5HOAA

Crystal structure of c-met l1195v in complex with sar125844
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
292
structure length
225
Chain Sequence
AVQHVVVYHGTLKIHCAVKQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFVASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Pharmacokinetic and Pharmacological Properties of the Potent and Selective MET Kinase Inhibitor 1-{6-[6-(4-Fluorophenyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-3-ylsulfanyl]benzothiazol-2-yl}-3-(2-morpholin-4-ylethyl)urea (SAR125844).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 225
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hoaA02
5CSXA 1H25A 3VS5A 1IEPA 1PW2A 1ZZ2A 2YM6A 1YXUA 3HDMA 3NNUA 2OK1A 4JT3A 3KB7A 4LV5A 4YLJA 4L42A 2EWAA 4TZRA 1Q3WA 2XCKA 3NUNA 1R0EA 3NGAA 3RCDA 4FKIA 2ZM4A 4QYEA 4YZDA 4XEYA 2VN9A 3FL4A 4NK9A 4PNIA 5ACKA 5JGDA 5K4IA 3R9NA 3AGMA 4XBRA 4BCOA 3NW6A 3EHAA 1GAGA 5BVWA 3LFDA 5CAUA 4RPVA 3R9HA 5HO8A 4MXCA 3E8CA 5ANJA 4F0GA 2Y4PA 4D2PA 3BHYA 2B9FA 3QHWA 4S30A 4FKWA 2GS7A 3QTIA 3HVCA 4DH3A 2UW3A 1XBAA 5K3YA 2UW4A 1PXPA 2YISA 4XMOA 5CLPA 5AUTA 4C4IA 4JQEA 1H27A 5L2QA 3QC9A 2XP2A 3ANRA 3QTSA 2IN6A 2J90A 3E7OA 2W1ZA 4GT3A 3SAYA 4UZDA 4AX8A 4FV9A 3FMKA 3R8PA 1UU3A 4BCJA 4CMTA 5JGBA 3TNWA 3EQDA 4ASEA 5DRBA 3OCSA 4LGDA 4ACHA 1W84A 1QPJA 3AG9A 3DBEA 4YBJA 4I3ZA 3HV3A 4OAVB 2C0IA 4FKQA 3WARA 4OBQA 4WBOA 2YERA 5CY3A 4PTEA 2QQ7A 2HXQA 2OO8X 3MPMA 3R04A 3FPMA 3R8MA 4YTCA 1U4DA 4ZZNA 4YC8A 3F3ZA 3CP9A 4IAKA 4IXPA 3UO4A 5CSPA 4WKQA 3AMAA 5GJGA 3U4UA 2F2CB 4LUEA 3P86A 4RX8A 3W10A 4IB0A 4L7FA 4FVRA 3MVMA 4IAAA 4QP1A 3K3JA 4TKSA 3DGKA 2J2IB 2C47A 3RAIA 2J4ZA 3LCSA 2X4ZA 3GGFA 3H4JA 5EM5A 2UZOA 1GZKA 4DFXE 3ORXA 5DI1A 3LFNA 2IJMA 4XP0A 4J53A 5C8NA 4MH7A 3PIYA 4ENYA 1T46A 3MFRA 2QLUA 4RA4A 4A4LA 4QMNA 3KF4A 4FTIA 3RM6A 1Q99A 4BWXA 3TUCA 3EFJA 4YGAA 1V0BA 4A07A 5HVJA 5IMXA 2BTRA 1ZMWA 3HV6A 5EM7A 5BNJA 3HP2A 3R8ZA 4DH1A 4O91A 5AX3A 4EWHA 1JKTA 2R2PA 2KULA 4FK3A 5E1EA 3PVGA 3RGFA 2OW3A 4WUNA 3QD0A 5AUXA 4DH5A 1VEBA 4MXAA 1VZOA 3UTOA 4USFA 2W0JA 3R30A 3OG7A 4G3EA 3UZPA 2VV9A 3M2WA 3PXFA 3JVSA 4MKCA 3VQUA 3FSFA 4UB7A 3KA0A 3V3VA 4DGNA 4EORA 2XMYA 4KNBA 2ITZA 4RMZA 2XNNA 1KE5A 4LGGA 3A4OX 1PMEA 3ALOA 3KK8A 1W82A 4BWKA 5GJDA 1OL5A 3FLWA 1F0QA 4GMYA 3BGPA 3HUBA 3P79A 4AN9A 4GSBA 4FIFA 3SRVA 2WQBA 1H24A 3G0EA 5FDPA 3BGZA 2JIVA 2XBAA 2REIA 4OW8A 3H9OA 4R7HA 4WO5A 3SW7A 4CRSA 1OPLA 3TZ9A 4QTAA 4UMRA 3TNPC 2R3OA 5BVOA 4KA3A 3F7ZA 4C2WA 3GU6A 3QRIA 1H0WA 2HELA 5CEIA 4OTWA 2CJMA 4G5JA 4ACDA 4EJNA 4CV9A 4PL3A 4ARKA 4XX9A 4QNYA 1YXTA 3VF9A 4M69B 3L1SA 5HG9A 3SKCA 5CENA 4DHFA 1H01A 2PMNX 4YHJA 5IF1A 4JOAA 4QMVA 3E92A 4B8MA 4X2GA 4HVDA 4RIWB 3R21A 3UODA 4O22A 3MVHA 1Q62A 3D5UA 2P0CA 4YO4A 3DKGA 4LMUA 4XNEA 4PNKA 5CF8A 5KMKA 2QO7A 3K5VA 3IG7A 3L9PA 2XS0A 4AW0A 3TV4A 4CRLA 3KN5A 5LQFA 4FF8A 5AV3A 2YEXA 2QD9A 3CCNA 4AZEA 3BBTB 4ACCA 5J7HA 3ZO1A 5ICPA 4NH1A 2X7FA 4ANNA 3AD4A 3ETAA 2RL5A 5D10A 2C1BA 1Q5KA 2YWPA 4YJNA 5DHJA 5JN2A 2ETKA 1J1BA 3A99A 4I4EA 3QQFA 4PP9A 4AGCA 3VS7A 3OEFX 4AZSA 3K3IA 3Q4CA 4ENXA 1LPUA 5HNIX 5DLSA 1QCFA 3TEIA 3A7FA 1JSTA 2W05A 4BGHA 1Y8YA 4H58A 5L8KA 4YZCA 5E7RA 3HX4A 4FKGA 2VTIA 3F9NA 3TNHA 3S4QA 3C13A 1E1XA 1Q8ZA 4QMPA 5GZ9A 5HLPA 3QUEA 5KE0A 4ZTMA 1M14A 2UZEA 1WCCA 3JY9A 5AV0A 2C5XA 3DAEA 3TKHA 5IUHA 4J8NA 2JBOA 3PE2A 3R1SA 5D7AA 5CF5A 3MIAA 4ZJJA 4F7NA 3MWUA 4AQCA 1Q97A 3FZSA 4H39A 1TKIA 1MRVA 3DY7A 4FSZA 1M2QA 4FUXA 4I5MA 5EOBA 2PMLX 2BRNA 2ZVAA 3HMPA 2C6OA 4IM0A 4BDBA 4YZBA 2OI4X 5CI7A 5BMMA 2OJ9A 2XM9A 2YCFA 4YLLA 4CMOA 4FYNA 4OBOA 2IVUA 4TWNA 4XG4A 4O38A 4QYGA 1OIYA 3T3UA 4EOPA 5I9ZA 2X9EA 4XG3A 4TYIA 1F5QA 4U41A 2X8DA 3U87A 2Y4IB 4F7JA 4W9WA 4BVUA 4PL4A 4S33A 3ACJA 4QMOA 4X6QC 4AW1A 5A14A 4I21A 4O0RA 2Z60A 5JQ8A 4DH7A 4C0TA 4G6OA 4ZOGA 1YKRA 3H10A 3UMWA 1XH6A 4YHTA 2QKRA 1H28A 2VTPA 2YCQA 3E8EA 3ELJA 2QODA 3DFCB 4F70A 2VTHA 4C62A 4PDSA 2I0YA 1B38A 4G9CA 2OJJA 1RDQE 3ODYX 3IPHA 2ZM1A 4I94A 2ITPA 3TZ7A 2QOKA 3VVHA 3EQPA 3CY2A 5AIKA 2Z7RA 4NFMA 2WQNA 3GCUA 5TF9A 2ITVA 2W5AA 4XJ0A 4EL9A 3R7EA 5EG3A 2AC3A 4QPAA 3RHKA 1ZY4A 2W5HA 3QQGA 4YPSA 3LCKA 3NWWA 4ASDA 3R01A 4MXXA 2O8YA 5DMZA 3IW4A 2X9FA 4AOIA 1PJKA 1BMKA 2J50A 2OIDA 2XNEA 2I0VA 4FT3A 4ZTRA 4EH3A 3JUHA 4IZ7A 2FYSA 2H8HA 3KMUA 3LMGA 3PXRA 1VYZA 2YM3A 3W8LA 3ITZA 3VBXA 4G2FA 2C6MA 3N9XA 4XG7A 4N70A 3TV6A 3C4ZA 2IZTA 2WB8A 4BIBA 2ITOA 3EYGA 2C6IA 5F94A 4RIXB 1IG1A 2BZJA 1XH9A 2JIUA 3QF9A 4A9TA 2YCRA 1FQ1B 2RIOA 4GVJA 2ZM3A 1Q3DA 4KINA 3UIMA 4BTFA 5IA3A 2IZRA 3DZOA 1CM8A 1GNGA 3RZFA 3UGCA 4AE9A 3BQRA 3DNEA 3W18A 4AT4A 2GNGA 3EH9A 4FX3A 2ZV2A 3OF0A 5CVFA 3TT0A 3F69A 2PK9A 4QMXA 4X21A 4CFWA 3QRTA 2BZHB 4LGHA 4O0YA 1YWNA 3D2IA 5FEQA 4YZNA 3R28A 3OWKA 4IX6A 4G3GA 3GC8A 2W1EA 3QTZA 3BU3A 4HYSA 4UMUA 3QLFA 3KRRA 3ZO2A 3R7IA 2QNJA 2BCJA 2FH9A 4FIEA 2Z7QA 2GNJA 2YLEA 4NUSA 3MPTA 4V0GB 2XJ2A 3AD5A 3FMDA 3EOCA 3LLTA 3HDNA 4OLIA 5HICA 4H1JA 3VQHA 3P0MA 4F0IA 3UP7A 4BDEA 2GS2A 2P55A 4UXLA 2R3RA 3A7HA 2VGOA 1SNUA 5GZAA 2W96B 3MVJA 3VBWA 4L45A 1XO2B 4TYEA 3Q9ZA 4XG6A 4CLIA 5FRIA 4FG9A 3NUSA 3ZHPC 3D9VA 4A4OA 4C3RA 4D2SA 1B39A 2HCKA 5AM6A 3H0YA 3KXXA 3E93A 4HYIA 4ID7A 5HX6A 4X3JA 4ZTLA 1XBBA 3ZFMA 5EHOA 3FLYA 5CF4A 2VU3A 3I5NA 3GU5A 4EYJA 4JLCA 4G1WA 1SM2A 2XNBA 5I3OA 2GTMA 4IB1A 2R9SA 5AP2A 4AA5A 4KKGA 3ZDIA 3NUUA 5E8ZA 4FMQA 5BPYA 5DPVA 5DT4A 3DKFA 4BCHA 5HNGA 3WF5A 4GUEA 4O6EA 4ANSA 4YJTA 4ANLA 2IW9A 3WI6A 3Q9XA 4XRLA 1PXJA 1Z57A 2FVDA 3SD0A 4JX7A 4MBJA 3WF7A 4ITHA 5LMAA 4RGJA 4EQMA 3V8SA 2V62A 4FZDB 2B9HA 2YCSA 3KXZA 4M8TA 3P1AA 2XNOA 3SLSA 1KSWA 2YJRA 4I20A 4EHGA 4F6UA 4XP2A 4DGLC 2UV2A 4IC8A 1LUFA 2IW8A 4QNAA 5CEQA 5HCZA 1WVYA 4EOQA 5A4CA 1YHWA 2OIBA 5CZIA 2C3JA 1F3MC 2B9IA 4NFNA 3BE2A 1WBVA 4QP4A 3AMBA 5L2TA 3UC3A 3IW8A 4RFMA 3HV4A 3TTIA 3CQEA 3QZHA 5DGZA 3ZUUA 4FA2A 3GC0A 2XRUA 3B2WA 4L6QA 4NKSA 4JRNA 3MS9A 4QQJA 4C4FA 2IO6A 2C5YA 3NYXA 4K33A 4RJ4A 3NAXA 4A9YA 5HCYA 3B8RA 2VUWA 2WTWA 3FYKX 3LJ0A 3VUKA 4RX5A 3FYJX 2EXCX 4IWOA 2C6LA 5D41A 1UU8A 1URCA 3V6RA 5IISA 4FKVA 4C7TA 2C3IB 5K0KA 5M55A 4C3PA 1WBTA 4QP2A 4F99A 5FM2A 4J8MA 4ZIMA 4GH2A 3ZM4A 4EOSA 3FDNA 4BCMA 3KVXA 4IFCA 1YOMA 3POOA 3WF6A 2JFMA 4PPCA 4XV2A 2X81A 2IWIA 5DR2A 4FSQA 2J9MA 2CGUA 2VGPA 3I60A 3FMMA 3QRKA 3Q4TA 4GK4A 4OTFA 3RWQA 4EZ7A 5AR5A 2OZAB 5D9HA 4RJ3A 4AXAA 5AM7A 3FKOA 4IX4A 3FLSA 5AAEA 2R0IA 4MAOA 4ZSGA 4GFMA 4O2ZA 2GNLA 4ANMA 4M97A 5EK7A 2X6EA 3V5QA 5FQDC 4BN1A 3HMNA 3R7VA 3S2PA 3D7TB 5IPJA 1PXMA 5AAFA 5HKMA 3MIYA 3PZHA 4PY1A 2HY81 3O8UA 1YRPA 3OWPA 3EMGA 3UG1A 2ITUA 4FZAB 2XKFA 5LJJA 2B53A 3BHHA 1BLXA 5FXRA 4ZLOA 4H36A 3U6JA 1L3RE 2YLFA 2WPAA 4YJOA 4P4CA 2CPKE 2J0KA 4CT1A 4AW2A 3DBDA 4G16A 3D15A 4XS2A 1UU9A 3MW1A 3NDMA 4IZ5A 5C01A 4GW8A 2WELA 5AJQA 3P78A 3R73A 3WZUA 3BV2A 3VS4A 4MF1A 4F9BA 3UC4A 3QD4A 4BGQA 4MD8E 1PYXA 3GCSA 4R1YA 3EKKA 4EH8A 3WOWA 2H6DA 3QZIA 5HEZA 4EK8A 3E3PA 4F08A 1YDRE 4E5WA 4RT7A 1OPKA 2ITQA 3PWYA 5J5SA 5KCVA 4W4YA 2VWZA 2VWXA 1BI7A 3PIXA 3NYVA 4K11A 4LOPA 4R7IA 3BEGA 3VNTA 2I0HA 4BYJA 3O17A 2X2KA 2J5FA 2WTKB 4W4VA 3KRXA 4GV1A 3WIGA 4LMNA 4KAOA 4HZRA 4MQ2A 2XZSA 2C4GA 1NA7A 2FB8A 1Z9XA 3DJ5A 3FLNC 2WGJA 3O0GA 2BTSA 3GCQA 4O6LA 3A7GA 2HW7A 2JITA 3GNIB 4L3PA 4S34A 1LR4A 4FSTA 4U45A 4YJSA 5DR6A 5FP6A 2PWLA 3F82A 1FMKA 4PMTA 1ZMUA 4BDFA 5A4LA 5BMSA 4PF4A 4BI2A 5AMNA 4PMMA 4U3ZA 4XRJA 4ASXA 5HO7A 3ZYAA 4B6LA 4HNIA 3QXPA 2BMCA 3C51A 3W2PA 4D4YA 2A19B 3KXNA 4DFLA 3PPJA 5L3AA 1XR1A 3OD6X 3KK9A 4HVSA 3OXTA 4BBMA 4USEA 3E64A 5ITAA 2XB7A 2Z7LA 3MTFA 1FGIA 4QMMA 3NCZA 4JVGA 4DEIA 4EWQA 5E92A 2YIQA 4XBUA 5H2UA 3Q9YA 3MY1A 2QOLA 5HD7A 5L8LA 2HW6A 4IJ9A 1WVXA 2BUJA 4X7QA 1GZ8A 3LCOA 3V6SA 4I6HA 5K9IA 3DBQA 1H07A 2GTNA 1P5EA 2QOQA 2ZMDA 2IVVA 4DC2A 3V5LA 4GJ2A 2RFEA 4BIEA 4E6AA 2JLDA 1WBSA 3LPBA 3PSCA 3MH1A 3U6HA 4D9TA 4KKEA 5AP0A 3KVWA 4JRVA 4E4LA 1OL7A 2UW9A 2IW6A 4D2TA 5EH0A 3U9NA 1KE9A 5DT0A 3I5ZA 4H3PA 2O64A 4DYMA 3EZRA 4C57A 2P2HA 3AC2A 3KFAA 5H9BA 2JDTA 4IM2A 5AUZA 3NR9A 3QQJA 5FEDA 5TOZA 3VHEA 1HOWA 1MRUA 3UYSA 3R7GA 3QD3A 3BKBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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