5AR5A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310) complex with benzimidazole
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
307
structure length
284
Chain Sequence
EAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMEGGTIIYMPPENYEPSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 284
sequence length 307
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar5A00
2H8HA 4IB1A 1M2RA 2R3RA 3JXWA 3VF8A 2QNJA 5AUXA 4BTKA 1DI8A 3GCQA 1TQIA 2PZRA 3PA4A 2R3FA 5BVOA 4LRJA 3OMVA 3G90X 5DRDA 1XKKA 3UNKA 5GZAA 3OC1A 2E9PA 2OJFE 2ITUA 4YJVA 3DS6A 5E8TA 5LMBA 2QQ7A 2UZBA 1PXJA 2W1CA 4U43A 3L9NA 4CMTA 3MGYA 4QMWA 2QOLA 1OKYA 3VS6A 2DWBA 1FINA 4FSNA 4DGNA 2F2UA 4B99A 3VAPA 4M97A 4BCPA 4D5KA 3D5XA 5JH6A 4GFMA 1B38A 3BYSA 4N6YA 4TXCA 3UO6A 3A8WA 4EH4A 3HP5A 5DT0A 2X4FA 2HWPA 2JDRA 4FT7A 4I1ZA 1P4OA 3C51A 3FKNA 4YU2A 3CPCA 5C01A 3H4JA 5DOSA 4ZJVA 3ZSGA 3RBWA 2OXXA 5BX0A 2OJ9A 5BYYA 5JQ5A 2ITYA 4KBKA 3SKCA 4ZK5A 3MVHA 4PDPA 2GNFA 3MFRA 3MJ2A 2VGOA 5ANKA 2WTKB 5JN2A 3F5GA 4LV5A 4ZTNA 3PIYA 1Y6BA 2CLXA 3KXGA 2WQMA 3NCGA 3QHWA 4LMNA 4EOKA 2IZTA 4CCUA 3AT3A 4V0GB 3MWUA 2F49A 2IVUA 4RVMA 4I20A 5IEXA 1LEWA 5IDNA 1H01A 5J9ZA 3GU5A 3VJNA 4JAIA 5CXHA 4ZP5A 1R78A 2J0KA 5FXSA 4TTHB 5HZNA 3JVSA 4XHKB 3R02A 3IQ7A 3RINA 1PYEA 5EW3A 2GFCA 4IVAA 3DB8A 3DFCB 3UC4A 3R9NA 4ENXA 2VWYA 3O2MA 2UZNA 3UTOA 4M0YA 4J98A 4QPMA 1MUOA 4TT7A 2X7GA 4UEUA 5CQUA 3TTIA 3W8QA 3F3WA 4HZSA 4BDIA 2ITZA 4ANLA 3U6HA 3BEGA 4FKSA 3FAAA 2OI4X 5BVWA 3QYZA 5HX8A 3MS9A 3KKVA 3RPRA 4CEGA 5FEEA 4U8ZA 1FOTA 5J1WA 1RE8A 2DUVA 3LQ8A 3VS2A 3IECA 4S31A 4FTRA 4EH9A 4C57A 4N4SA 4R7HA 3AC3A 3HX4A 3V5QA 4AACA 4MX9A 4LG4A 3QCXA 5DEYA 3Q53A 2PVMA 4NW5A 2CHLA 1KE5A 3W2SA 4ERKA 4QTCA 5C27A 5TR6A 1UNGA 3PPJA 3F7WA 5F20A 5J1VA 4YHTA 4NFMA 2WTKC 5HG9A 4JJRA 4FTJA 3BQRA 5EW8A 5IA2A 4EHZA 4U79A 1KV1A 2ITQA 3CCNA 3FQEA 4KBAA 4R5SA 4XV2A 3T9TA 3TIZA 4IHPA 2YIYA 1SZMA 4E26A 3WZJA 3HA8A 3TN8A 3G33A 5E91A 5ITAA 2WNTA 3OWJA 2WKMA 3NUXA 3WIKA 4U7ZA 2QOIA 4PTCA 5JQ8A 4QMVA 3CY2A 5BVEA 4EH5A 2R3PA 2YCFA 1V1KA 3L9LA 3DA6A 3Q52A 4FV3A 3NYOA 4J71A 4GT3A 3R8MA 5ANGA 2G2HA 2PUUA 3HDMA 3ULIA 4D2WA 4CT1A 3MH0A 5AP2A 2YM3A 1QPDA 2J4ZA 3IGGA 5L2TA 3RK9A 5M55A 3VRZA 5B2KA 4EC9A 2JKQA 3BHTA 4UWBA 1JKTA 3Q9ZA 5DG5A 4ZTQA 4IM3A 1BL7A 5EM6A 1H27A 3FZRA 3MH1A 2CSNA 3C4WA 4I22A 3RAWA 3PXYA 1XWSA 3R7UA 3AMYA 3W8LA 1MRUA 5CVHA 3EMGA 4IJPA 3UIBA 3A7HA 5EM8A 3KRRA 3PXQA 4BI1A 4XBRA 1OPKA 3F2NA 5KZIA 1H1PA 2E2BA 4AGDA 1Q8UA 1DAYA 2CGXA 3I5NA 4P5ZA 3HP2A 2CCHA 3TKIA 3MTLA 3AGLA 5C8MA 3U51A 4FICA 1YDRE 3BBTB 2GMXA 1WBVA 2JIIA 4QP2A 4FKJA 4UMQA 3ZS5A 5KMLA 1YXVA 3R7YA 1FMOE 3RAKA 4QQ5A 5L2QA 4KBCA 3V6RA 4TWOA 3N51A 4V01A 3VS1A 3F5XA 3ORPA 2W0JA 3PTGA 4L67A 4WG5A 4EH7A 4XNEA 3AGMA 4APPA 2RFDA 4EKLA 5ICPA 1Q4LA 2C1AA 3COKA 3CY3A 4FTLA 4IZAA 4YHJA 1UKHA 5HVJA 1FQ1B 4XEYA 4K8AA 3BLQA 4CQEA 5HHWA 1OUYA 2FA2A 2YABA 3FSKA 4U81A 1NVQA 4QP1A 2AC5A 3FXWA 3QQGA 3L8VA 3GC9A 4JR3A 4KIQA 3PP1A 5AP5A 2R2PA 5AV1A 3CQWA 3P7AA 4KS8A 4OTIA 3IPHA 4ZSEA 3SA0A 2P4IA 3CIKA 5JZNA 1URWA 2HWOA 3D4QA 3R63A 4D2PA 3UMWA 5LOHA 1XHAA 4JBVA 5EOLA 1BI7A 5D12A 2OH4A 3ZTXA 2WMRA 3LOKA 5AR2A 4IWQA 4F7JA 3PIZA 5KMIA 2BRNA 3HZTA 3R01A 4XYFA 4U44A 2DYLA 1U54B 4L44A 4U0IA 3DU8A 3LFSA 3PZEA 3ODYX 3GXLA 3IS5A 3OCTA 2F7ZE 3CKXA 3QKLA 4UALA 5AR3A 3WF6A 4AA5A 2XBJA 5HLNA 4ASXA 4FIIA 3TL8A 2GNHA 4DGGA 2HYYA 3GU4A 4HCTA 4TNBA 3MJ1A 2W05A 4YMJA 2YAKA 4GS6A 2AUHA 5EH0A 2XIKA 3BGPA 4GVJA 3MFTA 4EKKA 4YJNA 1Q8ZA 3LQ5A 5A9UA 5BVDA 4UXQA 4MH7A 2ZJWA 4BWPA 4S30A 5DE2A 4YTFA 3H10A 4I23A 3GB2A 3IW5A 4L01A 5CF6A 4RA5A 4FTKA 4YSJA 5IF1A 4DFNA 1XH5A 3UGCA 2AYPA 4FK6A 2HIWA 3AT2A 3C4XA 3CP9A 3HV6A 3UC3A 4B9DA 5J5SA 2ZM3A 4W8EA 4O21A 3OT3A 2C6TA 3GNIB 3Q2MA 3BCEA 4JQ8A 5HEZA 2JITA 4XLIA 4RZWA 3GBZA 1YI6A 2YDJA 5CEOA 2O3PA 4CTCA 4NM0A 4W4YA 4F1MA 2WAJA 4IM0A 4RFYA 4EOJA 5IUHA 3AD5A 4IDTA 2KTYA 4Z9LA 2C3LA 2O65A 3BX5A 3LXNA 1J91A 4QTAA 4XBUA 5L4QA 4KA3A 1ZZ2A 3F3UA 5FM2A 3QYWA 4DYMA 2BTRA 2WTJA 4MCVA 4U45A 4IACA 1A9UA 4HYSA 1M7QA 3RNIA 5JGBA 2YFXA 2UW4A 3VULA 4RJ3A 2ZM1A 4FZ6A 4BDJA 4QD6A 4TPTA 4Q2AA 3ZC5A 5IA3A 2OBJA 3QTRA 4XRJA 5GNKA 3UJGA 2FSTX 1ZWSA 2OF4A 3LHJA 4XG9A 4O0YA 3FMDA 4C8BA 4CD0A 4Y83A 3P9JA 2OXYA 4NTSA 3GC8A 4IMYA 3KXXA 4PPCA 4BGQA 4OAUC 3TKUA 3PE2A 4IANA 3LCSA 3VF9A 2F4JA 3R2BA 3QCQA 4RA4A 4I4EA 4RIYB 3SOAA 3COMA 2J90A 3EFJA 3QQLA 5AX9A 3SW4A 1ZMVA 2ITXA 4NW6A 4RJ6A 4XX9A 2ZM4A 2QU6A 5H9BA 3ZDUA 2VGPA 4AW0A 2JLDA 4PMSA 4E8AA 5CS6A 4DCEA 4RIWB 3V5WA 4BZOA 1FPUA 3IKAA 1H26A 1RQQA 3EQIA 4O0WA 4TYHA 5T6KA 3BU5A 2P2HA 3LZBA 4KABA 4L00A 5HX6A 3FPQA 4I5PA 4QOXA 4ARKA 3ZC6A 4QMXA 5HNBA 2X7FA 5DRBA 2GNGA 3DJ6A 3I5ZA 2FYSA 3C1XA 2HK5A 2YITA 3MYGA 4FIGA 3OTUA 4PMMA 4QMTA 5M4UA 3PXZA 5JT2A 3QC4A 2QLUA 2C47A 3GC7A 5B0XA 4EH3A 3LVPA 2UVZA 2XZSA 3C7QA 4FTUA 3RAHA 3R28A 4HPTE 5HE1A 2GDOA 2BZHB 3IW4A 5J9YA 4AWIA 3DAJA 3OTVA 3AMAA 1QCFA 5KMJA 3R73A 3EQPA 3MDYA 2QG5A 3WZDA 3VUIA 4EH6A 3UOKA 4G17A 1FGIA 3QF9A 4X3FA 3JVRA 4PNIA 4OTPA 1UU3A 3EQHA 4W4XA 4DH7A 4LL5A 3LFDA 1MRYA 4CKRA 1YWNA 3EL7A 1XH8A 2DS1A 4CFWA 4X2GA 3EKKA 3NGAA 4FSZA 3RTPA 4X3FC 4L6QA 5DBXA 2ONLC 5H3QA 2ITVA 3G51A 5CI7A 4ANNA 5AUTA 2IN6A 3ZXTA 2UV2A 4JG7A 2W1ZA 2BFXA 4D2VA 4PL3A 1W98A 4DBNA 5EKNA 2OO8X 4YJTA 3OUKA 3OEFX 3UO4A 2J6MA 2OGVA 4IXPA 3O7LD 3V8TA 2QOHA 3CS9A 3UG1A 4IZ7A 4YZ9A 4JAJA 1LP4A 3PVWA 4HGTA 3P1AA 4CCBA 4DG3E 2XKEA 4CNHA 2QOCA 1OIUA 3ITZA 2RG6A 3MTFA 4P7EA 1OL2A 3ERKA 3P78A 4AP7A 4ZY4A 3B2TA 3GCSA 2XIXA 4BCOA 4YLJA 2P2IA 4ALVA 4GT5A 4ANBA 3ENHA 5IU2A 4G3GA 3TI1A 3UO5A 4FF8A 1YHVA 5CLPA 3NYXA 2JKMA 4AUAA 2JKOA 5F95A 1PXNA 3O17A 3GT8A 4Y5HA 3QGYA 2VUWA 3LFCA 4DEGA 3F6XA 3JS2A 3D5WA 4QMZA 2PZ5A 4HNFA 2VU3A 5D10A 2R3NA 4P2KA 4XG2A 3NLBA 3BYMA 2G15A 3KQ7A 3NPCA 2PVRA 4AN3A 3CGFA 1X8BA 4FV5A 3CBLA 4TYJA 2XH5A 3FZ1A 2EWAA 2HZNA 2VAGA 3LFQA 1XH4A 3PJ8A 4Y85A 4AN2A 5IH4A 2QD9A 3ENMA 3AC2A 3BYVA 2BHEA 4QPAA 3R8ZA 3R00A 3KA0A 5AIKA 3EFWA 1GZ8A 3ORMA 2R0IA 3ALOA 2WELA 4FV2A 3L8PA 1PXIA 4WG3A 3EKNA 1ZYDA 3I1AA 4PPBA 2G9XA 1W0XC 3DB6A 3EN7A 1WFCA 4RFZA 4YZMA 1NA7A 4I6QA 4NH1A 4XV1A 4O22A 1OITA 2A27A 4IH8A 5C8NA 2C5NA 4RX8A 4EUUA 3Q3BA 5AR4A 1WBOA 4YC3A 3WF8A 4O6LA 5HG7A 3OWPA 4DFLA 4LOPA 1M7NA 1R1WA 2VTAA 3SOCA 4E6CA 1BLXA 3O50A 5ACKA 1W8CA 2YDIA 2R7IA 3PJ3A 4IB3A 2VX3A 2C6MA 3QD2B 1PXLA 3BWJA 3NYNA 2RL5A 2YN8A 1CKPA 3MH3A 3DGKA 4A9SA 3Q4UA 4F9AA 4YBKA 5C26A 2PHKA 1O6LA 3F5UA 3GGFA 3QC9A 4IADA 2J51A 3IO7A 3ORTA 5M57A 3KRJA 2WOUA 1OL1A 1Q3DA 4ZIMA 1FVRA 2IVTA 2W06A 4H39A 4QMQA 4XLVA 4QTBA 2PVFA 4FV4A 2WGJA 4KSQA 4QO9A 4XMOA 5TOZA 3DNEA 1GAGA 5HG5A 3JPVA 2RIOA 5AA9A 3COIA 3G2FA 3UE4A 1V0BA 4JDKA 3GOPA 2DQ7X 3WE8A 1YOLA 4L68A 2VTHA 5K4JA 4WIHA 2C5OA 5CSVA 5CU6A 1OECA 3VW8A 3UIUA 4BKZA 2QCSA 3AG9A 4WKQA 4A9YA 4F63A 4B7TA 1YRPA 1OI9A 5KCVA 3CD8A 5CVFA 1YWRA 3NW6A 4PL5A 5HBEA 4F0FA 5JGAA 3UP7A 1PXPA 4LV8A 5I3OA 2BKZA 2F7XE 3ZBFA 3BELA 3V5LA 4AX8A 5M4CA 2YAAA 2VWUA 5EKOA 5HNGA 4NEUA 4FSTA 2GU8A 1Q97A 4M12A 4GH2A 3WOWA 3QRJA 3D7TA 2WPAA 3SQQA 4AW5A 1H24A 4GYGA 3RZFA 4KIOA 3CEKA 4ACMA 1AGWA 5A4QA 3GVUA 4RMZA 4CZTA 5GJDA 5ANDA 3F82A 4G6LA 1YXSA 2I40A 3GC0A 3OXIA 5ACBC 1YOJA 2ESMA 4DG0E 1RW8A 4Q5EA 3Q9YA 4K2RA 3DCVA 2ZAZA 3IDCA 3V3VA 3DJ7A 4BZDA 1Z57A 2WU6A 2WHBA 3WE4A 1O6YA 1URCA 2QONA 3KMWA 1BL6A 4QMSA 3S4QA 5E7RA 2BTSA 3PSDA 4NJ3A 5IUIA 2C1BA 3CJFA 4HOKA 4DG2E 4IAAA 5IUGA 2FGIA 3H0ZA 5CI6A 2YJSA 5ANEA 3SAYA 2XJ0A 1ZARA 4ANSA 3FL5A 4W9XA 3K5UA 1S9JA 4NT4A 2E9VA 3BHVA 5JFWA 3M42A 3PG3A 4BZNA 5HESA 2EXMA 4NJDA 5LCJA 2WU7A 3ZOSA 1SYKA 1H1WA 2R0UA 1K9AA 2PVKA 1OZ1A 2JGZA 3BGZA 3MI9A 3R21A 4G3EA 4QP6A 5FEQA 4EOLA 5HICA 4K1BA 4WNMA 5H8BA 3BHYA 4N70A 1BMKA 3DNDA 4CTBA 2UW7A 3SW7A 5K4IA 5AAFA 3ET7A 1PYXA 3FY2A 5EHLA 1ZOGA 3I6WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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