4PPB | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	264
structure length	239
Chain Sequence	SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	67
structure length	239
sequence length	264
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-02-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ppbA00

1DI8A 5I9WA 4EJNA 4KRCA 3WI6A 3GC8A 2HY81 2Y4IC 3DDQA 2UZWE 3BYSA 5E8VA 2EB3A 4UXQA 1MRYA 5IUGA 3QTWA 5L8KA 2C30A 3LM0A 4XYFA 3DA6A 4TKSA 3FMEA 5L2WA 4LFIA 4EZ5A 1OZ1A 3G6GA 4WG4A 5DE2A 5CALA 3V01A 3T3UA 4GCJA 2A1AB 3DKGA 1OPJA 1YXSA 4RZVA 5AP6A 5A4CA 4FNZA 3TUCA 2JIVA 4DEDA 4E8AA 3OTVA 1OL1A 5A46A 5L6PA 2VO7A 4TN6A 3L9PA 5CZHA 2XBJA 3ZLYA 4QPSA 3O8TA 4BF2A 3F3UA 3R1QA 3WYYA 4RC3A 5DLSA 3W2RA 4HYUA 3UMWA 3RM6A 5BNJA 2CCIA 4BDEA 3EL8A 1H1SA 3KMWA 3R2BA 3SX9A 4FTKA 3PPKA 4EH9A 1UV5A 1VEBA 3FY0A 1Z57A 3P08A 1I09A 2VO0A 4BGHA 4L3JA 2HWOA 3MY1A 4JDKA 1Q8YA 4LUDA 4B0GA 3AMBA 4JJRA 5EW9A 2X2MA 2NPQA 2VD5A 4O0SA 4CZTA 3MJ2A 5EM8A 2W1DA 2RG6A 3AC4A 2CSNA 4USFA 4I92A 1OL6A 1J91A 3UNJA 3P23A 4DAWA 3POZA 3ZRMA 4IX5A 3ZXZA 3U8WA 3S2PA 3EQGA 1O6YA 2XNNA 3A60A 3KL8A 4GRBA 1RE8A 4BDDA 3RI1A 3MA3A 2J0JA 4KIQA 3ZLSA 3ZRLA 4ANOA 3FMNA 3VBTA 3E8NA 5T6KA 3R9DA 3CS9A 3CD3A 2AUHA 4MWIA 3ERKA 4PMTA 4X6QC 4C4GA 5B2MA 3BYUA 5ANDA 2YCFA 2FSOX 3DAJA 5EG3A 1FOTA 1IASA 4JL9A 3I5NA 1ZZ2A 3QLFA 4BCMA 5M56A 4F64A 1GZ8A 1NXKA 3CJGA 2R3RA 4UALA 1R0EA 2BKZA 2J0IA 3N9XA 3ZC5A 4EHEA 2BILB 4QTEA 4ZIMA 4NFMA 1V1KA 3A99A 3FDNA 2WTWA 3VQUA 5B7VA 3GUBA 1JAMA 1W8CA 3KKVA 2ACXA 5AUYA 5F4NA 3A8XA 3FAAA 5CX9A 4GIIA 3JS2A 3IS5A 4CMOA 4FV6A 3FI2A 4I5HA 4BYJA 2R2PA 3A7HA 4R1VA 5FEQA 3SC1A 2VAGA 4CVAA 4MF0A 3OOMA 1MQ4A 2ONLC 4I23A 3TKHA 4BICA 1WAKA 3MB6A 2RFDA 3VNTA 3BEGA 3BGQA 3QCQA 2Z7RA 4FL2A 3Q9WA 3R21A 2IO6A 2XIXA 3NAYA 2QLUA 3E8CA 3QYZA 1MUOA 4BFMA 2F7ZE 3NAXA 3RAHA 3W10A 4TWNA 3BZ3A 3QRTA 5JZNA 2E9NA 4RJ8A 2PMLX 4D55A 1NVSA 2PVNA 1ZYDA 3QTIA 2ERKA 4RJ7A 3KMMA 3QRKA 2V55A 2JD5A 3R8UA 2C0IA 1WBWA 3PJ3A 2OIDA 2ZM1A 4S30A 1WBNA 4OT5A 3V6RA 4APCA 2QNJA 2CKEA 2QOQA 1M52A 3BE2A 3PWDA 4AA5A 5J95A 3WBLA 3PJ8A 3OROA 1URWA 3EQPA 4IZYA 3LFFA 4GJ2A 5ETAA 4XCUA 4DG2E 4EK4A 5M4CA 3BLQA 3SOCA 3Q9ZA 2YWPA 4IX6A 4I6HA 3GCPA 3HKOA 4KIKB 1K2PA 5CASA 5FXRA 3UYSA 3CY3A 4RC4A 5ANOA 3AOXA 4Q5EA 2UW5A 2BAJA 3FL5A 3OVVA 3TNHA 2W7XA 1PW2A 4TTHB 5HE0A 4MBLA 4DYMA 4U8ZA 3R83A 4RQVA 3PA5A 2IZRA 4PP9A 3FC1X 4IB0A 4U0IA 3SLSA 4PV0A 2JDSA 4RFYA 1ZXEA 3D7TB 4F0IA 4FSYA 3REPA 4A4XA 5J9YA 3FLNC 4EZ3A 2YCQA 4GU6A 4OTWA 1BI8A 4N70A 1Q61A 4RJ5A 2QVSE 1YWVA 3GCSA 1P4FA 3GXLA 3E8EA 4FTJA 2J0KA 1ZMVA 2V5QA 2PWLA 3P7CA 4FIHA 3UP7A 3VAPA 3PIXA 3M42A 1IRKA 4YR8A 3MGYA 2OI4X 3EN6A 3S95A 4MXYA 3TV4A 5DT0A 2VGPA 2R3PA 3LAUA 4X7QA 4EOLA 4QQTA 2BR1A 4A7CA 2BIKB 4GUEA 4J98A 3GC9A 4LOPA 4GYIA 5TR6A 3UDBA 4JG7A 5EHOA 3VUTA 4EYMA 4K0YA 4KB8A 1LP4A 3ODYX 3ZM4A 2ZB1A 3R7EA 4ZSLA 4RIWB 3FC2A 2C3IB 5DR9A 3TACA 3TXOA 5EKNA 2WTJA 2GSFA 4HZRA 5FTQA 4XG9A 2WPAA 3NWWA 1VJYA 2PVYA 5AV2A 3EFKA 2BAQA 4BKZA 2WAJA 1WBPA 2PK9A 1M2PA 4L8MA 4U42A 2ONLA 2JKMA 4H3QA 4IE9A 5CQUA 4BDBA 3VBVA 3MA6A 3LQ8A 3NIZA 4D2RA 2J7TA 3A7GA 3I1AA 4J53A 4PP7A 5AAFA 4F1OA 2QOKA 2BRNA 2C6LA 2XIZA 3Q53A 3Q9YA 1PMEA 3QQJA 3EQRA 4WOVA 2BAKA 3I7BA 1FVTA 3PVGA 5KMMA 4DLJA 2PMIA 4UEUA 4PPAA 4QYFA 2UZLA 2WOTA 3NRMA 4AS0A 4ZS0A 5BX0A 5ANGA 3DZOA 3KQ7A 1ZOHA 3WILA 3WE8A 3HEGA 3MVHA 4HGTA 3T8OA 1BYGA 3MFRA 5ETFA 5B0XA 2UW0A 5D9HA 5TE0A 3QUEA 4D5HA 5EYDA 3QC9A 4IVBA 4FKTA 4HOKA 3C0IA 5EOLA 3MV5A 3W2PA 4YZNA 2J9MA 3LM5A 3LW0A 4FTNA 2FYSA 4G2FA 3KVXA 4N6YA 2EU9A 2O0UA 2G9XA 1SVHA 4PTCA 5CU3A 4KBCA 4E6AA 2Z8CA 4PDSA 2X2KA 3C0GA 3ELJA 4FBXA 4L3LA 4FV7A 5E1SA 5BVWA 2YM3A 5JFXA 4JBPA 4BTKA 1UVRA 3KXHA 1XH7A 4EOKA 3CPCA 3P78A 2XNGA 1Y6BA 3P4KA 2YM6A 4W4XA 3ODZX 3TKUA 4CD0A 3UG2A 4L6QA 4QNYA 4GFOA 4DBNA 3FLQA 3RINA 4EONA 1JSTA 4HVGA 3MPTA 1J1CA 2Z7QA 4GIHA 4ACMA 4EOJA 4BDFA 5D12A 3ZDUA 4QMQA 3CGOA 5I9ZA 2X1NA 3UOLA 5HBEA 1Z5MA 4L68A 5F9EA 2A0CX 2XM8A 4UWBA 4QMTA 2V0DA 2QO7A 5AWMA 5LVMA 4FV4A 2X6DA 5IKWA 5DIAA 3G51A 5DGZA 4IAYA 4B9DA 3O17A 5ITAA 5EM7A 2P3GX 3ULZA 2X6EA 2Z7SA 3NR9A 4PL3A 3NS9A 3H30A 3PSDA 4PPBA 1T46A 5KMIA 3R7YA 4NU1A 4O22A 4EBVA 3ZH8A 5C8KA 4V0GB 1XHAA 4O96A 4GV1A 4N6ZA 3SW4A 4C8BA 1UKHA 5BVFA 2BRGA 4IACA 4JAJA 4F9AA 5A4EA 2J4ZA 3WF5A 1KOBA 4QRCA 3MBLA 4ZAUA 2UZDA 5IA2A 4CZUA 5A4TA 4OTHA 4HGSA 4XRLA 3WZEA 2O63A 4M0YA 3BLRA 1CKJA 2OKRA 2J5FA 3FMMA 4FKWA 5ANJA 4E6QA 4RVMA 4IXPA 2VTJA 3UJGA 2XMYA 4J96A 3VBYA 4E26A 4W9WA 3FI3A 4ZY6A 4C4JA 4MEDA 1KE9A 3CQUA 3F7ZA 1Q3WA 2HOGA 3PRFA 5CU6A 2OJFE 3RTPA 4JDIA 4BC6A 5D7AA 1JBPE 4FKJA 1V0BA 3H0YA 2JLDA 5CU4A 3DKFA 3PXYA 4NH1A 3A62A 4KINA 2R3KA 3ET7A 1P4OA 4FTIA 3VHKA 1F5QA 2JBPA 4YJPA 4CZYB 2VWBA 5HG9A 2R3JA 5AM7A 4AT4A 2OZAB 4OTQA 3C0HA 1BI7A 4D4SA 3GFWA 4M14A 3DTCA 1BUHA 3EYGA 3ZEWA 4DG3E 4BCOA 3OW4A 3ORMA 4AGWA 4YSMA 4C36A 5FM2A 2PMOX 2WMBA 3D7ZA 4FV9A 4BZOA 5KNJA 3S1HA 3R02A 5L3AA 3VRZA 4IHPA 2Z2WA 2YAAA 1GNGA 5CVHA 1Q97A 4JG6A 2YIWA 4FT3A 1H08A 3HMNA 2VZ6A 3KXGA 3SQQA 2VGOA 3DY7A 4YGAA 2QR7A 5H8EA 4LM5A 2ITVA 3SRVA 1JKSA 5J7BA 3EQHA 3THBA 3AMAA 4JDJA 2IZTA 2XK6A 3OXIA 3A4PA 5L6OA 3OCBA 2OH0E 1OIRA 4RX7A 3CC6A 5FP6A 5DT3A 3BBWA 4AN3A 4WNKA 4IAKA 1JVPP 4G3GA 2VWWA 3AD5A 3UNZA 2J0MB 2XJ0A 3OBGA 4Z3VA 4U6RA 1YI3A 3POOA 2IWIA 5DWRA 1TQPA 3NLBA 3QTQA 5DRDA 2IN6A 5M55A 5I4NA 4W4YA 3Q2MA 4KWPA 3ZZEA 1YQJA 3FLZA 3Q04A 4RIOA 5CSVA 5JGDA 4IM3A 4ZJIA 2O64A 3RWPA 4FNXA 5KKRB 4YZDA 4OW8A 4PTEA 1LR4A 2W4KA 4YJUA 2F2CB 4NEUA 1OITA 1UWJA 2R3LA 5E7RA 4XS2A 5M4IA 3S3IA 3QFVA 1LPUA 4G31A 5JGAA 4FIIA 4G6OA 5BUJA 5IPJA 4KKHA 4A9TA 4LRMA 4GT3A 3DK6A 2BRHA 3UP2A 2FB8A 3DDPA 2UVZA 2W1IA 4H36A 3ZXTA 4BHNA 3CPBA 2QU6A 5CXZA 3PXKA 2ETKA 2J6MA 4WRSA 3PLSA 1H4LA 2WMXA 1QPDA 3KRXA 4FTOA 4Y72A 4MD9E 3V5QA 2WNTA 4WKQA 3ORKA 4F09A 4AZEA 3R8VA 3E63A 1ZY5A 3NUNA 1ZLTA 3OFMA 3R30A 3V51A 4C35A 3H4JA 4XBUA 4YJSA 1WVWA 1M7QA 1XR1A 5AR8A 5CQWA 1CKPA 3AXWA 1L3RE 4XP3A 5JFSA 5BQ0A 5FM3A 4KD1A 2PE0A 5CF4A 4EK5A 4CFVA 2Q0BA 4R1YA 5BVNA 2XA4A 5AIKA 4IWOA 2VTPA 5AV4A 3NSZA 4O6LA 1H26A 2WMSA 2YCRA 2QURA 3SHEA 4WSYA 1UU7A 4FV1A 4AE9A 3QQUA 2WTVA 4C3RA 2VV9A 2WB8A 1YXTA 3K3IA 3DB8A 2BTSA 4BVUA 4ENXA 1PXNA 2WMAA 3NW6A 5HICA 5IF1A 3I4BA 4X2FA 4YZBA 5FDPA 3FQHA 4ANLA 3DNEA 4HVIA 4XNEA 5CENA 2FSTX 5FGKA 4BIBA 4PTGA 1YKRA 4RRVA 2Q0NA 3ZLXA 3ORTA 4S34A 5LVNA 3KA0A 1FVVA 2B52A 4G17A 2I1MA 3QCYA 4EUUA 3F3TA 1VYWA 5L2TA 4C4HA 4XV3A 4LMUA 3EN4A 3DFCB 5CLPA 3GQIA 5K5XA 3DS6A 3OTUA 5JFWA 3VUGA 2PTKA 3F9NA 3D7TA 3V5LA 2IVUA 4BIDA 3S00A 4FT7A 3JYAA 5FTOA 4FKSA 5CEPA 5I9YA 5E8UA 3NIEA 2WQBA 2YDIA 3KRWA 4BRXA 4EQCA 2A27A 3QX4A 1Q8ZA 1OKYA 4RPVA 3H9FA 2R9SA 3ZFXA 4ASEA 3C4CA 3UQFA 3ALOA 4FX3A 4WNOA 4XH6A 3PZEA 4UMPA 3TN8A 3UODA 4WIHA 4I5CA 3UTOA 4EKKA 1YXXA 2RFSA 4IJ9A 2GU8A 3UG1A 5CNNA 4XLIA 2CPKE 3HMPA 3VBXA 2W9FB 2X2LA 1PF8A 2JKKA 4AP7A 3PY1A 3UVRA 2UW6A 3BLHA 3UO4A 1WBVA 3HGKA 4QP8A 2VNWA 4XV2A 3TZMA 4C02A 2YABA 4LGGA 4FKGA 3CTHA 2W1GA 3D9VA 3FI4A 4FT9A 5AIRA 1DM2A 4ZZMA 3Q6WA 4XV9A 4X2NA 4Z55A 2ITWA 2E9UA 4IZAA 3VJNA 1F3MC 4BDJA 4MXAA 4BCFA 4BI1A 4R8QA 3HV3A 3RKBA 4AU8A 5HTCA 4ACDA 1JKKA 2CLXA 2Y7JA 4FSMA 4I93A 2VUWA 3FKLA 4O0TA 4E4MA 3RPYA 5KX8A 4YZCA 4EZ7A 2G01A 4AA0A 1H24A 5HEZA 2PHKA 1R3CA 3O8UA 3BYVA 3F6XA 3Q6UA 4WD5A 4X3FC 4JT3A 4A07A 4F99A 4NCTC 4AZVA 4QMVA 2RFNA 4D4YA 3MVJA 3ZSIA 4RIYB 2B4SB 3PJCA 1YHVA 4FSRA 2R3OA 5CEMA 2O3PA 1J3HA 5A4LA 3UZTA 5HU9A 2Y4PA 1WFCA 5A6OA 3TNWA 4N0SA 1ZARA 1XKKA 1TQIA 3I6UA 3RAKA 4ACHA 3R9NA 4AUAA 3R63A 4G9RA 2FH9A 3QCSA 4E73A 4E4NA 4BWPA 1YHSA 4ASXA 2V7OA 3C4EA 3LFDA 5CF5A 2C3JA 2YLFA 3KVWA 5D11A 5L2QA 5CI7A 2XNOA 3CTQA 3ZU7A 5CU0A 4LV8A 2C0OA 4ZTLA 1GZNA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PPBA

Total Genus

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Chain Sequence

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