5J5T | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	303
structure length	297
Chain Sequence	SQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLDNGHVKLADFGVSAQITATIAAFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPSTYHDFDDDDPEPLVAVPHR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Germinal-center kinase-like kinase co-crystal structure reveals a swapped activation loop and C-terminal extension. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3
total genus	79
structure length	297
sequence length	303
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2016-04-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	5j5tA00

3RPYA 3DPKA 4D2RA 5CZHA 3LCDA 3VULA 3E7VA 4EH4A 1OUKA 2XMYA 4RJ3A 3UO6A 4WRSA 4GRBA 3REPA 4MNEB 5GJFA 4I41A 4TKSA 3BV3A 3KRJA 3WYYA 2WMSA 2WMXA 2ONLA 4RQVA 1XJDA 3TNIA 1GOLA 4GK3A 5A4EA 2XYUA 1NVSA 3V8WA 5HU3A 1H1QA 4QPAA 3QQGA 2Y4PA 4RFMA 2WMTA 3ZFMA 3A4OX 2CKEA 3UOKA 3UQGA 3I1AA 3OROA 2GFCA 3DT1A 4YSJA 4F63A 2XCHA 4W8DA 4X6RA 2VTOA 4XBRA 2QKWB 3OTVA 4W4VA 3DNDA 4XBUA 2QR7A 1OL5A 3EQCA 3WE8A 3FHIA 3O7LD 3VUMA 3OP5A 4EOIA 4RG0A 3RZBA 2J0LA 4EUUA 2XNGA 5FRIA 3BHTA 4K1BA 4IHPA 2BPMA 3LIJA 2H9VA 3KULA 3A2CA 4H1JA 3W55A 5I3OA 3RAIA 5IA1A 4KIKB 4HZSA 2JEDA 4IJ9A 1JKSA 2RSVA 4ITHA 3D5VA 5FWKK 4AG8A 4AZWA 4WBBB 2C1BA 1YQJA 2XK7A 5ANEA 3FZ1A 1ZRZA 3C0IA 4JDHA 4KBAA 5M56A 4AF3A 1U54B 4FKLA 4ALVA 3BQRA 4NKSA 3MH2A 3FLZA 3PTGA 4RC2A 3RCJA 3NW5A 1YRPA 4D4VA 4APCA 4A4LA 1H00A 4DEHA 5M53A 1OPJA 5FXRA 4FZ7A 2OIQA 3F2AA 4JG6A 3OBJA 1BI8A 4EH3A 3RK7A 4FTJA 5EYCA 3B8QA 4LYNA 5IG1A 2HY81 4QNAA 4RVLA 5DH3A 3C0HA 5AP4A 3U6JA 3H9OA 4UV0A 3PXRA 4R7IA 2I6LA 3MJ2A 1PHKA 2ZV9A 3A7GA 4W8EA 5DR9A 4IIRA 2IN6A 4X2JA 5AUZA 4AA0A 5K0KA 2F7EE 1WZYA 3ZBFA 3VUGA 4D5KA 1ZLTA 3P9JA 2JBPA 4JR7A 5DOSA 5JSMA 3OWJA 4FIHA 4OT5A 2YDIA 3KY2A 1JPAA 5AMNA 4EH5A 2VTAA 1RJBA 1SVGA 1JKKA 3UODA 3BHYA 4ZSEA 1WBPA 3PA4A 4MWHA 4ACGA 2BZHB 5BVDA 3BKBA 3CJGA 2I0HA 3FC1X 4OUCA 2C5OA 5AIKA 3O2MA 3D94A 5E1SA 4NT4A 5J95A 3TWJA 2WQMA 4OTFA 4ZLZA 4BCNA 2WFYA 5GJGA 4G17A 5CI6A 3GC9A 4U81A 4AW0A 4CLJA 5HVYA 3PY1A 4U40A 2OFVA 4RLLA 3II5A 1H24A 4BDCA 1XBAA 3LLTA 3D7ZA 4G34A 3QC4A 4M12A 1BX6A 2VWXA 5LJJA 2J6MA 4JI9A 4ZIMA 4FSQA 2EB2A 4EH6A 5EHYA 3C7QA 2G2IA 4UN0C 2J5FA 2XEZA 3R1SA 2GPHA 4NK9A 4NM5A 2B53A 3R1NA 3S0OA 3EZRA 3LFAA 2WTKB 3HMMA 4H3BA 4ASEA 3I5NA 1YDTE 5BX0A 4RFZA 4DN5A 4I0RA 2W1FA 5L6OA 4JIAA 5KMIA 1WVYA 4RMZA 4GH2A 4WRGA 5DLSA 4YURA 3TKIA 4FV6A 4MXOA 3VRZA 1OL2A 3CQEA 3QQHA 3CY3A 1WBOA 4KBCA 5GJDA 3VQUA 2VV9A 2FH9A 2UZDA 3DFCB 3R7IA 4I3ZA 1ZOEA 4QT1A 3KB7A 3MFRA 3VJNA 4A9RA 4UX9A 1QPDA 1M2RA 4EH8A 3H10A 1UNHA 2QOQA 2WHBA 5ETIA 3VRYA 1GJOA 4MXCA 1GY3A 2VO6A 3Q52A 4O0SA 3LE6A 2CSNA 3ZM4A 5J9ZA 2J7TA 5H9BA 3QD3A 3RK9A 3ACJA 5IH4A 2ZB1A 5M57A 4D4SA 3RM6A 4YJNA 5D12A 3PJ2A 4ACCA 3IW8A 5D9HA 3D2KA 2C4GA 3DZOA 3MH3A 2HZ4A 4UWCA 2EWAA 2OW3A 4HYUA 4QP3A 3RKBA 4JAJA 4BCMA 2BIYA 4V0GB 3DBEA 3HMPA 1UU3A 3BGQA 2OGVA 5I9VA 4I94A 2NRYA 4LOPA 3T3VA 5KZIA 2ZJWA 3LCKA 1MRYA 4XP0A 4L67A 3MBLA 3BCEA 2C0OA 4F6WA 5JEBA 2XNMA 2B9HA 5TE0A 3OBGA 4FK3A 4N70A 4NW5A 1W82A 4FKTA 1YDRE 1YI6A 3NPCA 4TW9A 2VD5A 1OM1A 3ZLWA 4BF2A 4BRXA 2BFYA 4EKKA 3P7BA 5JFVA 3KL8A 2OI4X 3ZO1A 4DYMA 2OF4A 4QMUA 1MP8A 5F20A 4S32A 2W7XA 3WZKA 4LGDA 4O0UA 5I9UA 4UBAA 5LCKA 1W83A 3OY3A 3DBQA 4DFYA 4B4LA 3F5GA 2GU8A 3EN4A 2PE2A 2WELA 3B8RA 4BI2A 4FIIA 1TKIA 1O9UA 3FQSA 5HVKA 3LQ5A 3QFVA 2FSLX 3F5UA 3GCUA 3QQFA 4U42A 3L9PA 3FSFA 3LFCA 4IAYA 4YJOA 3VF8A 4JG8A 4AOIA 2QLUA 5LMKA 3QQJA 2IVUA 3ZDUA 5CQUA 5EDQA 4RQKA 4J7BA 3QTRA 3UPZA 5J1WA 1JQHA 3WOWA 4FTTA 3A7JA 3BIZA 3R6XA 4WNMA 3SXRA 4UEUA 4ANNA 5E8WA 3V04A 4C8BA 2RKUA 4XG4A 3VHEA 4LOOA 4CT2A 2R3GA 2R0IA 3D5UA 3ZHPC 4FL3A 2PK9A 3HV5A 4JRNA 5CAVA 3DB8A 1NVQA 2UZOA 2C3KA 2X8EA 2XH5A 4L01A 5HCXA 2F7XE 3EB0A 3R7UA 1GZNA 2DYLA 4HCVA 3ELJA 3HRCA 4GL9A 2ERZE 2FO0A 5CAPA 4AWIA 3WIGA 2HENA 3QYZA 5B2KA 5K5XA 2PVRA 3BU3A 3FKLA 3H0ZA 4GUBA 5BVEA 1JAMA 4G6NA 2YDJA 3FZTA 4PMTA 2VNWA 5DVRA 4F4PA 2BMCA 2C5XA 4RJ5A 4ZSJA 4BCIA 5JFXA 1SYKA 2XJ1A 2HWOA 2I0EA 3LZBA 4XRJA 1FOTA 4GT5A 5JQ8A 3RBWA 1YHVA 1YXUA 4Z7HA 3FZRA 3KRXA 4LGGA 4AE6A 4BHNA 5EG3A 4DITA 1SMHA 5BPYA 1W98A 1FVVA 3S2PA 2WU6A 3SQQA 3QRIA 5KCVA 5HCZA 3LVPA 4BI1A 3AMAA 4C2WA 5K4JA 1YOLA 3IW4A 4XG8A 3HECA 4RIYB 2ZV8A 2JIUA 4S30A 4FSTA 4XYFA 3OWKA 4ZXTA 5HBJA 1UNLA 1UU7A 3S4QA 4YTFA 5JGDA 4BI0A 5LARA 4YZMA 3KF4A 3A7IA 2JIIA 3IG7A 5BQ0A 2VTMA 2W1CA 1G5SA 3GU5A 3MPTA 3V8SA 4F7LA 1IRKA 1ZMVA 4QQ5A 5FD2A 2V7OA 3U4WA 1HCLA 3TKHA 2YLEA 4GYIA 3VUTA 4AS0A 4BTKA 1H8FA 2VNYA 3JVSA 3KK8A 4PTEA 3VWAA 4O22A 2OH4A 4EOLA 4I21A 3OHTA 4IB3A 4S31A 4XOZA 4LOQA 3D4QA 3TZMA 3MVLA 4TTHB 3FLSA 3DS6A 2WQBA 5BVWA 3AD6A 1YDSE 3PPZA 3MV5A 3ALOA 4EZ3A 5IDPA 4FBXA 3BGZA 5HZNA 5CEPA 5CU4A 1U46A 2R3IA 3WYXA 4C4HA 4Q9SA 2X8IA 4BTMA 3DKCA 3PP0A 4O21A 4KSPA 4YC8A 3RAWA 3QGYA 4K0YA 4EHEA 3BYVA 5DHJA 4H36A 4Z7GA 2BAKA 2W1IA 3MWUA 3QYWA 5M4IA 4EZ7A 5CVHA 3W2SA 4G1WA 4DGLC 4GU9A 5CF5A 5HTBA 4OTRA 3EH9A 3P7AA 3W8QA 2PZIA 3QTSA 4U3ZA 5FLFA 4C59A 2IVVA 3FHRA 3W10A 4J8MA 1AGWA 5CU0A 4C58A 1EH4A 4IAIA 5AP5A 3THBA 3D7TB 4FTRA 4EOKA 2ITVA 4FSMA 4EWHA 5KMLA 4FYNA 2XRUA 1B39A 2WQOA 2YM4A 4RIXA 4EORA 1O6YA 1OB3A 2FYSA 4MK0A 5E90A 4I24A 3HUCA 4D9TA 3WF7A 3E8DA 4I5MA 3G9NA 3KF7A 3S00A 3RVGA 3D14A 1W0XC 2BDWA 4EJNA 1WBSA 3R01A 3FPMA 4U43A 5M44A 3UMWA 2ITWA 4BCPA 2OWBA 2GS6A 3QLGA 2C5VA 2X7FA 3MH0A 4LV8A 4A07A 1Q3DA 4OTQA 4AN9A 4WT6A 4GSBA 2CMWA 4I5PA 1F0QA 3POOA 1YOMA 4YHTA 5DIAA 4G9RA 2ETMA 2IZRA 5F94A 4QD6A 4FZAB 4LRKA 2QU5A 5D10A 2C6DA 2XJ2A 3KCKA 3TN8A 4FNYA 3SA0A 4PTCA 4IB0A 4ASDA 2QD9A 4FODA 4IVAA 2Y4IB 4RJ4A 2C6TA 2YIQA 4RSSA 3DJ6A 3ROCA 3EMGA 3GBZA 3NWWA 5L6WL 4AU8A 5HX6A 3PPJA 2CHLA 1B38A 2VWYA 1CSNA 2X6EA 3MN3A 3NYXA 3PP1A 3JY9A 4LUEA 4XLIA 3Q04A 4J52A 3V8TA 4JBVA 4YO4A 5CF4A 4E7WA 4U7ZA 4RWIA 5BVOA 3RHKA 2KULA 5KHXA 5C8KA 5FGKA 1Q8YA 3GXLA 3S95A 4S34A 4F6SA 4I0SA 3QCYA 5HLNA 3MIAA 4KIQA 3BHHA 2X2KA 4H3PA 3DZQA 2YM8A 3U9CA 2CGXA 3PZEA 1I44A 3G90X 4I4FA 4UXLA 3DK3A 5FP6A 5TKDA 4X0MA 4ZSLA 4FMQA 3ROYA 2YCQA 4C3PA 2Y6MA 5DEYA 5GNKA 3IOPA 3UE4A 3AMYA 3ANRA 3N9XA 3FSKA 3NIZA 4ZTQA 4DH8A 2C47A 2RFEA 2FB8A 4Y5HA 3PA5A 2GNHA 5HLWA 3R73A 2XBAA 2OXXA 2VTSA 4ONAA 4RVMA 3W2RA 3KFAA 2BRHA 4WG4A 5HBHA 3ZOSA 3ZFXA 4UB7A 1Y57A 4ZZMA 1P2AA 1KOAA 4DG2E 4KKEA 2V5QA 3GENA 3SRVA 3DAKA 3IQ7A 3C51A 1ZOHA 4BDBA 1OIYA 2IWIA 2ZAZA 3RINA 4D0WA 4AQCA 5D7AA 4FL2A 5ETAA 5K3YA 4FV7A 2PHKA 4PL5A 3TNQB 1V0BA 2ITUA 3KC3A 3I6UA 3C5UA 3GCSA 2XKFA 4DEAA 4K8AA 4M0ZA 5I4NA 2YM3A 3ZO4A 1UKHA 2CCIA 1XH7A 2OJGA 2YM6A 2JITA 3EFLA 3G51A 3AD5A 1Y91A 3QKLA 4IZYA 4PQNA 4PDSA 4BWPA 3A8XA 3B2WA 2JDTA 5L2WA 3DB6A 1ZZLA 4EK8A 4ZSAA 2OFUA 3ZLXA 4CD0A 4KAOA 4MD7E 5AR4A 4FF8A 1M2PA 5LMBA 3FDNA 2VTJA 3F3TA 2OIBA 2B7AA 2WXVA 2YITA 4KA3A 5CWZA 5ITAA 4F99A 5KNJA 2RF9A 2PVMA 4M67A 4RFYA 4A4XA 3PA3A 3R28A 2UZBA 4FZDB 3MDYA 5AIRA 2B1PA 4XOYA 2PE1A 2H6DA 4M66A 4X21A 4FTIA 3VF9A 1UU8A 2YCSA 3RPOA 3SV0A 4B7TA 3QUPA 4HNFA 4FV8A 2OSCA 3R7EA 3RGFA 3GVUA 3CTHA 4ASXA 3C50A 2PVJA 1PXOA 5AV0A 4BIBA 3C4WA 2J2IB 5CEOA 3DDPA 1VJYA 4HVGA 5J1VA 3CKXA 2JAVA 1R0PA 4W9WA 4OT6A 4IWQA 3OEFX 4AT4A 5KMMA 5HE3A 4G3EA 3CXWA 2W0JA 3QTWA 4IXPA 1KE7A 1U5QA 3OCGA 5AR7A 2OZAB 3EQGA 3DK6A 3VAPA 2KTYA 4FTMA 4MAOA 4JIKA 4NJDA 5J79A 3NX8A 4IB5A 1Q41A 2R3LA 4XRLA 4CQGA 4F1OA 5E7RA 1IA8A 2Z8CA 4FKQA 3Q9YA 3VBWA 2C6MA 4S2ZA 4ACMA 3E92A 4C61A 4BZNA 3ZXTA 3I60A 1YHWA 4M69B 3VC4A 3C4ZA 2VTIA 2YERA 4C57A 4MBJA 3Q4CA 1Y8GA 4JRVA 5E8ZA 4XLVA 3KEXA 5J87A 2PMOX 3UO5A 3AG9A 3ZXZA 1LR4A 3OMVA 5HG7A 3QCXA 4OR5A 5CF8A 3PSDA 4FOCA 5H3QA 1V0OA 4TRLA 1OL7A 5AWMA 3RNIA 2X4FA 5AX9A 1CKIA 2QO2A 4FV0A 2J4ZA 2YZAA 4IAZA 5AAFA 2BVAA 4DINA 4NJ3A 2EXMA 3C9WA 4O0YA 5FG8A 5HIBA 3QX4A 3MA6A 4YLLA 3POZA 3UNKA 3OY1A 2ITYA 5FEQA 4YTCA 3FQHA 2PZPA 4YJQA 2W4KA 5CSXA 5AADA 3ETAA 1R39A 2JC6A 3FI3A 1PXIA 3E88A 2CN5A 4FT5A 4QO9A 4PWNA 4CEGA 3PE1A 4FV9A 5BVNA 3LFQA 1OL6A 1VYWA 3CGFA 3WARA 4L44A 4JLCA 3E3PA 4TYHA 5EYKA 1H08A 1UWHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5J5TA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations