2EIOA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKCFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords Thioredoxin 1
total genus 26
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eioA00
4Z7XA 3IA1A 3HZ4A 2I1UA 6GSWA 1IYHA 1MDJA 4LL1B 1OE8A 4ML1A 1RQMA 3QMXA 2IL3A 1Z9HA 3FRCA 2LQOA 1K0DA 1WE0A 1FOVA 4O7HA 4IJ3A 1B48A 2YN1A 1GUMA 1ZYQB 4KDUA 1W4VA 2H74A 3LQ7A 1O81A 1LBKA 1XVWA 2IMEA 2YCDA 1S3CA 2QKEA 3HDCA 2K9FA 3C73A 4ECJA 1DE1A 1PQNA 3GX0A 2AYTA 3TOTA 4PQIA 1XOAA 3GA4A 1XWCA 2A2SA 4IBPA 3VWUA 4BL7A 3WGEA 1QFNA 2R6KA 2N5FA 2H0HA 4GLTA 1T1VA 5AGYA 5G1KA 1EWXA 2DJ1A 4MCUA 3MAKA 3GL3A 3VPTA 5CYYA 1X5EA 3DRNA 2C4JA 4QQ7A 3E0UA 5J9CA 1TRVA 2O8VB 2X8HA 4NHWA 3FY7A 2FLSA 3TKSA 5CRWA 1TK0B 3IBHA 1A8LA 4LL4B 2MMNA 3IOSA 4HZ2A 4HS1A 3DVWA 1S3AA 1BEDA 4HI7A 3KJYA 2ES7A 5D9WA 4HUAA 2C0DA 5IPGA 2IJYA 4ZB6A 5JWOB 1V40A 4MP4A 3VFIA 1OC9A 1GNEA 2WS2A 4RI6A 1PRXA 3KP9A 3KP8A 3L9UA 4D73A 5D9XA 2VIMA 4K1FA 2ZCTA 1F3BA 1OC3A 2OE1A 5G30A 14GSA 3CTFA 1G7EA 3E3EA 1XPVA 2EC4A 1S3DA 3IV4A 1WRYA 4BWQA 2H0GA 5EL8A 4I2TA 1QK8A 3L9SA 1SJ6A 5AN1A 2KP1A 6GSUA 4KX4A 1XWGA 1PX6A 2CV4A 2FWGA 1TK8B 1XW6A 1SK0A 4MLYA 3UBLA 4V2NA 1Z7RA 2BJXA 3IAM2 1M0UA 1GL8A 1E6BA 4LMVA 4OD7A 5ECQB 1DBYA 3EU4A 1VF4A 3Q18A 2VCZA 1V57A 2CX4A 2QSIA 1FAAA 1MTCA 6GSSA 3TRXA 4WXTA 4TR1B 2F51A 4EKZA 3LEFA 5FHIA 4GWRA 1FW1A 3JCML 1GSSA 1YY7A 5ELAA 4QL9A 1X0RA 4L0WA 2DMMA 1PD21 1ZOFA 5H5QA 3RDWA 2KP2A 4DVCA 1Z6NA 1T8EB 3MSZA 2H72A 3Q74A 3ZFBA 5ECLB 5IO0A 3W6GA 4K0GA 3EWLA 3APOA 4JRRA 5J9BA 4NMUA 1THXA 3TKSC 4N10A 3IDVA 1A2JA 2GZYA 5KN0A 1YZXA 4ZBDA 1AXDA 4DSRA 3FW2A 3UJ1A 4F9ZA 2K6VA 1K3LA 2HSHA 4RUVA 1J9BA 3SBCA 5IOWA 2ZNMA 5B6NA 3LXZA 2LUSA 1U6TA 2MBSA 1CQGA 1XFLA 3GHAA 4ULXA 1KTEA 2AV4A 5F8BA 5DJLA 1MD3A 3KTLA 1XWBA 3GN3A 2H1BA 3BCKA 1AQWA 1K3YA 4TXVA 4JBBA 2M46A 1T7PB 2RUEA 4BVYA 2YJHA 3D22A 2DMLA 4FYCA 1UA5A 5F07A 2FNOA 4IGJA 2YWOA 3F6DA 1YF1A 4RI7A 4ID0A 2E0QA 1AW9A 2H6XA 1Z6MA 1V58A 2YV7A 3KZQA 1X9WB 1TJDA 5GAPD 4HZ4A 1JZOA 3UBKA 4KH7A 1MDIA 3UEMA 3D4TA 1O73A 3BBYA 5INYA 5B8BA 4JZQA 4MK3A 2VD0A 4GSTA 4MJEA 3TJBA 4ZL7A 4PQ1A 5ECHB 2OE3A 4IS0A 4RQRA 3L4NA 5DBQA 5CO3A 4AJ6A 3VI5A 1Z5YE 3N9JA 4OWYA 4AJ7A 4TOPA 4FYBA 2LRTA 4TR0A 3CRUA 1OYJA 4ML6A 2FHEA 1QGVA 1OKTA 3N5OA 3TJJA 2VUPA 5DVBA 3FR9A 6GSXA 1EEMA 2RLIA 5FWGA 5ID2B 3HJOA 1ERTA 2P31A 3EVIA 1YJ6A 2V1MA 1AIUA 2H19A 3W8SA 3BJ5A 3QAGA 5IM9A 4GRFA 3ZL5A 1F6MC 2PMTA 3A2WA 1M2BA 5DJMA 3SWLA 2YZHA 1U87A 3S9FA 2YWIA 5ELGA 1ZL9A 5IMVA 1R7HA 5IPHA 2F8AA 3P8WA 5J4UA 2H6ZA 4EL1A 2I81A 13GSA 4YAPA 2YZUA 3GNJA 2JADA 2KOKA 2OBKA 2B7JA 2HZFA 1GSEA 3QAVA 4PXOA 5C04A 3TCOA 2OBIA 3LYKA 2X64A 1SL1B 2HRNA 2HYXA 1A0RP 3NIVA 4E8EA 1ZGNA 2G0FA 1JHBA 5JCGA 4IELA 2O87A 4Q5FA 5J41A 3ME7A 2PVQA 2K8VA 3GRXA 3UOMA 2BTOT 4IP6A 2LNSA 3APSA 1PSQA 3KH7A 3UVHA 6GSTA 4ZXGA 3WD6A 4AF2A 4PNFA 4KUNA 5DCGA 3FHKA 2GLRA 2DJ3A 4F0CA 1VGLA 2FWFA 2NDOA 2GTUA 4HU7A 3KCMA 1SENA 3GTUA 2DJJA 1A24A 4HU9A 2V41A 5D96A 2AUVA 4AGSA 1GSDA 2L5LA 4EVMA 4V2LA 2XHFA 1O8WA 3VPQA 4FIWA 3Q19A 2C3NA 1T3BA 1URMA 4K7IA 2V2GA 1QUWA 2PERA 5D93A 2BMXA 4XRAA 2EIOA 2VL3A 4MA9A 2IFQA 2OA7A 1JLVA 4LMWA 1U3AA 1JFUA 1USBA 4F2IA 3KMNA 5CAXA 1OC9B 1EP8A 2H1AA 5F0GA 5JCWA 2LJKA 4D73B 2AB6A 2EIRA 3F3RA 4OMVA 3KM6A 4GSNA 2YPMA 1M9AA 3F3QA 1MDKA 1BYEA 3D0ZA 3R2QA 4PX1A 2VCVA 4IHUA 3CMIA 2NTOA 3EURA 2CVBA 2LJAA 2J9HA 2DIZA 2KUCA 3ZREA 2WZ9A 2CX3A 2M72A 1RW1A 3TGZA 4BVXA 1NHOA 3G7IA 2L4QA 4G2EA 1TDIA 4NPBA 3WT2A 4EDZA 5HR3A 1K0OA 3FYGA 2WDUA 4WBRD 1T00A 2LJRA 1FVKA 2FA8A 1M9BA 3EMXA 2LSTA 2WGRA 3VI7A 3VWVA 4OFMA 1ZZYA 1N2AA 5ECRB 2NBSA 2F3MA 2XBQA 1UC7A 2PUKC 3HY2A 4IQ1A 4XTSA 4V1Ap 4KCEA 1XVQA 2V6OA 4CW9A 3WYWA 3C7MA 1LJRA 5HFGA 22GSA 2IN3A 5AIXA 3CBUA 3EINA 5B6MA 2WFCA 2XPDA 2H75A 1NHYA 5COHA 3DWVA 3ZIJA 1TKDB 2FGXA 1ST9A 5D8IA 2RM5A 2HXKA 2I9HA 4I2UA 4MJBA 2TRCP 4KGIA 4MPGA 3P2AA 1AQVA 3GV1A 2JZSA 3KTBA 2PGTA 2L6DA 1GSYA 4K6XA 20GSA 4HOJA 4PURA 2K18A 3CYNA 2RIIA 1Z7PA 5ENUA 1HQOA 1EZKA 1VRSD 1GSFA 2ZUPA 1GULA 3ZIVA 5LD0A 1MD4A 5DALA 2N5AA 2FCHA 1SL2B 1ON4A 3TJGA 3IPZA 4N11A 3HHVA 4ECCA 3FR3A 1GTIA 5IO2A 1CQHA 3M0FA 1JZWA 2GVPA 2MYGA 3U6VA 2XC2A 3H79A 3LYPA 3TKSE 5HFIA 1TI1A 1SL0B 5HR1A 3ZTLA 3TKRA 2C0EA 3APQA 1FVJA 2R3XA 1BX9A 2EIQA 3CSHA 1X9MB 1Q98A 1GH2A 2OE0A 5AIVA 5HR0A 4EF0A 4XS1A 9GSSA 3QD9A 4GCIA 3P7XA 4MH2A 6GSVA 1TK5B 1V2AA 2IWTA 4IN0A 2H6YA 3IR4A 4ZB9A 5ECNB 2JU5A 4BWSA 3M9KA 3M3MA 4GF0A 5IQYA 1XCCA 4MZWA 2DJ2A 4I6XA 5CP1A 4BPYA 2R37A 4JU5A 1WP0A 3GFKA 3HVVA 1R5PA 4GQFA 5J3RA 5DCHA 2IMFA 3HVXA 1ACVA 3WT1A 3FZ9A 1GNWA 4XS6A 1TXXA 2D2ZA 4MABA 4MZBA 1HNAA 1XW9A 2WJUA 4KAEA 4YH2A 3VURA 1PL2A 4NHZA 1DSBA 2B3SA 2CVKA 4X0XA 1EV9A 5KEJA 4EO3A 1GTAA 3H8QA 4ZB8A 1N8JA 2JSZA 3J7Yb 4J2FA 2VLTA 5IMZA 1TP9A 4N30A 2HZEA 3ZITA 4Q5RA 4ZBBA 4ACSA 3MWHA 2L6CA 1EEJA 2JZRA 3KEBA 3LFLA 3HXSA 5G5EA 4MF7A 2OACA 1FG4A 1SYRA 1MEKA 1PKZA 2YWNA 3ERFA 3IRAA 4JR4A 4XS4A 4F0BA 18GSA 2XBIA 3IC4A 4YQMA 4HEA2 1GP1A 3G7YA 5DQSA 3TKQA 4ECIA 2JSYA 4E8HA 2O89A 3WGXA 1QXHA 4TXOB 1QMVA 4KA0A 4GQCA 4IW9A 5A4VA 3J7Yk 3TRPA 1O6JA 2CQ9A 2B5EA 3DMLA 4K7OA 2B5XA 5KN2A 2CVDA 4MJAA 4AJ8A 3K8NA 1JLWA 2A2RA 1U3IA 4GXZA 1F2EA 1F9MA 2H1GA 4KDXA 2LRNA 2H73A 1X9SB 1K0MA 1BJXA 1EV4A 2GDRA 3DVXA 1J0FA 1TRSA 3M1GA 5F05A 4HJ2A 3AY8A 4YQVA 4K8MA 3FZ4A 3EC3A 1YKAA 2F9SA 4MF5A 5E4WA 2L4CA 2GT6A 2H1DA 2HFDA 1XIYA 2C1YA 1AQXA 3A2VA 3ISOA 3O3TA 1GLPA 1SK1A 3ERGA 3FZ5A 1Y25A 5D73A 2A4VA 1B9YC 4L5LA 2OJLA 1EP7A 2GQKA 17GSA 5HR2A 1GTUA 4POLA 3EMPA 2LKUA 1WOUA 2FUG2 3LXTA 1OKDA 3I43A 4O32A 4ZL8A 6GSYA 1GUHA 1FO5A 1BQ7A 2C0FA 4IKHA 5JWRB 2H76A 2GS3A 3CSIA 1O85A 1W89A 2GZPA 2VL9A 4JEDA 1OAZA 2VO4A 2RUFA 4KNDA 3GH9A 1YEPA 12GSA 1KEBA 4POBA 4X43A 5B7CA 1I9DA 4KSOA 5CRDA 4L8EA 1PA3A 4ZIJA 2R2JA 3ME8A 4FO5A 1V9WA 5ECPB 1TOFA 1J08A 3H93A 3E9JB 3CXGA 4NXIA 4ZBAA 3WGDA 4OFTA 1Z3EA 3IAS2 3LWAA 3PINA 1YKCA 1H4OA 2LQQA 3NOFA 3FR6A 2B6MA 1AUCA 3DKSA 2GZZA 3BOAA 3L9VA 5D9VA 1SK2A 4HQZA 4MH3A 4EC0A 3DEXA 1VF3A 1SJZA 1SU9A 2K8SA 1ERVA 2HT9A 3A2XA 2KLXA 1A2LA 3F6FA 1NM3A 16GSA 1Y6EA 4PUAA 5DAKA 1T4YA 4QL7A 2C80A 1A0FA 1NSWA 3IXRA 2JL4A 3UMAA 2OADA 3HJMA 3LSZA 2C0GA 2VLVA 5IIZA 1H75A 3ZLPA 2PWJA 3LORA 1A8YA 2DBCA 3TJFA 4OO4A 3QR6A 4WETA 1YDKA 1DUGA 4O92A 2LS5A 1TU8A 2ALBA 3F8UA 1XWKA 2P5QA 3GIXA 4DSSA 2E2GA 4KW6A 5ID2A 2R4VA 3GUSA 5EPFA 1R26A 3QFBC 1XZOA 3F4RA 5DALB 3TRQA 2ON7A 3C1RA 5JCUA 3C71A 4OCFA 2PPTA 4WF5A 4LA1A 4V1Ag 5G1LA 4EE0A 1GSUA 4MMMA 2H66A 3I6AA 1Q4JA 4ECBA 3QFAC 5A4WA 2CZ2A 4K0NA 2WULA 3VWWA 2MMOA 3L78A 1BAYA 3A5WA 2X99A 1WWJA 3ERWA 1UN2A 1SKWB 2VCQA 3MDKA 1TRUA 5HQPA 4NAXA 2FY6A 2FD3A 1EGOA 2LRCA 2X8GA 5J5NA 1SYXA 1WMJA 4TR3A 4OFNA 2PU9C 1R4WA 3P90A 4KCAA 2YANA 3RPPA 4RQXA 1PX7A 4HQSA 2E2MA 2CZ3A 1PL1A 3KD0A 3QPMA 1M99A 4G9HA 4JE1A 2DSAA 1JZRA 2GQMA 2B7KA 5LCZA 5ECSA 3TB2A 3F9UA 2VM2A 2DC5A 3M8NA 3GKMA 2DLXA 1LU4A 2O85A 1VF1A 3BD2A 2VCWA 3ZYWA 3HVSA 2L59A 3RPNA 1M7TA 2IMDA 4POKA 4ILFA 1FHEA 1ZMAA 3GKXA 5A4UA 4YAVA 5EVOA 2DJ0A 3KH9A 1AAZA 1HNCA 4IQAA 4TN8A 4X1UA 1TU7A 5KN3A 5D9TA 4JR6A 3HYPA 5AISA 3TOUA 1VF2A 2MMAA 1GUKA 3RHCA 5IOXA 2YV9A 3GYKA 3US3A 3LG6A 2IIYA 4I5QA 2P0GA 1M2AA 2H0IA 3V1WA 2HNLA 2HZEB 4WEYA 1ILOA 1B9XC 2GSSA 1ZYEA 1SKSB 3ZFLA 3FEUA 4MPFA 2L5OA 2YWMA 2F8FA 2QGVA 1X5CA 3HA9A 1V98A 5ECIB 3F4SA 4FYUA 3O6TA 2WRTA 3TDGA 2P5RA 5DQYA 4PUFC 4XS4B 3UARA 5B8AA 1T4ZA 2LTKA 2QC7A 1NW2A 5G31A 2WB9A 3DYRA 4ZL9A 3D5JA 3DD3A 1HD2A 4MJCA 5CRHA 2H8LA 3UVTA 2RM6A 4Q5NA 3O76A 2J23A 1BG5A 2LV3A 2TRXA 3ZZXA 2HE3A 2REMA 4WR4A 3GH6A 4IP1A 3F0IA 5ECOB 4ISDA 5CRGA 4PGTA 3VWXA 4EUYA 4CDOA 2ON5A 19GSA 1PGTA 1GLQA 4F82A 2GGTA 3MNGA 2GSTA 1KBNA 1K0CA 3HKRA 2E7PA 3ZMKA 3EU3A 4P3YB 2YJ7A 3VLNA 11GSA 5ABRA 4OO5A 2H30A 3CTGA 1WIKA 3EYTA 1XWAA 1XOBA 1O7UA 5EY6A 3TKPA 1PN9A 2B1LA 3QOUA 4KB3A 4L0UA 1R5AA 4NWYA 2O7KA 2CA8A 4XHMA 3QAWA 4MF6A 5DDLA 2PBJA 2VL2A 2CAIA 3LJRA 2PN8A 4PQHA 3FZAA 4WF4A 5IMAA 4N0VA 2LNTA 4XIHA 2GSRA 1EOHA 1G6WA 2GT5A 1ML6A 2H01A 3ED3A 4G19A 4TVEA 4HJMA 4WBJA 4EXJA 3RAZA 2CAQA 4V2MA 3G9BA 3QDNA 3KIJA 2I4AA 3Q6OA 1YQ1A 4IJIA 3GL5A 4NV2A 1XXUA 3KGKA 1GRXA 5LNKe 2V32A 3QCPA 4CHSA 3GKKA 3BCIA 2DJKA 2AHEA 2NPBA 3FK8A 2V6KA 3PGTA 2OKAA 3GSTA 4TKYA 3G7JA 4ZILA 1SJIA 1E2YA 3UL3A 1FB6A 1ABAA 1O8XA 2YOIA 4MDCA 2JACA 1OE7A 4KE3A 3U5RE 4L5OA 1XBSA 5GSSA 4GTUA 3D4MA 4PNGA 2FA4A 3A3TA 1A23A 2C8UA 1SD8A 1HYUA 2B1KA 4KDYA 4G10A 2JZTA 2HSYA 4KSMA 2MZCA 2TIRA 1WPIA 3DXBA 5JWQB 4XCSA 2YP6A 5A5KA 1QQ2A 3GTUB 5F06A 3M9JA 4Q5QA 2B5YA 3ZMLA 1K0NA 3D6IA 4WR5A 1K0AA 3F4TA 3ZVJD 3TUEA 3GSSA 5C00A 5DAKB 8GSSA 4TR1A 1GWCA 3RBTA 1OVNA 4O5RA 1G0TA 1ERUA 3H4KA 2VOCA 3D21A 3C8EA 5KN1A 3IK9A 2YNXA 2PVOC 4J57E 5CNWA 1GSQA 2IMIA 2IFQB 1A2MA 2H71A 3FKFA 1SD9A 1WJKA 2VAFA 2WCIA 2VM1A 4HDEA 3GKNA 3DGQA 2IMKA 5H5SA 1SKRB 1F37A 4IVFA 3UAPA 2VLUA 4DSSB 2CT6A 2R5GA 4DSQA 2X8CA 1JZDA 3PH9A 5ECMB 1HNBA 1M2DA 1B4PA 2FWEA 2VL2C 2XPEA 1TW9A 4H86A 1G7OA 4K9ZA 1ZCPA 2N5BA 5IMFA 3DIEA 1UVZA 1EOGA 5FT3A 5G2ZA 5CREA 2LEGA 2I3YA 2AAWA 4K7NA 1B4QA 4FH8A 3I9V2 1G6YA 3H1NA 10GSA 4TW5A 3HCZA 3TJKA 1THOA 4WKWA 3CRTA 2L57A 4EDYA 3W8JA 4OCEA 3KMOA 4F03A 4LLRA 1YF0A 3EE2A 1TTZA 3GURA 3HZ8A 2Z9SA 4J56E 4N0ZA 1B8XA 4NV5A 5GSTA 2VCTA 5GAND 1U88A 3ZRDA 3RHBA 1KNGA 2DIYA 5G5FA 1C72A 5IMDA 5H5RA 4TXOA 1GTBA 3HJPA 2G2QA 4I8BA 1XW5A 1F3AA 5L71A 4I97A 3KXOA 3L0HA 1DE2A 3UIWA 2C3QA 3PR8A 4YQUA 2VCXA 1YEXA 2GSQA 3I69A 2IPAA 3OR5A 1TI3A 1K3OA 2C3TA 1PKWA 3HD5A 4K2DA 3C1SA 5ECKB 4GSSA 3NZNA 2M80A 3IHQA 1I5GA 1FB0A 4XRDA 2FWHA 1EGRA 2MBTA 1ERWA 1TRWA 2H70A 2VD1A 2NVLA 1PMTA 4TR4A 3CSJA 4TRXA 3GX8A 5GZZB 4POMA 3ZVJA 1IYIA 3GMFA 5HFKA 5IMCA 1X5DA 7GSSA 5E59A 2AJQB 2HLSA 1AC1A 4DEJA 3VK9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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