5HO6A

Crystal structure of cmet in complex with cmpd.
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
294
structure length
240
Chain Sequence
VQAVQHVVIGPCVYHGTLIHCAVKSVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Pharmacokinetic and Pharmacological Properties of the Potent and Selective MET Kinase Inhibitor 1-{6-[6-(4-Fluorophenyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-3-ylsulfanyl]benzothiazol-2-yl}-3-(2-morpholin-4-ylethyl)urea (SAR125844).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 240
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ho6A02
2WQMA 5CEQA 2R3MA 2P2IA 4U5JA 4CTBA 4GK4A 3VJOA 3DKOA 3PWYA 4DTKA 5CEMA 2XS0A 2GNLA 3BBWA 3FI4A 1GIJA 3QXPA 5LCJA 5BUIA 2X39A 5EDRA 2FSMX 4GH2A 5JKGA 4CFXA 4I1ZA 3VS0A 3OTVA 2CGXA 3LIJA 4YJOA 3W2CA 4S32A 4ZTMA 5FTQA 1SNUA 3FXXA 4PL4A 3R04A 1U59A 2F2UA 2PK9A 5M53A 2BKZA 4UMUA 1H08A 2YWPA 3QD2B 4OBQA 4Z7HA 5FXRA 2C3JA 3MJ2A 1YQJA 5A6NA 5AIRA 4QMYA 3W2RA 4H3QA 2JGZA 5HVKA 4EC8A 4RWKA 4ZSJA 1NVSA 2Y6MA 4G17A 3QTZA 3BELA 3MYGA 2ZYBA 5JH6A 2HY81 2HW6A 4G3CA 4ALWA 3RMFA 4FL3A 5HE1A 2BFYA 1XH7A 4FT0A 4LQMA 2Q0NA 3G2FA 3ZO3A 4ZAUA 4EOKA 1F5QA 5JZNA 2EXCX 2QHMA 5A46A 3K3IA 1FINA 1NVQA 3ORNA 4BDEA 3BLHA 1W7HA 3FDNA 4YZBA 3IW5A 3R2YA 5GZ9A 5FG8A 1J91A 4CNHA 1VR2A 3B2WA 4JJRA 4P5QA 4IANA 3VHKA 3COMA 3P4KA 3W2PA 2I1MA 2GNFA 2YLFA 4HZRA 4WIHA 4XUFA 4L53A 4FIFA 2JKOA 5EM5A 1PXMA 3UPXA 3VS6A 5I9XA 5CXZA 4FV8A 4D4SA 4EK3A 3QD4A 3U4WA 4V05A 4KD1A 2PVYA 3F5PA 1P4OA 3UZPA 3I7CA 3PYYA 5AR7A 4XMOA 3RALA 4I24A 4QMLA 3NW7A 2ZMDA 4YUQA 3DKFA 2OH0E 3PSBA 4WBBB 5A3XA 2ZOQA 3NYOA 4FSNA 5HG7A 4JAJA 2QU5A 3GENA 3W1FA 3FZPA 4O22A 4DG2E 2XKCA 5KBQA 3IW8A 4I0RA 2UW0A 2ZV2A 2RFNA 2XIZA 3EMGA 5DPVA 4ZTLA 5H3QA 3VAPA 4AGDA 1E1XA 2XZSA 3LXLA 4WRGA 3QQLA 1YXXA 4D2SA 4OTWA 4UXQA 5AV3A 4CLJA 4GIHA 5L2QA 3VN9A 2W7XA 2PZ5A 4RLKA 4CCUA 1U5QA 2QOLA 3EQFA 1ZRZA 5AUXA 3I79A 4GCJA 3PRIA 3DA6A 5FDPA 5L6OA 3V6RA 2YDJA 3ANRA 4HVIA 4F6UA 2OJGA 2E2BA 4DH3A 1WCCA 3GUBA 4J71A 3V5QA 3CGFA 5M4UA 4L7SA 3BU3A 4LI5A 4IX3A 3R0TA 3OXTA 4RFYA 3UO4A 4BDIA 4AAAA 2VX1A 3OEZA 5ANGA 3CJFA 3ENHA 3DAJA 3OCBA 4YO6A 3TUCA 3F2AA 4GSBA 3FKNA 1LP4A 3QBNA 4OAVB 5AV2A 3OG7A 3A60A 2UW9A 3RPOA 4EHZA 3H4JA 3UMWA 3P5KA 1YI3A 4QMPA 1DI8A 3U8WA 5DNRA 4XV1A 4F9WA 1VEBA 2DYLA 1RQQA 2I40A 3MPMA 5M57A 3FZTA 5HNIX 4KAOA 4IFGA 3FXZA 5AIKA 4R7HA 1OKZA 4R1YA 3ZC6A 1GZNA 3FMDA 3W8QA 4W9XA 2B9IA 3LFFA 4XRLA 4C57A 2H96A 5IDPA 3HKOA 1LPUA 2R3KA 2B9FA 4FT5A 4UY9A 3UTOA 4BTFA 4YNEA 3UNJA 4CVAA 5L4QA 4QYHA 4E6DA 5CSWA 3LCKA 2VTIA 3QAME 2RFDA 5AAGA 1Q4LA 4MD9E 3QX2A 1NVRA 3QYZA 2W1IA 2B53A 3R7IA 4USDA 1ZLTA 3IGGA 4D2TA 1WVYA 5FGKA 2ACXA 5M51A 3LM5A 1J3HA 3B8QA 4ITIA 3R7UA 5A9UA 1Q61A 4RGJA 4FOBA 4FYNA 4ITHA 4NEUA 4M15A 1OIUA 4K11A 3H30A 3KCKA 3TV7A 3VJNA 5DVRA 4ZLOA 3QLFA 4EOOA 3HV3A 3L8SA 3T3VA 4FT3A 3ZM4A 2QURA 3RTPA 1B38A 5LMAA 3ZCLA 3GP0A 3MH1A 1KOAA 2OKRA 3LXNA 4S34A 3BLQA 1OL5A 1XQZA 2BAQA 2BZIB 4U79A 4ZP5A 4BICA 3C4XA 4ZSEA 3D4QA 4GV1A 4GEOA 4YJTA 5IEVA 4L52A 4EZ5A 5CI7A 2BPMA 5HICA 5CVGA 4RQVA 3WF5A 3HA6A 4FV2A 4C35A 4U8ZA 4AE9A 3LCDA 4BZNA 3G51A 3DJ7A 1LEWA 3MJ1A 3WF7A 2IO6A 3L9NA 5A4QA 2AUHA 3MI9A 3F5XA 1PF8A 4D2WA 5T6KA 4F08A 3F3ZA 3DFAA 1OIYA 2EWAA 3FL4A 4A7CA 4HGLA 4IZ5A 5LWNA 4ID7A 4IAZA 5HX8A 2BAJA 5I0BA 2UZVA 2O8YA 4AQCA 4GL9A 2GFSA 2WIPA 3O7LD 4BGGA 1B6CB 3N9XA 4MK0A 4RIYA 4YSJA 3TNIA 4W8EA 3AC4A 3F2NA 3FBVA 2YHVA 3PY0A 4RC3A 4ANBA 3C4EA 4P90A 3GEQA 3VUGA 1W98A 2J7TA 3HLLA 5KMJA 5TOZA 5A4EA 4DBNA 5JSMA 2GQGA 4OR5A 4DINA 4A9SA 5HCZA 1V0OA 3TZ8A 5IDNA 4YJSA 3R9HA 5BYYA 1UU8A 1GJOA 2PZPA 2WMAA 4PMMA 5KNJA 2YM4A 4FTLA 2X6EA 2BRNA 2ITVA 4LV8A 2SRCA 3R71A 1YWRA 4JI9A 4QD6A 4QP9A 4FA2A 2PY3A 5BPYA 5J8IA 1XH8A 2PWLA 3BGQA 4PTEA 4XG7A 4UEUA 1EH4A 4G3GA 4RIWB 4Y85A 4BZDA 3HMNA 5AR8A 4BBEA 4D2VA 3BEAA 4BB4A 3A62A 3Q96A 3QX4A 4Q9SA 4BI1A 1WBPA 2C69A 3I4BA 3VS5A 3ZDIA 1ZY4A 4OT6A 2V22A 3RAHA 5LCKA 2UUEA 1FGKA 5E1SA 4FTMA 2PUUA 4FTCA 4RJ8A 3I5ZA 3ALOA 1JSVA 4ZSAA 4GU6A 4XBRA 4QQ5A 3H10A 1R39A 3HL7A 3DBFA 3PVWA 3DU8A 3TUDA 2F9GA 5HE0A 2QODA 4QP1A 3QRKA 2VUWA 4OTHA 5BVFA 4F1TA 2DS1A 2FO0A 3O8TA 4IAKA 3BHTA 3RNIA 2OJIA 3CKWA 3DDQA 3GU4A 2ITXA 4TTHB 3QA8A 2EXEA 5AP5A 4CCBA 5KHXA 3DAEA 2P3GX 3EH9A 3R6XA 3Q60A 4OTDA 4C3RA 2JIVA 2X7GA 4FSRA 5AUTA 4M8TA 2XRWA 4MHAA 2C0OA 5FEDA 3OY1A 3ZLYA 4UMRA 5CAVA 2G2HA 1R0PA 3NEWA 4KSQA 3VO3A 1I44A 3LCOA 5DMZA 4AW1A 4Q5HA 3WF9A 3TACA 3RNYA 4IH8A 2OIDA 4BDBA 3P7CA 5LXMA 4YJUA 2XKFA 5J9LA 4AX8A 2CCIA 1HCKA 4BDAA 2QHNA 3ZONA 4U7ZA 2OJJA 3FLZA 1YXSA 2CKEA 3II5A 4AP7A 2IVSA 3K54A 5IMEA 3UYTA 5IA4A 2B52A 4KRCA 5A14A 5KMMA 2XK4A 4Y72A 4YGAA 3R9NA 5E8TA 4AZFA 5J9ZA 5JFXA 4XS2A 2YAAA 5HTIA 2XNOA 3WARA 4ENXA 3JY9A 2UZBA 4ALUA 4D5KA 3WOWA 3MY5A 2W1GA 2XK7A 4E5AX 3HV4A 2IZRA 3HP2A 2JLDA 4GFGA 4IE9A 5HKMA 1E9HA 2B1PA 4I4FA 1YXUA 2RFEA 1CDKA 3GFEA 3T9TA 5HG5A 4M97A 3NAXA 3KULB 4MD7E 5HO7A 4HGTA 5KKRC 2XNPA 1RDQE 2JIUA 4U3YA 2PVHA 5AP4A 4XEYA 4GT3A 3R02A 5JRQA 5AX9A 4UX9A 2X4ZA 4JL9A 4YJPA 3DOGA 5LVMA 2ITPA 4XLVA 2UZNA 3BHVA 4Z9LA 4YZCA 1DM2A 5KE0A 4A9YA 3RAIA 3UNKA 2XJ1A 2WTIA 3GU6A 2OJFE 4FTAA 3VF9A 3R8LA 2R9SA 3NYXA 3ZYAA 4LYNA 3PFQA 4QTAA 3G9NA 3OBGA 5CU2A 3ZH8A 5JT2A 2ZV8A 1WFCA 4MKCA 5ANIA 1OECA 4B7TA 3KRXA 4U44A 1UNGA 4F0FA 3SRVB 3D5XA 3WE8A 3G5DA 4OTFA 4LUDA 1RW8A 4USFA 2F2CB 3OMVA 4IFCA 3F3UA 5B0XA 5C27A 3S2PA 4F0GA 3DBCA 3PA5A 1KV2A 4FL2A 1H00A 3EQPA 3OT8A 3B2TA 1QPDA 2PE2A 3I7BA 3UP2A 3A7HA 4FK6A 2FA2A 1MRYA 5J87A 4ZK5A 1YKRA 5LJJA 2FSTX 2WQBA 5CLPA 3QGWA 2WMVA 2OIQA 4NKSA 2XH5A 4W9WA 4HVGA 3PVUA 4CYJA 5HIDA 2F7ZE 4EJNA 4DFZE 4QQTA 3AMAA 3BKBA 3N51A 4QYYA 1IA8A 4CMUA 3V51A 5AM7A 2XK8A 1PKDA 4YLKA 2B54A 3C0IA 5KCVA 2BCJA 2BRGA 4DCEA 3CTQA 3CGOA 3MIYA 3LZBA 2VX3A 1XR1A 4O2PA 4BDHA 4PMPA 2E9PA 4TZRA 3QC9A 1YXVA 4MWIA 3L8VA 3E7VA 3R7EA 4BVUA 3P1AA 5D9HA 2YISA 4XP2A 3FLWA 4QQJA 1NA7A 5B2LA 4I5CA 4I6HA 1H1SA 3D94A 4YURA 5JZJA 5J95A 1T45A 3O71A 3UC3A 2HK5A 5JRSA 2UZEA 4RC4A 3G0FA 2J0IA 3RHXA 4KB8A 3VWAA 2QO2A 4RX7A 1L3RE 3C0HA 2PZYA 4OTRA 5LMBA 3ELJA 3AC8A 4F70A 2WOTA 3FQHA 3OXIA 2VTRA 1UU3A 1JKTA 2F7XE 3PG3A 5CZIA 2VTAA 5EDPA 2HXQA 2O2UA 5FRIA 2VN9A 4RC2A 3V6SA 2GTMA 4AT4A 3RPYA 3R7YA 3UDBA 1WBOA 3EB0A 3PIXA 1UWHA 2C1AA 2C6LA 2JEDA 2Z8CA 3DJ5A 4CD0A 3NRMA 3C4WA 5ETIA 3KC3A 3QHWA 2A19B 1U54B 1Q8ZA 4IVBA 2ERZE 2YABA 3NW6A 3PRFA 1YI4A 3WIGA 2EXMA 2VWVA 3HMOA 4GG5A 4EL9A 2VTOA 3NWWA 2HW7A 4AA5A 4ANLA 3C13A 1KE5A 1H27A 2E9VA 2E9NA 4X3JA 4RJ5A 5CWZA 1DI9A 4DAWA 4WNOA 2YJSA 5I9UA 4QMQA 1UV5A 2Y0AA 3W33A 1VZOA 2W1DA 5I5ZA 4BDCA 4YR8A 5FM3A 2W1FA 3OUNB 3COKA 4BTMA 2ITQA 2RG5A 2V0DA 3OOMA 3DK3A 4QPMA 3TV6A 3VQUA 2OF2A 2J6MA 2OWBA 3FWQA 4QMTA 1XJDA 2RF9A 3BX5A 3NDMA 3CCNA 5DOSA 1KOBA 3O7LB 2YIYA 4F9BA 3V8WA 2GU8A 5F4NA 3JY0A 4Q2AA 5DR6A 3CP9A 2OXDA 3P86A 4GUEA 3G9LX 4QNAA 4RJ7A 4OT5A 1BLXA 3CTJA 3IS5A 5GJFA 4F7LA 2BAKA 2R4BA 3AD6A 2XUUA 5AP0A 4ZTHA 3QHRA 1PKGA 4CFVA 2PMOX 2XEZA 4I6FA 4MBJA 3AQVA 3DLSA 4FT9A 4R7IA 3TKUA 4BKYA 3AC5A 5GJGA 1ZWSA 4PWNA 2Y6OA 4PMTA 3BYUA 4CTCA 4FKTA 3WILA 2GCDA 2UW6A 4IHPA 3MVHA 3ZSHA 4BDJA 5J79A 3O8UA 4QT1A 1GZOA 2XA4A 5IMXA 3EFJA 2WO6A 4CMOA 4BFMA 4RVKA 4I94A 1IASA 4Y46A 2VGPA 3FMNA 1WVWA 4PDSA 3W10A 4E6AA 1ZOHA 3ACKA 2PTKA 2X7FA 2XM9A 3QTRA 5HTCA 1XH6A 2F4JA 4PQNA 3MIAA 3QL8A 4USEA 4II5A 4QNYA 5JQ8A 2R3QA 2WGJA 3TTIA 5BVKA 4IJPA 2XKDA 5F20A 1SYKA 1W8CA 3R9DA 3G6HA 4YNOA 2GFCA 5C9CA 1YDSE 1RE8A 3SA0A 2UW7A 2JFMA 5AP1A 1REKA 5EG3A 3ZLWA 3D5UA 4HCVA 3MVLA 4C7TA 3ZFMA 4F9YA 3GQLA 4LRKA 5CYIA 4O0SA 5M44A 5DA3A 3M1SA 4XX9A 3FXWA 2YIWA 4LL0A 3EN4A 4FV9A 2GSFA 4FV1A 2YA9A 2W5BA 4IAIA 4YC8A 1M14A 4FT7A 5E7RA 4EOIA 4B6LA 1F3MC 3IGOA 1Y6AA 3AD4A 2XIYA 4TNDA 1O6LA 1OL7A 2CSNA 2I0EA 4PF4A 4WG3A 5CAPA 3C50A 3PP0A 4IC7A 3W18A 3U6JA 4PNKA 2NP8A 2GMXA 4ANMA 3KEXA 4XLIA 4IM3A 3ZSGA 4RVTA 4NKAA 5JFSA 3I6WA 4BDGA 4YO4A 3ANQA 3D14A 3IG7A 4EOLA 4GK3A 2G9XA 2P33A 4FV6A 4BL1A 3UIMA 3BCEA 4C4GA 1YOLA 3OFMA 2WMQA 5HO6A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4GFM A;  3VW8 A;  4ZY4 A;  4YC3 A;  3LQ5 A;  4K1B A;  5AWM A;  3ZUT A;  3G0E A;  3PG1 A;  3WF8 A;  2ITW A;  4JDH A;  2OXX A;  1ZYJ A;  2QLU A;  3P7B A;  4FV5 A;  3BQC A;  1R78 A;  1PJK A;  3CTH A;  2XF0 A;  2CGW A;  2BZH B;  1E1V A;  3FQE A;  3RCJ A;  4B8L A;  3DND A;  5KZI A;  4JR3 A;  4FTN A;  4RLL A;  4Y73 A;  3MY1 A;  4CKJ A;  3F3V A;  3FMM A;  4ZSL A;  1SVG A;  3RP9 A;  5CAU A;  2VTL A;  2WB8 A;  4BWK A;  2V7A A;  4LOO A;  2ITT A;  1YWV A;  2QI8 A;  2YIT A;  4WUA A;  3KMW A;  3GOP A;  3DQX A;  3HP5 A;  1ZYL A;  3QTU A;  4D4V A;  3RIN A;  1CM8 A;  5DT0 A;  3S3I A;  5CEO A;  4FZD B;  3PJ3 A;  4RFM A;  3GVU A;  4YPS A;  4XH6 A;  2QO9 A;  4EON A;  4HVS A;  5F9E A;  4G5J A;  5AAD A;  3H3C A;  4ANN A;  5GZ8 A;  2JKK A;  3ZHP C;  3FJQ E;  1ERK A;  4KNB A;  3KRL A;  5EHY A;  4EUU A;  4QMZ A;  3IDC A;  1FVR A;  3Q52 A;  4UZD A;  4L46 A;  3EL7 A;  4EH5 A;  2BHH A;  2C47 A;  2JAV A;  2ZB0 A;  2X0G A;  3EN7 A;  3F61 A;  3RCD A;  2YM6 A;  2VD5 A;  5KMK A;  2W05 A;  4L01 A;  4O91 A;  4BDF A;  2WQE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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