 1PKGA 3H30A 4Y85A 5B2KA 5HQ0A 3UP7A 1YW2A 2QONA 3P4KA 1M2RA 4GS6A 1PMUA 4KIPA 2WTKC 4NTSA 4NK9A 1I44A 5AV4A 5LCJA 3REPA 1R1WA 5A6NA 1FINA 3NR9A 3QC9A 4E20A 2R0UA 3HDMA 3RZFA 1PXMA 3BE2A 4L7FA 4M84A 5D7AA 3EJ1A 2JKMA 3OXTA 4MWHA 5T68A 3WI6A 2KTYA 4RFMA 2UW0A 4RVKA 3OY1A 4YC3A 4LOPA 5LJJA 2ZDUA 4MAOA 5HLPA 3DNEA 3TZ9A 3UJGA 3AMBA 3UC4A 4BHNA 3PJ1A 3PWYA 2OWBA 4FKPA 4KS8A 4TT7A 3UG2A 4J98A 3Q2MA 3K5VA 5DHJA 3KMUA 3OOGA 4ZSGA 1P4OA 5J1WA 4RJ3A 3PA3A 3R04A 4G3EA 4LL5A 4AN3A 4ASDA 4E3CA 1L3RE 4ZSLA 1MUOA 3QRJA 4JDHA 4KBKA 4F08A 5CNOA 4Z16A 4LRKA 4A4OA 1KE8A 3OUNB 2GNLA 2RG6A 4OTIA 3ZO2A 4IB0A 4OT5A 2PVKA 2Y6OA 3SA0A 3F5XA 3I81A 5KMMA 4D4SA 5CU2A 3VRZA 3UIUA 5JFXA 1ERKA 2GHMA 4ZJJA 2XA4A 2Y4IB 3DZQA 5AWMA 4H3QA 4TYIA 4MQ2A 2YISA 3R8ZA 3Q52A 4C58A 2W96B 5HVJA 3UDBA 1QL6A 4ZTRA 4YJPA 3E5AA 5L3AA 1UNHA 1QPEA 2WXVA 3D5XA 4FKQA 4XX9A 3H4JA 5L2IA 4BCNA 5H3QA 5M4CA 3DA6A 1W84A 3K3JA 3BEAA 3CE3A 2HY81 1FPUA 4FIIA 4I6HA 3T8OA 3O71A 2X6EA 4KIOA 4AQCA 5AV0A 1H0VA 4PNKA 3ACJA 3COHA 4UMUA 3CKXA 4WO5A 4IXPA 2WMRA 4C7TA 3UPZA 3QWJA 3FMKA 3FHRA 3EQHA 5ETIA 5GJFA 2W1ZA 3FZRA 3L8SA 4I0SA 3G9LX 4P5ZA 4QP1A 4WBBB 3EKNA 3VUHA 1EH4A 3SAYA 5JRSA 2FB8A 5LARA 4BTMA 5IUGA 3QC4A 2AYPA 3BHVA 5JRQA 3W2SA 1OIYA 3DKFA 2CCIA 5EI8A 3F6XA 5EH0A 5D10A 5A9UA 4HVIA 3L9PA 3DFAA 2VX0A 3OFMA 4RPVA 2Z7RA 3BLHA 3BU6A 4JBVA 4MCVA 3T9IA 5GZ8A 2BIYA 4C36A 4FIHA 3GCVA 3KMMA 1UA2A 3R9OA 1U54B 3QXPA 1PYXA 3VJOA 2BILB 4FL3A 4Z3VA 1H8FA 3HP2A 1IEPA 3KN6A 3Q9XA 4Q2AA 5AP3A 1OUKA 3LCDA 5E1EA 3L8XA 4J7BA 3R9HA 4Z7HA 4XG4A 4R7IA 5EI2A 3VHEA 2WQOA 3IOPA 1KOBA 1GZNA 4IHPA 4D2RA 4EQUA 2JKKA 3CQEA 4LRMA 2P2IA 2NRUA 3DTWA 3R7YA 1HCKA 3FYKX 4CFWA 2QO7A 4RGJA 2HIWA 3BHUA 3PFQA 4NM7A 4ACDA 2WIPA 2BHHA 1OL6A 4I5HA 3ZMMA 3GXLA 3LFEA 4NM5A 3PJ2A 3E93A 5BVFA 3WZEA 3KULB 3TEIA 2QU5A 3R7UA 4C59A 3V6SA 1FVTA 2V5QA 3OXZA 4D0WA 1M17A 2WQMA 4E93A 2B7AA 1ZYLA 3H0YA 3ZH8A 5CTPA 4FTCA 5CF8A 5C1QB 3W2QA 4Q5HA 3G0EA 5BVKA 5FD2A 2W5BA 1OMWA 4HNIA 4O0WA 3RCDA 2XK4A 3QA8A 5E8XA 3DBCA 2DS1A 5AX3A 4EC9A 3HV6A 3PY1A 2YDIA 4J52A 2B9JA 2Y4IC 3UOLA 3SXRA 3VJNA 3ZDIA 4YC8A 2WD1A 4BGGA 1FQ1B 4PWNA 5AR7A 1FVRA 4DEDA 4IWPA 3GB2A 5BVWA 3QBNA 4I5MA 5EI6A 4BBMA 3E87A 4CFUA 1Y8GA 2WOTA 2HZ0A 2BDWA 3RPVA 4F09A 3D0EA 3ANRA 5GZAA 1ZYDA 3I6UA 3FKLA 4YHFA 3R1NA 3CCNA 2BZHB 4RVLA 5ANGA 2FO0A 3EQBA 2VD5A 4WT6A 2QOFA 3ERKA 4QNAA 4RJ7A 4IWQA 3CR0A 2WTJA 1BYGA 4QP9A 4AGUA 5JT2A 1UV5A 5HNGA 2O3PA 3PJ3A 2YHVA 4B99A 4D9UA 2BFXA 3CPBA 4RWJA 5BPYA 4EC8A 4BDKA 1T46A 4E4MA 4UZDA 4PTCA 5HLWA 5IF1A 2QOCA 5M56A 3DXNA 1VJYA 4HGLA 4WUAA 2YDJA 1BI7A 3DJ7A 5E92A 3W2RA 4BWKA 4EORA 4QQJA 3UNKA 4IVCA 4BZNA 4I5CA 5ITAA 3DAKA 4XJ0A 2VWZA 1G5SA 3GCSA 3GI3A 3ENHA 4FF8A 2J50A 4GT5A 4JAIA 5L8KA 2E9VA 4FIGA 4RJ5A 2PSQA 2BTRA 1UU8A 4K9YA 5D1JA 4FA2A 3QQFA 4EYMA 4CMTA 4XCUA 4A4XA 4EH7A 4NIFB 3EFJA 3IOKA 4CZTA 4C3RA 2C5YA 2GHGA 2YM7A 3ZLXA 4CCUA 4DFXE 1H1SA 5D11A 3W32A 2E9UA 1CDKA 3Q3BA 3ZEPA 4FMQA 2HZNA 3V5LA 5DMZA 4BCFA 2R3LA 4JS8A 3K2LA 5LVLA 3P08A 3NUXA 5EKOA 4EBVA 4MXYA 2XIRA 4QO9A 3E7VA 4RT7A 2YWPA 3BV3A 4CQEA 2BRBA 3G90X 4MQ1A 4M12A 3DLZA 3EQPA 4IVBA 3I7BA 3ZS5A 1H1QA 1K2PA 2RFDA 4UBAA 3I5NA 4IW0A 4L6QA 5CEPA 1KE9A 2C5NA 3F5UA 4P4CA 4LOOA 4WNOA 3Q4UA 2J2IB 3LIJA 4LG4A 3RHXA 3TZ8A 4AZFA 4QTDA 4A7CA 4AGWA 1SVEA 3IG7A 3MJ1A 5KCVA 2OSCA 3QTXA 3MTFA 1PJKA 1PMNA 4PTGA 3MFSA 3KK8A 4GEOA 3RVGA 2Q0NA 4JX7A 4XRJA 4DINA 4A9SA 4CT1A 3PZEA 3FMMA 4BC6A 3H10A 4E5WA 5BYYA 2EUFB 5KMLA 4EOOA 3R8UA 3OTVA 5ICPA 3VBVA 4IM3A 4O0RA 3DBEA 5IEYA 3FSFA 3MYGA 2W1HA 2JAVA 4U43A 4DYMA 3GGFA 4GVAA 3GC7A 4UXQA 2GCDA 2VTIA 4BI1A 4LV8A 1MRYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HA8 A;  4AA5 A;  2OO8 X;  4KSQ A;  3VUG A;  4FIF A;  3TZ7 A;  3DY7 A;  1JSV A;  4FG8 A;  1F3M C;  2QR7 A;  2B9F A;  4ZJV A;  3Q5Z A;  2W4J A;  3ZHP C;  5CU6 A;  1AQ1 A;  2ITQ A;  3CTH A;  2JIT A;  3UVQ A;  3GC0 A;  4A9Y A;  4IFC A;  4FYN A;  3LFS A;  4IX6 A;  4I92 A;  4M7I A;  3UOK A;  2I6L A;  2W4O A;  3D7Z A;  4ALU A;  3AMA A;  3PWD A;  4QYE A;  4FT7 A;  3FLY A;  2XJ0 A;  4G9R A;  4CRS A;  3VF8 A;  4IAZ A;  3R1Q A;  2VRX A;  2Y9Q A;  4L43 A;  1H01 A;  5C8M A;  4W8D A;  3ZBF A;  2CJM A;  2VX3 A;  4JRV A;  1ZY5 A;  4AT4 A;  4IDV A;  3IW5 A;  2FA2 A;  3F3V A;  1VEB A;  2A98 A;  2XH5 A;  3MVJ A;  3FL5 A;  5IUI A;  4CFN A;  1M2P A;  4ZOG A;  3IPH A;  5CF4 A;  4FTM A;  3Q9Z A;  3BWJ A;  3R8L A;  5I0B A;  4YBJ A;  2OI4 X;  4AS0 A;  4FV3 A;  2O5K A;  3COI A;  3HL7 A;  3U51 A;  4H1M A;  2VNY A;  3CGF A;  2OJF E; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2RKU A;  4RZW A;  3IQ7 A;  5K5X A;  3RK9 A;  3ZUT A;  4BWP A;  4BDH A;  3WF9 A;  5A4C A;  4YR8 A;  3HRF A;  4ZK5 A;  2O64 A;  4ZTL A;  4F0I A;  4EWH A;  1YKR A;  1OIT A;  3TWJ A;  2DUV A;  4EZ7 A;  1LPU A;  2XP2 A;  2VTL A;  4A9T A;  1P4F A;  4D0X A;  2ITW A;  1F5Q A;  4ZEG A;  3TIY A;  4EHE A;  2XNP A;  2JII A;  4W8E A;  4PV0 A;  5FM3 A;  4X2K A;  5AV2 A;  5KX8 A;  2PUU A;  4D2S A;  1Q8Y A;  1Z5M A;  2PMN X;  3KK9 A;  4V01 A;  3IO7 A;  1ZRZ A;  5LCK A;  4LYN A;  4I0R A;  1H24 A;  3G6H A;  3R28 A;  4DG3 E;  3QAL E;  5FTQ A;  4CT2 A;  4ENY A;  4C4H A;  2W1F A;  4YHT A;  1M7N A;  3P7C A;  3N9X A;  4MXA A;  3QYW A;  3NWW A;  1E1V A;  3COM A;  4ZTN A;  3SXS A;  2ITV A;  3GC8 A;  5EHL A;  4EQC A;  1KSW A;  4YZD A;  3VRY A;  4FYO A;  4L3L A;  4JG7 A;  2RIO A;  3O7L B;  4G5P A;  4S33 A;  4BCK A;  1P5E A;  4KIK A;  4MXZ A;  4B9D A;  4CMO A;  5HIC A;  4BDA A;  2VO3 A;  2Y6M A;  4MF0 A;  3NYV A;  4FTA A;  4TRL A;  1YWV A;  4FTK A;  3HLL A;  3NUN A;  3OMV A;  2RFE A;  1JLU E;  3FME A;  3D7T B;  4FTQ A; 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