5K0X | Genus

Total Genus 74

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	74
sequence length	288
structure length	258
Chain Sequence	KLEDVVIDRNLLILGKILGEGSVMEGNLKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEPKPMVILPFMKYGDLHTYLLYSRLETGPKHIPLQTLLKFMVDIALGMEYLSNRNFLHRDLAARNCMLRDDMTVCVADFGPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWAFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDRPTFSVLRLQLEKLLESLPD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Discovery of Macrocyclic Pyrimidines as MerTK-Specific Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase Mer
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	74
structure length	258
sequence length	288
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2016-05-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	5k0xA02

2VWXA 4LGGA 2WELA 4GIIA 5CASA 4EOKA 5HG8A 4BBEA 4W4XA 3HNGA 5DBXA 3FZOA 4W9XA 4S33A 1XH9A 5HO7A 3LLTA 4JDKA 3UZPA 2BRGA 2OZAB 4F09A 2AUHA 4CFMA 1XH7A 1BLXA 5HX8A 3BELA 3V5LA 4CT1A 3LQ5A 2UZBA 5FEQA 3F9NA 1GZ8A 4EK6A 3S0OA 4EOPA 3H0ZA 4DLJA 4TKSA 4UN0C 2UVZA 4IDVA 4EUUA 3F2NA 2VUWA 4QMXA 4WUNA 4XRJA 3R9HA 3UMWA 4WHZA 3KC3A 3F3VA 5KMMA 1QPCA 4EOJA 3UIXA 5KCVA 1YOJA 3U8WA 4GK3A 4RZWA 1Q8YA 4TYIA 4F9YA 5IPJA 3IDCA 5CU3A 2OO8X 4IVCA 4EEVA 3K5UA 4MXCA 2W5HA 3PA3A 2PE1A 2WTWA 3P79A 2V7OA 3MH0A 4MEDA 4IHPA 3V8TA 4IADA 5C03A 4F9WA 3MDYA 2I6LA 4FTLA 3V5TA 2BDFA 5LMBA 3B8QA 5G6VA 2RSVA 4XV3A 3SAYA 2WNTA 4ZJVA 4M14A 2V7AA 4ITIA 2BFXA 2VTNA 3LAUA 3NPCA 4BTMA 4RC2A 1JVPP 4ANQA 2R3LA 3BHHA 4RZVA 3V51A 4DTKA 4LGHA 4I6BA 2WQOA 4UMTA 4BWXA 3EHAA 5HOAA 1VYWA 4B0GA 3ZRKA 4EH8A 5JN2A 2IVVA 3LQ8A 5EK7A 2X6DA 2ONLA 3TZ9A 3WARA 2B52A 4TN6A 1H27A 4FSWA 5K5XA 1YQJA 1UNLA 3FBVA 1OVEA 3MV5A 3FPQA 5CSHA 5C8MA 1W82A 4MNFA 2PZYA 4KBKA 1REKA 4CFFA 4A07A 2VZ6A 2B9JA 4BCKA 4RIXB 3AT3A 4YJPA 2RG6A 3AC5A 3AC1A 3KL8A 3NX8A 4Q9SA 3ZSGA 4BCQA 4E5WA 5TF9A 2OH4A 2QC6A 4ACDA 2W5AA 1Z5MA 2QONA 2R3RA 4AP7A 3ZH8A 4AZEA 4ALVA 3D2KA 5D9HA 4FKSA 3KF7A 5EYCA 2I1MA 2XB7A 2YIRA 3W2RA 3KB7A 3HMOA 1KE5A 4A9SA 4L9IA 5CF5A 4IX5A 5KNJA 3HP2A 1I09A 4OBOA 4W4WA 5CSWA 4HCUA 5AR8A 2HZ4A 3KMWA 3RGFA 2ITXA 2JKQA 4F9BA 5TT7A 4FIHA 3R28A 4M12A 4TYEA 3V01A 1I44A 4HGLA 4A4LA 3SXRA 5HVKA 4FKPA 5E1SA 4U79A 4ITJA 4F99A 5E92A 3RZFA 2G15A 3GFEA 4NM7A 3UYTA 3QXPA 2B53A 3OFMA 4L3LA 2WTKC 3MPTA 2ITUA 4Y46A 1QPEA 2WQMA 2Y7JA 3H0YA 4RVLA 2YCQA 4YPDA 1SMHA 2ONLC 3BWJA 4OBPA 2PVNA 5CENA 2F7EE 5H8GA 2XA4A 4YO4A 1IRKA 3FE3A 5G1XA 2GCDA 5DR9A 2P3GX 3MSSA 2IW6A 3AGMA 4JAJA 2O3PA 3ORIA 2H6DA 4MBLA 3D5VA 4JDIA 4O22A 4CYIA 3FYJX 2C5XA 4QD6A 4NFMA 3UJGA 1JSUA 3ZSIA 5JFXA 4QP3A 1XBBA 3KRRA 4HVDA 4X7QA 4P2KA 1H25A 5ANJA 2BAKA 2YDIA 3EL7A 4AGDA 3HX4A 1BYGA 2XNOA 3EFKA 4GJ2A 3VAPA 4DCEA 3OMVA 3R6XA 4RJ8A 2Y6OA 5K9IA 3GT8A 4RIYB 2A4LA 5DR6A 4ASEA 5J79A 4AT4A 1QPJA 4DEBA 4QP2A 3Q32A 5AP3A 3CGFA 4AN3A 5JQ8A 1YDTE 2R64A 2UZWE 5AP5A 2BILB 4IZ5A 2IVTA 3BYSA 3IS5A 3OBJA 4FKRA 4CXAA 5AUVA 4E4NA 4FSMA 5E8VA 4EQUA 2OI4X 3LM5A 4HPUE 4IXPA 4K33A 4XEYA 4G17A 3PVGA 4IB5A 4RIOA 4ZEGA 4FIEA 4DEEA 3AMAA 4F6WA 5L2SA 4IH8A 1UNGA 4P5QA 2YJRA 3GOPA 4FOCA 3R8ZA 3WYYA 3GVUA 2BR1A 4C4JA 5FDPA 1Y8GA 4U3YA 2BRMA 3KK9A 5CAVA 5EKNA 4IAAA 4ASDA 4FTKA 5DNRA 2OJGA 4CKJA 3QBNA 3ENMA 4FNXA 5H9BA 3TZMA 4Y8DA 1F3MC 4BGGA 5AV1A 4K77A 4EH7A 3ALNA 5DG5A 3E8CA 4TYHA 3QUPA 4IZ7A 4X6QC 4RQKA 4RFMA 4DH7A 4FT9A 4C0TA 2XIRA 1GAGA 3BQCA 3IG7A 3W55A 4D5HA 5CY3A 5FEDA 5KMJA 4JX3A 5CXHA 5AR4A 4BC6A 5JGAA 2IN6A 2I0YA 1U54B 3U9NA 3FZ1A 1PXLA 4TNDA 2YAAA 2OK1A 2A2AA 3KXGA 2YISA 3QTRA 3GCPA 1QCFA 3O7LD 4NFNA 2VAGA 1E1VA 5AJQA 4GCJA 4FZFB 2GNIA 4WG4A 4MBIA 3LFEA 3AG9A 2ESMA 3F3TA 1Q3DA 3HDNA 4KINA 2R3HA 3ZRLA 2VTPA 3VS0A 4RWLA 4XX9A 1XJDA 4FTIA 3QD2B 3QKMA 4MNEB 3HV3A 3V5QA 2J0LA 3DU8A 4L3PA 3DKCA 4EBWA 4KIOA 2WMVA 2W1HA 4F1MA 4QPSA 3R9DA 5ANKA 2PVFA 1J91A 4V01A 3RJCA 3CS9A 3MTLA 4FV9A 2WTIA 4QMTA 3WZDA 2HXQA 4PPBA 2O64A 4XUFA 3ODZX 3DJ7A 3DQWA 3RM6A 4YTHA 4BF2A 1JNKA 4OAVB 4ZTNA 3WZKA 2W1GA 4QMYA 5BUEA 4I5CA 2R3IA 3LCDA 2RL5A 4CQEA 1BI7A 4EYJA 4UMPA 3UPZA 4LQMA 1ZMWA 1XHAA 3NUUA 4KS8A 4YJVA 3VUIA 4FBXA 3WF6A 1UU3A 4EHZA 3S00A 4QMWA 4QNYA 5JEBA 1ZYCA 2XYNA 4KBAA 4PL5A 5AX9A 5A4EA 2VO7A 2PMNX 4ZIMA 4V0GB 4R7IA 1WBPA 5JQ5A 4FZDB 3IW4A 4W8EA 4GU9A 4LMNA 2ZV8A 3GNIB 2W1FA 5FGKA 3V8WA 3DS6A 1O9UA 1OIUA 2BRBA 4NH1A 4Q2AA 4NM3A 2OFUA 1KV1A 3QD0A 5JGBA 4NEUA 4AXAA 4KKHA 3UG2A 3FWQA 1LPUA 3DTWA 5DVRA 3F2AA 3FZSA 2BROA 2VGOA 3DK3A 4FSZA 2YDJA 4EH4A 3VS4A 4D1XA 2BDWA 4O6LA 3SVVA 4E6CA 4S32A 4FKTA 2OSCA 3IONA 4AWIA 2W7XA 4FICA 5LXMA 5AR7A 2VU3A 2FVDA 3EMGA 4GYGA 4QMOA 3WBLA 4RWIA 2C3JA 4YNOA 2B1PA 3QGYA 2OKRA 1FMOE 3C50A 3F5UA 4I93A 2JC6A 4GRBA 1Q8TA 3RHXA 3T3VA 3VVHA 5IEYA 4JX7A 5KE0A 3H9RA 3BU5A 3OW4A 2OXYA 3UVPA 2YWPA 4BWPA 1F5QA 4GYIA 4I94A 4JJRA 4QO9A 2HYYA 3FLZA 2GQGA 4GUEA 3G9LX 2PVMA 4C2WA 1H1QA 3CKWA 2QOIA 2RFSA 3FQEA 4TWOA 4XP2A 2ZM3A 4F64A 5KHWA 3WF8A 4M0ZA 2ZM4A 3BRBA 4RLKA 4AGWA 2UUEA 3AC3A 3TJCA 4BDIA 1YXVA 4KABA 4LUEA 3W2CA 4JIKA 1SYKA 4DFLA 4JLCA 3QLFA 4ZP5A 3RK7A 4EOLA 3UP7A 4ANNA 4TWPA 4FNYA 2JDSA 4I0SA 2BDJA 4K18A 5TOZA 4A4XA 2J5EA 3IW7A 4CKRA 4ZAUA 3ORNA 3QQHA 4KSPA 2PZRA 2ZV7A 1BKXA 1Y57A 4I4EA 2J51A 4FV5A 4RG0A 4WA9A 3GU8A 3MJ1A 3OCBA 4X2NA 3RPRA 5JRQA 1Q99A 2OZOA 1JPAA 5EM8A 4IACA 5T68A 4MX9A 5I3OA 3UO5A 3QCSA 5M53A 1H08A 2BZJA 2EXCX 4FUYA 4E7WA 4FUXA 4HGEA 2WTCA 4JOAA 5HBJA 3VBVA 4FC0A 2G01A 1JKSA 5HBEA 3B2WA 4O2PA 2H34A 3HP5A 3R1YA 4J53A 4EZ5A 1O6LA 4ZK5A 3LFFA 3NEWA 4L01A 4NKAA 3QYWA 5LWMA 3FJQE 5AUZA 2OJJA 4RT7A 4D2RA 1Q24A 3D15A 5KMLA 4GH2A 5H8BA 2XK8A 4D2WA 4Y95A 2BFYA 3F5GA 4L43A 4EI4A 4JBPA 3VS7A 4E4MA 1U46A 1UWHA 3LCOA 1A9UA 1XQZA 4IWOA 4QP9A 3FL4A 2VRXA 2WMBA 4B9DA 4JNWA 4F7SA 2PTKA 3C4WA 4PMMA 4EK4A 4WRSA 2XK3A 4CRLA 1VYZA 2C68A 3FSKA 4UEUA 4S31A 2ERZE 3F61A 4AG8A 3NYOA 4FTOA 3CTHA 4BDGA 5DA3A 5CLPA 3F82A 3F3UA 2W96B 2C30A 3QWJA 5CU2A 3KK8A 3C4CA 4FYNA 4CFNA 5GHVA 1YXTA 3PP1A 4JBOA 4FV0A 1PXMA 2UW4A 2YM5A 1JQHA 3DBEA 5DEYA 3AC4A 3BYMA 2PK9A 3ZZWA 4DG2E 4D2PA 3KXMA 1YOLA 4M69A 4I5MA 1Q5KA 3DFAA 4HYSA 3DNEA 5KBQA 3GBZA 4HYUA 1WFCA 3EYHA 3G0FA 2O65A 2QQ7A 4K1BA 3P1AA 5FBNC 3TIZA 5A4CA 4PTEA 4RVTA 5C9CA 3ET7A 2RG5A 1Q4LA 4PUZA 5M4UA 5JSMA 2PMLX 5EFQA 4UZHA 2JKKA 2VTIA 5KZIA 4G34A 4YU2A 4UWYA 2C3IB 4I5PA 2VTHA 4AZVA 3V3VA 3QRKA 4EOQA 2WMRA 3VQUA 2IWIA 3RP9A 3MTFA 4ACCA 4FODA 2Y0AA 5AP7A 3QU0A 1PXPA 5DFPA 5HTCA 2B54A 2QOLA 4CKIA 5IA1A 5I9XA 3WF5A 3FLYA 4YLLA 4DC2A 1W98A 2V62A 4J1RA 5LJJA 4WRGA 2NP8A 4RPVA 3PY0A 2OJ9A 3PYYA 4J96A 4MH7A 4PY1A 2QURA 3VUMA 3MH2A 5EHOA 5T3QA 4CQGA 3A62A 4BDEA 3E7OA 3FI4A 5LMKA 2SRCA 4PPCA 2EXEA 1W7HA 4O0SA 3PG3A 4O1OA 3RALA 4B6LA 4ZLYA 4AAAA 4JDHA 4GVAA 1M2PA 4GSBA 5FTQA 5C01A 3A7FA 5BVNA 3DKOA 3CD8A 3TEIA 3U51A 5EYKA 3CE3A 2WIPA 2IVUA 3VWAA 4M66A 4C4GA 2XVDA 4EKKA 5LVNA 4BCMA 5DEWA 3VS5A 4D4YA 4YJOA 1BL7A 3NUYA 4AUAA 3F6XA 2R3KA 3CPCA 4IW0A 5L6WL 2XNBA 4ZTQA 5DMZA 4DFZE 2X6EA 3M11A 2PHKA 3O23A 4DFXE 3R02A 5HU9A 4FL1A 3U6JA 3LW0A 1GZNA 4GT4A 4YO6A 4EQCA 3ZM4A 3OWLA 1PXNA 2C6IA 2XK7A 5E8SA 2DS1A 3ZDIA 4BCOA 2UZEA 4CMUA 3HLLA 4IZAA 3R1QA 4IX6A 4QRCA 3PXYA 3ZUVA 5ANEA 2CJMA 4FSNA 2KTYA 2O0UA 2X8DA 4RMZA 4X0MA 3P0MA 4AW5A 3VRYA 3GU4A 5FEEA 4GFOA 4ANOA 1H1WA 3CQUA 1M2QA 3TV7A 1Q97A 4LFIA 4JQEA 2FA2A 5F95A 3Q3BA 3W2OA 1H0WA 1PKDA 2CN5A 2QOCA 4TWCA 2JAVA 3BWFA 4CT2A 5DH3A 2C5NA 1XBCA 2VWIA 3D7TA 3FMLA 5KMOA 3LFSA 4CVAA 2RGPA 3A7JA 4KS7A 4GU6A 4HVIA 4WIHA 2VTTA 2WO6A 4USDA 4I3ZA 1SM2A 4GUBA 2CCHA 3O8PA 3R2BA 4MWHA 4ASXA 2JAMA 3TXOA 4I21A 4NKSA 3DLZA 4GG5A 3OOMA 4F4PA 4BIEA 4PMTA 1UU8A 2BVAA 4QMQA 4BI0A 4I6FA 1B39A 4TYHB 4EOIA 2XRWA 4OW8A 4XBUA 4J99A 5M56A 4DGGA 5LVPA 4NW6A 3AOXA 2HWOA 3D5WA 1PMEA 4KNBA 4BYJA 5FDXA 3EQDA 1Q61A 3SHEA 3PE2A 4UXQA 2J0MB 5KMNA 5BVEA 3RPSA 1HOWA 3QRIA 3BU3A 3I5ZA 2F57A 2XCKA 3QYZA 3KMUA 3NUNA 3NW5A 2BZKB 5LVOA 3QQFA 4RX9A 4Z9LA 2C5YA 1AQ1A 3L1SA 2QI8A 4EC9A 3NW7A 4IAYA 4Y72A 4E20A 5KX8A 3VUHA 3V8SA 4I92A 3C0HA 4QMLA 2V55A 4XV1A 5DE2A 2WGJA 1IASA 1GZKA 4G6OA 3RHKA 2O8YA 3SV0A 4ZZOA 4F0IA 4JG8A 3E87A 3A99A 3BYVA 4FNZA 4G6LA 3EKKA 3LFAA 3O96A 2IVSA 5E8ZA 4U43A 3SXSA 5A54A 1NVSA 5ETIA 3WIKA 4B8LA 5K0XA 3C4XA 3MPAA 3LFBA 3V5JA 2R0UA 3TACA 3VBTA 2PZPA 3TTIA 5A4LA 2OG8A 1GY3A 1ZYSA 4XG7A 5E8XA 4UALA 2QD9A 4YHFA 5HHWA 1WMKA 1FINA 2XJ1A 1GIHA 5AUXA 5GZ8A 3A7HA 3PJ2A 4XG6A 3H9OA 4GK4A 5FM2A 3O2MA 3UQFA 2UZOA 4G16A 4IWPA 5CEOA 3QWKA 3VHEA 1IA8A 1OPJA 1DM2A 2B9IA 4OT6A 5KO1A 3GU7A 3QHRA 4U81A 3CQEA 1MRUA 1WBVA 2WPAA 1WCCA 4FKLA 3BV3A 4ZTMA 4PL3A 4R3PA 3TNWA 4O0RA 3QTSA 5J7HA 2VNWA 4WKQA 4RVKA 2C6LA 3O50A 1H4LA 2BUJA 2FYSA 4L00A 3D9VA 2XNPA 2Z7SA 3DJ5A 4IZYA 4RJ4A 5F4NA 5LCKA 2OW3A 2UZUE 3BLRA 3FZTA 3PY1A 4OTIA 4YTFA 5M57A 4FZAB 5CT0A 1YRPA 3T8OA 4C57A 4V05A 4PMPA 1OIYA 4BCJA 4S30A 3IK3A 3KRJA 5F1ZA 3SXFA 2EUFB 3TZ7A 5AAEA 4DEDA 3ORXA 3QD3A 2X4FA 3FLNC 3R1SA 4UXLA 4APPA 1XR1A 2ITQA 3FY0A 1QMZA 1X8BA 2WQBA 3O8UA 1LR4A 4KSQA 5HE3A 4A9RA 4FNWA 4EH6A 4F65A 3POZA 3E88A 5AEPA 5HORA 5LCJA 1K9AA 2IZSA 3MS9A 2W1CA 2CN8A 1TVOA 3TCPA 5HCYA 5IU2A 4IVBA 5BQ0A 3BCEA 3T9IA 4RX8A 3PPKA 4KAOA 3GC9A 5EDRA 4Z3VA 4BDFA 1R0PA 4I6QA 2DWBA 4NM0A 3F66A 4XV2A 4ZTRA 5EHLA 3RWQA 3FMKA 4EYMA 3BGPA 4MF1A 4ZXTA 4BDKA 5I5ZA 2JLDA 3EFJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5K0XA

Total Genus

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