4UMP | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	97
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4umpA00

4XX9A 3CR0A 4BCGA 3ZC6A 2VTLA 4E4LA 2E9NA 3PA3A 4E4XA 4FI1A 2JITA 4FGBA 4PP7A 3R2BA 1ZY5A 1P14A 1Q97A 2I40A 2ITOA 3OP5A 3R01A 4FNWA 4RLKA 3DDQA 2G1TA 3C0IA 3I60A 3L9MA 1DAYA 3TUBA 5CY3A 1O9UA 5AV2A 2HELA 4C4HA 2BZIB 3CPCA 4ZS0A 5KO1A 3H4JA 5AUXA 4ITJA 3CGOA 2A0CX 4TPTA 5HHWA 1MUOA 5L2TA 3M2WA 4WRGA 3GCQA 3BRBA 2CSNA 3I0OA 3EQPA 4BCIA 3GU4A 5IA5A 4ZLOA 4Z55A 4R6VA 3JYAA 5CT0A 2UW7A 3OD6X 5HI2A 5CU6A 4JQ8A 3IW4A 2PSQA 4FL3A 2XNEA 5CEKA 5DVRA 4EC9A 3R04A 1R39A 2WXVA 4BDDA 2J2IB 5BVOA 2JDOA 4CKIA 2H9VA 5HLNA 3SVVA 2HYYA 3A60A 3V6SA 4DG2E 3NS9A 4E93A 3TWJA 3RAWA 4P90A 1OB3A 5LJJA 5FLFA 3TG1A 2IW9A 4TYIA 4YJVA 4JG7A 3ANRA 5CAOA 1Q8TA 2RFSA 5ACKA 4F09A 3BGZA 2VWUA 4U45A 4D1XA 4F7NA 4FTQA 2FB8A 4XG8A 3HEGA 3CS9A 2CN5A 4MEDA 4JOAA 3WZKA 1IR3A 1OPLA 4KA3A 4IX5A 4II5A 5J8IA 1PXLA 3ZLSA 4RJ4A 2VGPA 3DNDA 4XG3A 5HG9A 3O96A 5M4CA 5JRSA 4YZ9A 3HYHA 5TO8A 4F1MA 1ZYJA 3H9OA 3PIZA 4ZJJA 4APPA 1LR4A 4HZRA 3EN5A 2YCFA 2BKZA 1QPCA 5FTOA 3LFDA 4YP8A 2CLQA 3TNPC 5K5NA 4F6UA 3AC1A 2ITZA 5K4IA 3PVUA 4L7SA 4A9SA 4ZTHA 4F1TA 4NM7A 1E1VA 2W05A 1CM8A 4IAFA 4O0XA 3IECA 3P4KA 1CMKE 3V5LA 2OJGA 3VS5A 4MNFA 2J0LA 3SV0A 2HW6A 4JG6A 4E6DA 5IH5A 3CQWA 3L8VA 2PVNA 3QUDA 1TQIA 3BI6A 4WSQA 4WOVA 3BWFA 1P4FA 3BEGA 4QMQA 5FQDC 3ULZA 3OCGA 5FP6A 3R9NA 3WZJA 4TL0A 5IEVA 1T45A 3RPSA 5CF8A 1RJBA 2ZJWA 3IW6A 5C8MA 4MD7E 3ZDIA 4EK4A 5BUIA 1X8BA 5CALA 3BU6A 2CCIA 4DGOA 3EL7A 2LGCA 3PXZA 5HBJA 4BRXA 4AGUA 4QTAA 3Q5ZA 3FL4A 4EOJA 4F4PA 5EKNA 1UNLA 3P7BA 2W4KA 2WD1A 2VWIA 2WTKC 4XG4A 3ZTXA 1U59A 5EI2A 4BGGA 4BCOA 3DXNA 4JIKA 4NH1A 3ACJA 2BRMA 1JOWB 3A4PA 4J97A 4L3PA 2QOLA 4ITHA 2YIYA 3CKWA 2XK3A 4XG7A 3VF9A 2QR7A 2VTQA 3EFLA 1GZ8A 2VNWA 4PDOA 1Q8UA 3ORNA 5CEIA 4MCVA 3QHRA 4B9DA 4BGHA 4G1WA 4EEVA 4F6SA 3F88A 1Q61A 3F2NA 2FSLX 4F63A 4YURA 3MH3A 4W4WA 4E3CA 5DE2A 1OPJA 2PVLA 2X0GA 3KCFA 4O0WA 5FEQA 4AXAA 2QC6A 2YDKA 3FLSA 5AADA 1WBNA 4FV0A 4V01A 4ANQA 2PVJA 2W17A 4IVCA 3VS7A 3HMIA 1G3NA 2PTKA 5AUYA 1KE6A 1GOLA 2PZPA 1VYWA 4OBPA 5KMNA 3E93A 3PSCA 5DN3A 2BRBA 2GDOA 4FL1A 2XH5A 5AMNA 2QI8A 4TN6A 5BVEA 4U0IA 1BI7A 5J7BA 5JK3A 3CJFA 3WE4A 4IAAA 2OJJA 3MA3A 5AAEA 3FSKA 2BHHA 2E9VA 2YERA 3TACA 2OIQA 2GNGA 4UWCA 2BFXA 5CF5A 2JIIA 4NEUA 3W2OA 3TV6A 2ITQA 5E8TA 2BFYA 4EYJA 3IW8A 4H3QA 5EOBA 3UPZA 1HCKA 4DH3A 2C5YA 1OL1A 2W99B 3UYSA 3QU0A 5T3QA 5D11A 4EH9A 3D7ZA 4D2VA 1CTPE 3I0QA 4XRJA 4FKRA 4CLIA 4D55A 1GIIA 3O23A 3E3BX 4JL9A 4C62A 4EK6A 3AD4A 2YITA 3LJ2A 2J7TA 3Q2MA 5AIRA 3VS6A 4TNBA 3GOKA 1JKLA 2VTAA 3D7TA 2F7EE 4KKEA 3IDCA 3FBVA 1U46A 5FD2A 3U8WA 3OWJA 4CNHA 4QYEA 5JEBA 2CHLA 4IC7A 4XOZA 1MQBA 5CEMA 4F9WA 2I0VA 3ORIA 2PY3A 4W4XA 4OBQA 3HMNA 5CENA 1P2AA 3BHVA 3RAKA 5HG8A 3CC6A 5HD4A 4L8MA 4DC2A 5A4QA 2QOOA 4PWNA 3T3VA 3UOHA 3R1QA 4I0RA 4DLIA 4A9TA 5CANA 1PXOA 2HZNA 4IFCA 2XJ2A 4EK3A 3FMNA 3MBLA 3BYUA 4L42A 3IKAA 4LRMA 4LV8A 5DI1A 3G9NA 3A62A 2XNGA 4JBPA 4LL5A 2WTIA 2OF4A 1Q5KA 3VHEA 4EJNA 1XH7A 2XKDA 1H4LA 4EHVA 5M55A 3F5XA 3GENA 3LFNA 1XH8A 2A4LA 4OAVB 3R2YA 4AA0A 4ALUA 4RX9A 2RF9A 4NIFB 4BIEA 4EH6A 1CDKA 1JSUA 4M84A 2W06A 4CMUA 4CKRA 2IN6A 2X81A 3R0TA 1YWRA 4QQTA 3QC9A 4FKWA 4EH2A 4YZNA 5D41A 5KMJA 5EYMA 4ZLYA 4MHAA 2E9OA 4DTKA 5I9YA 3VBYA 3M42A 3QQLA 1FVRA 2WIPA 5FEEA 3GCSA 4AE6A 5EM7A 5AUUA 2A27A 2QOFA 4LGGA 4P5ZA 5E8WA 3EHAA 5K9IA 3QHWA 4A4XA 4MBJA 2WTCA 2R3RA 5F95A 2R7BA 3NZ0A 4I21A 4AGDA 4XMOA 3RMFA 3FMDA 4DH5A 2WQEA 4XG6A 1UNHA 3ZSIA 2OH0E 4LUDA 5FEDA 4EH8A 5HE1A 1NXKA 4R3CA 1M7NA 4G17A 3QZIA 4YJSA 5BVFA 2W1DA 4MD8E 3D14A 2C0IA 2YJSA 3PVWA 1WBWA 5JGBA 4O0YA 1ZMVA 4BVUA 3Q4UA 5BMSA 4UB7A 5AR4A 5A6NA 4HNFA 4D5KA 2JDTA 4ENXA 4R7IA 5TE0A 1ZOGA 3VBQA 4FTRA 3FLNC 3QKKA 3UP7A 3OY3A 2VWVA 5E91A 5AP5A 2W1CA 3R83A 4C4EA 4L9IA 3FKNA 4GK2A 3P9JA 3LW0A 3E62A 3PIYA 2R7IA 1YKRA 4WKQA 1FPUA 4JR7A 4B6LA 3FZSA 3O8PA 3CIKA 4CFUA 4M12A 5M53A 5ICPA 1GJOA 3WI6A 4DFNA 3LFFA 3II5A 4IAIA 2C1BA 3CD3A 3T9IA 4I24A 4AZFA 3IOPA 3MN3A 1UKHA 4KKGA 1ZOEA 5CZHA 1OMWA 2GPHA 4BFMA 5LQFA 3ETAA 1O6YA 1VJYA 3G6HA 1NVQA 3A7FA 5EOLA 2GTMA 3HZTA 1H1WA 2ITWA 3WF6A 5ITAA 4O91A 2J5EA 3VQUA 2CDZA 2OZAB 3LAUA 4ANOA 4M15A 3B2TA 3EFWA 4QRCA 3EZRA 3WARA 2FA2A 4WNOA 4BZOA 5J9ZA 3R8VA 4YPDA 5FWKK 5J5SA 2YLFA 1SVEA 3QCYA 3QQUA 3F66A 3HA8A 3L9NA 4L43A 4RIXA 5GNKA 3KC3A 1FVVA 3U9NA 3EN7A 4WBOA 5I4NA 5ETCA 3L8XA 5E92A 2NP8A 4QMOA 5KCVA 5J1WA 3KXZA 3F7ZA 4L6QA 4QP8A 5DR2A 4OTDA 2RG5A 5HIBA 2VWBA 5HE2A 2C1AA 2ESMA 2HY0A 2ZDTA 1QCFA 2XVDA 3DB8A 4HGSA 2ETRA 3R00A 4ITIA 4IWDA 4LRKA 4YC6A 3ZO3A 4IAKA 4E7WA 5ACBC 2R3MA 3C13A 4PUZA 4RLLA 3ITZA 5C27A 2CGVA 2JDRA 4BDBA 2C6TA 3NGAA 3EIDA 2ZDUA 2W9FB 2YM4A 2YJRA 3IGGA 4QMXA 4CZYB 2FGIA 4RT7A 5J87A 5FTQA 3KXHA 3G0FA 3VW8A 4AU8A 4F9BA 2R64A 4OLIA 3FZ1A 2OK1A 3ANQA 3GFWA 4TYJA 3U6HA 3DCVA 3ZOSA 4FG9A 3DJ7A 3DY7A 2VX3A 3NWWA 4B4LA 3BBTB 3ZMMA 3IOKA 5JQ8A 2VWXA 4NWMA 4ZY6A 2YAKA 3R7EA 2F49A 4IB3A 2WELA 1BX6A 4PPAA 3ORTA 3JY9A 4M0YA 4XG9A 2J0JA 3F5PA 3ZYAA 4RRVA 2CPKE 5EM8A 1PXIA 3BBWA 3HDNA 2O5KA 4O2PA 5K4JA 5J9LA 5L2IA 2IZRA 4X2NA 3BV3A 2O63A 4XNEA 2QOIA 3KF7A 4GG5A 4MXZA 1U5RA 2CGWA 2QNJA 4GVAA 4I5MA 5JZJA 4PMTA 3U4WA 2UW5A 4RG0A 4TYHB 4FTMA 3I79A 3DDPA 3R8PA 2PWLA 3LCDA 3OWPA 4WNMA 3H0YA 5AR5A 2ITUA 2QODA 3GCPA 1OL6A 1WBOA 4ANLA 2C3JA 3V5QA 4AW5A 5I9VA 1GY3A 3FJQE 1W82A 1YRPA 3I4BA 3DZQA 1Y8GA 1SMHA 3UBDA 4I41A 4IWPA 3QA8A 4LOOA 2DUVA 4NM0A 4AA4A 3S1HA 4AACA 2BR1A 4CCBA 5CAQA 5HE0A 3VW6A 5JGAA 3DFAA 3GUBA 5B0XA 4XG2A 2XA4A 2Y4PA 1LEWA 2C0TA 2QOCA 3AT4A 3MPAA 4U81A 5AP6A 5CNNA 2IW8A 4K11A 2GNHA 3MY0A 5E8SA 3W32A 4BN1A 1S9IA 1U54A 2WQOA 4QP1A 2WHBA 3PVGA 1Q3DA 2G9XA 3BHYA 1M52A 2GS2A 4IB0A 1CKJA 4K18A 5BVDA 4FK3A 4GT3A 3ODYX 4YJTA 3W2RA 3V3VA 4B8MA 3R7YA 4OTIA 5A6OA 4UWYA 4XP0A 4YZCA 5E90A 4XV1A 4EQUA 2BALA 4I0TA 4RWKA 3FQEA 5TF9A 4BCPA 4EZ7A 4NT4A 4XH6A 3FLZA 3IG7A 5AUTA 3EOCA 4K33A 2HY81 4GFOA 5CX9A 2XEZA 1UWJA 2YCSA 4FTNA 4KS8A 4IVAA 2UZBA 2WTKB 4DH8A 4U42A 4ANMA 2W1FA 3NLBA 1B38A 3O51A 3OVVA 2WQMA 3WIGA 3K3IA 4RIOA 2GU8A 2GQGA 3MTFA 3I5ZA 3ULIA 2W96B 4KSQA 1XR1A 3LOKA 3PP0A 1H1RA 4IQ6A 4HJOA 4AS0A 2YHVA 3FLWA 5AA8A 3E87A 3KQ7A 2WEVA 3EQIA 3RM7A 1OKZA 4A4OA 3QRKA 5HTBA 3EQRA 2BAJA 5HIEA 5AP1A 3RBWA 4FV9A 3ZC5A 3F6XA 5A3XA 2EVAA 4QMNA 2W9ZB 3IW5A 4I93A 3A7IA 2ZAZA 3MA6A 3WYYA 3OFMA 4JX3A 3K2LA 2I0YA 4O0UA 4KRCA 2GNLA 1P4OA 4U8ZA 4CMOA 3IDBA 4L3JA 4R3RA 4UXLA 2CJMA 4QMSA 4F0IA 1IASA 2UZEA 5DA3A 4CEGA 4C58A 3OEZA 1QPDA 3C4EA 4FT3A 4ZZNA 3BLQA 4HCVA 3LXPA 5LVLA 5E8XA 3ELJA 2QOHA 4MD9E 5AX3A 3BLHA 2O3PA 4EOPA 5IUHA 2OO8X 3QD2B 2F9GA 1PYXA 3PA5A 1PXJA 4UYNA 4FV3A 3U6JA 1IG1A 2HAKA 4CSVA 3GT8A 3FI2A 4JDHA 2C5NA 4NFMA 5GJDA 4BI1A 3MPMA 3W16A 1WVXA 1DI8A 1OGUA 1OKYA 4MNEA 4C3RA 2WZJA 1FMKA 2XJ1A 1YVJA 5HORA 4XUFA 2P0CA 4C4FA 3TV4A 5K5XA 2I1MA 3F3UA 3UP2A 4D28A 4Z7GA 3MIYA 1Q4LA 4DG3E 3KA0A 4UXQA 4YLLA 4YJQA 3TNHA 3TZ9A 2C5VA 3O8TA 4FIHA 3C5UA 3BU3A 4B8LA 1OVEA 4L53A 4IANA 5LVPA 2UV2A 4JXFA 3GFEA 4ASEA 3HLLA 3CXWA 1KV1A 2H8HA 3FMLA 3G51A 3R1YA 3RP9A 2XM8A 4ZJIA 2EB3A 5CT7A 4DH7A 4F64A 2Z2WA 1REKA 3KVXA 4G2FA 3SW7A 4XEYA 2XS0A 1Q8WA 2OKRA 3Q5IA 2JFMA 4XRLA 3W8LA 3HP5A 4C37A 4MXXA 5KHWA 3NUNA 3FMJA 4NZWB 5H9BA 3MJ2A 4W4VA 3ZLXA 1OIYA 4Z3VA 4EH4A 2XCKA 2J51A 3RCDA 3F2AA 2I6LA 4GU9A 2F7ZE 4QMMA 5H8GA 3DBDA 3NNXA 4NTSA 4I6FA 3ZZEA 4A7CA 1L3RE 3ZO1A 5BPYA 3DQWA 3MVLA 3DBEA 3R8ZA 3W2SA 2OJFE 3CBLA 4DGGA 4L7FA 2X6EA 4GCJA 5CS6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UMPA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations