1A24A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, family of 20 structures
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a24A00
3HDCA 1A8YA 3ZTLA 4PURA 1A0FA 3IA1A 1DUGA 2X8CA 2YOIA 3KXOA 1AC1A 5B6MA 3P90A 1ILOA 2B7KA 1M0UA 2NPBA 1ZGNA 5ID2B 2XHFA 5JWQB 1X9SB 1GL8A 1ML6A 3RAZA 1VF4A 5CNWA 2LJAA 3EU3A 1HNBA 4EC0A 5IPGA 2L57A 4EKZA 5G31A 2MMAA 3DYRA 2PU9C 1TOFA 1U3AA 2E7PA 3HJOA 3GSTA 4IVFA 3PR8A 1GUMA 2CVDA 4POLA 4G9HA 3BCKA 4N10A 4ISDA 2JSZA 1GTUA 2PUKC 4Q5RA 3I6AA 2JU5A 4XRAA 1JLVA 3EINA 4EDZA 4HOJA 3S9FA 4GF0A 1TRWA 2XPDA 3HHVA 4JBBA 2LTKA 2XBQA 2K9FA 2NDOA 3M1GA 3FR6A 2BMXA 4Z7XA 1SKRB 2G0FA 1Z7PA 5B8AA 2V6OA 2FY6A 2H6XA 3L4NA 1T00A 4HUAA 3P2AA 1ZCPA 3DMLA 4IN0A 2QKEA 2RIIA 5LD0A 4ECIA 4EXJA 4ZXGA 4EVMA 1YKCA 2HRNA 1PQNA 2H72A 4EE0A 5ELAA 2OE0A 1AUCA 4ML6A 4EF0A 4MJEA 2GSTA 4HU9A 1T4ZA 2ON5A 4PX1A 2JACA 4BA7A 3GHAA 3OR5A 2LRNA 3H1NA 2CVKA 1TI1A 4WF4A 3BCIA 3H4KA 5DVBA 1SU9A 5A5KA 3GFKA 4K9ZA 5A4WA 3GURA 5A4VA 4NHZA 6GSWA 4HQZA 1R5AA 4N11A 4MDCA 4OMVA 4ZL8A 2JZRA 3KH9A 2AJQB 1T1VA 3C1SA 3P8WA 1TXXA 3ZL5A 2GTUA 5IO0A 1RK4A 4JR4A 4MJCA 2GVPA 3CBUA 1Z3EA 1TW9A 4KH7A 1F9MA 5ABRA 1SL1B 2ZNMA 1JLWA 1QGVA 4POMA 4ZB9A 3HZ8A 4DVCA 3EE2A 4L5OA 3ZREA 1QQ2A 1HD2A 3GYKA 1Q4JA 2NBSA 3G7IA 1EGRA 4MK3A 3HCZA 2P0GA 3IE3A 1ZZYA 1R5PA 4WXTA 2WZ9A 3IV4A 1EP8A 2XPEA 4MPGA 4GSSA 2VCTA 1X0RA 4K7NA 5CO3A 4ILFA 1MTCA 5EL8A 3TJFA 2J23A 3KIJA 2R3XA 4WBJA 4DSQA 3VLNA 1U3IA 1VGLA 3GH9A 4DSRA 2O8VB 1TU7A 3IHQA 2HYXA 4MH3A 3CTGA 4MLYA 3HZ4A 4I2UA 2F8AA 5IQYA 3KM6A 4E8EA 3F8UA 2H1AA 1B4PA 5KN0A 3FY7A 2VO4A 1MDJA 1GNEA 4LA1A 3CMIA 2QSIA 5GAPD 2O87A 2X99A 3V1WA 2O7KA 1ABAA 1PGTA 2YV9A 3CSHA 1RW1A 4NV5A 2PN8A 3GH6A 3WT2A 1TK5B 4JZQA 4YQVA 1Z6NA 2VL2C 5IMCA 1THOA 2VAFA 1K0CA 5D9VA 4BVYA 2V2GA 4N0VA 5HFGA 4PQIA 2H6YA 3I43A 2MMNA 1JFUA 1ZYQB 1F3AA 2C0EA 1B4QA 1GLPA 4K0NA 2IFQA 2B5YA 5E59A 2DMMA 4IQ1A 2GQKA 1N8JA 2OA7A 1O73A 1ERVA 5DJMA 6GSVA 4PQ1A 3M9KA 2LSTA 5GSTA 1M2BA 4PGTA 1HNAA 5F07A 2GSQA 4OO4A 1K0AA 3IDVA 3IK9A 4AF2A 3M9JA 2GT5A 5JWRB 5ECNB 4KCAA 20GSA 3TB2A 3UBLA 3HYPA 1BJXA 1BG5A 2GSSA 4TR1B 1EZKA 2JSYA 3EC3A 3CRUA 2VCQA 4YAVA 2V32A 5G1LA 2YANA 3TKRA 3GN3A 3F6FA 1PL1A 1ZOFA 3UJ1A 3WT1A 5H5RA 1SL0B 1Z7RA 2VL9A 2GGTA 3U6VA 1MD3A 4K1FA 1R26A 1NW2A 3LXZA 1M9AA 2LJRA 3ZFBA 1OC9B 1SD8A 3FW2A 3U5RE 3UBKA 1K3OA 4XS1A 5HR1A 2MYGA 2H1DA 3F4SA 1SKSB 5ECQB 2MBTA 3UOMA 1DBYA 4NAXA 4XS6A 2ES7A 1T4YA 1GUKA 2GZPA 3QFAC 3A2WA 2VCZA 1XW6A 3EURA 4GWRA 4ML1A 4DSSB 2PBJA 2JL4A 5B7CA 3HVVA 5AN1A 3D6IA 2LNTA 5D8IA 2DIYA 2TIRA 3ZITA 2WGRA 3PGTA 4V1Ag 1EOHA 4HU7A 1O81A 1U88A 4IP6A 1B48A 3GL3A 1Z9HA 2OE3A 2H6ZA 3O3TA 4BVXA 4IHUA 2AYTA 2F51A 1GULA 1V57A 1SJIA 2HNLA 1ACVA 1OKDA 4KDYA 3DRNA 1VRSD 5DQYA 3FHKA 4I5QA 1O8XA 1FOVA 6GSSA 4QQ7A 4AJ7A 3GV1A 4MABA 3VK9A 2IJYA 2YCDA 2IIYA 1TI3A 1ERWA 3D22A 5CRWA 2H71A 2R6KA 1V98A 2H66A 4YQUA 4BWSA 5J9CA 2DBCA 3IXRA 2HE3A 3GNJA 3DXBA 3FR3A 1QUWA 2OE1A 1GSEA 4DEJA 4FYCA 2PPTA 4MCUA 3GUSA 4P3YB 2AUVA 3RHBA 3VI5A 4Q5QA 1DE1A 1GTBA 1FVKA 3GL5A 4GXZA 2MMZA 4ECBA 3VI7A 2H0IA 1S3DA 5DJLA 2VM1A 2R37A 3NZNA 1WP0A 2GSRA 1PL2A 3BJ5A 1J08A 1K0NA 1K3LA 2R4VA 5D93A 2RUEA 1EP7A 4TXOA 5IMVA 1XBSA 4NXIA 3ZFLA 2FWEA 1V9WA 4V2NA 1YKAA 3C1RA 3VWUA 2VD1A 3H93A 5CRDA 5J9BA 4FO5A 5ECKB 2HT9A 2VUPA 4BL7A 5KN1A 4K7OA 2FUG2 4TN8A 4CHSA 4OFTA 4MF6A 5J3RA 3L78A 4HI7A 4OFMA 3Q19A 2VCWA 4MF5A 3UMAA 1VF1A 2RM6A 3IPZA 1GSYA 3KJYA 1VF2A 1PN9A 2GDRA 2HXKA 3E9JB 2F8FA 1WIKA 2E0QA 1LU4A 4ZL7A 1SYXA 4J56E 4OD7A 3FR9A 1OYJA 1EOGA 2GT6A 3C71A 3KEBA 2X8HA 6GSYA 4F0CA 3IK7A 4HJMA 3DEXA 2WJUA 5COHA 3KTLA 5FT3A 2DJ3A 1A2MA 3KGKA 2L4QA 1DSBA 3TDGA 1XFLA 3C7MA 3CRTA 1SD9A 2DMLA 2C0GA 3APSA 3LWAA 4HJ2A 5D9TA 5KEJA 5ID2A 2LKUA 1FW1A 3KP9A 2B3SA 4BPYA 3FZAA 2VM2A 1UN2A 4H86A 1W4VA 2OJLA 3R2QA 2CVBA 5HR3A 4O92A 5F05A 4GQFA 4F0BA 3IAM2 2F3MA 1XWGA 1QK8A 2ZCTA 7GSSA 5IOXA 3WGXA 3ZMLA 4TOPA 1FB6A 1W89A 1YDKA 3QR6A 4XCSA 1PSQA 3F3QA 2FA4A 2FNOA 1WJKA 4WETA 3WGEA 1BEDA 4F03A 1F37A 3KCMA 2YWNA 1X9WB 4EO3A 1XW5A 2A4VA 3TRXA 3IC4A 3BD2A 5ECPB 3ZIJA 4TKYA 2OKAA 1NHYA 5LCZA 1AW9A 5HFKA 2C0DA 1KBNA 3SBCA 1YF1A 3W8JA 3ZMKA 1PD21 3GIXA 1JZOA 2DJ0A 2IMKA 2PMTA 3C73A 1JZWA 3HKRA 1F3BA 2A2SA 2H01A 4NWYA 6GSUA 1AXDA 3LGCA 1YQ1A 3KZQA 2C8UA 3C8EA 1TP9A 2YJ7A 3QMXA 4AJ6A 5J5NA 1B9XC 4K7IA 3M0FA 4J2FA 3D5JA 3Q6OA 3KP8A 1B9YC 3P7XA 2CAQA 2HRFA 4Q5FA 4YH2A 4RQXA 4KUNA 2QGVA 1WMJA 1ERUA 14GSA 2L4CA 4L5LA 2P5RA 1TJDA 5KN3A 5HFIA 1E6BA 4O7HA 2REMA 3RBTA 4QL9A 4WKWA 3ME7A 5L71A 2FLSA 4X1UA 3UARA 2WULA 3G9BA 3QD9A 4LMVA 4GLTA 5IMAA 1Y6EA 3US3A 1PX6A 3KTBA 2RLIA 4RUVA 3IBHA 1USBA 4POBA 1ON4A 3F4TA 1EV4A 3RPPA 2KUCA 1O6JA 4Q5NA 5DCGA 4NV2A 1G7OA 3WD6A 2VD0A 1FVJA 4TXVA 5LNKe 1PRXA 3Q18A 2B1KA 1OKTA 2N5FA 10GSA 1B8XA 4CW9A 5G30A 3VWVA 2K8SA 2H76A 2K18A 3FYGA 5ECHB 5IPHA 1XWBA 1H75A 3LJRA 4IBPA 4I8BA 1K0BA 3K8NA 1JZRA 1YEXA 4MP4A 4NMUA 4I97A 2K6VA 4WBRD 2IFQB 3E3EA 4XHMA 2CQ9A 1IYHA 1SJ6A 4O5RA 2GLRA 1DE2A 2L6CA 3A2XA 1KTEA 2LEGA 2YN1A 1AIUA 3ZIVA 4PXOA 1AAZA 1XW9A 5ECRB 2DJ2A 2H1BA 2H74A 4YQMA 2E2MA 2V1MA 3A5WA 2FD3A 5G1KA 1LJRA 4ZILA 2CT6A 1GSUA 1QXHA 2CAIA 2CV4A 3EWLA 3ERFA 2M80A 2WDUA 1K0DA 3GMFA 4ZBAA 2H8LA 2GZYA 2VCVA 1YJ6A 4LL4B 3J7Yk 1ST9A 4F2IA 4JR6A 2L5OA 1OE7A 3QPMA 4IJ3A 3TUEA 1TU8A 2GQMA 2X64A 1V40A 2VLUA 2VIMA 4IQAA 4XS4B 2LNSA 4OCFA 3CXGA 2EIQA 3M8NA 2Z9SA 1HNCA 4MH2A 4IGJA 1H4OA 4IS0A 3EMPA 1OVNA 1ZMAA 4WF5A 4KSOA 3HJPA 2KP2A 4WEYA 3ZLPA 4NHWA 2ALBA 8GSSA 2YWMA 2VL2A 4PUAA 3CYNA 2JZSA 1K0MA 2C0FA 4KCEA 1TKDB 2B5XA 1UC7A 2WB9A 5DALB 3M3MA 4EDYA 5FWGA 3ZRDA 17GSA 3F6DA 3TKSE 2C3QA 3ZYWA 4L8EA 3QDNA 1XWAA 2GZZA 2X8GA 4N0ZA 2R2JA 1X9MB 2HI7A 3TKQA 1S3CA 2IPAA 3HY2A 5D96A 5ECOB 3GTUA 3VFIA 2M72A 2LS5A 2BTOT 1NSWA 2E2GA 4MF7A 1NM3A 4D73A 2KOKA 3VWWA 5CRHA 2JADA 2WCIA 4XRDA 1M2AA 4AGSA 1UVZA 1J0FA 1U87A 1OAZA 3QAVA 1TK0B 4HS1A 3CSJA 4OCEA 5CYYA 2KP1A 4KGIA 3EMXA 1XWKA 4RQRA 2DJKA 5INYA 3HVSA 2AHEA 4F82A 4ECJA 5ELGA 1AQWA 3TRQA 1OE8A 2HZFA 5HQPA 4PQHA 5IIZA 4KE3A 2LRCA 4YAPA 1XOAA 2HZEB 2L59A 4G19A 4ZB6A 3W8SA 5DCHA 3F9UA 4MA9A 3F3RA 2H30A 3MDKA 1A2LA 4BWQA 1KNGA 18GSA 1WRYA 5ECLB 1MDKA 1SJZA 1FAAA 3L9SA 3EYTA 2JZTA 3ZVJD 3FZ4A 3ERGA 3TKPA 4POKA 1Z5YE 1GSSA 3I69A 4GQCA 1WOUA 4HZ2A 6GSXA 1GRXA 2HSYA 5DDLA 5JCUA 3DGQA 1THXA 5DAKA 2PGTA 4ZBDA 3N5OA 5AIXA 1HYUA 1PKZA 2VCXA 1G7EA 3FZ9A 4RI6A 1YF0A 1K3YA 1WWJA 3FK8A 3TCOA 5ECIB 5GSSA 1EEJA 2AB6A 5D9WA 2J9HA 1V2AA 3GX0A 2MBSA 1OC3A 1X5DA 3LFLA 2P5QA 3J7Yb 4IP1A 5J41A 2HLSA 1MEKA 3GKKA 4KDUA 3KH7A 4XIHA 4XTSA 3RPNA 2LJKA 1LBKA 2H0HA 2DIZA 4V2MA 3GSSA 4CDOA 4MZWA 5H5QA 1CQHA 2VLTA 5AGYA 3DD3A 5FHIA 4OFNA 2H75A 3G7YA 2V6KA 1M2DA 2CX3A 4X0XA 5D9XA 2G2QA 3E0UA 2LQOA 2ON7A 1X5CA 5JCWA 2FHEA 3VWXA 1WE0A 1XZOA 3NOFA 5IMFA 1R4WA 1SENA 1WPIA 3RDWA 1X5EA 4KNDA 3TJGA 1T8EB 1A8LA 2FA8A 1TDIA 2DC5A 2YNXA 2YWOA 1XVWA 5JWOB 2FWGA 1G6WA 2D2ZA 2C3TA 3JCML 3H79A 3KMNA 2I4AA 4JEDA 5J4UA 1U6TA 1IYIA 1FB0A 1GH2A 5C00A 3CTFA 1BX9A 4KX4A 3RHCA 1FHEA 2LV3A 2DJ1A 1Q98A 3APQA 4WR4A 3TRPA 3GX8A 3IOSA 3ME8A 3H8QA 3GKMA 1N2AA 1V58A 4IJIA 4TR4A 5E4WA 4QL7A 2F9SA 3GKNA 5ENUA 3UEMA 2DJJA 2XBIA 1GWCA 2PWJA 1S3AA 4G10A 3TKSC 5G5FA 4HEA2 1EV9A 4ID0A 5IMDA 1PA3A 2RM5A 1XWCA 3ERWA 1GLQA 2LRTA 3L0HA 1VF3A 1SKWB 5DBQA 1T3BA 4KA0A 2DSAA 3BOAA 4V2LA 4FIWA 2VL3A 4KDXA 2EIOA 5IM9A 3BBYA 5CRGA 4FYBA 4HZ4A 4ECCA 5EPFA 5CAXA 2H70A 3DVWA 2OBKA 1Y25A 3A3TA 3APOA 2I81A 3LXTA 3HD5A 3ED3A 2C3NA 2YP6A 5EVOA 2A2RA 3QOUA 1QFNA 4K8MA 2L5LA 2GS3A 2HSHA 3F4RA 3O6TA 5AISA 4J57E 3G7JA 2PVQA 4PNFA 13GSA 2WRTA 3QCPA 2FWFA 2YWIA 3TOTA 4JRRA 2TRCP 1XCCA 1CQGA 1HQOA 2AAWA 2KHPA 4FYUA 5ECMB 2O85A 3VPTA 4MZCA 4LLRA 2C1YA 4L0WA 1FO5A 2EIRA 3TJJA 1BYEA 3LYKA 1TK8B 3AY8A 4ZB8A 1GSDA 2GQLA 2NTOA 3NIVA 1PKWA 2CZ2A 5A4UA 1J9BA 3A2VA 4HQSA 5EY6A 4TR0A 1AQVA 3GKXA 1A23A 4LL1B 3TKSA 3LQ7A 1GTAA 4F9ZA 3DIEA 2IMFA 2H1GA 2CX4A 1YEPA 4KB3A 3UIWA 3TJKA 2FWHA 2LUSA 3DKSA 3D4TA 4ACSA 4O32A 1M7TA 4IELA 2MMOA 2I9HA 2B1LA 4PUFC 5F06A 5KN2A 3WYWA 1ERTA 2YZHA 3F63A 4TRXA 1NHOA 5HR2A 4NPBA 1BQ7A 1ZYEA 1R7HA 2YV7A 3EU4A 3D0ZA 1GSQA 4TR3A 1EEMA 1M99A 3QAGA 2NVLA 4V1Ap 1KEBA 2ZUPA 4EUYA 4TW5A 5AIVA 4PNGA 3F0IA 5H5SA 22GSA 1XIYA 3UVHA 2CA8A 3TGZA 2C80A 2YJHA 4IKHA 1SYRA 5DQSA 3HJMA 1TTZA 1EGOA 4MPFA 5F8BA 2L6DA 1AQXA 3CSIA 1SL2B 3O76A 2M46A 3GA4A 2OADA 3QFBC 2H73A 1XVQA 19GSA 4K2DA 2B6MA 6GSTA 5G2ZA 9GSSA 1JZDA 2OBIA 2CZ3A 1K0OA 3DWVA 4KAEA 4GRFA 3UVTA 3D4MA 3MNGA 2B7JA 4ZIJA 3W6GA 1XPVA 12GSA 3LYPA 1OC8A 4I2TA 2WS2A 5ECSA 5IO2A 1GSFA 3FKFA 2IWTA 3ZZXA 2H0GA 3QAWA 2O89A 2TRXA 2IMDA 4JU5A 4ULXA 1UA5A 3ISOA 1XOBA 2EC4A 3LEFA 3UAPA 1GUHA 4WR5A 5GAND 3PINA 4JE1A 1O7UA 5CP1A 4OO5A 3UL3A 2H19A 2C4JA 2QC7A 2R5GA 3TOUA 16GSA 3MSZA 4L0UA 2OACA 2VOCA 3FEUA 2B5EA 1ZL9A 4TR1A 1SK0A 1URMA 3MAKA 1FG4A 5HR0A 4FH8A 3FRCA 2IN3A 4XS4A 1I9DA 2V41A 3GTUB 1PX7A 1BAYA 5GZZB 4D73B 3KMOA 3HXSA 5C04A 1SK1A 5F0GA 3EVIA 4OWYA 1A24A 1TRVA 1OC9A 3MWHA 1T7PB 1PMTA 3LORA 3IRAA 1G0TA 1Z6MA 2VLVA 1RQMA 4IW9A 1O8WA 1A2JA 3KD0A 4MMMA 1MDIA 4GSNA 1QMVA 2XC2A 4ZBBA 4E8HA 1O85A 3PH9A 4MJBA 1TRSA 5IMZA 4DSSA 5DALA 1XXUA 2P31A 3GRXA 2I3YA 2FCHA 4GTUA 3I9V2 4EL1A 5IOWA 1G6YA 3VPQA 3Q74A 4I6XA 4ZL9A 2I1UA 1SK2A 2AV4A 4K0GA 2N5AA 4K6XA 1EWXA 5D73A 3N9JA 2IMIA 2LQQA 4LMWA 3VURA 4TXOB 3D21A 4G2EA 3LSZA 1A0RP 3DVXA 1I5GA 3IR4A 5JCGA 1GTIA 5DAKB 3LG6A 1GNWA 3ZVJA 2K8VA 2BJXA 4RI7A 4GSTA 1M9BA 3WGDA 1MD4A 3HA9A 5G5EA 1F2EA 4KSMA 2WFCA 5B8BA 3TJBA 2YZUA 1E2YA 11GSA 5B6NA 3SWLA 2DLXA 3FZ5A 3IAS2 4GCIA 1F6MC 4KW6A 2PERA 5CREA 1YY7A 4HDEA 2HZEA 2KLXA 2RUFA 2YPMA 4AJ8A 1JHBA 3HVXA 4MZBA 3L9VA 1C72A 2FGXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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