5FWKK

Atomic cryoem structure of hsp90-cdc37-cdk4 complex
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
IKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALTPVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic Structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 Reveals that Hsp90 Traps and Stabilizes an Unfolded Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords HEAT SHOCK PROTEIN HSP 90 BETA
total genus 52
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
K PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5fwkK00
1M7NA 3UODA 3W2CA 3NNWA 4LMUA 5TKDA 5AV2A 3UIBA 4CFXA 4D2TA 5CF6A 3BU3A 3DBDA 2QHMA 4BCGA 2QOCA 3P4KA 2J51A 3Q2MA 5DR9A 2P0CA 1WBPA 1U5QA 1T46A 5A3XA 4KA3A 2XM8A 2ITYA 3JXWA 3LFFA 3G6GA 4XBRA 1NVRA 4PP9A 3PSDA 3PIYA 3CY2A 4FZ7A 4D1SA 4Y5QA 3TTJA 3OF0A 1APME 5F94A 4YPSA 2JEDA 4MX9A 4C36A 4EOLA 4PTEA 3SHEA 4QMLA 4E5WA 2WMBA 4KKGA 2BRBA 5JZJA 4FV2A 4H3QA 4X3JA 4HYHA 5H8EA 3TJDA 2BAKA 4HYIA 4FIGA 5AR4A 4C58A 2Y4IC 4ALVA 1SM2A 2XEYA 2C5OA 3KB7A 4LRKA 4DFZE 1OB3A 2UZWE 1WBOA 4PRJA 4K1BA 3MH3A 4KSPA 4KS7A 4MCVA 3DDQA 4D0XA 2QOHA 1XKKA 4DG3E 5GZAA 3MS9A 1MQBA 3QFVA 4NTTA 4BI2A 2PVKA 4EHGA 3VBWA 3P9JA 1ZXEA 3ZBFA 3DY7A 3UVRA 3IGGA 1WZYA 2Z2WA 4FVQA 4FV8A 4OTFA 3P0MA 1YXTA 4GMYA 3Q52A 4CRLA 2VTTA 2PVLA 4QMSA 4UB7A 3WIGA 2WMQA 3MA6A 4I41A 2FO0A 2ONLA 4RIOA 4WSYA 4YLKA 3RM6A 1Q3DA 2J50A 4RJ3A 4CRSA 4YO4A 3TKUA 4Y95A 1KV2A 2UW0A 2V7AA 3D15A 3FMDA 4YR8A 3EQIA 5HKMA 4AZVA 3PXYA 2J7TA 3U6IA 1YWNA 3GENA 4G5PA 4IWDA 3QBNA 4F6SA 5A4TA 3O2MA 4I20A 1H0VA 4BZOA 5HBEA 3ZLYA 4C38A 3NYXA 4IE9A 5KKRB 2R3IA 4EWQA 4X3FB 3REPA 3QRKA 4WD5A 3QTWA 4HPUE 1NVQA 4AOJA 4AGUA 2HWOA 3KF4A 5DFPA 3I0QA 3BYMA 5AUUA 2J0LA 4R3RA 3VS7A 3DB8A 3R7UA 4GU6A 5KUPA 2QU5A 5BNJA 3COKA 4A4LA 4E4XA 1WBVA 3VBYA 4RIXA 3WZEA 4J97A 4EOSA 2ITZA 3I81A 3KA0A 4BCMA 3E63A 2PY3A 5ACKA 1RDQE 5CZIA 3R7EA 5GZ8A 4QQCA 3KCKA 5AAFA 1JKLA 2ETRA 2UVXA 2B53A 2CGXA 3OUNB 1YHWA 5JRQA 5L2QA 3RNIA 2JBPA 2VRXA 4UMQA 4AGWA 4AT3A 4D5HA 2QOLA 4F65A 4IZ7A 3QQHA 4TTHB 2FA2A 1W83A 3BEGA 5JRSA 4UMRA 2O0UA 4XLVA 5JQ5A 3QU0A 4H58A 2C5VA 3EFKA 4KIPA 4F9WA 2Z7LA 2C1BA 3IGOA 4AW0A 4FTIA 3T9IA 2BAJA 3WBLA 1OPJA 3GEQA 4NUSA 3FXWA 2X9FA 2X4FA 4KRDA 5A4LA 1WVXA 2O63A 4YC8A 1FVRA 3ORMA 5IA4A 4KKHA 2YERA 3Q4CA 4WO5A 4RX7A 2ACXA 1ZMWA 4A07A 4FKRA 3VS4A 4QD6A 1KE9A 2Q0BA 1XHAA 4ANQA 3GI3A 5E8YA 2J6MA 1ZYCA 3VUTA 1TQIA 3VS6A 5J1VA 1UU9A 4EONA 1OIUA 3P7AA 4WBOA 4CFMA 2PMLX 4FNYA 3VS0A 2GS2A 3NLBA 5BVOA 5CEOA 4FEQA 4JAIA 4B6LA 3UC3A 1QPDA 2Y7JA 2WMAA 3LFBA 5AUVA 2ETMA 5HGIA 4A06A 4D0WA 2PVRA 4EQMA 5I3RA 5J5SA 3PSCA 3DK7A 3EFWA 1U5RA 2QOFA 3SQQA 2OJFE 4LV8A 3OT3A 3TV6A 1BI7A 5LVOA 1XBBA 4O0XA 2VUWA 4BDAA 3NR9A 4D4VA 3BHHA 3D7TA 5IA0A 5TR6A 3E8NA 4BYIA 1P4OA 4NM3A 4X6RA 5EOBA 4BICA 4G34A 5AR3A 2WQNA 4P2KA 1OUYA 2YM8A 3I7BA 3W33A 3BZ3A 1PF8A 2VWYA 4XG2A 3BEAA 3I79A 3VBQA 3MB6A 5CEQA 3BGPA 3SRVA 4E4LA 3JYAA 3R0TA 5E8XA 1MRVA 1PXJA 3BRBA 3EH9A 5CENA 5IA1A 5KMJA 4GFOA 2VNWA 3R30A 3HMPA 4QMWA 3RPYA 3W2OA 3C5UA 3KKVA 4RJ6A 4M3QA 3BV3A 3PVBA 5K9IA 3P7BA 3KRWA 4HGSA 3MFRA 4QTAA 4U45A 5CI7A 3VJNA 4HVHA 5BUEA 4P5ZA 2XNEA 3L9PA 3CR0A 3F66A 1XO2B 5I5ZA 3CD8A 3MIAA 3MJ2A 4S33A 3ZRLA 4AWIA 4BI0A 4ANBA 3CKXA 4JBPA 1Y57A 3BLHA 3H0YA 2W1EA 3ZDUA 4FICA 3UYTA 4MD8E 3QZGA 4ANSA 3MWUA 4ASDA 4BCJA 4RWKA 2CCIA 4X6QC 1U59A 1ZZ2A 3NRMA 3KN5A 4JT3A 5GNKA 5LJJA 5CF5A 3UO4A 4I5MA 3UYSA 3FZ1A 2IW6A 3EKKA 4F9CA 3LFEA 3AT2A 4XMOA 4WRGA 4F99A 5F9EA 1OZ1A 4I94A 4TWPA 3VW6A 4XOZA 3PE2A 4BCPA 3R8ZA 4PUZA 4UWBA 1Y6AA 3G6HA 3TL8A 2EXEA 3ORNA 2IO6A 3KC3A 4WKQA 5H2UA 4QPAA 1Q4LA 4LGGA 3AXWA 4RG0A 3EMGA 3DT1A 4L7FA 4MXCA 3LOKA 4O0YA 4C4HA 4D4YA 4I6HA 4JIKA 1OL6A 5L8JA 4APCA 2BCJA 3MGYA 4I4EA 4L3JA 4FSWA 4MXXA 4N70A 4RVTA 4PF4A 3UMWA 3ORXA 4YSJA 5BUIA 2F7EE 2ZV7A 4FZAB 4GL9A 3DTCA 4JDIA 3GGFA 4IM2A 3ZC6A 2JFLA 3TZ7A 4BL1A 3ACJA 5HU9A 4U43A 2RG6A 1Q41A 3MSSA 4PX6A 1J1CA 2DWBA 3L8PA 4L67A 4U41A 1HCKA 2W4JA 3OXIA 3U87A 4F0FA 5C27A 3L9NA 1PXOA 1WCCA 3QZIA 3RTPA 3R9DA 5E8VA 3RPSA 3ZMMA 3K3IA 3Q4TA 3W55A 4D2RA 5CSVA 1GIJA 3C4WA 5HX6A 2FGIA 2XIZA 2WIPA 4CVAA 5ICPA 2FSTX 3GCUA 3E64A 4V01A 3TIYA 4RIXB 4U40A 2ITNA 1W8CA 2VX3A 3PIXA 3ZC5A 4AN9A 5C1QB 2XS0A 3FBVA 4RT7A 4X0MA 3V01A 3QKKA 5AP2A 3UZPA 3UBDA 2J4ZA 5HQ0A 3ZO2A 4A4XA 2P4IA 4XS2A 1H00A 1UU8A 4U3YA 4W8EA 3SW7A 2PMOX 3SOAA 4ZJVA 1I09A 2E9UA 3UNKA 4FKLA 5IEVA 4GUBA 4QYHA 2B9IA 1JOWB 5AAGA 3R28A 2J90A 4EHVA 4YBKA 5CF8A 4DC2A 4IM0A 5HOAA 4XG3A 5J95A 3RZBA 4PTGA 4IAIA 3QTZA 4IIRA 5HE1A 4W8DA 4XV3A 1E1VA 4IADA 3FI2A 2C3KA 3QF9A 4HGLA 4L3LA 4XP2A 3D7ZA 3MTLA 4DHFA 4YTCA 2BROA 3B8RA 3VUGA 3GFEA 4MNEB 2XK3A 4AP7A 3UOJA 2JIVA 3COMA 5EK7A 2AC5A 2V22A 2GCDA 4FT3A 2EXMA 2X7GA 5HD4A 1Y6BA 4YHTA 4FV1A 3BHYA 3EB0A 3IQ7A 4O6EA 2O2UA 4RMZA 3VS3A 1KE8A 4IWQA 5LOHA 2UZNA 4IX4A 4B99A 3EN6A 3HRCA 4QP4A 4NJDA 4HPTE 5EW3A 5IH5A 3PE1A 4FTRA 5E8TA 3R83A 4BGQA 2XK6A 3O96A 3O8TA 4C57A 3F69A 3R1SA 2XM9A 5FTQA 4FVRA 4YNEA 4QP2A 2ZM1A 1M2RA 1FVVA 4DGLC 3VAPA 4BIBA 3BU5A 3D7TB 4OT6A 2W7XA 2PUUA 2I40A 2EB2A 2W4KA 4OBQA 4ZTNA 4C3FA 5AR5A 3EQBA 3GP0A 1H1RA 3HYHA 3ORKA 4QMMA 3TN8A 4CD0A 3FKOA 3P86A 3QTUA 4IWPA 2XYUA 4BWPA 3OWPA 4ZSAA 2O3PA 2E9VA 3F2NA 4ZLZA 5CWZA 3QA8A 4J53A 3SRVB 3G0FA 3E62A 1WBTA 1VYZA 3AGLA 3DZOA 3ALNA 4RPVA 4U9AA 3BWFA 3PVGA 3AGMA 3EN5A 4C4JA 5L2WA 5HNBA 3NW7A 5FD2A 4O2PA 4EH3A 3AMYA 4ERKA 3DKCA 2R3JA 2X7FA 4L9IA 3CJGA 3LVPA 2UW8A 3BYUA 5K4JA 5IKWA 2JDOA 2WPAA 3F3TA 3R1QA 5B7VA 3KL8A 3G90X 5CNOA 3VNTA 4J7BA 5BMMA 2VTHA 1CTPE 4MVFA 4DGOA 3PY3A 2GU8A 3P1AA 1PMNA 2HY0A 4XJ0A 2WTKB 4FG8A 1YWVA 2FVDA 2YLFA 5ANGA 4FTKA 5KE0A 3IOPA 4DH3A 2ZV9A 4KBKA 1KOAA 5AR8A 3E7VA 3MI9A 4YUQA 4YJRA 4B9DA 4MBIA 1Q62A 2HCKA 2WOTA 2XYNA 4D2SA 4WG5A 1ZOEA 3R21A 4EHZA 4FIEA 2W1IA 3CD3A 2HXLA 3IW6A 3V8WA 5HLPA 3FYKX 3QLFA 5DGZA 5A46A 4CSVA 3QLGA 4BKZA 4GFGA 4N6YA 5D12A 3ZFMA 5FDPA 2NPQA 3HMOA 3O17A 5IEYA 2OKRA 4FKSA 5JK3A 3FLSA 5AUWA 4NU1A 5JFVA 1BL6A 3BIZA 2YM3A 4D2WA 4NIFA 4G9RA 3TI1A 4LL5A 4D4RA 2QOBA 2LAVA 3I4BA 1GZ8A 2W05A 3BU6A 3FMHA 4FSMA 5CTPA 2WMRA 3OEFX 2YAAA 4RFMA 3HX4A 4LV5A 3R7YA 4L52A 2E9NA 3P7CA 3LQ8A 1Q61A 2P2HA 3RK9A 1UWJA 1OKWA 3S0OA 1M52A 3EIDA 3WZUA 3F61A 3WILA 2UZTA 4HGEA 5I9WA 5L3AA 4RVKA 3QXPA 4EBVA 2YIWA 3O23A 3VF8A 2VO7A 2PL0A 3FC1X 1Y91A 3R02A 1KOBA 4FTMA 3ULIA 2ONLC 1EH4A 3ANQA 3TNPC 4MAOA 3BI6A 2J5FA 4L43A 1HCLA 5KCVA 5L4QA 4CEGA 2GPHA 1GY3A 4QMOA 3V5QA 2WMXA 1NY3A 4AOTA 5I9ZA 3VBTA 2WHBA 4YTHA 4ACDA 5AP7A 3D0EA 1BYGA 1OKVA 1YXSA 2CGWA 3LPBA 4DH5A 5CALA 3VW8A 4K11A 4EK5A 3NAYA 5KX8A 1OVEA 3FHIA 3AD4A 3NPCA 4FI1A 4F4PA 5CAPA 2VO0A 2XK8A 4BIEA 2GQGA 2YISA 4E6AA 2OBJA 5K5XA 5ANJA 2FSMX 4K18A 2OICA 4HCUA 1WVWA 4NT4A 5K0KA 2W17A 5AR2A 2V5QA 2VN9A 2PMIA 1OL1A 5AWMA 5GJFA 4APPA 4FIIA 5ANDA 3HZTA 4E20A 2JBOA 3ZFYA 4QYGA 3W18A 5CAOA 3VWAA 5LVLA 1SMHA 4FSYA 4QQTA 2VU3A 3QTQA 4WA9A 4S34A 2FSLX 2BHEA 5DR6A 3A8XA 1OMWA 3G51A 4YC3A 2XF0A 4LG4A 4X2KA 5I0BA 5DVRA 5HCXA 1OKYA 2E2BA 2YCQA 4RZWA 3FY0A 4EBWA 3PG1A 2J0JA 4FMQA 3MH2A 2W06A 4XG7A 2R0IA 3OW4A 4EKKA 4GH2A 4WIHA 4USEA 3DZQA 3O7LB 4NKSA 4U8ZA 1ZWSA 3R7OA 2JGZA 1I44A 2R3PA 4TL0A 4I6BA 5D11A 3QHRA 4BDDA 4ENYA 5HORA 4D5KA 3GOPA 4KD1A 4GCJA 4XV1A 3KMMA 5J1WA 4XP0A 4DG2E 3IECA 4YZCA 3AC5A 2DQ7X 2EWAA 2F7ZE 3BHUA 4GK2A 2PVHA 3GCVA 2R3LA 3WYXA 3DBFA 3FZPA 3GC8A 4YZBA 4OBOA 3R01A 4RRVA 4ACCA 3OG7A 5ETCA 4ASEA 5HBHA 2XVDA 4FKIA 1ZYSA 2QHNA 2YACA 3C4ZA 2FB8A 5DEYA 4UV0A 4YJQA 3R9NA 5AA8A 4PMTA 5CQWA 4G3GA 4FKGA 4J71A 4M7IA 3QXOA 5E1SA 3ZCLA 1H27A 2X7OA 2VZ6A 3PRFA 5K5NA 4PNIA 2WTCA 1PMUA 3DB6A 4W4VA 3UPXA 4V04A 2H8HA 3RAIA 3UOKA 5T3QA 4O91A 4YTFA 3S00A 5C9CA 2BZIB 3NSZA 5JFXA 5CI6A 1WBSA 3UO5A 3NDMA 5HE3A 3LFAA 2GS7A 2X81A 3LJ2A 2FYSA 3NWWA 3QD4A 4I1ZA 3ZUTA 2W4OA 3IKAA 2QVSE 3D5XA 3ANRA 5AMNA 4TNBA 3C51A 4L01A 1WMKA 4MF0A 4X3FA 2OXYA 3BE9A 3MH1A 4WSQA 3WARA 5L2SA 4F9BA 3FWQA 2QC6A 5TOZA 4CLIA 4I5PA 4TWNA 3JVSA 4CZYB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5D7A A;  4QMY A;  3QD0 A;  4KWP A;  4FSZ A;  5IH4 A;  4NFM A;  2CGU A;  4QMX A;  3HL7 A;  1H01 A;  2BRH A;  3EQR A;  3BCE A;  4MWI A;  3SDJ A;  3VHE A;  3WF8 A;  5CF4 A;  3UTO A;  2X0G A;  5M4F A;  3R22 A;  5DI1 A;  3DQW A;  4RQV A;  4KRC A;  3KK8 A;  4UZH A;  1PXI A;  2GNJ A;  4FOC A;  2QKW B;  4AZF A;  2OIQ A;  2FUM A;  4YZ9 A;  4QMP A;  3SLS A;  4BFM A;  2A19 B;  1W7H A;  3FKN A;  2JC6 A;  5AM6 A;  2C30 A;  3WZD A;  5IMX A;  4ZLO A;  4I3Z A;  3ROY A;  4ACM A;  4F6U A;  2WMV A;  4MD7 E;  3NGA A;  4R5S A;  4TKS A;  3VBX A;  2CCH A;  2XH5 A;  4PPC A;  4R7H A;  3OWL A;  4IBM A;  3WZK A;  4LFI A;  2W1C A;  4JAJ A;  2I0H A;  1SNX A;  3RCJ A;  1PKG A;  2BHH A;  2C5Y A;  5M4U A;  3TUB A;  1L3R E;  2XCK A;  2OH0 E;  3DJ5 A;  4NFN A;  2X0Q A;  4L53 A;  3OTV A;  5FWK K;  5F4N A;  4RFZ A;  2IWI A;  4LOO A;  3HGK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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