4UMP | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	97
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4umpA00

4O0TA 3DBFA 4G6OA 2VO7A 3R04A 3O8UA 3R28A 5G1XA 2XKCA 3QZHA 4B8MA 3KN6A 3COKA 4QP2A 3OMVA 2WMVA 3OZ6A 2IVVA 4FNWA 2YFXA 4HOKA 3FLYA 4Q9ZA 3R71A 1MUOA 2HENA 4CZUA 2HOGA 1JBPE 4XBRA 5CAVA 3BHHA 2VTTA 4RZVA 4G1WA 2BZHB 3SHEA 5KMKA 2XRWA 3B2TA 2YA9A 4ZZOA 1ZMVA 3P86A 4F65A 3TNPC 3EFJA 2YACA 5M4CA 4OBPA 1QL6A 4FV2A 4JX7A 2HZIA 4K33A 3NUYA 3C4EA 5HI2A 4I5HA 3AC5A 1ZYLA 3P5KA 5CSPA 1JKLA 3GC8A 2AC5A 4U8ZA 1LP4A 4OAVB 3KF7A 1F0QA 3OTVA 5KZIA 2ESMA 2WTWA 2J0JA 2XNEA 3HV4A 1OIUA 3FQHA 3PPJA 4GYIA 5M53A 5AAGA 3DT1A 5AP7A 3EQDA 2P4IA 1U4DA 1PXNA 3S1HA 3KULB 3P79A 4PMTA 5TO8A 5BPYA 5K5XA 4FNYA 2XB7A 4IDTA 3A4PA 4J52A 3RCJA 2R3HA 4BCNA 1IA8A 2WOUA 4RJ7A 5DHJA 4I22A 4ITJA 1DAYA 2BR1A 4NKSA 4N6ZA 1P5EA 4IX6A 5EDQA 2Z8CA 4ZZMA 2IW6A 3QRJA 3BI6A 4QMWA 5HESA 4ZLOA 5KMMA 3VRYA 4FL3A 5EI2A 3UO6A 5H8GA 3EL8A 1CTPE 4MX9A 2XNPA 4ZEGA 4CFXA 4IX5A 4FGBA 4O6LA 4ZP5A 5M57A 4G16A 4ITIA 5HIBA 4QPSA 4PP9A 2G2FA 2X4ZA 5L8JA 5CF4A 2EVAA 3ZOSA 1URWA 4I5CA 1OKWA 3W8LA 5IG1A 2WMUA 4G3EA 3C0GA 4AT5A 4JRNA 1XBCA 4OTDA 2GFCA 3FXZA 2QONA 4YZMA 2ONLC 4YMJA 1Q8YA 3DS6A 4O0RA 5FDPA 3MB6A 3ZDIA 4Z7HA 3QFVA 4IZYA 4IB0A 5JZJA 1PXPA 3EJ1A 3M42A 3COMA 4AT3A 3BV3A 1IEPA 4FKSA 4S34A 4ZJJA 3ETAA 1H1WA 3UQGA 1OL5A 4PDSA 4FTLA 3OW4A 2QO7A 5AX3A 5CSWA 4YO6A 1M17A 3U6JA 3UOJA 4RWLA 3P9JA 3FI4A 4ZXTA 4G3DA 4L45A 1MQBA 4JQEA 4KSPA 4LGDA 3FJQE 4QP1A 4XG3A 4YZDA 3Q52A 3UMWA 4GEOA 4YBJA 3F3UA 3O23A 3VN9A 3KGAA 2VTQA 4BDJA 4IDVA 2C4GA 5LCKA 2YIRA 5DVRA 2XKEA 3QTWA 2ETKA 3CTQA 4ACCA 3I1AA 3ORLA 2VTMA 2C0TA 4ACGA 5HX6A 3CJFA 4FTIA 3AT3A 2X39A 3F5UA 1UKIA 3MS9A 5CZHA 2P2IA 4MD9E 4USDA 3WF9A 1B6CB 4TWNA 4FSQA 1L3RE 2XK3A 3QGWA 5I9YA 1WAKA 1H1SA 2W17A 4GUEA 1PYEA 2BHEA 4PTGA 4W9XA 2QOIA 5JQ5A 2XIRA 3D15A 3FYJX 4YTHA 3VBTA 3SVVA 4LG4A 4XG7A 5F95A 5HORA 4FT7A 4ANBA 5FGKA 4S31A 2W1HA 4JAIA 4QQTA 2WB8A 3HMNA 4J8NA 3MFUA 4M7IA 3TV7A 2W1EA 3WE8A 2WPAA 3ODZX 4USEA 3PSBA 4MNEB 2C1BA 1PY5A 4TYIA 4E7WA 4E6DA 1HCLA 3IPHA 3O50A 3ULZA 4D2TA 4BL1A 1OKYA 2ZV7A 1OIYA 4AN9A 3V6RA 2XA4A 3QLFA 4ZLYA 5I9XA 4QTBA 2ZDTA 4GVAA 4BBMA 5KMNA 4C3PA 2BAQA 3KVWA 5CENA 2CPKE 4GJ3A 5DR2A 3O51A 2QVSE 2C0IA 4FNXA 4RBLA 4CFWA 3ELJA 3E8NA 3BHTA 4EH2A 5ITAA 3C4XA 4XG9A 1Q3WA 3Q96A 2J5EA 4IZAA 3D0EA 3MGYA 4JG6A 2OBJA 1DAWA 5BVOA 2XNBA 3JYAA 4I6FA 2WQBA 2NO3A 3BHVA 4QTEA 3OC1A 1YXVA 1U46A 2ZAZA 2H8HA 4R3CA 2VWYA 4M68A 3R9HA 3NUXA 3UE4A 3AMAA 3UTOA 4ZOGA 4CT1A 5IEYA 4P7EA 3OXZA 1Q97A 1KE9A 3LIJA 3Q9XA 2X7FA 5J7BA 4RG0A 4II5A 4Y83A 5ANOA 3ZU7A 2IN6A 5CAUA 3TTIA 2WQEA 5ACBC 4DFYA 1H8FA 1NVRA 3FHRA 3EIDA 3TWJA 4BDCA 3QTUA 5LQFA 2PVMA 1UWHA 3HMPA 4G5PA 3QLGA 5C27A 1AGWA 5AP2A 3C9WA 3R7OA 3R8LA 3VUMA 1Z9XA 4JI9A 3FZ1A 3R83A 2W4JA 4CMTA 4AN2A 3MTLA 4BF2A 4A06A 4W8DA 4FKRA 2RIOA 3R02A 3MFTA 2BRMA 2NP8A 2OXDA 4G3GA 5AR2A 2XBJA 5A6OA 3UODA 4RWIA 3EMGA 3V8TA 5CZIA 3QBNA 5E92A 1ZARA 1NA7A 4BGGA 3OWPA 1W83A 2J6MA 3NDMA 4X3JA 4AA0A 4XG6A 3KEXA 3QAME 3DFAA 4DYMA 1QCFA 1YXUA 2J5FA 3PXFA 2QOFA 4U81A 2B9FA 2RG5A 4ANOA 5KMOA 4FIEA 1HOWA 5CSVA 3WILA 3C5UA 3FXXA 5C26A 4GS6A 3KC3A 4FG7A 3PJCA 1K2PA 3ENHA 4G2FA 3QUEA 1WBPA 2W9FB 3FSFA 5KBQA 1ZWSA 4EZ3A 3H0YA 5CI6A 4I21A 3E62A 2OJFE 4QTCA 5AMNA 4C57A 2UZVA 3AD6A 1KV2A 2UZTA 3FMMA 3PVBA 5A4EA 2C6KA 3OFMA 5IA0A 2W0JA 1O6YA 3W2OA 2YWPA 3KRWA 4IFGA 4MQ2A 5AP3A 2JKKA 1P4FA 3DKGA 4OGRA 3FPQA 2NRUA 3DCVA 1FVRA 4AT4A 1H0WA 1T45A 3WZKA 3ORTA 4WG4A 2IVTA 1GZKA 4QQJA 3IQ7A 3TCPA 4GK3A 2VTHA 2XH5A 4FKOA 4X2JA 5HCZA 4C2VA 4F0GA 3PG3A 4GK4A 4C62A 2YJRA 2OZAA 3L8PA 4GFGA 4WSYA 3TZ7A 3BPRA 1REJA 2DUVA 2JFLA 3Q2MA 4RSSA 3CQEA 3KRLA 2CJMA 5AV2A 3HP5A 4F1MA 1R0PA 3OBJA 4E4MA 1IR3A 2XCHA 3HMMA 3IW4A 1Z57A 5H3QA 3TJCA 3U9NA 3V5QA 4F7NA 5A4CA 5GZ8A 3JUHA 5DG5A 1PXKA 3UIMA 3NYVA 3QUPA 4GCJA 3QA0A 4FSNA 3B2WA 1Q24A 2R0IA 2YDJA 4ONAA 4B0GA 4CD0A 3G2FA 4OTIA 4YJUA 4MAOA 5BQ0A 4Z9LA 3W2RA 4AGWA 2QI8A 5F1ZA 2FSTX 2ITNA 3RI1A 4U7ZA 4IANA 2WMWA 3R00A 4C4GA 4AFJA 5CASA 1JVPP 2IVSA 2FA2A 1Q4LA 2CCIA 1KOAA 3EFWA 3L9MA 4FUYA 3KXXA 1OPJA 3HRCA 1H08A 4F63A 1RQQA 3S00A 5AP5A 1R3CA 3RBWA 4W4VA 5FEDA 3GENA 2QU6A 3U6IA 2FSOX 3S3IA 4BWKA 3F5PA 2GS7A 2C6OA 3GC0A 4RJ3A 4ALVA 3FY2A 4NJ3A 5LWMA 2WTIA 4EORA 2ITZA 2BIYA 5DH3A 2ERKA 3W16A 1J3HA 3SOCA 4O2ZA 3ZYAA 3GCQA 4D2RA 5IDNA 5M4UA 4S33A 3WF8A 2VU3A 4BDEA 3FPMA 4L3PA 3OBGA 5EM5A 4ANMA 5IUHA 3CTHA 4H3BA 2FYSA 2H6DA 3FMLA 3QKLA 5BYYA 2FO0A 4DEEA 4K8AA 1T46A 5B2LA 4MF0A 3IOKA 4CFMA 1OUKA 4FSTA 4IVBA 3HV3A 5AUYA 4A4OA 1FQ1B 2BTSA 4DH5A 4TT7A 3FZTA 2C6EA 3TNIA 5GHVA 3MJ2A 4BWXA 2B9IA 4I3ZA 3QZFA 4IAIA 4LFIA 3IW8A 4LYNA 5EH0A 3R1NA 5CF5A 3ALNA 2G1TA 2GMXA 4R3PA 4ASEA 4JIAA 2PSQA 2WKMA 3D83A 3S4QA 3FV8A 4ZY4A 2ITWA 4OW8A 2W05A 2UZOA 2ZV2A 3KF4A 2Y4PA 5F20A 2W1CA 4CZYB 4LL0A 2YCSA 2C5VA 5KHWA 4AOTA 3MDYA 5DT4A 4WNPA 2FGIA 5IA3A 3HZTA 4NM5A 4DLIA 1YXSA 3R7UA 3QRUA 4MTAA 3D5UA 4CV9A 3MIAA 1ZRZA 5HCXA 4QD6A 3QQFA 2FUMA 3UNJA 4TY1A 3FMNA 2PMIA 4UMRA 2JDOA 2CGVA 2ZV9A 5DWRA 3VUTA 5K0XA 2Z60A 4AAAA 3UNZA 4APPA 4CCBA 5L2IA 5D1JA 4ZY6A 4GIHA 4WBBB 5HO8A 2P33A 3EB0A 3TN8A 4JG7A 4JBOA 5EDRA 3V04A 3FSKA 2W1GA 4C33A 4JIKA 2PK9A 3F61A 4FA2A 2OFVA 4FKLA 4LQMA 4RJ8A 4FR4A 1YRPA 2ACXA 4LM5A 3D94A 5DGZA 1NVSA 1WCCA 3MPTA 2QR7A 3MH3A 5G6VA 2GNHA 3CCNA 1H1RA 2GNIA 4EYMA 3SRVB 2BAKA 3A99A 4FSUA 1V0BA 5GNKA 3O7LD 4FKIA 3F88A 3R7GA 4QT1A 4XMOA 2YZAA 5A6NA 3UO4A 4MK0A 1FGKA 4BC6A 3FLSA 4JQ7A 4H36A 3UPZA 1XKKA 2XVDA 4NCTC 1ZOHA 3GOPA 3HVCA 1OB3A 3F7ZA 3D2IA 5L6WL 4EBWA 4L42A 4YBKA 5JKGA 1S9IA 1CKJA 3GCSA 4L3JA 3R0TA 5I0BA 5EHYA 2X6EA 4PL5A 5HICA 3PA3A 4WIHA 1B38A 5D7VA 2Z2WA 4QMVA 3W2PA 3EN7A 4D9UA 2B7AA 3IO7A 4I0SA 3HUCA 2EB3A 4IAYA 2HZ4A 5D12A 4YJPA 2CGXA 2YM6A 4EH6A 4YPDA 1PMUA 2E2BA 3V5LA 1FMOE 4NWMA 4V0GA 3EQFA 4G6NA 3WF6A 2B4SB 2YLEA 4U0IA 2QD9A 5AV0A 3ZLWA 4BIBA 2RFDA 1GOLA 3UVPA 3KXMA 4GG5A 4DGGA 1YOLA 4FSWA 2GSFA 3LFDA 1VYZA 3ZS5A 3FBVA 4CFVA 4QMZA 5EW9A 4AE9A 2JBPA 5CT7A 3GP0A 5EHLA 4KRCA 3KXHA 3EYHA 4L00A 3LQ8A 2BHHA 4KBKA 2R64A 2HZ0A 4ZTNA 4E1ZA 4G3FA 2Z7LA 3B8RA 2HWOA 4DFXE 4YJTA 5AM6A 2QHMA 2B53A 5H8EA 4D2SA 2QOQA 4IB1A 4BDIA 1Y8GA 4F6WA 1MP8A 3DK3A 4FX3A 3W2SA 3QYZA 3QD3A 5F4NA 3NCZA 4EL9A 3N51A 4IVAA 4Y72A 4KKHA 4W8EA 4RX9A 3R21A 3KCFA 3ZEPA 3KK9A 5M44A 2XP2A 4NK9A 3PIZA 4AGCA 1IASA 4CLJA 3LHJA 2WO6A 4HCUA 4L43A 5FDXA 2VWIA 4NTSA 4F9YA 4A9RA 4NTTA 5CY3A 4ZSAA 3UMXA 4QPMA 2J0KA 2P55A 3C50A 5E7RA 4XH6A 1YWVA 4WO5A 1JKSA 1PYXA 5L2WA 3U6HA 3O0GA 3GEQA 4K0YA 4C58A 4BZNA 3Q5ZA 4L52A 3NUSA 3GQIA 5M4IA 2YM7A 4TW9A 3RK9A 3UQCA 1V0OA 3JVRA 2CCHA 3UP2A 4FTNA 5FD2A 4C0TA 3OG7A 5BVFA 2UW4A 5A46A 3QX2A 5B0XA 3SLSA 1PJKA 3P7AA 5BYZA 4A9SA 2VZ6A 4EOIA 3OWKA 3DKCA 3R1YA 4ZTHA 2QODA 5H8BA 3LMGA 3H30A 4RX7A 4U9AA 5HE2A 4A9YA 3RMFA 4EC9A 4S32A 3ZUUA 3DPKA 3EHAA 5AV4A 4FIIA 4EH7A 4HVSA 2PMLX 2KTYA 5CF8A 4O0UA 5JSMA 2W06A 3MY0A 4RFZA 3Q32A 4FL1A 4AOJA 4NT4A 4G3CA 2LAVA 2ZB1A 5BUJA 3PVGA 4Z16A 3RPRA 4V04A 3QQKA 4NM3A 4BDGA 4JT3A 4D4RA 1U54A 4ZJVA 3DJ5A 3EN9A 3Q60A 2BILB 3T3VA 2WHBA 4ASXA 4DITA 2H34A 4DFLA 3Q4CA 1TKIA 4YLJA 4HNIA 2ITVA 2C47A 2UZEA 3C4ZA 4MWHA 4P2KA 1H1PA 4RT7A 3D5XA 5IUGA 3UYSA 2YM3A 4KNBA 4MNFA 3TNWA 1O6KA 5FEEA 3HEGA 4KIPA 2DYLA 4DLJA 4CLIA 4YJNA 4FVQA 5J79A 5CX9A 1OM1A 1Y91A 4QMNA 4FVRA 3SOAA 2XF0A 5LARA 4CRSA 4OAUC 1XQZA 3NRMA 4AZFA 4JAJA 4D2WA 2XK6A 1OL2A 3Q5IA 1JPAA 2BRNA 1UNGA 3OROA 4L53A 1KOBA 4W4XA 3IOPA 2X7OA 4UBAA 4O38A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UMPA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations