1A24A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, family of 20 structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a24A00
2C0EA 5CYYA 3GA4A 4Q5QA 4GTUA 4GSNA 3ZLPA 2HI7A 3ZITA 4IJ3A 3FKFA 3TJFA 3E9JB 4O32A 2PU9C 4OFTA 2VCVA 4O7HA 3LWAA 1F3BA 2KLXA 1ZZYA 1B9XC 2V32A 1GP1A 2PBJA 1OC9A 2H1DA 4JE1A 4NPBA 1PX7A 2H72A 4ECCA 4F82A 6GSVA 5D96A 4LA1A 3VI7A 4NMUA 4N10A 3IV4A 3QFAC 1FHEA 4KH7A 1RQMA 5ECNB 1EGOA 3FY7A 2WULA 1TRUA 3FR3A 3IA1A 1Z9HA 3GMFA 3H4KA 1XWKA 4IS0A 3GN3A 2GTUA 4ZBBA 2AB6A 1TK0B 4PNGA 3UARA 5HFIA 1DE2A 4ECIA 1EOGA 3VFIA 2B1LA 1WIKA 2CV4A 3QAWA 4KA0A 1GLQA 1YF0A 2PN8A 4EL1A 3C8EA 1EV9A 5ECKB 16GSA 3HHVA 1EEMA 3ZFBA 1R4WA 1SJZA 5ID2B 5LNKe 1PN9A 2AHEA 3FHKA 1WJKA 4CHSA 1GTAA 1J0FA 2IMKA 1A2LA 1X5CA 2JZSA 4HDEA 3DVXA 2YV7A 2FA4A 2YN1A 3GTUA 3LSZA 4L5LA 4TR1B 4ZBDA 1ZCPA 3PGTA 1M2BA 1VF3A 1SK1A 1ACVA 3MDKA 2LRTA 2C0FA 3FYGA 2YJ7A 1AQWA 1DSBA 3A2WA 3EURA 4XIHA 4I97A 1K0CA 1OVNA 3QPMA 1U3IA 3CXGA 3E3EA 3L0HA 3ME8A 2B3SA 4KW6A 2M46A 1HD2A 2FD3A 4KSMA 1U3AA 4MLYA 4FO5A 5COHA 1Z7RA 3US3A 1OE8A 1V98A 2GS3A 1XZOA 1LBKA 4Q5NA 2YPMA 1GUMA 3GSSA 3HZ4A 5CO3A 2H0HA 2LNSA 3TKRA 2H1BA 2HNLA 2X8HA 1DUGA 1ERVA 3IAM2 2GQMA 2HZFA 1H4OA 4HQSA 2DJ1A 1XIYA 20GSA 2H73A 2VCZA 1ZGNA 2IMDA 2OA7A 1VGLA 4V2MA 5C04A 1MEKA 5FT3A 3HVSA 1GSUA 4JR4A 4POBA 4HS1A 5D73A 5G5FA 5IPHA 2HZEA 5G5EA 3P90A 4ZB6A 3HDCA 2H8LA 1WOUA 3KP9A 3HKRA 4XHMA 2PWJA 2JZTA 5JWQB 18GSA 3U6VA 2J23A 4MF5A 2F3MA 2B1KA 1O85A 2A2RA 2LRNA 3DMLA 3GX0A 6GSUA 4EDYA 5H5QA 3G7YA 2M80A 1ML6A 3GNJA 3QR6A 3UVTA 3GKXA 4KGIA 1LJRA 1AW9A 3WYWA 1BJXA 3TRXA 4YH2A 2QKEA 2V41A 5D93A 4IN0A 3EE2A 2GT6A 4IQAA 4HQZA 2EIRA 4MP4A 2VL2A 4NHZA 2DC5A 2L4CA 4ML1A 3GKKA 5A4VA 1O8WA 1VRSD 3EC3A 4OO5A 4K7OA 1K3YA 1MD4A 2HXKA 3NZNA 4XTSA 3QAGA 5CRWA 3WGEA 4EC0A 1W89A 2OBIA 4OCFA 3IK7A 1KBNA 2GQKA 4HJ2A 2NBSA 2MZCA 4PXOA 1U87A 1A24A 3GYKA 2YWMA 2GZZA 1K3OA 2K8SA 1BG5A 4PQIA 5CP1A 1WRYA 1TW9A 2YWNA 2L4QA 3DYRA 1X0RA 4IP1A 2LNTA 4L0WA 3NOFA 4OO4A 5J4UA 3QOUA 1PKWA 1EEJA 2H0GA 3MSZA 2H71A 3PH9A 3H8QA 2ZNMA 1F6MC 1SK0A 2FNOA 3IC4A 3HY2A 1JZDA 2C3NA 1PL1A 3HVVA 4K7IA 2LJRA 4HOJA 1Q98A 4JEDA 4I2TA 4QL9A 4OFNA 1WMJA 2E0QA 2PERA 2TRXA 3FRCA 2PVQA 5F8BA 2E2MA 3LQ7A 4BVXA 4NXIA 2H6ZA 2Z9SA 2VLTA 3R2QA 3ZVJA 3P2AA 3ZIVA 3KTBA 3VWUA 1OC8A 3VPQA 5DALB 4GXZA 2AYTA 1YQ1A 1GSFA 4IHUA 2K6VA 1Z6NA 2L5OA 4CDOA 2NTOA 1KNGA 3APQA 2P5RA 2KOKA 2LKUA 3TUEA 4NV5A 3L9SA 1SENA 1Y6EA 2HE3A 3F9UA 4MZWA 1XVWA 4YQMA 4KDYA 1PX6A 4PQ1A 3BD2A 5FHIA 2RUEA 4XCSA 2H75A 1TTZA 4DSSA 3F4TA 3UL3A 3K8NA 3L9VA 2RLIA 5F05A 3GX8A 4HU9A 3FK8A 4GSSA 2GGTA 4TOPA 3I69A 5ECSA 4MDCA 5ELGA 1DBYA 4BWQA 1XXUA 4EDZA 1GSQA 1BX9A 1R26A 4POMA 4O92A 2V6OA 1B48A 1GLPA 2CZ3A 3D6IA 5HR0A 2J9HA 4XS1A 4MA9A 2IN3A 3F3QA 4K0NA 2H30A 4OWYA 5AGYA 2KHPA 3IOSA 4IQ1A 1AQVA 1XWAA 1THOA 3JCML 3IPZA 4TRXA 1GSYA 4KE3A 2V2GA 4Q5FA 1BAYA 4RUVA 2N5BA 4ZILA 4YQVA 2VO4A 4F03A 4K7NA 2B5XA 4FIWA 1OKTA 5ECLB 4ZL8A 1FW1A 5ECOB 3C7MA 4V1Ag 2IFQA 2CAIA 1N8JA 3PR8A 5DAKA 4NHWA 2YNXA 1O7UA 2P31A 5HFKA 2B5YA 1TU8A 5KN2A 2EIOA 3LORA 2C8UA 3ERFA 4MJBA 5E4WA 1SJ6A 3L9UA 4JR6A 2XPEA 3DD3A 3SBCA 1S3CA 3M9JA 1BYEA 2TRCP 5L71A 2LQOA 3KM6A 3HD5A 4K8MA 3OR5A 2IMIA 4WBJA 2DJJA 4MH2A 1ERUA 4TR4A 3G9BA 1B4PA 1FVKA 1Y25A 5IPGA 7GSSA 1XOBA 2H70A 2I81A 2MYGA 1XWBA 3KEBA 3GV1A 1GTIA 2B6MA 4DVCA 4OCEA 4ZB8A 3SWLA 3CTFA 2L6DA 2AV4A 4I5QA 4TXOA 1S3AA 2I3YA 2L5LA 1M2AA 1ZL9A 4RQXA 2CZ2A 2PVOC 3HVXA 2LEGA 1B8XA 1TU7A 2JADA 1XWGA 4ZIJA 1TJDA 4MCUA 1RK4A 1UN2A 1QK8A 2CVDA 2H6XA 3A5WA 3D0ZA 2FLSA 3HYPA 1OC3A 2DJKA 5IQYA 4PGTA 4L0UA 2M72A 2IPAA 1Z7PA 2DLXA 1O73A 4ECJA 1URMA 3A2VA 3FZ4A 1GNEA 3WT2A 3ZL5A 4GF0A 1B9YC 3LG6A 1OYJA 1QGVA 4IELA 5G1KA 5D9TA 3WT1A 1NM3A 4D73A 3L4NA 5HFGA 2B5EA 5HR3A 1SK2A 4MJCA 3LJRA 1GTUA 3A2XA 2VM2A 2PGTA 2NPBA 4YQUA 4IKHA 1TK8B 5ECIB 1GL8A 3M0FA 2FWEA 1ZMAA 2OACA 4GRFA 2OE3A 2IJYA 4QQ7A 3TB2A 2RM6A 4N0VA 1BQ7A 2I1UA 5A4WA 3LGCA 2LS5A 3GSTA 1PQNA 1O6JA 1V57A 2G0FA 4OFMA 2HFDA 1YF1A 2FHEA 2L59A 4TKYA 1E2YA 4L8EA 5EPFA 2I4AA 1A8YA 1SJIA 4F0BA 3H79A 2K9FA 4XS4A 1Z6MA 4ILFA 2E2GA 4JU5A 2JSZA 2LQQA 1XW6A 3Q74A 5DJLA 3KGKA 3GTUB 4V2NA 5FWGA 1KEBA 4ZL7A 3KH7A 1SD8A 4N0ZA 2NVLA 4FYCA 2YV9A 3QMXA 2R6KA 1UA5A 4MJEA 2AJQB 5CRGA 1YDKA 2L57A 3EU4A 3CSJA 3GFKA 4XRDA 3VWVA 3DKSA 3ZMLA 3DRNA 3HJPA 3EWLA 1M9BA 22GSA 1IYIA 5J3RA 5IMDA 1N2AA 5GSSA 4V1Ap 2E7PA 1VF4A 3DGQA 1QFNA 4YAVA 2HSYA 2CT6A 1FO5A 3I43A 4N30A 2CX4A 3C1RA 2H0IA 3WD6A 4HU7A 5CRHA 5G1LA 2F8AA 3FR9A 2REMA 1NHOA 3BJ5A 3C73A 3F6FA 3DWVA 2C3QA 4ID0A 19GSA 2VL2C 3UVHA 3M8NA 5KN0A 2HRNA 2X8GA 3DEXA 4KAEA 2OE0A 5DQYA 1UVZA 4HZ4A 1AUCA 5J5NA 3AY8A 1KTEA 3UBKA 3F6DA 3ZMKA 2JSYA 3ED3A 3ZIJA 4HUAA 3DXBA 4TXVA 1PKZA 3TOTA 12GSA 4KUNA 1GUKA 1GSDA 4MF6A 2HZEB 3HA9A 3KJYA 4ZXGA 2F8FA 3ZREA 5AN1A 6GSYA 1V40A 1EZKA 2QSIA 2DIYA 3KMNA 3E0UA 3F8UA 1M2DA 2GLRA 2PPTA 4GLTA 1SD9A 2IWTA 3CMIA 1QXHA 1OAZA 2H1GA 1XVQA 1JZWA 2C80A 3KTLA 2C4JA 4WXTA 2CA8A 1YKCA 2JZRA 2YCDA 2LV3A 2K18A 1F37A 3TGZA 1FAAA 1W4VA 3TJJA 3CTGA 4MF7A 2C1YA 3EU3A 4K2DA 11GSA 3VWXA 1PRXA 5ABRA 2XPDA 5B6MA 1X9WB 5HR1A 1V2AA 2WCIA 2WRTA 2WZ9A 1M7TA 2O89A 3ERWA 3KZQA 5DDLA 2LRCA 3ZVJD 3H1NA 3CRTA 4X0XA 5IMFA 1TK5B 1XBSA 4POLA 4IGJA 3RAZA 3EVIA 3TOUA 2RM5A 3LFLA 5D9WA 2GDRA 3GKMA 4AGSA 2DSAA 2GT5A 4XRAA 4WR4A 13GSA 2C0DA 2WFCA 4MJAA 3LEFA 1WWJA 3CSHA 3F4RA 3KD0A 3L78A 3QCPA 1XW9A 2C0GA 5GAPD 1U88A 2MBTA 1JLWA 4EKZA 3EINA 3MAKA 3Q19A 5G2ZA 5HQPA 1K3LA 2WGRA 1EOHA 2VD0A 2YJHA 4RI7A 4MH3A 5GZZB 1YY7A 2AUVA 3H93A 3BCIA 3A3TA 2H74A 1R5PA 4JRRA 2N5AA 2R5GA 3ME7A 1CQHA 3HXSA 4ZL9A 2VCWA 1USBA 2HSHA 1PD21 2DJ3A 3N5OA 1T4ZA 3KIJA 4G2EA 3M1GA 1ON4A 1NHYA 1A2MA 2V6KA 5EY6A 3IDVA 2CVKA 3VPTA 3TKSA 4TR0A 1SYXA 3FZAA 2A2SA 3FW2A 5JWRB 2OJLA 2AAWA 1ILOA 4IBPA 3IHQA 1EV4A 1LU4A 4DSSB 2YZHA 1JHBA 1XW5A 2RIIA 4K6XA 4GWRA 4KB3A 2MMOA 3LXZA 2B7KA 3VLNA 3N9JA 1U6TA 4X1UA 1T8EB 1SKRB 3DIEA 4ML6A 1SL2B 4GCIA 4WKWA 1YKAA 6GSWA 4PUAA 2HT9A 3Q18A 1TRSA 1A8LA 1R7HA 4F0CA 1K0MA 2GZYA 3LYPA 4PURA 3APSA 1FB6A 1SL0B 5H5SA 4HZ2A 1MTCA 2VUPA 3MWHA 3J7Yk 1A0FA 1SU9A 3UOMA 1NW2A 2LSTA 4WBRD 1X5EA 3QAVA 1TI3A 1GSEA 3GL5A 4DSRA 5DAKB 3UMAA 4PUFC 4KX4A 3I9V2 4G19A 2CX3A 2MMZA 3IBHA 2VD1A 2LJKA 5CREA 3F0IA 2O85A 5GAND 2YZUA 3RBTA 4G9HA 3VURA 5ECHB 1V58A 5IOWA 3TJBA 1GRXA 4WF5A 3TKPA 1QUWA 3HJOA 3CBUA 2IMEA 1G0TA 3F3RA 1C72A 9GSSA 1J9BA 2FGXA 4WETA 3FEUA 3EMXA 3I6AA 4BL7A 4KDUA 4NWYA 5G31A 1Q4JA 4HI7A 1SKWB 4WEYA 4J2FA 4TXOB 1THXA 3J7Yb 1K0AA 2HRFA 2EC4A 1NSWA 2GVPA 3UBLA 4L5OA 4PX1A 1ST9A 5ECPB 1GTBA 4LL4B 4XS6A 3CYNA 3U5RE 2RUFA 3TCOA 5B6NA 1FOVA 1PSQA 1TOFA 2CQ9A 1OC9B 5DBQA 5D9VA 5EL8A 2FWGA 3D21A 1E6BA 2PMTA 4EVMA 3TDGA 4AJ6A 1GH2A 5DQSA 3GUSA 4K0GA 17GSA 2NDOA 2A4VA 1YEXA 4Z7XA 3HJMA 2LUSA 1M0UA 4KNDA 3KH9A 3G7JA 2OKAA 3P7XA 5IMZA 1O8XA 2DBCA 1X9MB 4RQRA 1WP0A 1T3BA 1Z3EA 2ON5A 1G6WA 3IR4A 3V1WA 1TI1A 4HJMA 4D73B 4RI6A 1G7OA 2BTOT 4K9ZA 4MMMA 1HNBA 3KCMA 4I6XA 1H75A 5KN1A 5D9XA 2DJ2A 1FB0A 10GSA 4OMVA 1YEPA 1IYHA 4EUYA 3HCZA 2VCQA 1FVJA 1PA3A 4FH8A 5AIVA 4Q5RA 14GSA 1TP9A 2VCTA 1YJ6A 1XPVA 3CSIA 1G6YA 3PINA 1M9AA 4ACSA 5ID2A 5LD0A 1F9MA 2FUG2 1B4QA 3F4SA 3UJ1A 4TN8A 1I5GA 3ERGA 3S9FA 2MMNA 1Z5YE 1EP7A 5DJMA 6GSTA 4IJIA 4XS4B 4OD7A 3WGDA 3UEMA 4TR1A 1JLVA 3QFBC 1XOAA 4BPYA 1S3DA 1JZOA 3DVWA 2JL4A 2VCXA 5E59A 1BEDA 3TKQA 5JCWA 3GIXA 5LCZA 5AIXA 2ALBA 2WJUA 6GSXA 5G30A 4GSTA 2H76A 3KMOA 5F0GA 2ZUPA 1K0OA 2N5FA 4G10A 3KXOA 1F3AA 3EMPA 4KDXA 2O7KA 5IOXA 4PNFA 3D4TA 2OE1A 5B7CA 4CW9A 2CVBA 3LYKA 1ZYEA 2ES7A 2VM1A 3TKSE 2WDUA 4N11A 5AISA 1OKDA 2EIQA 6GSSA 4TW5A 4TVEA 2V1MA 3BBYA 1PMTA 2GQLA 4GQFA 4EF0A 2GSRA 2TIRA 3IXRA 4NV2A 4QL7A 3P8WA 5CNWA 3BCKA 5J41A 2YWOA 3NIVA 1WE0A 2K8VA 4EXJA 4KSOA 2O8VB 1GULA 8GSSA 1K0BA 1PGTA 5A4UA 2XHFA 5GSTA 3M9KA 3QD9A 3IE3A 1ABAA 4DEJA 2X64A 1GNWA 4I2UA 1VF1A 4WF4A 3Q6OA 4BVYA 5IIZA 1GUHA 1CQGA 2D2ZA 3UAPA 2FCHA 2VL9A 2R2JA 3GURA 2H6YA 1X9SB 1HYUA 2HLSA 1ERTA 2G2QA 1JFUA 4E8EA 2MMAA 4EO3A 4F2IA 2R37A 3KP8A 4FYUA 4NAXA 4BA7A 4ECBA 3W8JA 2CAQA 4EE0A 1YZXA 5ECRB 2DMLA 3W6GA 1TRVA 5J9BA 3ZFLA 5J9CA 2BJXA 1PL2A 1X5DA 2WB9A 1GWCA 4MPGA 3VWWA 5JCGA 2H01A 5ELAA 4AJ8A 5KEJA 2ON7A 4LLRA 5DCHA 1M99A 2KP1A 5C00A 3TRPA 3VK9A 3GH9A 1T7PB 4FYBA 2GSQA 4JZQA 2MBSA 4KCAA 2KP2A 3LXTA 4MPFA 3D5JA 4F9ZA 1QMVA 1MDJA 2FWFA 3TRQA 4MK3A 1ZYQB 1EP8A 3D4MA 1F2EA 3W8SA 3RPNA 3ZYWA 2O87A 1QQ2A 2C3TA 2L6CA 4X43A 4H86A 4POKA 1ZOFA 2XBQA 4I8BA 3G7IA 3GRXA 1OE7A 3RHBA 2HYXA 5DCGA 3RHCA 3TKSC 2H19A 4LMWA 2P0GA 5IO0A 3GHAA 2YWIA 1AC1A 3FR6A 4ULXA 2BMXA 1XCCA 4BWSA 3HZ8A 1DE1A 2QGVA 4TR3A 1AXDA 4LL1B 2VLVA 2OADA 3F63A 3ZZXA 1AQXA 1T1VA 3TJGA 3IK9A 1J08A 1T4YA 5DALA 2XC2A 1T00A 4J57E 4LMVA 3ZTLA 2GSTA 1V9WA 5HR2A 5JWOB 5H5RA 4IVFA 1HQOA 4KCEA 2X8CA 3CRUA 4AJ7A 2VAFA 2GZPA 5INYA 1ERWA 3C71A 1SKSB 5KN3A 1AIUA 2H1AA 3IAS2 2F51A 4ISDA 1JZRA 4O5RA 1EGRA 2LJAA 1A23A 4WR5A 2R3XA 5EVOA 1WPIA 5D8IA 5A5KA 1TDIA 1TXXA 3EYTA 5CRDA 2YANA 1VF2A 2VLUA 2F9SA 5B8AA 4HEA2 1SL1B 1MDIA 3C1SA 2ZCTA 4MZCA 3O3TA 2WS2A 4AF2A 1HNCA 2OBKA 5IMAA 2VOCA 5ECQB 5DVBA 1G7EA 2X99A 3O76A 1I9DA 5IMCA 1R5AA 3O6TA 3VI5A 3ISOA 1SYRA 2YP6A 3ZRDA 3GH6A 2R4VA 5JCUA 4ZBAA 2FWHA 4ZB9A 1UC7A 2JU5A 2I9HA 1K0DA 1RW1A 2P5QA 4E8HA 2IL3A 4MZBA 2IIYA 3TJKA 1HNAA 4PQHA 2VL3A 1AAZA 3D22A 3APOA 3FZ5A 4P3YB 2XBIA 4J56E 2H66A 2IMFA 2PUKC 2IFQB 5ECMB 5IMVA 2LTKA 2FA8A 2KUCA 3UIWA 5IM9A 1A2JA 2YOIA 5B8BA 5F06A 3RDWA 1A0RP 3RPPA 4IW9A 1GSSA 2B7JA 5IO2A 1MDKA 2VIMA 5CAXA 2JACA 1O81A 4IP6A 5F07A 1EWXA 4YAPA 3QDNA 3GKNA 3GL3A 3BOAA 3M3MA 3IRAA 4GQCA 4K1FA 2GSSA 2FY6A 2QC7A 3MNGA 2DIZA 4DSQA 1XWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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