4PPA | Genus

Total Genus 69

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	69
sequence length	264
structure length	239
Chain Sequence	SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
total genus	69
structure length	239
sequence length	264
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-02-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ppaA00

4FYOA 1ZWSA 4ITHA 1VJYA 4DFNA 5AEPA 3OTVA 3IW6A 3A8WA 3PPJA 3AG9A 1NVSA 4LGGA 2OIQA 4TT7A 1Y8GA 4X3FB 4H1MA 4U81A 5IA0A 4IB1A 4HPUE 1T46A 2BDJA 3EOCA 3G6HA 4NKSA 4O6EA 4BCOA 5CF5A 5I9WA 3ZTXA 5JGAA 3FZPA 4E7WA 2P4IA 1IASA 1DS5A 4MH7A 4XG4A 4BN1A 4ZTSA 1UV5A 3QFVA 4I4EA 5H8BA 3V51A 4CFVA 3NYNA 1ZYDA 4W8DA 4BCHA 5L2TA 1H1PA 5IMXA 2W0JA 1MRYA 2VWIA 3SXSA 3EMGA 4FKLA 4RJ4A 3UQGA 4P2KA 5IA5A 3E64A 3V8SA 4MEDA 3PA3A 4G6OA 3DOGA 3R9HA 4X3FC 4D2VA 2NO3A 1V0OA 3BV3A 5ACKA 4IAAA 3BGQA 5CTPA 4NIFB 2BVAA 3RBWA 3PTGA 4CT2A 5K9IA 2XEZA 3CP9A 2VTMA 3QTZA 2PMOX 5CVGA 5IG1A 3V5JA 4D4YA 4WBOA 1WFCA 5I9XA 2BIYA 3EFWA 1W83A 3CEKA 1NY3A 4G5PA 5F20A 4JBVA 2OF4A 3THBA 4FKPA 3H9OA 1KE8A 3MDYA 3O96A 4MD7E 4ZTQA 4CFWA 4F4PA 2C3IB 2QC6A 4MQ1A 3BELA 2WIPA 3O8PA 5CY3A 3VS7A 3VUKA 4C57A 4LL5A 5CENA 2GFSA 3QZGA 1KOBA 4NM5A 4E4XA 3UP7A 5CS6A 4FKGA 4MXOA 4RX5A 5M53A 4M15A 1UU7A 4BCKA 3UO5A 3QKKA 3QRUA 5K3YA 3MTLA 5EW9A 3GFWA 3BKBA 3HUBA 3V5WA 4DGOA 4ZS0A 1REKA 4X2KA 1URCA 4QNAA 4HVHA 5EW8A 1W0XC 1YOJA 3E5AA 4C37A 2YLFA 3ITZA 5EI2A 5F9EA 5J1WA 2PVNA 2UZBA 3EQHA 3B2WA 4M7IA 3NLBA 4AU8A 2IVVA 4IWQA 1CMKE 4AW5A 5LMKC 3VS3A 4GSBA 4HVGA 2BALA 4RJ8A 3FMMA 2WIHA 3QYZA 2H6DA 3HMNA 3EFKA 2O64A 3GFEA 2XJ0A 4F63A 3LVPA 3ZEWA 2G15A 2PSQA 2EWAA 4CMUA 4NJ3A 4BBMA 4YZMA 4C4FA 3ODYX 2IW8A 1REJA 5F4NA 2JKMA 3UOJA 4WRSA 3LHJA 3UNJA 1PXMA 3RK5A 5KO1A 3D9VA 3BIZA 4WOVA 2C6EA 1Q61A 5CF6A 4QQCA 5AV0A 1NVRA 4O0YA 4RA5A 1BYGA 4S31A 5DEWA 3T3VA 3CR0A 4WUNA 1G5SA 4EBWA 3V04A 3U51A 3UC3A 1YQJA 4CRSA 4RFMA 4C4GA 1Y8YA 4DG0E 3VVHA 4BCNA 3GVUA 3TZMA 3ZFXA 5AV1A 4RVKA 4FSTA 3HV4A 3VF8A 4KIQA 4C3RA 3A4PA 4F6SA 3P5KA 2R3NA 4YO6A 1QL6A 2DQ7X 5D1JA 5F94A 4EORA 4FV6A 4TRLA 2A1AB 4WG4A 3CD8A 3R7IA 3R8VA 4ASEA 1XH5A 2HW6A 4AACA 2PE2A 4PP7A 4WUAA 5FEDA 2QLUA 1R0EA 5A4CA 4EQCA 5DLSA 3DNDA 4M69B 4YHTA 3D7TA 4E8AA 4FYNA 3OXTA 1ZY4A 2RF9A 3ROCA 4S34A 3VS2A 2QONA 3IPHA 4QRCA 3G9LX 3NW5A 3PWYA 4FK3A 3V8WA 3LXPA 3PJ1A 2OXYA 2VX0A 3TJCA 4C4IA 4YTFA 3R7GA 4G6LA 4XOZA 3CBLA 4CEGA 4DGMA 4RFYA 3PUPA 3KA0A 3QQUA 3FLQA 3FHIA 2R7BA 4FZFB 2VU3A 3E88A 1ERKA 3VW8A 3I1AA 3HZTA 4LFIA 4W4WA 1KWPA 4O2PA 2IVUA 1LEZA 3QCQA 3CQWA 5DWRA 1WAKA 3UNKA 5E7RA 1QCFA 3OCBA 3PJCA 3LFFA 4BKYA 5DNRA 5TT7A 1PXLA 1SVHA 3EN9A 2ONLA 4IDTA 4L67A 5A4QA 5E92A 4FT7A 1U46A 3DBQA 3G51A 3I4BA 4Z3VA 1IRKA 4IJ9A 5EM7A 2X6EA 4ERWA 3NEWA 3A62A 2VD5A 4C7TA 1OPKA 3L8PA 5IEXA 1OECA 4DFYA 3HMMA 3QU0A 4J98A 4OTWA 4FV3A 4G3FA 4DEEA 4FKIA 5T3QA 4F1TA 3R7EA 3ZEPA 4L3LA 2GNFA 4RJ6A 1ZLTA 5A4EA 2REIA 5JRSA 5CALA 1PXPA 2A19B 4UZHA 5HKMA 1GZKA 2YDIA 5J5TA 1IG1A 5CEQA 1YDSE 1YDRE 4FKWA 4ALUA 2XKCA 5K4IA 1O6LA 4KINA 1OUYA 3RNYA 4JVGA 3IQ7A 4HCTA 2J6MA 4JG6A 4QTCA 3MY0A 5AAGA 4PRJA 5AR8A 4J53A 4DH5A 4DFLA 2W1EA 2WMWA 5CAQA 3S4QA 3C4CA 4QYHA 4O2ZA 1MRVA 5A6OA 4NCTC 2C3KA 4UYAA 4LOQA 2R3PA 3A7JA 1PXOA 2QHNA 3CTHA 3ZCLA 4PPBA 3FLYA 2C5XA 2HENA 2WTCA 2GU8A 2XKEA 2XH5A 4I1ZA 4YLLA 4RBLA 4F99A 2J0JA 2IW6A 2PTKA 4O1PA 5J79A 2CCHA 3LCOA 3I7CA 5AP6A 3RAWA 4EK5A 4GUEA 4UWBA 2X4ZA 3ACKA 3R1QA 4AZVA 4E6CA 4DGNA 3NYXA 1R78A 4D2SA 4IDVA 2XA4A 4RJ5A 2P3GX 5E1EA 2XIRA 4GEOA 4L43A 5HESA 2XS0A 2PY3A 2FB8A 4CNHA 4NT4A 5HIDA 4NEUA 4NFNA 5HZNA 4AN9A 3AOXA 1SVEA 2PMLX 3IW5A 3OCSA 3VBQA 3PVGA 2LAVA 3IOPA 4BDHA 2E9VA 3EYGA 2XJ1A 1BLXA 1RE8A 1OB3A 4H58A 5I3RA 3SKCA 3QQGA 1OIQA 3C0HA 3WZUA 3GGFA 4JQ7A 4BTMA 4FTOA 5KCVA 3T9TA 4ZLOA 1SMHA 4FKQA 3C13A 4YU2A 2OZAA 4X6QC 4O0UA 2PZIA 3JS2A 4YZDA 5LARA 4A07A 3MWUA 4ANOA 3ETAA 2XK9A 4EOPA 3U6JA 2I40A 4L45A 1ZARA 4RPVA 1UWJA 4A4OA 1W84A 2SRCA 3RPSA 3PY0A 1VYWA 2ZMCA 2IVSA 3ENHA 3VS4A 4K0YA 2HWOA 4BZDA 1YOLA 4IX3A 4BDIA 3WF9A 3FKNA 3FY0A 2OU7A 4CZTA 3W2PA 4X2NA 4YZCA 2EXMA 1CM8A 3KXNA 4WA9A 2JFMA 3NIZA 2YM7A 5H8GA 5LCKA 2X8EA 3A8XA 1OIUA 4FTLA 1M7NA 2ITZA 4TYHA 5B0XA 3KULA 4F7SA 3FL4A 1Y6BA 3LXKA 3HV5A 1YXUA 3QTQA 4IBMA 1JKTA 5A3XA 2B9HA 4EQUA 4UWCA 1X8BA 2UVYA 2ETRA 4ACGA 1U54A 5C8NA 4L7SA 1WBTA 4D28A 4L8MA 1PY5A 4IZAA 5LVLA 2ZMDA 5E91A 3Q4TA 4L53A 3O2MA 2UW6A 4ZTHA 2CKEA 5LCJA 5KMMA 3L9MA 4YJQA 2R3MA 4FZDB 4S30A 5L4QA 3L1SA 3AMYA 3DU8A 1T45A 3MYGA 4BCIA 3MI9A 5B2KA 1ZYLA 4HJOA 4O96A 4BDJA 3DA6A 3BHVA 3DKFA 2YM5A 4LGHA 4UMUA 4M67A 4D55A 3D7TB 5DT3A 1YDTE 4QTEA 3DLSA 3MFSA 4IANA 4YZNA 4EZ3A 3KF7A 1WBVA 4LG4A 4Y5HA 4GVAA 2ETMA 5CZIA 3TNIA 5I0BA 1XBCA 2WEIA 2X2KA 3PIYA 2XYNA 2ZM3A 3IW4A 3OOGA 2R3HA 4W4XA 2UVXA 4HPTE 4LQMA 1HCLA 4YJRA 3OEZA 4AFJA 4CD0A 5HIBA 5BVEA 4DEDA 4FZAB 5AR2A 5IMEA 2RSVA 3WYYA 1Q8TA 1SNXA 1ZMWA 2DUVA 2VTNA 3FLZA 3UC4A 4E20A 5CAVA 4FKRA 2ITUA 3UNZA 4PMSA 4O0TA 5EHYA 2Z60A 5KX8A 3R7UA 5AP4A 4WKQA 4D1XA 3R1YA 3L8XA 4QP8A 1CDKA 4HYUA 2O8YA 5GZAA 3P7CA 4FTTA 3Q6UA 3CQUA 3K2LA 3UMWA 4AWIA 3ZO3A 4C59A 3OUKA 4NU1A 5CU3A 4TL0A 3DK7A 5CX9A 1YRPA 5LVMA 4I6HA 3Q3BA 3C4EA 3Q52A 2YAAA 4XS2A 4IWOA 2C3JA 2HZIA 4U7ZA 1M17A 1PYEA 2Y6MA 5AV3A 5EKNA 4AE9A 3TKHA 2CSNA 3RKBA 3ORPA 4EK8A 4TWCA 4U97A 2W1FA 4AT5A 4DH7A 5LVOA 5AAEA 1Q24A 3PRFA 1GZ8A 2Y4IC 4OGRA 2G2HA 2W1DA 3R04A 3N51A 4RT7A 3DXNA 2GNIA 3H9FA 5ETIA 2LGCA 3NZ0A 3SXRA 2YITA 3QRJA 5CSWA 3A60A 1GOLA 2J0IA 4AF3A 3KB7A 2ONLC 2PVJA 4KB8A 3DDPA 2UVZA 4YPDA 2PHKA 5HI2A 4AG8A 5T6KA 3M42A 4YHFA 4YJUA 1B38A 5KUPA 2QI8A 4LI5A 4M0YA 2C6IA 4BI0A 2VTSA 2GMXA 3FI4A 4L3JA 4MD8E 3FSKA 3D5WA 5DR9A 2XVDA 4KBAA 1PMVA 5FQDC 4AZTA 4CVAA 4RA4A 5KBRA 4J1RA 4DFXE 2UZDA 3R1SA 4J52A 2NRUA 4IVCA 2DYLA 4C58A 3OF0A 4UX9A 2OJGA 1BL6A 4PP9A 1OL2A 4HOKA 2P2IA 4BDDA 4N6ZA 4JS8A 2WEVA 1Q8YA 2Y9QA 4FTUA 3VHKA 4JOAA 4QPSA 5ANGA 5GZ8A 2Y6OA 2Z7QA 3BEAA 3QRIA 4U8ZA 3O8UA 4IVAA 3CS9A 4YSJA 3OUNB 3ZXZA 4HW7A 4BVUA 5TO8A 4N4SA 2BDWA 2F57A 2ZOQA 4RMZA 4JNWA 5DIAA 4F1OA 2YFXA 3LZBA 3GCUA 3DAJA 3C1XA 4KNBA 3SQQA 4OT6A 2OI4X 4HCUA 4XMOA 3SW4A 3WARA 3EQIA 5AA8A 4R7IA 4X2FA 4ASXA 1O6KA 4GG7A 5AWMA 5FEQA 4WIHA 4YNEA 3NUNA 3VBVA 5AUYA 3COIA 3OROA 5FDXA 3UO6A 3AQVA 4E4LA 4EHEA 2VNYA 2IJMA 1ZOEA 2QNJA 5EYKA 5CEOA 4MVFA 4WHZA 4YBJA 1H28A 4JBQA 4DN5A 3CQEA 3MS9A 4WNPA 3GB2A 3ZLWA 4EI4A 3LCTA 3TCPA 3DJ5A 3S0OA 4BDKA 3PP0A 4GCJA 3C4WA 3DZOA 5FDPA 3K54A 5EW3A 2OZAB 3L9NA 2HXQA 5AP1A 2GNGA 2ITXA 5AR4A 4YUQA 1XBBA 5HNBA 3RM7A 2UW0A 5L2SA 4B6LA 2YACA 1HOWA 3DKCA 1KE7A 2ZV9A 2RFNA 3QTIA 4L42A 4M97A 2HY0A 5BVDA 3D15A 4EYMA 5DFPA 4ACCA 4AZWA 4XG6A 3VJNA 3E8NA 3Q9WA 3NIEA 3SD0A 1Q97A 2VN9A 4JIAA 3TEIA 4EK3A 3Q60A 5E8SA 3PXYA 5A46A 4XBUA 3A61A 4FL2A 4TYHB 4YJVA 1P5EA 3I6WA 3FI3A 5EI8A 3KULB 3GNIB 2FUMA 2JDTA 2ZV2A 2ITWA 3QC4A 3R2BA 4WSYA 3GU8A 2FH9A 5DE2A 2YWPA 3QA0A 2OO8X 4RJ3A 5CSPA 4YC3A 1GAGA 2JAMA 2X6DA 3DS6A 3IGGA 5FD2A 5BQ0A 5CZHA 3BYSA 5HBJA 5CU2A 2FYSA 1PW2A 3BCEA 5IA4A 3W2CA 2OKRA 4RG0A 3UE4A 2G2FA 2QHMA 3R0TA 5HQ0A 3FKOA 4YTHA 2YJRA 3Q04A 3R28A 1NXKA 4BIBA 2QOIA 2E2BA 4QMVA 2HWPA 2JFLA 3A2CA 3VJOA 4UXQA 4B8MA 4P5QA 4O0XA 3LXLA 4BHNA 3W2QA 3RAKA 2WOUA 4C2VA 5JKGA 4ZSJA 2JAVA 4AOIA 2YN8A 5L2IA 4C38A 3UOHA 3CGOA 3GEQA 5C26A 2CGUA 3KMUA 1PXKA 4IX6A 5KZ0A 3FXXA 3CD3A 3R7YA 5ANOA 3OXIA 1RJBA 3B8QA 4FIIA 5BUJA 3AC1A 5AR3A 4FSZA 2W99B 4PV0A 5FP6A 2W4OA 2JGZA 3ORLA 5HU9A 1PHKA 1Q3WA 5CNNA 4JRVA 3EZVA 2F49A 4Q9SA 4U44A 4IAIA 4KRDA 4O0RA 3P78A 1KOAA 1XQZA 1ZYCA 1K3AA 1Q99A 3DBDA 3PIZA 4GFOA 5EYMA 3FDNA 3EQDA 3VO3A 4ANSA 4XV3A 2VTOA 1Y91A 3UDBA 2GFCA 3UO4A 3QALE 4F6UA 5M57A 3PPZA 4P4CA 4CKIA 5DN3A 1LEWA 4PMTA 5LVPA 5BYYA 2C5NA 3POOA 4PMMA 4RIYA 3BEGA 3HDNA 5HE3A 4E5BA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PPAA

Total Genus

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Chain Sequence

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