5J7BA

The identification and pharmacological characterization of 6-(tert-butylsulfonyl)-n-(5-fluoro-1h-indazol-3-yl)quinolin-4-amine (gsk583), a highly potent and selective inhibitor of rip2 kinase, gsk583 complex
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
306
structure length
277
Chain Sequence
AICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLGTIIYMPPENYESRASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Identification and Pharmacological Characterization of 6-(tert-Butylsulfonyl)-N-(5-fluoro-1H-indazol-3-yl)quinolin-4-amine (GSK583), a Highly Potent and Selective Inhibitor of RIP2 Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2
total genus 81
structure length 277
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5j7bA00
1ZYJA 2VX1A 4KA3A 3V8SA 2QHNA 2BAQA 4XX9A 3PXZA 3FLWA 5T68A 1JSVA 3DTWA 3IW5A 4S30A 4CMUA 3E7VA 5EKNA 3Q9YA 4TWNA 3V51A 4IVDA 3PVWA 2XNEA 3AD4A 4K2RA 5FM2A 5FBOA 5AAFA 4FSQA 3SDJA 5K0KA 3HDMA 3LFEA 4WG4A 4H1MA 2BR1A 4AGDA 4CMTA 4CD0A 1JBPE 1SVHA 5HO7A 2QR8A 4ZSLA 5H8BA 3D0EA 3QRJA 3IS5A 4WNKA 4EH2A 5AAGA 2KULA 2R7BA 4AZSA 1ZYCA 4JS8A 3W8LA 3LCOA 4W4YA 4QMTA 2JIUA 1WVWA 3LXNA 4C0TA 4B8MA 1O9UA 3DFAA 5D12A 1LEWA 2XK9A 1UNGA 4JQEA 3CP9A 3EQIA 2GS6A 2WMXA 2WMBA 2ZM4A 4HPTE 4O91A 5DE2A 4W9XA 5E7RA 2R7IA 3DOGA 1KV1A 3DBDA 1ZMUA 1JOWB 2PSQA 4L43A 4FV9A 2O65A 4C34A 4QQJA 3B2TA 4R6VA 3KFAA 1R0EA 2XIKA 4RVLA 1BL6A 3N51A 4D4VA 2X4ZA 4JR3A 4U79A 5CEQA 3A8XA 2FSOX 4H58A 2BIKB 3FPMA 4D2SA 3AMAA 3EN6A 2YIYA 4XYFA 3LXKA 4CXAA 1ATPE 5I5ZA 4LUEA 4D9TA 1MRUA 3MPMA 4PDOA 3FUPA 3PWYA 4FV8A 4BGGA 1U46A 4L9IA 4XP0A 5HTCA 4CEGA 4J95A 4J71A 5LCKA 1Q24A 3ZSGA 2ZAZA 4AXAA 3GOPA 3QUDA 5F95A 3Q9ZA 3VS3A 4LRJA 4QP8A 2YM6A 3R2YA 4RX8A 3NUNA 3ANRA 2XIXA 3R63A 3TCPA 3F3TA 2UZDA 4G3DA 4ZTMA 3LM5A 3PTGA 1P4OA 2IZRA 3JVSA 3PSCA 2YLFA 3H9FA 2P2IA 3ZO3A 4N4SA 5DT0A 2OICA 3A7IA 4J1RA 3FXXA 2J5EA 3BQCA 3NUYA 1M52A 3UIXA 4DEBA 4LMNA 4O0RA 3BV3A 4XG2A 4KNBA 3NCZA 5IPJA 5BVDA 3A2CA 5F4NA 4M69B 4AW2A 2JDSA 5E1SA 2XNMA 3RVGA 1FGKA 3VVHA 4I4EA 4E5AX 2JD5A 3ENMA 3VJNA 3PUPA 2JFMA 3VS0A 3QKMA 1QCFA 1CDKA 4L7SA 3VUKA 1BX6A 4PWNA 5GJDA 4TWCA 4Z55A 2WMSA 4AT5A 1M2QA 4DFXE 2XBJA 3NGAA 3DS6A 2YA9A 4DG2E 4TPTA 4BHZA 3D7TA 4IWDA 2UZOA 5FRIA 3UYSA 4CTBA 1IASA 2VWIA 4E93A 1ZY5A 3PE2A 3WF5A 2NP8A 4C38A 3MBLA 2GNFA 2C4GA 2WQNA 3KK9A 4HCUA 5FBNC 4YNOA 5AV2A 3E88A 4YP8A 3S2PA 2QLQA 4D4RA 4LQMA 1QPJA 3PXYA 3VBTA 1GAGA 2PZIA 3F88A 3QFVA 5AUWA 5HIDA 3SRVA 4BBFA 5LCJA 3LIJA 5DFPA 5HX8A 5GNKA 4EWHA 1QMZA 4KBCA 4I5CA 3VW6A 1MP8A 3WZJA 5L8KA 2W5AA 4XRLA 2OI4X 4G9CA 3UG1A 4HOKA 5DOSA 1FINA 5AUYA 4YJNA 2QO9A 3VUGA 1TKIA 3BELA 2G2HA 4AOIA 3VBWA 2VGPA 1BKXA 3BEAA 3QAME 4U44A 1JSUA 4BL1A 1OB3A 2HZ0A 3FKLA 5CEIA 4E4XA 4MAOA 5D11A 5M53A 5DNRA 4YBKA 4CFNA 2O8YA 3F5PA 4E4LA 5JH6A 3BI6A 2Y6MA 2OJIA 4GT4A 5IU2A 2IZSA 1P14A 3ALOA 3RK7A 3UODA 1Z5MA 3LVPA 3R71A 4B7TA 3KGAA 4IC7A 2Z7LA 2IVTA 4QYGA 4WRGA 5LVLA 4ZZOA 4JDHA 4PUZA 4O0SA 5FTQA 3U4UA 3QD2B 4PNIA 5CZIA 2YDIA 4EI4A 5BPYA 4LI5A 4AGWA 1FMOE 5JFSA 5FDPA 4RIOA 4XG9A 4BZDA 1OKYA 2UZVA 4QQTA 5L8LA 4M15A 4BVUA 2JGZA 4X2KA 3WF6A 4RJ8A 3LXLA 4UMPA 4M66A 2CGVA 3S3IA 3KULB 4QP3A 2LAVA 3PIYA 4ERWA 1H08A 4RJ3A 1OL5A 2FA2A 4WA9A 4MXZA 3T9TA 3DDQA 4Y73A 2VTJA 4GG5A 4FVPA 5CEOA 5KMJA 1KWPA 4XV1A 3R7VA 3GGFA 3VS6A 2PMNX 5DEYA 1CMKE 3KA0A 4ZTNA 3OEFX 5AM6A 4USFA 2AC5A 4Y95A 2PVKA 4GYGA 1XBCA 4NWMA 2HELA 1PKDA 3UIMA 5HNIX 4I24A 3U87A 1Q8YA 4RVTA 3VBVA 1NY3A 3NYVA 4AN2A 2V7OA 3FMNA 3FL4A 2WTKB 1Y91A 4S32A 3GT8A 4JRNA 5E8UA 5FTOA 5HOAA 3VUTA 5I9VA 5AM7A 3MIYA 5BVFA 2YZAA 3FJQE 4G16A 3GFWA 4DEDA 5CAQA 3MGYA 4E5WA 2C6MA 4XOZA 4GFMA 3CTJA 4C3FA 4FSNA 2W05A 4XV9A 1CSNA 5IISA 3R7OA 3QCXA 4QYHA 3IW8A 3V04A 2VWBA 5EK7A 4XLVA 5CNOA 4G3FA 3ORTA 1DI9A 3P5KA 3GU6A 4LL5A 4G6OA 3LM0A 3WE8A 4YC8A 2HENA 3RAIA 3HMPA 2W99B 4IAFA 4W4XA 2YWPA 3KF7A 5CEMA 4EH3A 5AR2A 2VTRA 3FQHA 3S4QA 4AW1A 4MYGA 3VBXA 3QQKA 3KXXA 4RWJA 5A14A 2X39A 4RWLA 2BDJA 5CI6A 4O96A 3BGPA 3GC0A 3I1AA 4FKOA 2YIQA 5I9XA 5CXZA 3I0OA 3QBNA 2C3LA 4L46A 4E6QA 5CASA 3Q32A 4JL9A 2QU6A 3V5TA 4PL5A 3UP7A 3IGOA 4IE9A 3P0MA 4H3QA 4GK3A 5ANJA 4QMSA 4ACGA 2WU7A 3ZLWA 5H3QA 2CPKE 1H27A 4TKSA 4ASXA 2WU6A 4CLJA 2VNYA 4DGLC 2GNJA 5LMKA 2J90A 3TNHA 2O2UA 3MB7A 1XBAA 2W96B 4X7QA 3GCSA 5HG5A 3VS7A 4B99A 5AX3A 2WAJA 3QTIA 1XH5A 3F3VA 5A3XA 2ERKA 4CYJA 5FEQA 4ZEGA 2JKKA 1J1BA 3UVPA 3VS5A 1H4LA 5HLPA 5F94A 3D5WA 5ANDA 3ZDIA 4BI1A 4FX3A 4L3PA 4ALUA 1JKTA 3ZS5A 2HZNA 3KY2A 5DT4A 5JK3A 4PL4A 5CEKA 4EOIA 3TUDA 3BE9A 4KABA 3UO4A 2O64A 1OMWA 2OGVA 3QA0A 4FTUA 4QYYA 5ETFA 1OIRA 3C4ZA 4FV6A 4MNEA 4TYGA 5J8IA 1JLUE 3W55A 4C37A 2R4BA 5HE0A 5KKRB 3FQEA 2F2UA 5FGKA 2RFEA 3S00A 3RBWA 1Q97A 4CFWA 5C8KA 1ZYLA 3BRBA 3Q04A 4YZCA 3FC1X 1ZYDA 3BLQA 4QQCA 1Z9XA 4Q5HA 3W2CA 5FQDC 4HYHA 4PP9A 2UVYA 4R7HA 4ZIMA 3U6IA 3CQEA 4KINA 4TRLA 3ZXTA 1MUOA 5HIBA 1ZOEA 4NIFA 4UMQA 2HY0A 3ETAA 3GFEA 3VRZA 4DC2A 3LFQA 4BTFA 3HRCA 2QHMA 3QTRA 3R9NA 3ZONA 4NU1A 4QMQA 2XNOA 5JQ5A 3WYYA 4XEYA 3JPVA 3WIKA 4BDIA 3BHVA 4AZVA 2X2KA 5KMLA 3HMNA 4YHFA 5ANEA 4XHKB 4NSTA 5J9YA 4P5ZA 4XLIA 3FAAA 4DH3A 4FKRA 3G6GA 4CRSA 2QD9A 4NH1A 3I5NA 3TEIA 1V1KA 2PVNA 3BWJA 4RRVA 3PJ2A 3NYXA 4BTKA 2FO0A 4PP7A 4ALVA 5ICPA 3OEZA 3T8OA 4EH9A 1WCCA 1AGWA 2NRYA 3HEGA 1W8CA 5IA0A 3OW4A 2OFVA 2B1PA 2WTKC 2QOOA 3NLBA 4HW7A 1BYGA 4F09A 3R7GA 3Q4CA 4WUAA 1VJYA 4HVSA 2WTVA 3RK5A 2QOQA 1NVRA 1J91A 4PDPA 4YU2A 5FG8A 3DZOA 2C6TA 3AT3A 4K6ZA 5CSHA 3QKKA 2J51A 3QC4A 3RHKA 5HLNA 3ZSIA 4C3RA 4QPMA 3GU7A 4YNEA 4IBMA 3R1NA 3FC2A 2CCHA 4N6YA 4XG7A 4X3FB 3DAKA 2WEVA 3FLQA 3RCDA 2CKEA 2HYYA 3BU6A 4FSYA 3DXNA 3P7AA 1E1VA 4Q9ZA 5LJJA 3BU5A 3FQSA 3AT4A 4J8MA 3CJFA 4JT3A 3HUCA 3LHJA 4PDSA 2IVSA 3B8RA 2JIVA 4KIKB 3QRTA 4U3ZA 2FSLX 2XIRA 4RC3A 4DH8A 4YHTA 3S1HA 3EKKA 3N9XA 4LRKA 3MY0A 4IZAA 5AP6A 2A1AB 4EOLA 3WE4A 3RHXA 4ID7A 1OKVA 2Y4IC 5T3QA 3PXKA 5ITAA 3PVUA 4AN9A 3UVRA 2X6DA 2C5NA 4A07A 5L6PA 2R0IA 4EKKA 2Z2WA 2R3QA 3R1QA 3TZMA 4CKRA 1BL7A 2BVAA 4QPAA 5FLFA 5AUVA 3QCSA 4FTQA 4RFMA 4QOXA 4YJSA 4GK2A 2BKZA 4EOKA 4GFOA 4BWKA 2C3IB 3FHIA 5IG1A 2JDVA 5CT0A 5AIRA 3BKBA 3DBEA 3PYYA 4FT0A 3MTFA 4KIPA 1OPLA 1ZOGA 5CSWA 4CYIA 4TY1A 4J52A 3DJ5A 3QRIA 2XK4A 5D9HA 2XBAA 3R00A 2A4LA 4E26A 4OTPA 5HIEA 4MD8E 3G0FA 3R8ZA 5L2TA 2HZIA 3R30A 4PTCA 3LJ0A 4WD5A 1R78A 3POOA 3Q6WA 3W10A 3CC6A 4RC2A 4G9RA 2C6IA 4ZP5A 3FSKA 3EOCA 5K4JA 2QI8A 2HIWA 3JY9A 4YMJA 4I20A 3BQRA 3ZC5A 2WO6A 5EHLA 5J1WA 5KX8A 4CMOA 2GU8A 1S9JA 5E8SA 4AQCA 3D4QA 5C8NA 4M0YA 3RALA 4F63A 3BPRA 4RZVA 5EFQA 2J0KA 5KKRC 4IVAA 1MRYA 4K77A 4OT5A 3WZUA 3Q60A 3PY1A 3UYTA 3UOKA 3OTUA 1WVYA 3QTXA 2B9FA 3FZPA 3UE4A 4KBAA 5ETAA 3A62A 2XKDA 4R3CA 3O7LB 5LMAA 3NNXA 4S31A 3DKOA 3DPKA 3A60A 4A9UA 4C4EA 5DN3A 3TWJA 2QO7A 4O0YA 3NDMA 5GZAA 4TTHB 1YVJA 1CM8A 2YCFA 3E8EA 3GCUA 1H24A 1VYWA 2HAKA 4NFMA 4P90A 3DQXA 1ZMWA 3WZKA 3MH1A 3WI6A 2XJ1A 4YJTA 2OH0E 5AMNA 5DGZA 1YDSE 1PHKA 1RE8A 3FKOA 5CWZA 1UU7A 1OIYA 3QWJA 3ORIA 2YDJA 3SW4A 3DK7A 4I5MA 3ZO4A 4A4LA 1Q8ZA 4K0YA 5FD2A 5B0XA 1UU8A 2UZWE 3DK6A 4RGJA 1CKPA 3DK3A 1XH9A 2WFYA 2HCKA 2BALA 4G6LA 3SKCA 4HGSA 3UOHA 4H39A 4M67A 2OIQA 3AGLA 3QRUA 3TIYA 2YFXA 2PMOX 4DLJA 5JRQA 3PFQA 3GVUA 4FIEA 4AN3A 5AR5A 3TXOA 4AACA 2I1MA 2BZHB 2QNJA 4EOPA 5IA2A 3U8WA 4X6QC 2GTNA 3R7UA 3NNWA 4D1XA 1YHSA 5KHXA 4BIBA 2ZV9A 3I4BA 4QP9A 3VRYA 4C36A 3NAYA 4X3FC 5ETCA 4GS6A 3Q52A 4NFNA 4PTGA 4L3LA 3DBFA 2QG5A 3MA6A 4C3PA 2IZUA 3EQCA 1M14A 3NS9A 3DY7A 4S2ZA 2CHLA 1PXPA 4BKZA 1LUFA 1KE9A 4ZJIA 3F5UA 4I5PA 4F1OA 2BRBA 4RQVA 4FA2A 3IDBA 4J7BA 3E92A 3EFJA 5CU6A 2DQ7X 3ZLYA 4GVAA 4L00A 4EUUA 3D9VA 1V0BA 3OXIA 4L6QA 3GC9A 3L8SA 5TE0A 1ZWSA 4PMTA 4M68A 5CNNA 3E5AA 4JG6A 2JBPA 4R8QA 1GZKA 3L8VA 4L7FA 3G9LX 4XUFA 3FMDA 4MH7A 4HVDA 3A99A 4HCTA 3DDPA 4QMPA 5EM6A 3GP0A 3QCQA 1B38A 3CXWA 3EHAA 1O6LA 4I0SA 1ZXEA 4IAAA 2OO8X 4L53A 3SOAA 5C01A 4D2PA 3RPSA 4ITJA 4FYNA 3A4PA 1AQ1A 1KE6A 3AC8A 3GU4A 5TR6A 3PP0A 4FNWA 4FZDB 3COIA 5KHWA 2RKUA 3DTCA 3CTQA 5A4TA 3EFKA 3BHYA 4M7IA 2XIYA 2X4FA 1FGIA 4Z7GA 1M17A 3RCJA 3EQPA 3EQGA 4ACHA 1OGUA 2Z7SA 3I7BA 4KKGA 4D2WA 4JG8A 2VO0A 2X9EA 3MFTA 4FTLA 3AXWA 1R3CA 2XK6A 3HUBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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