4O5UA

Crystal structure of alkylhydroperoxide reductase subunit f from e. coli at 2.65 ang resolution
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
521
structure length
521
Chain Sequence
MLDTNMKTQLKAYLEKLTKPVELIATLDDSAKSAEIKELLAEIAELSDKVTFKEDNSLPVRKPSFLITNPGSNQGPRFAGSPLGHEFTSLVLALLWTGGHPSKEAQSLLEQIRHIDGDFEFETYYSLSCHNCPDVVQALNLMSVLNPRIKHTAIDGGTFQNEITDRNVMGVPAVFVNGKEFGQGRMTLTEIVAKIDTGAEKRAAEELNKRDAYDVLIVGSGPAGAAAAIYSARKGIRTGLMGERFGGQILDTVDIENYISVPKTEGQKLAGALKVHVDEYDVDVIDSQSASKLIPAAVEGGLHQIETASGAVLKARSIIVATGAKWRNMNVPGEDQYRTKGVTYCPHCDGPLFKGKRVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVEHVTLLEFAPEMKADQVLQDKLRSLKNVDIILNAQTTEVKGDGSKVVGLEYRDRVSGDIHNIELAGIFVQIGLLPNTNWLEGAVERNRMGEIIIDAKCETNVKGVFAAGDCTTVPYKQIIIATGEGAKASLSAFDYLIRTKTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit F
publication title Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 155
structure length 521
sequence length 521
ec nomenclature ec 1.8.1.-:
pdb deposition date 2013-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00070 Pyr_redox Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o5uA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4o5uA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4o5uA03
5CQFA 2XFPA 2YLWA 2GF3A 1OJCA 4XXGA 5U63A 2R0PA 3NHOX 1VRQB 2CULA 4JN9A 3KPFA 4Y4LA 4A65A 3D1CA 2UZZA 1HYUA 5KVIA 1PBCA 4C3XA 5C2TA 2VRMA 1YQZA 5U25A 2B9WA 4OPLA 1ZKQA 3KKJA 3GD3A 3NYFA 2Z5YA 4J34A 5JCIA 1D5TA 4J57A 4BK3A 4GDEA 3FIMB 4AT0A 2VVLA 1LTXR 2WP6A 4GCMA 4YWOA 1LPFA 2ZZBA 1PN0A 2C73A 4OPTA 1DJQA 1GESA 2IIDA 4CBQA 1YKJA 3UTGA 3AB1A 4X9NA 2OLOA 5LV9A 4JY2A 4LA1A 4BJYA 1P2EA 1OJDA 5TR3A 5C3JA 2R0CA 3ITJA 3NYEA 4K8DA 3BI2A 2WETA 4GF7A 1E1KA 3P4PA 3P1WA 3WE0A 1YY5A 3UKPA 3OC4A 4H2NA 1EL9A 2WDVA 1B4VA 2X8CA 3UKAA 3F8PA 3VRDB 3BNMA 2GR3A 1NDAA 4MJWA 2YLSA 3PS9A 4FK1A 2NVKX 3ALJA 4H2PA 4DSGA 3GWFA 3QVPA 2QA2A 1Y56A 2O9ZA 1ZX9A 5J7XA 4KX6A 3ATQA 5JCKA 4D04A 3G5QA 3AYLA 1IUTA 1QO8A 4USRA 2GMHA 5IQ4A 2V6OA 5IPYA 4H4SA 4EMJA 3NIXA 2OALA 4PAAA 1DODA 4A9WA 4C74A 3FBSA 4U8JA 4CY6A 2V3AA 3UOVA 2XLRA 3URHA 3DMEA 1E1LA 5CKUA 5EOWA 2WU2A 1Y56B 4O5QA 3FMWA 2BC1A 2BS4A 3UKLA 3NH3X 4IA5A 2WOIA 1D4CA 3EF6A 1CC6A 1AOGA 2TPRA 2EQ9A 1GT8A 1IUUA 3C4NA 2CFYA 4N9XA 1OJTA 4BK1A 2C76A 1H81A 1H7XA 5FS9A 2C67A 1E6EA 4YSXA 1VG0A 3KU9A 3SGLA 3RHAA 3D8XA 1IUSA 4H7UA 1BGJA 1EBDA 1KFYA 1PXAA 5JCMA 1O94A 4NZHA 2YG3A 4U8OA 3Q9TA 4DSHA 1TDKA 4E0VA 1TDEA 4RG4A 2EQ7A 3GYIA 1GRHA 4IVMB 3S61A 1LQTA 4EM4A 4UDRA 1FEAA 4H4YA 4UDPA 2F5ZA 4Z2RA 1GSNA 5KXJA 1ZDLA 3AD7B 4C5OA 4B68A 1JRXA 3DK4A 4H4UA 3AYJA 3UTFA 1V59A 4LU6A 2JB2A 3F8DA 2AQJA 5DBJA 3NRNA 4Z44A 2WOVA 4NEVA 4J31A 3ATRA 4DNAA 1L9CA 3RNMA 1H83A 1KDGA 1NHSA 4U2SA 3SFDA 3UP4A 4Z43A 3UP5A 4EMWA 5HY5A 3K7MX 4AP1A 3KVEA 1O95A 1REOA 3NN6X 4CRTA 2E1MA 3AWIA 4NTDA 4XWZA 4K5RA 3GYJA 2BK3A 5HXIA 5KOXA 2I0ZA 3H8IA 4X9MA 4H50A 2DKIA 1XANA 2BXRA 3M0OA 1CJ4A 3UOYA 3GDNA 3QFBA 3BHFA 2CDUA 2WHDA 3CPHG 2XFOA 1NPXA 4M52A 3VQRA 2BXSA 4TM1A 1JNRA 4EM3A 3AE6A 4A79A 2AR8A 5HYMA 1TYPA 4TM0A 3QSMA 4Z24A 5FS6A 3RP6A 3NT6A 1PHHA 2GAGB 2OA1A 3ADAB 2W0HA 3LADA 4JQ9A 3ISHA 2IVDA 3S5WA 1D4DA 1H84A 1B8SA 2WEUA 1S3EA 2YG4A 4JY3A 3BI4A 1Q1WA 4OVIA 4Z26A 2FBWA 3H8LA 1DOBA 1DXLA 2GMJA 4OPUA 4Z2TA 3AE4A 1S2YA 2C65A 3ABVA 3DJDA 2V61A 2VRLA 3EAOA 3CNTA 2GQFA 2Z5XA 2B7RA 3SFEA 2AAQA 3I3LA 2JB1A 3ZYXA 4REKA 5HHFA 1CC4A 1FL2A 1F6MA 5L46A 3CPIG 5BULA 4HB9A 3L1RA 1E7PA 2APGA 2JKCA 1GOSA 2YLXA 5JCNA 2E4GA 3LZXA 3QJ4A 4J36A 4EQWA 3SM8A 1ZMDA 2FJEA 3B6DA 4NEWA 1E39A 2GQWA 3GSIA 2XLPA 3UKQA 4DGKA 4H4ZA 1D7YA 2OLNA 2RGJA 2YR5A 2V5ZA 4H2QA 1GV4A 4AT2A 5J60A 1DNCA 4BV6A 4APNA 1UKVG 1N4VA 1VG9A 3LB8A 1JEHA 5KRQA 2Q0KA 4EQSA 3CGBA 2BK4A 1B37A 3NG7X 4OPIA 4XWRA 3GWDA 1JNZA 3F8RA 1IUXA 1SEZA 2YG7A 4YSZA 1GREA 1LJ1A 1DOCA 1N4UA 4U2TA 4ICYA 5M10A 4GDPA 2QA1A 1TYTA 4GR1A 4U2LA 4YSYA 3NGCX 2ACZA 4K22A 4U8LA 3DGZA 4IA6A 2YR4A 4ZCCA 5EBKA 4U8NA 4OPDA 1CJ3A 2YWLA 4P9SA 3NNEA 1KSSA 2XLTA 2YVJA 3BI5A 1FOHA 4Y4NA 3ZDNA 1MO9A 3K30A 1OJAA 5IQ1A 2WBAA 2XFQA 2JK6A 4H4WA 3DGHA 1L0VA 4JNQA 2EQ8A 2BCGG 4EIQA 2VVMA 3V3OA 1P2HA 1PBBA 3KLJA 3G5SA 2GVCA 1GPEA 5BVAA 2VOUA 5EB5A 3FG2P 1GEUA 3AECA 2YVFA 3AD8B 3CNJA 2YLRA 4UDQA 2B9YA 3V76A 1E1NA 4U8KA 4USQA 4Z2UA 1NG3A 4X4JA 1OJ9A 1YQ3A 2PYXA 3NTAA 4TM4A 1K0JA 2WDRA 1EL5A 3ICTA 4ZCDA 1L9DA 2V60A 2TMDA 3CGDA 3OZ2A 4CNKA 3CPJG 3AEGA 4NTCA 2X8HA 4O5UA 4H4VA 1E1MA 3UOXA 3AD9B 2X50A 1IJHA 2A8XA 3NKSA 2OAMA 1CJ2A 4CCRA 2Y6QA 1PBDA 3BHKA 4FX9A 2X99A 4H4QA 4UP3A 2WPCA 3L8KA 1ZMCA 3DK8A 5FS7A 4K2XA 4HA6A 2C64A 3CNDA 3V3NA 2XLSA 4BURA 4H4XA 4EQXA 1M6IA 4YKGA 3PVCA 1H6VA 3NN0X 1MOKA 1NEKA 3IF9A 3NLCA 1ONFA 4IV9A 3Q6JA 2C70A 4B1BA 2R9ZA 4B64A 2V3BA 1KF6A 2WP5A 3NYCA 1B5QA 4TLXA 4AOXA 2XVFA 3P4SA 3CGCA 1Q1RA 3AE9A 2GR1A 3IC9A 1IUWA 4H2RA 2GAHB 1H82A 2B76A 5GRTA 2WS3A 2R46A 2C72A 3LZWA 4U8PA 3RP7A 1N4WA 1Q9IA 1GNDA 2A89A 3JSKA 1COYA 1N1PA 1PXBA 2Q6UA 2ARDA 3HZLA 3NK0X 3AE5A 5M0ZA 1D7LA 2C3DA 1FEBA 2XVEA 5BRTA 2X3NA 1X31B 3E1TA 1W4XA 3LOVA 5BUKA 1F8RA 1IUVA 1MXTA 2DKHA 2WPEA 2XVJA 3O0HA 4GUVA 3AE3A 3GMCA 3AE8A 3DK9A 1NHPA 2NPXA 1PBEA 3ALLA 1KSUA 4Z25A 1XPQA 1RYIA 2YM1A 3EANA 2H89A 1ZK7A 1NAAA 3AYIA 4H4RA 4A99A 3BNUA 1F8WA 2XVHA 2XFUA 2FJAA 3CN8A 1D4EA 2FJDA 1GRBA 3CGEA 1GRFA 3QSEA 5FS8A 5KOWA 1PDHA 3B3RA 2XCGA 2RGHA 3COXA 1GERA 1Z6LA 3CNSA 2YLTA 3UKFA 3AEAA 3AE7A 4EIPA 1XDIA 3DH9A 1RP0A 2CVJA 2GEWA 5U1OA 4AP3A 3AE2A 3CNPA 2WQYA 3QVRA 3VRBA 1PJ6A 2X8GA 3ICRA 3CTYA 1JU2A 4FDCB 1GTEA 2HQMA 3AEBA 1BZLA 1QLBA 3I6DA 2YM2A 3UOZA 3NTDA 1CHUA 1H7WA 3UKHA 3LXDA 1ZYNA 1RSGA 2C3CA 2FJBA 1ELIA 4ECHA 3M13A 2VZ2A 2XDOA 3R9UA 4B65A 4OPGA 5ER0A 4B66A 4TM3A 4YXDA 2A87A 1GETA 1ZYPA 3IHGA 5KVHA 4JDRA 4C3YA 3CIRA 2BS2A 1ZOVA 4B67A 1S2QA 2YVGA 2WU5A 3K7TA 3GMBA 1KNPA 3REDA 1JOAA 1NENA 5EB4A 2R45A 1Y0PA 2YG6A 2GRTA 2XFNA 3LJPA 4GRTA 4EMIA 3AEFA 4H4TA 4U8MA 2B9XA 2BYBA 2ZBWA 3DJJA 3ALMA 4YSHA 1LQUA 3ICSA 1JRZA 1PBFA 1M64A 2RGOA 4CNJA 1CF3A 1ZOYA 3G5RA 3KA7A 3C96A 3UTHA 2WP9A 3AEDA 1CL0A 1F3PA 2BA9A 2YR6A 3K7QX 2WESA 2Y6RA 1BWCA 2GH5A 1GTHA 1GRTA 4PABA 4EQRA 1ZY8A 1O5WA 4NTEA 1L9EA 1PXCA 2QCUA 3GRSA 4WCTA 3H4KA 4ZN0A 1PJ7A 4YT0A 3P9UA 2VQBA 1GRGA 4I59A 4KPRA 2R4EA 2ZZCA 2YAUA 3QSSA 4OPCA 2BCPA 2J3NA 4BJZA 3AE1A 2QAEA 2R0GA 2XVIA 2YG5A 2XYOA 3II4A 4LIIA 4YTNA 3RP8A 4YKFA 2VQ7A 1QJDA 4J56A 1EL7A 3VRAA 1NHQA 3SQPA 1GRAA 4RG3A 2GV8A 4TLZA 3GRTA 4OCGA 2WPFA 4B69A 1FECA 3EPTA 1F8SA 2XLUA 3GD4A 3IWAA 2JBVA 4U8IA 4RSLA 1DOEA 2BACA 4D03A 1GXFA 1NHRA 2ZZ0A 4A7AA 1TRBA 1H86A 1BKWA 1K0LA 3VR8A 3IHMA 1VQWA 2C66A 2E5VA 2BS3A 2BC0A 2GR2A 2H88A 3DJGX 3GDPA 5GSNA 3PO7A 4IVOB 1PJ5A 4MNNA 4ADWA 1DJNA 3AXBA 2EQ6A 4K7ZA 4I58A 4FK1C 5KWFA 1EL8A 1K0IA 2GB0A 2VVLG 3UTEA 3VR9A 4AOSA 2C7GA 4Y4MA 4CY8A 3UCLA 1KNRA 4A5LA 1TDOA 2C75A 2BK5A 4H4PA 2GR0A 3QFAA 1CBOA 1TDFA 4J33A 1YQ4A 4BK2A 2Q0LA 1VDCA 2JAEA 4K5SA 4CCQA 2R4JA 2PHHA 2RABA 1K4QA 4A6NA 4YTPA 1S3BA 3KD9A 1CJCA 3C4AA 4WX1A 1LVLA 1TDNA 2B7SA 2JB3A 1FCDA 3NK2X 3P4RA 1PS9A 1LV0A 3M12A 1JRYA 1XHCA 1ZP0A 2Q7VA 1BGNA 4C77A 3T37A 3UKKA 3NK1X 2WDQA 1NG4A 2BABA 3DA1A 4B63A 5FMHA 4JNAA 2IVEA 5JCLA 4J2WA 2YLZA 2YQUA 4A6NB 1BF3A 4YTMA 3P4QA 1CC2A 3FPZA 1GALA 3DJEA 3AEEA 2WOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HZEA 2LQOA 3TJBA 1XXUA 1OJCA 3CSJA 3FK8A 4GSSA 2IIYA 3L0HA 2CULA 4JN9A 2DMLA 2YWIA 3KPFA 1PGTA 1OC9B 1HYUA 5KVIA 4ZL8A 2VRMA 1YF1A 2H74A 1ZKQA 1N8JA 3GD3A 2GS3A 3NYFA 4J57A 2FWHA 4AT0A 1M9AA 1JZWA 2WP6A 2GVPA 2PWJA 1V2AA 1PN0A 2LJKA 3U6VA 2IN3A 4CBQA 4WBRD 1A0FA 4X9NA 2OLOA 3J7Yb 5LV9A 2YPMA 22GSA 1WJKA 3A2VA 1V98A 5D73A 4CDOA 4GF7A 3UKPA 3OC4A 4BWSA 1WWJA 3TRXA 2DJ2A 4JU5A 4PNFA 2RUFA 1WMJA 3QFBC 1NDAA 3FRCA 4YAVA 3GWFA 3QVPA 4IN0A 1R26A 3GSTA 1ZX9A 5EL8A 3ATQA 5JCKA 1QO8A 4E8EA 2GMHA 5IQ4A 2GZPA 2P0GA 3GA4A 4PAAA 1DODA 4A9WA 4HZ4A 4CY6A 3FBSA 3DKSA 2XLRA 2B1LA 2WU2A 1GULA 5BMUA 2VL3A 3FMWA 1GSQA 4O5QA 2LTKA 3F4RA 3L78A 1CC6A 1AOGA 1R7HA 4J2FA 2EQ9A 3C4NA 3A5WA 4L0WA 2R6KA 1H7XA 1E6EA 4YSXA 1U88A 1XG8A 3L9UA 1VF2A 1SD9A 3D8XA 1IUSA 3GH6A 3ZITA 1BGJA 1KFYA 1PXAA 3Q9TA 1TDKA 4N0VA 1TDEA 4RG4A 3GKKA 1Z6MA 3G7YA 1V57A 1S3RA 3S61A 4EM4A 4UDRA 3TCOA 4G19A 5KXJA 1AIUA 1JRXA 3DK4A 5ECMB 1NSWA 2WB9A 5E4WA 4ZL9A 2WOVA 2CZ3A 4NEVA 2CVDA 2VL2A 1L9CA 4DNAA 3GX0A 1NHSA 3UP4A 4WF4A 3UP5A 4Z43A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2HZE A;  2LQO A;  3TJB A;  1XXU A;  1OJC A;  3CSJ A;  3FK8 A;  4GSS A;  2IIY A;  3L0H A;  2CUL A;  4JN9 A;  2DML A;  2YWI A;  3KPF A;  1PGT A;  1OC9 B;  1HYU A;  5KVI A;  4ZL8 A;  2VRM A;  1YF1 A;  2H74 A;  1ZKQ A;  1N8J A;  3GD3 A;  2GS3 A;  3NYF A;  4J57 A;  2FWH A;  4AT0 A;  1M9A A;  1JZW A;  2WP6 A;  2GVP A;  2PWJ A;  1V2A A;  1PN0 A;  2LJK A;  3U6V A;  2IN3 A;  4CBQ A;  4WBR D;  1A0F A;  4X9N A;  2OLO A;  3J7Y b;  5LV9 A;  2YPM A;  22GS A;  1WJK A;  3A2V A;  1V98 A;  5D73 A;  4CDO A;  4GF7 A;  3UKP A;  3OC4 A;  4BWS A;  1WWJ A;  3TRX A;  2DJ2 A;  4JU5 A;  4PNF A;  2RUF A;  1WMJ A;  3QFB C;  1NDA A;  3FRC A;  4YAV A;  3GWF A;  3QVP A;  4IN0 A;  1R26 A;  3GST A;  1ZX9 A;  5EL8 A;  3ATQ A;  5JCK A;  1QO8 A;  4E8E A;  2GMH A;  5IQ4 A;  2GZP A;  2P0G A;  3GA4 A;  4PAA A;  1DOD A;  4A9W A;  4HZ4 A;  4CY6 A;  3FBS A;  3DKS A;  2XLR A;  2B1L A;  2WU2 A;  1GUL A;  5BMU A;  2VL3 A;  3FMW A;  1GSQ A;  4O5Q A;  2LTK A;  3F4R A;  3L78 A;  1CC6 A;  1AOG A;  1R7H A;  4J2F A;  2EQ9 A;  3C4N A;  3A5W A; 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