5HTI | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	295
structure length	290
Chain Sequence	HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of c-Met kinase domain in complex with LXM108 rcsb
molecule keywords	Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	91
structure length	290
sequence length	295
ec nomenclature	ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2016-01-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	5htiA02

1Z57A 2EXCX 2SRCA 5DIAA 2XYNA 4FT9A 3I6UA 5A4EA 2GS6A 5M55A 2WOTA 3H9OA 5HHWA 3TNWA 3ZUVA 4W4XA 4A07A 4HVGA 3A60A 3PVBA 4ID7A 4KBAA 4X2NA 4IACA 5EDQA 5DGZA 2VNWA 4RVLA 2I0EA 3ACJA 3R8PA 3E8DA 5CTPA 4BDFA 4D28A 5B2MA 2GHGA 2VZ6A 3COIA 3PP0A 5HBEA 2RG6A 5LXMA 3ORMA 4BYIA 3OWJA 5IUGA 4FV0A 4S31A 3ZO1A 5BYYA 2VTTA 3U9NA 5K0XA 3MIYA 3UMXA 4YTCA 4OTPA 1H1SA 4TN6A 4GIIA 4YC6A 2PTKA 4ZLYA 4NM5A 2EU9A 4QMXA 4WNMA 4YBJA 2OI4X 3R2YA 2NPQA 1Q8TA 4UMRA 3ENHA 3ZU7A 4AFEA 2CPKE 3OZ6A 4FNYA 4FGBA 4P4CA 3WZEA 5DHJA 4TL0A 4OAUC 1Y91A 4BKJA 4BCNA 2WTKB 3R6XA 4WSQA 3KKVA 4FKIA 4QMUA 4BHZA 4C4GA 3R30A 4MNEB 4L44A 1OVEA 2CLXA 3DY7A 3DLZA 2X2LA 1H1PA 2O2UA 3LXPA 3KF7A 4PX6A 3FMHA 3GB2A 3GP0A 4FKGA 3R0TA 1F0QA 1SM2A 1Q5KA 5CU0A 1H28A 4U0IA 2ZV9A 3O7LD 3PXZA 4J96A 2IZRA 4HPTE 3BU6A 1UU3A 4ZSGA 2PVYA 4J95A 4FT0A 4U45A 3QUPA 1KE8A 5CS6A 5A4TA 5DEWA 3OOMA 3TCPA 5F20A 3VS4A 3L9MA 3ZRKA 2J7TA 3QTIA 5EM5A 3G5DA 3IECA 4M0ZA 4D5KA 1GIIA 5I4NA 4X3FB 4EOLA 2YACA 3C9WA 1DAWA 3KMUA 3PA3A 4FUXA 3VUDA 2WTKC 1STCE 4RC3A 4UZDA 5JFSA 2HXQA 4GFOA 1GAGA 3ZC5A 3UO5A 3I6WA 2QOBA 3G6GA 3TKUA 5CAPA 5ITAA 2WQBA 5IDNA 2YIQA 2OXDA 3ORKA 4EH7A 2BDFA 3GFEA 2ITZA 1XQZA 4FKTA 3UP7A 5I5ZA 3IDBA 2IVSA 5CU2A 3NCZA 3KN5A 2J90A 2ZMDA 3DU8A 4R3RA 4C37A 4XUFA 4IDTA 3CQEA 3RAIA 3VRYA 2UUEA 4E6DA 2PE0A 3I5ZA 4KWPA 5E91A 2ZYBA 3A7HA 4P7EA 1A06A 4IC7A 4QP6A 4P5ZA 1G3NA 4H3BA 5AUUA 4JX7A 1PF8A 3RGFA 2W5AA 2XP2A 4RWKA 4X7QA 5CF8A 3RHKA 2W5HA 2WMBA 2ZAZA 4G3FA 2XJ0A 5BYZA 2XEYA 2X7GA 2J9MA 4N4SA 1KE6A 3OW3A 4AN3A 4MWIA 2R3IA 4X3FC 2QI8A 4O91A 3VUGA 4BCKA 2Z7SA 3OW4A 4O0SA 4CRSA 3K2LA 5K4JA 3R7IA 4E8AA 1PXLA 2BKZA 4CFUA 2I0HA 2BDWA 4YZNA 3PG3A 5L8JA 3A7IA 4RJ5A 4C57A 4DFYA 2GU8A 1YOMA 4X6QC 3HMIA 2R7BA 4KB8A 2QR8A 4PMSA 1GOLA 3FY2A 4Q5EA 2VWWA 3ZO2A 3KRXA 1AGWA 3Q96A 3IS5A 4HPUE 1TQMA 3NNUA 4L52A 4BZNA 1URWA 4CFVA 3HZTA 3KULB 2XA4A 3BLRA 3QLGA 1JLUE 4U8ZA 5DRBA 3NYVA 4QNYA 5T68A 4FZ7A 5LMAA 4MNFA 5M44A 4BDJA 2ZM3A 4IB0A 4TYHA 1XH6A 4EOIA 4ZTMA 5KMIA 3MH3A 3SA0A 3FZ1A 3G33A 5J9YA 2DWBA 4U41A 3Q2MA 4NWMA 1Y6AA 3VS2A 2ITQA 4TWPA 3OTUA 5DR2A 5E8SA 3PUPA 3FPMA 4JG8A 4EKKA 1YI4A 3C4EA 1V1KA 3BZ3A 3PXKA 5L6PA 2VTRA 2R3PA 3O8TA 4CCBA 2BVAA 3IW7A 3TNIA 3UC3A 4CYJA 4FIGA 3ZSIA 1SVEA 4YZMA 4BDAA 2ITYA 1J1BA 1XH5A 4RVKA 2WHBA 3GOPA 4H3QA 4M84A 1JKSA 3QCXA 4RA4A 4R7IA 4C0TA 3MVMA 3MTFA 4ACMA 2CGVA 4N0SA 4KS8A 3ZFMA 5A4LA 2XK6A 4R3PA 3RZBA 4K0YA 4O2PA 3II5A 3NUXA 1PXOA 4D9TA 5ETFA 3LQ8A 3W2RA 4IADA 2E2BA 4KAOA 5KMLA 1VR2A 4BKYA 2J5EA 1MQ4A 5L2TA 5L6OA 2C6KA 2UZUE 4M69B 3OUKA 2G15A 2ZB1A 4D5HA 3DB8A 3UGCA 2JIIA 4EBVA 2EVAA 3RPSA 4D0XA 4UXLA 3DLSA 4ANLA 5CENA 4CXAA 3O71A 3O8PA 3TIYA 3S0OA 3CQWA 2JIUA 3BYSA 2R9SA 2WMXA 5TF9A 5CEKA 5M4FA 4G6OA 5ANIA 2VO7A 3TZMA 3VS7A 4BZDA 4OBQA 1OPJA 2WNTA 2C5VA 3VW8A 3QX2A 3M11A 5LJJA 2LGCA 4FTLA 4IAIA 4EH2A 1R1WA 3R28A 4MBLA 4FTIA 5IEYA 3FMMA 4WNKA 2HY81 2GPHA 3L1SA 4MX9A 4XCUA 3OCTA 2X1NA 2UZTA 4AACA 2ZM4A 2YHVA 3FL5A 5AEPA 4TY1A 2PUUA 3IW5A 3ROCA 3QRJA 4PQNA 1XH7A 4DYMA 1PMUA 1YRPA 3F2NA 5B2KA 2R3QA 2OIDA 4FSRA 2X8IA 2CDZA 3HV6A 4RVMA 4DEDA 4I0TA 2YM7A 4H1JA 4RX9A 4JL9A 4ZSLA 4S2ZA 3UIMA 4YSJA 3P08A 5CYIA 4AA5A 4D4RA 1ZMWA 3EYGA 4BCPA 4EBWA 1IEPA 3FXWA 4G5JA 4E4NA 4NJ3A 3DJ7A 3EL7A 3BI6A 4RJ7A 2E9OA 5AUVA 4FSNA 1Q8UA 1UWHA 2J6MA 2YIRA 2R4BA 4QMWA 5KE0A 5C9CA 3GQLA 4NK9A 5ETAA 4BN1A 3VS6A 4BCOA 2UW8A 3H30A 4AAAA 3BEAA 4KRCA 2V22A 1YQJA 4LRKA 5F94A 1W84A 4AG8A 4FTJA 2AC3A 2OFVA 4YO6A 4XOZA 3GC7A 5CY3A 5CVHA 2YJSA 1H01A 3HA8A 4FNWA 5EYKA 4FV8A 4FOCA 4AW2A 3QHRA 1OZ1A 3EQGA 4EH5A 2R64A 2XKDA 3MB7A 2O8YA 2DYLA 4W4VA 5G1XA 3L8PA 4BIEA 4HVHA 5GJDA 3SC1A 2YM4A 4AT3A 4RIOA 4PNKA 5HVYA 4PDPA 2X6DA 2V7AA 4F0GA 2QO9A 3AGMA 4O38A 4FVQA 2OXXA 2VWBA 3UNZA 5LVLA 4BBFA 4E5WA 3QD2B 3CTQA 4TNDA 1OL6A 3MBLA 5ACKA 4C8BA 2OICA 5CU4A 2UW5A 5DRDA 4I5HA 4L3PA 5CX9A 4QYYA 3F7WA 4BGHA 3UQGA 3DA6A 4O6LA 3DBDA 5F95A 5HO6A 4AWIA 1O6LA 5LCJA 3QGYA 3MVJA 2IO6A 4IVAA 1ZXEA 5JH6A 2QOLA 4OUCA 4RQKA 3VQHA 3G9LX 1LEZA 5F1ZA 3POOA 4HCVA 4DEIA 1WCCA 4Y46A 5EDPA 3GU4A 1TKIA 5DOSA 5C03A 3G9NA 2C5YA 4MCVA 4I41A 4MVFA 3F61A 4MAOA 4R1YA 4CQEA 3DDQA 4H39A 4QQ5A 4D2TA 3TNPC 4O0VA 3TTIA 2B1PA 2YERA 2JFLA 5H9BA 5DNRA 3QTSA 3CBLA 5CT0A 4CNHA 5TE0A 3UZTA 1XKKA 4KIOA 4PRJA 2C6OA 3UYTA 4NFMA 3ZZWA 1OPKA 5C8MA 1W82A 4Q9ZA 1OPLA 4GFMA 4G9RA 3HP2A 4TYEA 5JQ5A 1Y57A 3HRCA 4CKIA 3OBJA 1U5QA 2X8EA 4QMNA 5CAOA 1BUHA 4GVAA 5C26A 5L8LA 3I79A 2UW6A 5EH0A 4EHZA 4WRSA 4ZLZA 5AA9A 3W1FA 3R8MA 3D5UA 5E8VA 3TACA 4FNXA 3R04A 3BYMA 3MSSA 3GENA 4C2WA 4F1TA 4HYIA 2BRBA 5LWMA 4K11A 3R01A 4YZ9A 3LXLA 3PXQA 2QOOA 3PA5A 4FI1A 3ZBXA 5JGBA 1ZOHA 3PRIA 5ANOA 3EL8A 2Y6MA 2IWIA 3D2IA 3QUDA 2XKEA 1VJYA 1QPEA 4MBJA 4EL9A 3MN3A 4V0GB 2CGUA 4Y83A 2QHMA 4KA3A 4GYGA 3U87A 2Z7LA 3NPCA 4ZTRA 5JMSA 3MFTA 3MY5A 3D4QA 5FD2A 3P9JA 5A3XA 3WI6A 3TJCA 5HLNA 3HVCA 2QLQA 5HI2A 2YISA 3R22A 4IJPA 1H08A 3QQGA 4DGGA 4BCFA 1RE8A 3JXWA 4J52A 1XR1A 2WQNA 4BDKA 3V01A 2BCJA 4I4EA 4I92A 2W05A 4YPDA 1YHSA 4JR7A 1FPUA 1Q62A 2R3LA 3KB7A 3KXNA 4A4XA 4FL2A 4LRJA 4ACHA 3B8QA 4BCIA 4FKOA 4OGRA 4UN0C 2X4FA 3DTCA 4FTMA 1ZZ2A 1TQIA 3E8CA 2JIVA 3K5VA 5HLPA 4JDHA 2B9IA 3MS9A 1UU9A 1XWSA 2C6MA 4PP7A 4FKLA 3B2WA 2B9HA 4GK4A 3QRUA 4FIFA 4DGLC 5JEBA 4LGHA 5EM6A 3EN7A 3EQIA 1E9HA 3QF9A 4H1MA 3R8ZA 5D1JA 3Q5IA 5CEMA 1XHAA 3G90X 4HOKA 2BAJA 4F6UA 1CKJA 1NA7A 5DT0A 4GG7A 2FVDA 3BQRA 3ZXTA 5IA0A 3GOKA 3PG1A 4YO4A 3CKXA 4E93A 5I9VA 4Q2AA 4W9XA 4EK6A 5L2QA 2Y7JA 3KEXA 4U79A 5B2LA 5L8KA 2PVFA 2QLUA 4MQ2A 5HIBA 3TEIA 2WMQA 3WF6A 1HOWA 3OCSA 4AZSA 3QLFA 4IBMA 4J97A 2QKWB 3QZHA 4L53A 2PZ5A 2YM5A 3PTGA 2W1EA 4XH6A 1PMEA 2IZTA 4LG4A 4XRLA 3BGPA 4JX3A 4MXCA 4K33A 2GS2A 4QP8A 4HZRA 4Y95A 5D10A 3T3VA 5IF1A 1OKYA 3C4ZA 4J98A 3W33A 4RIYB 5JK3A 3CE3A 4IVCA 3D5XA 3FKLA 1J1CA 3P7BA 2VAGA 3M2WA 4Z16A 5IEXA 3LFCA 5DI1A 3DFAA 5BVNA 4LL0A 4BWXA 4BTKA 3FQHA 4YJRA 4XV2A 4EHVA 3C1XA 4HYUA 1FVRA 2HIWA 3POZA 4KSPA 3HMMA 5BVEA 4KRDA 5JKGA 3OVVA 2WEVA 4YZBA 4CFFA 3VF8A 4C58A 1HCLA 4WO5A 5LVNA 4S32A 3KRWA 2C68A 3FZRA 5J5SA 2QD9A 2XNEA 2W1DA 4X2GA 4C38A 1H0VA 4L3JA 2R7IA 5HO8A 4R5SA 3CQUA 3PXYA 3QYWA 4RIXA 4CCUA 2YJRA 3AG9A 1Q99A 2ERZE 2YCSA 2C5OA 5JZNA 3HMNA 4DCEA 2JAMA 4PTEA 2XYUA 2KTYA 2P2IA 4OTIA 2XCHA 3K54A 4FV3A 4EORA 3RAHA 3R9HA 4BCHA 5DG5A 3LFQA 4JQ7A 4C3PA 3C50A 2Z7RA 5TT7A 5FLFA 3SAYA 5EDRA 3V6RA 2VTLA 4YUQA 3U6HA 3RM6A 2RF9A 5TOZA 4C4EA 3R63A 4XHKB 2J0JA 4IZ5A 3TKIA 4EC9A 5JFVA 1Q3DA 3FKOA 2J0IA 1REJA 2IZUA 2VTIA 2VX3A 1W8CA 4L42A 4WA9A 3UOLA 4DLIA 3ZCLA 4PV0A 2W4OA 3OC1A 3A8WA 4U81A 4W9WA 2H6DA 3UVPA 5CXHA 5AR2A 3DBQA 2Y6OA 3FLYA 3PYYA 4KIKB 4F9BA 4ASXA 4C4JA 4UMUA 5JGAA 1YW2A 4QP9A 5C01A 3RTPA 3DGKA 4OTFA 4PWNA 4XNEA 1IASA 1PXMA 2WD1A 1OB3A 1NVSA 2JKMA 4U44A 4EK3A 3GC0A 3DQWA 3C0GA 2Y4IB 5KHXA 5DT4A 2OJFE 3FUPA 3PSCA 5FM2A 4MXAA 4AOTA 4FTCA 4UYAA 3O0GA 3L9PA 5FXQA 4I20A 3AT3A 3DB6A 5I3OA 1DI8A 2QKRA 2ITOA 4D1XA 4CMTA 4BB4A 2PZRA 4EUTA 3E64A 3PLSA 2R5TA 2XNGA 3PJ3A 2WMUA 3BE2A 4YHJA 5IH6A 4EYJA 3HNGA 2ITVA 3KVXA 4KKGA 2UZDA 3PZEA 3OT3A 4YC3A 4W8DA 4DFZE 5I9ZA 4NW5A 3UDBA 2XH5A 4IEBA 4JAJA 2BZJA 5E8WA 1JBPE 2C0TA 3F3VA 5AR4A 5FBOA 3COKA 4YJUA 3FMNA 3CGFA 3EFLA 5KO1A 3MI9A 4H36A 2F49A 2ZB0A 4AZFA 2JDOA 2P0CA 3K3IA 2PVMA 4WT6A 3GC9A 3D0EA 4Z7GA 3ZUUA 5AIKA 2JDVA 3V5QA 2YDIA 4BI2A 5I9YA 2WQOA 4NM0A 4XG6A 5BVWA 2A1AB 4YGAA 3I5NA 3PSBA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5HTIA

Total Genus

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Chain Sequence

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