5J5TA

Glk co-crystal structure with aminopyrrolopyrimidine inhibitor
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
303
structure length
297
Chain Sequence
SQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLDNGHVKLADFGVSAQITATIAAFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPSTYHDFDDDDPEPLVAVPHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3
publication title Germinal-center kinase-like kinase co-crystal structure reveals a swapped activation loop and C-terminal extension.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 297
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5j5tA00
1B38A 1PKDA 4WG3A 2W1EA 3BEGA 4O2ZA 4YJVA 5FG8A 3A7GA 4B6LA 5DWRA 3LLTA 4ZJJA 3O71A 4DEAA 3OWLA 5E90A 2I1MA 5HCXA 5HIBA 2F2UA 3EFJA 3DKFA 1P5EA 3VUIA 5EYMA 3RNYA 3BV2A 2IZRA 2YEXA 4PF4A 3GC0A 4OLIA 1PXIA 2RL5A 3NUXA 4LGDA 3NLBA 3PJ8A 4W4VA 5IUHA 3QZIA 4IAYA 3L1SA 5JKGA 3DV3A 2X2KA 3PIXA 4QQCA 5CEMA 4B99A 4MNEB 3ET7A 3PSDA 3OXIA 1REKA 3LJ1A 4BDAA 4QMOA 5M53A 3A61A 1QMZA 3SQQA 4EH2A 3FPQA 4F64A 3TJDA 2O64A 5LMAA 4BCKA 4D9TA 1XO2B 4HVIA 4L3JA 3QCSA 4XCUA 1KOBA 1AGWA 1M2PA 2UW0A 1BX6A 5CAQA 4AOIA 2UUEA 2ZOQA 3LJ0A 3D2IA 4D2SA 4JG8A 1R3CA 2W1DA 1Y6AA 4K8AA 4LL0A 3ZBXA 4BDCA 4C4HA 5C26A 2AC3A 4F65A 1XHAA 3CPCA 3R83A 4Q2AA 3VF8A 3O8PA 2OSCA 4FNXA 4EZ3A 2B9HA 2XIZA 5K3YA 3KRXA 4TYHB 5KUPA 5CWZA 5FM2A 4FUXA 4CV9A 2WU6A 3Q5IA 3GUBA 3VW6A 4YU2A 3KN6A 5GJDA 3UTOA 3CKWA 3PA3A 2C6IA 4HNIA 3EQBA 4QP9A 2I0EA 2RFDA 4YLKA 5E8UA 3ROYA 4NCTC 3FKOA 4RT7A 4H3BA 1ZOHA 2R3MA 1DS5A 2XIKA 3EQIA 4KB8A 4DAWA 1H8FA 5C8NA 4JQ7A 2VWZA 2CCHA 5DNRA 5IU2A 5IG1A 1PF8A 3PVUA 3IK3A 5D11A 5C9CA 5FP5A 1U5RA 4BI2A 2GSFA 5H2UA 4ANQA 1KV1A 5HO7A 2JITA 2XZSA 3JY0A 4EUTA 4GJ3A 4MK0A 5FBNC 5BX0A 4ZZOA 5JFXA 4PDOA 3R1QA 1Z57A 3MVHA 5DLSA 3RHKA 2ITYA 3EWHA 3FAAA 5AV0A 4JQ8A 2J9MA 3ZZWA 2BFYA 3BI6A 5DA3A 3UNZA 3W2CA 4JIKA 2JKMA 1O6YA 2HXQA 4QMSA 2RG6A 4UB7A 3R8PA 5I9UA 3ZLWA 1OIUA 2Z60A 1BMKA 3QRIA 1KOAA 4I6FA 4AFJA 4EJNA 3UZPA 4ZJVA 4Z9LA 5E8TA 1U4DA 2IJMA 3ACJA 5D12A 3KMUA 2PY3A 1IG1A 3AT3A 4WKQA 1WMKA 1URWA 5ACBC 3TI1A 4ZLOA 4IX3A 4ALVA 2ITQA 2OW3A 3Q6UA 3QTZA 3KMWA 3KRJA 3QTUA 3FL4A 4USFA 3LFQA 4NT4A 3RPVA 2WTWA 4DFXE 3BQCA 2J6MA 3L8VA 2CN8A 2NRUA 3R6XA 4B8MA 4J8MA 4CZYB 1ZYSA 4ZSAA 2A1AB 2X6EA 3GENA 4UBAA 2OJFE 4NKSA 4WSYA 1U59A 3ULZA 4JOAA 3MIAA 3THBA 3LVPA 3QCYA 3ZONA 4IB0A 3FC2A 3KQ7A 3BLQA 2BMCA 4D0WA 2VTQA 2BHEA 3FE3A 5M4CA 2PVRA 3RJCA 2B9JA 5FDXA 3VQHA 3EQGA 5DMZA 3LXNA 1UVRA 3UYSA 5HESA 1IA8A 4QQJA 3GFEA 3NDMA 5FEEA 3FSFA 1P4FA 4LRJA 4MVFA 4GIIA 3TV7A 2XBAA 3ZSHA 2P2IA 2BFXA 5DVRA 4RVMA 3OROA 4ZLYA 5CQWA 2UW6A 5BVOA 4PMMA 4CNHA 1ATPE 4WT6A 4ASXA 1WCCA 3RP9A 4U40A 1B39A 4IDTA 3AMYA 3HKOA 5A4LA 4NFMA 1BI7A 4QTCA 2R3OA 3IW4A 4FV2A 3OZ6A 4J99A 3PPKA 4G17A 5AUVA 3MB7A 3C13A 4O1OA 5J7BA 3VJOA 5HIDA 4W9WA 3QQGA 2R3IA 3FQEA 3TN8A 2CGVA 2W0JA 2XIYA 1YXSA 4FTNA 3GCQA 1CSNA 3QHRA 3SXRA 4ZEGA 2WTIA 4BIBA 4C37A 2PL0A 1W84A 4ANOA 3HGKA 4DFNA 1H25A 3LJ2A 3ULIA 4IVDA 1WBNA 3MY0A 2ITXA 3UMXA 3EL7A 3IDBA 4A4XA 3TL8A 3E8CA 4XG3A 4H3QA 3ETAA 4GW8A 2XIXA 4QRCA 3BU6A 3R9DA 3UOKA 1BI8A 5AR4A 3AXWA 3F5XA 5BQ0A 3OVVA 1XH6A 1V0PA 4PUZA 4PDSA 3R8ZA 4WG5A 2YN8A 3WF7A 3UVRA 3DK3A 4RQVA 4FIFA 3PTGA 4QNYA 3IW5A 4BZOA 4M68A 4ENYA 2CHLA 5CI7A 3IW6A 3IG7A 4YSJA 5GJFA 2JDTA 3LE6A 1HOWA 5AADA 3EQRA 4L7FA 3BYOA 3CTQA 4QTBA 2PSQA 4EKKA 3ENHA 5CEQA 3R1NA 4O0SA 5K0XA 1K2PA 4IVCA 1FOTA 2ONLC 3RNIA 4FL2A 3RWPA 1PHKA 4FV6A 4MNEA 4NK9A 4E20A 4YJSA 3EFKA 3D0EA 1ZOEA 1RDQE 1ZY4A 5J95A 4JBOA 4XV1A 3OF0A 4ALUA 2F7XE 3VIDA 4G31A 3VF9A 1JLUE 3PSBA 4E6DA 2WZJA 2XA4A 3AQVA 3JY9A 2YAAA 4UN0C 4EYMA 4L45A 3KF4A 3MTLA 3E93A 1TQMA 1H1QA 2G2FA 4CZUA 3F69A 5K4JA 4HGTA 2OFVA 2P55A 4U7ZA 5FEDA 4M14A 4MXYA 3KCFA 4RIXB 3VUKA 4ZXTA 3QU0A 4CEGA 3MGYA 4TYHA 4XP2A 2WIPA 4FTJA 4FTMA 4DFYA 5A4CA 5A3XA 2YDIA 5CVFA 1WBOA 2OGVA 1MQBA 3NUSA 4FTTA 4IBMA 1Q8ZA 3M2WA 1SZMA 4FKPA 5ANGA 5FBOA 3T3UA 3A7JA 3D5XA 2QO9A 3R1YA 3C51A 4M69B 5CANA 3CTHA 5HG8A 2Y7JA 4RPVA 4ZLZA 3OUKA 4XYFA 4APPA 5IA3A 3R7IA 4I92A 4R7HA 3COKA 3ORZA 5EK7A 4TW9A 4WG4A 3G9NA 2I0HA 1FMOE 4X7QA 4Z7GA 3ZXTA 1S9IA 3R9NA 4OTPA 4DG0E 2W05A 2ITWA 2Z7QA 1YWRA 3HP2A 1SYKA 1V0BA 1ZYLA 4MX9A 3RI1A 3V6SA 3V8SA 2GS6A 1VEBA 3U6IA 2GFCA 3LFAA 3HV3A 3WIGA 4RWKA 5IA0A 4M3QA 3MH3A 4F7NA 1SVGA 3PXKA 4I20A 3L8PA 3OOMA 3DBQA 4JDKA 5DPVA 4ZTLA 1RQQA 2LAVA 5HLWA 5CNNA 4WSQA 1WBPA 3Q52A 5CQUA 2PZRA 2QOIA 4FSWA 4UWCA 4V05A 3KK8A 3O96A 3QX2A 2R0UA 4BKZA 4CVAA 5EHYA 3NYXA 4ZSGA 4FK3A 5DRDA 3QXOA 2C68A 5E91A 4IADA 2QU5A 2ZDUA 4HCUA 3FZRA 3RINA 2C0IA 3Q4TA 1H08A 3D7ZA 2XJ2A 1DAYA 4LV5A 4JDIA 3LQ5A 4JBPA 3NAYA 2R3HA 3OBJA 3ORLA 2BPMA 3VWAA 1OKZA 4ASEA 4EOPA 5CEIA 4QPMA 4BHNA 4ZZNA 4I3ZA 3C4XA 4P5ZA 2A19B 3NS9A 4RA5A 2PVHA 2X9EA 4O1PA 3IOKA 4I6QA 4QP4A 2PE0A 2VX3A 3L9NA 3O7LD 4KINA 4ASZA 4U45A 5CU6A 5DBXA 3V5PA 3PIZA 4BBFA 4EOLA 3C4ZA 1JWHA 3DS6A 3WF6A 5LVNA 2XK9A 2R4BA 2E9OA 4E5AX 1ZLTA 2I0YA 3MJ1A 4RIYA 3DB6A 1Y8GA 4O22A 4X6QC 4PMTA 4AZTA 5J5SA 4F1TA 3JPVA 1TKIA 1U46A 3QGYA 4EI4A 4AX8A 5HD7A 5HLPA 1ZY5A 4AA5A 5I5ZA 5A14A 2FH9A 3U8WA 3HDMA 4YO6A 4EYJA 1TQPA 3H0ZA 2UZWE 1H26A 3KU2A 4C4GA 2PMNX 3FXXA 3HUCA 2VN9A 5HNGA 4NTTA 5CENA 4UXLA 5KMMA 4UX9A 3V3VA 3DU8A 5A54A 5B7VA 3EMGA 5FTOA 4IM3A 2PVFA 4A9RA 5AM7A 4CFNA 1XBCA 4DBNA 4DGOA 4X3FB 3BGPA 3K3IA 5HHWA 2IVUA 3Q04A 2OICA 3GCVA 3UYTA 4OW8A 3EFLA 5FRIA 5J1VA 5D7VA 3T9TA 3VBXA 1Q8UA 2YM3A 3ANRA 1CKJA 1YDRE 2NRYA 2GTNA 2YJSA 3I4BA 3I5NA 4G3EA 4JX3A 5DHJA 1YOJA 5CSWA 5AR2A 1OUKA 3VNTA 5AM6A 4IFGA 4CV8A 3DOGA 3LXLA 2BTRA 5FTQA 3SKCA 2W1ZA 1NVQA 4BYJA 5EDQA 2W9FB 2X0GA 4C2VA 3GU7A 4E8AA 4EZ5A 2VTJA 1W8CA 4J53A 4OTFA 4X2JA 4OBPA 2UZBA 2VGPA 3A99A 5FLFA 4FV9A 1PYEA 3SW4A 5T6KA 3QA0A 4C3PA 4DG3E 4EONA 5ACKA 4I0RA 3A62A 5C1QB 4G6LA 2RSVA 2PZ5A 4BRXA 5G1XA 4GT5A 4H3PA 4E4XA 2OIQA 2UW5A 4ANNA 1J3HA 2XBJA 3L8XA 5AUZA 4EH6A 4KIPA 3T9IA 1PMUA 2J0JA 2G01A 4QTEA 5BUEA 3ZZEA 2W1GA 4JNWA 4BB4A 5HOAA 4D4RA 2VGOA 3O8UA 5E1SA 2PVYA 4RVLA 2VTMA 2QC6A 2EXEA 3O2MA 2ZV7A 4MWIA 3U6HA 3D9VA 3FLYA 4Y83A 1KV2A 3RPYA 3H10A 1YDSE 4J8NA 5IKWA 5E8YA 5EDRA 2QQ7A 3WI6A 3HV5A 4ZTSA 2JDVA 4FSUA 1BLXA 5DN3A 3AGMA 5C27A 4AN2A 1H0VA 1UWJA 5BVNA 3DQWA 2CGWA 2EB2A 3KN5A 3R63A 5ETAA 4Z3VA 4MH7A 1Q4LA 1JKKA 4RIXA 3VBVA 3DZOA 4NJ3A 4AN3A 4FT7A 3A4PA 5E8XA 4FYOA 2XMYA 3POOA 2BALA 4XV9A 4XG6A 4V04A 5TT7A 3RPSA 3SX9A 4BF2A 4RWIA 2R0IA 1JSUA 5I9YA 2PK9A 5FXRA 1JVPP 2OBJA 3ZEPA 4DG2E 3UNJA 5JEBA 2X8DA 4DEDA 1JOWB 2VTLA 3CD3A 3FC1X 4G3CA 4M69A 5AIRA 3WF5A 5IA1A 1UA2A 4J52A 5CF6A 2KULA 4I5MA 3ZO2A 4ACDA 4MD7E 4YMJA 2NP8A 3O51A 4EZ7A 2OJGA 2CJMA 2WB8A 1ZAOA 3LM0A 2I6LA 3ZLSA 4JLCA 4EEVA 5DE2A 2VWBA 3FLQA 4ZTMA 5L2QA 5K4IA 5CU2A 1ZYDA 3WILA 4CKIA 4YHTA 1OKYA 3QALE 5HVJA 2X4FA 4FZ6A 4CT1A 5KMKA 3IW7A 4JAJA 4F0GA 2QD9A 3FY0A 2ZMDA 4KA3A 5KO1A 3KXNA 4XLIA 4FICA 2O3PA 1KE6A 3W55A 3EB0A 2UZTA 3BBTB 4JQEA 3R8VA 1JKTA 5EFQA 4FV1A 2VTAA 4G5JA 2QOOA 1NVRA 2FUMA 2WIHA 4Q9ZA 2V55A 3QFVA 2QO7A 5HD4A 3GU6A 2WNTA 1Q41A 3G9LX 4FT3A 3UIBA 4LM5A 4C4EA 3MY1A 2BRHA 1JAMA 2WTVA 4E6CA 3BU3A 3R7OA 2FO0A 3E7VA 3VS7A 4QQ5A 4LGGA 5HE0A 5BUIA 5F94A 4NCTA 4A9YA 1YHWA 4RC4A 5EM8A 1MP8A 1MRUA 5I9VA 2R3LA 2E9PA 3HLLA 3MH0A 3NYNA 3AC5A 4QMWA 4BC6A 4MBLA 4FKSA 3BE2A 4I24A 4IQ6A 3RAKA 4F08A 2VX0A 4FV0A 3ZFXA 2YACA 2WTKC 4JRVA 4QP7A 3F61A 4GVJA 4RVKA 3HMNA 1Y8YA 3TNHA 1ZARA 4E6QA 4LOQA 4MAOA 5KHXA 2X8EA 4S34A 4AA0A 2GNHA 4KIOA 4BFMA 3P4KA 4FKVA 5HKMA 3AOXA 2WMSA 5AP7A 3T3VA 3Q2MA 4DGMA 4E1ZA 1OKVA 4F9WA 1MRVA 2IWIA 2XYNA 3R1SA 4O38A 3ROCA 4ASDA 4G9CA 4PV0A 4BDGA 4DINA 5CF4A 3ZFMA 1MQ4A 1M14A 2BTSA 3I60A 5HVYA 2G1TA 5LMBA 3W32A 3KL8A 3Q9WA 3QLFA 4X2FA 2QHNA 3OCGA 1PXOA 2XK4A 3LIJA 3PJ2A 4GL9A 3L8SA 3AMAA 1GNGA 3LFEA 3PWYA 3ZRLA 3QTQA 4A07A 3KK9A 3MBLA 3QD3A 3Q9XA 4NH1A 1M52A 2DYLA 5F1ZA 1FVTA 5JRSA 3PZEA 5HICA 4AGCA 4BCGA 2YDKA 3FYJX 4BCOA 4FSRA 5M44A 4QP8A 2Y4PA 4EBWA 3T8OA 4P90A 3QL8A 2PE1A 4EH4A 2XS0A 1G3NA 3NSZA 4KABA 4A4LA 3LFCA 3G0FA 3A4OX 1QCFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 3KRX A;  4TYH B;  5KUP A;  5CWZ A;  5FM2 A;  4FUX A;  4CV9 A;  2WU6 A;  3Q5I A;  3GUB A;  3VW6 A;  4YU2 A;  3KN6 A;  5GJD A;  3UTO A;  3CKW A;  3PA3 A;  2C6I A;  4HNI A;  3EQB A;  4QP9 A;  2I0E A;  2RFD A;  4YLK A;  5E8U A;  3ROY A;  4NCT C;  3FKO A;  4RT7 A;  4H3B A;  1ZOH A;  2R3M A;  1DS5 A;  2XIK A;  3EQI A;  4KB8 A;  4DAW A;  1H8F A;  5C8N A;  4JQ7 A;  2VWZ A;  2CCH A;  5DNR A;  5IU2 A;  5IG1 A;  1PF8 A;  3PVU A;  3IK3 A;  5D11 A;  5C9C A;  5FP5 A;  1U5R A;  4BI2 A;  2GSF A;  5H2U A;  4ANQ A;  1KV1 A;  5HO7 A;  2JIT A;  2XZS A;  3JY0 A;  4EUT A;  4GJ3 A;  4MK0 A;  5FBN C;  5BX0 A;  4ZZO A;  5JFX A;  4PDO A;  3R1Q A;  1Z57 A;  3MVH A;  5DLS A;  3RHK A;  2ITY A;  3EWH A;  3FAA A;  5AV0 A;  4JQ8 A;  2J9M A;  3ZZW A;  2BFY A;  3BI6 A;  5DA3 A;  3UNZ A;  3W2C A;  4JIK A;  2JKM A;  1O6Y A;  2HXQ A;  4QMS A;  2RG6 A;  4UB7 A;  3R8P A;  5I9U A;  3ZLW A;  1OIU A;  2Z60 A;  1BMK A;  3QRI A;  1KOA A;  4I6F A;  4AFJ A;  4EJN A;  3UZP A;  4ZJV A;  4Z9L A;  5E8T A;  1U4D A;  2IJM A;  3ACJ A;  5D12 A; 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