5AR5A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310) complex with benzimidazole
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
307
structure length
284
Chain Sequence
EAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMEGGTIIYMPPENYEPSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 284
sequence length 307
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar5A00
1Q99A 1Y8GA 1WFCA 4QMZA 2BRBA 2W1FA 3UZTA 3QUPA 3PE2A 2B9JA 3W2SA 3LJ0A 5K0XA 3VUHA 1H1SA 4AA5A 4AOJA 4BI0A 2VAGA 3O7LB 2I0YA 4IXPA 3RAKA 2DUVA 4FIFA 1H8FA 1OL5A 5CF5A 3AC3A 4C59A 2QLQA 5CI6A 2GNIA 2GS6A 4AOTA 5FTOA 4JJRA 5DA3A 4AGDA 4X2FA 2YJSA 2W05A 4AE6A 3G9NA 4C3RA 4I5CA 5KMIA 4G5JA 4USEA 2ITNA 2QLUA 3R9NA 3TKIA 4I5MA 4JAJA 4GH2A 5K0KA 1BL6A 5IA0A 2J90A 4TYHA 2BDFA 3ZSIA 2BCJA 2OH0E 2XNOA 3E7OA 4MK0A 5DT3A 4FV6A 5HIBA 4RVTA 4CYIA 1U46A 1GZNA 3F69A 1W98A 4EQCA 4YC8A 4ANOA 2CLQA 4JRNA 4OTHA 3BWJA 3DFCB 3FSKA 2X9EA 3I60A 4IVAA 4RGJA 5AV4A 4EEVA 4YUQA 4BTFA 3L8PA 2X2LA 3CTHA 4EOIA 2HAKA 3KCFA 2PVKA 4HCTA 4ZTQA 1F5QA 3HDNA 4C4FA 4MD7E 1KOBA 3QD3A 4GT4A 1Q97A 3UYSA 5KKRC 1VJYA 4JQ7A 3KK8A 4KIKB 4N0SA 5FLFA 2VUWA 4EOMA 2C3KA 5AR5A 3QD2B 4H58A 2PZ5A 2ZAZA 1M14A 4YJPA 5KBRA 5JGDA 5LVPA 2VV9A 4BVUA 4FV5A 3E3BX 5JRSA 1ZWSA 2H6DA 5L2TA 5LMKC 4GJ2A 4FV9A 4CMOA 4NM3A 4IANA 3C4CA 4O1PA 5H8GA 3PZHA 2X0GA 4PWNA 4XMOA 3DY7A 2XM8A 4P90A 2GQGA 3GFEA 4FNYA 3HP5A 1G5SA 3ZUVA 1WBPA 2VTPA 3G5DA 4MWIA 2C3LA 4F7JA 3UDBA 1OGUA 3D2IA 5GNKA 5EDPA 5M55A 1XH7A 3LXPA 3ZDIA 1KE6A 4PPCA 5AR3A 3ZRKA 1FMOE 2C5YA 4QP1A 4XS2A 3AT3A 4FSWA 5AV0A 2UVZA 1YXXA 3SVVA 4Z7GA 1W8CA 2QOIA 2OK1A 2XNNA 4LV5A 4WG3A 5HVYA 1GIHA 4DGMA 1GNGA 4O2ZA 2OXYA 3TNPC 4Q9SA 2VO0A 3W33A 5FEDA 4HGLA 1BLXA 4NM5A 3NUUA 1OL7A 3V51A 4K9YA 4BTJA 5CAPA 5CEPA 3OC1A 4B8LA 2UW3A 3A7HA 3MY0A 4QD6A 4QP7A 4TPTA 4YPDA 4YZNA 5IA1A 5L2SA 3Q60A 4OBQA 3ZH8A 1QPJA 3O17A 4FV3A 5D1JA 2G2FA 3DQXA 4FZFB 2A4LA 2OH4A 5E1EA 4A9SA 3PP1A 3CPCA 3BELA 3GFWA 4JRVA 4EBWA 4TNDA 2Y9QA 2WTKB 4DTKA 3PJ3A 3W32A 2A1AB 4EKKA 3OY1A 5HD4A 3DLZA 2GNGA 3EN5A 3Q6WA 5CVFA 1OPKA 2UW8A 5AIRA 4WD5A 1DI8A 4FKUA 1U54B 2VWIA 2WMUA 5AP5A 5CEMA 3VWAA 4RFZA 5GHVA 4HVDA 2QONA 2XUUA 2E9UA 2Z7SA 4QNYA 4F70A 4RIWB 3RCDA 4ZZNA 4BDKA 1P14A 3KXZA 4FVPA 2X9FA 3W2RA 3BHUA 4I4FA 4YJNA 4HVHA 3NAYA 3C1XA 5ANOA 3QTRA 3SAYA 4O21A 1ZAOA 3CQWA 1PYEA 3QRJA 5AM6A 1W83A 5M57A 3C50A 2B4SB 4EH3A 2Q0NA 1WBSA 4AACA 2ZMDA 3PG1A 3GP0A 3LFEA 3DPKA 4QP8A 3ZRMA 1QMZA 1WVWA 3FI3A 4D2PA 5JZNA 5IU2A 4ZTLA 4KIQA 2W1DA 4O0TA 4AGCA 3LPBA 4E73A 4X2NA 5TR6A 3RI1A 1H27A 3SV0A 3OBGA 4XBUA 5B2KA 2W1EA 4F9AA 4NKSA 4PL4A 3VS2A 4QP4A 4Z9LA 3TUBA 3NIEA 2R3LA 3JS2A 3C9WA 5AM7A 4V05A 3EB0A 2PZRA 4S34A 2VTNA 4O0UA 4EK6A 2F7EE 2VWWA 4YR8A 4FKRA 3ZXTA 2YIRA 5CZIA 3EL7A 5D12A 3U9CA 5K5NA 3RM7A 4J53A 1W7HA 4IZYA 3PXYA 1H26A 1LUFA 1XKKA 2Y7JA 2YERA 2O8YA 3COIA 4KRDA 4TZRA 4X3FA 3BI6A 3KRJA 2IVTA 2PVNA 3DK6A 3K54A 2HW7A 3OZ6A 2V22A 4M68A 3CR0A 4WHZA 4ERWA 4L52A 3KMMA 4J8NA 4FTLA 4M3QA 3TNQB 3SW7A 3QA0A 1ZMUA 4KIKA 4MF1A 3W2PA 4XBRA 4AW5A 1S9JA 4L6QA 5CTPA 2VTRA 4HNFA 3A99A 4BHZA 1ZOHA 4Z55A 3WYXA 3AD5A 4E4NA 4GIHA 3R7OA 3ORZA 4CXAA 1KE9A 3CEKA 5EKOA 3R7EA 3KXNA 4U80A 5CSHA 3W55A 5JK3A 4TYEA 5FXRA 5A54A 2IVUA 4ALWA 4KIOA 4KINA 3TL8A 1NY3A 4KKGA 4H1MA 3CXWA 4GL9A 5J79A 3IDPA 4BKYA 1M2RA 1V1KA 2HY0A 4DHFA 3DS6A 4DG0E 4NTSA 1XBCA 3KRRA 3RNIA 4GFOA 1KOAA 2XK4A 4BCPA 3WF7A 4DFNA 4XG4A 3S2PA 3PYYA 3B2WA 3Q4UA 3HMIA 3T3UA 3O96A 3F7WA 3R63A 3EKNA 3MB6A 3QD0A 4IZ5A 3KXXA 2R7BA 5ACKA 3OEZA 2CHLA 4EYJA 2E9VA 3NW6A 4WRGA 3UYTA 4AU8A 4J99A 3AMBA 4PF4A 3PXFA 3TZMA 5BUEA 1YWRA 4RC4A 3P9JA 2XK3A 4KKEA 4M69B 1H01A 4OR5A 3ZZEA 2EB2A 4RWJA 4EZ7A 4JNWA 4XG3A 3CLYA 4HCVA 1UNLA 3CQUA 4G3CA 5IZFA 3TTJA 5HU3A 3HMNA 2W5BA 5EW8A 3MPMA 4GW8A 2XYNA 2BAQA 4NIFB 3MVLA 4WSQA 5C8MA 2J6MA 2EB3A 2V55A 5JFWA 4I23A 4HPTE 3MDYA 3EKKA 2XP2A 2PSQA 2XCHA 4JI9A 1J91A 2XBJA 4E20A 4U3YA 3CD3A 4U79A 2XKFA 5HBHA 3FMHA 4IQ6A 4WO5A 4GK4A 5AR4A 1U54A 1GZOA 3DAKA 2WMRA 2WTCA 5ETCA 2ETRA 3MW1A 1R0EA 4BDCA 4GCJA 4KWPA 3W8LA 1UA2A 4AGUA 2UZLA 2OJJA 5B7VA 4G6OA 4II5A 4TWNA 4RIWA 3U4UA 4EH2A 2BKZA 3COMA 5LMBA 1JKSA 2ETKA 3BHTA 4L00A 1DM2A 5J8IA 4IFGA 4K0YA 3WZUA 1GZ8A 5LMKA 3UTOA 2VNYA 5EH0A 4FGBA 2I40A 3QUEA 5DGZA 1LPUA 3QZHA 2R3KA 3TXOA 2HXLA 2J5FA 2YZAA 4JOAA 2WAJA 4N70A 4AT3A 4UX9A 3ZO3A 4IDTA 3P5KA 5HG9A 4I41A 4OTWA 1SVEA 2ITUA 3QQLA 4XG2A 5F9EA 3ZC5A 2IW9A 5LJJA 4F4PA 3VRZA 1I44A 3UVRA 2WTWA 1BYGA 4XH6A 3KGAA 2VD5A 3P7CA 4A4LA 2J2IB 5JFSA 2WIHA 4ZJVA 3KEXA 5DN3A 4UV0A 5J5TA 4RJ6A 3QKLA 2VX0A 4GT3A 4EJNA 5AMNA 2C3IB 5IF1A 1AQ1A 2KULA 4IACA 3MFSA 4EOJA 3U6HA 4YNOA 4UN0C 3S1HA 2BRNA 3FZPA 4JQ8A 3IW7A 3D83A 1IRKA 1FVRA 4XX9A 5IEXA 1PXOA 4PL3A 1PMVA 3T3VA 3BQRA 1MP8A 4BGQA 3LCSA 5IA4A 5BVNA 2VZ6A 4X6QC 4IVBA 4YLLA 2YCSA 4PL5A 4ARKA 5KHXA 4IIRA 3BIZA 4JDHA 4W4WA 2RIOA 3HRFA 5ACBC 4QPSA 4MQ1A 2O65A 5J7HA 3IDBA 5HEZA 4RLLA 3DBEA 5M53A 4ZY6A 5FDXA 3VS5A 3RBWA 2ZV9A 4XP0A 5TT7A 2UV2A 4G1WA 4AOIA 2WMVA 2UZVA 5CXZA 4MXZA 3A4PA 3LCDA 4JL9A 4FYNA 3ZM4A 3ZYAA 1YQJA 2YM5A 2QCSA 5HKMA 4DFZE 3E64A 4X0MA 1YOJA 1OB3A 4IADA 5CSXA 5KZIA 4AZTA 1LEWA 3BRBA 4EOSA 5IDPA 2WO6A 4RZVA 1T45A 4QTEA 3HECA 3FJQE 4QP6A 4EK3A 4YO4A 5BVFA 2R3JA 3AGLA 2YCQA 1SMHA 3C5UA 1U4DA 3LCOA 3R1QA 2XK8A 4O0SA 4XNEA 1UU9A 2ZV8A 3LFFA 1OKVA 4H3QA 5FG8A 4ANNA 5FXSA 2ITQA 2R3MA 4YZ9A 5IA2A 4FTOA 3NAXA 4AG8A 4FT0A 4JG8A 3ITZA 5BVEA 4GU6A 4YP8A 4AW2A 1P2AA 3LLTA 1K3AA 4ANSA 5BYZA 1CKPA 3D9VA 3UPZA 3VHKA 1YI6A 2FVDA 2V5QA 2CCIA 3FKNA 3L9MA 4PPBA 4XLIA 5H8BA 2R2PA 4F1OA 5DWRA 5HX8A 4Y85A 1U5QA 1TQPA 2EU9A 5H8EA 3WOWA 5KX8A 4EKLA 3SRVA 5M4IA 3LFBA 2IZRA 4NIFA 4PNKA 3A7IA 4OT6A 5M51A 2JKKA 5DLSA 1M17A 3VS7A 3GENA 4IVCA 3S3IA 4U6RA 5GJGA 4TYJA 4ZZOA 2WMWA 5IKWA 4X2GA 2Y0AA 4B0GA 4E4LA 2JAVA 5KO1A 4G3FA 2R4BA 1OITA 5LVLA 4BRXA 2F57A 4ENYA 5J5SA 2UZEA 4CMTA 4QMTA 5CASA 4QPMA 4CRSA 3VUIA 2OIDA 4GVJA 3R7GA 1FGKA 1GAGA 5J95A 4CVAA 1WAKA 3R02A 5E8UA 3KRLA 5DBXA 3OXIA 5JQ8A 2CN8A 4IWOA 1Y6BA 3NSZA 3O50A 3ORXA 3VN9A 4EK8A 4QYYA 3PFQA 3F3ZA 3REPA 2RL5A 4Q5HA 4AT4A 2PVYA 2B7AA 5AV1A 4PMMA 3VUTA 4DEEA 3I79A 3A60A 2FH9A 3HUBA 3A8XA 2P3GX 3RM6A 4KS8A 4R6VA 5AAEA 2J4ZA 2OG8A 3F5GA 4XRJA 4L46A 3MVHA 3FQSA 3HMMA 4TWCA 4GFGA 3AXWA 2AYPA 2QU6A 4V01A 3Q4ZA 4E5WA 3H9FA 2A19B 2EXMA 3A4OX 2CCHA 2VO6A 2X81A 3IGGA 4FTUA 3WARA 5HTIA 2JDTA 2ERZE 2P55A 3NW5A 3Q96A 2X1NA 2FUMA 1Q8UA 2G2HA 2VWZA 3GU8A 3PIXA 4F7SA 1XR1A 3WBLA 2C6LA 3O2MA 5EG3A 3UG1A 2BUJA 5AIKA 3VBTA 2PVJA 1FOTA 2X4ZA 3AC4A 1R1WA 2HZ4A 4PX6A 2GMXA 4HGEA 2RGPA 2PZYA 3VUGA 3D94A 3DJ5A 4YTHA 3CTQA 4FKTA 4BTMA 4O6EA 4AN2A 1PXPA 2HW6A 1WBTA 2CGWA 3ALNA 2H9VA 4FC0A 1CKIA 3FLQA 1P4OA 2Q0BA 5G6VA 3QAME 2HZNA 2R0IA 2BDWA 3UO4A 4FTMA 1Q61A 3SXFA 3F66A 5HOAA 4OT5A 5AUVA 5JRQA 5HE3A 3OUNB 3V5WA 3OOGA 3CGOA 3R8LA 2R64A 3FMDA 4G3DA 2UW7A 3UJGA 3R04A 5ITAA 3CC6A 3FSFA 5AP6A 3OCBA 2YM7A 4FI1A 3ORNA 3KN5A 1ZMWA 2XB7A 4HYUA 3QFVA 4DH1A 2J7TA 1RQQA 5KMNA 1I09A 3K3IA 4BC6A 3SX9A 3VS0A 3ZLSA 2J0JA 3UIUA 1MQ4A 3LIJA 4MBLA 3RHKA 4IAYA 3Q2MA 4ACMA 4XYFA 4CCBA 3DQWA 4BWXA 4RWIA 4C8BA 4IM2A 4FTJA 4RIYB 4YJOA 5CU2A 3Q9YA 4F7NA 4QYGA 4J8MA 4TYIA 4FZ6A 3FYKX 3PA5A 4FT9A 3RINA 4DGOA 1JKTA 4LFIA 4WNOA 2ZB1A 4R3RA 4BBMA 4I4EA 4L3PA 3PWDA 3E92A 4R5SA 5D7VA 4ANQA 2BAJA 2JBPA 5GZAA 3PJ2A 1S9IA 1YHVA 4O96A 3PY1A 4C36A 3PPJA 3GEQA 4RA5A 4FVRA 4TY1A 5DE2A 2JGZA 3R2YA 3NNXA 4ZTNA 3AMAA 4MXXA 3VAPA 3VIDA 3FI4A 1J1BA 2XRWA 4C35A 2HELA 3QTZA 4K6ZA 5LARA 2C6MA 1J1CA 3KVXA 4PDSA 3ZHPC 2QKRA 4FV7A 3R21A 1UU7A 3RZFA 3DBDA 4CV8A 2XNEA 3BV2A 3OWJA 2YIWA 4A7CA 4YBJA 3UIXA 1BMKA 2CGVA 3NYVA 4J1RA 4K77A 3HX4A 3TG1A 3GVUA 4V04A 2HWPA 4CTBA 3R22A 1YWNA 3LAUA 2WMAA 3EZVA 1XQZA 2EWAA 4L8MA 5AV2A 3V5TA 3JVSA 4CNHA 5EM6A 3HKOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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