4D2V | Genus

Total Genus 98

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	98
sequence length	334
structure length	313
Chain Sequence	HMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	98
structure length	313
sequence length	334
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4d2vA00

3FE3A 3FZPA 4JQ7A 5E8YA 2J5EA 2GQGA 4H3BA 4KBKA 4XOYA 4L6QA 3WBLA 1P5EA 1PYXA 3FYKX 5D1JA 3UOHA 4AGCA 1XH8A 4QTBA 4RSSA 3G6GA 4FK6A 1OI9A 3OZ6A 1STCE 4FV3A 3QTSA 4QYYA 4YZ9A 4E6QA 5LVNA 3Q5IA 2HY0A 5JH6A 3R1NA 5EDPA 4BHZA 2FGIA 4I93A 2O8YA 4IW0A 4PDSA 3MVJA 3Q53A 1R78A 3DA6A 5I9XA 5JFVA 1KE5A 4PL5A 1OB3A 4FV8A 5KNJA 5I3RA 5JSMA 2LGCA 4I92A 3QCSA 4IE9A 4U6RA 3TZ7A 4F6SA 3GU8A 5AP2A 5G6VA 4DBNA 3Q4CA 3ZCLA 5CVHA 4O0RA 2PE1A 4V0GA 3LHJA 3D14A 1M7NA 2UZBA 4MBLA 1PMVA 4AWIA 2YM7A 4RWJA 3BWJA 5TOZA 1REJA 2WOTA 4IAYA 2RGPA 4A9UA 5AR4A 2VRXA 5AX9A 2X81A 4HCVA 4OBOA 3RCDA 4AAAA 3AC8A 3KN5A 3ZC6A 2WB8A 2WU7A 1MQ4A 1PXPA 2QOKA 4F1MA 4I6HA 1J91A 4BCKA 4EI4A 3ITZA 3QTXA 4N0SA 3RAHA 1J3HA 4YJVA 3PZEA 4QTDA 2IN6A 3LXNA 2UW4A 5IA3A 2OIBA 3TN8A 3TV4A 3ZZEA 2R7BA 5BMMA 4RJ6A 1WBPA 5G1XA 2XKCA 2GNFA 4ALWA 1TKIA 5HLWA 2GMXA 3IOKA 3G6HA 3GFEA 3R73A 4MEDA 5HD4A 3ULIA 4S2ZA 1CMKE 4BB4A 1ZY4A 5AP1A 1KWPA 4RQVA 3QWJA 3NDMA 4MVFA 5EFQA 4BZOA 4PMMA 2AC5A 3IDCA 5HNBA 1ZMWA 4BCFA 3V8TA 3QRTA 2XUUA 4I1ZA 4HVSA 1ZYJA 5AJQA 2B53A 4GSBA 2W17A 4OBPA 3ORMA 5CEKA 4JG8A 4JJRA 3U87A 2EXCX 3KXNA 1JQHA 1URCA 4UV0A 1YHVA 4ZY6A 4YURA 2BZIB 4ANQA 4P2KA 4BZDA 1PXNA 3VIDA 5H3QA 3FI4A 2V5QA 4FZFB 4RJ3A 1F0QA 4D55A 5CEMA 4QMXA 1YRPA 3AGMA 4A9SA 3V5WA 3RPYA 3FKOA 2YAAA 4U0IA 2O63A 1XH7A 4OGRA 4M3QA 5H8EA 3NW5A 2C5XA 5CSXA 4ZK5A 2VX0A 4ZAUA 5DE2A 5H9BA 5A9UA 5IA2A 3PY1A 3F61A 4TT7A 4E4MA 3KY2A 2EB3A 3H30A 4BIDA 3NAXA 3GVUA 4GK2A 4ALUA 1U5RA 2RSVA 2V7OA 4QQ5A 2WXVA 4MXYA 1GZNA 1G3NA 4FBXA 2R3OA 4MH7A 5EI6A 4BCOA 2GNIA 4AP7A 1RE8A 3LVPA 1UWJA 5AADA 4FV5A 2EXEA 5ETAA 2NRUA 4O2PA 3EHAA 1KV1A 2BRNA 5CX9A 5IA5A 4NM3A 4BIBA 3UIXA 4Y95A 1QMZA 2EWAA 2ZYBA 4N70A 3GC9A 4F6UA 4FKRA 4G34A 5LWMA 2Y8OA 5IH5A 3BCEA 4QNAA 3E7VA 1WBNA 4F6WA 3U4UA 5J9ZA 4YTCA 2F2CB 2QOOA 4OTQA 3KEXA 4YHJA 2H9VA 3MFUA 4WG4A 3HRFA 2RKUA 3GBZA 2Y4IB 4AUAA 3L9MA 1RDQE 3UODA 4DC2A 4J95A 1H1WA 2ITVA 4R5YA 4TNBA 5GZ9A 3HMNA 4Y83A 4G6LA 3ORIA 2OJIA 5JGDA 4U8ZA 3KF4A 4E20A 5L2SA 3FPMA 1GJOA 2PHKA 3V04A 4NZWB 5T6KA 2E2BA 4OLIA 1UKIA 3H0YA 4BDIA 3O7LD 4ANLA 3C0HA 3QAME 4G3EA 4F08A 5C1QB 4Q5HA 3OCGA 3W55A 5ACBC 1ZRZA 4DH8A 4AF3A 2WMAA 2X9FA 3BV2A 4D0XA 4LG4A 3EN9A 4IC8A 5DT0A 3C4CA 4BC6A 5A46A 3UG2A 2DQ7X 3UE4A 3UBDA 4P7EA 1OUYA 3EQCA 4IB3A 3FMDA 4GJ3A 1JSUA 3NW7A 4TKSA 4EORA 3ZEWA 1XWSA 4GFMA 4IWDA 4U5JA 3VBTA 3AGLA 1H26A 4YO4A 3CJGA 4RFMA 2BTRA 2XYUA 4K6ZA 4EOJA 4YC6A 4DHFA 1DS5A 2GNGA 3UPXA 4O6LA 3BU3A 3LFBA 4BDHA 4L8MA 3E93A 4YO6A 1FGIA 4YLKA 3OW3A 3LXKA 4QYGA 3QZGA 3UO6A 4FTRA 3QCQA 2F57A 5TR6A 3QQHA 4MD8E 4RIYB 4X3FA 4TTHB 4FKJA 3SLSA 2UZNA 1OIYA 1QL6A 3EQFA 5E1EA 4FTQA 1WMKA 4BDFA 5L2TA 3TTJA 3FLYA 2VO6A 4GU9A 4WUNA 4D2PA 3F9NA 1R0PA 4G5JA 3R8UA 4F1OA 4EHVA 4MNEA 3VHKA 3KCKA 5B7VA 3DT1A 4OTFA 3HV5A 4FG9A 2W9ZB 4YJTA 1YHSA 3ORKA 3DJ5A 1OVEA 1CDKA 3JXWA 2Z7RA 3IECA 4LL5A 4XX9A 3S4QA 2G2HA 4OR5A 3UIBA 2BIKB 3NGAA 4DEAA 3VS1A 4K1BA 4Y5QA 3D5VA 1VJYA 2ITPA 2VO0A 4USDA 4FZAB 3PTGA 5ANEA 4U45A 1FPUA 4ASEA 1UU9A 2BHEA 3HUCA 3OXTA 4CV8A 4EHZA 5I9ZA 5IMEA 1WBVA 3SXRA 2A1AB 4X3FC 1LUFA 3OROA 3VW8A 2KTYA 5FTOA 3MV5A 4YNOA 4GYIA 5TF9A 2GFSA 4IZ5A 1WBSA 3IW4A 3R7GA 2WGJA 4DINA 3C1XA 2PZPA 4IDTA 1Q8WA 3QGWA 4PL4A 5CASA 5KBQA 3NX8A 3COKA 2UW7A 4F7JA 3MB7A 3PRIA 5DEYA 3TNPC 4JS8A 3R9NA 3TG1A 4B4LA 2WAJA 5GNKA 4F9BA 4YLJA 2BRBA 3VJOA 2BPMA 2WMVA 3DKCA 3GCSA 2PZRA 1QPDA 2F7EE 2WHBA 3HMIA 3RHKA 3ZS5A 5KE0A 5IPJA 3QC4A 4AOIA 3CJFA 3QZHA 1OM1A 2EUFB 2R3JA 3PA4A 4GT3A 2JD5A 2HW6A 2BRGA 2W1GA 3FMNA 5AR2A 3F3WA 2GNHA 5KMKA 1JBPE 4FG8A 4X2JA 3WZUA 2C3LA 2XRWA 5CU3A 2HELA 3F3TA 3EQBA 1YW2A 2W7XA 3VUKA 2GTMA 5AIRA 4PY1A 4D2RA 4M13A 2BALA 3PZHA 3L9LA 3R2BA 4HNIA 4U97A 2OFUA 1XBAA 3U4WA 4G6OA 4HZRA 1WBOA 2Y7JA 4X2KA 4D0WA 3KGAA 1OL6A 4HGEA 4MXXA 2Y0AA 4FUYA 3V5PA 1G5SA 2BMCA 3RK9A 3SAYA 4BCMA 1LEWA 1ZOHA 4RRVA 3W16A 3LJ1A 4UB7A 3QXPA 3AC3A 4FKUA 2W05A 5KMLA 5TO8A 5L2WA 4EH8A 4TXCA 5DIAA 4WKQA 4HOKA 4FNWA 3WF8A 2QURA 5HORA 3OUKA 3T3UA 4M66A 2Z8CA 1H27A 3GU7A 2OH4A 3E87A 4MXZA 4N4SA 5B0XA 4IAZA 1JLUE 3LFCA 3Q32A 3DNEA 3KRWA 4IBMA 4PRJA 4FKTA 4XYFA 5HNGA 3ZO4A 5IA0A 4G1WA 4RC3A 4ANMA 4W4VA 5EW9A 3VC4A 4C4IA 2LAVA 5DRDA 4H1JA 5IDNA 1Q5KA 2YCQA 4DLIA 3QD3A 5L8JA 4BHNA 3P7AA 4AS0A 5AA9A 1PMNA 2IZRA 5C8MA 3EQRA 4O21A 3F3VA 2C0TA 4Z55A 5HO8A 3RZFA 1OKZA 4XG8A 3PUPA 5E7RA 5BPYA 3OWPA 4HPTE 1V0PA 4QMZA 3MI9A 5KBRA 4E5BA 3OEZA 3PE2A 4FNZA 5IEVA 4TYHA 2R64A 4WA9A 3IDBA 3TZ9A 2FSMX 2X8EA 4BKJA 5HBEA 3NNXA 2JDTA 2ONLC 5CVGA 3HA6A 4EH3A 5L3AA 3FC1X 3IPHA 4KKHA 1Q24A 2C5NA 5HG7A 2BUJA 3FQHA 2V7AA 2WMXA 3QTUA 5BMSA 3EQIA 4B6LA 4FSYA 2JKMA 2Y6MA 4EL9A 2C47A 2VWYA 5BVOA 4USEA 1Q41A 3ZRMA 2Y9QA 1GIHA 5B2KA 3KMMA 3R9DA 5AEPA 3E63A 4BRXA 2IVVA 3F5GA 3KFAA 4WNPA 2B9FA 3C7QA 4I20A 4JOAA 2BDFA 3C0IA 3F69A 3BKBA 4KIOA 4FTNA 3GFWA 2DWBA 2QHMA 3GOKA 3PRFA 5DR2A 4LYNA 1FOTA 3P08A 3RMFA 3VJNA 4E93A 3P5KA 2XF0A 5HD7A 4KIKB 3BHTA 4YJNA 4JR3A 2BR1A 3ORLA 2O64A 3T8OA 1UA2A 4D58A 2UVXA 3BHVA 4BL1A 2X9EA 4O22A 2C6MA 5IISA 4UMUA 4WIHA 1KE6A 1PW2A 1VYWA 4B8MA 3ZC5A 2C5OA 2V55A 3PXRA 4J99A 4L45A 4QP4A 3QLFA 4FT9A 5AP3A 3VUTA 3MB6A 5C8KA 4G3CA 5DVRA 2X4ZA 1KOBA 3F66A 4JR7A 4BDEA 1BUHA 4H3PA 3WZDA 4BKYA 2J0KA 3FKNA 3A62A 2FYSA 5EI8A 4ZXTA 3P23A 1LR4A 5EYMA 1VZOA 3ODYX 4E73A 3IS5A 3BQRA 4FSRA 4EC8A 4QP8A 5HIBA 3GU5A 3W2RA 3QRKA 4ZS0A 3DAJA 2W1ZA 3CQEA 4RX7A 3VULA 3U6HA 3T3VA 3RTPA 2VTPA 2V0DA 3AG9A 3UMXA 2PZ5A 2OXDA 2O65A 2HCKA 2VTJA 3UIUA 3V01A 4IM3A 4IFGA 2OJJA 3P7BA 4EOPA 4RLKA 2C3JA 4TN6A 2ITZA 4BBMA 4E8AA 1T45A 4XS2A 2O2UA 5DGZA 4W4WA 5E8UA 5JK3A 3DBCA 2O5KA 4L7SA 3FY2A 5CF8A 2OF4A 2ITOA 3R1YA 2C0IA 4J7BA 4ACGA 4EYMA 4HPUE 5BVDA 3COIA 3LCSA 5C03A 4EYJA 2R3RA 4FNYA 4A4LA 5AV4A 3LM5A 4TPTA 4PL3A 3ZM4A 4C36A 4DH7A 1ZWSA 1XH9A 5HVKA 1ZY5A 2HENA 4XCUA 2QOQA 3VBVA 5AUUA 1LP4A 2R3FA 3VAPA 4U43A 4IM0A 5IUGA 3O51A 4JLCA 3EB0A 1ZLTA 3CPCA 1KOAA 2P0CA 4NK9A 2VTOA 3ZFYA 4CTBA 1H1QA 4I0TA 4U3YA 2PE0A 1OL1A 4FV1A 4BZNA 3L8VA 5JKGA 1GZOA 4GYGA 2A2AA 3C13A 4JDHA 5LVPA 3PXYA 4GW8A 4IAFA 4XUFA 3WE4A 3LFQA 4RC4A 3TUDA 3DB8A 2GFCA 3FI2A 3OG7A 2HIWA 5CEIA 4TRLA 2QOBA 3HVCA 3IKAA 5DN3A 3A7IA 5CT0A 3RGFA 4A07A 3KXHA 2ZM4A 4I4FA 4OBQA 1BL6A 4K77A 3OT3A 5I3OA 3ZUUA 3SW4A 5J5TA 4MNEB 4JRVA 3QZIA 3PA5A 5F94A 4AT4A 2V22A 2CLQA 4FGBA 2W4OA 4I6FA 4NTTA 3GNIB 3ZEPA 3U6IA 4DTKA 1JVPP 4KA3A 4QMOA 1X8BA 4X6QC 5CQUA 4IZ7A 3IONA 3W10A 3EYGA 4CFFA 3S0OA 3H3CA 5L2QA 4IHPA 2W4KA 3FZ1A 2C1AA 4CZTA 2ETRA 3HV7A 1OKVA 4CZUA 5EYDA 5HVYA 4ZY4A 3ZXTA 5HE3A 1MRYA 3PIYA 3PYYA 4FTMA 4BCNA 4DEDA 4EQMA 3IO7A 5HE0A 1OECA 1CM8A 5ANKA 2CHLA 1CTPE 1DAWA 2XIXA 2YACA 4NM5A 5EW8A 1PMUA 2GSFA 5KMNA 5DLSA 4I21A 4DH1A 5CU4A 3GQLA 3ZU7A 3O23A 4QP7A 5KMOA 4IVCA 4RPVA 4CYJA 3A4OX 5HI2A 2VWUA 4QP9A 3V6RA 5KX8A 1K9AA 1M2PA 1H25A 1OGUA 2XMYA 3MVLA 3ORZA 3MPTA 5JRQA 4JIAA 3WZJA 2ESMA 2JKQA 3ENMA 2QOCA 5AMNA 3DFAA 4EOSA 5EH0A 5F20A 4XG6A 2OZAA 3QRIA 3Q9YA 2RG6A 4ZJJA 2W0JA 3ZO1A 4BDKA 2R3QA 4ZSAA 4DAWA 2OBJA 3BHYA 3FL4A 3HV6A 3TIZA 3P9JA 2UZOA 3DKFA 4YPDA 3CCNA 4XH6A 3VRYA 2JKKA 2WO6A 3Q96A 3HV4A 4WHZA 3QQLA 3VS4A 3ZH8A 2Z7LA 2CCIA 4FKSA 2WOUA 1GZ8A 4QPAA 2B1PA 4GVAA 4IJ9A 4FTIA 2JAMA 4DG0E 1YWVA 4UALA 1H1RA 4NW6A 3EZVA 4YZCA 2PY3A 5C9CA 1T46A 2QC6A 5HBHA 4U81A 1OPLA 4WBBB 4AT3A 3S00A 3LM0A 2QOHA 5F1ZA 1IR3A 3RM7A 4W9XA 2WNTA 3G0EA 3BYUA 4B99A 1OIQA 2XP2A 4GUEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4D2VA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations