4UMP | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	97
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4umpA00

2PHKA 2XK8A 3HMNA 2C4GA 3HRCA 4IANA 2YACA 2O5KA 4X7QA 2XNMA 4G16A 2OWBA 4FUXA 5TKDA 1NVQA 3ZSGA 2P2IA 5IPJA 2VTAA 3VS5A 1BI7A 2WTIA 3GCVA 2X7OA 3PSCA 3FC2A 4NW6A 2W9ZB 5BYZA 4F64A 1U46A 3KRJA 4O0TA 4EBVA 3G6HA 3KU2A 3E3BX 1Y91A 4GK3A 5HBJA 3TTIA 3MPAA 2QHMA 3Q60A 2B9IA 3KCKA 5B7VA 4GYIA 4CXAA 4L8MA 5CANA 3OCBA 4MQ1A 4G3DA 2G2FA 4LGGA 4O0VA 2BMCA 3EYGA 4QD6A 4AW2A 4AW5A 1QPCA 2OI4X 5KBRA 4J1RA 4RVMA 1V0PA 4E7WA 4O0RA 3L8VA 4IACA 3KQ7A 3CTQA 2I6LA 4I20A 1KE5A 1Q3DA 2O3PA 2P4IA 4QMTA 4PL5A 3EIDA 2JEDA 1ZOEA 2R3PA 5CSHA 2QOIA 3POOA 1UU3A 2GNHA 4HPUE 1UWJA 3FBVA 4UX9A 1GZOA 4IAKA 1RE8A 5HD7A 3Q9YA 4DAWA 1P2AA 1SMHA 3MFSA 4CVAA 2J7TA 2UZUE 4QP2A 4FA2A 4A9UA 3I0OA 2NRUA 3G2FA 4FSYA 4L3PA 5BMMA 3VS0A 1URCA 3FY2A 3HYHA 3MWUA 2OJGA 4KBAA 1U59A 5IZFA 2J50A 3DKOA 4B9DA 3R21A 5GJGA 4BGQA 3ZUUA 2JKMA 3DQWA 2OU7A 5K4JA 2YIXA 5IEVA 4GFGA 4JBPA 4RVLA 5TF9A 3JVSA 3ODZX 4TWCA 5KHWA 4FTLA 2UVXA 5CF6A 1H01A 3CEKA 1AGWA 3HKOA 4LGDA 1W82A 5HGIA 4GYGA 4QP1A 4UZHA 2XA4A 2WAJA 3QALE 3MFUA 2CCIA 2PTKA 2FSLX 3HVCA 2X0GA 4FTTA 3OF0A 2QLQA 4RWIA 4WSYA 1Z9XA 5IMEA 4GG5A 4F6UA 4NZWB 4FOCA 2W1CA 2JIVA 5EOBA 4QTEA 1TVOA 2VTNA 3W33A 5CALA 4ZTSA 3E8EA 3O8PA 2Y4PA 3MY0A 2RFDA 5D11A 3POZA 4J7BA 3ZBFA 2WNTA 1WBOA 3TL8A 1S9JA 1YDRE 3QCXA 4QMNA 1HCKA 2ACXA 4UN0C 5KX8A 5KE0A 4OTRA 5I3RA 3V01A 3LIJA 4AFEA 4IDTA 4C8BA 1TQMA 5JFXA 2OO8X 4F7SA 1V1KA 1ZZ2A 1ZWSA 2FH9A 4GCJA 4OBOA 5L8KA 5AP4A 1B6CB 5CT0A 4F9BA 1H25A 5I5ZA 2XRWA 1RW8A 3EHAA 5B2LA 3D7ZA 3GB2A 4UWYA 5EM8A 5AP5A 4ZTHA 3FKOA 5LWNA 4LV8A 4QMVA 1CSNA 2WTVA 2OF2A 3D83A 2ETKA 4LL0A 2PVFA 3Q5ZA 3NDMA 4GW8A 3A7HA 4QMSA 5KMNA 2F4JA 3LM5A 3IGOA 2WELA 3V8SA 2PE1A 3FI4A 3RK7A 4OTDA 3WF5A 4CT1A 3BGPA 5EI8A 3BLHA 5IF1A 3P7AA 2WKMA 4ENYA 2W96B 5EYKA 2OH4A 3C50A 4GUBA 3BBWA 3OD6X 3GCQA 3RP9A 3TT0A 4FODA 4ALVA 5A46A 2JKQA 4FYOA 3UNJA 2R3RA 2F7ZE 3BPRA 3PXQA 3A8XA 4YJVA 4FZ6A 1JNKA 3P5KA 4DGOA 4IX5A 4IX3A 3UZTA 4U45A 4PMTA 4BDEA 1YHVA 2I0EA 4F6WA 4O1PA 3L8PA 4JRNA 5F20A 4ONAA 3QUDA 3BHUA 3U6JA 2ITWA 2CCHA 5C03A 2C5XA 4K77A 4RJ6A 4UXQA 2V55A 5J7HA 4D4YA 4OT6A 2VGPA 5DIAA 3S2PA 5CT7A 3QYWA 1OITA 4YJOA 2QOKA 4BZNA 3WIGA 4L45A 5ETAA 4BGHA 4DEDA 2VUWA 5GZAA 2RG5A 3P08A 3W2RA 2VWIA 3NCGA 3D94A 4IWDA 5DLSA 4C7TA 2R4BA 4MYGA 5E8VA 4BCKA 5KUPA 3R8ZA 2EVAA 2X7FA 4CFMA 3FZTA 2BUJA 2WTCA 3SRVB 5BUJA 3AC4A 4K9YA 4YZDA 4BCMA 4L01A 1XWSA 4GT4A 4AGCA 4FI1A 4DFYA 1Y8GA 5CENA 2RFEA 1OL7A 5AR3A 3ZEPA 3LW0A 3ZSHA 4O6EA 4CTBA 4TYJA 4OAVB 2IZTA 4D9UA 4JXFA 3DJ6A 3RTPA 4Z55A 3UVRA 4WBBB 4FTAA 4CRLA 4NJ3A 1UNGA 2FUMA 2J5EA 4FTOA 1A9UA 3V51A 1PMEA 5LMKC 4M97A 2YWPA 5FM2A 1REJA 2IVTA 4JBQA 3M11A 4I21A 4F70A 3GOKA 2VRXA 5AR4A 3NUNA 4CFUA 3BYSA 4BKJA 4D2TA 2W1GA 4JR7A 4EWQA 2ERKA 5AUVA 4U41A 3T3UA 3PXFA 1YWVA 5BVOA 4OBQA 3L8SA 3VS6A 1OPKA 2Y4IB 2JDSA 3KXMA 3V5QA 3OOGA 4XP3A 3RPSA 2W4JA 3KMMA 2H34A 4W4YA 4KIKA 3E88A 4EOLA 1O9UA 3CCNA 4FIHA 5EOLA 2A19B 1SVGA 2V22A 2YISA 3MY1A 4XHKB 3WF8A 2F7XE 4ANBA 3RZBA 4CEGA 4IADA 3QTRA 5E1SA 3MB6A 4DG3E 5K0KA 1Q61A 5G1XA 4D0WA 5M4CA 1PYXA 1Q62A 5E8ZA 3ZONA 5AAGA 2HZIA 3EZRA 4J8MA 4DLJA 2OGVA 4S30A 3DDPA 1CKJA 2VWZA 3QX4A 2EUFB 4QP3A 4QQ5A 5IUGA 2CGUA 2P0CA 1WBWA 1I44A 4O2ZA 2I1MA 5L4QA 4I4FA 4UV0A 4MHAA 4QQJA 5H8EA 3LOKA 4BHNA 3B8RA 3HA6A 4E6DA 3AMBA 4K1BA 4TT7A 4UWBA 4F0FA 4R7HA 4C3RA 1ZMWA 2RKUA 3O8TA 5HE1A 2WGJA 3TNHA 3QWJA 4TYGA 2WO6A 3QXPA 4FTKA 1XH4A 4A06A 3KF7A 1XBCA 4E26A 5JN2A 1HOWA 3QKKA 4CFVA 3AC3A 5AAFA 4AX8A 5HQ0A 4FVPA 4QTDA 3FZ1A 4QQCA 3EKNA 4NCTC 5DNRA 2VO7A 3PXRA 4L67A 3UDBA 2C6LA 4I94A 4NKSA 3S3IA 4A07A 4A4OA 1JOWB 3F3UA 3BHYA 2BFYA 2JAMA 5I4NA 5EK7A 5HLWA 4ZJJA 2C0OA 1M2RA 4MXYA 5AP7A 4APPA 3V04A 1F3MC 4J71A 5HNIX 3FV8A 3ORZA 2UV2A 4LMNA 3HP2A 4YZMA 4RFMA 3BLRA 4PF4A 5KZIA 2A0CX 5CXHA 4XCUA 4FTUA 4O6LA 2H9VA 2ZMCA 4E6CA 4EH8A 5JGBA 2YIWA 4D4VA 4U43A 3RK5A 3W2SA 2IW6A 4JQEA 3QRKA 4YLJA 4FV7A 4QYEA 4Z3VA 5K9IA 3MGYA 3DNEA 4JG7A 3U4UA 4IZYA 3DXNA 4WHZA 4PRJA 1GIJA 4Q2AA 3PA4A 2R0UA 1XH8A 2ESMA 1DS5A 3CQEA 2WU7A 4YZCA 3T9TA 2XCHA 1JKKA 3EQCA 4LRJA 3MFTA 4ZY5A 2I40A 3HV4A 2WEIA 1WMKA 2BVAA 2ZVAA 3AT3A 2G9XA 5AM6A 4PMSA 2XVDA 3OXTA 4ANQA 4AA5A 4IB0A 3VJNA 4AE6A 4NM7A 4RX9A 1AD5A 5K5XA 5AIKA 5AV0A 3BRBA 3A4PA 5FDPA 5J5TA 2R0IA 3TCPA 4ITHA 3R8VA 4QTCA 3AT2A 4KIKB 4D4RA 4GIHA 4JBVA 2W99B 2QLUA 2X39A 4IC7A 4CQEA 2YIRA 2KULA 4MD8E 5D41A 4V04A 2PMNX 4FKRA 1PY5A 2XK7A 4W4XA 3RHXA 2GTNA 4DTKA 2JAVA 4ASEA 3HV5A 4XP0A 3JS2A 3VBXA 4AN3A 1WZYA 1OKZA 5KNJA 2C30A 3HX4A 2X9EA 3NX8A 1FQ1B 2IVSA 4ID7A 4C3FA 5KMMA 1JKTA 2BZHB 4IBMA 3WZDA 4QPMA 4JR3A 4EH3A 5L6PA 4OTWA 4JIAA 3ENMA 1J3HA 4I23A 4D2SA 3RHKA 3AMYA 4NM0A 1YXVA 1URWA 3NWWA 4PMPA 4C61A 4RA4A 4FV9A 4IZ5A 2W1ZA 2GHMA 4GG7A 3ZLXA 2CGWA 4AOIA 3ROYA 2CKEA 2HXLA 4DEIA 4PP9A 2CGXA 3U6IA 1JWHA 4FKIA 4IIRA 4OTFA 4AF3A 1BLXA 5GNKA 5LXMA 4EHGA 4FUYA 3OROA 4JG6A 4RVTA 3BKBA 5D10A 5AR2A 3WIKA 2J0MB 4I92A 4FZFB 2HELA 5HD4A 5J9LA 2HZ0A 4TW9A 3WYYA 5BVNA 1Q8WA 4L6QA 5LARA 2YCFA 4NJDA 4XYFA 3COKA 5A4EA 3LFSA 3LFQA 5LWMA 3DAEA 4BCQA 5C26A 2WMQA 3RM6A 1UVRA 1F0QA 3QQFA 1R39A 4F7LA 5AUXA 1NVRA 4L44A 3SX9A 3EJ1A 3PP1A 4HNIA 2ITVA 1P5EA 4QRCA 3KEXA 2A27A 4ACGA 5FEDA 4FV8A 3V5JA 5HNBA 3ZZEA 2B52A 3K3JA 4H1MA 4ZSEA 2BKZA 3PXKA 3BEGA 2OICA 4XS2A 2PUUA 2XJ1A 3PIZA 3VRYA 4RLLA 3ZUVA 4NFNA 1SM2A 1QPJA 3S00A 1JPAA 5M4FA 2WMRA 3F82A 2QQ7A 3QF9A 3QC9A 4B4LA 1KE9A 2ZM4A 5DE2A 1YRPA 3BZ3A 2HYYA 3I7BA 5H9BA 2QD9A 3ELJA 3K54A 3MBLA 4ZZNA 3OWPA 4ZXTA 2OH0E 4LOOA 4ZEGA 3EFLA 3GC9A 3II5A 3PA3A 3QGYA 4OGRA 2WMAA 4TNBA 5CSXA 3IO7A 2X4ZA 1UA2A 5CU0A 5EKNA 1OZ1A 4NSTA 4OTQA 5E8YA 2E9PA 3R7EA 4QNYA 5HE3A 2R5TA 3B8QA 2C6TA 4UBAA 4AZWA 4MXAA 2YCQA 2HY0A 4MXZA 3KRRA 4ZOGA 3UOLA 4NUSA 3ZSIA 1SVEA 4LRKA 5ANGA 3CQUA 4DH1A 3WI6A 3MI9A 4OTHA 3OTVA 3FMDA 4TXCA 3NW6A 3BHTA 3G33A 1W83A 3FKNA 4W8DA 1E9HA 2CHLA 2O64A 2B9FA 2GHGA 2J2IB 2OF4A 4BYIA 3UYSA 3EQGA 3I5NA 4G6NA 5HLPA 3EQPA 4D28A 5AV4A 2XBJA 3D0EA 3ZXZA 4EOSA 4ZSGA 4ZIMA 4N0SA 3RM7A 4UEUA 4FKOA 2YJSA 3OXZA 4K0YA 2VTRA 4QYGA 4BB4A 3TV6A 4WA9A 3PJ8A 4O38A 3PP0A 4AUAA 3SKCA 4CMTA 3DBQA 1RJBA 4CRSA 5L2SA 3L9MA 4TWOA 5ETCA 3QYZA 3PY0A 4J96A 3NYVA 5FP6A 1MUOA 1P14A 3LFEA 4RRVA 4PTGA 4O1OA 4ERWA 3Q53A 2G2IA 4R3RA 4GFOA 3OC1A 2B54A 1OL5A 3UPZA 3HMPA 5I9WA 4B7TA 3LFNA 3BYVA 4DGLC 5AJQA 5AMNA 3C1XA 4C2WA 2B53A 4XG9A 2CSNA 4FTRA 1SYKA 2R64A 4YC6A 3L9LA 5EYDA 5I9XA 5BVWA 5H3QA 3CE3A 5K4IA 1KOAA 2VTMA 3C4ZA 2C0TA 2QOLA 3MSSA 4I5CA 4YBKA 5FXRA 2OFVA 3L1SA 4IVBA 5CX9A 4EZ5A 5C8NA 3LZBA 4FR4A 4I3ZA 4PUZA 2Y4IC 4XV1A 5HEZA 4AOTA 5JQ8A 2BDJA 2VWBA 2VTOA 4H36A 3ORLA 4U44A 2VNWA 3O50A 5CU6A 4Q9ZA 3OW3A 4YU2A 1JAMA 1ZYSA 4OTPA 1FINA 4D2WA 3V5WA 3UQFA 3PWDA 5EKOA 5J7BA 3FSFA 2YHVA 1XKKA 4O22A 4TPTA 4R3CA 4TRLA 4YJSA 2XRUA 4B6LA 2BR1A 4I6HA 4AFJA 4IAFA 5JMSA 3NIEA 2R3HA 4F7JA 3SW4A 5CU2A 4JDKA 3VS4A 5A4TA 3R1NA 5ITAA 2ZOQA 2R3JA 3AG9A 3VNTA 5AP2A 5BNJA 4LI5A 4EOOA 5EW8A 5JT2A 2NP8A 3P23A 4A7CA 3PUPA 1JSTA 5HESA 1PYEA 2XM9A 4GVJA 1IASA 2GNGA 4NM3A 2P55A 4BTKA 3SVVA 3TIZA 4OTIA 4QPSA 4CYIA 4I6QA 1OVEA 4BWPA 4KIOA 4BDHA 4X2NA 3C5UA 3RK9A 5BVDA 3UOJA 3ORKA 4IFGA 2X1NA 2Y0AA 4FV6A 2C0IA 1JSUA 5DT0A 4DLIA 3E87A 4C59A 3F3WA 5HG7A 3CIKA 4USDA 3TN8A 4BDKA 5FTOA 3A4OX 3D7TB 4HCUA 2B9JA 5HVYA 4BCFA 1GZKA 3VN9A 3HUCA 1R0EA 4D9TA 1ZXEA 2C5YA 4IWOA 5AWMA 4WD5A 3AMAA 4X6QC 3ZLWA 2IZUA 3BYOA 3RCDA 4YLKA 3BQCA 3UP2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UMPA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations