4PPCA

Itk kinase domain with compound 27 (n-{1-[(1r)-3-(dimethylamino)-1-phenylpropyl]-1h-pyrazol-4-yl}-6-(1h-pyrazol-4-yl)-1h-indazole-3-carboxamide)
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
264
structure length
233
Chain Sequence
SVIDPSELTFVQEIGSGGLVHLGYWLNKDKVAIKTIIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 233
sequence length 264
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ppcA00
2JDTA 5C26A 4H58A 3Q53A 2C6OA 4O0SA 2YM7A 3UO4A 4XBUA 4FOBA 5AAFA 4U81A 4TT7A 3R01A 3W33A 2UZWE 4GFOA 2QOKA 4JAJA 5HG8A 3D0EA 3ZRLA 1KE8A 2VTJA 3CCNA 4C37A 3ZRMA 4YZDA 4DINA 1H0VA 1M14A 1H27A 3QCSA 5ANDA 3IPHA 1WBVA 4IAZA 3B2WA 4R5YA 4AACA 3NW6A 3UTOA 3DJ6A 1REJA 5CAOA 4EQUA 3BHYA 5A14A 3NCGA 4N4SA 3BI6A 3FY0A 1SVGA 5LWNA 4IVDA 4J8NA 3HMPA 4UXQA 5JSMA 2QR7A 4FV4A 1AGWA 4ZJVA 2YABA 3DQXA 3MIYA 1JVPP 1QMZA 5CI7A 4M97A 3GC9A 4GU6A 3WI6A 4NEUA 4CYJA 4ANOA 4BICA 2RFDA 5IZFA 5LMKA 4LQMA 4NIFA 1YXUA 2JDVA 3E3BX 5KCVA 3AT4A 1U46A 3HA8A 5AP3A 5AR4A 4E6CA 4FG9A 5K3YA 5KX8A 3CC6A 4HYIA 4M0YA 4P5ZA 2WMQA 4IWQA 2J7TA 5EI6A 1HOWA 2ITYA 3NNXA 4YBKA 4X6QC 4TW9A 4YJOA 2A27A 2XM8A 4F9BA 1Q4LA 4IVBA 5L8KA 4IZ7A 4CCUA 1KSWA 2ONLA 5LXMA 1VR2A 2BFXA 4ANQA 3RALA 3N9XA 2VTMA 4FV9A 5DNRA 4YU2A 2YM3A 5CSWA 5M4UA 3L1SA 3G0EA 3QYWA 5GZAA 5HO8A 2WQEA 3DOGA 3AT3A 4LGGA 4Z9LA 3ENMA 1QPCA 3P79A 3OCGA 1TKIA 3QU0A 4FTCA 4BTMA 3QC4A 3FI4A 4EWQA 1OIYA 4WUNA 1OMWA 2CDZA 5D12A 4QMLA 4HYSA 4ID7A 3KXNA 3TKIA 3TNPC 4FV2A 3LCDA 4OTIA 5IH6A 5DWRA 2Z7QA 5FGKA 1ZARA 5FXQA 4ZJJA 2YDIA 5JFWA 2OG8A 5EOLA 4U43A 4LRMA 3I7CA 3ZEPA 3OBGA 3O17A 4ZP5A 3EWHA 3SC1A 3QD2B 2VO0A 4UBAA 1WAKA 2VGPA 4G31A 3CTQA 4P90A 3KN6A 3TKUA 4ENYA 3IG7A 3MSSA 4J52A 4Z16A 5A4TA 5DBXA 3UP7A 1DS5A 2XNGA 3FZRA 5BMMA 3KCFA 2ITPA 4BBMA 2XRWA 3PIXA 2W0JA 2YA9A 4FMQA 4IWDA 3FPMA 3HL7A 3O7LD 2PMIA 3QD4A 2IZTA 4PF4A 1O9UA 2JKOA 4AE9A 4GG7A 3RINA 4RWIA 4DGMA 2BDFA 3V5LA 5J1WA 4Y85A 3KXGA 4AZTA 2PE1A 5CAPA 3BHHA 3QGYA 5AP4A 3HV6A 1KOBA 4I92A 4MNEA 4W8EA 3V5WA 4A9RA 3KRJA 5KMJA 1VYWA 3R8VA 3HP2A 3U6JA 4FT7A 2QHNA 3FKNA 3H9FA 4NJDA 3EQHA 4M67A 4FI1A 4YZCA 3OCSA 3I5ZA 4KKEA 1VZOA 3P0MA 5KMOA 2X7GA 4BRXA 4ANSA 2DUVA 4G6LA 2FH9A 4EH3A 3QLGA 2EB2A 2WHBA 3OC1A 4BGHA 3SA0A 3MTLA 3TXOA 1GIHA 2ZJWA 4IW0A 4Q5HA 4ZSEA 4AFJA 3R28A 2R3LA 4I5CA 5A4QA 3PFQA 1LR4A 3TV6A 4EYMA 4IM2A 1JOWB 4MXCA 5CSHA 3PA5A 5DRBA 3UOLA 3NIEA 3MFTA 1G3NA 3TG1A 4OAVB 1E1XA 2G15A 3HGKA 4IJ9A 1PMEA 5KMNA 2F7ZE 4W4VA 1J3HA 4DGNA 5IISA 3POZA 5HVKA 2YIXA 3UNZA 3Q9XA 2UV2A 4EONA 4QTCA 4TL0A 4GV1A 5I5ZA 3HEGA 4QP6A 2ITTA 3ZLWA 3F2NA 1YWVA 4XH6A 1UWJA 3VS1A 1DI9A 2R3NA 4MTAA 4RJ3A 3PJ3A 3GFWA 4L8MA 5M56A 4DITA 2VO7A 3RZBA 2CGWA 4AOIA 4CVAA 1FMKA 1Y8YA 4WOVA 3FY2A 4UWCA 5TO8A 4XCUA 2Y7JA 5EW9A 5HNIX 3EB0A 1OIUA 5T3QA 1B6CB 3FV8A 4UV0A 1WVYA 5J87A 4FVQA 4L9IA 2OU7A 3AC4A 5D1JA 4GMYA 2ITOA 3Q6WA 4ACMA 2OF4A 3DBEA 1R3CA 3Q32A 2A0CX 2QKWB 1PXOA 4IX4A 4E93A 3FQHA 3UG2A 1JLUE 2UZEA 3C4XA 3R7YA 2I0VA 4ANNA 1JKSA 2XK3A 4FOCA 1ZAOA 2UZTA 4J97A 4XV3A 1UKHA 4DEIA 4UXLA 4I4FA 2OF2A 1T45A 4EH8A 4N6ZA 4JL9A 2GQGA 3VAPA 4MD9E 3QF9A 3FQEA 5CASA 4S34A 3QQKA 3O8UA 2PK9A 3FYKX 4NH1A 4NW6A 3FBVA 4AGWA 4G3DA 5J95A 3WILA 1OKZA 4EQMA 2BDJA 4O1OA 4EH2A 3ELJA 1O6YA 3DNDA 4HPUE 3C13A 3ET7A 3GBZA 4O91A 5C1QB 3POOA 3ZM4A 3VHKA 3SXFA 2V55A 2B52A 3D4QA 2XEZA 1H28A 2WQMA 1BI7A 2UW0A 2W9FB 4AFEA 5HE3A 2PTKA 3UGCA 4HYHA 3DBFA 3MPTA 2HOGA 5FD2A 3HKOA 2BUJA 2WNTA 2XZSA 3CEKA 1FINA 4BBEA 4F65A 5BVOA 2REIA 4FV1A 3NYNA 4XOYA 3ZC6A 2IO6A 3ACJA 3FMJA 4JDKA 3UIXA 3CQEA 5DFPA 3VBYA 1FVVA 5KMMA 3L8SA 4IAIA 3S4QA 2BPMA 4QYHA 3ZO1A 3VJNA 4Q2AA 3P08A 4D1ZA 2R3MA 3C4WA 3VF8A 5KNJA 3JY0A 4TNBA 3HYHA 4KINA 3TV4A 4U6RA 5CENA 3QTWA 3R83A 2J2IB 3QTSA 4JBQA 4PPCA 4RGJA 5L6WL 3ZDUA 3RVGA 2OK1A 5J79A 3P4KA 3B8QA 4IBMA 4HGLA 1R39A 3OWKA 3Q9ZA 3AC5A 3OF0A 3R63A 4DH8A 3R1NA 4G2FA 5KZ0A 2EB3A 4ZXTA 5ETIA 3PG3A 4FTIA 3LFBA 5IUGA 3ZFYA 1M2QA 1K3AA 2FUMA 1YVJA 3KXXA 2ZM3A 3PE2A 1ZRZA 2XYUA 2UZBA 1BLXA 3BCEA 1H01A 5K0XA 3CGOA 3A7IA 3SOCA 3UOJA 2I1MA 5A4LA 5CXHA 4M69B 4CKIA 4J99A 4CRLA 1Q61A 1ZZ2A 3A7GA 2AC5A 5GJDA 5DR2A 4IIRA 3COIA 3PXQA 2PMLX 3BGQA 4N0SA 4RIXB 4IAFA 4IB0A 1RE8A 3DAJA 3OWJA 3P1AA 3H4JA 2O2UA 2JD5A 3ACKA 4I5PA 4QTBA 5EM6A 3Q3BA 3BWFA 2X9FA 5CF8A 3WYYA 3W1FA 2WTVA 5HVYA 2EVAA 4APPA 3U6IA 3MW1A 5EW8A 3NAXA 3HP5A 4O0XA 1U54B 2J90A 1YHSA 4K2RA 4ANMA 5DR9A 1V0BA 4MD7E 2X8EA 5AUXA 3RM7A 3VBXA 3LVPA 4EHGA 2VTOA 4JXFA 2YWPA 5CEKA 3CPBA 4JBPA 4MQ2A 1F5QA 3ZTXA 5FXRA 3JPVA 5HIEA 1IASA 3OEZA 3W2CA 5AUTA 2JKKA 5IMXA 1JQHA 2G01A 2R3OA 1W98A 4L43A 4RJ5A 2F2UA 5EYDA 4YTIA 2JLDA 1G5SA 3EN4A 3HDMA 3E93A 4PMPA 1M2PA 3VUDA 4ASZA 4EH9A 3AC1A 2XK9A 3DB6A 1KV1A 3P86A 4U5JA 5I0BA 2OW3A 4RX8A 4CTBA 4RIOA 1WVXA 4C0TA 4F09A 3A7JA 5HU3A 3Q4TA 3FLWA 3D83A 4PNIA 4O22A 2BIKB 1URCA 4YR8A 3KRLA 4AQCA 3NS9A 1GIJA 2W1ZA 4I6QA 2YM8A 5E8UA 4BCHA 2XP2A 1YWNA 2OIDA 3AG9A 3TACA 3I4BA 2E9UA 4MWIA 1H00A 2PL0A 2BAJA 3BZ3A 3LHJA 4O0WA 5ETCA 2R3QA 3OEFX 2R3FA 5IA3A 3MH2A 3LM0A 4G1WA 1IR3A 3GENA 4PV0A 1OM1A 1IEPA 2ITWA 1Y6AA 4S30A 3AC3A 3M42A 4J8MA 4KS7A 4OTGA 2PVRA 2GCDA 3F3UA 1B39A 4FSQA 4YNEA 3ZO2A 5EDRA 2C6MA 3ORTA 1SZMA 4PRJA 4A9SA 1Q8WA 5IPJA 2ETKA 5J8IA 4AN9A 3F61A 4BDBA 4JG6A 2CN5A 3GNIB 3QWJA 3V01A 4TWCA 3UDBA 2OIBA 3H3CA 3I5NA 3CTJA 4FSTA 3KMWA 3DKFA 4C59A 4YJRA 4EKKA 4ZTRA 3ZSGA 3LW0A 3ORNA 3VS5A 3F9NA 4OR5A 3EFLA 3L9LA 4UY9A 1UU3A 3ZBFA 2C3KA 2QU5A 1GY3A 2R0UA 1UWHA 2PMNX 2Q0BA 2OJ9A 3CGFA 2P55A 1WBSA 5AR3A 4GFMA 3F3ZA 3OY1A 4FKRA 4M0ZA 5AP7A 2FVDA 3VULA 3BV3A 1AQ1A 5H2UA 4RZWA 3JXWA 4HGEA 3MYGA 4YP8A 3DU8A 4I23A 2WOUA 3QTIA 4FIIA 5KHWA 2E9PA 3PA3A 4ZOGA 1FGIA 3PE1A 5HBEA 3OP5A 2X0GA 4XP0A 3PWYA 3QQGA 2Z7SA 2IN6A 4XP3A 3KU2A 4BF2A 4DG2E 1NVQA 3D9VA 2UW8A 5FP6A 5HLPA 1WMKA 3DTCA 4QYFA 4RLKA 5CU4A 4O6EA 1PJKA 4IX6A 4S32A 5DVRA 5AV2A 5HESA 5DEWA 4LG4A 4AZSA 2EXMA 3C1XA 3Q4UA 3QAME 2UW6A 4LMUA 1H1WA 4MXOA 4Y95A 1GZOA 3QRJA 1XBAA 1U54A 1NY3A 3PVWA 5AUYA 2HYYA 4W4WA 5DI1A 3RI1A 2I6LA 3MVMA 2NRUA 1LEWA 1YDSE 1B38A 3DGKA 3UVPA 5A54A 1Q5KA 4XG7A 2QHMA 2JEDA 2X8IA 3DAKA 5JRSA 4USEA 3U6HA 3QBNA 4M14A 2OJIA 1OKYA 4O27B 3UODA 5JKGA 3FC1X 2BRHA 3CJGA 5E1EA 3ZEWA 3NAYA 3OCTA 3V8SA 4DH3A 5IA4A 3LFNA 5GZ8A 5GJFA 3C50A 5B2MA 3IDBA 4EQCA 4QTEA 1OPJA 2G2IA 2W4KA 5E8VA 4BGQA 4QMSA 2C69A 3RJCA 3VRYA 3QUPA 4WNPA 4NW5A 1M52A 2XNBA 3F7WA 4B7TA 1YHWA 2ETMA 3O51A 1H4LA 1PKDA 3ULZA 2E9VA 3MY0A 5AEPA 3R7OA 2UVXA 3CY2A 4D28A 4U40A 2PZYA 3EFWA 3OT3A 3OFMA 4FYOA 5E7RA 3ZC5A 2WZJA 3MWUA 3QA8A 3II5A 4FZ6A 4BCJA 2VU3A 2FYSA 2WMVA 3BHUA 4KKHA 2PVFA 4KIKB 3KRXA 4MK0A 4ZK5A 4BC6A 4YTFA 5DPVA 4Z7GA 2WIHA 3D5XA 2ZM4A 4QYEA 4MYGA 3R7IA 3PJ1A 4A4XA 4FKPA 1LPUA 2J0LA 2XH5A 2XK8A 4FC0A 1BKXA 1ZMWA 2GHGA 1XH6A 2Z8CA 3DJ5A 4NM3A 2BZIB 2PVMA 4DAWA 1MQBA 4GSBA 2C0OA 3LIJA 2YIRA 4GEOA 2R9SA 1NVSA 4WBBB 4FG8A 4XV9A 5GZ9A 4CFNA 4JG8A 3EN5A 2GHMA 5M44A 2OH4A 1H25A 1ATPE 4FL3A 4G9RA 1GZ8A 3R8ZA 4E4LA 3L8XA 2OXDA 4E4XA 3UNKA 2CLXA 3O23A 4WG5A 1GAGA 4FKVA 1CKPA 2HIWA 4JIKA 3B2TA 3BHVA 3KB7A 4ZY6A 4ERWA 4G34A 3V8WA 3CS9A 5E1SA 5A46A 2XNMA 3MFSA 3CKWA 4PP9A 3EQDA 1JKTA 5A3XA 4IZ5A 2Y4PA 2Y0AA 3TTIA 4DFZE 4OAUC 3I7BA 3DQWA 1MRYA 3TZ9A 3RWPA 3O8TA 2W9ZB 4U3ZA 3PVGA 3UPZA 3K2LA 3KGAA 3FL5A 1CMKE 4JLCA 4CV8A 5EH0A 2ZV9A 4U8ZA 3A61A 3EL8A 1VYZA 2IVTA 2WMRA 4A9YA 1YRPA 3TZMA 4EHVA 4LYNA 4GUBA 4FX3A 5C8MA 2V7OA 3EQRA 3FMLA 4L3JA 1UVRA 3LLTA 5FDXA 1JPAA 5K5XA 3P7CA 3C0IA 2CKEA 3JYAA 3BYSA 4L3LA 4WBOA 4ZLOA 3DK3A 4UB7A 2QG5A 2VTLA 2R5TA 5D9HA 4F63A 2C3IB 2OI4X 4AZEA 3FZTA 3NCZA 4OW8A 5HHWA 4XRLA 1PXIA 4JDIA 1SNUA 2GNIA 4JVGA 5CEOA 4P4CA 2O3PA 1KE5A 4QMYA 4O1PA 4WSQA 5HD7A 2Z7RA 2W4JA 3PPZA 5HZNA 3RZFA 3D5VA 5FQDC 4XV1A 2ERKA 2NP8A 2X7OA 1TQMA 3T8OA 2RFNA 4ZSLA 2R3PA 4AUAA 2OJFE 4W8DA 2QO7A 3K5VA 4AA4A 2Z2WA 4L7SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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