4UMP | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	333
structure length	313
Chain Sequence	MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAGALAYAAPELIQGKGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDTAAALVAKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fragment-Based Discovery of Type I Inhibitors of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	MATERNAL EMBRYONIC LEUCINE ZIPPER KINASE
total genus	97
structure length	313
sequence length	333
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4umpA00

1OZ1A 4C2WA 3VN9A 5DPVA 1UU8A 3KRXA 4CTCA 4D9TA 2YIRA 1FGKA 3EYGA 3PIZA 2R4BA 2Y4PA 1VEBA 3PXQA 4M0ZA 2C69A 1BYGA 3D5WA 3ITZA 4TL0A 4HCTA 2NP8A 4DG2E 4IMYA 5ETIA 3HDMA 3G9LX 2Y8OA 4OGRA 4G3FA 4E20A 4EHGA 5EI8A 5FP5A 4JX3A 4P7EA 1FGIA 3ODYX 2UV2A 3OXIA 5DHJA 4H3PA 3R30A 3SLSA 3UNZA 5I9XA 2VWWA 5L6PA 3GEQA 4FKGA 5IUGA 3EJ1A 3OTVA 3QCYA 4ZXTA 1KOBA 4AW1A 5LOHA 1IEPA 2FSLX 2HXQA 4DITA 4RPVA 1PYEA 3HV3A 4FX3A 1Z9XA 4OT5A 4I6FA 4YZBA 3T3VA 4JQ7A 3UC3A 4RSSA 4QO9A 2XNOA 4RWIA 1FVTA 4L44A 4RJ6A 2PMIA 4FKTA 4RJ3A 2XM9A 2RIOA 1LP4A 3JXWA 3V5TA 4JX7A 3RAHA 2NO3A 1TVOA 2BR1A 5GJFA 4II5A 3PSBA 3VC4A 1P14A 2OK1A 5HORA 4KSQA 2UZNA 3O2MA 1Q8ZA 4EL9A 3ORTA 4F0FA 2GHMA 3CCNA 4M67A 4C58A 2J5EA 2RF9A 5LMAA 4Q9SA 2B52A 2GNLA 3IW5A 5LARA 4LQMA 5IPJA 3UG1A 1SZMA 4MVFA 3R8MA 1V0PA 2UW8A 3AC1A 3FL5A 3E88A 3FQHA 4XMOA 4YC8A 5FWKK 5TOZA 2BFXA 3BU6A 1YXSA 3E8EA 5D9HA 3RAIA 3B2WA 4EWHA 4JIKA 5FEEA 4ZAUA 4D2PA 3NYNA 4TZRA 4BB4A 2C3IB 4R3RA 5LWMA 5E1EA 4O27B 3GFWA 4GMYA 5I4NA 4AU8A 1K9AA 2W1GA 3GC0A 3FZRA 4A4LA 1UWHA 3PWDA 1H26A 2FSMX 3V6RA 3NGAA 3UODA 5I9YA 2UZUE 3D5VA 2WMWA 5HHWA 4BL1A 2R3NA 4R3CA 3SC1A 2DQ7X 4FK6A 2PE2A 2BFYA 2O64A 4AA5A 5EDPA 2FSTX 2ONLA 2XIYA 4CSVA 3HMNA 4HGLA 3ALNA 5FEDA 2YDIA 4QMYA 3BYVA 2BALA 2B9JA 5K5XA 3BLQA 4I6HA 3KB7A 1A06A 3FXZA 3L8SA 1MRYA 3GU5A 4LGGA 2OZAA 1Q41A 3Q9WA 2R0UA 4L45A 4MBIA 4PPCA 2R3LA 4IM0A 4QPMA 4BBFA 4C35A 4DG3E 1WBNA 3U87A 1YDSE 4QP8A 5EDQA 1CKJA 3LQ8A 4FI1A 5I5ZA 1XH9A 3KGAA 4O0UA 2R0IA 2CLXA 3V5PA 4O6EA 4GYIA 3QTXA 1P5EA 3FE3A 4DLIA 3FXXA 3LE6A 5IMEA 1ZARA 4IZYA 4FKLA 4ZY6A 2VO0A 3LAUA 5TT7A 4BIDA 3GOKA 4HYUA 1ATPE 1OL5A 3ZTXA 5I9WA 4FGBA 4YPDA 3LMGA 1ZYSA 2C3LA 2EB3A 2BRGA 3QD3A 4E5WA 3PG1A 4U41A 3EKKA 1PF8A 4W9WA 3K5UA 3QZFA 2XK7A 4EHEA 5AA8A 4PP7A 4L43A 2QG5A 3A62A 1CKPA 2QCSA 4EH8A 3T8OA 5KKRB 3HV6A 4H36A 3HVCA 3UTOA 4MX9A 4B9DA 4EZ3A 4QRCA 3TIZA 4QYHA 4IH8A 2C6MA 2WELA 3BYUA 4G9CA 2UZEA 2V22A 2WEVA 3PPJA 3UP2A 1F5QA 2OH0E 3RAWA 3TV7A 5LVPA 4B8MA 2W1DA 3KN5A 4ERWA 2G1TA 3AGMA 5AUVA 1UU7A 3WZEA 5KBRA 2UW0A 2I0EA 4MYGA 1Q61A 4P90A 3PSCA 3COMA 3MTFA 5IEVA 2H8HA 5B0XA 3EQFA 2ZM4A 3W8QA 4G3CA 5E8ZA 4LI5A 4HCVA 4FZ7A 1H1SA 4DEGA 4XBRA 3ZBXA 4CMTA 3VUTA 4S33A 3Q6UA 4G34A 5LMKA 4FV3A 4OT6A 3OUKA 3R73A 2OIDA 2QU6A 3OY3A 4NK9A 4Y5HA 5CF6A 3ZONA 5DT4A 1VR2A 2W9FB 4Y85A 1YXVA 1WMKA 4F0GA 4NH1A 4RZVA 2C1AA 3OD6X 3VUIA 1BI8A 4XV2A 5HBEA 2ZV8A 3GT8A 4ACCA 5HGIA 5AUZA 5ANKA 4E5BA 3LFCA 2VWBA 2OWBA 2YIYA 3KKVA 2CHLA 2HCKA 3LCDA 1H8FA 4X3JA 3KVXA 2WMQA 2BKZA 5CTPA 3VBWA 5FQDC 4IAYA 1OUYA 3TNIA 1Y57A 3QHRA 4YTIA 2QHMA 2R3KA 2X7GA 3QALE 4IVCA 2PMLX 2QOOA 3K54A 3KEXA 3C7QA 4AG8A 1ZMWA 3FV8A 3KXMA 4YTCA 5LCJA 3KF4A 5HCZA 2EB2A 3VRYA 1RE8A 4YHFA 3OEZA 4GU6A 5JFXA 2PVKA 3VUDA 1YXTA 2GHLA 4PX6A 1RJBA 3R8ZA 5AUUA 2ZDTA 4OAUC 3EQCA 1MUOA 3GC7A 4X3FB 3JUHA 4BGGA 2OXXA 4RA5A 3TL8A 3ZLWA 1Q99A 2WMAA 4J52A 4U7ZA 4WSYA 2OBJA 2XB7A 3OWKA 4ID7A 3RWPA 4LV5A 4KKGA 2IJMA 3E8DA 4IB5A 4CFUA 2IVTA 5CU0A 4QMNA 3NEWA 3NUXA 1NY3A 2PHKA 3AG9A 5E1SA 2BCJA 4FZDB 5HTIA 4AT5A 5KCVA 4E7WA 4YJVA 2WNTA 3R6XA 3LXLA 3PXYA 2XKDA 3BHYA 2QU5A 2ITQA 1Y6BA 3DPKA 5AP4A 4EEVA 1XBCA 1JLUE 3CPBA 4YTHA 1EH4A 2Y9QA 3R7UA 2YACA 4CKJA 3NIZA 5CASA 3DV3A 2F7EE 3QXPA 4FTAA 4JVGA 3RK5A 5LJJA 4PPBA 4QTAA 5E91A 2UW7A 5E92A 4FMQA 4FIFA 1UU9A 2J0LA 2UVXA 1ZOHA 1GZNA 3MPMA 4BIEA 3R8UA 5M44A 4FIHA 4NIFB 3UPXA 5AM7A 2WMSA 1SNXA 2XH5A 4AGDA 4FL3A 2VWVA 3DBDA 4D2RA 3BLHA 2XRWA 2IZUA 2XNNA 5J5TA 3CD8A 2BZKB 2IN6A 3BE9A 4X21A 4Y5QA 1KE7A 5AP1A 4B99A 5LVNA 5M4CA 1OL1A 2C6EA 4CMOA 1E1XA 4D2VA 2OSCA 4FT5A 4H39A 3NUSA 3FZ1A 4G17A 2ZM1A 3AXWA 4A9YA 1H28A 5DWRA 1Y8YA 3QX2A 5AX3A 2WEIA 5ANIA 5CF5A 4QOXA 2PVHA 4RZWA 5IMXA 4F9BA 2CMWA 4GFGA 3CGOA 5C8MA 4EOPA 4DAWA 3U6HA 1QPDA 4YJTA 2A19B 4GU9A 4J96A 4D5HA 4XCUA 2HK5A 3V5JA 1BX6A 3FMJA 3G6HA 1BL7A 4AX8A 3FXWA 4RFZA 3DFAA 3PUPA 5I3RA 4JDHA 4L9IA 4AN3A 4C37A 3DQXA 3UIBA 4F64A 3WIKA 2R9SA 5HQ0A 3BCEA 4O1PA 2QODA 3EQIA 5JRQA 4FV4A 3A7FA 4WHZA 4BTKA 4Z9LA 3ZRKA 4MCVA 4FTTA 3LZBA 2BZHB 2XK8A 3W33A 3R04A 5HO7A 4YJQA 5LVMA 5AM6A 4G3DA 4TYHB 4YLJA 2R3OA 3LVPA 2XUUA 4BDDA 4RFYA 3V04A 3JPVA 3CS9A 4RBLA 2JD5A 3ZFMA 1TQIA 4BWXA 3A2CA 4JBOA 2R7IA 3MN3A 3DK3A 3GCUA 2YERA 4FODA 3VBQA 3NRMA 2JC6A 3UMXA 4OAVB 3AC2A 4WRGA 4O0WA 4S34A 2C5VA 4FG9A 4YPSA 2GCDA 1CDKA 1J1BA 2G15A 4AOJA 3UYTA 4BTMA 4YZMA 4C3PA 5HX8A 3HUCA 5EDRA 2JLDA 3LLTA 2X6DA 5HIBA 3CD3A 1GAGA 2J51A 3ORMA 2YFXA 3H9RA 3LQ5A 3W2QA 4A9TA 2ZB0A 4JBQA 3VJOA 4YURA 4ZP5A 3V8WA 1NXKA 4QTCA 4G3GA 1JNKA 3R1YA 2CN5A 3VJNA 4M66A 2Z8CA 3FL4A 3Q4UA 4RJ7A 4ZSJA 3ORXA 4BCQA 4BKJA 3AD6A 3LFSA 4Z7HA 3VO3A 5AUXA 4YSMA 3QFVA 2W06A 4FV2A 5EYDA 4PMPA 5HD4A 4YU2A 3RI1A 3IQ7A 2OJ9A 4FG8A 2OW3A 4N70A 4OTRA 2WD1A 5HIEA 4FL2A 2HW6A 3TNPC 2ITPA 4YSJA 4RWLA 4USDA 2WTIA 4TNDA 3TTJA 2F57A 4LRKA 2IZRA 1H0WA 4N6YA 4ONAA 3C4ZA 4U43A 3NDMA 1U5RA 2YCSA 4Q5EA 3VS2A 5CALA 3A4PA 3QCXA 4MBJA 1QMZA 1P4FA 2RFNA 1XQZA 4FTUA 4I5CA 3MY5A 3SQQA 3ZU7A 2GNGA 2DUVA 3NNXA 1GZ8A 2W5BA 3MY0A 2RFSA 3COHA 4RX9A 1V0BA 4NKAA 2C5XA 3I6WA 4QP4A 3LM5A 4IAIA 2C5YA 4UEUA 4JR7A 2WGJA 5IEYA 1BKXA 3R1QA 2PVYA 3EHAA 3NAXA 2ITYA 1MQBA 3NAYA 4PNIA 3KU2A 3P7CA 4GJ2A 4MWIA 1OB3A 4RIWA 5L3AA 4YC3A 2CDZA 4AS0A 1OVEA 3ZLSA 5HBHA 1UNGA 3L8VA 3MDYA 3U4UA 4CZUA 5HTCA 2WIPA 3MBLA 3DAEA 3NYOA 4USEA 2P2HA 1GJOA 3ZUVA 2QO9A 5AWMA 3UC4A 3FYJX 4CLIA 4F6SA 4CNHA 4IAKA 3RNYA 3PTGA 3QYZA 5TKDA 4MD7E 4HVGA 2VTAA 3FYKX 3GC8A 4CRLA 3D7TA 4MEDA 4U0IA 5FEQA 4ZY4A 3FSFA 2J0KA 2JAMA 3QKMA 5FXSA 3TI1A 4K1BA 4E4LA 3QTRA 4F7NA 3HP5A 4QMSA 4ANSA 3Q4CA 3WYYA 1LR4A 1JKLA 3AMYA 4C38A 3AC4A 2VNWA 2Y4IC 4E73A 2C0IA 2KULA 4C0TA 4H1MA 4CLJA 3ORNA 1W8CA 4AN2A 1HOWA 2WTKC 4QPAA 3UVPA 4DHFA 3A61A 3PY3A 3UVRA 3MVHA 2F7XE 3DOGA 3QXOA 1APME 4ANOA 3ZC5A 4FV6A 3OOGA 4GG5A 2JKQA 4MXOA 5FD2A 4BHNA 2ZDUA 3E63A 2CGUA 1YOLA 4Y95A 4FSWA 4HPUE 1OIRA 2X0GA 1Y8GA 4MBLA 5IA2A 1U54A 3GCSA 4RIYA 2W4KA 3KULA 4EBWA 4FSZA 4RC2A 5HE1A 1PMEA 4IWOA 4YZDA 2WTVA 1B6CB 1YW2A 3M42A 3S2PA 1KOAA 4XG7A 4ZSLA 3KQ7A 4KKEA 4ASDA 3O71A 3OWPA 4FV7A 3DGKA 4FKIA 4ZZOA 2ERZE 3CLYA 3O8PA 3OT3A 1B39A 3FZOA 3DNEA 3P23A 1W98A 5HO8A 3WZDA 1KE8A 2XIZA 4PTGA 4V01A 3DBQA 3QQHA 2JIIA 4QMTA 5CU2A 3LW0A 4BCNA 4W8EA 4DFXE 4WIHA 3DCVA 3ZZEA 4XP3A 2YDJA 3GB2A 2VO6A 3VBYA 5K0KA 1H07A 4FKPA 5EFQA 3SXSA 1SVEA 4E8AA 3FQEA 3PA5A 3R9HA 3FLNC 4U6RA 5HEZA 1CSNA 4BCKA 2RG6A 3DAKA 3R00A 5ACBC 4GS6A 4JR3A 5HICA 1W82A 4RLKA 4UWCA 3S95A 3LFQA 2W17A 4HGSA 4IX4A 4CMUA 4M69B 5A14A 3C0GA 4AF3A 4IDVA 3U9NA 5CSHA 3UPZA 1NVRA 3TV4A 4CD0A 3LCOA 2XNEA 4HYSA 3TJCA 4E26A 4NU1A 4UX9A 2WFYA 5BQ0A 3CY3A 3F66A 3T9IA 2ITXA 2XIKA 2J6MA 3QLGA 4HVIA 3DLSA 2A4LA 3MYGA 3QHWA 3QZHA 1K2PA 3HMIA 4U9AA 3HNGA 3HMPA 4KBKA 1UNHA 2W1CA 3G9NA 2OF2A 5AJQA 3O0GA 3ROYA 5AP6A 2OICA 2ONLC 2H6DA 3PWYA 3ODZX 3BZ3A 3DU8A 4EJNA 5A6OA 5BUEA 1YKRA 4X2GA 2VTQA 3RZFA 5CNOA 5JN2A 5FBNC 3BEAA 3R83A 4FOBA 3QZGA 2VZ6A 4CVAA 4BCPA 3EB0A 4IBMA 5J9LA 2VUWA 2W5HA 4Q2AA 4XRJA 5AP3A 3E92A 4ASEA 2QVSE 4APCA 4I0SA 3AMBA 4EH4A 2XK6A 5J7BA 3H9FA 3Q6WA 3ZSHA 2B7AA 5ETFA 4DG0E 4F1MA 2WQNA 4L7SA 4XLIA 5HU9A 4NT4A 2JIVA 1JPAA 1XH5A 4DFLA 5BVOA 1OI9A 3N9XA 5HLPA 3EFJA 3QRIA 4NFMA 3TNWA 3RJCA 4FKWA 1R0EA 1IASA 4A9RA 5L2IA 3QKKA 4HOKA 3SOAA 3FPQA 5CI6A 1UKIA 5AR7A 2VTSA 2JGZA 4FSTA 3CQEA 3PXRA 4G16A 4D28A 3K2LA 2PUUA 4B8LA 3E3BX 5J5SA 4CT2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UMPA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations