5HTI | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	295
structure length	290
Chain Sequence	HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of c-Met kinase domain in complex with LXM108 rcsb
molecule keywords	Hepatocyte growth factor receptor
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	91
structure length	290
sequence length	295
ec nomenclature	ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2016-01-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	5htiA02

2B55A 3QUEA 4KBCA 3TUCA 5EFQA 5IZFA 5GZ9A 4RLKA 2BAKA 3MH2A 5EH0A 2XIXA 3OOMA 4WBBB 3OS3A 1QPEA 2PZYA 3ALOA 3L8VA 3MA6A 3SOCA 4K11A 3N9XA 4B6LA 4PF4A 5DPVA 5CU3A 3NIEA 4UEUA 1R3CA 2VWZA 1LPUA 5AA8A 3R02A 4O0VA 4RIXA 5M55A 3ZCLA 1P2AA 1CMKE 2HZ4A 3CP9A 2J7TA 3DAEA 3PY3A 2F2UA 3QGWA 4FC0A 4N70A 3TNWA 2YHVA 2BIKB 1WBOA 4USDA 3VUDA 1G3NA 4BGHA 2WMXA 3UNJA 3NUUA 1UNHA 4JRNA 1FVVA 5DOSA 5CAUA 3F7WA 4GUBA 1KE7A 2REIA 2R3GA 3OTUA 4IB5A 4P4CA 4YJOA 3ET7A 1OITA 3JS2A 3ZHPC 5B0XA 3IO7A 3ZFMA 2ZYBA 4W8EA 5CF8A 5IA1A 1AD5A 4PV0A 4QRCA 3LHJA 3EZVA 3VNTA 4P90A 1OIYA 3FWQA 1Q8YA 3RNIA 5KZIA 1OGUA 4I6HA 3OWLA 2GNIA 4FIHA 3RBWA 3HNGA 3QQFA 5DHJA 3RMFA 3V6SA 2X7FA 3BYSA 1XKKA 2RG6A 4O38A 5C27A 3UTOA 1H08A 3BBTB 4JQEA 2EB3A 1WBVA 3FYJX 4M0ZA 5CVGA 4YNEA 1YXUA 3GU7A 3I0QA 4IMYA 3RM7A 2W1CA 3ZS5A 2YDIA 4IBMA 3MVHA 3QD2B 4APCA 2WMSA 4XG8A 4EKLA 4KBAA 4EH4A 5HX8A 3BU3A 4FKRA 1FGIA 2BKZA 4KB8A 3V5TA 4XEYA 3WIGA 3HL7A 5KMJA 5CXHA 4HPUE 4FIEA 5AP2A 3ANQA 4QP9A 2JFMA 4EQUA 3PSCA 5IH5A 2XEYA 3KK9A 3MIAA 3T3UA 4ERWA 2OG8A 2O63A 4F7JA 4FL2A 1WFCA 4TYIA 4TYJA 3DFCB 5AUVA 2F7EE 5A3XA 3VW8A 4FV6A 3GP0A 3PG1A 4DEHA 4XOZA 4YSMA 4DG2E 4E73A 2WNTA 5IKWA 3SOAA 4CNHA 5CSWA 3V04A 2B9JA 3TN8A 2VRXA 1Q41A 3O51A 1J1BA 1OKZA 3BRBA 3KVXA 3A60A 4HPTE 1YVJA 4IC8A 4WO5A 3RK7A 4BDFA 4J97A 1TVOA 4E7WA 3QFVA 5KMMA 1YI6A 4FZAB 5HE1A 3GGFA 4FF8A 5A4EA 3UQCA 1FVTA 4MCVA 3S95A 4TWNA 2DUVA 3PIXA 4JQ8A 4RPVA 5DG5A 4BDGA 4EYJA 3FPQA 2HY81 3LJ0A 4ZY5A 4N6ZA 5AR8A 3CBLA 3W33A 3UOHA 2OZAB 3E3PA 3VO3A 4X2KA 1WBTA 5HIEA 4XNEA 3DKOA 1M52A 5AR7A 4EZ3A 1Q62A 3OF0A 5LWMA 2VZ6A 3U6HA 2C6MA 5CLPA 2HXLA 4QMSA 4AGWA 2NRUA 1RE8A 5AP5A 1YI4A 3DGKA 5I9UA 5HD4A 5ICPA 4AQCA 2QOBA 5J1WA 2ONLC 2IZUA 4FTOA 1PXNA 4AF3A 3DXNA 3E63A 3R9OA 2OIBA 3EQFA 5HG5A 3R8PA 3MFSA 2WMVA 3TL8A 3N51A 4XV1A 3MGYA 5DH3A 5LMKC 4K2RA 4GT5A 2OFUA 3BYOA 4FK3A 2XK8A 3PRIA 4FOCA 5AR5A 4AOIA 2V7OA 4EH8A 3LXKA 3SD0A 4AA0A 5FRIA 3GNIB 5TO8A 3F5GA 4PDSA 1OZ1A 4YJRA 5DRBA 2I6LA 2JIVA 1H00A 3FI4A 2EUFB 2R64A 4UMPA 3BV2A 3U9CA 4YJTA 1CSNA 1ZAOA 1JKLA 1YRPA 5J5SA 4XLVA 4XS2A 5JFVA 3RI1A 5KHXA 3G0EA 4D1SA 5GJFA 4RFMA 4WRGA 4KKEA 4RJ5A 3HV3A 3DV3A 3QLGA 5AIKA 4BWXA 4FSZA 5HE2A 5D9HA 4CFVA 3BKBA 2Z60A 3C4WA 3FZTA 5IISA 3JXWA 5JGDA 5LMBA 4D1ZA 4IE9A 4MXAA 5AP6A 3V5QA 3EQDA 3QUPA 5BVWA 1APME 2RG5A 3OY1A 5EM8A 2VWUA 1QPDA 3MH3A 3WIKA 4NWMA 4AP7A 1M7QA 4DAWA 2PL0A 5E90A 4JVGA 2ZMCA 5BVKA 1H1RA 4ZTNA 2CN5A 4L8MA 2R3FA 2QNJA 3DB8A 4CYJA 3PUPA 2YJSA 3JVRA 3ZC6A 5DEWA 5I9ZA 2QOFA 4E6QA 3D5WA 1ZYCA 4ID7A 1GZOA 2ETRA 1Q4LA 2VTTA 4IW0A 3FMJA 3LM5A 4LMUA 1XBCA 4G6NA 4AW2A 3KB7A 4V0GB 3KKVA 4KKGA 4RJ8A 4CMTA 2QD9A 2WTKB 2WXVA 3PE1A 4KSQA 3TACA 4IJ9A 4DGMA 3HA8A 1V1KA 4O96A 4ASEA 4N0SA 4OR5A 4YJSA 4X6RA 4H3PA 4XG6A 2HK5A 5CAPA 3NSZA 2A4LA 2C0IA 3OY3A 1H1SA 4AN9A 4YTCA 2VTPA 3R04A 5CU6A 3FXZA 4I92A 4AZTA 4PRJA 4BFMA 1OL6A 3GVUA 4FIJA 3PVBA 1Q97A 3UMWA 3ITZA 4TNDA 4OTDA 4XLIA 2VWBA 4MBIA 3REPA 1PXOA 3FDNA 3THBA 3VUHA 5I9WA 5KX8A 2OJ9A 2UZVA 4XG9A 4JLCA 4BI2A 4NK9A 5EYMA 3M42A 3ENMA 4X2NA 3OMVA 4O0YA 4EOKA 3D15A 2YABA 3KRRA 4MWHA 5H8BA 1OPKA 4QMQA 3QAME 4JBVA 5JRQA 4RX7A 4FSTA 3MJ2A 3ORMA 5DMZA 2ZV8A 1OKVA 4JDHA 2G1TA 4ZAUA 5L8KA 2BDJA 3UZTA 5ANEA 4BTKA 2YIYA 3K54A 3E8EA 2ZV2A 3QBNA 4HW7A 2Z7SA 5HU9A 4FTQA 5EI6A 1LEZA 4MD7E 3QTZA 4CT1A 3GC7A 5E92A 4G3CA 4U40A 4Q9SA 3I1AA 4J53A 4UALA 5BUIA 4IB3A 4YBKA 3MFTA 5T3QA 1P14A 3LLTA 4QP7A 3DQXA 3O0GA 1VR2A 3PJ3A 4NM5A 1QPCA 1Y91A 4ERKA 4IAZA 4YZDA 4GU9A 3V5LA 5AAFA 3QCQA 1T45A 4IIRA 5LMAA 2XKCA 5HVJA 5KMIA 1CM8A 2X4ZA 3G9NA 4O1PA 4C4GA 5BYYA 4X2FA 2Y4IB 4RX8A 3VN9A 2PWLA 5CY3A 4HOKA 3E7OA 4MNEB 4WRSA 4ASDA 2XK7A 3ZUUA 2WIHA 2IZRA 3LAUA 4I41A 3DU8A 1H28A 3GT8A 3QRKA 4C61A 3FLZA 3UGCA 1M2QA 5JRSA 3C0GA 1NVQA 4IX3A 3BU6A 4N4SA 4CZYB 4DN5A 4RSSA 2OJGA 4IM3A 3NNVA 2Z8CA 3R7GA 4NSTA 4U5JA 4V04A 5GNKA 3ZU7A 4BDCA 4CKIA 4EHEA 4EZ7A 5HTBA 3LZBA 3VS4A 4QO9A 3VBTA 2NPQA 1RJBA 5KZ0A 2B1PA 4AU8A 1SVHA 2CCHA 2C6LA 2Q0NA 3U51A 2C6EA 3T8OA 3QD3A 5IA5A 2GSFA 3CQUA 4RC4A 2WQOA 5CU2A 3IECA 2WMTA 3V51A 4EH5A 1OIRA 2C6IA 5AJQA 3V6RA 3RTPA 4B0GA 5TE0A 3TCPA 4KINA 5D10A 3AC2A 4W4WA 5HVKA 1W84A 3VRYA 1WBNA 4NIFB 4RQVA 2HW7A 4A9SA 1H26A 3FLSA 2XNNA 4CEGA 3ZOSA 3MVJA 3D7TB 4FT5A 4FIIA 5FDXA 1YDSE 1H1PA 4ACHA 1ZXEA 4C58A 4FSMA 2C47A 1CTPE 1W83A 2XNEA 5KUPA 4FVRA 4RMZA 5TF9A 4ZLOA 4PNKA 2JKMA 4FV8A 4ALWA 4ANNA 1E1VA 3C4XA 4LMNA 2I1MA 5BQ0A 3KCKA 5HBJA 4GFOA 3CJFA 3VS7A 1R0EA 3TNHA 4DLJA 4LYNA 2QR7A 2RKUA 3PWDA 4A9TA 2PVNA 3FJQE 3QTSA 3ACJA 2XNGA 3CEKA 5DE2A 3VBVA 4HGTA 4WG3A 4RWLA 3ZO3A 2WTDA 3LIJA 1XWSA 5CF5A 2R0IA 4GUEA 4D4SA 3ORPA 4F0GA 5EHYA 4R1YA 3GBZA 5EYDA 3RWQA 1WCCA 3Q96A 5FTQA 3R7IA 3DA6A 3R7EA 5BMSA 2Y7JA 3OTVA 4KNBA 4U45A 5CWZA 4NH1A 5CEIA 4CV9A 3O23A 5AM6A 3D5VA 3D83A 1WVWA 2BFXA 4A9RA 4OW8A 4G3EA 4ITHA 3FKOA 4O2ZA 4HGEA 5HCYA 3CY3A 4AA4A 5K0XA 4IAIA 1M7NA 4XV9A 1YOJA 3F3UA 4I5MA 3EQCA 3CTHA 3FLQA 2Y6OA 1FMKA 1YHVA 2VX1A 4IACA 1KE8A 3NWWA 3TNIA 3VS6A 4E1ZA 5CAVA 4MTAA 3UO6A 3KQ7A 2ITUA 3ZZWA 1IRKA 4C33A 3K3IA 3SQQA 2UZEA 4QMMA 2WHBA 4GJ3A 2W5AA 3D4QA 4FV5A 3LCKA 1ZARA 3EMGA 3EQBA 3SHEA 1XH4A 2I0YA 2YEXA 5A4TA 4I3ZA 1OUKA 2X9EA 4CV8A 2OFVA 3QD0A 4C59A 4YUQA 2QO7A 2VNYA 4F9BA 2YERA 4EH6A 3W55A 4USEA 4BVUA 3LCSA 5CVFA 2I40A 1XHAA 2JIIA 2OXYA 1BI8A 2BPMA 2OBJA 5AUYA 3TZ9A 3COMA 4ANLA 2JDSA 2UZUE 5EHLA 2WAJA 3TKIA 3OCTA 3PP1A 4ZTRA 4C37A 4FVPA 5LVOA 1OM1A 1J91A 5E7RA 5AWMA 2WQNA 1PY5A 4ENYA 3ERKA 1MP8A 2FUMA 1H1QA 2QOKA 3MH1A 4YP8A 3U4WA 1P5EA 5DR6A 3MV5A 3D94A 3Q53A 5FEEA 2BR1A 4FIFA 2OF2A 4F99A 2VNWA 3WE4A 3KY2A 2Y9QA 2YM7A 3FSKA 3I7BA 4I0RA 4Y95A 1VZOA 1YWNA 2XYNA 3PA5A 4S30A 5KNJA 2QOCA 3R83A 4FTLA 4IWQA 4PMTA 5ANIA 2UW9A 4CFMA 5LWNA 3U9NA 2UUEA 4ZLZA 5BUJA 3QQUA 5C03A 3NW6A 1TKIA 4BICA 3DJ7A 4G17A 1A9UA 4V01A 1F5QA 3CLYA 4F09A 5F9EA 3UPZA 4OT6A 3WE8A 5ANKA 2YIWA 3SDJA 2UW0A 2OZOA 2XP2A 1SNUA 4UX9A 4FL1A 4CSVA 1IG1A 5L4QA 2BRNA 2GS2A 3FMEA 5HESA 4PPBA 4FNYA 3FHIA 4KBKA 4AACA 4E8AA 4CFNA 5FBOA 2WQEA 4ANBA 2XA4A 1KE6A 5HLNA 2PVJA 3PA3A 2GNGA 4BWPA 3Q04A 4IX4A 4CLJA 4J95A 3CE3A 4GK2A 4YHJA 1URWA 3B2TA 4YHFA 2F57A 2KULA 4ANSA 4UMRA 2PK9A 4XG2A 5H2UA 4D1XA 3V5WA 4EI4A 3OBGA 4BBFA 3FZSA 3UE4A 5CANA 2LAVA 1AGWA 4HNFA 3IQ7A 3VS0A 4B4LA 4HVIA 2YIXA 3AGMA 1P4FA 2QC6A 3GCVA 3C1XA 3QQKA 4R1VA 4JOAA 4X0MA 4CRLA 2CLQA 5LOHA 4O91A 4JG7A 2XUUA 4W9XA 3PY0A 3DB6A 3DQWA 4KIKA 1W98A 2C1AA 3A7FA 3DJ6A 4MHAA 4NZWB 4USFA 4MD8E 3FQHA 3RK9A 4EQCA 2CCIA 4FSYA 4DH1A 2A27A 4F08A 3Q3BA 4EC9A 4LUDA 3A4OX 3DBCA 4A9YA 4J71A 4KA3A 4UV0A 2GNFA 2R2PA 2X0GA 4K77A 3DS6A 3BV3A 3F3VA 4AG8A 4E93A 4EC8A 2CMWA 2H34A 2EU9A 3PYYA 5CEQA 4JXFA 4FKWA 2IW8A 2UZLA 3IDCA 2FSOX 3QXOA 4FK6A 5AUUA 3O2MA 4QYFA 5LQFA 3C4ZA 1GY3A 4IAFA 3E8CA 1XO2B 4NUSA 4A4XA 5FXRA 4I6QA 1ZMUA 4RIXB 1HCKA 3RZBA 3H4JA 1Z57A 3L8PA 4FGBA 4BTJA 4YTFA 2B9HA 3QRIA 3QTRA 1W8CA 2JGZA 4XV3A 5CSHA 4IWDA 4XMOA 3R63A 4JIKA 4RRVA 4BDKA 3A4PA 4FICA 5H3QA 3CD8A 2W1IA 4GCJA 2G01A 3KK8A 3EFKA 3RPOA 3ZC5A 2ZMDA 5DEYA 2J50A 3COHA 5HE3A 4EK6A 2RSVA 5CQUA 4DEIA 1IASA 2GNJA 3BQRA 2PE1A 3V8SA 3WF5A 2XIZA 5HNIX 5CVHA 3MFUA 3EFWA 3KFAA 3UNKA 3W2SA 3GFWA 3HMOA 2OK1A 2F4JA 2GCDA 3O8PA 4QT1A 1OIUA 5AUXA 2WD1A 3FMNA 5JQ5A 2WQBA 3DAJA 3VF8A 4FTKA 5DVRA 5AV1A 3D14A 4C38A 4H1MA 4PMPA 5GJGA 3R21A 5DFPA 2QHMA 2BROA 4LG4A 3RJCA 2G15A 3CCNA 4EWHA 4BBMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5HTIA

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Chain Sequence

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