4UMP | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	97
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4umpA00

2WTDA 3RM7A 3PP1A 4FF8A 3CBLA 3MI9A 4R6VA 5LMAA 4GSBA 3U4UA 1Y8YA 4G1WA 3UGCA 2E9UA 2R9SA 2HZIA 4GYGA 2OZOA 5H2UA 4JIKA 5FXRA 3Q32A 4C36A 1MRYA 4BBMA 4NM5A 4QMNA 4OTQA 3AG9A 3AQVA 3MY5A 3SXFA 3ORMA 1Y8GA 3TIYA 1ZYCA 3R00A 5CF6A 3TNPC 5F20A 3E3BX 3DBCA 4XYFA 5CVFA 4FSTA 4XHKB 2XKDA 5TO8A 2W1EA 2W1CA 1WBSA 4GG7A 4Z7HA 2BVAA 2ZVAA 2XNOA 5HICA 2C0TA 3DBEA 3IGGA 4KIKA 4CZUA 4WNPA 4K18A 3Q52A 3UPXA 5IEYA 3UIMA 5JQ8A 2HK5A 2ITPA 2JKQA 3GCSA 5HU3A 4IAFA 5CQWA 3EQCA 1M2QA 4PF4A 3PJ1A 1OM1A 4NJ3A 5B2KA 4S33A 2OBJA 4FNWA 1KE9A 2XNBA 3D2IA 4G3FA 3UDBA 4BCOA 3I79A 1GIHA 5E8YA 5AP7A 3TNHA 4ERKA 5M51A 3A4OX 1H0WA 3FPMA 3FAAA 3LCKA 3VS6A 2W0JA 2BR1A 3OY3A 2XJ2A 1BI7A 4GUEA 3UVRA 2IJMA 3I7CA 4E1ZA 5CF4A 1H1RA 2BDFA 4AE9A 4J96A 4BDGA 3U8WA 4PMMA 4CD0A 3QU0A 2E9NA 4KINA 5HG8A 3ZRMA 1Z9XA 3T8OA 4YU2A 2YCRA 3ZSHA 2X39A 5L6PA 4UV0A 2C3LA 2RIOA 5CEIA 2GNIA 4JAJA 5EYDA 4FTAA 4GIIA 5D9HA 4F64A 4DEAA 4Y85A 3R7YA 5BMSA 3KRLA 4L7SA 4ACHA 4DFNA 3TV6A 3HEGA 2E9PA 2WMQA 1VEBA 3FE3A 3KF7A 2VTQA 4TPTA 3FL5A 1PXLA 4DH7A 1OL1A 3BQRA 4CLJA 4Z3VA 5ANEA 4U3ZA 4BDIA 2V62A 3BEAA 4RIYB 3A60A 4X3FA 4YZDA 5EI8A 5HO8A 2WKMA 3ZU7A 2CLXA 3R6XA 4I23A 4FTOA 1Z57A 2C6TA 2WZJA 3H30A 3IGOA 4WRSA 1UU8A 4FOBA 5CXHA 3BGZA 4ZK5A 5BX0A 1PXJA 4U6RA 3D7ZA 3UIBA 4B6LA 5GZAA 2XBJA 5F1ZA 4TW9A 5KCVA 2OXDA 3DLSA 2YIWA 4FVRA 4QQ5A 4BCKA 4PX6A 4CFNA 2WFYA 4JBOA 1I09A 3ORPA 4RIXB 3WOWA 2XNNA 3QTSA 4FT7A 3CPCA 3DK6A 4IB1A 5IEXA 1RJBA 4JG6A 4M3QA 4TXCA 2BALA 4I0TA 1Q4LA 4EK3A 3UNKA 1O9UA 1ZMUA 3A7GA 2EUFB 3PG1A 4G9RA 4CFFA 5I9YA 3ACKA 5J1VA 4UEUA 4EH2A 1YXTA 3BGQA 5ETAA 3BV3A 3RI1A 3TJCA 2BIYA 2XA4A 4AGCA 1SZMA 4X2GA 4DGMA 3VW8A 3OEZA 5IDNA 1Q8TA 3MIAA 4RVTA 4YNEA 2UZNA 2I1MA 2EVAA 2PVHA 3NGAA 4BCQA 2VAGA 4MCVA 1WBVA 3QCQA 4LV8A 3D5XA 3WF8A 3UYSA 2WMAA 4YGAA 3TUCA 5EI6A 1ZOGA 4UBAA 4Y83A 4JIAA 4WT6A 4EK6A 3CC6A 3ETAA 4BZOA 3A7FA 4F6SA 3SW7A 4JDKA 4ZTLA 1KOBA 3ZO3A 4R7HA 4JBVA 3DFCB 4YJSA 3CJGA 3UO5A 2OJJA 4DFLA 1XWSA 4N70A 4KS8A 3NAXA 4EI4A 1Z5MA 5LMKC 5GNKA 3LAUA 4ASDA 3JY0A 3NZ0A 4HNIA 4PMPA 4WUAA 3EN7A 5IDPA 2X1NA 1KE6A 3AC8A 4OT5A 1M52A 3BCEA 4Y95A 4K9YA 4CFUA 4BF2A 4DC2A 3D94A 4ARKA 3LFBA 3FL4A 4PP7A 4LQMA 4J71A 3HMOA 1KWPA 4DBNA 2C5NA 4QD6A 3I7BA 3LFQA 3OZ6A 1B39A 1XQZA 3V5QA 3WF9A 4WD5A 5JFWA 4ANMA 4F4PA 4RX8A 5D41A 4ENYA 5IZFA 5KX8A 3R8LA 3OD6X 5M44A 3FLWA 3S00A 5AUYA 2XEZA 5FQDC 4GIHA 5LJJA 4KA3A 5D10A 3VO3A 3PRIA 5GJDA 3ZEPA 3EL7A 5LVNA 2OICA 5T68A 5J8IA 2NRYA 3R9NA 2WTJA 1XKKA 3NUSA 3QYZA 4JAIA 3OBGA 4ZLZA 2W5AA 3RAHA 4D4YA 4X0MA 5J9LA 1J91A 4ZJVA 1YHVA 3VN9A 4C0TA 4EHZA 3WZUA 1E1XA 3QTIA 5G6VA 4ONAA 5HO7A 4XOYA 5DR6A 2OWBA 3TL8A 4I93A 4EK8A 2C3KA 5IA2A 3F5GA 4U7ZA 5EDQA 5A6OA 5CALA 2BRHA 3TKUA 2JIUA 4MXAA 3LFFA 4OUCA 4U0IA 1M7NA 3CP9A 4IWOA 3R1YA 5CLPA 3TTJA 4FV2A 3L8SA 1YKRA 4IE9A 4UY9A 3IK3A 1PYEA 5CYIA 5CSWA 1H4LA 4KABA 4D2WA 5D7VA 5ANGA 4ZTMA 5C8KA 3QLFA 5KO1A 1SNUA 2B9FA 3E62A 3PY3A 2YABA 4NCTA 3FZSA 5CSVA 3D14A 2JFMA 3PJ3A 3IG7A 2OZAB 1O6YA 3FMNA 4NEUA 3LZBA 4KSPA 4YLKA 2UW4A 5DG5A 4ZJJA 4ANNA 1U5QA 4E5AX 5J7HA 3MPAA 5A4LA 2B55A 3PA3A 2PVJA 2BZIB 2VWXA 1TVOA 3G0EA 4FKOA 4PL4A 3SQQA 3T9TA 4DEEA 3FHIA 3PE1A 3EB0A 3QRJA 2VUWA 3BE2A 3L9PA 1Q8WA 3BLRA 3ORKA 3RWPA 1JKKA 2CN8A 2XJ0A 4ACDA 4IMYA 1E1VA 1P2AA 4E8AA 4ANOA 2W1DA 3OT3A 4NKSA 4EEVA 3GOPA 3EFWA 2XYNA 4MQ1A 2VGPA 3GC7A 3HMMA 4IC8A 2EXEA 3PVUA 4BZDA 2XZSA 5KNJA 3SAYA 1T45A 1JPAA 3PVGA 4XOZA 3MA3A 4PRJA 4ZTQA 3F66A 4L44A 5CAOA 4TNBA 4XCUA 4YJUA 2Z7RA 4CFVA 1OKWA 3EQIA 1UNGA 2HZ4A 3II5A 3NCGA 5IMXA 1OMWA 3CJFA 3ZRKA 5AUZA 3I5ZA 4A4LA 2Y4PA 4H36A 4YZ9A 2VN9A 4XP2A 2KTYA 2WIPA 3VULA 1T46A 4DEDA 3E63A 4DFZE 5BVNA 2P0CA 3QQHA 3KFAA 3ACJA 4RJ7A 4RJ5A 4QP7A 4EZ3A 3P4KA 1CKIA 3F88A 4FKQA 4GU6A 5BMMA 4PNKA 3E88A 4WHZA 2J90A 4MBIA 4ASXA 4HVSA 5K3YA 3IW6A 3DBDA 2FH9A 4G2FA 3ZXTA 3FMJA 4GJ3A 2LAVA 3T3VA 4RQVA 4HNFA 1H27A 4NM3A 2QLQA 4FV5A 5HCXA 2QG5A 3R8VA 3C13A 4RFMA 3O2MA 3ZSGA 4IX5A 3UO4A 2NO3A 4GVAA 3C4FA 2X6EA 4RG0A 2W06A 5I9ZA 2W17A 4PL3A 3ZUUA 5TE0A 4CKJA 3KU2A 4E6CA 1BMKA 3SV0A 1OVEA 2QHMA 3MB6A 3NW7A 3DKOA 2I0HA 2ZB1A 4TL0A 3B2TA 3FMEA 3LJ0A 5AUUA 2C47A 4C4EA 4M12A 3RVGA 1H8FA 2X7FA 3EN4A 5J9YA 3RAIA 5CSPA 4Y46A 4USEA 5EOLA 4K6ZA 3GUBA 4D5KA 4LOPA 3ZCLA 4AG8A 4S2ZA 4M69A 3ZO4A 2OF4A 2RFEA 4E7WA 3HMIA 5HO6A 4YHJA 4L67A 4BWKA 3ZONA 5HNGA 5L6WL 4AUAA 4YJRA 5E1SA 2G01A 3SW4A 5L2WA 2CGXA 2XM9A 4C4JA 2JKKA 3H9FA 3HMNA 3UOJA 5E8WA 3ANQA 4TWCA 2JBPA 3GENA 4C4FA 2CPKE 4NJDA 4RX5A 4EUUA 3L8VA 1QL6A 3QLGA 3PPJA 4L46A 4W4YA 4R3CA 2YEXA 4RIWB 4ZSLA 2GHLA 4OT6A 4ZAUA 3SA0A 2HW7A 1DAYA 4X2NA 4BYJA 2YIRA 5I9UA 1FMKA 1BL7A 4EJNA 1YXXA 3UG2A 2G1TA 4GJ2A 1ZWSA 5ANDA 5CEMA 3AD4A 2WB8A 2QURA 4F9BA 2YM8A 4X2KA 4BDCA 2YM4A 5DEYA 5KKRC 2HXQA 4GT3A 3UMXA 4E5WA 5TOZA 5C01A 5K4IA 4G9CA 5AP6A 4BCIA 2W05A 4WNKA 5DHJA 4YJTA 2H9VA 4U3YA 4CKRA 1QMZA 2B7AA 2OG8A 2W99B 2XK6A 3UQCA 3F3UA 3FMLA 4FIGA 4V04A 3UYTA 3VBXA 3QGYA 4FTRA 2PZRA 4BTJA 3GEQA 4P2KA 3A4PA 3LIJA 1YQJA 3Q4UA 4U97A 4FV9A 1JQHA 2J5EA 2X4ZA 2VGOA 1CKPA 1V0PA 3NSZA 4QPAA 2YCQA 5HCZA 4H1MA 4UWYA 2C69A 2UZWE 2YISA 3V6RA 2X4FA 4J97A 5CAPA 3P7AA 4PTGA 4II5A 4KIKB 4EOPA 3UOLA 5HIEA 1OITA 4O96A 5I9VA 5BVEA 1R3CA 4K77A 1Q97A 4KNBA 5FP5A 4F7LA 4D1XA 5LQFA 2W1HA 3OTUA 5AP1A 2QHNA 3RZBA 4RIYA 5IF1A 2J0LA 4M97A 2IVVA 3OT8A 2C6LA 5DPVA 5K0KA 2OIDA 4YC6A 4ERWA 1MP8A 2WOUA 3AC5A 2WPAA 4FTQA 2F4JA 4EYJA 2JDTA 4TTHB 4HW7A 1Q99A 3HV6A 5E8VA 3R9HA 4ENXA 4X3FC 1SVGA 4BCNA 3RPSA 4O0UA 4EOSA 3LCSA 1ZOHA 3O23A 2ERKA 2VX3A 4KD1A 3OXZA 2IVSA 5K5NA 3I6UA 3MFTA 4KIQA 4RIXA 4BCFA 3W32A 3WARA 1JSUA 3ANRA 4IZ7A 4PWNA 1TQPA 3VF9A 2OIBA 3Q5ZA 3KXZA 4I0SA 4CT2A 4EKLA 3Q6UA 3QZHA 2QOKA 3F61A 2GFCA 4YJVA 5HBJA 5M4FA 4PTEA 1YHSA 3QRTA 3VS3A 1KV2A 4JQ8A 5ICPA 5IISA 3PIZA 4RJ6A 3LXKA 3QTXA 5E8XA 2QR7A 3PXQA 4G3EA 2BHHA 2WMWA 4FUYA 1SMHA 4TWNA 2NP8A 3E7OA 1XO2B 2X2KA 4FYNA 4AFJA 4X3FB 3ZLWA 3KRRA 2HW6A 3OY1A 1BI8A 1WBWA 4NUSA 4PPBA 2ITTA 4XH6A 3NYVA 1FVVA 4FMQA 4RFZA 4XG9A 4F09A 4K11A 2VX1A 4UZHA 3DAKA 2XK7A 4MHAA 4EYMA 2OJIA 3MSSA 5L2SA 1WBTA 2PVNA 3BYMA 4DLJA 5ANKA 4BGQA 3GVUA 1RQQA 4WG3A 3GU5A 3HMPA 5H9BA 4FK3A 3QWKA 3VBQA 1VYZA 2XM8A 4GVJA 4HOKA 3O17A 5F4NA 3ORIA 4I5HA 4ASEA 1V0BA 3ZDUA 2UVZA 4NIFA 3VJOA 5BNJA 3NIEA 2C6OA 5EYCA 2QODA 2BZKB 2BZJA 5HESA 3OWJA 3P7BA 3QHRA 4FNYA 3W16A 2JLDA 3CLYA 3MA6A 4BFMA 4IXPA 5BVKA 3KRJA 2XK3A 3M42A 4YBKA 3ZDIA 1ZLTA 1U46A 2G2IA 3EKNA 2IVUA 3O8UA 3MFRA 4Q5EA 5IH4A 4IWQA 5HE2A 4NU1A 3ZTXA 3MS9A 1GAGA 2RFNA 2C5XA 2OK1A 1U54A 5K9IA 4CV9A 3LHJA 2A0CX 3R7GA 1CKJA 3HV4A 5AA8A 4YTIA 3RKBA 3HUBA 5CEOA 4NT4A 1NVSA 3PSCA 3R2YA 4MF1A 2UW7A 2O5KA 3JPVA 3MIYA 4NK9A 3QGWA 4QTBA 5DMZA 4OBQA 4DGOA 5AM7A 4FZDB 3R0TA 3UMWA 4CEGA 4DEBA 1H24A 1ZMWA 4HYSA 4WOVA 4YBJA 4C62A 5AV3A 2R7IA 3TIZA 1LEWA 2WELA 5AWMA 3Q9XA 5HU9A 2XNEA 5AUVA 4APPA 4ZTHA 5E8TA 5JGAA 4MK0A 2PWLA 3RMFA 2OI4X 3C50A 1V0OA 3U9CA 3ZM4A 4D1SA 4CXAA 4RVKA 4HVDA 4I5CA 2BCJA 3RCJA 1Y91A 3OW3A 5HVYA 3NX8A 4C59A 5JRQA 3P79A 5KMLA 4XG2A 4XRLA 3R2BA 4C4HA 4A06A 2YAKA 3QUEA 2Y9QA 2YDJA 3PVBA 4KBCA 4OTIA 4BTKA 4FV3A 5HIDA 4XP3A 2C0IA 2IO6A 3OCGA 4J1RA 5CI6A 4BDJA 4MAOA 5LMBA 1W8CA 3OC1A 1YWVA 1YI6A 3SX9A 3QALE 4FV0A 3QCXA 4NCTC 4GEOA 4O0YA 4OBPA 1M2PA 3BHTA 3MY1A 4IANA 4JG8A 1M7QA 3KKVA 4UMRA 4GFOA 4HVGA 2CCIA 4NZWB 3PYYA 4MF0A 4KRCA 4QTDA 5ACKA 3TKHA 3IECA 3QC9A 4U44A 3R21A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UMPA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations