5AR5A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310) complex with benzimidazole
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
307
structure length
284
Chain Sequence
EAICSALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLHLLDSERKDVLREAEILHKARFSYILPILGICNEPEFLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGLSKWRMEGGTIIYMPPENYEPSIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
total genus 87
structure length 284
sequence length 307
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar5A00
3MPTA 2FSMX 1MRUA 2V5QA 4EBWA 3R83A 1CKJA 2IVSA 3LJ1A 3COHA 5AP3A 4CV9A 5CS6A 4ZLYA 4TKSA 4F7LA 5L6PA 4FKRA 1URCA 5IA3A 3R7IA 4GEOA 4ZJVA 2RFDA 3C4ZA 3MY0A 4D4RA 3GU4A 3LFQA 2HZ0A 3OXTA 4XG9A 3C4XA 4I23A 3UNKA 1P4OA 4XH6A 5HLNA 3HRCA 4A7CA 4R6VA 3ORLA 1W83A 2ITTA 3NUYA 1B38A 4GRBA 4C57A 3KF4A 3ORKA 5FEDA 4ZSGA 3R8VA 3BQCA 4BYJA 5F9EA 3TN8A 3ZC5A 4FG7A 3SVVA 4NTSA 2R3OA 2V7AA 4RJ5A 4U6RA 2BILB 4GFOA 4C2VA 3Q4CA 4CMTA 4EUTA 2R3KA 3MN3A 3ODYX 4USFA 2QOKA 5HVKA 2JDRA 3RAIA 3PRIA 1H1PA 2G2IA 4IQ6A 3E8EA 4GT4A 3U4WA 4RIOA 3WE4A 5CEMA 4WKQA 4YJNA 4HOKA 4JBQA 4RIXA 3JY0A 5TF9A 3L8SA 3AC3A 5I9WA 2BRHA 4N70A 4CFMA 5AAFA 1KWPA 3I7BA 3OOGA 3ORZA 2X8DA 4V0GB 3WARA 1GNGA 4QP2A 1YKRA 2OW3A 2CN8A 2YM6A 4YLLA 5KKRC 4JRVA 1ATPE 1CSNA 3UQGA 1FQ1B 5FP5A 3ZO1A 3F9NA 4XG3A 3EQGA 1ZOGA 4XOZA 2IZSA 4D0XA 4M66A 4EHVA 4BYIA 2Z60A 3M11A 4QTCA 3SD0A 3AQVA 4GJ2A 3BHYA 4OBQA 2JGZA 3MY1A 3TV7A 2OBJA 4K11A 4E5WA 5HQ0A 4IWOA 2QNJA 3KXNA 2W0JA 3LCTA 4QYHA 3BYSA 3LXPA 2P33A 3R28A 3HYHA 1OI9A 4GK3A 5CANA 4O1PA 5D12A 2GFSA 3DLZA 3HP5A 3C4EA 3UOJA 2OXXA 5HICA 3ZZWA 4A9UA 3TZ9A 4Q5EA 3FKNA 4ENYA 4BDIA 3IS5A 4P5ZA 4B0GA 4BB4A 2WMRA 1WVYA 1Z9XA 5JMSA 4N0SA 2VTAA 4EH8A 1PXPA 1TVOA 2ETMA 3QYWA 4E6CA 5ETFA 4E73A 4ZSJA 4IXPA 5CEQA 3UYSA 3QQFA 1H08A 4AF3A 4EH6A 4O96A 5E8SA 5IMXA 3KY2A 5L2QA 3FY0A 4G1WA 4C4IA 3KXHA 2DYLA 2HWOA 4NW5A 4ZSEA 4FVPA 2VX1A 3EHAA 1R0EA 1Q8TA 2XKEA 4RX5A 1YWRA 1Q5KA 1O6KA 4QMOA 1W82A 2W17A 2W1ZA 4TT7A 5IEXA 1DI9A 1M7NA 4F70A 3E8NA 4F6WA 3MS9A 3BKBA 4MQ1A 4KWPA 3D14A 2JEDA 2HAKA 4EKLA 3KVWA 5AP4A 5GJGA 4IWPA 4DTKA 4R1YA 5HEZA 4BDFA 4FGBA 4UZDA 4RG0A 4Y46A 4KD1A 5I5ZA 1GJOA 5AM7A 3BWFA 2UZOA 2UZUE 1TQIA 5ITAA 3DDPA 1Q8ZA 3EQPA 2XBAA 3ODZX 3W55A 1XH4A 5J5SA 5JGBA 2E9VA 2ITYA 2QI8A 2FGIA 3COKA 3ELJA 2YCSA 5CQUA 4J98A 5E92A 3WI6A 2VWXA 3HDMA 4C62A 4L53A 3MH3A 3NUSA 3NW6A 2FH9A 3W10A 5CAQA 4O0UA 5CF6A 2OI4X 3DFCB 3PJ8A 4A9TA 3G6HA 2EXMA 2HW7A 4XV3A 4ZP5A 4DGMA 3UMXA 4OT6A 2UZBA 3KRJA 4L67A 3JPVA 1YHWA 4IX4A 4JG8A 4A06A 2XS0A 3K2LA 3KN6A 4D4VA 2QHMA 3AC1A 3P7BA 4IX6A 4E6QA 4YC3A 3L9MA 3RZFA 3FZTA 4HYUA 3OFMA 2WU7A 3ORNA 4S34A 1URWA 2C6OA 2Y4IB 3Q4UA 4IX5A 4YO4A 5M56A 5T3QA 3PXKA 4HNIA 4EQMA 4OTRA 3FHIA 2O0UA 3QFVA 4ZEGA 2CGXA 1OIRA 5CAUA 4FV0A 3A7IA 2IW8A 4M97A 4FR4A 5AR3A 4CKIA 3B2TA 3PFQA 4XS2A 4CTBA 5LWMA 3LAUA 3FL4A 4YZMA 3OY3A 2W1HA 4XRLA 5AADA 2OJGA 2HOGA 3QWJA 4DEBA 5H2UA 5AV2A 4PX6A 2V0DA 3SXSA 5DE2A 4ZZNA 3QKLA 5EI2A 3OOMA 3O8UA 1L3RE 4IZ7A 4ZS0A 4MYGA 3CLYA 3PG1A 4G9RA 4KB8A 4BFMA 4BTJA 1STCE 4MK0A 5KHWA 2W5HA 3GCVA 3ZCLA 4MD8E 3LM5A 2Z7QA 2EWAA 1FPUA 5AV3A 3VBQA 3ZLXA 5ANKA 5HE0A 5JEBA 5JQ5A 3H10A 1LP4A 4G16A 5CALA 4KSQA 3R7GA 2YZAA 5AP6A 4QMLA 4ERWA 1ERKA 1YOMA 4WRGA 4X2NA 2VWVA 3HVCA 3MH1A 2W5AA 4G5JA 4PF4A 3F3VA 4BWKA 1J91A 3BI6A 1JSVA 3BE2A 3COMA 3EL7A 4WIHA 3VJOA 3CQUA 4BCPA 2HELA 3HMMA 3PUPA 3QAME 2HZIA 3OG7A 4EK8A 4JI9A 3WIGA 3BE9A 5E8UA 4JNWA 2VRXA 2YIQA 1MQBA 2XIYA 2QURA 4K6ZA 2WOTA 3Q5ZA 4FIIA 3QZGA 2RG5A 3P7CA 3IKAA 4G6NA 5JSMA 1HOWA 2HENA 1UVRA 2FSLX 3D7TB 4NZWB 1XJDA 3FMNA 3PIZA 2CLQA 4FZFB 3UODA 2OF2A 2W7XA 2PTKA 3DPKA 3QZIA 4HGSA 4V01A 5IH6A 2HK5A 5EDQA 3LM0A 3QCSA 4KBAA 5HE1A 4FV2A 2GDOA 2Q0BA 3EQFA 4YHFA 4M69B 1PXOA 3FBVA 2XRWA 4QTBA 5I4NA 2R3MA 3OT8A 5HD7A 4DC2A 3IW8A 3BLHA 5EYCA 1XO2B 3PZEA 3BHTA 2UZNA 1T46A 3CBLA 3OMVA 3WZJA 4DG2E 3VNTA 2C5XA 2W99B 4BTKA 1B39A 4EHEA 4MX9A 3UO6A 4DHFA 3ZU7A 5CSWA 3Q2MA 4RVMA 2PZPA 2H6DA 5IA0A 5KMNA 4CFVA 4KKEA 4XG6A 4RSSA 1S9JA 5HG8A 3DAEA 3F3UA 2JFLA 1LEZA 1A9UA 1UKHA 4ITIA 4IWDA 5HG5A 3LFBA 3Q4ZA 4U44A 4DLIA 4DITA 4MXAA 3TNIA 4TWNA 2XA4A 4FZAB 3OS3A 5AR2A 4F9AA 4FOCA 4OAUC 4YSJA 3VUHA 2VD5A 4ANOA 2VTOA 4FTCA 5IKWA 4J97A 4LGHA 4EOSA 4APCA 4WNOA 4E4MA 5AIKA 4KAOA 2WTKC 3F2AA 3R1NA 4K8AA 5D7AA 3TV4A 3VJNA 5DPVA 4RIYB 3RK9A 3VS1A 2OK1A 2PMIA 1BYGA 3JVSA 4YLJA 3NS9A 4UALA 3ZOSA 4TNBA 5CEKA 3RWQA 4UN0C 3IGOA 2VO7A 4C3FA 1M2QA 2VTMA 1M7QA 4B8LA 5HCZA 2BROA 5E8TA 4IC7A 2JC6A 4C4JA 4D1SA 1WBNA 3B8QA 1E1XA 3RAKA 3POOA 3VVHA 3O7LD 3KFAA 3LFCA 4P2KA 4BTFA 5L8KA 3SQQA 4O91A 4H1JA 2EB2A 4BWXA 5IISA 4DFYA 4DINA 5J7BA 4V0GA 4MBIA 4NSTA 3HV6A 3U6JA 4FNXA 4FSWA 4R1VA 3LFNA 5AP1A 3FLQA 3VBVA 3ZO2A 1G5SA 4KRCA 2YERA 3Q04A 4MKCA 1VR2A 2W06A 2QU5A 4W9XA 4CFNA 4TYIA 4AOIA 2HXLA 3UVPA 4ZSAA 3G90X 5A14A 5BUEA 5K4JA 3TTIA 5JH6A 5M4CA 2UZVA 3DU8A 4ASXA 4YJRA 3R8UA 4IB3A 3THBA 1H07A 3ZONA 2BPMA 3UO5A 3HX4A 4LFIA 4NJDA 4S30A 3G6GA 4BL1A 2VTQA 3A99A 2C3KA 4UY9A 4CLJA 1YI6A 3SAYA 1IASA 4FSMA 4USEA 3HRFA 3BGPA 2XUUA 4RZVA 2W1IA 4QQ5A 2GNLA 5FG8A 1ZOHA 3QTZA 3RNYA 5D41A 4ZLOA 3RPVA 5E90A 2ITOA 5BYYA 3P5KA 4EK6A 3ZLYA 2A0CX 2XCHA 3ZTXA 4EUUA 3UIUA 1GZKA 3RPOA 1M14A 3D5WA 2F7EE 4UXQA 2GHLA 4UYAA 5DVRA 3NNVA 4FSTA 1LUFA 3QQKA 1YWNA 3FMMA 3ZLSA 3I81A 4MXYA 4XBUA 3E7OA 3R7YA 4F7SA 2E9PA 3QCYA 3V04A 3ZFMA 2ZV9A 3PWDA 3NYXA 4NM3A 5GZ8A 4N6YA 2YWPA 4F0FA 2G01A 3HKOA 1A06A 4ACHA 4D1ZA 3BBTB 5FXRA 2R3QA 3LIJA 1DAWA 2J2IB 3RWPA 4J1RA 5EHYA 4JQ7A 4FKJA 5L8LA 5KCVA 1VYWA 3UTOA 4CRLA 3QHRA 4JVGA 4M68A 4F08A 4EH7A 2X6DA 2QQ7A 4ACMA 4KS7A 4C37A 5HNGA 3BU3A 5DI1A 4RJ4A 3RPRA 5AWMA 4ASDA 2Y7JA 4GH2A 4D1XA 4DFNA 4XG2A 4ZTSA 4BKZA 1Q3DA 2PL0A 4YBKA 3QD4A 4UX9A 4RMZA 2B4SB 4BCJA 1KOBA 4AXAA 1SVGA 3RK5A 3EN9A 4OTIA 2OIQA 4JT3A 3VUMA 4TNDA 4MWIA 2WD1A 2CLXA 3OC1A 4BI2A 5CTPA 5LOHA 5AP7A 5BNJA 3QQHA 5CU3A 1Y8YA 4FKUA 4P7EA 5IA1A 1K2PA 1KV1A 2EXCX 2R3RA 1U54B 3PJ2A 3W2OA 4CFXA 3OTUA 2XMYA 4UMPA 4RWLA 5AA8A 3FZ1A 3BGZA 5KE0A 1QL6A 4UMTA 3ORMA 3NR9A 3TCPA 2UVXA 5F20A 4DH7A 4HZSA 5HO6A 4P5QA 1H4LA 3ANQA 2ZDUA 2UW0A 3OBGA 3PXQA 4IAZA 4OGRA 4CMUA 3MY5A 1WVWA 3MH2A 4FK6A 4L7FA 5J87A 4RLKA 5KBRA 3QRJA 3I6UA 4DG0E 3M2WA 5HKMA 2UW4A 4FKVA 4YO6A 1E1VA 3PP0A 2OGVA 4RX8A 4B9DA 5EM8A 3VQHA 2J51A 4CVAA 3DV3A 4X3JA 2WMBA 2PMOX 1PXJA 5HNIX 2W9ZB 3UOKA 5HOAA 2PHKA 3KN5A 4KRDA 3I79A 1KE6A 1PF8A 2ONLA 4FV8A 5GZ9A 3UBDA 5HX8A 2YM3A 3RAHA 1SMHA 4ITJA 5IPJA 3AC4A 4TL0A 3MJ1A 5LVPA 1FGKA 1YOLA 3QD3A 4ZOGA 4YR8A 2IW6A 3RVGA 4OTGA 3DKOA 4H3PA 1IR3A 5CX9A 2YDJA 4II5A 3WYYA 3DKFA 3FSKA 1PW2A 5FDXA 3SOAA 2RIOA 3EIDA 3PY1A 2C0IA 2ITPA 2HCKA 2Z7SA 3FAAA 3QQGA 3KRXA 2BHHA 1U5QA 3FKLA 3VF8A 3RBWA 3F5GA 4BKYA 4APPA 5IMEA 2WELA 2ITWA 4XV1A 4LV8A 4JR7A 1QPCA 2I0YA 4C36A 3PPJA 2UZEA 3TTJA 3ZSHA 4LRKA 4F0IA 2WEIA 1ZWSA 4EWQA 4NM5A 3NPCA 3AC2A 4NJ3A 4YTFA 3D7TA 4FZ6A 4I4FA 5ANDA 3DK7A 3NX8A 2PWLA 3BEAA 1H1SA 3W2SA 2WNTA 2J0MB 3CGOA 5J7HA 2O3PA 3FV8A 2IW9A 4FVQA 1XBBA 4L42A 2AUHA 4QP6A 4M69A 3UQCA 3HRBA 2B9IA 3QU0A 2VTTA 4AP7A 4EQCA 2R64A 4EK3A 5LCKA 3OWJA 1UU7A 3DTWA 4Y5HA 2XKFA 2J5EA 2OIDA 4JDHA 5EM6A 4UEUA 5F4NA 4QMWA 4D2VA 2A4LA 4HJOA 4RA5A 4XMOA 4YTIA 1YDTE 4IB5A 4FNYA 5FLFA 5K9IA 4D2WA 1ZMVA 2YITA 3LFSA 5LVOA 3PSDA 5HCXA 4GIHA 5HZNA 1PMVA 1Q97A 3R7VA 3W16A 3WF5A 3NUUA 3HLLA 3MFTA 4FSZA 3A62A 5FD2A 1XHAA 3LCDA 3UMWA 3RKBA 2JFMA 4AT3A 4OAVB 1J1BA 1WBOA 2VO6A 2O5KA 3NIEA 4IZ5A 1RE8A 4X7QA 4XCUA 4BC6A 3ENHA 4YTCA 2HZNA 1OKYA 2I1MA 4MF1A 3AGMA 4ANMA 3HUCA 3EFKA 4CQGA 3PA3A 3DT1A 4G34A 4I20A 3VBWA 3CQWA 3CTHA 4JG6A 5EHLA 4CSVA 1APME 3H9OA 2YLEA 3C4CA 3OW3A 4RIYA 4Q2AA 3PE1A 4PNKA 4KNBA 3HV7A 5BYZA 1YDRE 1BL6A 4FZ7A 1OPKA 3C7QA 4FT5A 3LQ5A 5EH0A 3S95A 1UNLA 2PUUA 2BRBA 1W0XC 1Z57A 4W4YA 5BVFA 3GFWA 2QR7A 4NH1A 2YA9A 3I0QA 3QA8A 1YQJA 5ACKA 3MFUA 3V8WA 3VUGA 1MQ4A 4MF0A 2R3JA 4TN6A 4CTCA 3K3JA 5I9XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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