4BFMA

The crystal structure of mouse pk38
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
330
structure length
313
Chain Sequence
KDYDELLKYYELYETIGTGGFAKVKLACHVLTGEMVAIKIMDKNALGSDLPRVKTEIDALKSLRHQHICQLYHVLETKNKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQILSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDENHKLKLIDFGLCAKCGSLAYAAPELIQGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYEVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMRNLLNHPWVMQDYSCPVEWQSKTPLTHLDEDCVTELSVHHRSSRQTMEDLISSWQYDHLTATYLLLLAKKARLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structures of the Kinase Domain and Uba Domain of Mpk38 Suggest the Activation Mechanism for Kinase Activity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
molecule keywords MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus 95
structure length 313
sequence length 330
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bfmA00
2GFSA 3Q04A 5CASA 4AW0A 3F2NA 4IMYA 2XNMA 4MBIA 4BGQA 3NR9A 4APCA 4RIWA 4TNDA 2PTKA 4K8AA 2CGXA 2CCHA 4TKSA 3LCOA 5D12A 5M57A 5K0XA 1CKPA 2GTMA 3UC3A 5TKDA 3IDPA 3L8SA 4TZRA 3JY9A 1UU9A 3EL8A 2R3JA 2VNYA 1H0VA 4NTTA 3CKWA 3S3IA 1FGKA 3AC3A 4U7ZA 5IEYA 3PJ2A 5J9ZA 1WFCA 3K54A 1B6CB 3RALA 1QPCA 3D5VA 2G01A 4NIFB 4ZIMA 1ZZLA 2YJRA 3BU5A 3H4JA 5CU4A 5EYKA 3CEKA 4EK4A 5HU9A 2BRHA 4GSBA 4UZHA 4U80A 3UTOA 4AOJA 3ZRKA 5FQDC 3VW6A 4B0GA 3VBYA 2QOQA 3OCGA 2VTPA 4AQCA 3QF9A 4QMTA 4ZSLA 1ZOHA 1GZOA 3F2AA 4MNEB 4MK0A 5A46A 2V7AA 3MIAA 1JLUE 4W9WA 5F4NA 2VD5A 4XV9A 4UZDA 3EQFA 3G90X 5DGZA 3WOWA 4MAOA 4E6QA 5M55A 3QXPA 5G1XA 4C4IA 5LQFA 5EYCA 4F9YA 3L9MA 3D2IA 2R3MA 4GUBA 3W2SA 2RFNA 5HE1A 1S9JA 4DG2E 4FIJA 3HX4A 3S00A 4GUEA 5HCYA 4DN5A 2C6EA 2QG5A 2OGVA 5EOBA 3NGAA 3VBQA 3IW8A 1Q99A 3MPTA 3BE9A 5KMMA 5IA0A 4R1VA 5DFPA 4O1OA 4IAFA 3P1AA 4EQCA 1YXXA 3RHKA 1JSVA 3OY1A 4RT7A 4FTMA 3DZQA 4RC4A 3WILA 4CFXA 4DEGA 3DDQA 4O0YA 1H00A 3ZHPC 5LVPA 4UWYA 4H1JA 4FUXA 3QGWA 4HCVA 5AR3A 3BE2A 4EQUA 4XRLA 5IISA 2GNFA 2UW0A 4FTNA 4GFGA 3ZTXA 2CSNA 3AGLA 4IDVA 2X39A 4HVIA 5CEIA 2UZWE 4MVFA 3GOPA 3RINA 3O0GA 4D4VA 2VO7A 1FOTA 3ZUUA 3ZZEA 2XJ0A 4CFWA 4PPCA 2XIRA 3R8LA 2VX1A 3DNEA 4RZVA 2X4FA 2PE2A 4RRVA 1AD5A 2W06A 4DEIA 4CLJA 3FQEA 4QYEA 2WNTA 4L8MA 4AZSA 4DLIA 3M42A 1ZYLA 4AU8A 2FSMX 2BAKA 3PIYA 2Y4PA 3QU0A 4FVQA 4GIIA 4I5CA 5GHVA 4RWIA 3VHKA 5LCJA 4BB4A 5DEWA 5DI1A 4ZLYA 2NRUA 1O6LA 2OZAB 4EUTA 2RFDA 3LE6A 3W16A 4NW6A 2WEVA 5F9EA 4NJDA 2FA2A 2YABA 1OL7A 3G9NA 3ELJA 2DWBA 5AV0A 4YO6A 4DEBA 3SVVA 5DMZA 5DOSA 4D4SA 3PRIA 2XIKA 2F7EE 4UV0A 3DQXA 4HZRA 4ANMA 5ICPA 2I0EA 3UYSA 2G2IA 4LM5A 4FKWA 4FX3A 4X3FC 3GQLA 3NIEA 2X7OA 5HCXA 4BTMA 3OFMA 4F99A 3CGFA 3QZIA 3W8LA 1WZYA 3HDNA 5HESA 3ORXA 5HOAA 4AA0A 3PY1A 3PP0A 4FV5A 3VUKA 4BICA 3Q32A 4KIKB 3GC0A 3ZFMA 4YTFA 2C0TA 4DINA 1WBSA 2WQBA 4ZSAA 3UJGA 2ZV7A 3RVGA 4EH6A 1ZYDA 5C8MA 2W1DA 2YDJA 3NYXA 3AOXA 4KKHA 2YIWA 4OT6A 4BCPA 2WXVA 2R3GA 5AUUA 2H9VA 4WSQA 3DKOA 3OXTA 2W9ZB 5EHLA 4GVJA 4F09A 2OWBA 4FSWA 4YHFA 2PZ5A 5EFQA 4C38A 4CKIA 2F7ZE 2BRGA 5CYIA 2XIXA 4DYMA 1WVYA 4WG3A 5DIAA 3ZM4A 3R1NA 4F1MA 3ORZA 3ZUTA 4NCTC 2W17A 3ORTA 3M2WA 5J95A 2ZV8A 3L8XA 3DBFA 3LCSA 1SYKA 4IW0A 4RA4A 3KXXA 4EBWA 4GU6A 1UNHA 3QD2B 3VAPA 3NUPA 1WBOA 4BDCA 3A61A 3TIYA 2B55A 2P4IA 3EQDA 4R5YA 4QP9A 2NP8A 5ETAA 4UMUA 2QD9A 1BUHA 1Y57A 3E5AA 3VBVA 1H27A 3WE8A 4DFYA 2O65A 4G3FA 4X3FA 4K2RA 3TUBA 3ZRLA 4BKJA 1APME 4IVBA 2WMWA 5JT2A 1YI6A 3MFSA 1TQPA 3R9OA 2XA4A 2J0MB 3R1SA 4IM3A 4WSYA 4UBAA 3GOKA 3LZBA 3FL4A 3CQEA 3NUNA 4OW8A 4FIHA 4HJOA 4L7FA 4EYJA 3BI6A 4Q9ZA 3D7TA 3KA0A 2UZUE 2UZOA 3I1AA 1WBNA 3GVUA 4PTEA 3AD5A 3UZTA 4C02A 5JZJA 2ITVA 2YFXA 3FDNA 3QX2A 4H1MA 2CLXA 3EL7A 3KY2A 4U0IA 2XP2A 3CD3A 3KK9A 3TL8A 3VS7A 1BYGA 4YTIA 3FXWA 2C5YA 1LR4A 2ETRA 4N70A 2VGOA 4LRMA 4JT3A 3ZXZA 4FV2A 1M52A 4IM0A 2VGPA 3E7OA 4NCTA 3QYZA 3MB6A 5CVGA 3RPSA 2WEIA 3VF9A 5CAUA 3QZGA 4YZBA 2EU9A 2PSQA 2FO0A 4JAJA 4YZNA 4HW7A 4HNIA 3UZPA 4FZ7A 3MY0A 4WRGA 4XX9A 2BROA 3BKBA 3EZRA 2W7XA 4DH1A 3FLSA 3FKNA 4MD8E 5KMNA 4M14A 2BZHB 1P4FA 3HRFA 3OXZA 3F6XA 1VR2A 4PF4A 3QCSA 2WQNA 4MWIA 4YLJA 3DCVA 3IKAA 2IW9A 3VBXA 4E93A 5I0BA 1UWJA 3FHIA 3I0OA 5IUGA 2X4ZA 3BPRA 2JFMA 2PE1A 4IQ6A 3POOA 5FEQA 3QTIA 2B4SB 2OO8X 4A9SA 1YWRA 4L43A 3KKVA 1V1KA 3ENMA 4MXYA 1BLXA 3HV3A 5B2LA 4AGWA 4QNYA 1BMKA 3AGMA 1DS5A 2WQMA 3E7VA 4BGGA 2OZOA 1PYEA 3ZU7A 4S33A 1RQQA 4NFMA 4C35A 4RWJA 4YURA 3MVHA 4NSTA 4TRLA 4D2PA 4I20A 3PP1A 2VTIA 4RZWA 3HV7A 3E63A 2VX3A 2XEYA 5CZIA 2XNEA 2HY81 1ERKA 5F1ZA 2GTNA 3HYHA 4O0TA 4X3JA 3FI2A 5LMAA 1FVRA 4MF1A 2EUFB 5E91A 4F08A 4XEYA 3QUPA 2W1ZA 2R3RA 2X2MA 1WAKA 4XH6A 3D7ZA 3WYYA 4F9WA 4I1ZA 1ZZ2A 1JKLA 2BFXA 4BDJA 4XLVA 3DGKA 2BDWA 5BQ0A 2ZB0A 4F65A 4AW1A 4BDIA 3MH1A 3KCKA 5CLPA 3OP5A 3P5KA 4PTCA 3ETAA 4AOTA 4L44A 4HVGA 4IAAA 1PXPA 4RBLA 2OKRA 4FT9A 4XG4A 2Y4IB 3REPA 3VO3A 4J53A 4MXOA 2UZEA 3F7WA 5H8EA 4JXFA 3KB7A 3E8CA 5L2QA 2BCJA 3DT1A 4HYUA 2XRUA 4BYJA 3Q6UA 3T9TA 2P2HA 5HE2A 1PXNA 3D83A 2JIIA 4M12A 4MQ2A 3BELA 4C8BA 3LQ5A 1X8BA 4R8QA 2HZIA 2JDSA 1A9UA 3IPHA 3ZBXA 3RAWA 4R7HA 3TT0A 4BCOA 3QCXA 4GJ3A 5AEPA 3B8QA 3Q9WA 4ZTRA 3VRZA 3PXRA 4BDFA 5HVKA 3TZMA 4ASXA 4FTUA 5L3AA 2VO6A 2FH9A 4FOBA 3CS9A 5LARA 3FXZA 5KMJA 3HA6A 3C5UA 2Q0NA 3FWQA 3R1QA 3FC1X 3SXRA 4F7SA 4TXCA 1VYWA 5DBXA 3ORMA 1V0BA 4I93A 4BZDA 4F7LA 1M14A 4TW9A 3DKFA 3MWUA 4U8ZA 5BVKA 1W82A 4C4HA 2JKKA 2Z7LA 4O2PA 5L6PA 2ZMCA 4I22A 3Q96A 3W55A 5F94A 4QP1A 2VTHA 4CXAA 3Q9ZA 4NT4A 3WZKA 4EWQA 4X0MA 3I7BA 3OS3A 3F9NA 2W05A 3UIBA 4ZJVA 3QXOA 3TNHA 4Y5HA 4CYJA 3C4XA 3OWKA 1G5SA 3RZBA 1GAGA 2HK5A 1CDKA 5HIDA 5KMOA 1RW8A 2ETKA 4QMWA 5ANOA 4ARKA 4USFA 3UOKA 2XNNA 4IX3A 3E62A 4PPBA 2ZM3A 5CSHA 3D4QA 5AV3A 2WMVA 5A14A 4R6VA 2GNHA 4XG6A 2YDIA 5FTQA 1OM1A 3LFAA 3EN7A 3O7LD 5ACBC 3TV7A 3VS0A 4ID7A 3QUDA 4OTHA 2G15A 5LWNA 3C4CA 4FSZA 4GFOA 4MTAA 4P5QA 4TYHA 5EDQA 4KIOA 5GJFA 4CCUA 2J2IB 4J8MA 1M7NA 1WBTA 4CKRA 2BUJA 3DAEA 3UC4A 4GT5A 1OKWA 4TY1A 3AC5A 4FIGA 4JOAA 5DA3A 3CQUA 5T68A 3CJFA 2VTSA 2BMCA 4I41A 1REJA 3P86A 5K3YA 2JKOA 3R7IA 4BI2A 1XWSA 1UWHA 4L46A 4YBJA 3CBLA 4I5HA 4KD1A 3RHXA 2HZNA 1SVEA 2JD5A 3EN6A 2KTYA 3BIZA 2JEDA 3MTFA 1JSUA 3I7CA 4M13A 4FNXA 3AT2A 4AT3A 4FK6A 1PJKA 2C69A 5HBJA 5JMSA 3H0ZA 4ZY6A 1TQIA 5E1EA 1RJBA 2QURA 4FKOA 1URWA 2PWLA 2QI8A 4IZAA 1U54A 3QTQA 3UVQA 2A19B 4FZAB 3DBCA 4EH8A 2P2IA 5BVWA 4GRBA 4YZCA 2PZPA 4B7TA 5EW8A 5KKRB 2QNJA 5A6NA 2EVAA 5C26A 4GT3A 4DFLA 5BUJA 2B9JA 3IDCA 4LMUA 4M69B 5CF8A 5ANKA 5IA1A 1PHKA 4O2ZA 5HO8A 4UALA 4JNWA 4QNAA 2OJIA 3II5A 4FT3A 4XP3A 5KO1A 3UNJA 2QO2A 2UZLA 1XBBA 2Z2WA 3QTRA 4L67A 1R0PA 4PP7A 3HGKA 4F4PA 1V0PA 1YXUA 4YGAA 4USDA 5KZ0A 2PL0A 2W96B 4WA9A 4FKQA 3ZO3A 4UEUA 4HCTA 4ASDA 3QTWA 3IECA 5HE3A 5DT4A 4UMPA 2PVKA 2B54A 2YIQA 3LJ2A 3MVJA 4CFVA 3BYOA 5EM5A 4FKRA 4O91A 3HVCA 2OFVA 2OW3A 3DFAA 2W4JA 4C61A 4R3PA 2F4JA 3GU5A 4ACHA 4AE6A 3ORKA 4B9DA 4EOIA 4D0XA 3T3UA 2OIBA 3AG9A 4FVPA 4LUEA 1Y8YA 2C6TA 3FMEA 3OUNB 2GCDA 4CNHA 2J0IA 3LXPA 4BTJA 1Z9XA 5IEVA 3ALNA 1MRVA 3COMA 5LOHA 5JH6A 4ITJA 1ATPE 2YIYA 4C3FA 4BDKA 4CSVA 3A8WA 3BYMA 1PMUA 4FTAA 4EUUA 1SM2A 1UKIA 4WBOA 1QPEA 4QYYA 5FWKK 3AMYA 1UA2A 3GENA 5HG9A 2CHLA 3EFWA 3R9NA 2BR1A 4EC8A 5KZIA 5JFWA 4BGHA 1CKIA 4HPTE 3G0EA 3RI1A 4EZ5A 5HTBA 3LXLA 4OTPA 1OPJA 3LFCA 3OT8A 3A8XA 3L1SA 3A4PA 4USEA 3C50A 4E20A 2JBOA 4EORA 2YIRA 4EYMA 2R3FA 2Y4IC 3G6GA 4N0SA 2XNPA 1JBPE 3ZLSA 4QPSA 4KWPA 2ZAZA 4FKIA 4LMNA 3HZTA 4B99A 3CGOA 4D2TA 3UNKA 4HYIA 4A9YA 3FZSA 3V51A 3TNIA 4IVAA 4E5WA 4XS2A 3CQWA 1Q8TA 3GBZA 3JVRA 3FZPA 3U6IA 4PDSA 2R0IA 4C0TA 2WMXA 3DA6A 3NNUA 4II5A 4JBOA 3V8WA 4HZSA 3BGQA 3FY0A 3VJOA 4Y8DA 1MP8A 3K5VA 4YHTA 4KS7A 3NNWA 2I0YA 4L68A 2WQOA 3T3VA 4LOPA 4F9BA 5FDPA 3DDPA 1XH4A 5K9IA 4TWCA 2HZ4A 2WIHA 2XBJA 3QQGA 4LUDA 4JDHA 4QP2A 4BTFA 2HW7A 5CENA 3Q60A 2VO3A 3RCDA 1Q4LA 4QMYA 3OEZA 3R2YA 1YHVA 2HENA 2Y7JA 1F0QA 3SQQA 3FYKX 3KEXA 3JPVA 3EFKA 4BFMA 4FSTA 3A7FA 4Y5QA 3R01A 4FV6A 4DTKA 3BYUA 1ZWSA 3G2FA 4BIDA 2CKEA 3IS5A 4EI4A 2XK6A 4JBPA 2DYLA 5HVYA 2FGIA 2A1AB 2ITZA 3IONA 4YC6A 4ZTHA 3RAIA 3RNYA 2YM7A 3FPQA 1H1PA 3C7QA 4AUAA 4D2SA 4GK3A 5CALA 2I0HA 2F7XE 4QRCA 4L42A 2VRXA 4OTFA 3V5WA 4RQVA 3GGFA 2NO3A 4UMRA 4FICA 4A07A 4QT1A 2WTJA 4IACA 4AZTA 3LIJA 1PXJA 2J5EA 5AUTA 4DEHA 3I79A 4WUNA 5AP7A 5HVJA 3SC1A 1FQ1B 1K2PA 2XKDA 2B9IA 3BBWA 3HMPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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